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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-03-04 |
Self-Driven CuAAC Reaction Catalyzed by Photosensitive Biohybrids Energized by Lactate for Boosting Cancer Immunotherapy
2025-Feb-20, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202425018
PMID:39973575
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研究论文 | 本文构建了一种光辅助靶向电活性细菌装备的生物正交催化剂系统,用于增强癌症免疫治疗 | 创新点在于利用细菌在肿瘤部位厌氧代谢乳酸并转移电子至生物正交催化剂,从而触发CuAAC反应原位生成活性药物,并通过光照加速反应 | NA | 开发一种不依赖化学还原剂的高效CuAAC反应,用于癌症免疫治疗 | 肿瘤代谢与CuAAC反应 | 合成生物学 | 癌症 | CuAAC反应、光辅助催化 | NA | NA | NA |
22 | 2025-03-03 |
Remodeling of lipid-foam prototissues by network-wide tension fluctuations induced by active particles
2025-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57178-x
PMID:40016255
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研究论文 | 本文介绍了一种基于脂质的组织模拟物,能够通过活性粒子诱导的网络张力波动进行重塑 | 开发了一种毫米大小的脂质泡沫组织模拟物,具有自愈能力,并展示了由游泳细菌驱动的网络张力波动促进组织重塑 | 现有原型组织的横向尺寸较小或缺乏重塑能力 | 理解和模拟生物组织的结构和力学特性 | 脂质泡沫组织模拟物 | 合成生物学 | NA | 脂质双层技术 | NA | NA | NA |
23 | 2025-03-01 |
Discovery of Cortinarius O-methyltransferases for the heterologous production of dermolutein and physcion
2025-Feb-25, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02625-6
PMID:40001086
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研究论文 | 本文通过基因组学、转录组学和合成生物学方法,揭示了Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物emodin和endocrocin的生物合成途径,以及它们甲基化为黄色色素physcion和dermolutein的过程 | 发现了Cortinarius蘑菇中非还原性聚酮合酶(nrPKSs)和特异性O-甲基转移酶(OMTs)的平行进化起源,并成功在酵母中异源合成了physcion和dermolutein | 化学合成复杂且不经济,从森林中大量采集野生蘑菇不可行 | 研究Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物的生物合成途径及其应用 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、合成生物学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇 |
24 | 2025-03-01 |
The key role of cytochrome P450s in the biosynthesis of plant derived natural products
2025-Feb-25, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109695
PMID:40015195
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综述 | 本文综述了细胞色素P450在植物源天然产物生物合成中的关键作用,特别是在下游合成途径和骨架合成后的结构修饰中的重要性 | 强调了细胞色素P450酶在天然产物合成途径中的关键催化步骤,并概述了天然产物生物合成和合成生物学研究的最新进展 | NA | 探讨细胞色素P450酶在植物源天然产物生物合成中的作用,以促进天然产物的开发和合成生物学研究 | 植物源天然产物,包括萜类、生物碱、黄酮类、甾体皂苷等 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
25 | 2025-03-01 |
Direct Cloning and Heterologous Expression of the Dmxorosin Biosynthetic Gene Cluster from Streptomyces thermolilacinus SPC6, a Halotolerant Actinomycete Isolated from the Desert in China
2025-Feb-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041492
PMID:40003958
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研究论文 | 本文报道了从中国临泽沙漠分离的耐盐放线菌SPC6中直接克隆并异源表达dmxorosin生物合成基因簇的研究 | 成功克隆并异源表达了一个完全沉默的次级代谢生物合成基因簇,发现了一种新的羊毛硫肽dmxorosin | NA | 研究SPC6菌株的次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 耐盐放线菌SPC6及其次级代谢产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、直接克隆、异源表达 | NA | 基因组数据 | 1株耐盐放线菌SPC6 |
26 | 2025-02-28 |
Harnessing promoter elements to enhance gene editing in plants: perspectives and advances
2025-Feb-27, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14533
PMID:40013512
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综述 | 本文综述了利用启动子元件增强植物基因编辑的策略和进展 | 强调了组织和器官特异性以及诱导型启动子的潜力,以及合成启动子和生物信息学工具在植物基因编辑中的应用 | NA | 增强植物基因编辑的精确性、效率和特异性 | 植物基因编辑 | 合成生物学 | NA | 基因编辑 | NA | NA | NA |
27 | 2025-02-28 |
Construction and Characterization of MoClo-Compatible Vectors for Modular Protein Expression in E. coli
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00564
PMID:39801078
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研究论文 | 本研究构建并表征了与MoClo兼容的低拷贝和中拷贝载体,扩展了现有的MoClo工具包,用于在大肠杆菌中进行模块化蛋白质表达 | 扩展了现有的MoClo工具包,构建了低拷贝和中拷贝载体,实现了蛋白质表达范围的500倍差异,并通过选择性生长实验验证了低表达水平对乙醇依赖生长的优化作用 | 研究仅限于大肠杆菌中的蛋白质表达,未涉及其他宿主系统 | 扩展MoClo工具包,优化蛋白质表达水平,以支持合成生物学研究 | 大肠杆菌中的蛋白质表达 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆 | NA | DNA序列 | NA |
28 | 2025-02-28 |
Do the Shuffle: Expanding the Synthetic Biology Toolkit for Shufflon-like Recombination Systems
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00790
PMID:39869770
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研究论文 | 本文研究了自然发生的DNA倒位系统在合成生物学中的应用,特别是Shufflon倒位酶(SI)的改进和扩展 | 鉴定了14个以前未测试的SI基因及其位点,并建立了一种基于单分子测序的检测方法,以量化这些酶的倒位速率,并确定了正交SI/对 | 研究中仅使用了单一酶,且重组速率中等,这可能限制了SI的广泛应用 | 扩展合成生物学工具包,特别是Shufflon样重组系统的应用 | Shufflon倒位酶(SI)及其基因 | 合成生物学 | NA | 单分子测序 | NA | DNA序列 | 14个SI基因 |
29 | 2025-02-28 |
Cell-Free Systems to Mimic and Expand Metabolism
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00729
PMID:39878226
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研究论文 | 本文探讨了利用无细胞系统模拟和扩展代谢的研究进展 | 将无细胞系统的应用从蛋白质合成扩展到代谢途径的原型设计和新型反应网络的构建 | 目前仅探索了代谢可能性的一小部分,且主要使用模式生物的提取物作为起点 | 理解和设计生物基化学转化 | 无细胞系统中的代谢途径和反应网络 | 合成生物学 | NA | 无细胞合成生物学技术 | NA | NA | NA |
30 | 2025-02-28 |
Considerations for Domestication of Novel Strains of Filamentous Fungi
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00672
PMID:39883596
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综述 | 本文综述了丝状真菌作为生物技术资源的潜力及其在商业化应用中的挑战 | 提出了利用合成生物学和系统生物学工具来开发丝状真菌作为微生物细胞工厂的新方法 | NA | 探讨丝状真菌在生物技术中的应用潜力及其作为微生物细胞工厂的开发方法 | 丝状真菌 | 生物技术 | NA | 合成生物学, 系统生物学 | NA | NA | NA |
31 | 2025-02-28 |
Characterization of Rationally Designed CRISPR/Cas9-Based DNA Methyltransferases with Distinct Methyltransferase and Gene Silencing Activities in Human Cell Lines and Primary Human T Cells
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00569
PMID:39898483
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研究论文 | 本文研究了基于CRISPR/Cas9的DNA甲基转移酶在人类细胞系和原代人类T细胞中的甲基转移和基因沉默活性 | 通过合理设计DNMT3A甲基转移酶的催化核心,开发了三种dCas9-DNMT3A/3L变体,并在不同人类细胞系和原代T细胞中测试了其性能,发现这些突变能稳定表达且不牺牲DNA甲基化或基因沉默性能 | 研究主要局限于细胞系和原代T细胞,可能限制了在更广泛细胞类型中的应用 | 扩展合成生物学工具包,用于表观遗传编辑,并探索工程化dCas-DNMTs在原发性哺乳动物细胞类型中的应用 | 人类细胞系和原代人类T细胞 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9, DNA甲基转移酶 | dCas9-DNMT3A/3L | 基因表达数据 | 不同人类细胞系和原代人类T细胞 |
32 | 2025-02-28 |
Marine Phytoplankton Bioactive Lipids and Their Perspectives in Clinical Inflammation
2025-Feb-17, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23020086
PMID:39997210
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研究论文 | 本文探讨了海洋浮游植物作为免疫调节生物活性脂质的新兴来源,及其在临床炎症管理中的应用前景 | 提出了利用海洋浮游植物作为生物技术平台生产功能性生物活性脂质,用于治疗慢性炎症疾病和其他临床状况的新思路 | 为了商业竞争力,脂质前体的产量需要提高,目前的研究还处于初步阶段 | 研究海洋浮游植物中的生物活性脂质及其在临床炎症管理中的应用 | 海洋浮游植物中的生物活性脂质 | 生物技术 | 慢性炎症疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA |
33 | 2025-02-28 |
Advanced Technologies for Large Scale Supply of Marine Drugs
2025-Feb-07, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23020069
PMID:39997193
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review | 本文综述了海洋天然产物(MNPs)的大规模供应策略,探讨了供应、合成和可扩展性方面的挑战,并强调了可能改变当前海洋来源药物工业规模制造方法的生物技术进步 | 结合传统方法与现代合成生物学和生物合成策略,提出了一种多样化的方法来生产海洋无脊椎动物的天然产物 | 海洋无脊椎动物的天然产物通常自然积累量非常少,这限制了其大规模生产的可行性 | 确保海洋天然产物的可靠和可持续供应,以将其转化为商业药物和其他有价值的产品 | 海洋天然产物(MNPs) | 生物技术 | NA | 合成生物学、生物合成 | NA | NA | NA |
34 | 2025-02-28 |
GenomeOcean: An Efficient Genome Foundation Model Trained on Large-Scale Metagenomic Assemblies
2025-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635558
PMID:39975405
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GenomeOcean的高效基因组基础模型,该模型在大规模宏基因组组装数据上进行训练,旨在提升对稀有微生物物种的表征能力 | GenomeOcean直接在宏基因组样本的大规模共组装上进行训练,增强了对稀有微生物物种的表征能力,并改进了超越基因组中心方法的泛化能力 | NA | 开发一种高效的基因组基础模型,以提升对稀有微生物物种的表征能力,并推动精准医学、药物发现和复杂生物系统的理解 | 宏基因组数据集中的微生物物种 | 基因组学 | NA | 宏基因组测序 | 生成式基因组基础模型 | 基因组序列 | 220 TB的宏基因组数据集,包含600 Gbp的高质量重叠群 |
35 | 2025-02-28 |
Identification and Characterization of Two Se6OMTs from Stephania epigaea Offer Novel Insights into the Biosynthetic Pathway of Cepharanthine
2025-Feb-03, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo15020092
PMID:39997717
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研究论文 | 本研究从千金藤属植物Stephania epigaea中克隆并功能表征了三种O-甲基转移酶(OMTs),重点研究了其中两种Se6OMTs在头花千金藤碱生物合成途径中的作用 | 首次鉴定了参与头花千金藤碱生物合成途径的Se6OMTs,并阐明了这些酶在(R)-和(S)-立体异构体生物碱生成中的作用 | 未探讨Se6OMTs在其他生物碱生物合成途径中的潜在作用 | 阐明头花千金藤碱生物合成途径中关键酶的作用机制 | Stephania epigaea植物中的O-甲基转移酶 | 合成生物学 | NA | 基因克隆、酶功能表征 | NA | 生物化学数据 | 三种OMTs,九种1-BIAs底物 |
36 | 2025-02-28 |
Recent advances in the synthesis and application of biomolecular condensates
2025-Feb, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2025.108188
PMID:39814227
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综述 | 本文综述了生物分子凝聚体(BMCs)的合成和应用的最新进展,特别是通过相分离诱导的合成BMCs(SBMCs)在基础和应用研究中的潜力 | 介绍了合成生物学等新方法在BMCs从头合成中的应用,以及SBMCs在染色体结构、发病机制、生物制造、人工细胞设计和药物递送等领域的科学应用 | 对BMCs的内部组织和外部调控的理解仍处于早期阶段 | 探讨BMCs的合成方法及其在生物材料、生物技术和生物医学中的应用 | 生物分子凝聚体(BMCs)及其合成版本(SBMCs) | 生物技术 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
37 | 2025-02-27 |
Synthetic Lipid Biology
2025-Feb-26, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00761
PMID:39805091
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研究论文 | 本文介绍了合成脂质生物学这一新兴领域,旨在通过跨学科合作来理解和构建脂质及生物膜系统 | 提出了合成脂质生物学的概念,整合了化学、生物学、物理学和工程学的方法来研究和构建脂质及生物膜 | NA | 通过跨学科合作,构建更清晰的脂质和生物膜的性质、行为和功能描述 | 脂质和生物膜 | 合成生物学 | NA | 化学合成、化学酶法合成、光遗传学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | NA | NA |
38 | 2025-02-27 |
Toward an integrated omics approach for plant biosynthetic pathway discovery in the age of AI
2025-Feb-24, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2025.01.010
PMID:40000312
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综述 | 本文综述了利用多组学策略发现植物生物合成途径的最新进展,并提出了结合分子网络、反应对分析和基因表达模式的集成工作流程 | 提出了结合分子网络、反应对分析和基因表达模式的集成工作流程,并探讨了人工智能在途径发现中的革命性潜力 | 多组学数据的获取和解释仍面临挑战,尽管有新兴的计算工具,但数据利用率仍有待提高 | 推进可持续生物经济,通过合成生物学获取复杂的天然产物 | 植物生物合成途径 | 生物信息学 | NA | 基因组学、转录组学、代谢组学 | NA | 多组学数据 | NA |
39 | 2025-02-27 |
A concise enzyme cascade enables the manufacture of natural and halogenated protoberberine alkaloids
2025-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57280-0
PMID:39988594
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研究论文 | 本文设计了一种简洁的酶级联反应,用于高效生产天然和非天然的普罗托贝碱类生物碱,展示了其在药物开发中的工业潜力 | 通过酶发现和工程化,以及系统优化普罗托贝碱类生物碱生物合成中的制造挑战,实现了药物Rotundine的高产量生产,并展示了其在工业上的潜力 | NA | 克服植物源性生物碱高效生物合成中的长期挑战,并通过合成生物学引入结构复杂性和多样性 | 天然和非天然的普罗托贝碱类生物碱 | 合成生物学 | NA | 酶级联反应 | NA | NA | NA |
40 | 2025-02-27 |
Innovations and challenges in collagen and gelatin production through precision fermentation
2025-Feb-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04276-z
PMID:39910024
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综述 | 本文综述了通过精确发酵技术生产胶原蛋白和明胶的创新与挑战 | 介绍了精确发酵技术作为一种可持续且伦理的生产方法,替代传统的动物组织提取方式 | 讨论了生产规模化、成本效益和市场整合等挑战 | 探索精确发酵技术在食品行业中生产胶原蛋白和明胶的应用 | 胶原蛋白和明胶 | 生物技术 | NA | 精确发酵(PF) | NA | NA | NA |