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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Phase Separation-Mediated Multienzyme Assembly In Vivo
2025-Apr-02, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c09585
PMID:40107849
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于相分离蛋白RGGRGG和ReverseTag/ReverseCatcher标签系统的多酶组装策略,显著提高了番茄红素的生物合成效率 | 首次将相分离蛋白RGGRGG与ReverseTag/ReverseCatcher标签系统整合,实现了多酶复合物的体内组装和催化效率的显著提升 | NA | 开发高效的多酶组装催化系统 | 相分离蛋白RGGRGG、ReverseTag/ReverseCatcher标签系统、番茄红素生物合成途径中的六种酶 | 合成生物学 | NA | 粗粒度模拟、酶固定化技术 | NA | 模拟数据、实验数据 | NA | ReverseTag/ReverseCatcher系统 | 细胞系统 | 多酶复合物组装系统,通过相分离形成酶凝聚体 | 工业生物技术 |
| 42 | 2025-10-05 |
Synthetic biology approaches to improve Rubisco carboxylation efficiency in C3 Plants: Direct and Indirect Strategies
2025-Apr, Journal of plant physiology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.jplph.2025.154470
PMID:40056853
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综述 | 本文综述了通过合成生物学方法提高C3植物中Rubisco羧化效率的直接和间接策略 | 系统总结了基于合成生物学的最新Rubisco优化策略,包括直接工程化改造、间接环境调控及CO浓缩机制的应用 | NA | 提高C3植物的光合作用效率以应对全球粮食安全挑战 | C3植物中的Rubisco酶及其相关蛋白 | 合成生物学 | NA | 基因转化技术 | NA | NA | NA | NA | C3植物 | CO浓缩机制(CCMs)、光呼吸旁路、蛋白工程改造 | 农业 |
| 43 | 2025-10-05 |
Advances in engineering substrate scope of Pseudomonas cell factories
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103270
PMID:39978295
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综述 | 本文综述了通过代谢工程、合成生物学和实验室进化技术扩展假单胞菌细胞工厂底物利用范围的最新进展 | 提出将假单胞菌作为新一代工业生物技术平台,通过工程化改造增强其对木质纤维素残渣、合成塑料、C1化合物等废弃底物的降解和利用能力 | NA | 探索具有理想特性的新型微生物宿主,开发利用废弃底物的生物工艺 | 假单胞菌物种 | 工业生物技术 | NA | 代谢工程, 合成生物学, 实验室进化 | NA | NA | NA | NA | 假单胞菌 | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 44 | 2025-10-05 |
Toward an integrated omics approach for plant biosynthetic pathway discovery in the age of AI
2025-Apr, Trends in biochemical sciences
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.tibs.2025.01.010
PMID:40000312
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综述 | 本文探讨了整合多组学数据与人工智能技术加速植物生物合成途径发现的策略 | 提出结合分子网络、反应对分析和基因表达模式的整合工作流程,并引入AI驱动方法革新途径发现 | NA | 促进可持续生物经济发展,通过合成生物学实现对复杂天然产物的高效获取 | 植物生物合成途径 | 计算生物学 | NA | 基因组学、转录组学、代谢组学、分子网络、反应对分析 | AI | 多组学数据 | NA | NA | 植物 | 生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 45 | 2025-10-05 |
The structure of the Vibrio natriegens 70S ribosome in complex with the proline-rich antimicrobial peptide Bac5(1-17)
2025-Apr-22, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf324
PMID:40331629
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研究论文 | 通过冷冻电镜解析了富含脯氨酸的抗菌肽Bac5与Vibrio natriegens细菌70S核糖体的复合物结构 | 首次揭示了Bac5与核糖体的结合模式,发现其与同类肽Bac7具有完全不同的核糖体出口隧道相互作用方式 | NA | 阐明富含脯氨酸抗菌肽Bac5抑制细菌蛋白质合成的分子机制 | Vibrio natriegens细菌的70S核糖体与Bac5抗菌肽复合物 | 结构生物学 | 细菌感染 | 冷冻电镜 | NA | 结构数据 | NA | NA | Vibrio natriegens | NA | 医学 |
| 46 | 2025-10-05 |
Recombinant human collagen XVII protects skin basement membrane integrity by inhibiting the MAPK and Wnt signaling pathways
2025-Apr, Molecular medicine reports
IF:3.4Q2
DOI:10.3892/mmr.2025.13465
PMID:39981899
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研究论文 | 本研究探讨重组人胶原XVII通过抑制MAPK和Wnt信号通路保护皮肤基底膜完整性的机制 | 首次阐明重组人胶原XVII通过调控MAPK和Wnt信号通路保护皮肤基底膜完整性的分子机制 | 研究仅使用HaCaT角质形成细胞系,缺乏体内实验验证 | 阐明重组人胶原XVII保护皮肤基底膜完整性的功效和作用机制 | 人HaCaT角质形成细胞 | 合成生物学 | 皮肤损伤 | UVB照射、伤口愈合实验、HE染色、RT-qPCR、Western blotting、磷酸化抗体芯片 | NA | 基因表达数据、蛋白表达数据、细胞功能数据 | 人HaCaT角质形成细胞系 | 重组DNA技术 | NA | NA | 医学, 化妆品 |
| 47 | 2025-10-05 |
A novel NAC36-MYB18-TAT2 model regulates the synthesis of phenolic acid in Salvia miltiorrhiza Bunge
2025-Apr, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140987
PMID:39952526
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研究论文 | 本研究揭示了丹参中NAC36-MYB18-TAT2分子模块调控酚酸生物合成的分子机制 | 首次发现SmTAT2正向调控酚酸积累,并解析了SmNAC36通过激活SmMYB18间接调控及直接激活SmTAT2的双重调控通路 | NA | 探究丹参酚酸生物合成的分子调控机制 | 丹参(Salvia miltiorrhiza Bunge)中的酚酸合成关键酶基因SmTAT2及其转录调控因子 | 合成生物学 | NA | 转基因技术(过表达和CRISPR/Cas9)、酵母单杂交、双荧光素酶报告基因检测、EMSA | NAC36-MYB18-TAT2调控模型 | 分子生物学实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 丹参 | 酚酸生物合成调控通路 | 医药 |
| 48 | 2025-10-05 |
Unraveling the hydroxylation and methylation mechanism in polymethoxylated flavones biosynthesis in Dracocephalum moldavica
2025-Apr, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109571
PMID:39919496
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研究论文 | 本研究解析了香青兰中多甲氧基黄酮生物合成的羟基化和甲基化机制 | 首次在香青兰中鉴定出三个黄酮羟基化酶和四个黄酮O-甲基转移酶,并揭示了它们在多甲氧基黄酮生物合成中的关键作用 | NA | 阐明香青兰中多甲氧基黄酮生物合成的羟基化和甲基化机制 | 香青兰中的黄酮羟基化酶和O-甲基转移酶 | 合成生物学 | NA | 转录组分析、异源表达 | NA | 转录组数据 | NA | 异源表达 | 本氏烟草 | 多甲氧基黄酮生物合成途径 | 医药 |
| 49 | 2025-10-05 |
Progress on production of malic acid and succinic acid by industrially-important engineered microorganisms
2025-Apr, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.02.001
PMID:39923900
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综述 | 总结通过代谢工程改造工业微生物提高L-苹果酸和琥珀酸生物合成的最新研究进展 | 聚焦合成生物学和高通量筛选新技术在有机酸生物合成中的应用 | 未明确说明具体菌株改造的局限性 | 提高微生物发酵生产有机酸的产量和效率 | 工业重要工程微生物(生产L-苹果酸和琥珀酸) | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、代谢工程、合成生物学、高通量筛选 | NA | NA | NA | 代谢工程 | 工业重要工程微生物 | 有机酸生物合成代谢途径 | 食品, 制药, 化工 |
| 50 | 2025-10-05 |
Next-generation metabolic models informed by biomolecular simulations
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103259
PMID:39827498
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综述 | 探讨如何将生物分子模拟与机器学习预测整合到代谢模型中,推动结构引导的合成生物学应用 | 首次系统提出将生物分子模拟与机器学习预测整合到代谢建模框架中,开创结构引导合成生物学新范式 | NA | 优化/理解代谢途径以改善蛋白质和小分子产品的生物生产 | 从微生物到人类的各种生物体的细胞代谢 | 计算生物学 | NA | 生物分子模拟、机器学习、通量平衡分析 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径优化 | 健康,环境,能源,可持续性 |
| 51 | 2025-10-05 |
Advances in designed bionanomolecular assemblies for biotechnological and biomedical applications
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103256
PMID:39827499
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综述 | 本文综述了蛋白质工程在生物纳米分子组装体设计方面的最新进展及其在生物技术和生物医学领域的应用 | 整合人工智能工具(AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN)显著提升了从头设计的可扩展性和成功率 | NA | 探讨蛋白质工程在功能性治疗和生物技术应用中的生物纳米分子组装体设计进展 | 有限组装体(纳米笼、卷曲螺旋结构)和扩展组装体(丝状结构、2D/3D晶格) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、人工智能辅助设计 | AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN | NA | NA | NA | NA | 分子封装结构、功能蛋白域展示结构、细胞支架工程 | 生物技术, 生物医学, 材料科学 |
| 52 | 2025-10-05 |
Using synthetic biology to express nitrogenase biosynthesis pathway in rice and to overcome barriers of nitrogenase instability in plant cytosol
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.12.002
PMID:39818476
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研究论文 | 通过合成生物学方法将固氮酶生物合成途径导入水稻,并克服植物细胞质中固氮酶不稳定的障碍 | 首次成功将包含13个基因的固氮酶生物合成途径导入水稻,并鉴定出NifH-S18是导致蛋白降解的关键残基,获得了具有Fe蛋白活性且抗植物内切蛋白酶切割的NifH变体 | NA | 在谷物中实现生物固氮以减少化学氮肥使用 | 转基因水稻植株 | 合成生物学 | NA | 多基因载体转化、有性杂交、基因组测序分析 | NA | 基因组测序数据、蛋白质表达数据 | 两个F杂交水稻品系L12-13和L8-17 | 多基因载体 | 水稻 | 固氮酶生物合成途径(包含nifB、nifH、nifD、nifK、nifE、nifN、nifX、hesA、nifV、nifS、nifU、groES、groEL共13个基因) | 农业 |
| 53 | 2025-10-05 |
Synthetic Engineering of Microbes for Production of Terpenoid Food Ingredients
2025-Apr-30, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c01724
PMID:40254844
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程改造微生物生产萜类食品配料的方法与策略 | 提出通过多维度优化异源合成途径、整合合成调控电路和工程化长期遗传稳定性来提升萜类食品配料的生产效率 | NA | 开发高效的微生物细胞工厂以生产萜类食品配料 | 微生物细胞工厂和萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 合成调控电路、代谢途径优化 | 食品, 工业生物技术 |
| 54 | 2025-10-05 |
Synthetically Engineered Bacterial Extracellular Vesicles and IL-4-Encapsulated Hydrogels Sequentially Promote Osteoporotic Fracture Repair
2025-04-29, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c03106
PMID:40237831
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研究论文 | 开发了一种基于合成生物学细菌胞外囊泡和IL-4水凝胶的序贯治疗系统,用于促进骨质疏松性骨折修复 | 首次构建了负载pBMP-2-VEGF的工程化细菌胞外囊泡并与IL-4共同封装在GelMA水凝胶中,形成具有时序治疗功能的复合材料 | 目前仅在小鼠模型中验证疗效,尚未进行临床前大动物实验或临床试验 | 开发新型骨质疏松性骨折治疗策略 | 骨质疏松性骨折修复过程 | 合成生物学 | 骨质疏松症 | 细菌胞外囊泡工程、水凝胶封装技术 | NA | 实验数据 | 小鼠模型 | 合成生物学 | 细菌 | pBMP-2-VEGF基因负载系统 | 医学 |
| 55 | 2025-10-05 |
New Insight into Microbial Exploitation to Produce Bioactive Molecules from Agrifood and By-Products' Fermentation
2025-Apr-21, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods14081439
PMID:40282840
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综述 | 探讨微生物通过发酵和合成生物学技术从农业食品及副产品中生产高价值生物活性分子的最新研究 | 系统关联微生物利用与特定高价值分子生产,强调合成生物学在食品营养领域的应用潜力 | NA | 研究微生物在食品工业中生产具有促进健康效应的生物活性分子 | 具有特定性状的选育微生物及农业食品副产品 | NA | NA | 发酵技术, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 选育微生物 | NA | 食品工业, 营养保健品 |
| 56 | 2025-10-05 |
Effect of Local Heterogeneities on Single-Layer DNA-Directed Protein Lattices Through Non-Averaged Single-Molecule 3D Structure Determination
2025-Apr-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6095207/v1
PMID:40235486
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研究论文 | 通过非平均单分子3D结构确定研究局部异质性对单层DNA导向蛋白质晶格的影响 | 利用个体粒子冷冻电子断层扫描(IPET)分析每个单元细胞粒子的非平均3D结构,揭示DNA折纸二维晶格异质性的分子起源 | 研究仅针对特定DNA折纸八面体笼结构,未验证其他类型的蛋白质或DNA结构 | 研究局部异质性对DNA导向蛋白质二维晶格结构的影响 | DNA折纸八面体笼封装铁蛋白形成的二维晶格 | 结构生物学 | NA | 个体粒子冷冻电子断层扫描(IPET), 分子动力学模拟 | NA | 3D冷冻电镜图像 | 铁蛋白负载百分比为100%、70%和0%的DNA笼样品 | DNA折纸 | NA | DNA折纸八面体笼封装铁蛋白形成的二维晶格结构 | 合成生物学, 纳米催化, 生物器件 |
| 57 | 2025-10-05 |
A novel geminivirus-derived 3' flanking sequence of terminator mediates the gene expression enhancement
2025-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14561
PMID:39723813
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研究论文 | 本研究发现了甘薯曲叶病毒卫星DNA中的SBG51序列能显著增强基因表达,并鉴定出关键ATAAA/TTAAA重复元件 | 首次发现双生病毒卫星DNA的3'侧翼序列具有增强基因表达功能,并证明人工合成含ATAAA/TTAAA重复序列具有类似基质附着区的功能 | NA | 探索合成生物学中新型基因表达元件 | 病毒来源的DNA序列及其对基因表达的增强作用 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达分析、转基因技术 | NA | 基因表达数据、荧光成像数据 | 本氏烟叶片、拟南芥转基因植株、酵母 | 基因表达载体构建 | 本氏烟, 拟南芥, 酵母 | 基因表达增强元件,含ATAAA/TTAAA重复序列的人工合成序列 | 农业, 工业生物技术 |
| 58 | 2025-10-05 |
High-throughput optimisation of protein secretion in yeast via an engineered biosensor
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.010
PMID:39674781
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研究论文 | 本研究开发了一种基于酵母G蛋白偶联受体生物传感器的系统,用于高通量优化蛋白质分泌效率 | 首次将酵母GPCR生物传感器应用于蛋白质分泌效率的高通量筛选,能够同时评估启动子、信号肽和终止子的组合效果 | NA | 优化异源蛋白质在酵母中的分泌表达效率 | 蛋白质分泌系统、信号肽、启动子、终止子 | 合成生物学 | NA | GPCR生物传感器、高通量筛选、Golden Gate克隆 | NA | 荧光报告基因数据 | 超过6000种启动子、信号肽和终止子的组合 | Golden Gate Assembly | 酵母 | GPCR生物传感器系统,通过共分泌肽标签激活受体并诱导荧光报告基因表达 | 工业生物技术 |
| 59 | 2025-10-05 |
Regulatory and retrograde signaling networks in the chlorophyll biosynthetic pathway
2025-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13837
PMID:39853950
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综述 | 本文综述了叶绿素生物合成途径中的调控机制和逆行信号网络 | 深入探讨了叶绿素合成中的调控机制,包括TBS酶的活性和稳定性控制、TBS途径的转录和翻译后调控,以及叶绿体到细胞质和细胞核的逆行信号传导 | NA | 阐明叶绿素生物合成途径的调控机制及其在合成生物学和农业中的应用前景 | 植物、藻类和光合细菌的叶绿素生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物, 藻类, 光合细菌 | 叶绿素生物合成途径调控网络 | 农业, 合成生物学 |
| 60 | 2025-10-05 |
Leveraging the versatile properties of bacterial spores in materials
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.09.018
PMID:39472253
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综述 | 本文综述了基于细菌孢子特性的工程生物材料最新进展及其未来发展挑战 | 利用细菌孢子的休眠特性和环境抗性克服传统工程生物材料的寿命短和冷链运输限制 | NA | 开发高性能、时间效率和成本效益的孢子基材料 | 细菌孢子及其在材料科学中的应用 | 合成生物学与材料科学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌孢子 | NA | 材料科学, 工业生物技术 |