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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 工程工具 宿主生物 回路设计 应用领域
1 2025-10-11
Synthetic Biology in Natural Product Biosynthesis
2025-Apr-09, Chemical reviews IF:51.4Q1
综述 本文总结了合成生物学在天然产物生物合成领域的最新研究进展 系统整合了生物信息学工具、异源表达策略和生物合成途径工程三大前沿方向 NA 探讨合成生物学在天然产物发现和工程化中的应用 天然产物及其生物合成基因簇 合成生物学 NA 生物信息学分析、异源表达、组合生物合成 NA 基因组数据、代谢组数据 NA NA 细菌、真菌、植物 生物合成途径工程、组装线巨型合酶工程 医药、工业生物技术
2 2025-10-10
Light-Controlled Synthetic Communication Networks via Paired Connexon Nanopores
2025-Apr-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过工程化连接蛋白通道在脂质体合成细胞间建立了光控通信网络 首次设计出UV和近红外光响应的连接蛋白通道,实现波长依赖的正交信号分子传递 NA 在基于脂质体的合成细胞中模拟细胞间通信网络 连接蛋白43和连接蛋白32通道 合成生物学 NA 蛋白质工程、脂质体组装 NA NA NA 蛋白质工程 脂质体合成细胞 光控连接蛋白通道网络,实现正交信号传递和网络状态调控 合成生物学、生物医学工程
3 2025-10-05
Cryo-EM structure of cyanopodophage A4 reveals a pentameric pre-ejectosome in the double-stabilized capsid
2025-Apr-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过冷冻电镜解析了蓝藻噬菌体A4的完整结构,揭示了其双稳定衣壳内的五聚体预喷射体结构 首次发现由四种喷射蛋白组成的五聚体预喷射体结构,并观察到基因组DNA沿带正电荷环形裂隙分布的独特特征 NA 阐明蓝藻噬菌体A4的结构特征及其基因组包装和喷射机制 蓝藻噬菌体A4病毒颗粒 结构生物学 NA 冷冻电镜 NA 冷冻电镜图像数据 NA NA 蓝藻 NA 合成生物学
4 2025-10-05
Microbially Derived P=S and P=Se Bond Formation
2025-Apr-28, JACS Au IF:8.5Q1
研究论文 本研究首次发现多种细菌通过中心硫代谢和非酶化学反应形成P=S键,并成功应用于微生物P=Se键的形成 首次在微生物细胞中进行P=S键形成的生化和遗传研究,并首次利用微生物代谢物实现化学合成中的P=Se键形成 NA 探索微生物代谢物在化学合成中的应用潜力 细菌的磷硫键和磷硒键形成机制 合成生物学 NA 生化和遗传研究方法 NA 实验数据 多种细菌 NA 细菌 中心硫代谢途径 工业生物技术
5 2025-10-05
Understanding, inhibiting, and engineering membrane transporters with high-throughput mutational screens
2025-Apr-17, Cell chemical biology IF:6.6Q1
综述 介绍利用高通量突变筛选技术理解、抑制和工程化膜转运蛋白的方法与潜力 提出将高通量筛选方法系统应用于研究多特异性转运蛋白,并探讨其在抑制剂设计和合成生物学中的应用前景 NA 阐明多特异性膜转运蛋白的功能机制并开发其工程化应用 多特异性膜转运蛋白 合成生物学 NA 高通量突变筛选 NA 遗传筛选数据 NA NA NA NA 医学, 合成生物学, 生物技术
6 2025-10-05
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 本研究揭示了人工酒精依赖性半萜途径的广泛底物特异性,并成功在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物 发现ADH模块首个酶PhoN和下游芳香族异戊二烯基转移酶的广泛底物特异性,结合IPK的底物混杂性实现非天然烷基化色氨酸衍生物的体内生产 NA 拓展异戊二烯类化合物的化学空间,推动合成生物学在天然产物合成中的应用 人工酒精依赖性半萜途径及其酶组分 合成生物学 NA 酶工程、代谢工程 NA 生物化学数据 NA Gibson Assembly, BioBrick 大肠杆菌 人工酒精依赖性半萜途径,包含酸磷酸酶PhoN和异戊烯基激酶IPK 工业生物技术, 医药
7 2025-10-05
Attaining the Promise of Geminivirus-Based Vectors in Plant Genome Editing
2025-04-27, Viruses
综述 本文综述了利用菜豆金色花叶病毒载体改进植物基因组编辑技术的潜力与挑战 系统比较菜豆金色花叶病毒载体与传统转基因方法的优势,提出其可加速基因组编辑进程并降低技术门槛 NA 探讨菜豆金色花叶病毒载体在植物基因组编辑中的应用前景 植物病毒载体与基因组编辑技术 合成生物学 NA 同源定向修复(HDR)、组织培养 NA NA NA 植物病毒载体 植物 NA 农业
8 2025-10-05
Microfluidic Production of Spatially Structured Biomimetic Microgels as Compartmentalized Artificial Cells
2025-Apr, Small science IF:11.1Q1
研究论文 开发了一种微流控策略生产具有空间结构的仿生微凝胶作为区室化人工细胞 通过微流控技术实现微米级二区和三区仿生微凝胶的可控制备,能够调控区室数量、组成、尺寸和形状 NA 模仿生物细胞的区室化特征,开发功能化软物质微器件 仿生微凝胶和人工细胞 合成生物学 NA 微流控技术 NA NA NA NA NA 区室化人工细胞设计,包含蛋白质捕获、酶介导内容物释放和刺激触发运动等生物启发行为 工业生物技术
9 2025-10-05
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-Apr-16, RNA (New York, N.Y.)
研究论文 开发了一种通过抑制核酶催化作用来准确测量环境依赖性核酶活性的RT-qPCR方法 在样品制备流程中引入寡核苷酸抑制剂来防止RNA提取和逆转录过程中的核酶切割,从而恢复RT-qPCR测量的准确性 方法主要针对已知体外环境依赖性切割的自切割RNA进行验证,在其他核酶类型中的适用性需进一步验证 开发能够准确测量不同环境中核酶活性的方法 自切割核酶 合成生物学 NA RT-qPCR, RNA提取, 逆转录 NA RNA, DNA NA NA NA 自切割核酶 合成生物学, 生物制造, 核酸治疗
10 2025-10-05
Examining interactions of animal cells with chloroplasts and their light-induced responses in in vitro cell culture systems
2025-04-12, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究通过体外实验系统探究动物细胞与叶绿体的相互作用及其光诱导反应 首次系统比较人类癌细胞、小鼠巨噬细胞和天然含叶绿体海蛞蝓细胞与叶绿体的相互作用模式 仅使用特定细胞系进行研究,未涵盖更广泛的动物细胞类型 探究动物细胞与叶绿体相互作用的机制及光诱导反应 人类宫颈癌HeLa细胞、小鼠巨噬样J774.1细胞和Elysia marginata海蛞蝓分离细胞 合成生物学 NA 体外细胞培养、叶绿体共孵育、光照射实验 NA 细胞行为观察、细胞死亡率、活性氧检测 三种不同类型细胞系(HeLa、J774.1、E. marginata分离细胞) NA 人类细胞, 小鼠细胞, 海蛞蝓细胞 NA 医学, 基础研究
11 2025-10-05
Designing biological network motif-based controllers by reverse engineering Hill function-type models from linear models
2025-Apr, Journal of the Royal Society, Interface
研究论文 提出一种从线性模型反推非线性Hill函数型模型的反向工程方法,用于设计实现完美适应的生物网络基序控制器 将线性系统理论与非线性建模相结合的反向工程方法,解决了非线性模型理论分析困难而线性模型无法捕捉基因表达系统非线性动态的问题 仅通过仿真验证方法有效性,缺乏实验验证 设计能够实现完美适应能力的生物控制器 生物网络基序控制器和基因回路 合成生物学 NA 反向工程方法,Hill函数建模 线性模型,非线性Hill函数模型 仿真数据 三个生物网络基序控制器 NA NA 生物网络基序控制器,完美适应基因回路 合成生物学,系统生物学
12 2025-10-05
Designing with Printed Responsive Biomaterials: A Review
2025-Apr, 3D printing and additive manufacturing IF:2.3Q3
综述 探讨跨学科增材制造策略在响应性生物材料设计中的应用及其在日常物品和建筑中的整合前景 提出将印刷响应性生物材料整合到日常物品和建筑中以增强环境和人类健康的创新愿景 NA 综述响应性生物材料的增材制造策略及其在环境和人类健康领域的应用潜力 生物基环境交互材料、生物聚合物复合材料、电化学和电阻器件、活性分子、生物传感器、活细胞、孢子或无细胞位点 生物材料科学 NA 增材制造 NA NA NA NA NA NA 环境, 医疗, 建筑, 能源
13 2025-10-05
Intranodal injection of neoantigen-bearing engineered Lactococcus lactis triggers epitope spreading and systemic tumor regressions
2025-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
研究论文 本研究开发了一种携带新抗原的工程化乳酸乳球菌,通过淋巴结注射可诱导表位扩散并引发系统性肿瘤消退 首次将即插即显系统与食品级工程益生菌结合,实现新抗原的高效呈递,并观察到45倍特异性T细胞增长及表位扩散现象 未明确说明临床转化时间表及人体试验数据 开发基于工程益生菌的个性化肿瘤免疫治疗平台 工程化乳酸乳球菌(FOLactis)及其携带的新抗原复合物(Ag-FOLactis) 合成生物学 肿瘤 即插即显系统、膜插入肽技术 NA 动物实验数据 皮下和转移性肿瘤模型 Plug-and-Display系统 Lactococcus lactis 膜插入肽介导的新抗原展示系统 医学
14 2025-10-05
Transformative strategies for saline soil restoration: Harnessing halotolerant microorganisms and advanced technologies
2025-Apr-28, World journal of microbiology & biotechnology IF:4.0Q2
综述 本文综述了利用耐盐微生物和先进技术修复盐渍土壤的创新策略 整合耐盐微生物机制与前沿生物技术(CRISPR-Cas9、合成生物学)及数字技术(机器学习、人工智能)的协同修复策略 NA 缓解盐胁迫对作物的负面影响并修复盐渍土壤 耐盐微生物与植物的互作机制 NA NA 宏基因组学、宏转录组学、纳米技术 NA NA NA CRISPR-Cas9 NA NA 农业, 环境
15 2025-10-05
Exploring potential biosafety implications in DNA information storage
2025-Apr, Biosafety and health IF:3.5Q1
研究论文 本研究评估了五种DNA信息存储编码方法在生物安全方面的潜在风险 首次系统评估DNA信息存储编码方法与自然生物DNA序列的相似性,揭示不同编码方法产生的生物安全风险差异 仅分析了五种代表性编码方法,未涵盖所有DNA存储编码策略 评估DNA信息存储技术的生物安全风险 五种DNA存储编码方法(Church、Goldman、DNA Fountain、Grass和MT编码)产生的序列 合成生物学 NA Kraken2分类分析、BLASTn比对分析 NA DNA序列数据 五种编码方法产生的代表性DNA序列 NA NA NA 数据存储
16 2025-10-05
The Application of Multiple Strategies to Enhance Methylparaben Synthesis Using the Engineered Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-25, Biology
研究论文 本研究通过多种代谢工程策略改造酿酒酵母以增强对羟基苯甲酸甲酯的生物合成 通过调控内源莽草酸途径限速步骤、增强中心碳通量及改进外源酶表达等多种策略组合,实现了酿酒酵母合成对羟基苯甲酸甲酯的最高产量 摇瓶产量为68.59 mg/L,尚未进行大规模发酵验证 开发环境友好的对羟基苯甲酸甲酯生物合成方法 工程化酿酒酵母 合成生物学 NA 代谢工程、启动子工程 NA NA NA 启动子工程 酿酒酵母 对羟基苯甲酸甲酯生物合成途径,包括莽草酸途径调控、竞争途径敲除和前体合成促进 工业生物技术,材料
17 2025-10-05
Biosimilars Targeting Pathogens: A Comprehensive Review of Their Role in Bacterial, Fungal, Parasitic, and Viral Infections
2025-Apr-28, Pharmaceutics IF:4.9Q1
综述 本文全面综述了生物类似物在细菌、真菌、寄生虫和病毒感染治疗中的作用及其发展前景 系统探讨了抗体工程、合成生物学和无细胞蛋白合成等创新技术在提升生物类似物效力和生产效率方面的潜力 NA 分析生物类似物在传染病治疗领域的应用价值和发展挑战 针对病原体的生物类似物(包括治疗性蛋白、单克隆抗体、抗菌肽等) NA 传染病 抗体工程、合成生物学、无细胞蛋白合成 NA NA NA NA NA NA 医药
18 2025-10-05
Preventing Multimer Formation in Commonly Used Synthetic Biology Plasmids
2025-04-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 调查常用合成生物学质粒中多聚体形成现象及其对电路可靠性的影响 首次系统评估四种常用质粒骨架在多聚体形成方面的差异,并开发出能避免多聚体形成的大肠杆菌MG1655基因敲除株 仅测试了两种大肠杆菌菌株和四种质粒骨架,未涵盖更广泛的宿主-质粒组合 优化质粒基础电路的完整性,防止多聚体形成对合成生物学电路的影响 四种常用合成生物学质粒骨架及其在大肠杆菌JM109和MG1655中的行为 合成生物学 NA 质粒构建、基因敲除、菌株转化 NA 分子生物学实验数据 四种质粒骨架在两种大肠杆菌菌株(JM109和MG1655)中的测试 基因敲除 大肠杆菌JM109, 大肠杆菌MG1655 质粒基础合成生物学电路 工业生物技术
19 2025-10-05
dFLASH; dual FLuorescent transcription factor activity sensor for histone integrated live-cell reporting and high-content screening
2025-Apr-07, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 开发了一种名为dFLASH的双荧光转录因子活性传感器,用于活细胞报告和高通量筛选 开发了首个组蛋白整合的双荧光活细胞转录因子活性传感器系统,具有模块化设计和基因组整合特性 NA 开发用于活细胞转录因子活性检测和筛选的工具平台 缺氧诱导因子(HIF)、孕酮受体(PGR)和合成转录因子 合成生物学 NA 双荧光报告系统、高通量成像、CRISPRoff、全基因组CRISPR KO筛选 NA 荧光图像 1600种化合物的天然产物库 CRISPRoff, CRISPR KO 哺乳动物细胞 转录因子活性生物传感器 药物发现, 功能基因组学, 合成生物学
20 2025-10-05
Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales
2025-04-18, ACS synthetic biology IF:3.7Q1
研究论文 提出一种多层自催化反馈策略,解决资源竞争和上下文依赖耦合对积分反馈控制的限制 开发多层自催化控制器实现群体水平积分反馈和多细胞积分器,控制功能通过多细胞群体间的协调相互作用涌现 NA 设计能够在资源竞争环境下实现鲁棒适应的合成生物控制系统 自催化积分反馈控制器、多细胞群体、工程微生物生态系统 合成生物学 NA 多层反馈策略、数学建模 积分反馈控制器 NA NA NA 微生物 自催化积分反馈控制器、多层反馈、群体水平控制电路 工业生物技术
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