合成生物学相关文章
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当前共找到 90 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Next-generation metabolic models informed by biomolecular simulations
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103259
PMID:39827498
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综述 | 探讨如何将生物分子模拟与机器学习预测整合到代谢模型中，推动结构引导的合成生物学应用 | 首次系统提出将生物分子模拟与机器学习预测整合到代谢建模框架中，开创结构引导合成生物学新范式 | NA | 优化/理解代谢途径以改善蛋白质和小分子产品的生物生产 | 从微生物到人类的各种生物体的细胞代谢 | 计算生物学 | NA | 生物分子模拟、机器学习、通量平衡分析 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径优化 | 健康,环境,能源,可持续性 |
| 42 | 2025-10-05 |
Advances in designed bionanomolecular assemblies for biotechnological and biomedical applications
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2024.103256
PMID:39827499
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综述 | 本文综述了蛋白质工程在生物纳米分子组装体设计方面的最新进展及其在生物技术和生物医学领域的应用 | 整合人工智能工具（AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN）显著提升了从头设计的可扩展性和成功率 | NA | 探讨蛋白质工程在功能性治疗和生物技术应用中的生物纳米分子组装体设计进展 | 有限组装体（纳米笼、卷曲螺旋结构）和扩展组装体（丝状结构、2D/3D晶格） | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、人工智能辅助设计 | AlphaFold、RFDiffusion、ProteinMPNN | NA | NA | NA | NA | 分子封装结构、功能蛋白域展示结构、细胞支架工程 | 生物技术, 生物医学, 材料科学 |
| 43 | 2025-10-05 |
Using synthetic biology to express nitrogenase biosynthesis pathway in rice and to overcome barriers of nitrogenase instability in plant cytosol
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.12.002
PMID:39818476
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研究论文 | 通过合成生物学方法将固氮酶生物合成途径导入水稻，并克服植物细胞质中固氮酶不稳定的障碍 | 首次成功将包含13个基因的固氮酶生物合成途径导入水稻，并鉴定出NifH-S18是导致蛋白降解的关键残基，获得了具有Fe蛋白活性且抗植物内切蛋白酶切割的NifH变体 | NA | 在谷物中实现生物固氮以减少化学氮肥使用 | 转基因水稻植株 | 合成生物学 | NA | 多基因载体转化、有性杂交、基因组测序分析 | NA | 基因组测序数据、蛋白质表达数据 | 两个F杂交水稻品系L12-13和L8-17 | 多基因载体 | 水稻 | 固氮酶生物合成途径（包含nifB、nifH、nifD、nifK、nifE、nifN、nifX、hesA、nifV、nifS、nifU、groES、groEL共13个基因） | 农业 |
| 44 | 2025-10-05 |
Synthetic Engineering of Microbes for Production of Terpenoid Food Ingredients
2025-Apr-30, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c01724
PMID:40254844
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程改造微生物生产萜类食品配料的方法与策略 | 提出通过多维度优化异源合成途径、整合合成调控电路和工程化长期遗传稳定性来提升萜类食品配料的生产效率 | NA | 开发高效的微生物细胞工厂以生产萜类食品配料 | 微生物细胞工厂和萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 合成调控电路、代谢途径优化 | 食品, 工业生物技术 |
| 45 | 2025-10-05 |
Synthetically Engineered Bacterial Extracellular Vesicles and IL-4-Encapsulated Hydrogels Sequentially Promote Osteoporotic Fracture Repair
2025-04-29, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c03106
PMID:40237831
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研究论文 | 开发了一种基于合成生物学细菌胞外囊泡和IL-4水凝胶的序贯治疗系统，用于促进骨质疏松性骨折修复 | 首次构建了负载pBMP-2-VEGF的工程化细菌胞外囊泡并与IL-4共同封装在GelMA水凝胶中，形成具有时序治疗功能的复合材料 | 目前仅在小鼠模型中验证疗效，尚未进行临床前大动物实验或临床试验 | 开发新型骨质疏松性骨折治疗策略 | 骨质疏松性骨折修复过程 | 合成生物学 | 骨质疏松症 | 细菌胞外囊泡工程、水凝胶封装技术 | NA | 实验数据 | 小鼠模型 | 合成生物学 | 细菌 | pBMP-2-VEGF基因负载系统 | 医学 |
| 46 | 2025-10-05 |
New Insight into Microbial Exploitation to Produce Bioactive Molecules from Agrifood and By-Products' Fermentation
2025-Apr-21, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods14081439
PMID:40282840
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综述 | 探讨微生物通过发酵和合成生物学技术从农业食品及副产品中生产高价值生物活性分子的最新研究 | 系统关联微生物利用与特定高价值分子生产，强调合成生物学在食品营养领域的应用潜力 | NA | 研究微生物在食品工业中生产具有促进健康效应的生物活性分子 | 具有特定性状的选育微生物及农业食品副产品 | NA | NA | 发酵技术, 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 选育微生物 | NA | 食品工业, 营养保健品 |
| 47 | 2025-10-05 |
Effect of Local Heterogeneities on Single-Layer DNA-Directed Protein Lattices Through Non-Averaged Single-Molecule 3D Structure Determination
2025-Apr-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6095207/v1
PMID:40235486
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研究论文 | 通过非平均单分子3D结构确定研究局部异质性对单层DNA导向蛋白质晶格的影响 | 利用个体粒子冷冻电子断层扫描(IPET)分析每个单元细胞粒子的非平均3D结构，揭示DNA折纸二维晶格异质性的分子起源 | 研究仅针对特定DNA折纸八面体笼结构，未验证其他类型的蛋白质或DNA结构 | 研究局部异质性对DNA导向蛋白质二维晶格结构的影响 | DNA折纸八面体笼封装铁蛋白形成的二维晶格 | 结构生物学 | NA | 个体粒子冷冻电子断层扫描(IPET), 分子动力学模拟 | NA | 3D冷冻电镜图像 | 铁蛋白负载百分比为100%、70%和0%的DNA笼样品 | DNA折纸 | NA | DNA折纸八面体笼封装铁蛋白形成的二维晶格结构 | 合成生物学, 纳米催化, 生物器件 |
| 48 | 2025-10-05 |
Unlocking lignin valorization and harnessing lignin-based raw materials for bio-manufacturing
2025-Apr, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2792-x
PMID:39704933
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综述 | 本文全面总结了木质素生物降解的前沿策略、酶系统、代谢途径及降解菌株，并探讨了木质素增值化的创新方法 | 系统整合生物催化与合成生物学策略，提出人工智能驱动技术突破木质素增值化瓶颈的创新路径 | NA | 开发木质素生物增值化技术，实现木质素资源的高效利用 | 木质素聚合物及其降解产物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 木质素降解菌株或菌群 | 三羧酸循环等代谢通路重定向 | 能源, 材料, 工业生物技术, 食品 |
| 49 | 2025-10-05 |
A novel geminivirus-derived 3' flanking sequence of terminator mediates the gene expression enhancement
2025-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14561
PMID:39723813
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研究论文 | 本研究发现了甘薯曲叶病毒卫星DNA中的SBG51序列能显著增强基因表达，并鉴定出关键ATAAA/TTAAA重复元件 | 首次发现双生病毒卫星DNA的3'侧翼序列具有增强基因表达功能，并证明人工合成含ATAAA/TTAAA重复序列具有类似基质附着区的功能 | NA | 探索合成生物学中新型基因表达元件 | 病毒来源的DNA序列及其对基因表达的增强作用 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达分析、转基因技术 | NA | 基因表达数据、荧光成像数据 | 本氏烟叶片、拟南芥转基因植株、酵母 | 基因表达载体构建 | 本氏烟, 拟南芥, 酵母 | 基因表达增强元件，含ATAAA/TTAAA重复序列的人工合成序列 | 农业, 工业生物技术 |
| 50 | 2025-10-05 |
Taxus NPF transporter involved in the uptake of 10-deacetylbaccatin III facilitates the biosynthesis of taxane compounds
2025-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70146
PMID:40287958
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研究论文 | 本研究鉴定了一种红豆杉NPF型转运蛋白NPF2.1，该蛋白通过质子同向转运机制参与10-脱乙酰巴卡亭III的吸收，并开发了基于酵母的生物转化系统用于紫杉醇生物合成基因发现 | 首次发现红豆杉NPF2.1转运蛋白能介导10-脱乙酰巴卡亭III的跨膜运输，并建立了基于该转运蛋白的酵母生物转化系统用于新型BAHD酰基转移酶的发现 | 研究主要基于酵母异源表达系统，在植物体内的具体调控机制仍需进一步验证 | 阐明紫杉醇生物合成过程中中间产物的跨膜转运机制，并开发合成生物学工具 | 红豆杉细胞悬浮培养物、NPF2.1转运蛋白、10-脱乙酰巴卡亭III | 合成生物学 | 癌症 | 酵母异源表达、时间进程分析、生物转化系统 | NA | 代谢物动力学数据、酶活性数据 | NA | 酵母表达系统 | 酿酒酵母 | 基于NPF2.1转运蛋白的生物转化系统 | 医药 |
| 51 | 2025-10-05 |
High-throughput optimisation of protein secretion in yeast via an engineered biosensor
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.010
PMID:39674781
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研究论文 | 本研究开发了一种基于酵母G蛋白偶联受体生物传感器的系统，用于高通量优化蛋白质分泌效率 | 首次将酵母GPCR生物传感器应用于蛋白质分泌效率的高通量筛选，能够同时评估启动子、信号肽和终止子的组合效果 | NA | 优化异源蛋白质在酵母中的分泌表达效率 | 蛋白质分泌系统、信号肽、启动子、终止子 | 合成生物学 | NA | GPCR生物传感器、高通量筛选、Golden Gate克隆 | NA | 荧光报告基因数据 | 超过6000种启动子、信号肽和终止子的组合 | Golden Gate Assembly | 酵母 | GPCR生物传感器系统，通过共分泌肽标签激活受体并诱导荧光报告基因表达 | 工业生物技术 |
| 52 | 2025-10-05 |
Regulatory and retrograde signaling networks in the chlorophyll biosynthetic pathway
2025-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13837
PMID:39853950
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综述 | 本文综述了叶绿素生物合成途径中的调控机制和逆行信号网络 | 深入探讨了叶绿素合成中的调控机制，包括TBS酶的活性和稳定性控制、TBS途径的转录和翻译后调控，以及叶绿体到细胞质和细胞核的逆行信号传导 | NA | 阐明叶绿素生物合成途径的调控机制及其在合成生物学和农业中的应用前景 | 植物、藻类和光合细菌的叶绿素生物合成系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物, 藻类, 光合细菌 | 叶绿素生物合成途径调控网络 | 农业, 合成生物学 |
| 53 | 2025-10-05 |
Leveraging the versatile properties of bacterial spores in materials
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.09.018
PMID:39472253
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综述 | 本文综述了基于细菌孢子特性的工程生物材料最新进展及其未来发展挑战 | 利用细菌孢子的休眠特性和环境抗性克服传统工程生物材料的寿命短和冷链运输限制 | NA | 开发高性能、时间效率和成本效益的孢子基材料 | 细菌孢子及其在材料科学中的应用 | 合成生物学与材料科学 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 细菌孢子 | NA | 材料科学, 工业生物技术 |
| 54 | 2025-05-07 |
Phosphorothioate-Modified Hairpin G-Triplex Reporter-Assisted Split CRISPR/Cas12a-Powered Biosensor for "Turn-On" Fluorescent Detection of Nucleic Acid and Non-Nucleic Acid Targets
2025-Apr-24, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c00140
PMID:40270429
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research paper | 开发了一种基于CRISPR/Cas12a和硫代磷酸酯修饰的G-三链体报告基因的“开启”型荧光生物传感器，用于核酸和非核酸靶标的高灵敏度检测 | 首次探索了硫代磷酸酯修饰的G-四链体和G-三链体序列与硫黄素T结合在分裂CRISPR/Cas12a系统中产生“开启”荧光信号的新现象，并开发了相应的生物传感器 | 未提及在更复杂样本中的实际应用效果及可能的干扰因素 | 开发高灵敏度、低背景的“开启”型荧光生物传感器，用于核酸和非核酸靶标的检测 | 核酸靶标（miRNA-21）和非核酸靶标（卡那霉素） | 合成生物学传感技术 | NA | CRISPR/Cas12a系统，硫代磷酸酯修饰技术，荧光检测 | SCas12a/psHG3系统 | 荧光信号数据 | 未明确说明具体样本数量，但检测限达到100 fM（miRNA-21）和100 pM（卡那霉素） | NA | NA | NA | NA |
| 55 | 2025-10-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis of Maize Embryo Development
2025-Apr-23, Cold Spring Harbor protocols
DOI:10.1101/pdb.top108468
PMID:40268305
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在玉米胚胎发育研究中的协同应用 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学技术相结合研究玉米胚胎发育，实现基因表达模式在单细胞分辨率和空间背景下的协同分析 | 单细胞技术缺乏已知细胞标记物难以识别特定细胞簇，空间转录组学通常无法达到单细胞分辨率且检测到的转录本较少 | 研究玉米胚胎发育的基因表达模式和调控网络 | 玉米胚胎发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 玉米 | NA | 农业 |
| 56 | 2025-10-05 |
Multi-Omics Analyses Reveal the Red and Far-Red Light Combination Enhancing Heterologous Protein and Metabolite Production in Nicotiana benthamiana
2025-Apr-23, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.15573
PMID:40269597
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了红与远红光组合能显著提高本氏烟草中异源蛋白和代谢物的产量 | 首次系统研究不同光质对本氏烟草瞬时表达效率的影响，发现红与远红光组合能显著提升异源蛋白和代谢物产量 | 研究仅针对本氏烟草和特定异源产物，未验证在其他植物或蛋白体系中的普适性 | 探究光质对植物瞬时表达系统效率的影响机制 | 本氏烟草植株及其表达的绿色荧光蛋白和紫杉二烯代谢物 | 植物合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 分子生物学数据、组学数据 | 五种不同光质处理下的本氏烟草植株 | 农杆菌浸润 | 本氏烟草 | 异源蛋白表达和代谢物合成途径 | 工业生物技术 |
| 57 | 2025-10-05 |
Combining diffusion and transformer models for enhanced promoter synthesis and strength prediction in deep learning
2025-Apr-22, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00183-25
PMID:40105319
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研究论文 | 本研究结合扩散模型和Transformer模型，开发了一种用于合成启动子设计和强度预测的深度学习平台 | 首次将扩散模型应用于启动子设计，并结合Transformer模型进行强度预测，相比传统方法能生成更接近天然启动子的合成序列 | NA | 开发高效的合成启动子设计和筛选方法，优化外源基因表达和代谢通路效率 | 合成启动子序列及其转录活性 | 合成生物学 | NA | 深度学习 | 扩散模型, Transformer, CNN, 变分自编码器 | 启动子序列数据 | NA | NA | 模型细菌, 蓝细菌 | 合成启动子设计 | 工业生物技术 |
| 58 | 2025-10-05 |
Microalgae-based vaccines for aquaculture
2025-Apr-22, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.001
PMID:40268646
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综述 | 本文介绍基于微藻的口服疫苗在水产养殖中的应用及其免疫益处 | 提出微藻口服疫苗的合理化设计理念，结合合成生物学与鱼类免疫代谢研究推动疫苗创新 | NA | 探讨微藻疫苗在水产养殖中增强鱼类免疫力和控制疾病的作用 | 水产养殖鱼类 | 合成生物学 | 水产动物疾病 | 口服疫苗技术 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | 疫苗抗原设计 | 农业 |
| 59 | 2025-10-05 |
Electron transfer engineering of artificially designed cell factory for complete biosynthesis of steroids
2025-Apr-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58926-9
PMID:40258825
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研究论文 | 通过阐明NADPH依赖酶的电子传递机制，系统改造酿酒酵母细胞工厂实现胆固醇和孕烯醇酮的高效生物合成 | 首次系统阐明NADPH依赖酶的电子传递机制，并通过缩短和稳定电子传递链显著加速去质子化和质子耦合电子传递过程 | NA | 提高类固醇化合物的生物合成效率 | 酿酒酵母细胞工厂 | 合成生物学 | NA | 电子传递工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 电子传递链工程、NADPH再生途径、碳流导向的电子传递组件 | 医药, 工业生物技术 |
| 60 | 2025-10-05 |
Characterization of a 4'-O-rhamnosyltransferase and de novo biosynthesis of bioactive steroidal triglycosides from Paris polyphylla
2025-Apr-14, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101257
PMID:39844466
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研究论文 | 本研究从重楼中鉴定出4'-O-鼠李糖基转移酶UGT73DY2，阐明了甾体皂苷糖链生物合成机制，并通过合成生物学方法成功构建了地奥司宁生物合成系统 | 首次发现并表征了特异性催化甾体二糖苷4'-O-鼠李糖基化的UGT73DY2酶，通过半理性设计获得活性提升的突变体，并成功在烟草中重建了甾体三糖苷生物合成途径 | 未明确说明工程化系统的稳定性和规模化应用潜力 | 阐明重楼甾体皂苷糖链生物合成机制并开发替代生产方法 | 重楼(Paris polyphylla)中的甾体皂苷及其生物合成酶 | 合成生物学 | NA | 酶催化、分子动力学模拟、亚细胞定位分析、代谢工程 | NA | 酶学数据、分子模拟数据、代谢产物数据 | NA | 代谢工程,合成生物学 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 甾体三糖苷生物合成途径，包含14个生物合成基因的共表达系统 | 医药 |