合成生物学相关文章
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当前共找到 145 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-07-08 |
FoldMark: Safeguarding Protein Structure Generative Models with Distributional and Evolutionary Watermarking
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619960
PMID:39554012
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研究论文 | 本文介绍了FoldMark，一种基于分布和进化原理的水印策略，用于保护蛋白质生成模型 | 首次提出针对蛋白质生成模型的分布和进化水印策略，平衡水印容量和结构质量 | 未明确提及具体限制 | 开发一种保护AI驱动的蛋白质研究的安全措施 | 蛋白质生成模型 | 计算蛋白质科学 | NA | 水印技术 | AlphaFold3, ESMFold, RFDiffusion, RFDiffusionAA | 蛋白质结构数据 | 包括EGFP和CRISPR-Cas13在内的蛋白质设计案例 |
| 2 | 2025-07-06 |
Iterative deep learning design of human enhancers exploits condensed sequence grammar to achieve cell-type specificity
2025-Jun-04, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101302
PMID:40472848
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research paper | 该研究应用迭代深度学习设计具有特定细胞类型活性的合成增强子 | 利用迭代深度学习优化模型，设计出在两种人类细胞系中具有显著差异活性的合成增强子，并通过实验验证和模型再优化提高特异性 | 研究仅针对两种人类细胞系，可能无法推广到其他细胞类型 | 解决合成生物学中如何靶向特定细胞类型进行基因表达的问题 | 人类细胞系中的合成增强子 | synthetic biology | NA | deep learning, chromatin accessibility analysis | deep learning model | genomic sequence, chromatin accessibility data | two human cell lines |
| 3 | 2025-07-05 |
Revolutionizing lignin valorization: Key advances in demethylation, methylation, and methyl metabolism
2025-Jun-28, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108634
PMID:40588043
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综述 | 本文系统综述了木质素生物增值中的去甲基化、甲基化和甲基代谢过程，探讨了相关酶和机制，并提出了提高木质素转化效率的新策略 | 总结了微生物木质素增值的有前景的甲基循环途径，并强调了机器学习辅助酶工程、合成生物学和代谢工程等先进策略 | 未提及具体实验数据或案例研究的局限性 | 促进木质素的可持续增值，推动木质素基生物经济的发展 | 木质素及其衍生物 | 生物工程 | NA | 机器学习辅助酶工程、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
| 4 | 2025-07-05 |
Bridging BioSciences and technology: The impact of AI & GenAI in life sciences and agribusiness
2025-Jun-16, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149623
PMID:40516836
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综述 | 本文探讨了生成式人工智能（GenAI）在生命科学和农业业务中的多方面影响 | GenAI作为催化剂，加速药物发现、蛋白质折叠预测、基因组学研究、疾病诊断和生物标志物识别，同时在农业中优化作物育种和提高生产力 | 讨论了GenAI在生命科学和农业业务中的伦理问题，如数据隐私、算法偏见和利益公平分配 | 探讨GenAI在生命科学和农业业务中的应用及其影响 | 生命科学和农业业务中的GenAI应用 | 生命科学与农业技术 | NA | 生成式人工智能（GenAI） | NA | 基因组和生态信息数据集 | NA |
| 5 | 2025-07-04 |
Expanding salivary biomarker detection by creating a synthetic neuraminic acid sensor via chimeragenesis
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598939
PMID:38915506
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research paper | 该研究通过合成生物学技术开发了一种全细胞生物传感器，用于检测与口腔鳞状细胞癌相关的唾液生物标志物 | 利用合成生物学技术构建了一种新型嵌合转录因子（Sphnx），用于检测唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac） | 目前仅为概念验证，尚未应用于临床筛查 | 开发一种非侵入性早期诊断口腔鳞状细胞癌的生物传感器 | 唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸（Neu5Ac） | 合成生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 合成生物学技术 | 全细胞生物传感器（WCB） | 生物分子数据 | NA |
| 6 | 2025-07-04 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法改造Vibrio natriegens菌株，使其能够在含盐废水和土壤中生物修复复杂的有机污染物 | 利用合成生物学技术将tfoX基因插入Vibrio natriegens染色体并过表达，增强了DNA摄取和整合能力，构建了能够降解多种有机污染物的工程菌株 | 研究仅针对五种有机污染物进行了测试，未涉及其他可能的环境污染物 | 开发能够在高盐环境中生物修复复杂有机污染物的微生物技术 | 工业废水、石油污染和塑料污染中的有机污染物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因组工程 | NA | NA | 来自氯碱厂和石油精炼厂的工业废水样品 |
| 7 | 2025-07-03 |
Development and application of a highly specific whole-cell biosensor for supersulfide detection in environmental samples
2025-Jun-25, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117731
PMID:40592263
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研究论文 | 开发并应用了一种高特异性的全细胞生物传感器，用于环境样品中超硫化物的检测 | 首次报道了使用Agrobacterium tumefaciens的超硫化物感应抑制子BigR（AtBigR）构建的全细胞生物传感器，该系统对超硫化物具有极高的选择性 | NA | 开发一种能够准确检测超硫化物的生物传感器，以促进对超硫化物在生物学、环境和锂硫电池中作用的理解 | 超硫化物（如元素硫、无机多硫化物和有机多硫化物） | 合成生物学 | NA | 全细胞生物传感器技术 | AtBigR-WCB（基于AtBigR的全细胞生物传感器） | 环境样品（海洋沉积物、锂硫电池电解质） | 多种海底地形的海洋沉积物样品及锂硫电池电解质样品 |
| 8 | 2025-07-03 |
The Japan-UK Synthetic Biology Conference, Spring 2025: Strengthening Global Links to Engineer Biology
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00232
PMID:40538270
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评论 | 本文总结了2025年春季日本-英国合成生物学会议的内容，旨在促进合成生物学领域研究者之间的国际合作 | 强调国际合作在推动合成生物学发展和可持续生物经济转型中的重要性 | 未提供具体研究成果或实验数据，仅基于会议讨论的观点总结 | 促进合成生物学领域的国际合作与研究进展 | 合成生物学领域的国际合作与研究趋势 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9 | 2025-07-03 |
Advances in programmable DNA nanostructures enabling stimuli-responsive drug delivery and multimodal biosensing
2025-Jun-17, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00057b
PMID:40585578
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综述 | 本文综述了DNA纳米技术在精准医学中的应用，特别是在靶向药物递送和生物医学成像方面的最新进展 | 介绍了可编程DNA纳米结构在动态响应肿瘤微环境信号（如pH、酶活性、氧化还原梯度）以实现触发药物释放方面的创新应用 | 存在规模化制造瓶颈、免疫兼容性优化以及长期纳米毒性严格评估等关键转化挑战 | 探讨DNA纳米技术在精准医学中的应用，特别是在靶向药物递送和生物医学成像方面的潜力 | DNA工程纳米结构，包括基于瓦片的组装、折纸框架、球形核酸和刺激响应水凝胶 | 合成生物学 | 癌症 | 荧光共振能量转移（FRET）探针、电化学发光放大电路、SERS底物和细胞可变区传感技术 | NA | NA | NA |
| 10 | 2025-07-03 |
Structural insights and rational engineering strategies for modular polyketide synthases: A review
2025-Jun-16, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145299
PMID:40533022
|
综述 | 本文综述了模块化聚酮合酶（PKSs）的结构见解和理性工程策略，特别关注顺式酰基转移酶（AT）PKSs的设计和改造 | 系统总结了顺式AT PKSs的多维设计策略，包括模块化构建块的选择和基于结构及机制见解的催化域设计 | 未提及具体的实验验证数据或案例研究 | 探索顺式AT PKSs的理性设计策略，以增强产物产量并扩展可获得的聚酮化合物种类 | 顺式酰基转移酶（AT）聚酮合酶（PKSs） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 11 | 2025-07-03 |
Engineering artificial microbial consortia for personalized gut microbiome modulation and disease treatment
2025-Jun, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15352
PMID:40320966
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review | 本文提出了一种通过工程化人工微生物群落来个性化调节肠道微生物组并治疗疾病的新方法 | 整合合成生物学、系统生物学和先进培养技术，设计定制化的微生物群落以执行特定功能 | 需要进一步的临床试验来评估其安全性、有效性和长期影响 | 通过精确操控肠道微生物组来治疗代谢紊乱、炎症和胃肠道感染等疾病 | 人工微生物群落及其在肠道中的功能 | 合成生物学 | 代谢紊乱、炎症、胃肠道感染 | 合成生物学、系统生物学、先进培养技术 | NA | NA | NA |
| 12 | 2025-07-03 |
Design Principles Of Inorganic-Protein Hybrid Materials for Biomedicine
2025-Jun, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240182
PMID:40585774
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综述 | 本文综述了无机-蛋白质杂化材料（IPHMs）的结构基础和设计原则，并探讨了其在生物医学领域的潜在应用 | 提出了基于生物活性单元合成具有高度生物安全性的IPHMs的新材料设计与合成方法，并探讨了原位杂化材料合成的思路 | 未提及具体的实验验证或实际应用案例 | 探讨无机-蛋白质杂化材料的设计原则及其在生物医学领域的应用 | 无机-蛋白质杂化材料（IPHMs） | 材料科学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA |
| 13 | 2025-07-02 |
Understanding carboxysomes to enhance carbon fixation in crops
2025-Jun-30, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253072
PMID:40570186
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research paper | 探讨羧酶体在提高作物碳固定效率中的作用及其在合成生物学中的应用 | 研究羧酶体的模块化自组装特性及其在植物叶绿体中的移植潜力，以提高光合作用效率 | 对羧酶体外壳的精确机械作用机制尚不明确，且需要找到合适的碳酸氢盐转运体并优化表达水平 | 提高作物光合作用效率，增强碳固定能力 | 羧酶体及其在作物中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 14 | 2025-07-02 |
Advancements in DNA-Driven Precision Modulation of Cell Surface Receptor for Programmable Cellular Functions
2025-Jun-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505073
PMID:40588818
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综述 | 本文全面总结了基于DNA的策略在受体工程中的最新进展，包括遗传和非遗传方法 | 整合遗传和非遗传DNA工程策略，推动下一代智能细胞系统的发展 | NA | 理解细胞通讯并开发靶向治疗 | 细胞表面受体 | 合成生物学与DNA纳米技术 | NA | DNA origami, 功能性核酸(FNAs), DNA逻辑电路, DNA纳米机器人 | NA | NA | NA |
| 15 | 2025-07-02 |
Modular RNAi Pathway Engineering Enhances Plasmid Copy Number Control in Yeast Bioproduction System
2025-Jun-29, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70014
PMID:40583249
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研究论文 | 本研究通过重建酵母中的正交RNA干扰系统，开发了一种可动态调控质粒拷贝数的合成生物学底盘，显著提高了类胡萝卜素生物合成途径的产量 | 整合异源RNAi通路基因并设计靶向质粒选择标记的siRNAs，实现了化学诱导的质粒拷贝数动态调控，最高可扩增7.13倍 | 研究仅针对酿酒酵母系统，未在其他微生物宿主中验证通用性 | 开发动态调控质粒拷贝数的合成生物学工具以优化微生物细胞工厂的代谢通量 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）及其质粒系统 | 合成生物学 | NA | RNA干扰（RNAi）、siRNA设计 | NA | 分子生物学实验数据 | NA |
| 16 | 2025-07-02 |
Edible and Medicinal Fungi as Candidate Natural Antidepressants: Mechanisms and Nutritional Implications
2025-Jun, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70080
PMID:40289452
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综述 | 本文系统综述了食用药用真菌（EMFs）作为天然抗抑郁剂的潜力，重点关注其生物活性化合物和作用机制 | 探讨了EMFs通过调节神经递质系统、色氨酸-犬尿氨酸通路、HPA轴及神经炎症等多途径发挥抗抑郁作用，并涉及肠道-脑轴机制及3D食品打印、合成生物学等创新技术应用 | 存在标准化不足和缺乏临床验证的挑战 | 评估食用药用真菌的抗抑郁潜力及其营养学意义 | 食用药用真菌（如灵芝、猴头菇、茯苓、蛹虫草）及其生物活性成分 | 营养学与神经科学交叉领域 | 抑郁症 | 3D食品打印、合成生物学、人工智能建模 | NA | 文献数据与临床前研究数据 | NA（系统综述未报告具体样本量） |
| 17 | 2025-07-01 |
Multiactivity of Nanozyme Liposome Regulates the Homeostasis of Biochemical Microenvironment
2025-Jun-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202501918
PMID:40545445
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研究论文 | 本文开发了一种具有多酶活性的仿生脂质体，用于调节外源性植入物诱导的促炎因子 | 通过自组装人工膜在CeO纳米颗粒上构建具有多酶活性的仿生脂质体，模拟内皮细胞膜功能，调节生化微环境稳态 | 未提及具体临床前或临床试验数据，实际应用效果尚待验证 | 开发用于组织工程的合成生物学治疗脂质体，调节移植重塑过程中的生化微环境 | 仿生脂质体及其在调节促炎因子和血小板聚集中的作用 | 合成生物学 | NA | 纳米酶技术、脂质体自组装技术 | NA | 实验数据 | NA |
| 18 | 2025-07-01 |
Switchable RNA motifs for dynamic transcriptional control of RNA condensates
2025-Jun-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf497
PMID:40539511
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研究论文 | 本文探讨了通过RNA驱动的相分离工程化生物分子凝聚物的动态控制方法 | 利用可切换的RNA基序动态控制RNA凝聚物的形成与溶解，并展示了通过'入侵者'和'抗入侵者'RNA链实现可逆调控 | 实验仅在体外一锅反应中进行，尚未验证在复杂生物环境中的适用性 | 开发可调控的RNA自组装系统用于合成生物学应用 | 星形RNA基序（纳米星）及其与调控RNA分子的相互作用 | 合成生物学 | NA | 体外转录，DNA模板指导的RNA合成 | NA | 分子相互作用数据 | NA |
| 19 | 2025-07-01 |
Plant Microbiomes Alleviate Abiotic Stress-Associated Damage in Crops and Enhance Climate-Resilient Agriculture
2025-Jun-19, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14121890
PMID:40573878
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研究论文 | 本文探讨了植物微生物组在缓解非生物胁迫对作物损害中的作用，并讨论了微生物组工程策略的进展 | 提出了利用微生物组工程策略（如合成生物学、微生物群落设计、宏基因组学和CRISPR-Cas）来增强农业实践中的实际应用 | 将实验室发现转化为实际农业效益仍面临植物-微生物相互作用复杂性的挑战 | 研究植物微生物组如何缓解非生物胁迫并增强气候适应性农业 | 植物微生物组（包括细菌、真菌、古菌和微藻等微生物） | 农业生物技术 | NA | 合成生物学、微生物群落设计、宏基因组学、CRISPR-Cas | NA | NA | NA |
| 20 | 2025-06-30 |
Unraveling Nature's Pharmacy: Transforming Medicinal Plants into Modern Therapeutic Agents
2025-Jun-07, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics17060754
PMID:40574066
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综述 | 本文探讨了天然产物在药物发现和开发中的潜力，强调了传统知识与现代药物发现技术的结合 | 结合传统知识与现代技术，如基因工程、代谢工程和合成生物学，推动天然产物药物发现的研究 | 天然产物药物发现仍面临诸多问题和固有挑战 | 探索天然产物在药物发现和开发中的应用 | 天然产物，特别是药用植物 | 药物发现 | NA | 基因工程、代谢工程、植物细胞培养、合成生物学、组学技术和计算方法 | NA | NA | NA |