本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-05 |
Innovations in Bacteriophage Genome Engineering for Combating Multidrug-Resistant Bacterial Infections
2025-Apr-11, Foodborne pathogens and disease
IF:1.9Q3
DOI:10.1089/fpd.2024.0194
PMID:40216545
|
综述 | 本文综述了噬菌体基因组工程技术在对抗多重耐药细菌感染方面的创新进展 | 整合CRISPR/Cas9、同源重组等合成生物学技术改进噬菌体效能并扩大宿主范围 | 未提及具体临床转化时间表或大规模应用案例 | 开发针对多重耐药细菌感染的噬菌体治疗策略 | 噬菌体与细菌宿主的相互作用机制 | 合成生物学 | 细菌感染 | CRISPR/Cas9, 同源重组, 合成生物学技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 噬菌体 | 受体结合蛋白修饰 | 医学 |
| 82 | 2025-10-05 |
Discovery of diverse and high-quality mRNA capping enzymes through a language model-enabled platform
2025-Apr-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt0402
PMID:40203090
|
研究论文 | 开发基于大语言模型的基因挖掘平台SYMPLEX,用于发现高质量mRNA加帽酶 | 首次将大语言模型应用于基因挖掘领域,突破了传统基于序列同源性或专家知识的限制 | 未明确说明平台验证的规模限制和错误率 | 建立通用的基因挖掘平台以扩展合成生物学高质量遗传部件库 | mRNA加帽酶 | 合成生物学 | NA | 大语言模型,体外活性测试,体内交叉物种活性验证 | 大语言模型 | 生物医学文献和数据库文本数据 | 46个候选完整加帽酶进行实验测试 | NA | NA | NA | 生物技术,医药 |
| 83 | 2025-10-05 |
Harnessing RNA base editing for diverse applications in RNA biology and RNA therapeutics
2025-Apr-08, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-025-00063-x
PMID:40198443
|
综述 | 本文综述了RNA碱基编辑技术在RNA生物学和RNA治疗领域的多样化应用 | 系统阐述了RNA碱基编辑作为突破性技术的优势,包括可逆性、剂量依赖性效应,以及在转录组范围内绘制RNA结合蛋白互作图谱的能力 | NA | 探讨RNA碱基编辑技术在基础研究和转化应用中的潜力 | RNA碱基编辑技术及其应用 | 合成生物学 | NA | RNA碱基编辑(ADAR和APOBEC介导的A-to-I和C-to-U转换) | NA | NA | NA | NA | NA | RNA编辑传感器(响应特定RNA物种表达效应蛋白) | 医学, 合成生物学 |
| 84 | 2025-10-05 |
Understanding the role of poly(3-hydroxybutyrate) depolymerases in waste management
2025-Apr, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2025.124925
PMID:40132380
|
综述 | 本文综述了PHB解聚酶在生物塑料废物管理中的作用机制和应用前景 | 首次系统总结了胞外和胞内PHB解聚酶的结构特征、微生物来源及在PHB生物降解中的功能 | 主要基于文献综述,缺乏原始实验数据支持 | 探讨PHB解聚酶在生物可降解塑料废物处理中的应用潜力 | PHB解聚酶及其产生微生物 | 环境生物技术 | NA | 生物信息学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | NA | Rhodobacter, Rhodospirillum, Ralstonia, Zoogloea, Pseudomonas, Sinorhizobium, Bacillus | NA | 环境 |
| 85 | 2025-10-05 |
Dynamic and Diverse Coacervate Architectures by Controlled Demembranization
2025-Apr-09, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c01526
PMID:40135632
|
研究论文 | 本文提出了一种控制膜化凝聚体去膜化的策略,实现凝聚体结构的动态重构和功能调控 | 通过静电竞争机制实现凝聚体的可控去膜化,并创建具有双层和Janus-like不对称膜结构的凝聚体原细胞 | NA | 开发具有动态可重构膜结构的合成原细胞系统 | 膜化凝聚体液滴和去膜化凝聚体液滴 | 合成生物学 | NA | 去膜化技术、静电竞争机制 | NA | NA | NA | NA | NA | 膜化/去膜化动态重构系统、双层膜结构、Janus-like不对称膜结构 | 合成生物学, 系统生物学, 生物技术 |
| 86 | 2025-10-05 |
Functional characterization and regioselectivity manipulation of two Benzylisoquinoline alkaloids O-methyltransferases from Stephania yunnanensis
2025-Apr, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108238
PMID:39922041
|
研究论文 | 本研究从云南地不容中鉴定并表征了两个功能相同但系统发育不同的BIA 7OMTs,通过蛋白质工程成功调控了其区域选择性 | 通过定点突变操纵底物结合微环境,将SyOMT4转化为高特异性BIA 6OMT,将SyOMT5工程化为BIA NMTs | NA | 扩展BIA O-甲基转移酶的功能库,为药用重要BIAs的生产提供酶工具 | 云南地不容中的两个苯基异喹啉生物碱O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5 | 合成生物学 | COVID-19 | 转录组分析、多序列比对、结构建模、定点诱变 | NA | 序列数据、结构数据 | NA | 定点诱变 | 植物 | 酶催化区域选择性调控 | 医药 |
| 87 | 2025-10-05 |
Engineering Protocell Networks for Prototissue Development
2025-Apr-03, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500376
PMID:40177794
|
综述 | 探讨将原始细胞组装成原始组织的方法及其在模拟生物组织结构和功能方面的应用 | 系统总结了多种原始细胞模型的空间组织方法及其集体行为特征 | NA | 构建功能化原始组织系统以模拟生物组织的层次结构和复杂功能 | 脂质囊泡、聚合物囊泡、蛋白质体、无膜凝聚层和乳液滴等原始细胞模型 | 合成生物学 | NA | 化学和物理空间组织方法 | NA | NA | NA | NA | NA | 原始细胞网络 | 生物医学,再生医学 |
| 88 | 2025-10-05 |
Evolution and Impact of Imine Reductases (IREDs) Research: A Knowledge Mapping Approach
2025-Apr-02, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01421-9
PMID:40172741
|
研究论文 | 通过文献计量学和知识图谱方法分析亚胺还原酶(IREDs)研究的发展历程和研究格局 | 首次通过文献计量学方法对IREDs研究领域进行可视化分析,揭示该领域的发展轨迹和研究热点 | 仅基于Web of Science数据库的239篇文献进行分析,可能存在文献覆盖不全的局限 | 探索IREDs研究的整体格局和演进路径 | 2010-2024年间发表的239篇IREDs相关研究论文和综述 | 生物信息学 | NA | 文献计量分析、知识图谱构建 | NA | 文献数据 | 239篇研究论文和综述 | NA | NA | NA | 医药 |
| 89 | 2025-10-05 |
Promoting the glycosylation of drug-like natural products in a Saccharomyces cerevisiae chassis by deletion of endogenous glycosidases
2025-Apr, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132258
PMID:39971105
|
研究论文 | 通过在酿酒酵母底盘细胞中删除内源性糖苷酶基因,提高药物样天然产物糖基化效率的研究 | 首次系统评估了删除EXG1和SPR1外切糖苷酶对天然产物糖基化效率和区域选择性的影响,并发现大环内酯糖缀合物对EXG1水解具有抗性 | 仅测试了18种糖苷配基中的13种显示出改善效果,未涵盖所有天然产物类型 | 提高天然产物及其类似物的糖基化效率和区域选择性 | 苯二酚内酯家族聚酮化合物和苯丙素类多酚 | 合成生物学 | NA | 糖基化工程、基因敲除、生物催化 | NA | 代谢产物分析数据 | 18种糖苷配基 | 基因敲除 | 酿酒酵母 | 糖基化途径工程 | 医药,营养保健品,作物保护 |
| 90 | 2025-10-05 |
Machine learning for synthetic gene circuit engineering
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103263
PMID:39874719
|
综述 | 探讨机器学习在合成基因电路工程中的新兴作用及其与机理建模结合的潜力 | 提出机器学习与机理建模结合的混合方法,利用数据驱动模型的优势与基于机理模型的规范性能力 | 需要克服相关挑战才能充分发挥这些方法的潜力 | 提升合成基因电路工程从单个组件到电路层面的设计能力 | 合成基因电路及其与宿主细胞机器的相互作用 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | 能够执行操作、检测信号和调节细胞功能的工程生物电路 | 医学,能源,食品,环境 |