合成生物学相关文章
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当前共找到 95 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-05-16 |
Machine learning-led semi-automated medium optimization reveals salt as key for flaviolin production in Pseudomonas putida
2025-Apr-18, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08039-2
PMID:40251395
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研究论文 | 本文介绍了一种基于机器学习的半自动化培养基优化方法，显著提高了恶臭假单胞菌中黄酮醇的产量 | 提出了一种分子和宿主无关的主动学习流程，通过半自动化管道快速优化培养基，并发现盐浓度是影响黄酮醇生产的关键因素 | 未明确说明该方法在其他宿主或分子生产中的普适性 | 优化培养基以提高恶臭假单胞菌中黄酮醇的产量 | 恶臭假单胞菌KT2440和黄酮醇生产 | 合成生物学 | NA | 机器学习，主动学习，半自动化管道 | NA | 实验数据 | 三个不同的黄酮醇生产实验 |
| 22 | 2025-05-16 |
Long-Term Yeast Cultivation Coupled with In Situ Extraction for High Triterpenoid Production
2025-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c00273
PMID:40129278
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research paper | 该研究通过结合长期酵母培养与原位提取技术，提高了工程酵母细胞内人参皂苷的生产和输出效率 | 结合长期酵母培养与原位提取技术，显著提高人参皂苷产量，并实现酵母的重复利用 | 研究未提及该方法在大规模工业化生产中的可行性和成本效益 | 提高人参皂苷的生产效率，支持其工业化生产 | 工程酵母 | 合成生物学 | NA | 酵母培养与原位提取技术 | NA | NA | NA |
| 23 | 2025-05-15 |
Examining interactions of animal cells with chloroplasts and their light-induced responses in in vitro cell culture systems
2025-Apr-12, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151622
PMID:40117974
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研究论文 | 本研究探讨了动物细胞与叶绿体在体外培养系统中的相互作用及其光诱导反应 | 揭示了三种不同的动物细胞与叶绿体相互作用模式，并强调了光诱导ROS生成在细胞毒性中的重要性 | 缺乏完善的体外实验系统来研究叶绿体与动物细胞的相互作用 | 研究叶绿体与动物细胞的相互作用及其光诱导反应 | 人宫颈癌HeLa细胞、小鼠巨噬细胞样J774.1细胞以及从Elysia marginata分离的细胞 | 合成生物学 | 宫颈癌 | 体外细胞培养 | NA | 细胞行为观察数据 | HeLa细胞、J774.1细胞和Elysia marginata细胞 |
| 24 | 2025-05-15 |
Phase Separation-Mediated Multienzyme Assembly In Vivo
2025-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c09585
PMID:40107849
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research paper | 研究通过相分离蛋白RGGRGG与ReverseTag/ReverseCatcher标记系统的整合，探索其在多酶复合物形成中的潜力 | 首次将相分离蛋白RGGRGG与ReverseTag/ReverseCatcher系统结合，用于多酶复合物的自组装，显著提高了番茄红素的产量 | 研究主要集中于番茄红素生物合成途径中的六种酶，未广泛验证其他酶系统的适用性 | 探索相分离介导的多酶组装在合成生物学中的应用 | 相分离蛋白RGGRGG、ReverseTag/ReverseCatcher标记系统及番茄红素生物合成途径中的六种酶 | synthetic biology | NA | coarse-grained simulations, enzyme immobilization | NA | simulation data, experimental data | 六种番茄红素生物合成途径中的酶 |
| 25 | 2025-05-14 |
Synthetic biology approaches to improve Rubisco carboxylation efficiency in C3 Plants: Direct and Indirect Strategies
2025-Apr, Journal of plant physiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.jplph.2025.154470
PMID:40056853
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review | 本文综述了合成生物学在提高C3植物中Rubisco羧化效率方面的最新策略和技术 | 介绍了通过直接和间接策略优化Rubisco羧化效率的最新合成生物学和基因转化技术 | NA | 提高C3植物中Rubisco的羧化效率以改善光合作用性能 | C3植物中的Rubisco酶及其相关蛋白 | 合成生物学 | NA | 基因转化技术 | NA | NA | NA |
| 26 | 2025-05-12 |
Advances in engineering substrate scope of Pseudomonas cell factories
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103270
PMID:39978295
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research paper | 探讨如何通过代谢工程、合成生物学和实验室进化增强假单胞菌的底物范围，以利用多样化的废物衍生底物 | 提出利用假单胞菌作为新一代工业生物技术宿主，并通过工程手段扩展其底物范围，以利用废物衍生底物 | 自然分离的假单胞菌可能不适合高要求的生物技术应用 | 扩展和维持生物工艺，探索新的微生物宿主和废物衍生底物 | 假单胞菌及其代谢工程 | 工业生物技术 | NA | 代谢工程、合成生物学、实验室进化 | NA | NA | NA |
| 27 | 2025-05-11 |
Toward an integrated omics approach for plant biosynthetic pathway discovery in the age of AI
2025-Apr, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2025.01.010
PMID:40000312
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综述 | 本文综述了利用多组学策略和人工智能技术发现植物生物合成途径的最新进展 | 提出结合分子网络、反应对分析和基因表达模式的集成工作流程，以及AI驱动的方法来革新途径发现 | 未提及具体实验验证或应用案例 | 促进可持续生物经济发展，通过合成生物学获取复杂天然产物 | 植物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、代谢组学 | AI驱动方法 | 多组学数据 | NA |
| 28 | 2025-05-10 |
The structure of the Vibrio natriegens 70S ribosome in complex with the proline-rich antimicrobial peptide Bac5(1-17)
2025-Apr-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf324
PMID:40331629
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research paper | 该研究通过冷冻电镜技术解析了Vibrio natriegens 70S核糖体与富含脯氨酸的抗菌肽Bac5(1-17)复合物的结构 | 揭示了Bac5与核糖体出口通道的独特相互作用模式，不同于其他I型PrAMPs | 仅研究了Vibrio natriegens这一种细菌的核糖体结构 | 阐明Bac5抗菌肽与细菌核糖体的结合方式及其抑制蛋白质合成的分子机制 | Vibrio natriegens 70S核糖体与Bac5(1-17)抗菌肽复合物 | 结构生物学 | 细菌感染 | 冷冻电镜(cryo-EM) | NA | 冷冻电镜图像数据 | 单个复合物结构 |
| 29 | 2025-05-10 |
Recombinant human collagen XVII protects skin basement membrane integrity by inhibiting the MAPK and Wnt signaling pathways
2025-Apr, Molecular medicine reports
IF:3.4Q2
DOI:10.3892/mmr.2025.13465
PMID:39981899
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研究论文 | 研究重组人类胶原蛋白XVII（RHCXVII）在保护皮肤基底膜完整性方面的功效和作用机制 | 首次阐明RHCXVII通过抑制MAPK和Wnt信号通路保护皮肤基底膜完整性的机制 | 研究仅基于体外HaCaT细胞模型，未涉及体内实验或临床验证 | 探究RHCXVII在皮肤基底膜保护中的作用及其分子机制 | UVB照射的人HaCaT角质形成细胞 | 合成生物学 | 皮肤损伤 | 逆转录定量PCR、蛋白质印迹、磷酸化抗体阵列 | UVB诱导的皮肤损伤模型 | 分子生物学数据 | 体外培养的HaCaT细胞系 |
| 30 | 2025-05-09 |
A novel NAC36-MYB18-TAT2 model regulates the synthesis of phenolic acid in Salvia miltiorrhiza Bunge
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140987
PMID:39952526
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研究论文 | 本文揭示了丹参中酚酸合成的NAC36-MYB18-TAT2分子模型调控机制 | 首次报道了SmTAT2在丹参酚酸代谢途径中的生物学功能及调控机制，并揭示了NAC36-MYB18-TAT2分子模型的作用 | NA | 研究丹参中酚酸合成的分子调控机制 | 丹参（Salvia miltiorrhiza Bunge）中的酚酸代谢途径 | 合成生物学 | NA | 转基因实验（过表达和CRISPR/Cas9）、分子互作技术（酵母单杂交、双荧光素酶报告基因检测和EMSA） | NAC36-MYB18-TAT2分子模型 | 分子生物学数据 | NA |
| 31 | 2025-05-08 |
Unraveling the hydroxylation and methylation mechanism in polymethoxylated flavones biosynthesis in Dracocephalum moldavica
2025-Apr, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109571
PMID:39919496
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研究论文 | 本研究揭示了Dracocephalum moldavica中多甲氧基黄酮（PMFs）生物合成中的羟基化和甲基化机制 | 鉴定了三种黄酮羟基化酶（DmFH1/2/3）和四种黄酮O-甲基转移酶（DmOMT1/2/3/4），并阐明了它们在PMFs生物合成中的作用 | 研究仅基于转录组数据库分析，未进行更深入的体内功能验证 | 阐明Dracocephalum moldavica中多甲氧基黄酮生物合成的羟基化和甲基化机制 | Dracocephalum moldavica植物及其多甲氧基黄酮生物合成相关酶 | 植物生物化学 | NA | 转录组分析、异源表达 | NA | 转录组数据 | NA |
| 32 | 2025-05-08 |
Progress on production of malic acid and succinic acid by industrially-important engineered microorganisms
2025-Apr, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.02.001
PMID:39923900
|
综述 | 本文总结了通过代谢工程改进有机酸生物合成的最新研究进展，重点关注L-苹果酸（L-MA）和琥珀酸（SA） | 结合合成生物学和高通量筛选等新技术，探讨了代谢工程在提高有机酸产量方面的应用 | 微生物发酵的产量低和发酵周期长限制了其工业应用 | 改进有机酸的生物合成方法，提高产量和效率 | L-苹果酸（L-MA）和琥珀酸（SA） | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、高通量筛选 | NA | NA | NA |
| 33 | 2025-05-04 |
Microbially Derived P=S and P=Se Bond Formation
2025-Apr-28, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c00262
PMID:40313816
|
研究论文 | 本文报道了多种细菌通过中心硫代谢和非酶化学形成P=S键（PhP到PhPS），并首次应用于微生物P=Se键（PhPSe）的形成 | 首次在微生物细胞中进行P=S键形成的生化和遗传研究，并首次将微生物代谢物用于化学合成中的P=Se键形成 | NA | 探索微生物代谢物在化学合成中的直接应用 | 细菌及其代谢物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 34 | 2025-05-03 |
Creating a Halotolerant Degrader for Efficient Mineralization of p-Nitrophenol-Substituted Organophosphorus Pesticides in High-Saline Wastewater
2025-Apr, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.28923
PMID:39821562
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法创建了一种耐盐降解菌J9U-MP，用于高效矿化高盐废水中的对硝基酚取代有机磷农药 | 首次将包含七个基因的异源生物降解途径与耐盐底盘菌Halomonas cupida J9结合，创建了能在高盐和低氧环境下高效降解有机磷农药的工程菌J9U-MP | 研究仅针对特定类型的有机磷农药（对硝基酚取代的有机磷农药）进行测试，未涉及其他类型污染物 | 开发能在高盐废水中高效降解有机磷农药的生物修复技术 | 对硝基酚取代的有机磷农药（如甲基对硫磷）及其降解中间产物 | 合成生物学 | NA | 基因工程、RT-PCR、气相色谱分析、稳定同位素分析 | NA | 生物化学数据 | 工程菌J9U-MP在含60g/L NaCl的废水中对50mg/L甲基对硫磷及其降解产物的降解实验 |
| 35 | 2025-05-03 |
Next-generation metabolic models informed by biomolecular simulations
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103259
PMID:39827498
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research paper | 该文章探讨了如何将生物分子模拟与代谢模型相结合，以推动结构引导的合成生物学应用 | 提出了将生物分子模拟和机器学习预测整合到代谢模型中的新方法，以优化和理解代谢途径 | 尚未具体说明生物分子模拟与代谢模型整合的实际应用效果和具体案例 | 优化和理解代谢途径，以改善蛋白质和小分子产品的生物生产 | 从微生物到人类的细胞代谢 | 合成生物学 | NA | 生物分子模拟, 机器学习 | flux balance analysis, dynamic, kinetic delineations | 代谢网络数据 | NA |
| 36 | 2025-05-03 |
Advances in designed bionanomolecular assemblies for biotechnological and biomedical applications
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103256
PMID:39827499
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综述 | 本文综述了蛋白质工程在生物纳米分子组装设计方面的最新进展及其在生物技术和生物医学中的应用 | 结合AI工具（如AlphaFold、RFDiffusion和ProteinMPNN）显著提高了从头设计的可扩展性和成功率 | NA | 探讨蛋白质工程在设计和应用生物纳米分子组装方面的潜力 | 有限组装（如纳米笼和基于卷曲螺旋的结构）和扩展组装（如细丝和2D/3D晶格） | 合成生物学、材料科学、生物技术、生物医学 | NA | 蛋白质工程、AI工具（AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN） | NA | NA | NA |
| 37 | 2025-05-03 |
Using synthetic biology to express nitrogenase biosynthesis pathway in rice and to overcome barriers of nitrogenase instability in plant cytosol
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.12.002
PMID:39818476
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research paper | 该研究通过合成生物学方法将固氮酶生物合成途径引入水稻，以克服植物细胞质中固氮酶不稳定的障碍 | 成功将包含13个基因的固氮酶生物合成途径引入水稻，并发现NifH-S18是导致蛋白降解的关键残基，获得了具有Fe蛋白活性且抵抗植物内切蛋白酶切割的NifH变体 | NifH在水稻细胞质中仍不稳定，需要进一步优化以提高其稳定性 | 通过工程化方法实现谷物中的固氮作用，减少化学氮肥的使用 | 水稻 | 合成生物学 | NA | 多基因载体转化、性杂交、基因组测序分析 | NA | 基因组数据、蛋白质数据 | 转基因水稻品系L12-13和L8-17 |
| 38 | 2025-05-03 |
Designing with Printed Responsive Biomaterials: A Review
2025-Apr, 3D printing and additive manufacturing
IF:2.3Q3
DOI:10.1089/3dp.2024.0004
PMID:40308656
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review | 本文综述了跨学科领域中用于设计响应性生物材料的增材制造策略，并展望了如何将印刷响应性生物材料（PRBs）融入日常物品和建筑中以增强环境和人类健康 | 探讨了增材制造在生物材料科学、生物材料制造、合成生物学、生物医学工程、生物设计和活体建筑中的最新进展，展示了多感官互动的日常产品和建筑环境的新时代 | NA | 探索如何利用增材制造技术设计和集成响应性生物材料，以提升环境和人类健康 | 响应性生物材料及其在日常生活和建筑中的应用 | 生物材料科学 | NA | 增材制造（AM） | NA | NA | NA |
| 39 | 2025-05-02 |
Prevention of ribozyme catalysis through cDNA synthesis enables accurate RT-qPCR measurements of context-dependent ribozyme activity
2025-Apr-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080243.124
PMID:40050070
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研究论文 | 开发并验证了一种RT-qPCR方法，用于测量依赖于环境的核酶活性 | 引入了一种寡核苷酸来抑制核酶活性，从而恢复了RT-qPCR测量的准确性 | 方法依赖于特定的RNA提取和反转录条件，可能不适用于所有环境 | 验证新的核酶序列和基于核酶的生物技术 | 自切割核酶 | 合成生物学 | NA | RT-qPCR | NA | RNA | 一组已知在体外具有环境依赖性切割的自切割RNA |
| 40 | 2025-05-01 |
Synthetic Engineering of Microbes for Production of Terpenoid Food Ingredients
2025-Apr-30, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c01724
PMID:40254844
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research paper | 该文章探讨了利用合成生物学和代谢工程优化微生物细胞工厂生产萜类食品成分的方法 | 提出了通过优化异源合成途径、底盘前体供应和整合合成调控电路来提升萜类食品成分的生产效率 | 未提及具体的实验数据或样本规模，可能缺乏实际应用的验证 | 提高萜类食品成分的微生物生产效率 | 微生物细胞工厂和萜类食品成分 | 合成生物学 | NA | 合成生物学和代谢工程 | NA | NA | NA |