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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Structural Features of 5' Untranslated Region in Translational Control of Eukaryotes
2025-Feb-25, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26051979
PMID:40076602
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综述 | 本文综述了真核生物mRNA的5'非翻译区结构特征及其在翻译调控中的作用机制 | 系统整合了5'UTR中RNA二级结构、核苷酸基序和化学修饰等多元调控元件及其动态调控机制 | NA | 阐明真核生物5'UTR结构特征在翻译调控中的功能机制 | 真核生物mRNA的5'非翻译区 | 分子生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 生物医学 |
| 42 | 2025-10-05 |
Decoding and reengineering the promoter specificity of T7-like RNA polymerases based on phage genome sequences
2025-Feb-27, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf140
PMID:40042813
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研究论文 | 通过噬菌体基因组挖掘和序列共变分析,解码并重新设计T7样RNA聚合酶的启动子特异性 | 首次通过全面基因组挖掘揭示T7样RNA聚合酶与启动子相互作用的稀疏关键位点网络,并设计出正交性更强的RNAP-启动子变体 | 研究主要聚焦于T7样RNA聚合酶,其他类型ssRNAPs的规则可能有所不同 | 揭示单亚基RNA聚合酶与启动子特异性相互作用的规则,并工程化新型RNAP-启动子对 | 噬菌体单亚基RNA聚合酶及其启动子 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、直接耦合分析、序列共变分析 | NA | 基因组序列、蛋白质序列 | 多种噬菌体基因组中的ssRNAPs启动子 | NA | 噬菌体 | 正交RNAP-启动子变体、新型相互作用对 | 合成生物学 |
| 43 | 2025-10-05 |
[Research progress on biosynthesis of triterpenoids in Centella asiatica]
2025-Feb, Zhongguo Zhong yao za zhi = Zhongguo zhongyao zazhi = China journal of Chinese materia medica
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综述 | 本文综述了积雪草三萜皂苷的生物合成研究进展,包括其生物活性、合成途径解析及生物技术生产策略 | 系统总结了多组学、分子生物学和合成生物学在积雪草三萜皂苷生物合成研究中的最新应用进展 | NA | 提高积雪草三萜皂苷产量并促进其野生资源的可持续利用 | 积雪草三萜皂苷(包括积雪草苷、羟基积雪草苷、积雪草酸和羟基积雪草酸) | 合成生物学 | NA | 多组学、分子生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物底盘 | 三萜皂苷生物合成途径 | 医药, 化妆品 |
| 44 | 2025-10-05 |
SHIP identifies genomic safe harbors in eukaryotic organisms using genomic general feature annotation
2025-Feb-28, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-91249-9
PMID:40021804
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研究论文 | 开发了一种名为SHIP的算法,用于系统识别真核生物中的基因组安全港位点 | 首次提出基于基因组通用特征注释的系统性GSH识别算法,突破了传统经验方法的局限 | 目前仅在酿酒酵母中进行了实验验证,在其他真核生物中的适用性需要进一步验证 | 开发系统性识别基因组安全港位点的工具,满足合成生物学对多基因模块研究的需求 | 真核生物的基因组安全港位点 | 合成生物学 | NA | DNA测序、流式细胞术、qPCR、电子显微镜、RT-qPCR、RNA-Seq | SHIP算法 | 基因组注释数据、测序数据 | 在酿酒酵母中实验验证了5个GSH位点 | 基因组工程 | 酿酒酵母 | 基因组安全港位点整合系统 | 工业生物技术 |
| 45 | 2025-10-05 |
Remodeling of lipid-foam prototissues by network-wide tension fluctuations induced by active particles
2025-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57178-x
PMID:40016255
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研究论文 | 本研究开发了一种基于脂质的毫米级泡沫状组织模拟物,通过整合活性细菌实现了组织张力的网络级波动和结构重塑 | 首次在脂质泡沫原型组织中实现了由游泳细菌驱动的网络级张力波动,促进了原型组织的流体化和重组 | 未明确说明原型组织的长期稳定性及在复杂生物环境中的应用限制 | 开发具有重塑能力的合成原型组织,用于理解和模拟生物组织 | 脂质泡沫组织模拟物及其与细菌的相互作用 | 合成生物学 | NA | 脂质双层自组装技术 | NA | 结构特性数据、力学性能数据 | NA | 自下而上合成生物学方法 | 细菌 | 基于脂质双层的微米级隔室网络结构 | 医学, 基础生物学研究 |
| 46 | 2025-10-05 |
Dsembler - DNA Assembly Designer: A Tool for Facilitating Assembly of Oligomers
2025-Feb-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2412.12046
PMID:40016135
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研究论文 | 介绍一款名为Dsembler的网页软件工具,用于优化DNA组装设计并促进寡核苷酸组装 | 开发了能提供最佳解链温度和GC重叠的寡核苷酸组设计工具,解决了合成生物学中寡聚体组装的关键难题 | NA | 开发促进DNA组装设计的软件工具,解决合成生物学中的基因组装挑战 | DNA序列组装和寡核苷酸设计 | 合成生物学 | NA | DNA组装技术 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 医药 |
| 47 | 2025-10-05 |
CAR-NK cells with dual targeting of PD-L1 and MICA/B in lung cancer tumor models
2025-Feb-25, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-13780-2
PMID:40000974
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研究论文 | 本研究设计了一种靶向PD-L1和MICA/B的双靶向CAR-NK细胞,并在肺癌模型中验证其疗效 | 首次设计并验证了同时靶向PD-L1和MICA/B的双靶向CAR结构,可诱导肿瘤细胞焦亡 | 研究仅限于H1299肺癌细胞模型,尚未在其他癌症类型中验证 | 开发新型CAR-NK细胞免疫疗法用于肺癌治疗 | NK92细胞和人类肺癌H1299细胞 | 合成生物学 | 肺癌 | CAR工程技术、细胞共培养、动物模型 | NA | 细胞实验数据、动物实验数据 | NK92细胞系和H1299肺癌细胞系 | 合成生物学方法 | NK92细胞(人类自然杀伤细胞系) | 双靶向CAR结构,包含PD-L1纳米抗体和NKG2D作为胞外域,CD28跨膜区和胞内域,4-1BB和CD3ζ胞内域 | 医学 |
| 48 | 2025-10-05 |
A concise enzyme cascade enables the manufacture of natural and halogenated protoberberine alkaloids
2025-Feb-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-57280-0
PMID:39988594
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研究论文 | 设计简洁酶级联反应从廉价底物高效生产天然和非天然原小檗碱生物碱 | 通过酶发现与工程改造,系统性优化小檗碱桥酶,实现药物罗通定的克级规模高效生产,并能生物合成多种非天然卤代原小檗碱生物碱 | NA | 解决植物源天然产物含量低和结构多样性不足的限制,开发高效生物合成方法 | 原小檗碱生物碱(包括天然和非天然卤代衍生物) | 合成生物学 | NA | 酶工程、酶级联反应、生物合成 | NA | NA | NA | 酶工程 | NA | 酶级联反应系统 | 医药、工业生物技术 |
| 49 | 2025-10-05 |
Marine Phytoplankton Bioactive Lipids and Their Perspectives in Clinical Inflammation
2025-Feb-17, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23020086
PMID:39997210
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综述 | 本文综述海洋浮游植物中具有免疫调节功能的生物活性脂质及其在临床炎症治疗中的应用前景 | 提出将海洋浮游植物作为生物技术平台生产功能性脂质,并探讨通过合成生物学方法增强其光驱动生物合成 | NA | 探讨海洋浮游植物源生物活性脂质在慢性炎症疾病治疗中的应用潜力 | 真核海洋浮游植物及其产生的生物活性脂质 | 合成生物学 | 慢性炎症疾病 | 遗传工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | 异源生物合成途径 | 医药 |
| 50 | 2025-10-05 |
Direct Cloning and Heterologous Expression of the Dmxorosin Biosynthetic Gene Cluster from Streptomyces thermolilacinus SPC6, a Halotolerant Actinomycete Isolated from the Desert in China
2025-Feb-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041492
PMID:40003958
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研究论文 | 从中国沙漠分离的耐盐放线菌SPC6中直接克隆并异源表达dmxorosin生物合成基因簇 | 成功克隆并异源表达了一个完全沉默的隐蔽生物合成基因簇,发现了一种新型羊毛硫肽dmxorosin | NA | 挖掘耐盐放线菌中次级代谢产物的生物合成潜力 | 链霉菌SPC6菌株及其次级代谢产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、直接克隆、异源表达 | NA | 基因组数据、代谢产物数据 | 1株链霉菌SPC6 | 直接克隆 | 链霉菌SPC6, 异源表达宿主 | 羊毛硫肽生物合成基因簇 | 医药 |
| 51 | 2025-10-05 |
Advanced Technologies for Large Scale Supply of Marine Drugs
2025-Feb-07, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23020069
PMID:39997193
|
综述 | 全面探讨海洋天然产物的规模化生产策略及其在药物开发中的应用 | 结合传统方法与现代合成生物学策略解决海洋无脊椎动物天然产物供应难题 | NA | 解决海洋天然产物规模化供应的挑战并探索新型生产策略 | 海洋天然产物(MNPs)及其生产方法 | NA | NA | 合成生物学、生物合成 | NA | NA | NA | NA | 细菌、真菌、微藻、海洋大型生物 | NA | 医药 |
| 52 | 2025-10-05 |
Analysis of the Alkaline Resistance Mechanism of Halomonas alkalicola CICC 11012 s by Proteomics and Metabolomics
2025-Feb-13, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-024-04056-2
PMID:39945829
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研究论文 | 通过蛋白质组学和代谢组学联合分析探究嗜碱盐单胞菌CICC 11012s的碱性抗性分子机制 | 首次结合蛋白质组学和代谢组学技术系统揭示嗜碱盐单胞菌应对碱性胁迫的多层次适应策略 | NA | 研究嗜碱盐单胞菌对极端碱性环境的耐受机制 | 嗜碱盐单胞菌CICC 11012s野生型及tonb基因突变株 | 合成生物学 | NA | 蛋白质组学,代谢组学,CRISPR | NA | 蛋白质组数据,代谢组数据 | 野生型和突变株菌株 | CRISPR-Cas9 | Halomonas alkalicola | tonb基因突变体 | 工业生物技术,环境治理 |
| 53 | 2025-10-05 |
Oligonucleotide subsets selection by single nucleotide resolution barcode identification
2025-Feb-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56856-0
PMID:39939320
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研究论文 | 提出一种基于单核苷酸分辨率条形码识别的寡核苷酸子集选择方法 | 采用序列特异性循环核苷酸合成和模板寡核苷酸阻断技术,无需引物即可实现选择性杂交,且能用少于五个核苷酸的条形码编码选择数百个子集 | NA | 开发可扩展且经济高效的复杂寡核苷酸文库处理方法 | 寡核苷酸文库 | 合成生物学 | NA | 循环核苷酸合成、模板阻断技术 | NA | DNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 基因组学, 合成生物学, DNA数据存储 |
| 54 | 2025-10-05 |
A molecular proximity sensor based on an engineered, dual-component guide RNA
2025-Feb-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.98110
PMID:39937081
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研究论文 | 开发了一种基于工程化双组分引导RNA的分子邻近传感器,将蛋白质相互作用与CRISPR-Cas9基因编辑功能相连接 | 通过工程化crRNA与tracrRNA的相互作用,首次实现将蛋白质邻近性作为CRISPR基因编辑的触发机制 | 研究仅在人类细胞中进行验证,尚未在更复杂生物系统中测试 | 开发可编程的合成分子电路,将分子事件与基因组编辑相连接 | 蛋白质-蛋白质相互作用、化学诱导二聚化、RNA传感器 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9、prime editing、base editing、ADAR-based RNA传感器 | NA | 分子生物学数据 | 人类细胞实验 | CRISPR-Cas9 | 人类细胞 | 双组分引导RNA系统、蛋白质邻近传感器、合成分子电路 | 医学、工业生物技术 |
| 55 | 2025-10-05 |
A synthetic chronogenetic gene circuit for programmed circadian drug delivery
2025-Feb-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56584-5
PMID:39920119
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研究论文 | 开发了一种基于合成生物学的时序遗传基因回路,用于实现程序化昼夜节律药物递送 | 首次结合合成生物学和组织工程开发了称为'时序遗传学'的昼夜节律基因回路,能够根据生物钟基因Per2的表达节律程序化释放治疗药物 | 目前仅在体外和动物模型中验证,尚未进行人体临床试验 | 开发基于细胞的时间遗传疗法,用于昼夜节律医学的各种应用 | 类风湿关节炎和其他炎症性疾病 | 合成生物学 | 类风湿关节炎 | 合成生物学、组织工程 | NA | NA | NA | 基因回路设计 | 诱导多能干细胞 | 基于核心时钟基因Period2启动子的时序遗传基因回路,可程序化表达治疗性转基因 | 医学 |
| 56 | 2025-10-05 |
The evolution of sequences and spatial conformation in vertebrate chromosomes
2025-Feb, Yi chuan = Hereditas
DOI:10.16288/j.yczz.24-212
PMID:39924699
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综述 | 本文综述了脊椎动物染色体序列与空间构象的进化历程,重点关注染色体重排在物种形成中的作用及其分子机制 | 整合高通量测序技术揭示跨物种染色体进化规律,并探讨合成生物学为染色体进化研究带来的新机遇 | NA | 系统阐述脊椎动物染色体的进化模式与机制 | 脊椎动物染色体 | 基因组学 | 癌症 | 高通量测序, 荧光原位杂交(FISH) | NA | 基因组序列数据 | NA | NA | NA | NA | 基础研究 |
| 57 | 2025-10-05 |
Innovations and challenges in collagen and gelatin production through precision fermentation
2025-Feb-06, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04276-z
PMID:39910024
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综述 | 本文全面概述了通过精密发酵技术生产胶原蛋白和明胶的方法及其在食品领域的应用 | 系统探讨了精密发酵技术作为传统动物源生产替代方案的创新潜力,重点关注重组技术、合成生物学和生物工艺优化的最新进展 | NA | 分析精密发酵技术在胶原蛋白和明胶生产中的创新与挑战 | 重组胶原蛋白和明胶的生产技术 | NA | NA | 精密发酵、重组技术、合成生物学、生物工艺优化 | NA | NA | NA | NA | 基因工程微生物 | NA | 食品, 化妆品, 医疗保健, 制药 |
| 58 | 2025-10-05 |
Advances in magnetic nanoparticles for molecular medicine
2025-Feb-13, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d4cc05167j
PMID:39846549
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综述 | 本文综述了磁性纳米颗粒在分子医学中的最新进展,包括传统临床应用及其在基因组编辑和合成生物学等新兴领域的整合 | 磁性纳米颗粒通过外部磁场实现对生物过程的精确远程控制,为基因组编辑和细胞治疗等新兴领域开辟了新途径 | NA | 总结磁性纳米颗粒的临床应用并探索其在分子医学中的整合,以启发新一代疾病治疗平台的开发 | 磁性纳米颗粒及其在分子医学中的应用 | 纳米医学 | NA | 磁性纳米颗粒技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 59 | 2025-10-05 |
Towards microbial consortia in fermented foods for metabolic engineering and synthetic biology
2025-Feb, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.115677
PMID:39849795
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综述 | 本文综述发酵食品中微生物群落相互作用机制及其在代谢工程和合成生物学中的应用前景 | 系统阐述发酵食品中微生物相互作用机制,并提出将新型发酵剂与天然微生物群落结合开发功能性发酵食品的新视角 | NA | 探讨发酵食品中微生物相互作用机制及其在代谢工程和合成生物学中的应用潜力 | 发酵食品中的微生物群落及其相互作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌, 酵母 | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 60 | 2025-10-05 |
Bacillus methanolicus: an emerging chassis for low-carbon biomanufacturing
2025-Feb, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.06.013
PMID:39033040
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综述 | 本文介绍了甲基营养型细菌Bacillus methanolicus作为甲醇基生物制造新兴底盘细胞的潜力 | 提出将嗜热甲基营养菌Bacillus methanolicus开发为低碳生物制造的新型底盘生物 | 当前工程化菌株的产业化效率仍需提升 | 探索利用合成生物学技术改造Bacillus methanolicus实现低碳生物制造 | Bacillus methanolicus细菌及其代谢工程改造 | 合成生物学 | NA | 代谢建模、基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Bacillus methanolicus | 代谢通路工程 | 工业生物技术,环境 |