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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Engineered Bacteria Manipulate Cysteine Metabolism to Boost Ferroptosis-Based Pancreatic Ductal Adenocarcinoma Therapy
2025-Feb, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202412982
PMID:39696900
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研究论文 | 本研究开发了一种工程化细菌,通过调控半胱氨酸代谢增强铁死亡疗法治疗胰腺导管腺癌 | 首次利用合成生物学设计能够直接消耗半胱氨酸的工程菌,通过持续产生工程化胱氨酸酶彻底阻断半胱氨酸代谢 | 未提及具体动物模型验证细节及潜在免疫反应风险 | 开发基于工程菌的铁死亡疗法用于胰腺导管腺癌治疗 | 胰腺导管腺癌细胞 | 合成生物学 | 胰腺癌 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 工程化细菌 | 肿瘤低氧响应型基因回路,用于在肿瘤微环境中持续表达胱氨酸酶 | 医学 |
| 62 | 2025-10-05 |
Photoinduced electron transfer enables cytochrome P450 enzyme-catalyzed reaction cycling
2025-Feb, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2024.109412
PMID:39708699
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研究论文 | 本研究开发了一种光诱导电子转移系统,用于驱动细胞色素P450酶催化的反应循环 | 开发了基于曙红Y/三乙醇胺的光诱导电子转移系统,替代了传统NADPH依赖的CYP还原酶介导的电子传递 | NA | 解决细胞色素P450酶对还原当量的依赖性限制,开发更高效的催化系统 | 细胞色素P450酶及其催化的反应循环 | 合成生物学 | 肿瘤 | 光诱导电子转移技术 | NA | NA | NA | NA | 喜树 | 光诱导电子生成和传递系统 | 医药, 工业生物技术 |
| 63 | 2025-10-05 |
From Spores to Suffering: Understanding the Role of Anthrax in Bioterrorism
2025-Feb-27, Military medicine
IF:1.2Q2
DOI:10.1093/milmed/usae535
PMID:39656926
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综述 | 本文探讨炭疽在生物恐怖主义中的作用,并提出应对这一威胁的前沿策略 | 提出整合合成生物学技术、纳米诊断和CRISPR技术等创新方法应对炭疽威胁 | 基于文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 分析炭疽作为生物武器的威胁并探索未来防控策略 | 炭疽杆菌及其引发的疾病 | NA | 炭疽病 | 系统文献综述,合成生物学,纳米技术,CRISPR | NA | 文献数据 | 53篇精选文献(从626篇初选文献中筛选) | CRISPR | NA | NA | 医学,生物安全 |
| 64 | 2025-10-05 |
Interchromosomal contacts between regulatory regions trigger stable transgenerational epigenetic inheritance in Drosophila
2025-Feb-20, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2024.11.021
PMID:39667935
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研究论文 | 本研究揭示了果蝇中通过染色质间接触实现跨代表观遗传的分子机制 | 首次证明染色质间接触本身足以建立跨代表观遗传,揭示了Fab-7调控元件通过蛋白质介导的染色质接触传递表观遗传记忆的新机制 | 研究仅限于果蝇模型,尚未验证在其他生物系统中的普适性 | 探究跨代表观遗传的分子机制和建立条件 | 果蝇Fab-7调控元件及其同源基因座 | 表观遗传学 | NA | 合成生物学系统、转录因子结合位点突变 | NA | 表观遗传数据 | NA | 合成生物学系统 | 果蝇 | 表观遗传记忆系统 | 基础研究 |
| 65 | 2025-10-05 |
Synthetic biology and artificial intelligence in crop improvement
2025-Feb-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2024.101220
PMID:39668563
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综述 | 探讨人工智能驱动的合成生物学在作物改良中的工程原理与应用前景 | 首次系统提出通过AI赋能的合成生物技术开发SMART(自监测、自适应和响应技术)作物 | 尚未对植物工程中AI驱动的合成生物学路径进行系统综述 | 作物改良与生物生产提升 | 作物性状、遗传回路、生物组件与系统 | 合成生物学与人工智能交叉领域 | NA | 基因编辑、合成核酸与蛋白质技术、多组学分析、基因组选择、定向蛋白质工程 | AI | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 植物 | 遗传回路设计、代谢通路改造、性状网络构建 | 农业 |
| 66 | 2025-10-05 |
Advances in biosynthesis of 7-Dehydrocholesterol through de novo cell factory strategies
2025-Feb, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2024.131888
PMID:39603472
|
综述 | 本文综述了通过从头合成细胞工厂策略生物合成7-脱氢胆固醇的进展 | 全面总结了通过优化限速酶、代谢通量、氧化还原平衡和亚细胞定位等合成生物学策略提高7-脱氢胆固醇产量的方法 | NA | 提高7-脱氢胆固醇的生物合成产量 | 7-脱氢胆固醇生物合成途径和微生物细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 组学技术、基因编辑技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 7-脱氢胆固醇生物合成途径 | 医药 |
| 67 | 2025-10-05 |
Suppression of amber stop codons impairs pathogenicity in Salmonella
2025-Feb, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.15075
PMID:39666825
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研究论文 | 本研究揭示琥珀终止密码子抑制会选择性削弱沙门氏菌毒力基因表达和致病能力 | 首次发现终止密码子抑制具有调控病原菌毒力的选择性功能,琥珀密码子抑制特异性影响SPI-1毒力岛 | 研究仅针对沙门氏菌,未验证其他病原菌中是否存在类似机制 | 探究终止密码子抑制对细菌致病性的影响机制 | 沙门氏菌及其毒力基因调控系统 | 合成生物学 | 细菌感染 | 遗传学分析、生物化学分析 | NA | 基因表达数据、感染实验数据 | NA | 终止密码子抑制技术 | 沙门氏菌 | NA | 医学 |
| 68 | 2025-10-05 |
RH2Fusion: A universal tool for precise DNA fragment assembly
2025-Feb, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.138788
PMID:39675608
|
研究论文 | 开发了一种名为RH2Fusion的通用DNA片段精确组装工具 | 首次发现大肠杆菌外切核酸酶IX具有核糖核苷酸特异性切割活性,并创建了具有双酶功能的RNase RY和RNase YR融合构建体 | NA | 开发一种快速、有效且多功能的DNA组装替代方法 | DNA片段组装和多位点定点诱变 | 合成生物学 | NA | RNase HII介导的切割,位点定向诱变 | NA | NA | NA | RH2Fusion, RNase HII, YgdG, T4 DNA连接酶 | 大肠杆菌 | 用户定义的粘性末端形成,无疤痕多DNA片段组装 | 合成生物学, 基因工程 |
| 69 | 2025-10-05 |
Synthetic Biomolecular Condensates: Phase-Separation Control, Cytomimetic Modelling and Emerging Biomedical Potential
2025-Feb-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202418431
PMID:39575859
|
综述 | 本微型综述重点介绍了合成共凝聚液滴在模拟生物分子凝聚物方面的最新设计进展及其在生物医学领域的应用潜力 | 通过动态相分离控制构建具有细胞样特征的合成凝聚物,为细胞仿生建模和功能材料工程提供创新解决方案 | NA | 探索合成生物分子凝聚物的相分离控制机制及其在生物医学中的应用 | 合成共凝聚液滴及其仿生结构 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 仿生凝聚物结构、活性共凝聚物工程 | 生物医学, 材料科学 |
| 70 | 2025-10-05 |
Bioengineering lipid-based synthetic cells for therapeutic protein delivery
2025-Feb, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.08.004
PMID:39209601
|
综述 | 探讨基于脂质的合成细胞作为治疗性蛋白质递送平台的设计原理、功能特性及转化潜力 | 结合合成生物学与药物递送原理,利用脂质双层构建具有组织特异性靶向和免疫逃逸功能的刺激响应型合成细胞 | NA | 开发用于治疗性蛋白质递送的合成细胞平台 | 基于脂质的合成细胞 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 区室化蛋白质合成系统 | 医药 |
| 71 | 2025-10-05 |
Alien Chromosome Serves as a Novel Platform for Multiple Gene Expression in Kluyveromyces marxianus
2025-Feb-25, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13030509
PMID:40142402
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研究论文 | 本研究探索利用外来染色体R1作为新型平台在马克斯克鲁维酵母中实现多基因稳定整合与表达 | 首次利用外来染色体作为多基因表达平台,通过删除必需基因并补充功能实现无选择压力下的稳定遗传 | NA | 开发马克斯克鲁维酵母中多基因表达的稳定平台 | 马克斯克鲁维酵母和外来染色体R1 | 合成生物学 | NA | 染色体工程、基因替换 | NA | 基因表达数据 | NA | 基因替换、染色体转移 | Kluyveromyces marxianus | 多基因表达平台、代谢通路工程 | 工业生物技术 |
| 72 | 2025-10-05 |
Anti photoaging mechanism of a novel recombinant human fibronectin peptide (rhFNP) derived from the extracellular matrix
2025-Feb-28, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42730
PMID:40061928
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研究论文 | 本研究通过合成生物学构建新型重组人纤连蛋白肽(rhFNP),并系统评估其在光老化模型中的抗炎和细胞外基质重塑作用 | 首次利用合成生物学技术构建重组人纤连蛋白肽,并采用多物种模型(细胞、斑马鱼、小鼠)系统验证其抗光老化机制 | 研究主要聚焦于体外和动物模型,尚未进行人体临床试验验证 | 开发新型抗光老化生物活性肽并阐明其作用机制 | HaCaT、P815、NHEK细胞、斑马鱼、KM小鼠光老化模型 | 合成生物学 | 皮肤光老化 | 合成生物学、转录组学分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、组织形态学数据 | 多种细胞系、斑马鱼和KM小鼠模型 | 合成生物学 | NA | 重组人纤连蛋白肽的生物合成 | 医药 |
| 73 | 2025-10-05 |
Engineering Plasmids with Synthetic Origins of Replication
2025-Feb-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639468
PMID:40027650
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研究论文 | 本研究通过重构天然pMB1复制起点,开发了具有可定制拷贝数和正交兼容性的合成复制起点质粒系统 | 创建了可调节拷贝数的合成复制起点,开发了使用合成RNA调节器实现独立拷贝控制的兼容性起点,并构建了6种正交SynORI质粒库 | 目前仅在E. coli中进行了为期一周的验证,尚未在其他微生物宿主中进行测试 | 开发具有可调性和模块化特性的合成质粒复制系统 | 质粒复制起点和合成RNA调节器 | 合成生物学 | NA | 质粒工程、合成生物学方法 | NA | NA | 6种正交SynORI质粒在E. coli中共同维持一周 | 合成生物学方法 | E. coli | 合成复制起点、RNA调节器、可响应环境信号的多路拷贝报告系统 | 工业生物技术 |
| 74 | 2025-10-05 |
Nucleic Acid Framework-Enabled Spatial Organization for Biological Applications
2025-Feb-27, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.4c00164
PMID:40041004
|
综述 | 本文总结了核酸框架在生物应用中的空间组织功能,重点介绍DNA折纸和四面体DNA纳米结构在生物传感、成像和纳米医学等领域的应用 | 系统阐述核酸框架在二维和三维空间组织中的独特优势,及其在仿生蛋白质/生物膜和无机纳米粒子可控合成中的创新应用 | NA | 探讨核酸框架在生物技术领域的空间组织功能和应用前景 | 核酸框架(DNA折纸和四面体DNA纳米结构)及其生物医学应用 | 纳米技术 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学, 纳米技术 |
| 75 | 2025-10-05 |
Synthetic evolution of Saccharomyces cerevisiae for biomanufacturing: Approaches and applications
2025-Feb, mLife
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mlf2.12167
PMID:40026576
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综述 | 本文综述了合成生物学方法在酿酒酵母进化工程中的应用及其在生物制造领域的潜力 | 系统总结了合成生物学工具在酵母进化工程中的最新进展,特别关注转录调控、模板依赖和非模板方法的综合应用 | NA | 探讨合成生物学方法在设计和工程化酿酒酵母进化中的应用 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、进化工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 酿酒酵母 | 转录调控电路、代谢途径工程、生物传感器 | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 76 | 2025-03-01 |
Next-generation biotechnology inspired by extremes : The potential of extremophile organisms for synthetic biology and for more efficient and sustainable biotechnology
2025-Feb-27, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00389-6
PMID:40016427
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 77 | 2025-10-05 |
Discovery of Cortinarius O-methyltransferases for the heterologous production of dermolutein and physcion
2025-Feb-25, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02625-6
PMID:40001086
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研究论文 | 本研究通过基因组学、转录组学和合成生物学方法揭示了Cortinarius蘑菇中蒽醌类化合物dermolutein和physcion的生物合成途径 | 发现了与子囊菌非直系同源的nrPKS和OMT酶,表明担子菌中该途径的平行进化起源 | NA | 开发异源生产Cortinarius蒽醌类色素的方法 | Cortinarius semisanguineus和C. sp. KIS-3蘑菇中的蒽醌生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因组学, 转录组学, 合成生物学 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 两种Cortinarius蘑菇物种 | NA | 酿酒酵母 | 蒽醌支架化合物emodin和endocrocin的生物合成及其甲基化途径 | 纺织, 涂料, 电子, 化妆品, 农业 |
| 78 | 2025-10-05 |
Identification and Characterization of Two Se6OMTs from Stephania epigaea Offer Novel Insights into the Biosynthetic Pathway of Cepharanthine
2025-Feb-03, Metabolites
IF:3.4Q2
DOI:10.3390/metabo15020092
PMID:39997717
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研究论文 | 本研究从金线吊乌龟中鉴定并表征了两个参与头花千金藤素生物合成途径的6-O-甲基转移酶Se6OMT1和Se6OMT3 | 首次发现Se6OMT3对(R)和(S)构型的1-苄基异喹啉生物碱均具有C6、C7和C4'位点的催化活性,揭示了酶在立体异构体底物上的底物混杂性 | 未在体内验证这些酶的生物学功能,且对(R)立体异构体底物的研究仍较初步 | 阐明头花千金藤素生物合成途径中负责(R)和(S)立体异构体生产的O-甲基转移酶 | 金线吊乌龟中的三个O-甲基转移酶及其对九种(R)和(S)构型1-苄基异喹啉生物碱的催化活性 | 合成生物学 | NA | 基因克隆、酶功能表征 | NA | 生化实验数据 | 三个OMT基因,九种1-BIA底物 | 代谢工程 | 金线吊乌龟 | 头花千金藤素生物合成途径 | 医药 |
| 79 | 2025-10-05 |
DNAdesign: feature-aware in silico design of synthetic DNA through mutation
2025-02-04, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf052
PMID:39891349
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研究论文 | 介绍了一个基于网络的DNA突变设计工具DNAdesign,可同时考虑DNA序列和形状特征进行突变设计 | 首次实现了同时考虑DNA序列和形状特征的突变设计,提供交互式可视化比较突变候选与野生型DNA分子 | NA | 开发能够同时考虑DNA序列和形状特征的突变设计工具 | DNA序列和形状特征 | 合成生物学 | NA | Deep DNAshape预测,扩展k-mers,物理化学编码 | NA | DNA序列数据 | NA | DNAdesign | NA | 合成增强子和转录因子结合位点设计 | 合成生物学,基因调控研究 |
| 80 | 2025-10-05 |
Questions and Consequences of Omics in Genetically Engineered Crop Regulation
2025-Feb, Plant-environment interactions (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/pei3.70033
PMID:39967832
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评论 | 探讨组学技术在转基因作物监管中应用的问题与影响 | 首次系统提出将组学技术整合到作物监管体系需要解决的关键问题框架 | 未提供具体实验数据验证组学技术在监管中的实际效果 | 分析组学技术应用于基因编辑和合成生物学作物监管的可行性及挑战 | 转基因作物监管政策与技术体系 | 生物技术监管 | NA | 组学技术 | NA | 监管政策数据 | NA | 基因编辑, 合成生物学 | 作物 | NA | 农业, 监管科学 |