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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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101 | 2025-03-15 |
Unleashing the potential of biotechnological strategies for the sustainable production of microalgal polysaccharides
2025-Mar-14, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2025.2475240
PMID:40084718
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综述 | 本文探讨了利用生物技术策略可持续生产微藻多糖的潜力 | 提出了利用合成生物学和代谢工程克服微藻多糖生产中的技术生物复杂性,并实现大规模生产的关键策略 | 尽管合成生物学有进展,但微藻产品的商业化生产仍未被充分利用 | 探索可持续的生物原料,特别是通过光合作用生产多糖的微藻,以实现碳封存和绿色生产有价值的代谢物 | 微藻及其多糖生物合成途径 | 生物技术 | NA | 合成生物学,代谢工程 | NA | NA | NA |
102 | 2025-03-15 |
Identification, Characterization, and Catalytic Mechanism of Regioselective UbiA Prenyltransferases in Morus Plants
2025-Mar-13, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202504190
PMID:40080387
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研究论文 | 本文研究了桑树中UbiA预酰基转移酶的识别、表征及其催化机制,特别是区域选择性的精确控制 | 通过分子对接、动力学模拟和量子化学计算揭示了底物诱导的构象变化,以及不同MaPTs与moracin M之间的差异结合,并讨论了预酰基供体的识别和区域选择性逆转的潜在机制 | 尽管识别了10种MaPTs,但其催化机制,特别是区域选择性的精确控制仍不完全清楚 | 研究桑树中UbiA预酰基转移酶的催化机制,特别是区域选择性的控制 | 桑树中的UbiA预酰基转移酶及其底物moracin M | 生物化学 | NA | 分子对接、动力学模拟、量子化学计算 | NA | 分子结构数据 | 10种MaPTs |
103 | 2025-03-15 |
Design principles of gene circuits for longevity
2025-Mar-12, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2025.02.006
PMID:40082090
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review | 本文探讨了影响寿命的基因回路,并强调了反馈回路在维持细胞平衡中的作用 | 通过系统生物学和合成生物学的方法,提出了稳定单细胞中反馈回路的策略,以增强其对衰老相关损伤的抵抗力 | 主要基于酵母模型,可能不直接适用于其他生物体 | 探索基因回路如何影响寿命,并提出延长寿命的策略 | 基因回路,特别是SIR2-HAP回路 | 合成生物学 | NA | 系统生物学和合成生物学 | NA | NA | NA |
104 | 2025-03-14 |
Unlocking Ectoine's Postbiotic Therapeutic Promise: Mechanisms, Applications, and Future Directions
2025-Mar-12, Probiotics and antimicrobial proteins
IF:4.4Q2
DOI:10.1007/s12602-025-10506-5
PMID:40072821
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综述 | 本文综述了Ectoine作为一种后生元治疗剂的潜力,包括其作用机制、应用及未来发展方向 | 探讨了Ectoine在抗衰老、癌症预防及神经系统疾病治疗中的新应用,并提出了利用人工智能优化其药物配方和临床应用的新方向 | Ectoine在真核细胞中的生物利用度低,工业化生产的可扩展性受限,以及合成生物学方法的高成本 | 评估Ectoine作为后生元治疗剂在多种疾病管理中的有效性和安全性 | Ectoine及其在鼻炎、特应性皮炎、过敏性鼻炎、阿尔茨海默病、自身免疫性疾病和代谢综合征中的应用 | 生物医学 | 鼻炎、特应性皮炎、过敏性鼻炎、阿尔茨海默病、自身免疫性疾病、代谢综合征 | NA | NA | NA | NA |
105 | 2025-03-14 |
Building AuxInYeast Synthetic Biology Strains for Biochemical Characterization of Maize Auxin Hormone Signaling Components
2025-Mar-12, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108634
PMID:40074300
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研究论文 | 本文介绍了一种名为AuxInYeast的合成生物学工具,用于分析植物生长素激素信号通路的复杂生化特性 | AuxInYeast系统利用酵母作为植物合成生物学底盘,结合荧光蛋白报告基因,通过高通量方法如流式细胞术定量测量信号动态 | NA | 研究玉米生长素激素信号通路的生化特性 | 玉米生长素信号通路的关键组件,包括受体(ZmTIR1/AFB)、阻遏物(ZmIAA)、共阻遏物(REL2)、转录因子(ZmARF)和生长素响应元件(auxRE) | 合成生物学 | NA | 荧光蛋白报告基因、流式细胞术 | NA | 生化数据 | NA |
106 | 2025-03-14 |
Testing AuxInYeast Synthetic Biology Strains via Fluorescence Flow Cytometry
2025-Mar-12, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.prot108635
PMID:40074301
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研究论文 | 本文介绍了一种使用荧光流式细胞术测试AuxInYeast合成生物学菌株的协议,以分析玉米生长素信号通路 | 开发了AuxInYeast系统,利用酵母作为异源表达平台,结合荧光标记,实现了对植物生长素信号通路的高通量定量测量 | 该方法主要适用于实验室环境,可能不适用于所有植物种类或复杂的自然条件 | 研究目的是通过合成生物学方法,解析和工程化植物生长素信号通路,以促进玉米的生长和发育 | 研究对象是AuxInYeast菌株,特别是那些用于测量玉米生长素感知的菌株 | 合成生物学 | NA | 荧光流式细胞术 | NA | 荧光数据 | 多个AuxInYeast菌株,具体数量未明确 |
107 | 2025-03-14 |
Synthetic Biology Approaches to Study Maize Signaling Pathways
2025-Mar-12, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108450
PMID:40074299
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综述 | 本文综述了合成生物学方法在玉米信号通路研究中的应用,并提供了在玉米中应用合成原理和方法的指南 | 利用酵母异源表达系统(AuxInYeast)展示异源表达方法在测试信号通路进化、遗传和生化基本属性方面的强大能力 | NA | 研究玉米信号通路的基本生物学问题,并推动育种和植物工程新工具的开发 | 玉米信号通路 | 合成生物学 | NA | 荧光流式细胞术 | AuxInYeast系统 | NA | NA |
108 | 2025-03-01 |
Next-generation biotechnology inspired by extremes : The potential of extremophile organisms for synthetic biology and for more efficient and sustainable biotechnology
2025-Mar, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-025-00389-6
PMID:40016427
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
109 | 2025-03-12 |
Comprehensive strategies for paclitaxel production: insights from plant cell culture, endophytic microorganisms, and synthetic biology
2025-Mar, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhae346
PMID:40061810
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review | 本文综述了紫杉醇生产的综合策略,包括植物细胞培养、内生微生物和合成生物学的最新进展 | 整合了植物细胞培养、内生微生物和合成生物学在紫杉醇生产中的应用,并指出了未来的研究方向 | 内生微生物生产紫杉醇的产量和稳定性仍存在局限,植物细胞培养需要进一步的遗传和环境优化,合成生物学尚未实现完整的紫杉醇生物合成 | 优化紫杉醇的生产方法,以实现工业规模的生产 | 紫杉醇的生物合成途径及其生产方法 | 合成生物学 | 癌症 | 植物细胞培养、内生微生物培养、合成生物学 | NA | NA | NA |
110 | 2025-03-11 |
Building Climate-Resilient Crops: Genetic, Environmental, and Technological Strategies for Heat and Drought Stress Tolerance
2025-Mar-10, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf111
PMID:40062368
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综述 | 本文探讨了气候变化导致的干旱和热胁迫对全球作物生产的威胁,并提出了通过遗传、环境和技术策略增强作物耐热和耐旱性的方法 | 强调了将基础研究与实际农业环境相结合的重要性,并讨论了合成生物学、先进育种技术和高通量表型分析等新兴技术 | 当前育种计划和模型在应对复杂耐性机制和农业环境变异性方面存在局限性 | 研究如何通过遗传、环境和技术策略增强作物对热和干旱胁迫的耐受性 | 主要粮食作物,如小麦、水稻、大豆和玉米 | 农业科学 | NA | 合成生物学、先进育种技术、高通量表型分析 | NA | NA | NA |
111 | 2025-03-08 |
Large language model for knowledge synthesis and AI-enhanced biomanufacturing
2025-Mar-05, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.008
PMID:40050157
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综述 | 本文综述了大语言模型(LLMs)在合成生物学(SynBio)教育和研究中的进展及其在生物制造中的潜在影响 | 探讨了LLMs在从非结构化数据中提取SynBio信息、构建知识图谱、实现检索增强生成等方面的应用,并预测LLMs将革新代谢建模和工程中的设计-构建-测试-学习(DBTL)周期,并推动未来生物制造中的自动驾驶实验室 | 需要建立LLMs的基准,促进可信的知识合成,发展生物安全框架以防止滥用,并鼓励人工智能科学家、SynBio研究人员和生物过程工程师之间的合作 | 探讨LLMs在合成生物学和生物制造中的应用和潜在影响 | 大语言模型(LLMs)及其在合成生物学和生物制造中的应用 | 自然语言处理 | NA | NA | 大语言模型(LLMs) | 非结构化数据 | NA |
112 | 2025-03-08 |
Principles for introducing new genes and species for conservation
2025-Mar, Trends in ecology & evolution
IF:16.7Q1
DOI:10.1016/j.tree.2024.11.011
PMID:39667987
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研究论文 | 本文探讨了将新基因和新物种引入生态系统的机会和复杂决策,结合了生物、法律、社会、文化和伦理考虑,提出了一套全面的原则,以帮助保护管理者应对新兴技术 | 首次将生物、法律、社会、文化和伦理等多方面因素结合,提出了一套全面的原则,以指导保护管理者在面对高后果保护决策时进行综合考虑 | 未具体说明这些原则在实际应用中的具体效果和潜在问题 | 为保护管理者提供一套全面的原则,以应对新兴技术带来的高后果保护决策 | 新基因和新物种的引入 | 生态保护 | NA | NA | NA | NA | NA |
113 | 2025-03-08 |
From specialization to broad adoption: Key trends in droplet microfluidic innovations enhancing accessibility to non-experts
2025-Mar, Biomicrofluidics
IF:2.6Q2
DOI:10.1063/5.0242599
PMID:40046719
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综述 | 本文综述了液滴微流体技术的最新进展,旨在提高系统的稳健性和可访问性,使其更易于非专业实验室使用 | 讨论了液滴微流体技术从专业化到广泛采用的关键趋势,特别是商业化和自动化方面的创新 | 商业解决方案的适应性通常不如内部开发的设备 | 提高液滴微流体技术的稳健性和自动化,促进技术向非专业实验室的转移 | 液滴微流体技术及其在单细胞研究、合成生物学、定向进化和诊断等领域的应用 | 微流体技术 | NA | 液滴生成、试剂添加、分裂、洗涤、孵育、分选和分配 | NA | NA | NA |
114 | 2025-03-04 |
Synthetic Biology-Based Strategy for Nanomedicine Design
2025-Mar-03, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202401969
PMID:40025899
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综述 | 本文介绍了合成生物学纳米医学的基本概念,并探讨了其与传统和仿生纳米医学的关系与区别 | 提出了合成生物学纳米医学这一新概念,区别于传统或仿生纳米医学,采用基因工程策略进行设计 | 讨论了利用合成生物学开发纳米医学的潜在优势和挑战,但未具体说明具体挑战内容 | 探索合成生物学与纳米医学的融合,推动纳米医学在疾病诊断和治疗中的应用 | 合成生物学纳米医学 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
115 | 2025-02-23 |
Engineering microbial cell factories by multiplexed spatiotemporal control of cellular metabolism: Advances, challenges, and future perspectives
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2024.108497
PMID:39645209
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综述 | 本文全面总结了时空控制系统在构建高性能微生物细胞工厂中的最新进展,并探讨了其在不同微生物物种中的应用及未来挑战 | 探讨了合成生物学时代下,时空控制系统在微生物代谢工程中的创新应用,特别是设计合成隔室在构建高性能微生物细胞工厂中的潜力 | 文章未提及具体实验数据或案例研究,主要集中于理论探讨和未来展望 | 研究目的是探讨时空控制系统在微生物代谢工程中的应用,以构建高性能的微生物细胞工厂 | 研究对象是微生物细胞工厂及其代谢过程 | 合成生物学 | NA | 时空控制系统 | NA | NA | NA |
116 | 2025-02-23 |
Cell-free systems: A synthetic biology tool for rapid prototyping in metabolic engineering
2025 Mar-Apr, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108522
PMID:39863189
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review | 本文综述了无细胞系统(CFS)在代谢工程中作为快速原型设计工具的应用 | 无细胞系统提供了减少代谢干扰、精确控制反应条件、减少劳动力和缩短设计-构建-测试-学习周期的优势,并通过体外分隔策略实现超高通量筛选 | 本文主要关注无细胞系统在细菌中的基因调控、酶和多酶反应方面的应用,未涉及其他生物系统的详细讨论 | 探讨无细胞系统在代谢工程中作为快速原型设计工具的潜力 | 基因电路、代谢途径和酶功能 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统(CFS) | NA | NA | NA |
117 | 2025-02-20 |
Systematic molecular dissection of key intermediates in xanthones biosynthesis in Cudrania tricuspidata and establishment of a viable heterologous expression system
2025-Mar, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109524
PMID:39869995
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研究论文 | 本研究系统解析了柘树中黄酮类化合物生物合成的关键中间体,并建立了一个可行的异源表达系统 | 首次克隆并表征了柘树中参与黄酮类化合物生物合成的关键酶基因,并成功在酵母和烟草中进行了异源表达 | 研究中仅初步建立了2,3',4,6-四羟基苯甲酮的异源合成系统,尚未实现完整黄酮类化合物的异源生产 | 解析柘树中黄酮类化合物的生物合成途径,并建立其异源生产系统 | 柘树中的黄酮类化合物及其生物合成关键酶 | 合成生物学 | NA | 基因克隆、异源表达 | NA | 基因序列、酶活性数据 | 柘树根组织、酵母和烟草作为异源表达宿主 |
118 | 2025-02-09 |
Increased accumulation of fatty acids in engineered Saccharomyces cerevisiae by co-overexpression of interorganelle tethering protein and lipases
2025-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.11.005
PMID:39613152
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研究论文 | 本文提出了一种通过共表达细胞器间连接蛋白和脂肪酶来增加工程化酿酒酵母中脂肪酸积累的新策略 | 通过比较油性和非油性酵母的脂滴形态变化,开发了一种新的工程策略,通过调控与脂滴相关的调节因子和脂肪酶来增加酿酒酵母中的脂肪酸积累 | NA | 提高微生物细胞工厂中脂肪酸及其衍生物的生产能力 | 酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA |
119 | 2025-02-09 |
A rapid CAT transformation protocol and nuclear transgene expression tools for metabolic engineering in Cyanidioschyzon merolae 10D
2025-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.12.001
PMID:39638031
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研究论文 | 本文介绍了一种针对Cyanidioschyzon merolae 10D的快速转化协议和核转基因表达工具,用于代谢工程 | 优化了转化和选择协议,能够在两周内获得单氯霉素抗性转化体,并开发了合成模块质粒工具包,包括新的荧光报告基因 | NA | 促进Cyanidioschyzon merolae作为代谢工程和未来可持续生物技术生产的藻类系统 | Cyanidioschyzon merolae 10D | 合成生物学 | NA | 荧光报告基因成像和分析技术 | NA | NA | NA |
120 | 2025-02-09 |
Towards polyethylene terephthalate valorisation into PHB using an engineered Comamonas testosteroni strain
2025-Mar-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2024.12.005
PMID:39708916
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研究论文 | 本研究通过工程化改造Comamonas testosteroni RW31菌株,验证了其能够将聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)降解为单体并生产生物塑料聚羟基丁酸酯(PHB)的能力 | 首次验证了Comamonas testosteroni RW31菌株能够通过异源表达PET降解酶FAST-PETase和IsMHETase,成功降解PET并生产PHB | 研究中PET的降解率在体外和体内分别为37.1%和0.83%,体内降解效率较低 | 探索将PET废料转化为生物塑料PHB的合成生物学策略 | Comamonas testosteroni RW31菌株 | 合成生物学 | NA | 异源表达、酶降解 | NA | 实验数据 | NA |