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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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61 | 2025-05-22 |
Transcriptomic functional characterization of recombinant adeno-associated virus producing cell line adapted to suspension-growth
2025-May-21, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70042
PMID:40396307
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研究论文 | 本文通过合成生物学方法生成适应悬浮生长的HEK293细胞系,用于重组腺相关病毒(rAAV)的可扩展生产 | 开发了能够在无血清悬浮培养基中生长的GX6Bs细胞系,并研究了其转录组变化对rAAV产量的影响 | 悬浮培养的GX6Bs细胞病毒滴度显著降低,即使恢复贴壁培养条件,产量也只能恢复到GX6B的25%-50% | 开发可扩展的rAAV生产技术 | 重组腺相关病毒(rAAV)生产细胞系 | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | GX6B和GX6Bs细胞系 |
62 | 2025-05-22 |
Machine Learning Empowering Microbial Cell Factory: A Comprehensive Review
2025-May-21, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05260-x
PMID:40397295
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综述 | 本文综述了机器学习与合成生物学在微生物细胞工厂升级中的协同作用及其在生物技术中的应用 | 探讨了机器学习与合成生物学结合在化学生产、人类健康和环境修复中的具体应用,为未来研究提供了指导 | NA | 研究机器学习与合成生物学在生物制造中的协同作用及其潜在价值 | 微生物细胞工厂及其在化学生产、人类健康和环境修复中的应用 | 合成生物学 | NA | 机器学习 | NA | NA | NA |
63 | 2025-05-22 |
Remodeling of ribosomally synthesized peptide backbones based on posttranslational modifications
2025-May-20, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00018a
PMID:40392103
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research paper | 本文综述了2013年至2024年间核糖体合成并经翻译后修饰的肽(RiPP)天然产物的研究进展,重点介绍了通过翻译后修饰(PTMs)重塑肽骨架的酶及其催化机制 | 揭示了通过翻译后修饰重塑肽骨架的酶及其催化机制,为功能性肽类药物的理性设计和生产提供了新的生物学工具 | NA | 加深对RiPP生物合成的理解,并增强利用合成生物学策略理性设计、开发和生产功能性肽类药物的能力 | 核糖体合成并经翻译后修饰的肽(RiPP)天然产物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘 | NA | NA | NA |
64 | 2025-05-22 |
The Advancement of Peptides Derived From Kitasatospora
2025-May, Chemistry & biodiversity
IF:2.3Q3
DOI:10.1002/cbdv.202402999
PMID:39737746
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综述 | 本文综述了Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究进展,包括两种研究策略及其相关酶学和生物合成知识 | 提出了基于Kitasatospora的两种肽类天然产物研究策略,并总结了相关生物合成酶的最新发现 | 未提及具体实验数据或案例研究的局限性 | 探讨Kitasatospora来源的肽类天然产物的研究方法和生物合成机制 | Kitasatospora属放线菌及其产生的肽类天然产物 | 天然产物化学 | NA | 基因组分析、生物信息学工具、序列相似性网络构建 | NA | 基因组数据、酶学数据 | NA |
65 | 2025-05-21 |
A generalizable approach for programming protease-responsive conformationally inhibited artificial transcriptional factors
2025-May-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59828-6
PMID:40382329
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research paper | 本文提出了一种蛋白酶响应性构象抑制系统(PRCIS),用于设计可编程的人工转录因子(ATF)以构建正交和可组合的转录调控工具 | 通过分子内连接将ATF的自由DNA结合域与受限二聚化区域相连,实现转录结合的构象失活,并在蛋白酶切割连接后恢复DNA结合功能 | NA | 开发一种通用的蛋白酶响应性构象抑制系统,用于合成生物学中的基因调控 | 人工转录因子(ATF)和蛋白酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白酶响应性构象抑制系统(PRCIS) | NA | NA | NA |
66 | 2025-05-20 |
Ultrasound-responsive mammalian cell synthetic biology
2025-May-16, IEEE transactions on ultrasonics, ferroelectrics, and frequency control
DOI:10.1109/TUFFC.2025.3570813
PMID:40378033
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综述 | 本文综述了超声遗传学在合成生物学中的最新进展及其作为非侵入性精确控制细胞和分子过程工具的潜力 | 结合超声波与基因工程效应器,克服了组织穿透性和侵入性的限制,扩展了超声在生物系统中的应用 | 参数标准化和基础机制理解方面的挑战 | 探讨超声遗传学在研究和治疗应用中的潜力 | 哺乳动物细胞和分子过程 | 合成生物学 | NA | 超声波、基因工程、声学造影剂(如微泡和气体囊泡) | NA | NA | NA |
67 | 2025-05-20 |
Self-authenticating genomic materials in Escherichia coli via advanced genome signatures
2025-May-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08171-z
PMID:40379889
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研究论文 | 介绍了一种名为'基因组签名'的生物化学稳定且防篡改的DNA标记系统,用于创建自我认证的基因组 | 利用Golomb-ruler衍生的Genome-Comb技术,显著提高了错误纠正和数据编码能力,能够在活体大肠杆菌中记录450万核苷酸的基因组 | NA | 提高合成基因组材料的真实性和完整性,以促进科学知识的进步和生物安全性的增强 | 大肠杆菌的基因组 | 合成生物学 | NA | Genome Signature技术 | NA | DNA序列数据 | 450万核苷酸的基因组 |
68 | 2025-05-20 |
Combinatorial metabolic engineering of Yarrowia lipolytica for high-level production of the plant-derived diterpenoid sclareol
2025-May-16, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02744-7
PMID:40380140
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研究论文 | 通过组合代谢工程改造Yarrowia lipolytica,实现植物源二萜醇sclareol的高效生产 | 通过整合LPPS和SCS基因、优化蛋白融合与多拷贝基因整合、增强GGPP前体供应及调控甲羟戊酸途径,显著提高了sclareol产量 | 研究仅在摇瓶条件下进行,未涉及大规模发酵验证 | 开发可持续的sclareol微生物合成方法 | Yarrowia lipolytica酵母菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因整合与过表达 | NA | NA | NA |
69 | 2025-05-20 |
Pathway engineering for the biosynthesis of psychedelics
2025-May-16, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103314
PMID:40381450
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研究论文 | 本文综述了迷幻药物生物合成途径工程的最新进展 | 总结了在真核和原核生产宿主中合成迷幻化合物的最新生物合成成就,并整理了一系列相关的生物合成酶 | NA | 开发迷幻化合物的替代生产途径 | 迷幻化合物(如色胺类、麦角类和苯乙胺类) | 合成生物学 | NA | 生物合成途径工程 | NA | NA | NA |
70 | 2025-05-20 |
Responses of natural plastisphere community and zooplankton to microplastic pollution: a review on novel remediation strategies
2025-May-07, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04334-y
PMID:40332619
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综述 | 本文综述了微塑料污染对自然塑料球群落和浮游动物的影响,并探讨了基于自然群落水平的新型修复策略 | 提出了基于塑料球群落和浮游动物适应性响应的新型修复策略,并探讨了纳米技术等创新方法在微塑料去除中的应用 | 需要进一步研究以开发更先进的微塑料处理技术,并深入了解微塑料对海洋生态系统的毒性影响 | 探讨微塑料污染对环境和生物的影响,并提出修复策略 | 微塑料、塑料球群落、浮游动物、海洋生态系统 | 环境科学 | NA | DNA meta-barcoding、膜生物反应器、合成生物学、有机硅烷技术、生物膜介导修复、纳米材料技术 | NA | 文献数据 | NA |
71 | 2025-05-20 |
Emerging ultrafast technologies in biotechnology
2025-May, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04309-2
PMID:40292246
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综述 | 本文综述了超快技术在生物技术中的变革性应用,重点介绍了其在实时可视化和精确操控生物分子过程中的能力 | 飞秒激光提高了基因编辑的精确性,减少了脱靶效应;超快光谱学增进了对蛋白质折叠途径、酶活性和能量转移机制的理解;阿秒光谱学为超快电子动力学和电荷迁移提供了前所未有的见解 | 光损伤、与复杂生物系统的整合以及伦理问题 | 探讨超快技术在生物技术中的应用及其潜力 | 生物分子过程、基因编辑、蛋白质折叠、酶活性、细胞动力学 | 生物技术 | NA | 飞秒激光、超快光谱学、泵浦探测显微镜、相干反斯托克斯拉曼散射(CARS)、阿秒光谱学 | NA | NA | NA |
72 | 2025-05-20 |
A CYP80B enzyme from Stephania tetrandra enables the 3'-hydroxylation of N-methylcoclaurine and coclaurine in the biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids
2025-May, Chinese journal of natural medicines
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/S1875-5364(25)60867-3
PMID:40383618
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研究论文 | 本研究从粉防己中克隆了CYP80B基因(StCYP80B),并发现其能够催化N-甲基乌药碱和乌药碱的3'-羟基化,扩展了CYP80B酶的底物选择性 | StCYP80B不需要N-甲基基团即可发挥羟基化活性,且对(S)-构型有明显偏好,这是与之前报道的野生型CYP80Bs的不同之处 | NA | 阐明苯基异喹啉生物碱(BIAs)的生物合成途径和基因,为利用合成生物学方法开发可持续来源提供基础 | 粉防己(Stephania tetrandra)中的CYP80B酶及其催化功能 | 合成生物学 | NA | 酵母异源表达系统、定点诱变 | NA | 基因序列、酶活性数据 | NA |
73 | 2025-05-20 |
Comparative genomics of three medicinal Glycyrrhiza species unveiled novel candidates for the production of important bioactive compounds
2025-May, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70223
PMID:40384636
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研究论文 | 本研究通过比较三种药用甘草属植物的基因组,揭示了其生物活性化合物生产的新候选基因 | 首次获得了三种药用甘草的高质量基因组序列,并鉴定了调控甘草酸合成的关键转录因子及特定黄酮类化合物的生物合成途径基因 | 研究仅针对三种甘草属植物,可能不适用于其他药用植物 | 探究药用甘草属植物中重要生物活性化合物的合成机制 | 三种药用甘草属植物(Glycyrrhiza uralensis、Glycyrrhiza inflata和Glycyrrhiza glabra) | 比较基因组学 | NA | 基因组测序与组装、转录组分析 | NA | 基因组序列数据、转录组数据 | 三种甘草属植物的基因组(大小分别为425Mb、447Mb和423Mb) |
74 | 2025-05-19 |
Unlocking hidden bioactive compounds: from indolocarbazole and RiPP biosynthesis to the activation of cryptic secondary metabolism via microbial interactions
2025-May-16, The Journal of antibiotics
IF:2.1Q3
DOI:10.1038/s41429-025-00828-5
PMID:40379949
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综述 | 本文综述了放线菌次级代谢的三个方面:吲哚咔唑的生物合成、RiPPs的生物合成以及通过微生物相互作用激活次级代谢 | 强调了微生物相互作用在天然产物生物合成中的重要性,并提出了通过合成生物学和微生物生态学进行药物发现的新方向 | NA | 探索放线菌次级代谢的生物合成途径及其在药物发现中的应用 | 放线菌,特别是链霉菌,及其次级代谢产物 | 微生物学与药物发现 | NA | 细胞游离一锅合成平台、组合培养策略 | NA | NA | NA |
75 | 2025-05-19 |
Excavation of acoustic nanostructures biosynthesis gene clusters by combinatorial strategy
2025-May-15, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-025-00069-5
PMID:40372536
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research paper | 该研究通过合成生物学策略构建了一种新型基因编码的气囊纳米结构,可用于临床超声成像和药物递送 | 通过组合不同微生物的基因簇,合成了一种新型气囊纳米结构(ARG),其尺寸适合临床超声成像,并可通过点饱和突变调整大小 | NA | 开发适用于临床超声成像和药物递送的新型气囊纳米结构 | 气囊纳米结构(GVs)的生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 合成生物学策略、点饱和突变 | NA | NA | NA |
76 | 2025-05-18 |
Characterization and Optimization of Vesicle Properties in bioPISA: from Size Distribution to Post-Assembly Loading
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400483
PMID:39692631
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研究论文 | 本研究探讨了通过生物催化聚合诱导自组装(bioPISA)制备的囊泡作为人工细胞的形成和性质 | 探索了实现囊泡尺寸均匀性的方法,并研究了搅拌速度对囊泡形态的影响,同时展示了将大分子加载到预形成囊泡中的可行性 | NA | 开发具有可控形态的酶合成聚合物囊泡,用于合成生物学等应用 | 通过bioPISA制备的囊泡 | 合成生物学 | NA | 生物催化聚合诱导自组装(bioPISA)、荧光相关光谱(FCS)、电穿孔 | NA | NA | NA |
77 | 2025-05-18 |
Regulating Protein Immobilization During Cell-Free Protein Synthesis in Hyaluronan Microgels
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400668
PMID:39957478
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研究论文 | 研究利用透明质酸微凝胶作为实验平台,探索无细胞蛋白质合成(CFPS)与微凝胶内蛋白质原位积累的相互作用 | 首次提出利用双功能微凝胶平台研究蛋白质合成的时间-空间调控,通过定制蛋白质结合或释放来调控反应环境 | 研究仍处于初步阶段,尚未展示该平台在复杂生物系统中的应用效果 | 开发一种用于研究蛋白质合成时空调控的实验平台 | 透明质酸微凝胶及其修饰后的蛋白质结合能力 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS),线性DNA模板技术 | NA | 实验数据 | NA |
78 | 2025-05-18 |
Distinct Network Morphologies from In Situ Polymerization of Microtubules in Giant Polymer-Lipid Hybrid Vesicles
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400601
PMID:40071650
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research paper | 研究展示了在巨型聚合物-脂质杂化囊泡中原位聚合微管,模拟活细胞中的动态细胞骨架 | 首次在由特定两亲性嵌段共聚物和脂质组成的杂化囊泡中实现微管原位聚合,并观察到不同形态的微管网络 | 未探讨不同膜组成对微管形态影响的具体分子机制 | 模拟活细胞中的动态细胞骨架,探索膜组成对微管形态的影响 | 巨型聚合物-脂质杂化囊泡和微管 | 合成生物学 | NA | 原位聚合技术 | NA | 显微镜图像 | NA |
79 | 2025-05-18 |
Scaling Up Synthetic Cell Production Using Robotics and Machine Learning Toward Therapeutic Applications
2025-May, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202400671
PMID:40162738
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研究论文 | 本研究开发了一种自动化方法,用于大规模生产蛋白质合成细胞(SCs),以应用于治疗领域 | 结合机器人液体处理系统和AI图像分析,实现了SCs的大规模自动化生产和质量控制 | 研究主要关注蛋白质表达SCs,可能不适用于其他类型SCs的生产 | 提高合成细胞的生产效率和质量控制,以促进其治疗应用 | 蛋白质合成细胞(SCs) | 合成生物学 | NA | 机器人液体处理系统(LiHa)、AI图像分析 | AI | 图像 | 小鼠实验 |
80 | 2025-05-17 |
Plant synthetic biology-based biofortification, strategies and recent progresses
2025-May-16, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13934
PMID:40376763
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综述 | 本文概述了基于植物合成生物学的生物强化策略及其最新进展 | 提出了五种合成生物学核心策略,并展示了中国研究团队的最新突破 | NA | 解决全球微量营养素缺乏问题 | 植物组织中的营养素水平 | 合成生物学 | 微量营养素缺乏症 | NA | NA | NA | NA |