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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2025-03-05 |
Synthetic evolution of Saccharomyces cerevisiae for biomanufacturing: Approaches and applications
2025-Feb, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.12167
PMID:40026576
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综述 | 本文综述了合成生物学在设计和工程酿酒酵母进化中的方法和工具,并讨论了其在生物制造中的应用 | 本文详细讨论了转录调控、模板依赖和非模板依赖的方法,并全面总结了进化酿酒酵母在提高环境应激耐受性和细胞代谢性能方面的应用 | 未明确提及具体的研究局限性 | 探讨合成生物学在设计和工程酿酒酵母进化中的应用 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
62 | 2025-03-01 |
Discovery of Cortinarius O-methyltransferases for the heterologous production of dermolutein and physcion
2025-Feb-25, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02625-6
PMID:40001086
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研究论文 | 本文通过基因组学、转录组学和合成生物学方法,揭示了Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物emodin和endocrocin的生物合成途径,以及它们甲基化为黄色色素physcion和dermolutein的过程 | 发现了Cortinarius蘑菇中非还原性聚酮合酶(nrPKSs)和特异性O-甲基转移酶(OMTs)的平行进化起源,并成功在酵母中异源合成了physcion和dermolutein | 化学合成复杂且不经济,从森林中大量采集野生蘑菇不可行 | 研究Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物的生物合成途径及其应用 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、合成生物学 | NA | 基因组数据、转录组数据 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇 |
63 | 2025-02-28 |
Identification and Characterization of Two Se6OMTs from Stephania epigaea Offer Novel Insights into the Biosynthetic Pathway of Cepharanthine
2025-Feb-03, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo15020092
PMID:39997717
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研究论文 | 本研究从千金藤属植物Stephania epigaea中克隆并功能表征了三种O-甲基转移酶(OMTs),重点研究了其中两种Se6OMTs在头花千金藤碱生物合成途径中的作用 | 首次鉴定了参与头花千金藤碱生物合成途径的Se6OMTs,并阐明了这些酶在(R)-和(S)-立体异构体生物碱生成中的作用 | 未探讨Se6OMTs在其他生物碱生物合成途径中的潜在作用 | 阐明头花千金藤碱生物合成途径中关键酶的作用机制 | Stephania epigaea植物中的O-甲基转移酶 | 合成生物学 | NA | 基因克隆、酶功能表征 | NA | 生物化学数据 | 三种OMTs,九种1-BIAs底物 |
64 | 2025-02-27 |
DNAdesign: feature-aware in silico design of synthetic DNA through mutation
2025-02-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf052
PMID:39891349
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研究论文 | DNAdesign是一个基于网络的工具,用于基于DNA序列和形状特征比较和设计突变 | DNAdesign能够同时考虑序列突变引起的不同读取模式的改变,提供基于DNA序列和形状特征的突变设计 | NA | 研究基因调控和合成生物学应用,如设计合成增强子和转录因子结合位点 | DNA序列和形状特征 | 生物信息学 | NA | Deep DNAshape | NA | DNA序列 | NA |
65 | 2025-02-27 |
Suppression of amber stop codons impairs pathogenicity in Salmonella
2025-Feb, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.15075
PMID:39666825
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研究论文 | 本文研究了UAG(琥珀)终止密码子的抑制如何影响沙门氏菌的致病性 | 揭示了UAG终止密码子抑制对沙门氏菌致病性的选择性影响,特别是对SPI-1基因表达的减弱作用 | 未探讨UGA和UAA终止密码子抑制对沙门氏菌致病性的影响 | 探讨终止密码子抑制对细菌致病性的影响 | 沙门氏菌 | 合成生物学 | 细菌感染 | 系统遗传和生化分析 | NA | NA | NA |
66 | 2025-02-27 |
Harnessing the biology of regulatory T cells to treat disease
2025-02, Nature reviews. Drug discovery
DOI:10.1038/s41573-024-01089-x
PMID:39681737
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综述 | 本文综述了调节性T细胞(Treg细胞)在治疗疾病中的潜力,包括增强或抑制Treg细胞活性的临床试验进展 | 探讨了利用纳米医学和合成生物学进展来精确调控Treg细胞功能的新一代临床试验 | 现有临床试验仍存在重要局限性和未解答的问题 | 探讨调节性T细胞在治疗多种疾病中的应用 | 调节性T细胞(Treg细胞) | 免疫学 | 过敏、移植、自身免疫疾病、癌症 | NA | NA | NA | NA |
67 | 2025-02-24 |
Interchromosomal contacts between regulatory regions trigger stable transgenerational epigenetic inheritance in Drosophila
2025-Feb-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.11.021
PMID:39667935
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研究论文 | 本文研究了果蝇中跨代表观遗传的机制,特别是通过染色质接触建立的表观遗传记忆 | 揭示了转录因子结合位点突变对跨代表观遗传的影响,以及染色质接触在建立跨代表观遗传记忆中的作用 | 研究仅限于果蝇模型,未涉及其他生物或更复杂的遗传背景 | 探讨果蝇中跨代表观遗传的分子机制 | 果蝇的Fab-7调控元件及其同源位点 | 遗传学 | NA | 合成生物学系统 | NA | 遗传和表观遗传数据 | NA |
68 | 2025-02-23 |
Framing synthetic biology as an innovation-driven market
2025-Feb-20, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.003
PMID:39984349
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研究论文 | 本文提出了一个合成生物学市场的框架,以促进对其商业潜力的共同理解 | 提出了一个区分合成生物学专业市场与更广泛产品市场的框架 | 未提及具体的数据支持或案例研究 | 探讨合成生物学市场的商业潜力 | 合成生物学市场 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
69 | 2025-02-21 |
Questions and Consequences of Omics in Genetically Engineered Crop Regulation
2025-Feb, Plant-environment interactions (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/pei3.70033
PMID:39967832
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研究论文 | 本文探讨了将组学技术整合到基因编辑和合成生物学作物监管系统中的问题和后果 | 提出了需要回答的一系列问题,以将组学实验和数据整合到作物监管系统中,并强调了这些问题的科学有效性和监管负担 | 未具体说明组学技术在监管系统中应用的具体技术挑战或数据限制 | 探讨组学技术在基因编辑和合成生物学作物监管中的应用 | 基因编辑和合成生物学作物 | 生物技术 | NA | 组学技术 | NA | 组学数据 | NA |
70 | 2025-02-20 |
Chemistry and biology of natural stilbenes: an update
2025-Feb-19, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d4np00033a
PMID:39711130
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综述 | 本文更新了关于天然二苯乙烯类化合物的化学和生物学研究,特别关注了寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性 | 系统综述了2009年至2023年间新发现的409种二苯乙烯类化合物,特别是寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性,并探讨了其作为新药研究先导化合物的潜力 | 主要集中于2009年至2023年的研究,可能未涵盖更早期的重要发现 | 探讨天然二苯乙烯类化合物,特别是寡聚二苯乙烯的结构多样性和生物活性,以寻找新药研究的先导化合物 | 天然二苯乙烯类化合物,特别是寡聚二苯乙烯 | 化学与生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 化学结构数据 | 409种新二苯乙烯类化合物 |
71 | 2025-02-18 |
In vivo self-assembled siRNAs within small extracellular vesicles attenuate LRRK2-induced neurodegeneration in Parkinson's disease models
2025-Feb-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2024.12.045
PMID:39722304
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研究论文 | 本研究开发了一种合成生物学策略,通过小细胞外囊泡(sEVs)将LRRK2的小干扰RNA(siRNAs)自组装并递送至黑质,以减轻帕金森病(PD)模型中的神经退行性变 | 利用遗传电路(裸DNA质粒形式)实现siRNA的自组装和递送,通过sEVs将siRNA靶向递送至黑质,为PD治疗提供了新的策略 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 开发一种通过sEVs递送siRNA以减轻PD模型中LRRK2诱导的神经退行性变的治疗策略 | LRRK2R1441G小鼠模型 | 合成生物学 | 帕金森病 | siRNA自组装和递送 | 遗传电路 | NA | 两种小鼠模型 |
72 | 2025-02-18 |
Bacterial and bacterial derivatives-based drug delivery systems: a novel approach for treating central nervous system disorders
2025-Feb, Expert opinion on drug delivery
IF:5.0Q1
DOI:10.1080/17425247.2024.2444364
PMID:39688950
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综述 | 本文综述了基于细菌及其衍生物的药物递送系统在治疗中枢神经系统疾病中的最新研究进展 | 利用细菌及其衍生物作为药物递送系统,通过其独特的趋化性、生物相容性和靶向能力,克服传统方法的限制,实现精确药物递送 | 生物安全性、免疫排斥和规模化生产等挑战仍需解决 | 探索细菌及其衍生物作为药物递送系统在中枢神经系统疾病治疗中的应用 | 缺血性脑损伤、神经退行性疾病和胶质瘤 | 生物医学工程 | 中枢神经系统疾病 | 基因工程、合成生物学和纳米技术 | NA | NA | NA |
73 | 2025-02-16 |
Multiscale Mathematical Modeling in Systems Biology: A Framework to Boost Plant Synthetic Biology
2025-Feb-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14030470
PMID:39943032
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综述 | 本文探讨了多尺度数学建模在植物合成生物学中的应用,以评估和减轻相关风险 | 提出了将多尺度数学建模与农业数据分析技术结合,以全面理解作物在不同生物尺度上的表现 | 多尺度数学建模在植物中的应用仍然不足 | 通过多尺度数学建模提高植物合成生物学的安全性,增强作物对病虫害和干旱的抵抗力 | 玉米(Zea mays L.) | 系统生物学 | NA | 参数估计、分岔分析、敏感性分析 | 多尺度数学模型 | 农业数据 | NA |
74 | 2025-02-14 |
Modular plasmid design for autonomous multi-protein expression in Escherichia coli
2025-Feb-10, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00483-2
PMID:39930458
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研究论文 | 本研究描述了一组用于大肠杆菌中重组表达的细菌质粒,这些质粒可以独立诱导表达多达三种重组蛋白 | 提出了一种新的多基因表达策略,通过使用四种不同的细菌表达盒,实现了在一个质粒中独立表达多达三种重组蛋白 | 尽管系统展示了多基因表达的潜力,但每种表达盒的潜在限制和代谢机制的影响仍需进一步研究 | 探索独立且可控的多基因共表达系统,以优化重组蛋白的生产 | 大肠杆菌中的重组蛋白表达 | 合成生物学 | NA | Golden Standard Molecular Cloning kit组装 | NA | NA | NA |
75 | 2025-02-14 |
Synthetic tunable promoters for flexible control of multi-gene expression in mammalian cells
2025-Feb-10, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.008
PMID:39938795
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研究论文 | 本研究构建了一个多样化的合成可调启动子库,用于在哺乳动物细胞中灵活控制多基因表达 | 设计了包含通用激活位点(UAS)和特定激活位点(SAS)的合成可调启动子(STPs),通过CRISPR激活系统实现多层次表达控制 | NA | 构建一个多样化的合成可调启动子库,以实现对哺乳动物细胞中多基因表达的灵活控制 | 哺乳动物细胞中的多基因系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR激活系统(CRISPRa),大规模平行报告基因检测(MPRA) | NA | 基因表达数据 | 24,960个独特的非冗余启动子 |
76 | 2025-02-14 |
Effectors of the Future: Universal Chimeric Antigen Receptor
2025-Feb, Transfusion medicine and hemotherapy : offizielles Organ der Deutschen Gesellschaft fur Transfusionsmedizin und Immunhamatologie
IF:1.9Q4
DOI:10.1159/000539609
PMID:39944409
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review | 本文综述了通用嵌合抗原受体(CAR)技术在癌症免疫治疗中的应用及其潜力 | 提出了通用适配器CAR技术,以解决肿瘤抗原异质性和抗原逃逸机制的问题,并展示了其在多靶点免疫治疗中的潜力 | NA | 探讨通用CAR技术在癌症免疫治疗中的应用及其未来发展方向 | 通用嵌合抗原受体(CAR)技术及其在癌症治疗中的应用 | 免疫治疗 | 癌症 | 合成生物学、基因组编辑 | NA | NA | NA |
77 | 2025-02-14 |
Elucidation of the key flavonol biosynthetic pathway in golden Camellia and its application in genetic modification of tomato fruit metabolism
2025-Feb, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae308
PMID:39944987
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研究论文 | 本研究揭示了金花茶中关键黄酮醇生物合成途径,并将其应用于番茄果实代谢的遗传改良 | 发现了金花茶中黄酮醇生物合成的关键基因CnFLS1,并通过转基因技术成功改良了番茄果实的代谢途径,使其具有金花茶特有的黄酮醇成分和增强的抗氧化能力 | 研究中仅涉及23种金花茶物种,样本量相对较小,且转基因番茄的长期稳定性和安全性尚未验证 | 揭示金花茶中黄酮醇生物合成机制,并利用这些机制改良番茄果实的代谢途径 | 金花茶物种和栽培番茄 | 合成生物学 | NA | 转录组学、共表达网络分析、酶活性测定、转基因技术 | NA | 基因表达数据、代谢物数据 | 23种金花茶物种 |
78 | 2025-02-13 |
Engineered Bacteria Manipulate Cysteine Metabolism to Boost Ferroptosis-Based Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Therapy
2025-Feb, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202412982
PMID:39696900
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研究论文 | 本文探讨了通过工程化细菌操纵半胱氨酸代谢以增强基于铁死亡的胰腺导管腺癌(PDAC)治疗的效果 | 利用合成生物学开发了一种能够直接消耗半胱氨酸的工程化细菌,通过产生工程化胱氨酸酶(CGL)来阻断半胱氨酸代谢,从而触发PDAC细胞的铁死亡 | 当前限制半胱氨酸可用性的方法由于肿瘤靶向不足和半胱氨酸的补偿来源而未能有效阻断半胱氨酸代谢 | 研究目的是通过工程化细菌调节半胱氨酸代谢,增强PDAC的铁死亡治疗效果 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞 | 合成生物学 | 胰腺导管腺癌 | 工程化细菌和胱氨酸酶(CGL) | NA | NA | NA |
79 | 2025-02-12 |
Harnessing the Power of Photosynthesis: from Current Engineering Strategies to Cell Factory Applications
2025-Feb-10, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202402147
PMID:39930847
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综述 | 本文综述了光合作用的原理及其在设计和工程化光合系统中的应用,探讨了光合作用在能源和物质转换中的潜力 | 综述了多种设计和工程化光合系统的策略,包括纳米材料辅助方法、微流体技术、合成生物学技术和光生物电化学系统,并探讨了这些技术在人工细胞器、缺氧组织愈合、生物生产和环境可持续性等领域的应用 | NA | 探讨光合作用在能源和物质转换中的潜力,并介绍设计和工程化光合系统的最新策略 | 光合作用及其工程化系统 | 合成生物学 | NA | 纳米材料辅助方法、微流体技术、合成生物学技术、光生物电化学系统 | NA | NA | NA |
80 | 2025-02-08 |
Accurate phenotype-to-genotype mapping of high-diversity yeast libraries by heat-shock-electroporation (HEEL)
2025-Feb-05, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03197-24
PMID:39704499
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研究论文 | 本文介绍了一种创新的酵母文库转化方法HEEL,通过结合热休克和电穿孔技术,提高了单转化酵母细胞的比例,从而实现了近乎完美的表型到基因型的关联 | HEEL方法通过结合热休克和电穿孔技术,显著提高了单转化酵母细胞的比例,从20%提升至70%以上,解决了传统方法中多质粒摄取导致的异质基因型问题 | 尽管HEEL方法显著提高了转化效率和单转化细胞比例,但其在更大规模应用中的效果和稳定性仍需进一步验证 | 开发一种高效的酵母文库转化方法,以提高表型到基因型关联的准确性 | 酵母细胞 | 分子生物学 | NA | 热休克-电穿孔结合技术(HEEL) | NA | DNA文库 | 每个反应超过10个酵母细胞 |