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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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41 | 2025-02-27 |
DNAdesign: feature-aware in silico design of synthetic DNA through mutation
2025-02-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf052
PMID:39891349
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研究论文 | DNAdesign是一个基于网络的工具,用于基于DNA序列和形状特征比较和设计突变 | DNAdesign能够同时考虑序列突变引起的不同读取模式的改变,提供基于DNA序列和形状特征的突变设计 | NA | 研究基因调控和合成生物学应用,如设计合成增强子和转录因子结合位点 | DNA序列和形状特征 | 生物信息学 | NA | Deep DNAshape | NA | DNA序列 | NA |
42 | 2025-02-27 |
Suppression of amber stop codons impairs pathogenicity in Salmonella
2025-Feb, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.15075
PMID:39666825
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研究论文 | 本文研究了UAG(琥珀)终止密码子的抑制如何影响沙门氏菌的致病性 | 揭示了UAG终止密码子抑制对沙门氏菌致病性的选择性影响,特别是对SPI-1基因表达的减弱作用 | 未探讨UGA和UAA终止密码子抑制对沙门氏菌致病性的影响 | 探讨终止密码子抑制对细菌致病性的影响 | 沙门氏菌 | 合成生物学 | 细菌感染 | 系统遗传和生化分析 | NA | NA | NA |
43 | 2025-02-27 |
Harnessing the biology of regulatory T cells to treat disease
2025-02, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-024-01089-x
PMID:39681737
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综述 | 本文综述了调节性T细胞(Treg细胞)在治疗疾病中的潜力,包括增强或抑制Treg细胞活性的临床试验进展 | 探讨了利用纳米医学和合成生物学进展来精确调控Treg细胞功能的新一代临床试验 | 现有临床试验仍存在重要局限性和未解答的问题 | 探讨调节性T细胞在治疗多种疾病中的应用 | 调节性T细胞(Treg细胞) | 免疫学 | 过敏、移植、自身免疫疾病、癌症 | NA | NA | NA | NA |
44 | 2025-02-26 |
Living Fiber Dispersions from Mycelium as a New Sustainable Platform for Advanced Materials
2025-Feb-25, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202418464
PMID:39998258
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研究论文 | 本文提出了一种从菌丝体生成活纤维分散体(LFD)的可持续方法,结合了生物聚合物纤维的优异材料形成特性和活材料的高度动态特性 | 提出了一种新的可持续方法,通过工业可用的液体培养和机械解纤方法生成分散良好的活菌丝体纤维,展示了在无需添加营养的情况下通过生长利用动态特性的能力 | 未明确提及具体限制 | 开发可持续的先进材料平台 | 菌丝体纤维 | 材料科学 | NA | 液体培养和机械解纤方法 | NA | NA | NA |
45 | 2025-02-24 |
Pepticombisomes: Biomimetic Vesicles Crafted From Recombinant Supercharged Polypeptides with Uniformly Distributed Side-Chains
2025-Feb-22, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411497
PMID:39985267
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研究论文 | 本文介绍了一种新型仿生囊泡——pepticombisomes,由重组超带电多肽与均匀分布的侧链制成,用于模拟细胞膜的功能 | 提出了pepticombs作为超分子构建模块,通过精确控制分子拓扑结构,实现了膜厚度和灵活性的精确模拟,超越了传统的聚合物囊泡 | 未提及具体应用场景或实验验证的局限性 | 研究目的是开发一种能够精确模拟细胞膜特性的新型仿生囊泡 | 研究对象是pepticombs及其形成的pepticombisomes囊泡 | 合成生物学 | NA | 显微镜技术和分子动力学模拟 | NA | NA | NA |
46 | 2025-02-24 |
Interchromosomal contacts between regulatory regions trigger stable transgenerational epigenetic inheritance in Drosophila
2025-Feb-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.11.021
PMID:39667935
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研究论文 | 本文研究了果蝇中跨代表观遗传的机制,特别是通过染色质接触建立的表观遗传记忆 | 揭示了转录因子结合位点突变对跨代表观遗传的影响,以及染色质接触在建立跨代表观遗传记忆中的作用 | 研究仅限于果蝇模型,未涉及其他生物或更复杂的遗传背景 | 探讨果蝇中跨代表观遗传的分子机制 | 果蝇的Fab-7调控元件及其同源位点 | 遗传学 | NA | 合成生物学系统 | NA | 遗传和表观遗传数据 | NA |
47 | 2025-02-23 |
Framing synthetic biology as an innovation-driven market
2025-Feb-20, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.003
PMID:39984349
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研究论文 | 本文提出了一个合成生物学市场的框架,以促进对其商业潜力的共同理解 | 提出了一个区分合成生物学专业市场与更广泛产品市场的框架 | 未提及具体的数据支持或案例研究 | 探讨合成生物学市场的商业潜力 | 合成生物学市场 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
48 | 2025-02-23 |
p-Hydroxycinnamic Acids: Advancements in Synthetic Biology, Emerging Regulatory Targets in Gut Microbiota Interactions, and Implications for Animal Health
2025-Feb-01, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.01.034
PMID:39900184
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综述 | 本文综述了对羟基肉桂酸(p-HCAs)在合成生物学中的进展、与肠道微生物群的相互作用及其对动物健康的影响 | 强调了对羟基肉桂酸与肠道微生物群相互作用的复杂机制,并探讨了其在合成生物学中的进展 | NA | 探讨对羟基肉桂酸与肠道微生物群的相互作用及其对动物健康的影响 | 对羟基肉桂酸(p-HCAs)及其与肠道微生物群的相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
49 | 2025-02-22 |
A Nitrate/Nitrite Biosensor Designed with an Antiterminator for In Vivo Diagnosis of Colitis Based on Bacteroides thetaiotaomicron
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00602
PMID:39801064
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Bacteroides thetaiotaomicron的抗终止子微生物全细胞生物传感器,用于检测小鼠结肠炎 | 创新点在于使用抗终止子元件使生物传感器能够在炎症环境中响应硝酸盐和亚硝酸盐,从而检测结肠炎 | 研究中未提及生物传感器的长期稳定性和在人体中的应用效果 | 开发一种基于Bacteroides thetaiotaomicron的生物传感器,用于诊断结肠炎 | Bacteroides thetaiotaomicron和小鼠模型 | 合成生物学 | 结肠炎 | 微生物全细胞生物传感器技术 | 抗终止子元件 | 生物传感器响应数据 | 化学诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型 |
50 | 2025-02-22 |
Microbial Production of Ectoine: A Review
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00490
PMID:39834017
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综述 | 本文综述了微生物生产ectoine的策略,包括野生菌株筛选、突变育种和模型菌株的代谢工程 | 探讨了利用合成生物学和代谢工程技术替代传统嗜盐细菌生产ectoine的方法,以实现更高产量和更环保的生产 | NA | 探索更经济有效的ectoine生产方法,以满足市场需求 | ectoine的生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |
51 | 2025-02-22 |
DRIMS: A Synthetic Biology Platform that Enables Deletion, Replacement, Insertion, Mutagenesis, and Synthesis of DNA
2025-Feb-21, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00649
PMID:39902634
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DRIMS的合成生物学平台,该平台能够实现DNA的删除、替换、插入、突变和合成 | DRIMS平台通过PCR技术实现了DNA的多种修改和合成,且不依赖于recA重组途径,简化了操作流程并降低了成本 | 虽然DRIMS平台展示了其在DNA修改和合成方面的效率,但文中未提及其在更复杂或大规模应用中的表现 | 开发一种高效、简单且成本效益高的DNA修改和合成平台,以加速合成生物学领域的发展和治疗策略的开发 | DNA片段,包括不同大小的DNA片段、DNA结合序列、嵌合抗原受体组件、人工microRNAs和高GC含量的DNA序列 | 合成生物学 | 癌症 | PCR | NA | DNA序列 | 包括四种删除、六十四种替换、四种嵌合抗原受体组件替换、五十一种人工microRNA插入、五种点突变和八种DNA序列合成 |
52 | 2025-02-22 |
Cleavable donor-assisted CRISPR/Cas9 system significantly improves the efficiency of large DNA insertion in Physcomitrium patens
2025-Feb, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70020
PMID:39981890
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研究论文 | 本研究开发了一种体内可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统,显著提高了在苔藓植物Physcomitrium patens中插入大片段DNA的效率 | 开发了体内可切割供体辅助的CRISPR/Cas9系统,显著提高了大片段DNA插入的效率 | 研究主要针对苔藓植物Physcomitrium patens,尚未在其他作物中验证其适用性 | 提高CRISPR/Cas9系统在大片段DNA插入中的效率 | 苔藓植物Physcomitrium patens | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9 | NA | DNA序列 | 两种不同的sgRNA和四种不同的DNA插入片段 |
53 | 2025-02-21 |
Questions and Consequences of Omics in Genetically Engineered Crop Regulation
2025-Feb, Plant-environment interactions (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/pei3.70033
PMID:39967832
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研究论文 | 本文探讨了将组学技术整合到基因编辑和合成生物学作物监管系统中的问题和后果 | 提出了需要回答的一系列问题,以将组学实验和数据整合到作物监管系统中,并强调了这些问题的科学有效性和监管负担 | 未具体说明组学技术在监管系统中应用的具体技术挑战或数据限制 | 探讨组学技术在基因编辑和合成生物学作物监管中的应用 | 基因编辑和合成生物学作物 | 生物技术 | NA | 组学技术 | NA | 组学数据 | NA |
54 | 2025-02-20 |
Chemistry and biology of natural stilbenes: an update
2025-Feb-19, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00033a
PMID:39711130
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综述 | 本文更新了关于天然二苯乙烯类化合物的化学和生物学研究,特别关注了寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性 | 系统综述了2009年至2023年间新发现的409种二苯乙烯类化合物,特别是寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性,并探讨了其作为新药研究先导化合物的潜力 | 主要集中于2009年至2023年的研究,可能未涵盖更早期的重要发现 | 探讨天然二苯乙烯类化合物,特别是寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性,以寻找新药研究的先导化合物 | 天然二苯乙烯类化合物,特别是寡聚二苯乙烯 | 化学与生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 化学结构数据 | 409种新二苯乙烯类化合物 |
55 | 2025-02-20 |
A synthetic platform for developing recombinant adeno-associated virus type 8 producer cell lines
2025-Feb-19, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70009
PMID:39968660
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研究论文 | 本研究建立了一个基于合成生物学的平台,用于构建稳定的重组腺相关病毒8型(rAAV8)生产细胞系 | 将rAAV2细胞系构建管道扩展到rAAV8,并成功生成四个rAAV8生产细胞系,通过调整诱导条件提高病毒颗粒产量 | rAAV8生产细胞系的产量仍低于传统的三重质粒转染方法,Cap蛋白生产和衣壳形成是潜在的限制因素 | 开发适用于不同AAV血清型的rAAV生产细胞系平台 | 重组腺相关病毒8型(rAAV8)生产细胞系 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | 四个rAAV8生产细胞系(VH1-4) |
56 | 2025-02-20 |
Efficient expression of recombinant proteins in Bacillus subtilis using a rewired gene circuit of quorum sensing
2025-Feb-19, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70007
PMID:39968680
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研究论文 | 本研究在枯草芽孢杆菌中重构了来自Aliivibrio fischeri的LuxRI群体感应系统,以实现与细胞生长协调的蛋白质过量生产 | 通过重构LuxRI群体感应系统并优化启动子,实现了在枯草芽孢杆菌中细胞密度依赖的蛋白质过量生产,超越了常用的启动子系统 | 研究中未提及该系统在不同环境条件下的稳定性和适应性 | 提高枯草芽孢杆菌中重组蛋白的生产效率 | 枯草芽孢杆菌 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统重构、启动子工程 | NA | NA | NA |
57 | 2025-02-20 |
Morphology remodelling and membrane channel formation in synthetic cells via reconfigurable DNA nanorafts
2025-Feb, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-024-02075-9
PMID:39805958
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研究论文 | 本文构建了一个由信号响应性DNA纳米筏、生物孔和巨型单层囊泡(GUVs)组成的合成细胞模型,展示了纳米尺度上DNA筏的重塑如何与微尺度上GUVs的重塑相耦合 | 通过可重构的DNA纳米筏实现了合成细胞形态的重塑和膜通道的形成,扩展了DNA纳米技术在合成生物学中的应用潜力 | NA | 探索DNA纳米结构在合成细胞形态重塑和膜通道形成中的应用 | 合成细胞模型,包括DNA纳米筏、生物孔和巨型单层囊泡(GUVs) | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA |
58 | 2025-02-19 |
Development of a Cell-Free, Toehold Switch-Based Biosensor for Rapid and Sensitive Zika Virus Detection
2025-Feb-18, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.4c05808
PMID:39924741
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研究论文 | 本研究开发了一种基于toehold开关技术的无细胞生物传感器,结合核酸序列扩增技术(NASBA),用于快速、灵敏地检测寨卡病毒 | 该研究创新性地将toehold开关技术与NASBA技术结合,显著提高了检测灵敏度,达到了2.9 aM的检测限,解决了toehold开关在检测低丰度目标时的固有局限性 | 研究中未提及该检测系统在实际临床样本中的应用效果,可能需要在更广泛的样本中进行验证 | 开发一种快速、灵敏的寨卡病毒检测工具 | 寨卡病毒 | 合成生物学 | 传染病 | toehold开关技术,核酸序列扩增技术(NASBA) | NA | 核酸序列 | 未提及具体样本数量 |
59 | 2025-02-19 |
Synthetic Biomolecular Condensates: Phase-Separation Control, Cytomimetic Modelling and Emerging Biomedical Potential
2025-Feb-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202418431
PMID:39575859
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综述 | 本文综述了合成共聚物液滴在合成生物学、材料科学和生物医学领域的最新进展,重点介绍了其仿生结构和动态控制,以及在催化中心和递送载体方面的应用 | 本文强调了合成共聚物液滴在仿生结构和动态控制方面的创新设计,以及其在催化中心和递送载体中的独特应用 | 本文为综述性文章,未涉及具体实验数据或样本分析,因此缺乏对新技术的具体验证和局限性讨论 | 探讨合成共聚物液滴在仿生结构设计、动态控制及其在生物医学和材料科学中的应用潜力 | 合成共聚物液滴及其仿生结构和动态控制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
60 | 2025-02-19 |
A meta-analysis of the gut microbiome in inflammatory bowel disease patients identifies disease-associated small molecules
2025-Feb-12, Cell host & microbe
IF:20.6Q1
DOI:10.1016/j.chom.2025.01.002
PMID:39947133
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meta-analysis | 本文通过对炎症性肠病(IBD)患者和健康对照组的肠道微生物组进行元分析,识别出与克罗恩病(CD)显著相关的两种梭菌衍生的小分子生物合成基因簇(BGCs),并发现这些基因簇产生的六种脂肪酸酰胺在IBD患者的粪便样本中检测到 | 首次通过元分析识别出与克罗恩病相关的特定微生物组小分子,并揭示了这些分子在肠道通透性和疾病恶化中的作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证这些分子的具体作用机制 | 探索肠道微生物组小分子在炎症性肠病(IBD)中的分子和功能作用 | 炎症性肠病(IBD)患者和健康对照组的肠道微生物组 | 微生物组学 | 炎症性肠病 | 元分析、合成生物学 | NA | 宏基因组数据 | IBD患者和健康对照组的肠道微生物组样本 |