合成生物学相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['synthetic biology']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价9.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 92 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-02-11 |
Engineering Plasmids with Synthetic Origins of Replication
2025-Feb-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639468
PMID:40027650
|
研究论文 | 本文通过重构天然pMB1复制起点，创建了具有可定制拷贝数的质粒，并利用合成RNA调控器实现独立拷贝控制，展示了合成复制起点（SynORI）的模块化工程应用 | 开发了合成复制起点（SynORI）技术，实现了质粒拷贝数的可定制化、兼容性和模块化调控，并创建了正交质粒库 | NA | 研究合成生物学中质粒复制起点的工程化改造，以提高其可调性、兼容性和模块化 | 质粒的复制起点和合成RNA调控器 | 合成生物学 | NA | 合成RNA调控器技术 | NA | NA | NA | 合成RNA调控器 | 大肠杆菌 | 合成复制起点（SynORI）和正交质粒库，用于实现可调拷贝数控制和环境信号的多重报告 | 工业生物技术 |
| 22 | 2026-02-06 |
Advancing cellulose utilization and engineering consolidated bioprocessing yeasts: current state and perspectives
2025-Feb-13, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13426-0
PMID:39939397
|
综述 | 本文综述了在酿酒酵母中表达纤维素酶以开发整合生物加工（CBP）酵母菌株的当前策略与进展，并探讨了利用合成生物学工具优化菌株的工业应用前景 | 系统总结了通过理性菌株设计和现代合成生物学工具优化CBP酵母的策略，并指出组学策略对未来菌株开发的指导作用 | 目前报道的一步法纤维素底物转化乙醇的滴度和产率远低于工业要求，CBP尚未实现工业化规模应用 | 开发能够高效利用纤维素、实现整合生物加工的酵母菌株，用于将木质纤维素生物质转化为生物燃料和绿色化学品 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）及其工程化菌株 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学工具、组学策略（omics strategies）、理性菌株设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 纤维素酶表达系统、核心纤维素酶组合表达、分泌途径优化 | 能源、工业生物技术 |
| 23 | 2026-02-06 |
Study on the framework of ATP energy cycle system in Escherichia coli
2025-Feb-12, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13350-9
PMID:39937288
|
研究论文 | 本研究旨在开发一种用于大肠杆菌的快速、无标记、多位点、多拷贝基因组编辑系统，并探索构建AMP-ATP循环系统 | 鉴定出单个ppk基因（No.8）可完成AMP-ATP循环反应，并利用MUCICAT技术将其插入基因组不同位置和拷贝数，实现与质粒相当的表达水平 | 未明确说明实验规模或样本量，且研究主要聚焦于大肠杆菌，可能限制其直接应用于其他生物系统 | 开发高效的大肠杆菌基因组编辑系统，以降低ATP依赖反应的成本并推进合成生物学应用 | 大肠杆菌（Escherichia coli）及其ATP合成途径相关基因 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, MUCICAT技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌（Escherichia coli） | AMP-ATP循环系统 | 工业生物技术 |
| 24 | 2026-02-05 |
Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00569
PMID:39898483
|
研究论文 | 本研究通过理性设计CRISPR/Cas9基础的DNA甲基转移酶，在人类细胞系和原代T细胞中实现了可编程的DNA甲基化和基因沉默 | 在DNMT3A催化核心引入突变，稳定了dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白在Jurkat T细胞中的表达，同时保持DNA甲基化和基因沉默功能，并首次在原代人T细胞中验证了工程化dCas-DNMTs的功能 | 研究主要限于体外细胞实验，尚未在体内模型或更复杂的生理环境中验证 | 开发更稳定、高效的CRISPR/Cas9基础的表观遗传编辑工具，用于哺乳动物细胞的可编程DNA甲基化调控 | 人类细胞系（包括Jurkat T细胞）和供体来源的原代人T细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9表观遗传编辑、DNA甲基化分析 | dCas9-DNMT3A/3L融合蛋白系统 | 表观遗传数据、基因表达数据 | 多种人类细胞系及供体来源的原代T细胞 | CRISPR-Cas9 | 人类细胞系、原代人T细胞 | dCas9与DNMT3A/3L甲基转移酶融合构建的表观遗传编辑系统 | 医学、基础研究 |
| 25 | 2026-02-05 |
Enhancing lipid production in plant cells through automated high-throughput genome engineering and phenotyping
2025-Feb-13, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf026
PMID:39899469
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于植物生物工程的快速、自动化、高通量管道FAST-PB，通过整合自动化生物铸造、基因组编辑和单细胞质谱分析，以增强玉米和本氏烟草中的脂质生产 | 开发了FAST-PB管道，整合了自动化生物铸造、Golden Gate克隆、CRISPR编辑和单细胞MALDI-MS分析，实现了高通量植物基因组工程和表型分析，显著提高了脂质产量 | NA | 开发一种自动化高通量管道，以加速植物生物工程过程，特别是增强脂质生产 | 玉米（Zea mays）和本氏烟草（Nicotiana benthamiana）的愈伤组织和原生质体细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR编辑、Golden Gate克隆、单细胞MALDI-MS、自动化生物铸造 | NA | 质谱数据、脂质组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 玉米, 本氏烟草 | 通过CRISPR激活脂质控制基因来增强脂质生产，涉及多基因盒的引入 | 农业, 能源 |
| 26 | 2026-01-24 |
Efficient Site-Directed Mutagenesis Mediated by Primer Pairs with 3'-Overhangs
2025-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70104
PMID:39945594
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过具有3'-突出端的引物对进行高效定点诱变的优化方法 | 利用部分互补且具有3'-突出端的引物对设计，显著提高了诱变效率并降低了错误率 | NA | 开发一种更高效、可靠的定点诱变方法 | 质粒DNA | NA | NA | 定点诱变 | NA | NA | NA | Gibson Assembly | DH5α大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 27 | 2025-10-05 |
Chemistry and biology of natural stilbenes: an update
2025-02-19, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00033a
PMID:39711130
|
综述 | 系统回顾2009-2023年间发现的409种天然二苯乙烯类化合物，重点分析寡聚二苯乙烯的结构分类、仿生合成及生物活性 | 首次系统梳理近15年新发现的二苯乙烯类化合物，特别关注具有独特骨架的寡聚二苯乙烯及其绝对立体化学研究 | 仅涵盖2009-2023年间报道的化合物，未涉及更早期的研究成果 | 总结天然二苯乙烯类化合物的化学结构与生物活性研究进展 | 天然二苯乙烯类化合物，特别是寡聚二苯乙烯 | 天然产物化学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 文献数据 | 409种新二苯乙烯化合物 | NA | NA | NA | 医药 |
| 28 | 2025-10-05 |
Harnessing the biology of regulatory T cells to treat disease
2025-02, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-024-01089-x
PMID:39681737
|
综述 | 本文探讨调节性T细胞的生物学特性及其在疾病治疗中的应用前景 | 结合纳米医学和合成生物学技术开发新一代T细胞精准调控疗法 | 现有临床试验仍存在重要局限性和未解问题 | 研究调节性T细胞在疾病治疗中的临床应用策略 | 人类调节性T细胞 | 免疫学 | 过敏、移植、自身免疫病、癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 29 | 2025-10-05 |
GenomeOcean: An Efficient Genome Foundation Model Trained on Large-Scale Metagenomic Assemblies
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635558
PMID:39975405
|
研究论文 | 开发了一个高效的基因组基础模型GenomeOcean，通过大规模宏基因组组装数据训练，提升对稀有微生物物种的表征能力 | 直接在宏基因组样本的大规模共组装上进行训练，采用字节对编码(BPE)标记化策略，实现150倍更快的序列生成速度，同时保持高生物保真度 | NA | 开发高效的基因组基础模型，改进对稀有微生物物种的表征能力 | 宏基因组数据集中的微生物物种和蛋白质编码基因 | 机器学习 | NA | 宏基因组测序，字节对编码(BPE) | 生成式基础模型 | 基因组序列数据 | 220TB宏基因组数据集，包含超过600Gbp的高质量重叠群 | NA | NA | NA | 医学，合成生物学 |
| 30 | 2025-10-05 |
Bridging the gap: pathway programs for inclusion and persistence in microbiology
2025-Feb, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2024.12.007
PMID:39814665
|
研究论文 | 本文提出了一种旨在促进微生物学领域包容性和持久性的途径项目 | 设计了整合噬菌体发现、合成生物学和数据科学/AI等新兴领域的公平培训途径 | NA | 促进微生物学领域多元化人才培养和劳动力发展 | 微生物学领域的教育项目和人才培养途径 | 微生物学教育 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 教育 |
| 31 | 2025-10-05 |
A Nitrate/Nitrite Biosensor Designed with an Antiterminator for In Vivo Diagnosis of Colitis Based on Bacteroides thetaiotaomicron
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00602
PMID:39801064
|
研究论文 | 本研究基于Bacteroides thetaiotaomicron开发了一种抗终止子微生物全细胞生物传感器，用于通过检测硝酸盐/亚硝酸盐在小鼠体内诊断结肠炎 | 开发了基于抗终止子的新型生物传感元件，通过结合组成型启动子和诱导型终止子创建了硝酸盐/亚硝酸盐诱导型启动子 | NA | 开发基于Bacteroides thetaiotaomicron的诊断性工程益生菌用于结肠炎诊断 | Bacteroides thetaiotaomicron微生物和溃疡性结肠炎小鼠模型 | 合成生物学 | 溃疡性结肠炎 | 微生物全细胞生物传感器技术 | NA | 生物传感响应数据 | 化学诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型 | 合成生物学元件设计 | Bacteroides thetaiotaomicron | 抗终止子生物传感器，硝酸盐/亚硝酸盐响应型基因回路 | 医学诊断 |
| 32 | 2025-10-05 |
Construction and Characterization of MoClo-Compatible Vectors for Modular Protein Expression in E. coli
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00564
PMID:39801078
|
研究论文 | 本研究构建并表征了与MoClo系统兼容的低拷贝和中拷贝载体，扩展了模块化蛋白表达工具包 | 扩展了现有MoClo工具包，新增低拷贝(p15A)和中拷贝(pBR322)目标载体，实现500倍荧光输出差异的蛋白表达范围 | NA | 开发模块化蛋白表达系统，优化生长耦合酶表达条件 | 大肠杆菌(E. coli)蛋白表达系统 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆，模块化克隆(MoClo) | NA | 荧光输出数据，生长曲线数据 | 28个载体(Addgene目录号217582-217609) | Golden Gate Assembly | 大肠杆菌(E. coli) | 模块化蛋白表达系统，包含不同拷贝数的表达载体 | 工业生物技术 |
| 33 | 2025-10-05 |
Microbial Production of Ectoine: A Review
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00490
PMID:39834017
|
综述 | 本文综述了微生物生产四氢嘧啶的策略，包括野生菌株筛选、诱变育种和模式菌株代谢工程 | 系统总结了利用合成生物学和代谢工程技术替代传统嗜盐菌生产四氢嘧啶的最新进展 | NA | 阐明四氢嘧啶微生物生产的当前研究现状并为工业化生产提供见解 | 四氢嘧啶及其微生物生产菌株 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | 嗜盐细菌、非嗜盐工程菌株 | 四氢嘧啶合成途径 | 生物医学、化妆品、食品工业 |
| 34 | 2025-10-05 |
Do the Shuffle: Expanding the Synthetic Biology Toolkit for Shufflon-like Recombination Systems
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00790
PMID:39869770
|
研究论文 | 本研究通过鉴定新型shufflon倒置酶并建立单分子测序检测方法，扩展了合成生物学工具包中的DNA重组系统 | 鉴定了14种先前未经测试的shufflon倒置酶基因及其识别位点，建立了基于单分子测序的定量检测方法，发现了具有显著改善重组效率的酶 | NA | 扩展合成生物学工具包中的shufflon样重组系统 | shufflon倒置酶及其识别位点 | 合成生物学 | NA | 单分子测序 | NA | 基因组序列数据 | 14种shufflon倒置酶基因 | shufflon倒置酶 | 大肠杆菌 | 合成shufflon系统，用于产生数百万序列变体 | 工业生物技术 |
| 35 | 2025-10-05 |
Cell-Free Systems to Mimic and Expand Metabolism
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00729
PMID:39878226
|
综述 | 本文探讨无细胞合成生物学系统在代谢模拟与扩展中的应用 | 将无细胞系统从传统蛋白质合成扩展到代谢途径原型设计和非天然反应网络构建 | 目前仅探索了少量代谢可能性，且主要依赖模式生物提取物 | 通过无细胞系统理解和工程化生物基化学转化过程 | 无细胞合成生物学系统及其代谢组件 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统、酶组合设计 | NA | NA | NA | NA | 模式生物提取物 | 代谢途径原型、非天然反应网络 | 工业生物技术 |
| 36 | 2025-10-05 |
Considerations for Domestication of Novel Strains of Filamentous Fungi
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00672
PMID:39883596
|
综述 | 本文探讨丝状真菌作为微生物细胞工厂的驯化挑战与应用前景 | 系统阐述利用合成生物学工具开发丝状真菌生物技术潜力的新视角 | NA | 探讨丝状真菌菌株驯化策略以促进其生物技术应用 | 丝状真菌及其遗传与代谢特性 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 丝状真菌 | 代谢通路、信号转导通路 | 工业生物技术, 能源, 食品 |
| 37 | 2025-10-05 |
DRIMS: A Synthetic Biology Platform that Enables Deletion, Replacement, Insertion, Mutagenesis, and Synthesis of DNA
2025-02-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00649
PMID:39902634
|
研究论文 | 开发了一种基于PCR的合成生物学平台DRIMS，能够实现DNA的删除、替换、插入、突变和合成 | 利用recA非依赖性重组途径，在单一扩增步骤中完成多种DNA操作，无需DNA模板即可合成DNA | 仅提供了概念验证，尚未在更广泛的应用场景中验证 | 开发高效、简单、低成本的DNA操作平台以加速合成生物学和疾病治疗研究 | DNA片段、DNA结合序列、嵌合抗原受体组件、人工microRNA、点突变 | 合成生物学 | 癌症 | PCR, DpnI消化, 转化 | NA | DNA序列 | 4个删除、64个替换、4个组件替换、51个插入、5种点突变、8个DNA合成 | PCR, DpnI | 感受态细胞 | DNA删除、替换、插入、突变和合成操作平台 | 医学, 工业生物技术 |
| 38 | 2025-10-05 |
The Future of Microbiome Therapeutics
2025-Feb, Drugs
IF:13.0Q1
DOI:10.1007/s40265-024-02107-3
PMID:39843757
|
综述 | 本文概述了微生物组治疗领域的最新技术进展及其未来发展前景 | 系统性地比较了从粪便衍生产品到活体生物治疗剂、噬菌体疗法和合成生物学等多种微生物组治疗技术的优势与局限 | 作为叙述性综述，未进行定量荟萃分析，主要基于现有文献的定性总结 | 探讨微生物组治疗的未来发展方向和技术路径 | 人类微生物组及其相关治疗技术 | 微生物组研究 | NA | 粪便微生物移植、噬菌体疗法、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA | NA | 人类微生物组 | NA | 医学 |
| 39 | 2025-10-05 |
The mutational landscape of Bacillus subtilis conditional hypermutators shows how proofreading skews DNA polymerase error rates
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf147
PMID:40057377
|
研究论文 | 本研究通过构建枯草芽孢杆菌条件性超突变株，揭示了DNA聚合酶校对功能如何影响突变率 | 首次在革兰氏阳性模式细菌中系统解析DNA聚合酶初始核苷酸选择性、校对和错配修复对突变率的各自贡献 | 分析中存在聚集潜在异质性突变的困难以及野生型突变途径未知的局限 | 阐明DNA聚合酶校对如何影响净聚合酶错误率 | 枯草芽孢杆菌条件性超突变株 | 合成生物学 | NA | 突变积累实验、数学模型分析 | NA | 基因组突变数据 | 多个条件性超突变株系 | 合成生物学工具箱 | 枯草芽孢杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 40 | 2025-10-05 |
Systematic Characterization and Analysis of the Freeze-Thaw Tolerance Gene Set in the Budding Yeast, Saccharomyces cerevisiae
2025-Feb-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052149
PMID:40076774
|
研究论文 | 本研究系统表征和分析了酿酒酵母中与冻融耐受性相关的基因家族 | 在统一的BY4741实验室菌株遗传背景下，采用标准化协议对冻融耐受基因家族进行完整表征 | 研究仅限于6个基因的分析，且使用KanMX6抗性盒可能产生局部空间效应 | 鉴定能够提高冷冻后存活率的基因修饰 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的冻融耐受基因 | 合成生物学 | NA | 基因工程、表型分析 | NA | 基因表达数据、存活率数据 | 6个冻融耐受基因在BY4741菌株中的分析 | KanMX6 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | NA | 工业生物技术, 医药 |