本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
Attaining the Promise of Geminivirus-Based Vectors in Plant Genome Editing
2025-04-27, Viruses
DOI:10.3390/v17050631
PMID:40431643
|
综述 | 本文综述了利用菜豆金色花叶病毒载体改进植物基因组编辑技术的潜力与挑战 | 系统比较菜豆金色花叶病毒载体与传统转基因方法的优势,提出其可加速基因组编辑进程并降低技术门槛 | NA | 探讨菜豆金色花叶病毒载体在植物基因组编辑中的应用前景 | 植物病毒载体与基因组编辑技术 | 合成生物学 | NA | 同源定向修复(HDR)、组织培养 | NA | NA | NA | 植物病毒载体 | 植物 | NA | 农业 |
| 22 | 2025-10-05 |
Microfluidic Production of Spatially Structured Biomimetic Microgels as Compartmentalized Artificial Cells
2025-Apr, Small science
IF:11.1Q1
DOI:10.1002/smsc.202400320
PMID:40657197
|
研究论文 | 开发了一种微流控策略生产具有空间结构的仿生微凝胶作为区室化人工细胞 | 通过微流控技术实现微米级二区和三区仿生微凝胶的可控制备,能够调控区室数量、组成、尺寸和形状 | NA | 模仿生物细胞的区室化特征,开发功能化软物质微器件 | 仿生微凝胶和人工细胞 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 区室化人工细胞设计,包含蛋白质捕获、酶介导内容物释放和刺激触发运动等生物启发行为 | 工业生物技术 |
| 23 | 2025-10-05 |
Examining interactions of animal cells with chloroplasts and their light-induced responses in in vitro cell culture systems
2025-04-12, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151622
PMID:40117974
|
研究论文 | 本研究通过体外实验系统探究动物细胞与叶绿体的相互作用及其光诱导反应 | 首次系统比较人类癌细胞、小鼠巨噬细胞和天然含叶绿体海蛞蝓细胞与叶绿体的相互作用模式 | 仅使用特定细胞系进行研究,未涵盖更广泛的动物细胞类型 | 探究动物细胞与叶绿体相互作用的机制及光诱导反应 | 人类宫颈癌HeLa细胞、小鼠巨噬样J774.1细胞和Elysia marginata海蛞蝓分离细胞 | 合成生物学 | NA | 体外细胞培养、叶绿体共孵育、光照射实验 | NA | 细胞行为观察、细胞死亡率、活性氧检测 | 三种不同类型细胞系(HeLa、J774.1、E. marginata分离细胞) | NA | 人类细胞, 小鼠细胞, 海蛞蝓细胞 | NA | 医学, 基础研究 |
| 24 | 2025-10-05 |
Intranodal injection of neoantigen-bearing engineered Lactococcus lactis triggers epitope spreading and systemic tumor regressions
2025-Apr, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2025.02.041
PMID:40486831
|
研究论文 | 本研究开发了一种携带新抗原的工程化乳酸乳球菌,通过淋巴结注射可诱导表位扩散并引发系统性肿瘤消退 | 首次将即插即显系统与食品级工程益生菌结合,实现新抗原的高效呈递,并观察到45倍特异性T细胞增长及表位扩散现象 | 未明确说明临床转化时间表及人体试验数据 | 开发基于工程益生菌的个性化肿瘤免疫治疗平台 | 工程化乳酸乳球菌(FOLactis)及其携带的新抗原复合物(Ag-FOLactis) | 合成生物学 | 肿瘤 | 即插即显系统、膜插入肽技术 | NA | 动物实验数据 | 皮下和转移性肿瘤模型 | Plug-and-Display系统 | Lactococcus lactis | 膜插入肽介导的新抗原展示系统 | 医学 |
| 25 | 2025-10-05 |
Transformative strategies for saline soil restoration: Harnessing halotolerant microorganisms and advanced technologies
2025-Apr-28, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04342-6
PMID:40289223
|
综述 | 本文综述了利用耐盐微生物和先进技术修复盐渍土壤的创新策略 | 整合耐盐微生物机制与前沿生物技术(CRISPR-Cas9、合成生物学)及数字技术(机器学习、人工智能)的协同修复策略 | NA | 缓解盐胁迫对作物的负面影响并修复盐渍土壤 | 耐盐微生物与植物的互作机制 | NA | NA | 宏基因组学、宏转录组学、纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 农业, 环境 |
| 26 | 2025-10-05 |
Exploring potential biosafety implications in DNA information storage
2025-Apr, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.03.006
PMID:40453469
|
研究论文 | 本研究评估了五种DNA信息存储编码方法在生物安全方面的潜在风险 | 首次系统评估DNA信息存储编码方法与自然生物DNA序列的相似性,揭示不同编码方法产生的生物安全风险差异 | 仅分析了五种代表性编码方法,未涵盖所有DNA存储编码策略 | 评估DNA信息存储技术的生物安全风险 | 五种DNA存储编码方法(Church、Goldman、DNA Fountain、Grass和MT编码)产生的序列 | 合成生物学 | NA | Kraken2分类分析、BLASTn比对分析 | NA | DNA序列数据 | 五种编码方法产生的代表性DNA序列 | NA | NA | NA | 数据存储 |
| 27 | 2025-10-05 |
The Application of Multiple Strategies to Enhance Methylparaben Synthesis Using the Engineered Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-25, Biology
DOI:10.3390/biology14050469
PMID:40427658
|
研究论文 | 本研究通过多种代谢工程策略改造酿酒酵母以增强对羟基苯甲酸甲酯的生物合成 | 通过调控内源莽草酸途径限速步骤、增强中心碳通量及改进外源酶表达等多种策略组合,实现了酿酒酵母合成对羟基苯甲酸甲酯的最高产量 | 摇瓶产量为68.59 mg/L,尚未进行大规模发酵验证 | 开发环境友好的对羟基苯甲酸甲酯生物合成方法 | 工程化酿酒酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、启动子工程 | NA | NA | NA | 启动子工程 | 酿酒酵母 | 对羟基苯甲酸甲酯生物合成途径,包括莽草酸途径调控、竞争途径敲除和前体合成促进 | 工业生物技术,材料 |
| 28 | 2025-10-05 |
Biosimilars Targeting Pathogens: A Comprehensive Review of Their Role in Bacterial, Fungal, Parasitic, and Viral Infections
2025-Apr-28, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics17050581
PMID:40430873
|
综述 | 本文全面综述了生物类似物在细菌、真菌、寄生虫和病毒感染治疗中的作用及其发展前景 | 系统探讨了抗体工程、合成生物学和无细胞蛋白合成等创新技术在提升生物类似物效力和生产效率方面的潜力 | NA | 分析生物类似物在传染病治疗领域的应用价值和发展挑战 | 针对病原体的生物类似物(包括治疗性蛋白、单克隆抗体、抗菌肽等) | NA | 传染病 | 抗体工程、合成生物学、无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 29 | 2025-10-05 |
Preventing Multimer Formation in Commonly Used Synthetic Biology Plasmids
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00508
PMID:40101192
|
研究论文 | 调查常用合成生物学质粒中多聚体形成现象及其对电路可靠性的影响 | 首次系统评估四种常用质粒骨架在多聚体形成方面的差异,并开发出能避免多聚体形成的大肠杆菌MG1655基因敲除株 | 仅测试了两种大肠杆菌菌株和四种质粒骨架,未涵盖更广泛的宿主-质粒组合 | 优化质粒基础电路的完整性,防止多聚体形成对合成生物学电路的影响 | 四种常用合成生物学质粒骨架及其在大肠杆菌JM109和MG1655中的行为 | 合成生物学 | NA | 质粒构建、基因敲除、菌株转化 | NA | 分子生物学实验数据 | 四种质粒骨架在两种大肠杆菌菌株(JM109和MG1655)中的测试 | 基因敲除 | 大肠杆菌JM109, 大肠杆菌MG1655 | 质粒基础合成生物学电路 | 工业生物技术 |
| 30 | 2025-10-05 |
dFLASH; dual FLuorescent transcription factor activity sensor for histone integrated live-cell reporting and high-content screening
2025-Apr-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58488-w
PMID:40195317
|
研究论文 | 开发了一种名为dFLASH的双荧光转录因子活性传感器,用于活细胞报告和高通量筛选 | 开发了首个组蛋白整合的双荧光活细胞转录因子活性传感器系统,具有模块化设计和基因组整合特性 | NA | 开发用于活细胞转录因子活性检测和筛选的工具平台 | 缺氧诱导因子(HIF)、孕酮受体(PGR)和合成转录因子 | 合成生物学 | NA | 双荧光报告系统、高通量成像、CRISPRoff、全基因组CRISPR KO筛选 | NA | 荧光图像 | 1600种化合物的天然产物库 | CRISPRoff, CRISPR KO | 哺乳动物细胞 | 转录因子活性生物传感器 | 药物发现, 功能基因组学, 合成生物学 |
| 31 | 2025-10-05 |
Multi-Layer Autocatalytic Feedback Enables Integral Control Amidst Resource Competition and Across Scales
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00575
PMID:40116396
|
研究论文 | 提出一种多层自催化反馈策略,解决资源竞争和上下文依赖耦合对积分反馈控制的限制 | 开发多层自催化控制器实现群体水平积分反馈和多细胞积分器,控制功能通过多细胞群体间的协调相互作用涌现 | NA | 设计能够在资源竞争环境下实现鲁棒适应的合成生物控制系统 | 自催化积分反馈控制器、多细胞群体、工程微生物生态系统 | 合成生物学 | NA | 多层反馈策略、数学建模 | 积分反馈控制器 | NA | NA | NA | 微生物 | 自催化积分反馈控制器、多层反馈、群体水平控制电路 | 工业生物技术 |
| 32 | 2025-10-05 |
Development of a Transposon-Based Genome Engineering Toolkit for Efficient and Adaptable Genetic Modifications in Wolfiporia cocos
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00766
PMID:40173021
|
研究论文 | 开发了一种基于转座子的基因组工程工具包,用于在茯苓中实现高效且适应性强的遗传修饰 | 创建了专门针对茯苓优化的转座子工程工具包,通过鸡尾酒式组装多基因转座子实现高效多重基因整合,无需复杂遗传电路组装 | NA | 开发适用于真菌系统的高效基因组工程工具 | 茯苓(Wolfiporia cocos)真菌 | 合成生物学 | NA | 转座子工程、转录组分析 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | 转座子 | 茯苓(Wolfiporia cocos) | 多重基因整合系统 | 工业生物技术 |
| 33 | 2025-10-05 |
Fundamental Trade-Offs in the Robustness of Biological Systems with Feedback Regulation
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00704
PMID:40198741
|
研究论文 | 本研究通过分析五种生物反馈电路,探讨生物系统中反馈调节的鲁棒性及其基本性能权衡 | 首次系统量化生物反馈回路的灵敏度,并提出多目标优化框架研究其性能权衡 | 仅分析了五种典型反馈电路,未覆盖所有可能的生物反馈机制 | 建立研究生物反馈调节的理论框架,提高对生物系统鲁棒性的理解 | 五种生物反馈电路:正自调节、负自调节、双正反馈、正负反馈和双负反馈(切换开关) | 系统生物学 | NA | 多目标优化 | NA | 理论分析 | NA | NA | NA | 正自调节、负自调节、双正反馈、正负反馈、双负反馈(切换开关) | 合成生物学, 系统生物学 |
| 34 | 2025-10-05 |
Establishing a High-Yield Bacillus subtilis-Based Cell-Free Protein Synthesis System for In Vitro Prototyping and Natural Product Biosynthesis
2025-04-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00021
PMID:40203238
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于枯草芽孢杆菌的高产无细胞蛋白质合成系统 | 通过基因组整合T7 RNA聚合酶基因的工程菌株开发高产CFPS系统,无需额外添加T7 RNA聚合酶 | NA | 建立高产无细胞蛋白质合成系统用于体外原型设计和天然产物生物合成 | 枯草芽孢杆菌无细胞系统、核糖体结合位点元件、天然产物生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成、基因组工程 | NA | 蛋白质产量数据、酶活性数据 | NA | 基因组整合 | 枯草芽孢杆菌 | T7启动子系统、核糖体结合位点原型设计、天然产物生物合成途径 | 工业生物技术, 医药 |
| 35 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology-Based Engineering Cells for Drug Delivery
2025-Apr, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240095
PMID:40395752
|
综述 | 本文综述了基于合成生物学的工程化细胞在药物递送领域的新兴应用 | 聚焦合成生物学与纳米技术交叉融合的前沿进展,提出工程化细胞向模块化、标准化和智能化发展的新方向 | NA | 探讨合成生物学策略在生物药物递送系统开发中的应用 | 基于合成生物学的工程化细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 工程化细胞 | NA | 医药 |
| 36 | 2025-10-05 |
Development and application of an interbacterial DNA delivery system based on M13 bacteriophage
2025-Apr-05, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04309-z
PMID:40186660
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于M13噬菌体的工程细菌DNA递送系统,用于研究细菌间的协同响应机制 | 利用M13噬菌体构建动态噬菌粒补充系统,首次实现工程细菌间DNA介导的信息传递和协同响应 | 未提及具体应用场景下的效率验证和安全性评估 | 开发工程细菌间DNA递送系统并研究细菌协同响应机制 | 工程细菌和M13噬菌体 | 合成生物学 | NA | 噬菌体递送系统、基因电路模块化 | NA | NA | NA | M13噬菌体 | 工程细菌 | 动态噬菌粒补充系统、模块化基因电路 | 医学 |
| 37 | 2025-10-05 |
Sustainable regeneration of 20 aminoacyl-tRNA synthetases in a reconstituted system toward self-synthesizing artificial systems
2025-Apr-04, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt6269
PMID:40173221
|
研究论文 | 开发了一种能够持续再生全部20种氨酰-tRNA合成酶的重构系统,推动自合成人工系统的实现 | 首次实现了在重构系统中持续再生全部20种AARS,通过五项关键改进突破了翻译系统的自我再生难题 | 未提及在更复杂系统或体内环境中的应用验证 | 构建可自我复制的人工系统,推动合成生物学发展 | 20种氨酰-tRNA合成酶(AARS)及其再生系统 | 合成生物学 | NA | 体外重构系统、序列优化、翻译系统优化、密码子优化 | NA | 实验数据 | 20种AARS蛋白的再生系统 | 体外重构系统 | 无细胞系统 | AARS再生系统,包含20种酶的协同表达和功能维持 | 合成生物学、基础研究 |
| 38 | 2025-10-05 |
Introduction of human m6Am methyltransferase PCIF1 facilitates the biosynthesis of terpenoids in Saccharomyces cerevisiae
2025-Apr-02, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02701-4
PMID:40176045
|
研究论文 | 本研究通过在酿酒酵母中引入人类m6Am甲基转移酶PCIF1,显著提高了萜类化合物的生物合成效率 | 首次发现人类m6Am甲基转移酶PCIF1在酵母中能促进萜类化合物生物合成,并揭示其通过上调糖酵解和乙酰辅酶A生物合成途径基因以及激活细胞壁完整性MAPK通路发挥作用 | NA | 开发更高效的代谢途径优化策略以提高微生物细胞工厂的生产潜力 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、转录组分析 | NA | 基因表达数据、代谢产物数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 萜类化合物生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 39 | 2025-10-05 |
Machine learning-led semi-automated medium optimization reveals salt as key for flaviolin production in Pseudomonas putida
2025-Apr-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08039-2
PMID:40251395
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的半自动化培养基优化方法,显著提高了恶臭假单胞菌中黄青霉素的产量 | 开发了分子和宿主无关的主动学习培养基优化流程,通过可解释AI技术意外发现盐浓度是影响黄青霉素生产的关键因素 | NA | 通过机器学习和自动化技术优化微生物发酵培养基,提高目标化学品的产量和产率 | 恶臭假单胞菌KT2440菌株的黄青霉素生产 | 机器学习 | NA | 主动学习、可解释人工智能 | 机器学习 | 发酵过程数据 | 三个不同的黄青霉素生产实验批次 | DBTL循环 | 恶臭假单胞菌 | NA | 工业生物技术 |
| 40 | 2025-10-05 |
Long-Term Yeast Cultivation Coupled with In Situ Extraction for High Triterpenoid Production
2025-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c00273
PMID:40129278
|
研究论文 | 本研究通过结合长期酵母培养与原位提取技术,显著提高了工程酵母中人参皂苷的产量和分泌效率 | 将长期酵母培养与原位提取技术相结合,实现了3.4 g/L的高产量人参皂苷生产,且酵母可重复使用10次 | NA | 提高三萜类化合物(人参皂苷)的生产效率和工业化潜力 | 工程酵母生产的人参皂苷 | 合成生物学 | NA | 酵母培养、原位提取 | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | 酵母 | 三萜类化合物合成途径 | 医药、工业生物技术 |