合成生物学相关文章
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当前共找到 93 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Systematic Characterization and Analysis of the Freeze-Thaw Tolerance Gene Set in the Budding Yeast, Saccharomyces cerevisiae
2025-Feb-27, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26052149
PMID:40076774
|
研究论文 | 本研究系统表征和分析了酿酒酵母中与冻融耐受性相关的基因家族 | 在统一的BY4741实验室菌株遗传背景下，采用标准化协议对冻融耐受基因家族进行完整表征 | 研究仅限于6个基因的分析，且使用KanMX6抗性盒可能产生局部空间效应 | 鉴定能够提高冷冻后存活率的基因修饰 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的冻融耐受基因 | 合成生物学 | NA | 基因工程、表型分析 | NA | 基因表达数据、存活率数据 | 6个冻融耐受基因在BY4741菌株中的分析 | KanMX6 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 22 | 2025-10-05 |
Structural Features of 5' Untranslated Region in Translational Control of Eukaryotes
2025-Feb-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26051979
PMID:40076602
|
综述 | 本文综述了真核生物mRNA的5'非翻译区结构特征及其在翻译调控中的作用机制 | 系统整合了5'UTR中RNA二级结构、核苷酸基序和化学修饰等多元调控元件及其动态调控机制 | NA | 阐明真核生物5'UTR结构特征在翻译调控中的功能机制 | 真核生物mRNA的5'非翻译区 | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物医学 |
| 23 | 2025-10-05 |
Decoding and reengineering the promoter specificity of T7-like RNA polymerases based on phage genome sequences
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf140
PMID:40042813
|
研究论文 | 通过噬菌体基因组挖掘和序列共变分析，解码并重新设计T7样RNA聚合酶的启动子特异性 | 首次通过全面基因组挖掘揭示T7样RNA聚合酶与启动子相互作用的稀疏关键位点网络，并设计出正交性更强的RNAP-启动子变体 | 研究主要聚焦于T7样RNA聚合酶，其他类型ssRNAPs的规则可能有所不同 | 揭示单亚基RNA聚合酶与启动子特异性相互作用的规则，并工程化新型RNAP-启动子对 | 噬菌体单亚基RNA聚合酶及其启动子 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、直接耦合分析、序列共变分析 | NA | 基因组序列、蛋白质序列 | 多种噬菌体基因组中的ssRNAPs启动子 | NA | 噬菌体 | 正交RNAP-启动子变体、新型相互作用对 | 合成生物学 |
| 24 | 2025-10-05 |
[Research progress on biosynthesis of triterpenoids in Centella asiatica]
2025-Feb, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文综述了积雪草三萜皂苷的生物合成研究进展，包括其生物活性、合成途径解析及生物技术生产策略 | 系统总结了多组学、分子生物学和合成生物学在积雪草三萜皂苷生物合成研究中的最新应用进展 | NA | 提高积雪草三萜皂苷产量并促进其野生资源的可持续利用 | 积雪草三萜皂苷（包括积雪草苷、羟基积雪草苷、积雪草酸和羟基积雪草酸） | 合成生物学 | NA | 多组学、分子生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物底盘 | 三萜皂苷生物合成途径 | 医药, 化妆品 |
| 25 | 2025-10-05 |
SHIP identifies genomic safe harbors in eukaryotic organisms using genomic general feature annotation
2025-Feb-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91249-9
PMID:40021804
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研究论文 | 开发了一种名为SHIP的算法，用于系统识别真核生物中的基因组安全港位点 | 首次提出基于基因组通用特征注释的系统性GSH识别算法，突破了传统经验方法的局限 | 目前仅在酿酒酵母中进行了实验验证，在其他真核生物中的适用性需要进一步验证 | 开发系统性识别基因组安全港位点的工具，满足合成生物学对多基因模块研究的需求 | 真核生物的基因组安全港位点 | 合成生物学 | NA | DNA测序、流式细胞术、qPCR、电子显微镜、RT-qPCR、RNA-Seq | SHIP算法 | 基因组注释数据、测序数据 | 在酿酒酵母中实验验证了5个GSH位点 | 基因组工程 | 酿酒酵母 | 基因组安全港位点整合系统 | 工业生物技术 |
| 26 | 2025-10-05 |
Remodeling of lipid-foam prototissues by network-wide tension fluctuations induced by active particles
2025-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57178-x
PMID:40016255
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研究论文 | 本研究开发了一种基于脂质的毫米级泡沫状组织模拟物，通过整合活性细菌实现了组织张力的网络级波动和结构重塑 | 首次在脂质泡沫原型组织中实现了由游泳细菌驱动的网络级张力波动，促进了原型组织的流体化和重组 | 未明确说明原型组织的长期稳定性及在复杂生物环境中的应用限制 | 开发具有重塑能力的合成原型组织，用于理解和模拟生物组织 | 脂质泡沫组织模拟物及其与细菌的相互作用 | 合成生物学 | NA | 脂质双层自组装技术 | NA | 结构特性数据、力学性能数据 | NA | 自下而上合成生物学方法 | 细菌 | 基于脂质双层的微米级隔室网络结构 | 医学, 基础生物学研究 |
| 27 | 2025-10-05 |
Dsembler - DNA Assembly Designer: A Tool for Facilitating Assembly of Oligomers
2025-Feb-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2412.12046
PMID:40016135
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研究论文 | 介绍一款名为Dsembler的网页软件工具，用于优化DNA组装设计并促进寡核苷酸组装 | 开发了能提供最佳解链温度和GC重叠的寡核苷酸组设计工具，解决了合成生物学中寡聚体组装的关键难题 | NA | 开发促进DNA组装设计的软件工具，解决合成生物学中的基因组装挑战 | DNA序列组装和寡核苷酸设计 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 28 | 2025-10-05 |
CAR-NK cells with dual targeting of PD-L1 and MICA/B in lung cancer tumor models
2025-Feb-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13780-2
PMID:40000974
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研究论文 | 本研究设计了一种靶向PD-L1和MICA/B的双靶向CAR-NK细胞，并在肺癌模型中验证其疗效 | 首次设计并验证了同时靶向PD-L1和MICA/B的双靶向CAR结构，可诱导肿瘤细胞焦亡 | 研究仅限于H1299肺癌细胞模型，尚未在其他癌症类型中验证 | 开发新型CAR-NK细胞免疫疗法用于肺癌治疗 | NK92细胞和人类肺癌H1299细胞 | 合成生物学 | 肺癌 | CAR工程技术、细胞共培养、动物模型 | NA | 细胞实验数据、动物实验数据 | NK92细胞系和H1299肺癌细胞系 | 合成生物学方法 | NK92细胞（人类自然杀伤细胞系） | 双靶向CAR结构，包含PD-L1纳米抗体和NKG2D作为胞外域，CD28跨膜区和胞内域，4-1BB和CD3ζ胞内域 | 医学 |
| 29 | 2025-10-05 |
A concise enzyme cascade enables the manufacture of natural and halogenated protoberberine alkaloids
2025-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57280-0
PMID:39988594
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研究论文 | 设计简洁酶级联反应从廉价底物高效生产天然和非天然原小檗碱生物碱 | 通过酶发现与工程改造，系统性优化小檗碱桥酶，实现药物罗通定的克级规模高效生产，并能生物合成多种非天然卤代原小檗碱生物碱 | NA | 解决植物源天然产物含量低和结构多样性不足的限制，开发高效生物合成方法 | 原小檗碱生物碱（包括天然和非天然卤代衍生物） | 合成生物学 | NA | 酶工程、酶级联反应、生物合成 | NA | NA | NA | 酶工程 | NA | 酶级联反应系统 | 医药、工业生物技术 |
| 30 | 2025-10-05 |
Marine Phytoplankton Bioactive Lipids and Their Perspectives in Clinical Inflammation
2025-Feb-17, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23020086
PMID:39997210
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综述 | 本文综述海洋浮游植物中具有免疫调节功能的生物活性脂质及其在临床炎症治疗中的应用前景 | 提出将海洋浮游植物作为生物技术平台生产功能性脂质，并探讨通过合成生物学方法增强其光驱动生物合成 | NA | 探讨海洋浮游植物源生物活性脂质在慢性炎症疾病治疗中的应用潜力 | 真核海洋浮游植物及其产生的生物活性脂质 | 合成生物学 | 慢性炎症疾病 | 遗传工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | 异源生物合成途径 | 医药 |
| 31 | 2025-10-05 |
Direct Cloning and Heterologous Expression of the Dmxorosin Biosynthetic Gene Cluster from Streptomyces thermolilacinus SPC6, a Halotolerant Actinomycete Isolated from the Desert in China
2025-Feb-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041492
PMID:40003958
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研究论文 | 从中国沙漠分离的耐盐放线菌SPC6中直接克隆并异源表达dmxorosin生物合成基因簇 | 成功克隆并异源表达了一个完全沉默的隐蔽生物合成基因簇，发现了一种新型羊毛硫肽dmxorosin | NA | 挖掘耐盐放线菌中次级代谢产物的生物合成潜力 | 链霉菌SPC6菌株及其次级代谢产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、直接克隆、异源表达 | NA | 基因组数据、代谢产物数据 | 1株链霉菌SPC6 | 直接克隆 | 链霉菌SPC6, 异源表达宿主 | 羊毛硫肽生物合成基因簇 | 医药 |
| 32 | 2025-10-05 |
Advanced Technologies for Large Scale Supply of Marine Drugs
2025-Feb-07, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23020069
PMID:39997193
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综述 | 全面探讨海洋天然产物的规模化生产策略及其在药物开发中的应用 | 结合传统方法与现代合成生物学策略解决海洋无脊椎动物天然产物供应难题 | NA | 解决海洋天然产物规模化供应的挑战并探索新型生产策略 | 海洋天然产物（MNPs）及其生产方法 | NA | NA | 合成生物学、生物合成 | NA | NA | NA | NA | 细菌、真菌、微藻、海洋大型生物 | NA | 医药 |
| 33 | 2025-10-05 |
Advancing cellulose utilization and engineering consolidated bioprocessing yeasts: current state and perspectives
2025-Feb-13, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13426-0
PMID:39939397
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综述 | 本文综述了酿酒酵母中纤维素酶表达策略及理性设计优化CBP菌株的最新进展 | 系统总结了通过现代合成生物学工具优化CBP酵母菌株的理性设计策略 | 目前一步法转化纤维素底物为乙醇的滴度和生产率远低于工业要求 | 开发能够将木质纤维素生物质转化为生物燃料和绿色化学品的CBP酵母菌株 | 酿酒酵母及其纤维素酶表达系统 | 合成生物学 | NA | 组学策略、理性菌株设计 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 酿酒酵母 | 纤维素酶表达系统、核心纤维素酶组合 | 能源, 工业生物技术 |
| 34 | 2025-10-05 |
Analysis of the Alkaline Resistance Mechanism of Halomonas alkalicola CICC 11012 s by Proteomics and Metabolomics
2025-Feb-13, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-024-04056-2
PMID:39945829
|
研究论文 | 通过蛋白质组学和代谢组学联合分析探究嗜碱盐单胞菌CICC 11012s的碱性抗性分子机制 | 首次结合蛋白质组学和代谢组学技术系统揭示嗜碱盐单胞菌应对碱性胁迫的多层次适应策略 | NA | 研究嗜碱盐单胞菌对极端碱性环境的耐受机制 | 嗜碱盐单胞菌CICC 11012s野生型及tonb基因突变株 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学,代谢组学,CRISPR | NA | 蛋白质组数据,代谢组数据 | 野生型和突变株菌株 | CRISPR-Cas9 | Halomonas alkalicola | tonb基因突变体 | 工业生物技术,环境治理 |
| 35 | 2025-10-05 |
Oligonucleotide subsets selection by single nucleotide resolution barcode identification
2025-Feb-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56856-0
PMID:39939320
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研究论文 | 提出一种基于单核苷酸分辨率条形码识别的寡核苷酸子集选择方法 | 采用序列特异性循环核苷酸合成和模板寡核苷酸阻断技术，无需引物即可实现选择性杂交，且能用少于五个核苷酸的条形码编码选择数百个子集 | NA | 开发可扩展且经济高效的复杂寡核苷酸文库处理方法 | 寡核苷酸文库 | 合成生物学 | NA | 循环核苷酸合成、模板阻断技术 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 基因组学, 合成生物学, DNA数据存储 |
| 36 | 2025-10-05 |
Efficient Site-Directed Mutagenesis Mediated by Primer Pairs with 3'-Overhangs
2025-Feb, Current protocols
DOI:10.1002/cpz1.70104
PMID:39945594
|
研究论文 | 提出一种通过3'-突出末端引物对介导的优化定点诱变方法 | 利用部分互补的3'-突出末端引物对提高诱变效率并降低错误率 | NA | 开发更高效可靠的定点诱变方法 | 质粒DNA | 合成生物学 | NA | 定点诱变 | NA | NA | 每个诱变反应仅需分析3个菌落 | Gibson Assembly | DH5α大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 37 | 2025-10-05 |
Development of a Cell-Free, Toehold Switch-Based Biosensor for Rapid and Sensitive Zika Virus Detection
2025-Feb-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05808
PMID:39924741
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研究论文 | 开发了一种基于无细胞系统和脚趾开关技术的寨卡病毒生物传感器，结合NASBA扩增技术实现高灵敏检测 | 将脚趾开关技术与NASBA扩增技术相结合，显著提高了检测灵敏度，达到2.9 aM的检测限 | 脚趾开关技术在检测低丰度靶标方面存在固有局限性 | 开发快速、灵敏的寨卡病毒诊断工具 | 寨卡病毒 | 合成生物学 | 传染病 | 脚趾开关技术, NASBA核酸扩增 | 生物传感器 | 核酸序列 | NA | 脚趾开关 | 无细胞系统 | 脚趾开关基因表达调控系统，生物传感器 | 医学诊断 |
| 38 | 2025-10-05 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2025-Feb-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98110
PMID:39937081
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研究论文 | 开发了一种基于工程化双组分引导RNA的分子邻近传感器，将蛋白质相互作用与CRISPR-Cas9基因编辑功能相连接 | 通过工程化crRNA与tracrRNA的相互作用，首次实现将蛋白质邻近性作为CRISPR基因编辑的触发机制 | 研究仅在人类细胞中进行验证，尚未在更复杂生物系统中测试 | 开发可编程的合成分子电路，将分子事件与基因组编辑相连接 | 蛋白质-蛋白质相互作用、化学诱导二聚化、RNA传感器 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9、prime editing、base editing、ADAR-based RNA传感器 | NA | 分子生物学数据 | 人类细胞实验 | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 双组分引导RNA系统、蛋白质邻近传感器、合成分子电路 | 医学、工业生物技术 |
| 39 | 2025-10-05 |
Study on the framework of ATP energy cycle system in Escherichia coli
2025-Feb-12, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-024-13350-9
PMID:39937288
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研究论文 | 本研究开发了基于CRISPR的大肠杆菌快速、无标记、多位点多拷贝基因组编辑系统，探索ATP能量循环系统的构建 | 发现单个ppk基因(No.8)可完成AMP-ATP循环反应，并利用MUCICAT技术实现基因组多位点插入 | 研究仅针对大肠杆菌系统，未在其他生物体中验证 | 开发高效的大肠杆菌基因组编辑系统以推进合成生物学应用 | 大肠杆菌ATP合成通路基因及基因组编辑技术 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, MUCICAT, 基因编辑 | NA | 基因表达数据 | 多种插入位置和拷贝数的大肠杆菌菌株 | CRISPR-Cas9 | E. coli | AMP-ATP循环系统，代谢通路工程 | 工业生物技术 |
| 40 | 2025-10-05 |
A synthetic chronogenetic gene circuit for programmed circadian drug delivery
2025-Feb-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56584-5
PMID:39920119
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研究论文 | 开发了一种基于合成生物学的时序遗传基因回路，用于实现程序化昼夜节律药物递送 | 首次结合合成生物学和组织工程开发了称为'时序遗传学'的昼夜节律基因回路，能够根据生物钟基因Per2的表达节律程序化释放治疗药物 | 目前仅在体外和动物模型中验证，尚未进行人体临床试验 | 开发基于细胞的时间遗传疗法，用于昼夜节律医学的各种应用 | 类风湿关节炎和其他炎症性疾病 | 合成生物学 | 类风湿关节炎 | 合成生物学、组织工程 | NA | NA | NA | 基因回路设计 | 诱导多能干细胞 | 基于核心时钟基因Period2启动子的时序遗传基因回路，可程序化表达治疗性转基因 | 医学 |