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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Ultrasound-Energized OX40L-Expressing Biohybrid for Multidimensional Mobilization of Sustained T Cell-Mediated Antitumor Immunity and Potent Sono-Immunotherapy
2025-Apr-23, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c02025
PMID:40200836
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研究论文 | 开发一种超声激活的生物混合系统,通过合成生物学工程化细菌表达OX40L并集成声敏剂,实现多维激活T细胞介导的抗肿瘤免疫治疗 | 首次将超声激活的纳米佐剂与共刺激免疫增强剂整合于活体生物治疗平台,实现级联放大的多维免疫激活 | NA | 开发新型癌症声免疫治疗策略,实现持久抗肿瘤免疫应答 | 工程化细菌生物混合系统及其抗肿瘤免疫效应 | 合成生物学 | 肿瘤 | 合成生物学、超声技术 | NA | 实验数据 | NA | 合成生物学 | 细菌 | 表达OX40配体融合蛋白的生物传感器系统 | 医学 |
| 62 | 2025-10-05 |
Comparative Analysis of Codon Optimization Tools: Advancing toward a Multi-Criteria Framework for Synthetic Gene Design
2025-Apr-10, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2411.11066
PMID:40223268
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研究论文 | 对常用密码子优化工具进行综合比较分析,提出多标准框架用于合成基因设计 | 首次系统比较多种密码子优化工具的性能差异,并提出整合多参数的综合优化框架 | 研究仅评估了部分工业相关靶蛋白,未涵盖所有可能的蛋白质类型和宿主系统 | 评估不同密码子优化工具的性能差异,建立更有效的合成基因设计框架 | 密码子优化工具(JCat、OPTIMIZER、ATGme、GeneOptimizer、TISIGNER、IDT)和工业相关靶蛋白 | 合成生物学 | NA | 密码子优化,重组蛋白表达 | NA | 基因序列数据,蛋白质表达数据 | 多种工业相关靶蛋白在E. coli、S. cerevisiae和CHO细胞中的表达评估 | 密码子优化工具 | E. coli, S. cerevisiae, CHO细胞 | 密码子优化策略,合成基因设计 | 工业生物技术,医药 |
| 63 | 2025-10-05 |
Engineering carbon assimilation in plants
2025-Apr, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13825
PMID:39783795
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综述 | 本文综述了通过合成生物学和基因工程等方法优化植物碳同化过程的研究进展 | 整合合成生物学、基因工程、代谢通路优化和人工智能等多种技术来创建具有更高效光合作用能力的植物 | NA | 优化植物碳同化过程,提高光合作用效率 | 植物碳同化过程,特别是CBB循环和RuBisCO酶 | 合成生物学 | NA | 合成生物学, 基因工程, 代谢通路优化, 人工智能 | NA | NA | NA | NA | 植物, 藻类, 蓝细菌 | 碳固定通路优化,包括CBB循环改进和替代通路引入 | 农业 |
| 64 | 2025-10-05 |
Angle-controllable RNA tiles for programable array assembly and RNA sensing
2025-Apr-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58938-5
PMID:40253384
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研究论文 | 本研究开发了角度可控的RNA瓦片用于可编程阵列组装和RNA传感 | 通过整合反平行交叉和T型连接点,首次实现了65度或90度可控角度的RNA瓦片设计,显著扩展了人工设计多链RNA瓦片的多样性 | NA | 开发可编程自组装的RNA纳米结构以构建功能化生物材料 | 人工设计的RNA瓦片和RNA适配体 | 合成生物学 | NA | RNA纳米技术,荧光传感 | NA | 结构设计数据,荧光数据 | 22种不同的RNA瓦片 | NA | NA | 多链RNA瓦片阵列,集成split broccoli RNA适配体的线性阵列传感系统 | 生物材料,分子工程 |
| 65 | 2025-10-05 |
RmZHD Surface-Displayed Escherichia coli for High Efficiency and Low-Cost Degradation of Zearalenone
2025-Apr-21, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.4c01994
PMID:40080174
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研究论文 | 本研究构建了表面展示RmZHD的工程化大肠杆菌,用于高效低成本降解玉米赤霉烯酮 | 首次将新型玉米赤霉烯酮水解酶RmZHD通过表面展示技术构建于大肠杆菌,无需额外操作即可实现高效降解 | NA | 开发一种环境友好且适用于工业规模的玉米赤霉烯酮处理方法 | 玉米赤霉烯酮及其衍生物(玉米赤霉酮、β-玉米赤霉醇、α-玉米赤霉烯醇、β-玉米赤霉烯醇) | 合成生物学 | NA | 表面展示技术 | NA | NA | NA | 表面展示 | 大肠杆菌 | 酶表面展示系统 | 环境, 农业, 食品 |
| 66 | 2025-10-05 |
Development and construction of a novel Bacillus subtilis autoinducible extracellular expression system based on a LuxI/R device
2025-Apr-19, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02719-8
PMID:40251612
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研究论文 | 本研究开发了一种基于LuxI/R群体感应系统的新型枯草芽孢杆菌自诱导胞外表达系统 | 首次通过工程化感知模块启动子SPluxI序列和响应模块启动子RPluxIR6的lux box拷贝数来增强lux系统在枯草芽孢杆菌中的自诱导表达 | NA | 开发高效的枯草芽孢杆菌自诱导胞外表达系统 | 枯草芽孢杆菌表达系统 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统工程、启动子工程、发酵技术 | NA | 酶活性数据、发酵数据 | 摇瓶发酵和3-L发酵罐实验 | 启动子工程 | 枯草芽孢杆菌 | 基于LuxI/R群体感应系统的自诱导表达回路,包含感知模块和响应模块 | 工业生物技术 |
| 67 | 2025-10-05 |
Engineering electrogenetic interfaces for mammalian cell control
2025-Apr-17, Cell chemical biology
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.chembiol.2025.01.003
PMID:39879984
|
研究论文 | 本文概述了设计直接电遗传接口以控制治疗工程哺乳动物细胞行为的研究 | 提出了电遗传学这一新兴概念,探索数字电子设备产生的电子如何编程活细胞内的电子响应生物单元 | NA | 设计直接电遗传接口控制哺乳动物细胞行为 | 治疗工程哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 电遗传学 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 电子响应生物单元 | 医学 |
| 68 | 2025-10-05 |
Activation of Caged Functional RNAs by An Oxidative Transformation
2025-Apr-14, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202401056
PMID:39740778
|
研究论文 | 本研究展示了通过氧化处理激活含有2-硫代尿苷的功能性RNA分子 | 首次利用2-硫代尿苷的氧化脱硫反应实现RNA功能的可控激活,拓展了RNA作为环境响应性功能聚合物的应用 | NA | 开发通过氧化转化激活笼状功能性RNA的方法 | 功能性RNA(适配体和核酶) | 合成生物学 | NA | 氧化脱硫技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 氧化响应型RNA开关 | 医学, 合成生物学 |
| 69 | 2025-10-05 |
p-Hydroxycinnamic Acids: Advancements in Synthetic Biology, Emerging Regulatory Targets in Gut Microbiota Interactions, and Implications for Animal Health
2025-Apr, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.01.034
PMID:39900184
|
综述 | 本文综述了对羟基肉桂酸的合成生物学进展、与肠道微生物的相互作用机制及其对动物健康的影响 | 强调对羟基肉桂酸与肠道微生物相互作用的复杂机制,并探索其合成生物学的最新进展 | NA | 探讨对羟基肉桂酸的生物活性、与肠道微生物相互作用及其对动物健康的影响 | 对羟基肉桂酸及其与肠道微生物的相互作用 | 合成生物学 | NA | 生物合成技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 动物饲料 |
| 70 | 2025-10-05 |
Pepticombisomes: Biomimetic Vesicles Crafted From Recombinant Supercharged Polypeptides with Uniformly Distributed Side-Chains
2025-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411497
PMID:39985267
|
研究论文 | 本文介绍了一种新型仿生囊泡pepticombisomes,通过重组超带电多肽与表面活性剂自组装形成 | 开发了具有均匀聚合度、组成和序列的pepticombs作为超分子构建模块,能精确模拟膜厚度和柔韧性 | NA | 开发能更好模拟天然细胞膜特性的仿生膜结构 | 基于重组弹性蛋白样超带电多肽的仿生囊泡 | 合成生物学 | NA | 显微镜技术、分子动力学模拟 | NA | NA | NA | 重组蛋白技术 | NA | 自组装膜结构 | 生物技术 |
| 71 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica for Enhanced De Novo Biosynthesis of Icaritin
2025-Apr-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00754
PMID:40106718
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造解脂耶氏酵母,实现了黄酮类化合物淫羊藿苷元的从头生物合成 | 通过整合EsPT和OsOMTm合成途径、优化甲羟戊酸途径提高DMAPP供应、采用截断策略优化酶催化效率,将ICT产量提升至247.02 mg/L,创下目前微生物合成最高产量纪录 | NA | 开发高效的淫羊藿苷元微生物合成方法 | 解脂耶氏酵母工程菌株 | 合成生物学 | 肝癌 | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 代谢工程 | 解脂耶氏酵母 | 淫羊藿苷元合成途径,包含EsPT和OsOMTm基因,甲羟戊酸途径优化 | 医药 |
| 72 | 2025-10-05 |
Towards electrospray-assisted production of lipid-based synthetic cell assemblies
2025-Apr-16, Soft matter
IF:2.9Q2
DOI:10.1039/d4sm01284d
PMID:40035737
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研究论文 | 开发了一种基于电喷雾的技术ATLAES,用于形成基于脂质的囊泡组装体 | 提出无有机溶剂的水相两相系统(ATPS)模板化电喷雾技术,可形成具有高度稳定脂质涂层的微观囊泡 | NA | 扩展合成生物学工具箱,探索替代性脂质组装体和新生产方法 | 脂质基囊泡和合成细胞组装体 | 合成生物学 | NA | 电喷雾技术、水相两相系统(ATPS) | NA | NA | NA | ATLAES | NA | 脂质囊泡组装体 | 合成生物学 |
| 73 | 2025-10-05 |
Characterization of the Biosynthesis of Pimprinine-Type Indolyloxazoles Unravels an Unusual d-Configurational Substrate Metabolic Streamline
2025-Apr-16, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c01705
PMID:40178231
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研究论文 | 本研究揭示了皮姆普林型吲哚恶唑生物碱的生物合成机制,发现了一条以前未知的D-构型底物代谢流线 | 首次阐明了PIAs生物合成途径,发现了三个关键酶(PimA、PimB、PimC)参与的D-构型底物代谢流线,其中PimB作为门控酶从L-色氨酸池中提供D-色氨酸前体 | NA | 解析皮姆普林型吲哚恶唑生物碱的生物合成途径 | 链霉菌NZY3中的PIAs生物合成基因簇及其编码的酶 | 合成生物学 | NA | 氘标记实验、18O标记实验、比较基因组挖掘 | NA | 实验数据、基因组数据 | NA | NA | 链霉菌 | D-构型底物代谢流线,涉及色氨酸消旋、N-酰化和自由基重排介导的环化机制 | 医药, 农业 |
| 74 | 2025-10-05 |
Engineering biology applications for environmental solutions: potential and challenges
2025-Apr-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-58492-0
PMID:40229265
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综述 | 本文概述了工程生物学在环境解决方案中的应用潜力与挑战 | 整合工程生物学与纳米技术、物联网和人工智能等其他技术,并提出加速环境解决方案应用的策略 | NA | 探讨工程生物学在解决全球环境挑战中的应用前景和障碍 | 工程生物学技术在环境领域的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 75 | 2025-10-05 |
Deciphering the biosynthetic potential of microbial genomes using a BGC language processing neural network model
2025-Apr-10, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf305
PMID:40226917
|
研究论文 | 开发基于Transformer的BGC-Prophet模型用于微生物基因组中生物合成基因簇的预测和分类 | 首创基于Transformer编码器的超高通量BGC预测工具,能够捕捉基因间位置依赖关系 | NA | 挖掘微生物基因组和宏基因组中隐藏的生物合成基因簇潜力 | 微生物基因组和宏基因组中的生物合成基因簇 | 自然语言处理 | NA | Transformer语言模型 | Transformer | 基因组序列数据 | 85203个基因组和9428个宏基因组 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 76 | 2025-10-05 |
Derepression of transposable elements in mouse prefrontal cortex disrupts social behavior
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646358
PMID:40236017
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研究论文 | 通过合成生物学方法研究小鼠前额叶皮层中TRIM28蛋白功能改变对社会行为的影响 | 首次通过重构TRIM28蛋白的转录调控域来逆转其功能,揭示TE去抑制导致社会行为缺陷的新机制 | 研究仅针对小鼠前额叶皮层,未涉及其他脑区;性别差异分析不够深入 | 探究TRIM28-KZFP相互作用在调控转座元件和社会行为中的功能 | 雄性和雌性小鼠的前额叶皮层 | 合成生物学 | 社会行为障碍 | RNA测序,病毒介导的基因传递 | NA | 基因表达数据,行为数据 | 雄性和雌性小鼠 | 病毒载体 | 小鼠 | TRIM28转录调控域的重编程:用VP64-p65-Rta激活域替换抑制域,或切除调控域 | 医学 |
| 77 | 2025-10-05 |
Programmable DNA-Based Nanodevices for Next-Generation Clinical and Healthcare Applications
2025-Apr, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400593
PMID:39913110
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综述 | 本文探讨DNA纳米技术在医疗保健领域的应用潜力与当前挑战 | 系统分析DNA纳米器件在临床转化中的关键问题与发展趋势 | 未提出具体解决方案,主要聚焦于问题梳理与前景展望 | 促进DNA纳米结构向医疗应用的转化 | DNA纳米结构与纳米器件 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 自组装纳米结构 | 医学 |
| 78 | 2025-10-05 |
Antimicrobial Peptides and Their Mimetics: Promising Candidates of Next-Generation Therapeutic Agents Combating Multidrug-Resistant Bacteria
2025-Apr, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400461
PMID:39913150
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综述 | 全面讨论天然与合成抗菌肽及其化学模拟物在对抗多重耐药菌方面的研究进展 | 整合人工智能技术探索化学空间,结合化学与合成生物学进展开发抗菌肽化学模拟物 | NA | 开发对抗多重耐药菌的新一代治疗药物 | 抗菌肽及其化学模拟物 | NA | 细菌感染 | 人工智能、化学合成、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 79 | 2025-10-05 |
Beyond the blood: expanding CAR T cell therapy to solid tumors
2025-Apr, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02446-2
PMID:39533105
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综述 | 探讨CAR-T细胞疗法从血液肿瘤扩展到实体瘤的最新进展及未来策略 | 分析近期实体瘤CAR-T疗法取得突破的原因,并提出通过CAR工程和合成生物学策略持续拓展疗效 | NA | 探索CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的扩展应用和持续改进策略 | CAR-T细胞疗法在胶质母细胞瘤等实体瘤中的应用 | NA | 实体瘤 | CAR-T细胞疗法 | NA | 临床试验数据 | NA | 合成生物学 | T细胞 | CAR工程改造 | 医学 |
| 80 | 2025-10-05 |
Semi-automated workflow for high-throughput Agrobacterium-mediated plant transformation
2025-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70118
PMID:40220013
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研究论文 | 开发了一种用于农杆菌介导植物转化的半自动化高通量工作流程 | 优化了农杆菌转化流程并简化了地钱稳定转基因株系获取协议,首次实现六孔板冻融转化方法并适配机器人自动化 | NA | 建立高效高通量植物转化体系以克服植物研究中世代时间长和成本高的障碍 | 模型植物地钱(Marchantia polymorpha) | 合成生物学 | NA | 农杆菌转化法 | NA | NA | 每月可测试约100个构建体 | Agrobacterium tumefaciens | Marchantia polymorpha | NA | 农业, 工业生物技术 |