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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-05-13 |
[Research progress on biosynthesis of triterpenoids in Centella asiatica]
2025-Feb, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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review | 本文综述了积雪草三萜皂苷的生物合成研究进展及其生物活性 | 总结了积雪草三萜皂苷生物合成途径、代谢调控及异源生物合成的最新研究进展 | NA | 为积雪草活性成分的综合资源开发和生物技术合成提供参考 | 积雪草三萜皂苷 | 合成生物学 | NA | 多组学、分子生物学、合成生物学 | NA | NA | NA |
22 | 2025-05-12 |
SHIP identifies genomic safe harbors in eukaryotic organisms using genomic general feature annotation
2025-Feb-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91249-9
PMID:40021804
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research paper | 该研究提出了一种名为SHIP的算法,用于系统性地识别真核生物中的基因组安全港(GSHs) | SHIP算法通过基因组通用特征注释系统性地识别GSHs,而非依赖经验方法,解决了现有GSHs多位于高基因密度区域导致表达不稳定的问题 | 研究仅在酿酒酵母中进行了实验验证,尚未在其他真核生物中广泛测试 | 开发一种系统性识别真核生物基因组安全港的工具,以支持合成生物学中多基因模块的研究 | 真核生物基因组中的基因组安全港(GSHs) | 合成生物学 | NA | DNA测序、流式细胞术、qPCR、电子显微镜、RT-qPCR、RNA-Seq | 算法(SHIP) | 基因组数据 | 在酿酒酵母中实验验证了5个GSHs |
23 | 2025-05-12 |
Remodeling of lipid-foam prototissues by network-wide tension fluctuations induced by active particles
2025-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57178-x
PMID:40016255
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研究论文 | 本文介绍了一种基于脂质的组织模拟物,即毫米大小的'脂质泡沫',它由微米大小的隔室组成,通过脂质双层结合,并展示了其自修复能力和在包含细菌时的网络张力波动 | 开发了一种易于制备和功能化的脂质泡沫组织模拟物,具有自修复能力和由游泳细菌驱动的网络张力波动,促进了原组织的流动和重组 | 目前的研究尚未探讨脂质泡沫组织模拟物在更复杂生物环境中的应用效果 | 开发并表征一种新型的脂质泡沫组织模拟物,以模拟和了解生物组织的特性 | 脂质泡沫组织模拟物及其在包含细菌时的行为 | 合成生物学 | NA | 脂质双层技术 | NA | NA | NA |
24 | 2025-05-12 |
Dsembler - DNA Assembly Designer: A Tool for Facilitating Assembly of Oligomers
2025-Feb-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2412.12046
PMID:40016135
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research paper | 介绍了一个名为Dsembler的基于网络的软件工具,旨在优化长DNA序列的组装 | 开发了一个新工具Dsembler,用于优化寡核苷酸的设计,提高DNA组装的准确性 | 未提及工具在实际应用中的性能测试或用户反馈 | 解决合成生物学中寡核苷酸组装面临的挑战 | 长DNA序列的组装 | 合成生物学 | NA | DNA组装 | NA | DNA序列 | NA |
25 | 2025-05-11 |
CAR-NK cells with dual targeting of PD-L1 and MICA/B in lung cancer tumor models
2025-Feb-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13780-2
PMID:40000974
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研究论文 | 本研究设计了一种新型双靶向CAR-NK细胞,用于靶向PD-L1和MICA/B,以增强对肺癌细胞的杀伤效果 | 设计了一种新型双靶向CAR(dtCAR),结合PD-L1纳米抗体和NKG2D,增强了NK细胞的活化和杀伤能力 | 研究仅针对H1299肺癌细胞模型,未涉及其他肺癌细胞类型或临床样本 | 开发一种新型免疫治疗策略,用于治疗肺癌 | 肺癌细胞H1299 | 免疫治疗 | 肺癌 | 合成生物学、CAR-NK细胞工程 | 双靶向CAR(dtCAR) | 体外和体内实验数据 | H1299肺癌细胞模型 |
26 | 2025-05-11 |
A concise enzyme cascade enables the manufacture of natural and halogenated protoberberine alkaloids
2025-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57280-0
PMID:39988594
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研究论文 | 设计了一种简洁的酶级联反应,用于高效生产天然和非天然的普罗托贝碱类生物碱 | 通过酶发现与工程化,以及系统优化普罗托贝碱类生物碱生物合成中的关键酶,实现了高效生产药物罗通定,并展示了其工业化潜力 | 未提及具体的生产规模限制或酶稳定性问题 | 克服植物源性天然产物在药物开发中因低丰度和结构多样性不足带来的限制 | 普罗托贝碱类生物碱,包括天然和非天然(如卤化)衍生物 | 合成生物学 | NA | 酶级联反应、酶工程 | NA | NA | NA |
27 | 2025-05-11 |
Marine Phytoplankton Bioactive Lipids and Their Perspectives in Clinical Inflammation
2025-Feb-17, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23020086
PMID:39997210
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研究论文 | 探讨海洋浮游植物中具有免疫调节功能的生物活性脂质及其在临床炎症治疗中的潜力 | 提出利用海洋浮游植物作为生物技术平台生产功能性生物活性脂质,用于治疗慢性炎症疾病 | 脂质前体产量需要提高以具备商业竞争力 | 研究海洋浮游植物生物活性脂质在临床炎症治疗中的应用 | 海洋浮游植物中的生物活性脂质 | 生物技术 | 慢性炎症疾病 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA |
28 | 2025-05-11 |
Direct Cloning and Heterologous Expression of the Dmxorosin Biosynthetic Gene Cluster from Streptomyces thermolilacinus SPC6, a Halotolerant Actinomycete Isolated from the Desert in China
2025-Feb-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041492
PMID:40003958
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研究论文 | 本文报道了从中国临泽沙漠分离的耐盐放线菌SPC6中直接克隆并异源表达dmxorosin生物合成基因簇的研究 | 成功克隆并异源表达了一个完全沉默的隐秘生物合成基因簇,发现了一种新的羊毛硫肽dmxorosin | NA | 研究放线菌次级代谢产物的生物合成途径 | Streptomyces thermolilacinus SPC6菌株及其次级代谢产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、直接克隆、异源表达 | NA | 基因组数据 | 1株放线菌(SPC6) |
29 | 2025-05-11 |
Advanced Technologies for Large Scale Supply of Marine Drugs
2025-Feb-07, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23020069
PMID:39997193
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综述 | 本文全面探讨了海洋天然产物(MNPs)的生产策略,包括供应、合成和可扩展性方面的挑战,并强调了可能改变当前海洋来源药物工业规模生产方法的最新生物技术进步 | 结合传统方法与现代合成生物学和生物合成策略,为海洋无脊椎动物MNPs的生产提供了多样化的方法 | 海洋无脊椎动物MNPs通常自然积累量极少,生产策略面临挑战 | 确保海洋天然产物的可靠和可持续供应,以转化为商业药物和其他有价值的产品 | 海洋天然产物(MNPs)及其生产策略 | 生物技术 | NA | 合成生物学、生物合成 | NA | NA | NA |
30 | 2025-05-09 |
Advancing cellulose utilization and engineering consolidated bioprocessing yeasts: current state and perspectives
2025-Feb-13, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13426-0
PMID:39939397
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综述 | 本文综述了利用酿酒酵母进行纤维素酶表达的策略,以及通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株的最新进展 | 总结了纤维素酶在酵母中表达的策略,并探讨了如何通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株 | 目前报道的一步法纤维素底物转化为乙醇的滴度和生产率远低于工业要求 | 探讨如何通过工程化酵母菌株实现木质纤维素生物质的高效生物转化 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 纤维素酶表达系统、合成生物学工具 | NA | NA | NA |
31 | 2025-05-09 |
Analysis of the Alkaline Resistance Mechanism of Halomonas alkalicola CICC 11012 s by Proteomics and Metabolomics
2025-Feb-13, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-024-04056-2
PMID:39945829
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研究论文 | 通过蛋白质组学和代谢组学分析嗜碱菌Halomonas alkalicola CICC 11012s的耐碱机制 | 首次结合蛋白质组学和代谢组学技术研究嗜碱菌的耐碱分子机制,并利用CRISPR技术构建突变体验证tonb基因在耐碱机制中的重要作用 | 研究仅针对Halomonas alkalicola CICC 11012s菌株,未涉及其他嗜碱菌的比较分析 | 探索嗜碱菌对碱性胁迫的响应分子机制 | 嗜碱菌Halomonas alkalicola CICC 11012s及其CRISPR突变体 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学, 代谢组学, CRISPR | NA | 蛋白质组数据, 代谢组数据 | 野生型菌株和CRISPR突变体菌株 |
32 | 2025-05-09 |
Oligonucleotide subsets selection by single nucleotide resolution barcode identification
2025-Feb-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56856-0
PMID:39939320
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研究论文 | 介绍了一种利用序列特异性循环核苷酸合成和模板寡核苷酸阻断的寡核苷酸子集选择方法 | 无需引物进行选择性杂交,能够用少于五个核苷酸的条形码长度编码和选择数百个子集 | NA | 解决复杂寡核苷酸库中子集选择的问题 | 寡核苷酸库 | 合成生物学 | NA | 序列特异性循环核苷酸合成 | NA | NA | NA |
33 | 2025-05-09 |
Efficient Site-Directed Mutagenesis Mediated by Primer Pairs with 3'-Overhangs
2025-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70104
PMID:39945594
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研究论文 | 提出了一种优化的定点诱变方案,利用具有3'端突出部分的引物对提高诱变效率和降低错误率 | 通过部分互补的引物对设计显著提高诱变效率,平均效率达到约50%,部分情况下接近100%的理想阈值 | 未明确说明该方法在不同基因长度或复杂结构区域的适用性 | 开发更高效可靠的定点诱变方法 | 质粒DNA | 分子生物学 | NA | 定点诱变技术 | NA | NA | 每次诱变反应仅需分析3个菌落 |
34 | 2025-05-08 |
Development of a Cell-Free, Toehold Switch-Based Biosensor for Rapid and Sensitive Zika Virus Detection
2025-Feb-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05808
PMID:39924741
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研究论文 | 开发了一种基于无细胞脚趾开关技术的生物传感器,用于快速、灵敏地检测寨卡病毒 | 结合脚趾开关技术和核酸序列扩增技术(NASBA),显著提高了检测灵敏度和特异性 | 脚趾开关在检测低丰度目标时存在固有局限性 | 开发快速、灵敏的寨卡病毒诊断工具 | 寨卡病毒 | 合成生物学 | 传染病 | 脚趾开关技术, 核酸序列扩增技术(NASBA) | NA | 核酸 | NA |
35 | 2025-05-08 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2025-Feb-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98110
PMID:39937081
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research paper | 该研究提出了一种名为'P3编辑'的策略,通过工程化的双组分引导RNA将蛋白质-蛋白质接近性连接到功能性CRISPR-Cas9系统的形成 | 通过工程化crRNA:tracrRNA相互作用,将已知的蛋白质-蛋白质相互作用和化学诱导的二聚化作为激活基因编辑的触发器 | NA | 增强CRISPR基因编辑在合成分子电路中的可控性 | 人类细胞中的基因编辑 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, 双组分引导RNA, ADAR-based RNA传感器 | NA | 分子相互作用数据 | NA |
36 | 2025-05-08 |
Study on the framework of ATP energy cycle system in Escherichia coli
2025-Feb-12, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13350-9
PMID:39937288
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研究论文 | 研究大肠杆菌中ATP能量循环系统的框架,特别是通过CRISPR-Cas9技术进行基因编辑以优化ATP合成路径 | 发现单个ppk基因(No.8)能够完成循环反应,并通过MUCICAT技术将其插入大肠杆菌基因组的不同位置和拷贝数,实现不同活性水平 | 研究仅针对大肠杆菌,未涉及其他生物体,且插入基因的难度和表达水平可能受基因组位置影响 | 开发一种快速、无标记、多位点和多拷贝的基因组编辑系统,以推动合成生物学的发展 | 大肠杆菌及其ATP合成路径中的ppk基因(No.8) | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, MUCICAT | NA | 基因组数据 | NA |
37 | 2025-05-08 |
A synthetic chronogenetic gene circuit for programmed circadian drug delivery
2025-Feb-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56584-5
PMID:39920119
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研究论文 | 开发了一种基于合成生物学和组织工程的昼夜节律基因电路,用于程序化昼夜节律药物递送 | 结合合成生物学和组织工程技术,开发了名为“chronogenetics”的昼夜节律基因电路,能够根据核心时钟基因Period2 (Per2)的启动子表达预设的转基因 | 研究目前仅在体外和小鼠模型中验证,尚未进行人体临床试验 | 开发一种基于细胞的昼夜节律疗法,用于昼夜节律医学中的各种应用 | 诱导多能干细胞、软骨构建物 | 合成生物学、组织工程 | 类风湿性关节炎、炎症性疾病 | 合成生物学、组织工程 | NA | NA | NA |
38 | 2025-05-08 |
The evolution of sequences and spatial conformation in vertebrate chromosomes
2025-Feb, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-212
PMID:39924699
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review | 本文综述了脊椎动物染色体的序列和空间构象的进化过程,探讨了染色体重排在物种形成中的作用、分子机制、进化模式以及性染色体作为研究染色体进化的一般范例的意义 | 利用高通量测序技术革新了对染色体变异的理解,并探讨了合成生物学为染色体进化研究带来的新机遇和挑战 | NA | 理解和研究脊椎动物染色体进化 | 脊椎动物染色体 | 基因组学 | NA | 高通量测序技术 | NA | 基因组数据 | NA |
39 | 2025-05-08 |
Model-guided gene circuit design for engineering genetically stable cell populations in diverse applications
2025-Feb, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0602
PMID:39933591
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研究论文 | 本文提出了一种生物分子控制器,用于在合成生物学中维持工程细胞群体的遗传稳定性 | 开发了一种独立于突变合成基因身份的通用生物分子控制器,可广泛应用于不同合成基因电路而不需重新设计 | 未提及具体的实验验证或实际应用中的潜在问题 | 解决合成生物学中工程细胞群体遗传稳定性问题 | 工程细胞群体 | 合成生物学 | NA | 生物分子控制器设计 | 资源感知细胞模型 | 模拟数据 | NA |
40 | 2025-05-07 |
Spatial Control of CAR T Cell Activation Using Tumor-Homing Polymers
2025-Feb-12, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.4c15442
PMID:39902740
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research paper | 该研究开发了一种名为IMPACT的新框架,通过合成生物学和生物材料方法实现CAR T细胞的空间控制激活 | 提出了IMPACT框架,首次实现了通过聚合物介导的解剖学控制IF-THEN门控CAR T细胞 | 目前仅在鼠类肿瘤模型中进行了验证,尚未在人体中测试 | 提高CAR T细胞疗法的特异性,减少脱靶毒性 | CAR T细胞和肿瘤归巢聚合物 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学和生物材料方法 | IF-THEN门控CAR T细胞 | NA | 鼠类肿瘤模型 |