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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2025-04-15 |
Semi-automated workflow for high-throughput Agrobacterium-mediated plant transformation
2025-Apr, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70118
PMID:40220013
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研究论文 | 本文提出了一种优化的农杆菌转化流程和简化协议,用于高效高通量植物合成生物学实验 | 采用冻融农杆菌转化方法和Opentrons开源平台实现半自动化协议,提高了转化效率并降低了成本和时间 | 目前仅针对模型苔藓植物Marchantia polymorpha进行了验证,尚未在其他植物物种中广泛应用 | 优化植物转化流程,实现高通量筛选 | 模型苔藓植物Marchantia polymorpha | 植物合成生物学 | NA | 冻融农杆菌转化方法 | NA | NA | 每月可测试约100个构建体 |
82 | 2025-04-13 |
Innovations in Bacteriophage Genome Engineering for Combating Multidrug-Resistant Bacterial Infections
2025-Apr-11, Foodborne pathogens and disease
IF:1.9Q3
DOI:10.1089/fpd.2024.0194
PMID:40216545
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研究论文 | 本文探讨了利用噬菌体基因组工程技术对抗多重耐药细菌感染的创新方法 | 介绍了CRISPR/Cas9、同源重组等合成生物学技术在噬菌体改造中的应用,以增强其针对多重耐药菌的效果 | 长期噬菌体治疗可能导致抗噬菌体抗体的产生,可能干扰治疗效果 | 开发更有效的噬菌体疗法以应对多重耐药细菌感染 | 噬菌体及其与细菌宿主的相互作用 | 合成生物学 | 细菌感染 | CRISPR/Cas9, 同源重组, 合成生物学技术 | NA | NA | NA |
83 | 2025-04-12 |
Discovery of diverse and high-quality mRNA capping enzymes through a language model-enabled platform
2025-Apr-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adt0402
PMID:40203090
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研究论文 | 本文提出了一种基于大型语言模型的通用基因挖掘平台SYMPLEX,用于发现高质量的mRNA加帽酶 | 利用大型语言模型构建基因挖掘平台SYMPLEX,突破了传统依赖序列同源性和专家知识的限制 | 实验验证的候选酶数量有限(46个),需要进一步扩大验证规模 | 开发新型基因挖掘平台以支持合成生物学和生物工程研究 | mRNA加帽酶 | 合成生物学 | NA | 大型语言模型 | NA | 生物医学文献和数据库数据 | 46个候选酶进行实验验证 |
84 | 2025-04-12 |
Harnessing RNA base editing for diverse applications in RNA biology and RNA therapeutics
2025-Apr-08, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-025-00063-x
PMID:40198443
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review | 本文综述了RNA碱基编辑技术在RNA生物学和RNA治疗中的多样化应用 | RNA碱基编辑技术作为一种突破性进展,提供了可逆、剂量依赖性的位点定向编辑,与DNA编辑的永久性或遗传性变化形成对比 | NA | 探讨RNA碱基编辑技术在基础研究和转化应用中的潜力 | RNA分子及其在生物学研究和治疗中的应用 | RNA生物学 | NA | RNA碱基编辑(ADAR和APOBEC酶介导的A-to-I和C-to-U转换) | NA | RNA序列 | NA |
85 | 2025-04-12 |
Understanding the role of poly(3-hydroxybutyrate) depolymerases in waste management
2025-Apr, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2025.124925
PMID:40132380
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review | 本文综述了聚(3-羟基丁酸酯)解聚酶(PHBDs)在废物管理中的作用及其研究进展 | 提供了关于PHBDs的全面更新,包括酶的胞外和胞内形式,以及通过生物信息学和合成生物学方法探索未研究微生物中的PHBDs | 未提及具体实验数据或案例研究,主要基于文献综述 | 探讨PHBDs在生物降解聚(3-羟基丁酸酯)(PHB)废物中的潜在应用 | 聚(3-羟基丁酸酯)解聚酶(PHBDs)及其产生微生物 | 生物技术 | NA | 生物信息学、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA |
86 | 2025-04-10 |
Dynamic and Diverse Coacervate Architectures by Controlled Demembranization
2025-Apr-09, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c01526
PMID:40135632
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research paper | 该研究提出了一种控制去膜化膜化凝聚液滴的策略,以模拟生物系统中的膜动态过程 | 通过静电竞争触发去膜化过程,实现了凝聚液滴结构的可控重构,并扩展了其在合成生物学和生物技术中的应用 | NA | 研究膜化/去膜化过程对凝聚液滴结构和功能的影响,以开发具有动态和多样膜结构的合成原细胞 | 膜化和去膜化的凝聚液滴 | 合成生物学 | NA | 静电竞争触发去膜化 | NA | NA | NA |
87 | 2025-04-09 |
Functional characterization and regioselectivity manipulation of two Benzylisoquinoline alkaloids O-methyltransferases from Stephania yunnanensis
2025-Apr, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108238
PMID:39922041
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研究论文 | 该研究从云南地不容的转录组数据中鉴定并表征了两个功能相同但系统发育不同的BIA 7OMTs酶SyOMT4和SyOMT5,并通过蛋白质工程改造其底物结合微环境,成功改变了它们的催化区域选择性 | 通过定点突变成功将SyOMT4转化为高特异性的BIA 6OMT酶SyOMT4-WFE,并将SyOMT5意外改造为BIA NMTs酶SyOMT5-WFE和SyOMT5-WFD,拓展了BIA OMTs酶的功能多样性 | NA | 研究BIA O-甲基转移酶的功能表征与区域选择性调控机制 | 云南地不容中的两个BIA O-甲基转移酶SyOMT4和SyOMT5 | 合成生物学与代谢工程 | NA | 转录组分析、多序列比对、结构建模、定点突变 | NA | 序列数据、结构模型 | NA |
88 | 2025-04-07 |
Bioprinting and synthetic biology approaches to engineer functional endocrine pancreatic constructs
2025-Apr-03, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.03.005
PMID:40185667
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review | 讨论生物打印和合成生物学在工程化功能性内分泌胰腺构建体中的最新进展 | 融合合成生物学、细胞工程与生物打印技术,为开发先进体外模型和可移植移植物开辟新途径 | NA | 探索利用生物打印和合成生物学技术开发功能性内分泌胰腺构建体,以治疗糖尿病 | 内分泌胰腺构建体 | 合成生物学 | 糖尿病 | 生物打印、合成生物学、细胞工程 | NA | NA | NA |
89 | 2025-04-06 |
High-throughput optimisation of protein secretion in yeast via an engineered biosensor
2025-Apr, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2024.11.010
PMID:39674781
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research paper | 该研究通过工程化生物传感器优化酵母中蛋白质的高通量分泌 | 利用酵母G蛋白偶联受体生物传感器测量与目标蛋白质共分泌的肽标签浓度,实现分泌效率的高通量筛选 | NA | 优化异源蛋白质表达策略中的分泌效率 | 酵母中的蛋白质分泌系统 | 合成生物学 | NA | Combinatorial Golden Gate克隆 | NA | NA | 超过6000种启动子、信号肽和终止子的组合 |
90 | 2025-04-05 |
Unlocking lignin valorization and harnessing lignin-based raw materials for bio-manufacturing
2025-Apr, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2792-x
PMID:39704933
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综述 | 本文全面总结了木质素降解的前沿生物策略、木质素分解酶、代谢途径以及降解菌株或菌群,并批判性地评估了其潜在机制 | 强调了利用数字系统和合成生物学等创新方法来释放木质素衍生原材料的商业潜力,以及人工智能驱动技术在克服当前挑战和推动木质素增值广泛采用中的前景 | 木质素的复杂组成和抗分解性仍然是其定向增值的主要障碍 | 探索木质素增值和利用木质素基原材料进行生物制造的潜力 | 木质素及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因工程、人工智能驱动技术 | NA | NA | NA |
91 | 2025-04-04 |
Engineering Protocell Networks for Prototissue Development
2025-Apr-03, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500376
PMID:40177794
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review | 探讨将原始细胞组装成原始组织的方法及其在合成生物学和再生医学中的潜在应用 | 综述了多种原始细胞模型的构建方法及其组装成功能化原始组织的化学和物理策略,强调了原始组织在细胞间通讯和集体行为方面的独特性质 | NA | 探索原始细胞网络工程在原始组织发展中的应用 | 原始细胞模型(如脂质囊泡、聚合物囊泡、蛋白质体、无膜凝聚体和乳液滴)及其组装成的原始组织 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
92 | 2025-04-03 |
Evolution and Impact of Imine Reductases (IREDs) Research: A Knowledge Mapping Approach
2025-Apr-02, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-025-01421-9
PMID:40172741
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研究论文 | 本研究通过文献计量和知识图谱方法,探索了亚胺还原酶(IREDs)的研究格局和演变 | 首次通过文献计量分析提供了IRED研究的可视化表示,揭示了当前趋势和新兴主题 | 研究仅基于Web of Science Core Collection的数据,可能存在遗漏 | 评估IRED研究的现状和发展趋势,为学者提供研究方向和潜在合作者信息 | 239篇关于IREDs的研究文章和综述 | 生物催化 | NA | 文献计量分析、知识图谱方法(CiteSpace, VOSviewer, Pajek, Scimago Graphica) | NA | 文献数据 | 239篇研究文章和综述(2010-2024年) |
93 | 2025-03-30 |
A novel geminivirus-derived 3' flanking sequence of terminator mediates the gene expression enhancement
2025-Apr, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14561
PMID:39723813
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研究论文 | 本研究探讨了一种来自甜薯卷叶病毒的SBG51 deltasatellite DNA序列,该序列在终止子下游时能显著增强基因表达 | 发现SBG51序列能显著增强基因表达,并鉴定出一个123 bp的AT富集序列及其中的'ATAAA'/'TTAAA'元件具有增强效应 | 未明确说明该技术在更广泛宿主中的适用性及长期稳定性 | 探索合成生物学中基因表达元件的新设计 | SBG51 deltasatellite DNA序列及其衍生的AT富集序列 | 合成生物学 | NA | 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 本氏烟草叶片和转基因拟南芥植物 |
94 | 2025-03-05 |
Promoting the glycosylation of drug-like natural products in a Saccharomyces cerevisiae chassis by deletion of endogenous glycosidases
2025-Apr, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132258
PMID:39971105
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研究论文 | 本文探讨了通过删除内源性糖苷酶来提高酿酒酵母中药物样天然产物糖基化效率的方法 | 通过删除EXG1或SPR1糖苷酶,提高了糖苷化产物的产量和区域异构体分布的多样性 | 研究仅限于酿酒酵母系统,且仅测试了18种糖苷中的13种 | 提高天然产物或其非天然产物类似物的糖基化效率和区域特异性 | 苯二酚内酯家族的多酮类和苯丙烷类的多酚类化合物 | 合成生物学 | NA | 糖基化技术 | NA | NA | 18种糖苷 |
95 | 2025-03-03 |
Machine learning for synthetic gene circuit engineering
2025-Apr, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103263
PMID:39874719
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研究论文 | 本文讨论了机器学习在合成基因电路工程中的新兴作用,以及如何通过机器学习增强从单个组件到电路层面的工程设计 | 提出了机器学习与机制建模相结合的混合方法,以利用数据驱动模型的优势与基于机制的模型的规范性能力 | 需要克服的挑战包括如何有效地整合机器学习与机制建模,以及如何在实际应用中实现这些方法的潜力 | 探讨机器学习在合成基因电路工程中的应用,以解决设计空间大、组件与宿主细胞机器之间复杂交互的挑战 | 合成基因电路 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | 混合模型(机器学习与机制建模) | NA | NA |