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当前共找到 120 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-15 |
A roadmap to understanding and anticipating microbial gene transfer in soil communities
2025-Jun-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00225-24
PMID:40197024
|
综述 | 提出理解和预测土壤微生物群落中基因转移的路线图 | 针对土壤复杂异质性环境下合成DNA工程菌的基因转移预测难题，提出构建土壤标准、利用新兴技术测量宿主范围等系统策略，并强调生物防控措施的责任性社区参与 | 未提供具体实验数据或验证结果，主要基于现有知识缺口提出理论框架 | 建立环境特异性模型以预测工程微生物在土壤中的基因转移风险，推动安全合成生物学应用 | 土壤微生物群落中的工程微生物及天然微生物 | 合成生物学 | NA | 合成DNA技术 | 群落尺度环境特异性模型 | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 土壤微生物 | NA | 环境, 农业, 能源, 食品 |
| 2 | 2026-05-21 |
Expanding salivary biomarker detection by creating a synthetic neuraminic acid sensor via chimeragenesis
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598939
PMID:38915506
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研究论文 | 利用合成生物学技术构建新型嵌合转录因子（Sphnx）作为全细胞生物传感器，用于检测唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac），实现口腔鳞状细胞癌的早期非侵入性诊断 | 通过嵌合体技术创建新型合成神经氨酸传感器，首次将工程细菌的全细胞生物传感器应用于口腔鳞状细胞癌唾液生物标志物检测 | 尚未进行临床验证，传感器性能在真实唾液样本中的灵敏度和特异性待评估，平台仍需优化以提高检测通量和稳定性 | 开发能够检测口腔鳞状细胞癌相关唾液生物标志物的合成生物传感器，为口腔及全身疾病的临床筛查提供概念验证平台 | N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac）和工程细菌菌株 | 合成生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 合成生物学、嵌合体技术 | NA | 分子数据 | NA | NA | 工程细菌 | 嵌合转录因子（Sphnx）传感回路 | 医学 |
| 3 | 2026-05-20 |
Edible and Medicinal Fungi as Candidate Natural Antidepressants: Mechanisms and Nutritional Implications
2025-06, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70080
PMID:40289452
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综述 | 系统综述了食用药用真菌的抗抑郁潜力及其作用机制 | 整合了肠脑轴、色氨酸-犬尿氨酸通路及神经炎症调节等多维机制，并探讨了3D食品打印与合成生物学等技术创新 | 缺乏临床验证、标准化不足 | 评估食用药用真菌作为天然抗抑郁剂的潜力及营养学应用 | 灵芝、猴头菇、茯苓、蛹虫草等食用药用真菌及其生物活性化合物 | 机器学习 | 抑郁症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学, 食品 |
| 4 | 2026-05-17 |
Biomolecular Condensate-Based Artificial Organelle for Driving Compartmentalized Flux Control
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00871
PMID:40339164
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研究论文 | 利用工程化生物分子凝聚体构建人工细胞器，实现代谢途径的区室化通量控制 | 首次设计FUSLCD-GCN4融合蛋白系统创建可编程人工细胞器，通过空间组织关键酶来增强代谢途径效率 | 该研究仅以2'-岩藻糖基乳糖合成途径为模型，未验证在其他代谢途径中的通用性 | 建立基于生物分子凝聚体的合成生物学平台，实现通量区室化控制以提高微生物细胞工厂的生物合成效率 | 工程化大肠杆菌及其中的人工细胞器 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | NA | 蛋白质融合设计 | 大肠杆菌 | 人工细胞器（基于FUSLCD-GCN4的区室化途径） | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-05-17 |
Microfluidic Fluorescence-Activated Cell Sorting of Convolutional Neural Network-Designed Synthetic Yeast Promoter
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00025
PMID:40368332
|
研究论文 | 结合分支卷积神经网络设计和高通量微流控荧光激活细胞分选，筛选增强型合成酵母启动子 | 首次将分支卷积神经网络（B-CNN）与遗传算法结合，用于预测和重新设计酵母启动子核心区域，并集成微流控荧光激活细胞分选（μFACS）系统实现高吞吐量单细胞分选 | 未提及大规模验证或其他酵母菌株的通用性 | 实现合成酵母启动子的理性设计和高效高通量筛选，提升基因表达和代谢物生物合成性能 | 酵母酒精氧化酶1启动子（P_AOX1）及其突变体 | 机器学习 | NA | 微流控荧光激活细胞分选（μFACS）、分支卷积神经网络（B-CNN）、遗传算法 | 分支卷积神经网络（B-CNN） | 序列数据和荧光图像 | GFP表达文库，具体数量未给出；细胞吞吐量7000个/秒 | NA | 酵母（毕赤酵母） | 合成启动子（P_AOX1核心区重新设计）及GFP报告基因表达电路 | 工业生物技术、医药 |
| 6 | 2026-05-17 |
De Novo Synthesis of Friedelin in Saccharomyces cerevisiae via Combination of Metabolic and Lipid Droplet Engineering
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00047
PMID:40373267
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研究论文 | 在酿酒酵母中通过代谢与脂滴工程联合策略实现弗里德林的全新合成 | 首次在酿酒酵母中构建弗里德林的全新生物合成途径，并结合脂滴工程技术极大提高产量至1500 mg/L | 仅进行了摇瓶发酵，尚未进行中试或大规模生产验证 | 开发高效、可持续的弗里德林微生物生产方法 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成生物学 | NA | 代谢工程、脂滴工程 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 弗里德林生物合成途径 | 医药 |
| 7 | 2026-05-17 |
Genetic Toggle Switch in Plants
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00777
PMID:40387045
|
研究论文 | 本文利用定量表征的植物遗传元件和计算机模型，设计并验证了一种在稳定转基因植物中功能可预测的遗传双稳态开关 | 首次在稳定遗传工程化植物中实现可预测的遗传双稳态开关，并通过计算模型指导元件选择和电路迭代优化，克服了植物生命周期长、环境影响大的挑战 | 未讨论该遗传开关在不同植物物种或环境条件下的通用性，且长期稳定性尚未验证 | 开发可编程、可预测的植物遗传电路，特别是双稳态开关，以推动植物合成生物学应用 | 植物遗传元件（如启动子、转录因子）及其组装成的双稳态开关电路 | 合成生物学 | NA | NA | 计算机模型（in silico model） | 定量功能数据 | 稳定转基因植物（具体数量未提及） | NA | 植物（具体种类未提及） | 双稳态开关（mutually inhibitory gene-regulatory device） | 农业、环境 |
| 8 | 2026-05-17 |
Synthetic Phosphorylation Networks with Fluorescence and Luminescence Expansion
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00814
PMID:40476587
|
研究论文 | 提出一种名为SPN-FLUX的合成磷酸化网络平台，集成分裂荧光素酶或发光蛋白，实现快速可调的细胞过程报告 | 首次实现完全翻译后水平的合成磷酸化网络，能够在1小时内响应胞外刺激，克服了传统转录介导报告过程无法快速实时监测的局限 | 目前仅基于哺乳动物细胞模型验证，可能在其他系统（如细菌或植物）中的效果未知；且局限于缺氧等少数环境刺激的检测 | 开发一种基于翻译后修饰的快速、可调控的合成受体平台，用于实时监测细胞信号事件 | 哺乳动物细胞（如HEK293细胞） | 合成生物学 | NA | 合成生物学、分裂荧光素酶/发光蛋白、配体诱导二聚化 | NA | 荧光/发光信号 | NA | NA | 哺乳动物细胞 | 合成磷酸化网络，包括膜结合受体（配体诱导二聚化激活）和组成型活性细胞内生物传感器 | 生物医学研究，环境监测 |
| 9 | 2026-05-17 |
Standardized Quorum Sensing Tools for Gram-Negative Bacteria
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00036
PMID:40476774
|
研究论文 | 开发了一套标准化的群体感应工具，用于革兰氏阴性菌的合成生物学应用 | 基于SEVA载体库构建标准化、可互换的群体感应收发模块，并提供数学模型和参数以支持工程设计 | NA | 为革兰氏阴性菌提供标准化的群体感应工具，实现可预测的多细胞功能工程 | 群体感应系统及其收发模块 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统的标准化构建与表征 | 数学模型 | NA | NA | SEVA载体库 | 革兰氏阴性菌 | 群体感应收发模块 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 10 | 2026-05-17 |
Robust Synthetic Biology Toolkit to Advance Carboxysome Study and Redesign
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00144
PMID:40488673
|
研究论文 | 设计和验证了pXpressome工具包，用于稳健表达和重新设计α-羧酶体 | 开发了pXpressome工具包，实现α-羧酶体的稳健表达、纯化后保持完整和功能，并通过基因缺失实验揭示蛋白质比例可理性影响形态 | 未提及，但可能涉及工具包在复杂环境或不同宿主中的适用性限制 | 促进羧酶体的研究和重新设计，以增强碳固定或作为纳米封装平台 | α-羧酶体及其组成蛋白（Rubisco、碳酸酐酶、顶点蛋白、面形成蛋白） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | pXpressome工具包，Gibson Assembly | 大肠杆菌（E. coli） | 羧酶体表达系统，包括荧光标记构建体 | 环境，工业生物技术 |
| 11 | 2026-05-16 |
The Japan-UK Synthetic Biology Conference, Spring 2025: Strengthening Global Links to Engineer Biology
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00232
PMID:40538270
|
评论 | 总结2025年春季日英合成生物学会议，探讨国际合作如何推动工程生物学发展 | 强调通过跨国合作促进合成生物学从研究向可持续生物经济转型的视角 | 未深入分析具体技术瓶颈，仅概述会议讨论的挑战与趋势 | 促进合成生物学领域的全球协作，推动生物基经济转型 | 合成生物学研究者及国际合作机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 能源, 材料, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-05-16 |
Engineered Biomolecular Condensates Limit Tobacco Mosaic Virus Accumulation and Symptom Development
2025-06, Molecular plant pathology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/mpp.70113
PMID:40544335
|
研究论文 | 本文通过工程化生物分子凝聚体限制烟草花叶病毒积累和症状发展 | 首次利用液-液相分离形成的工程化人工凝聚体作为靶向抗病毒策略，限制植物病毒积累 | NA | 开发工程化生物分子凝聚体以减轻植物病毒积累和疾病严重程度 | 烟草花叶病毒（TMV）和本氏烟草 | 合成生物学 | 植物病毒病 | 液-液相分离（LLPS） | NA | 生物分子数据 | NA | MS2噬菌体发夹、MS2外壳蛋白（MCP） | 本氏烟草 | 人工生物分子凝聚体（基于TDP-43的凝聚体） | 农业 |
| 13 | 2026-05-12 |
Understanding carboxysomes to enhance carbon fixation in crops
2025-06-30, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253072
PMID:40570186
|
综述 | 本文综述了羧酶体在提高农作物光合固碳效率方面的潜在应用及当前理解 | 系统总结羧酶体生物发生、Rubisco组织和外壳功能的最新进展，并提出将其与碳酸氢盐转运蛋白共同移植到叶绿体中以增强光合作用的新思路 | 仍存在关键问题未解决，如外壳精确作用机制尚不明确，以及需要识别合适的碳酸氢盐转运体和调控表达水平 | 探讨利用羧酶体和蓝藻CO2浓缩机制提高农作物光合效率的可行性与挑战 | 羧酶体、Rubisco、碳酸氢盐转运蛋白、农作物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 14 | 2026-04-29 |
Harnessing Transient Expression Systems with Plant Viral Vectors for the Production of Biopharmaceuticals in Nicotiana benthamiana
2025-Jun-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125510
PMID:40564973
|
综述 | 综述了利用植物病毒载体在本氏烟中瞬时表达系统生产生物制药的关键作用与最新进展 | 阐述了病毒载体修饰、水培法和受控环境农业等创新技术如何提升可扩展性和法规合规性，并通过糖基化工程拓宽可生产的生物制药范围 | 未明确讨论瞬时表达系统在工业生产中的长期稳定性或大规模生产成本控制的具体挑战 | 强调瞬时表达系统在生物制药生产、教育、合成生物学和基因编辑中的应用潜力，并推动植物分子农业成为现代生物技术的关键组成部分 | 本氏烟中的瞬时表达系统及植物病毒载体 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达 | NA | NA | NA | 病毒载体 | 本氏烟 | 植物病毒载体驱动的瞬时表达系统 | 医药, 生物技术 |
| 15 | 2026-04-28 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
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研究论文 | 利用合成生物学将Vibrio natriegens改造成能修复含复杂有机污染物的盐废水及土壤的菌株 | 通过插入tfoX基因增强DNA摄取和整合能力，并利用酵母组装五个降解基因簇（总长43 kb）转移至Vmax菌株，实现从单环到多环有机污染物（联苯、苯酚、萘、二苯并呋喃和甲苯）的广谱修复 | NA | 解决有机污染物复杂性及盐胁迫耐受受限的问题，开发海洋微生物在生物修复中的应用 | 复杂有机污染物（联苯、苯酚、萘、二苯并呋喃和甲苯）及盐废水/土壤样本 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 来自氯碱厂和炼油厂的工业废水样本 | 酵母组装 | Vibrio natriegens | 代谢途径（五个降解基因簇） | 环境 |
| 16 | 2026-04-22 |
Recent advance in macrolactams: Structure, bioactivity, and biosynthesis
2025-06-01, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108406
PMID:40184666
|
综述 | 本文系统综述了2004年至2023年间报道的105个大环内酰胺，涵盖其来源、结构、生物活性及17种已知生物合成途径，并深入分析了相关基因簇、关键酶机制及其在生物合成中的作用 | 首次系统讨论大环内酰胺家族的最新进展，特别关注结构-活性关系及偏离传统共线性规则的新生物合成途径 | NA | 为大环内酰胺的发现及其通过合成生物学方法的可持续生产提供参考 | 105种由微生物菌株产生的大环内酰胺，这些菌株分离自海洋沉积物、土壤、植物和动物等多样环境 | NA | NA | NA | NA | NA | 105种大环内酰胺 | NA | NA | NA | NA |
| 17 | 2026-04-16 |
Advances in synthetic microbial ecosystems approach for studying ecological interactions and their influencing factors
2025-Jun, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100205
PMID:41982405
|
综述 | 本文综述了合成微生物生态系统在生态相互作用及其影响因素研究方面的进展 | 系统整合了当前关于合成微生物生态系统的知识，并强调了其相较于自然生态系统的简化性和可控性优势 | NA | 增强对微生物群落相互作用的理解，特别是群落稳定性、关键物种识别和群落结构调控等生态学关键问题 | 合成微生物生态系统及其中的生态相互作用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 环境 |
| 18 | 2026-04-16 |
The Kongming defense: Host-pathogen battles take a new face
2025-Jun, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100209
PMID:41982408
|
评论 | 本文评论了Kongming细菌防御系统的新机制，该系统利用噬菌体衍生的酶合成dITP，通过消耗NAD+触发宿主免疫，揭示了宿主与病原体间持续的进化军备竞赛 | 首次揭示了Kongming防御系统利用噬菌体酶合成dITP并触发NAD+消耗的独特免疫机制，以及噬菌体相应进化出对抗策略 | NA | 探讨细菌免疫系统与噬菌体之间的进化相互作用机制 | 细菌防御系统（特别是Kongming系统）与噬菌体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 生物医学研究, 合成生物学 |
| 19 | 2026-03-18 |
Purification of post-transcriptionally modified tRNAs for enhanced cell-free translation systems
2025-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.658963
PMID:40661628
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研究论文 | 本文开发了一种结合tRNA过表达和DNA杂交纯化的方法，用于纯化具有天然转录后修饰的tRNA，以增强无细胞翻译系统的性能 | 提出了一种灵活的方法，能高产高纯地生成修饰tRNA，解决了RNA生物化学中长期存在的挑战，并首次提供了关键tRNA的完整修饰谱 | NA | 开发一种纯化方法，以生产保留天然转录后修饰的tRNA，用于改进无细胞翻译系统和遗传密码扩展 | tRNA（转移RNA），特别是来自大肠杆菌和酿酒酵母的tRNA，以及工程化tRNA变体 | 合成生物学 | NA | DNA杂交纯化、tRNA过表达、细胞无翻译反应 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 20 | 2026-02-17 |
Integrating chemical artificial intelligence and cognitive computing for predictive analysis of biological pathways: a case for intrinsically disordered proteins
2025-Jun, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-025-01286-x
PMID:40727659
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研究论文 | 本文探讨了将化学人工智能与认知计算相结合，用于生物通路预测分析，特别是针对内在无序蛋白的应用 | 提出通过化学人工智能整合生物分子相互作用到认知计算中，以模拟人类思维过程并增强决策，为蛋白质工程和药物发现等领域提供新方法 | 生物数据复杂性和规模大，整合生物过程与认知计算仍面临挑战 | 旨在连接认知计算与生物知识，以开发更精确的蛋白质相互作用、基因调控和代谢通路模型，促进个性化治疗和早期疾病检测 | 内在无序蛋白及其在大脑功能和信息处理中的关键作用 | 生物信息学 | NA | 机器学习、自然语言处理、语音识别 | 认知计算模型 | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、蛋白质工程、药物发现、合成生物学、非传统计算 |