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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-06-14 |
Synthetic Biology in Natural Product Biosynthesis
2025-Apr-09, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00567
PMID:40116601
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综述 | 本文综述了合成生物学在天然产物生物合成中的最新进展 | 总结了合成生物学在天然产物发现和工程中的多学科工具整合与应用 | NA | 探讨合成生物学在天然产物生物合成中的作用 | 天然产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 生物信息学、异源表达、组合生物合成 | NA | NA | NA |
2 | 2025-06-12 |
Intranodal injection of neoantigen-bearing engineered Lactococcus lactis triggers epitope spreading and systemic tumor regressions
2025-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.02.041
PMID:40486831
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research paper | 该研究开发了一种携带新抗原的工程化乳酸乳球菌(Ag-FOLactis),通过淋巴结注射触发表位扩散和系统性肿瘤消退 | 利用Plug-and-Display系统在FOLactis表面展示肿瘤抗原,显著增强树突状细胞呈递和新抗原特异性细胞免疫,诱导局部反应性T细胞数量增加45倍并引发表位扩散 | NA | 开发一种基于益生菌的个性化肿瘤免疫治疗平台 | 工程化乳酸乳球菌(FOLactis)及其携带的新抗原肽(Ag-FOLactis) | 免疫治疗 | 肿瘤 | Plug-and-Display系统 | 皮下和转移性肿瘤模型 | NA | NA |
3 | 2025-06-10 |
Transformative strategies for saline soil restoration: Harnessing halotolerant microorganisms and advanced technologies
2025-Apr-28, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04342-6
PMID:40289223
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综述 | 本文综述了利用耐盐微生物和先进技术修复盐渍土壤的创新策略 | 整合耐盐微生物与基因组编辑、合成生物学、高级组学工具及数字技术(如机器学习和AI)以优化土壤修复过程 | 需要未来研究协调这些技术和方法,以最大化植物-微生物相互作用并建立可持续农业系统 | 缓解盐分胁迫,修复盐渍土壤,保障粮食安全 | 耐盐微生物及其与植物的协同作用 | 农业生物技术 | NA | CRISPR-Cas9、合成生物学、宏基因组学、宏转录组学、微生物挥发性有机化合物(mVOCs)、纳米技术 | NA | NA | NA |
4 | 2025-06-04 |
Exploring potential biosafety implications in DNA information storage
2025-Apr, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.03.006
PMID:40453469
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research paper | 该研究评估了五种代表性DNA存储编码方法在生物安全性方面的风险,分析了它们与自然生物DNA的序列相似性 | 首次系统评估了DNA信息存储技术中人工合成DNA序列的生物安全风险,并提出了随机化策略以降低潜在风险 | 研究仅评估了五种编码方法,可能无法涵盖所有DNA存储技术的生物安全风险 | 探索DNA信息存储技术的生物安全影响 | 五种DNA存储编码方法(Church、Goldman、DNA Fountain、Grass和MT编码) | 合成生物学 | NA | Kraken2分类、BLASTn比对分析 | NA | DNA序列数据 | 五种代表性DNA存储编码方法产生的序列 |
5 | 2025-06-02 |
The Application of Multiple Strategies to Enhance Methylparaben Synthesis Using the Engineered Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology14050469
PMID:40427658
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研究论文 | 本研究利用工程化的酿酒酵母构建甲基对羟基苯甲酸酯(MP)的生物合成途径,并应用多种代谢工程策略突破合成过程中的瓶颈 | 通过调控内源莽草酸途径的限速步骤、增强中心碳通量及改进外源酶表达,实现了MP在酿酒酵母中的高效合成,产量达到68.59 mg/L,为目前报道的最高水平 | 研究仅在摇瓶水平进行验证,尚未进行大规模发酵或工业化生产的测试 | 开发环境友好的MP生物合成方法以替代传统化学合成工艺 | 工程化改造的酿酒酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、启动子工程、基因敲除 | NA | NA | NA |
6 | 2025-06-01 |
Biosimilars Targeting Pathogens: A Comprehensive Review of Their Role in Bacterial, Fungal, Parasitic, and Viral Infections
2025-Apr-28, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics17050581
PMID:40430873
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review | 本文全面综述了生物类似物在细菌、真菌、寄生虫和病毒感染中的作用 | 讨论了生物类似物开发中的障碍及创新技术,如抗体工程、合成生物学和无细胞蛋白合成 | 未提及具体研究数据或样本量,主要基于现有文献的综述 | 探讨生物类似物在治疗感染性疾病中的潜力和挑战 | 细菌、真菌、寄生虫和病毒等病原体 | NA | infectious diseases | antibody engineering, synthetic biology, cell-free protein synthesis | NA | NA | NA |
7 | 2025-06-01 |
Attaining the Promise of Geminivirus-Based Vectors in Plant Genome Editing
2025-Apr-27, Viruses
DOI:10.3390/v17050631
PMID:40431643
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综述 | 本文综述了基于双生病毒载体在植物基因组编辑中的应用及其潜力 | 探讨了双生病毒载体如何克服传统转基因技术的限制,加速基因组编辑过程 | 讨论了双生病毒载体在实际应用中面临的障碍 | 评估双生病毒载体在植物基因组编辑中的效果和潜力 | 植物基因组编辑技术 | 合成生物学 | NA | 病毒载体介导的基因编辑 | NA | NA | NA |
8 | 2025-05-31 |
Preventing Multimer Formation in Commonly Used Synthetic Biology Plasmids
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00508
PMID:40101192
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research paper | 该研究调查了四种常用质粒骨架在克隆菌株和野生型菌株中多聚体的形成情况,并提出了避免多聚体产生的单基因敲除方法 | 首次系统调查了不同质粒骨架在克隆和野生型菌株中多聚体的形成情况,并开发了避免多聚体产生的解决方案 | 研究仅针对大肠杆菌的两种菌株(JM109和MG1655),未涉及其他宿主系统 | 优化基于质粒的合成生物学电路设计和可靠性 | 四种常用质粒骨架在JM109和MG1655菌株中的多聚体形成情况 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、基因敲除 | NA | 分子生物学实验数据 | 四种质粒骨架在两种大肠杆菌菌株中的测试 |
9 | 2025-05-31 |
dFLASH; dual FLuorescent transcription factor activity sensor for histone integrated live-cell reporting and high-content screening
2025-Apr-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58488-w
PMID:40195317
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研究论文 | 本文介绍了一种名为dFLASH的双荧光转录因子活性传感器,用于组蛋白整合的活细胞报告和高通量筛选 | dFLASH系统能够均匀且特异性地检测内源性HIF和PGR活性,以及合成转录因子的共激活因子招募,具有双色核荧光输出,实现了标准化、动态的活细胞转录因子活性检测 | NA | 开发一种用于活细胞转录因子活性报告的模块化、基因组整合的传感器系统 | 缺氧诱导因子(HIF)和孕酮受体(PGR)的活性以及合成转录因子的共激活因子招募 | 合成生物学 | NA | 双荧光报告系统、高通量筛选、高内涵成像 | NA | 荧光信号 | 1600种化合物的天然产物库 |
10 | 2025-05-30 |
Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00575
PMID:40116396
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research paper | 该研究提出了一种多层自催化反馈策略,用于解决资源竞争和跨尺度环境下的积分控制问题 | 利用多层反馈策略实现群体水平的积分反馈和多细胞积分器,控制功能通过不同细胞群体间的协调互动实现 | 尚未在实际生物系统中全面验证其有效性 | 开发在资源竞争和复杂环境下实现稳健适应的控制策略 | 合成生物学中的基因表达调控和多细胞系统 | synthetic biology | NA | autocatalytic integral feedback controllers | multilayer feedback controller | NA | NA |
11 | 2025-05-30 |
Promiscuity of an Alcohol-Dependent Hemiterpene Pathway for the In Vivo Production of a Non-Natural Alkylated Tryptophan Derivative
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00865
PMID:40134314
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research paper | 该研究揭示了酒精依赖性半萜途径的广泛特异性,并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | 揭示了ADH模块第一个酶PhoN和下游芳香族异戊二烯基转移酶的广泛特异性,并展示了其在体内生产非天然烷基化色氨酸衍生物的能力 | NA | 探索和扩展异戊二烯生物合成的化学空间 | 酒精依赖性半萜途径及其酶 | 合成生物学 | NA | ADH途径 | NA | NA | NA |
12 | 2025-05-30 |
Development of a Transposon-Based Genome Engineering Toolkit for Efficient and Adaptable Genetic Modifications in Wolfiporia cocos
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00766
PMID:40173021
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research paper | 开发了一种基于转座子的基因组工程工具包,用于高效且适应性强的Wolfiporia cocos遗传修饰 | 该工具包显著提高了转化效率,支持多基因整合,并通过鸡尾酒式组装多个基因到转座子中,避免了复杂的遗传电路组装 | 研究仅限于Wolfiporia cocos,未在其他真菌菌株中验证其普适性 | 开发高效且适应性强的真菌基因组工程工具包 | Wolfiporia cocos真菌菌株 | 合成生物学 | NA | 转座子工程 | NA | 基因组数据 | NA |
13 | 2025-05-30 |
Fundamental Trade-Offs in the Robustness of Biological Systems with Feedback Regulation
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00704
PMID:40198741
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研究论文 | 本文研究了生物系统中反馈调控的稳健性及其基本性能权衡 | 提出了一个理论框架来量化生物反馈的准确性和稳健性,并使用多目标优化方法研究其性能权衡 | 仅研究了五种特定的生物反馈电路,可能无法涵盖所有生物反馈系统的复杂性 | 提高对生物反馈调控的理解,并为合成生物学中的稳健电路设计提供指导 | 五种生物反馈电路:正自调控、负自调控、双正反馈、正负反馈和双负反馈(切换开关) | 系统生物学 | NA | 多目标优化 | NA | NA | NA |
14 | 2025-05-30 |
Concentration-Dependent CsrA Regulation of the uxuB Transcript Leads to Development of a Post-Transcriptional Bandpass Filter
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00668
PMID:40202123
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研究论文 | 该研究利用新发现的转录后调控机制,设计了一种基于CsrA蛋白浓度的生物后转录带通滤波器 | 利用CsrA蛋白与mRNA 5' UTR + 100 nt CDS序列的异质性相互作用,实现了基于浓度的转录后调控,减少了合成电路组件的数量 | 需要进一步表征天然调控RNA-蛋白质系统以开发更复杂的RNP基电路 | 设计合成生物学中的转录后调控电路 | mRNA转录本和CsrA蛋白的相互作用 | 合成生物学 | NA | 转录后调控技术 | NA | NA | NA |
15 | 2025-05-30 |
Establishing a High-Yield Bacillus subtilis-Based Cell-Free Protein Synthesis System for In Vitro Prototyping and Natural Product Biosynthesis
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00021
PMID:40203238
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研究论文 | 本研究开发了一种基于工程化Bacillus subtilis 164T7P菌株的高产无细胞蛋白质合成系统,用于体外原型设计和天然产物生物合成 | 通过基因组整合T7 RNA聚合酶基因,开发了无需额外添加T7 RNA聚合酶的高产CFPS系统,并实现了半连续反应模式下超过1100 μg/mL的蛋白质产量 | NA | 开发高产无细胞蛋白质合成系统,用于合成生物学和生物技术应用 | Bacillus subtilis 164T7P菌株及其无细胞提取物 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS) | NA | NA | NA |
16 | 2025-05-23 |
Synthetic Biology-Based Engineering Cells for Drug Delivery
2025-Apr, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240095
PMID:40395752
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综述 | 本文综述了基于合成生物学的工程细胞在药物递送中的新兴应用 | 探讨了合成生物学与纳米技术在药物递送中的前沿融合,强调了工程细胞的模块化、标准化和智能化发展趋势 | 未提及具体实验数据或临床验证结果 | 推动先进药物递送系统的构建 | 合成生物学工程细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA |
17 | 2025-05-17 |
Cryo-EM structure of cyanopodophage A4 reveals a pentameric pre-ejectosome in the double-stabilized capsid
2025-Apr-08, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2423403122
PMID:40163721
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研究论文 | 本文报道了蓝藻噬菌体A4的完整结构,揭示了其双稳定衣壳中的五聚体预喷射体结构 | 发现了由四种喷射蛋白组成的五聚体预喷射体结构,并提出了噬菌体的DNA包装和喷射机制 | NA | 研究蓝藻噬菌体A4的结构及其DNA包装和喷射机制 | 蓝藻噬菌体A4 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜(Cryo-EM) | NA | 结构数据 | NA |
18 | 2025-05-17 |
Development and application of an interbacterial DNA delivery system based on M13 bacteriophage
2025-Apr-05, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04309-z
PMID:40186660
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研究论文 | 开发了一种基于M13噬菌体的细菌间DNA传递系统,用于研究细菌间的协作响应机制 | 利用M13噬菌体构建了动态噬菌粒补充系统,实现了在无抗生素选择压力环境下维持噬菌粒DNA的稳定性,为多细菌联合调控提供了新方法 | NA | 开发细菌间DNA传递系统,研究细菌协作响应机制 | 工程化细菌 | 合成生物学 | NA | 噬菌体介导的DNA传递 | NA | DNA | NA |
19 | 2025-05-17 |
Sustainable regeneration of 20 aminoacyl-tRNA synthetases in a reconstituted system toward self-synthesizing artificial systems
2025-Apr-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt6269
PMID:40173221
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研究论文 | 本文开发了一种能够持续再生20种氨酰-tRNA合成酶(AARS)的重构系统,为自复制人工系统的实现提供了重要进展 | 通过五种改进方法实现了20种AARS的可持续再生,包括序列优化、翻译系统组成优化、使用不同细菌的AlaRS和SerRS、减少翻译抑制以及平衡DNA浓度 | NA | 实现自复制人工系统的体外构建 | 20种氨酰-tRNA合成酶(AARS) | 合成生物学 | NA | 体外重构系统 | NA | NA | NA |
20 | 2025-05-17 |
Introduction of human m6Am methyltransferase PCIF1 facilitates the biosynthesis of terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-02, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02701-4
PMID:40176045
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研究论文 | 本研究通过将人类m6Am甲基转移酶PCIF1引入酿酒酵母,显著提高了萜类化合物的生物合成效率 | 首次发现PCIF1能显著促进酿酒酵母中角鲨烯和长叶烯的生物合成,并揭示了其通过上调糖酵解和乙酰辅酶A生物合成途径相关基因以及激活细胞壁完整性MAPK途径的机制 | 研究仅针对PCIF1在酿酒酵母中的作用,未在其他微生物系统中验证其普适性 | 开发更高效的代谢途径优化策略以提高微生物细胞工厂的生产潜力 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)和萜类化合物(角鲨烯和长叶烯) | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略、转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 工程化酵母菌株 |