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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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1 | 2025-08-06 |
Purification of post-transcriptionally modified tRNAs for enhanced cell-free translation systems
2025-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.658963
PMID:40661628
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研究论文 | 本文开发了一种纯化方法,用于生产具有天然转录后修饰的tRNA,以提高无细胞翻译系统的效率和保真度 | 开发了一种结合tRNA过表达和DNA杂交纯化的新方法,能够高产高纯度地生产具有天然转录后修饰的tRNA | NA | 解决传统转录方法生产的tRNA缺乏关键转录后修饰的问题,提高翻译产量和保真度 | tRNA及其转录后修饰 | RNA生物化学 | NA | DNA杂交纯化 | NA | NA | NA |
2 | 2025-08-05 |
Unlocking hidden bioactive compounds: from indolocarbazole and RiPP biosynthesis to the activation of cryptic secondary metabolism via microbial interactions
2025-06, The Journal of antibiotics
IF:2.1Q3
DOI:10.1038/s41429-025-00828-5
PMID:40379949
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综述 | 本文综述了放线菌次级代谢的三个方面:吲哚咔唑的生物合成、RiPPs的生物合成以及通过微生物相互作用激活次级代谢 | 强调了微生物相互作用在天然产物生物合成中的重要性,并为通过合成生物学和微生物生态学进行药物发现提供了新方向 | NA | 探索放线菌次级代谢的生物合成途径及其在药物发现中的应用 | 放线菌,特别是链霉菌,及其次级代谢产物 | 微生物学与合成生物学 | NA | 细胞游离一锅合成平台、联合培养策略 | NA | NA | NA |
3 | 2025-08-03 |
Understanding carboxysomes to enhance carbon fixation in crops
2025-Jun-30, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253072
PMID:40570186
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research paper | 探讨羧酶体在增强作物碳固定中的作用及其在合成生物学中的应用 | 深入理解羧酶体的生物发生、Rubisco的组织及外壳功能,并探讨其在植物叶绿体中的功能整合 | 外壳的精确机械作用尚未完全阐明,且需要找到合适的碳酸氢盐转运体并优化表达水平 | 提高作物的光合效率 | 羧酶体及碳酸氢盐转运体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
4 | 2025-08-03 |
Armed Phages: A New Weapon in the Battle Against Antimicrobial Resistance
2025-Jun-27, Viruses
DOI:10.3390/v17070911
PMID:40733529
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综述 | 本文探讨了噬菌体疗法在对抗多重耐药细菌感染中的潜力,并重点介绍了通过合成生物学手段增强噬菌体效力的新策略 | 提出了'武装噬菌体'概念,通过基因工程改造噬菌体以规避细菌免疫系统,并整合抗菌肽、CRISPR基因编辑工具等增强功能 | 目前临床数据仍有限,仅有两个工程化噬菌体进入临床试验阶段 | 探索应对抗生素耐药性危机的创新治疗方案 | 多重耐药细菌及其防御系统 | 合成生物学 | 细菌感染 | 噬菌体生物工程、CRISPR基因编辑 | NA | NA | 提及SNIPR001的I期临床试验(健康志愿者)和LBP-EC01的II期临床试验(耐药性尿路感染患者) |
5 | 2025-08-03 |
Advances in engineered models of peri-gastrulation
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112659
PMID:40510116
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review | 本文讨论了利用干细胞技术和工程工具构建的围原肠胚形成模型,以研究人类早期发育中的细胞分化和组织形成 | 整合了工程技术和合成生物学工具,提高了模型的精确度,为人类早期发育研究提供了新视角 | 未提及具体实验数据或样本量的限制 | 研究人类早期发育中的细胞谱系特化和形态发生事件 | 围原肠胚形成阶段的干细胞模型 | 合成生物学 | NA | 干细胞技术、微流控系统、合成生物学工具 | blastoids、2D micropatterned systems、3D gastruloid constructs、somitoids | NA | NA |
6 | 2025-07-30 |
Integrating chemical artificial intelligence and cognitive computing for predictive analysis of biological pathways: a case for intrinsically disordered proteins
2025-Jun, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-025-01286-x
PMID:40727659
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research paper | 探讨将化学人工智能与认知计算结合用于生物通路预测分析,特别是针对内在无序蛋白 | 提出将化学人工智能与认知计算结合,用于更精确的蛋白质相互作用、基因调控和代谢通路建模,以及神经形态芯片的开发 | 生物数据的复杂性和规模给整合带来挑战 | 通过整合生物分子交互与认知计算,推动蛋白质工程、药物发现、生物信息学等领域的发展 | 内在无序蛋白(IDPs)及其在大脑功能和信息处理中的作用 | 生物信息学 | NA | 化学人工智能、认知计算、机器学习、自然语言处理 | NA | 生物分子数据 | NA |
7 | 2025-07-29 |
Exploring pigment-producing Streptomyces as an alternative source to synthetic pigments: diversity, biosynthesis, and biotechnological applications. A review
2025-Jun-25, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04379-7
PMID:40555885
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综述 | 探讨产色素链霉菌作为合成色素替代来源的多样性、生物合成及生物技术应用 | 综述了CRISPR/Cas基因编辑技术在激活沉默生物合成基因簇以提高色素产量方面的最新进展 | 毒性评估、工业条件下色素稳定性、未探索链霉菌菌株的高通量筛选以及AI预测工具在途径优化中的整合等方面存在研究空白 | 寻找天然、环保的色素替代品以解决合成色素带来的健康和环保问题 | 产色素的链霉菌 | 生物技术 | NA | CRISPR/Cas基因编辑 | NA | NA | NA |
8 | 2025-07-25 |
Innovation in Swine Nutrition in China over the Past Decade
2025-Jun-24, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.06.009
PMID:40571101
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综述 | 本文回顾了过去十年中国在猪营养学领域的创新,探讨了猪饲料行业的现代化、营养需求分析、质量控制策略及可持续发展计划 | 系统总结了应对猪产业重大挑战的针对性策略,如精准饲喂、循环农业中的废物回收、霉菌毒素降解及抗生素替代方案,并展望了合成生物学、人工智能等现代技术在猪营养学中的应用前景 | 未提及具体实施这些策略的案例研究或数据支持 | 优化猪营养学,提高饲料效率、动物福利及可持续实践,以应对粮食安全和环境挑战 | 中国猪饲料行业及猪营养学实践 | 畜牧营养学 | NA | 合成生物学、人工智能、分子技术 | NA | NA | NA |
9 | 2025-07-19 |
Biodegradation of Neonicotinoid Insecticides Thiacloprid and Thiamethoxam by Microorganisms: Metabolic Process, Metabolic Enzymes and Toxicity Assessments of their Metabolites
2025-Jun-25, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04326-7
PMID:40555881
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综述 | 本文全面探讨了微生物降解新烟碱类杀虫剂噻虫啉和噻虫嗪的代谢途径、关键酶及其代谢产物的生态毒理学效应 | 重点分析了微生物群落通过互补代谢途径协同提升降解效率的潜力,并提倡整合多组学技术、计算生物学、合成生物学和代谢工程以推进微生物生物降解策略 | 对噻虫啉和噻虫嗪的降解机制理解仍不充分 | 研究微生物降解新烟碱类杀虫剂的代谢过程及其生态毒理学影响 | 噻虫啉(THI)和噻虫嗪(THIA)及其代谢产物 | 环境微生物学 | NA | 多组学技术、计算生物学、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
10 | 2025-07-17 |
Light-orchestrated multi-step solid-phase picodroplet reactors
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.23.660884
PMID:40666841
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研究论文 | 介绍了一种光控固相皮升液滴反应器,用于实现复杂的多步生化反应 | 利用光电子镊子操控单个皮升液滴和微珠,实现了八步点击化学为基础的DNA连接合成循环,并实时原位荧光检测反应产物 | 当前皮升液滴微流控技术缺乏试剂交换和洗涤能力,无法执行多步过程 | 开发一种能够执行复杂多步生化反应的皮升液滴反应器平台 | 皮升液滴反应器和微珠 | 合成生物学 | NA | 光电子镊子、荧光检测 | NA | 荧光信号 | NA |
11 | 2025-07-17 |
Pepper RNA variants reveal decoupling of HBC530 binding thermodynamics and fluorescence activation
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660466
PMID:40667133
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研究论文 | 本文通过生成Pepper RNA变体库,定量评估了单个核苷酸对HBC530结合亲和力、镁结合亲和力和荧光强度的贡献,揭示了配体识别与荧光强度之间的解耦现象 | 发现了HBC530结合亲和力与荧光强度之间的相关性较弱,并识别出多个结合亲和力与野生型Pepper相似但荧光强度显著降低的变体 | 研究仅针对Pepper RNA变体,未扩展到其他荧光RNA适体 | 探究荧光RNA适体的配体识别和荧光激活机制,为下一代荧光RNA适体的理性设计提供框架 | Pepper RNA变体及其与HBC530和镁离子的相互作用 | 合成生物学 | NA | RNA变体库生成与定量评估 | NA | RNA序列与荧光强度数据 | 53个Pepper变体 |
12 | 2025-07-17 |
Temporal gene regulation enables controlled expression of gas vesicles and preserves bacterial viability
2025-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660610
PMID:40667317
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研究论文 | 本文报道了一种双诱导转录调控系统,用于控制气体囊泡(GVs)的时序表达,以保持细菌的活力 | 开发了一种双诱导转录调控系统,通过时序控制GV组装因子和外壳蛋白的表达,解决了GV异源表达导致的细胞生长受损问题 | 研究仅针对特定细菌宿主,未验证在其他宿主中的适用性 | 优化气体囊泡(GVs)在非原生宿主中的表达,以促进其在生物医学工程和合成生物学中的应用 | 气体囊泡(GVs)及其在细菌中的表达 | 合成生物学 | NA | 双诱导转录调控系统 | NA | NA | NA |
13 | 2025-07-15 |
Reprogramming Hairy Root Cultures: A Synthetic Biology Framework for Precision Metabolite Biosynthesis
2025-Jun-23, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14131928
PMID:40647937
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综述 | 本文综述了毛状根培养在可持续生产植物源化合物中的应用及其在遗传和代谢工程中的潜力 | 整合了毛状根系统与转录组学和CRISPR技术等先进基因组工具,以加速途径特异性代谢工程 | 大规模生产优化、生物反应器效率提升以及不同植物物种间代谢物合成增强仍面临挑战 | 探讨毛状根培养在可持续生产高价值植物源化合物中的应用及其潜力 | 毛状根培养及其在遗传和代谢工程中的应用 | 合成生物学 | NA | 转录组学, CRISPR技术 | NA | NA | NA |
14 | 2025-07-15 |
Reviving the Dire Wolf? A Case Study in Welfare Ethics, Legal Gaps, and Ontological Ambiguity
2025-Jun-21, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15131839
PMID:40646738
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research paper | 本文探讨了通过基因编辑和克隆技术复活已灭绝的恐狼所带来的伦理、法律和本体论问题 | 首次将五领域模型应用于评估基因工程动物的福利风险,并从多种伦理角度分析功能灭绝复活的道德合理性 | 研究主要基于理论分析,缺乏实际动物行为数据和长期观察结果 | 评估基因复活灭绝物种项目的伦理、法律和动物福利影响 | 基因编辑创造的恐狼样犬科动物、代孕母狼及可能受影响的生态系统 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑和克隆技术 | 五领域模型 | 理论分析 | 3只基因改造动物 |
15 | 2025-07-15 |
Unveiling the Diversity of Culturable Microbes from the Underexplored Mingyong Glacier Landscape: A Roadmap for Leveraging the Potential of Actinomycetota
2025-Jun, Indian journal of microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s12088-025-01449-0
PMID:40655354
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研究论文 | 本研究从明永冰川景观中分离并鉴定了土壤中的放线菌,揭示了其多样性和生物技术潜力 | 首次从明永冰川景观中分离出多样化的放线菌,并探讨其在药物发现中的潜在应用 | 研究仅基于73株放线菌的分离和鉴定,样本量较小 | 探索极端环境中的微生物多样性,以发现新型生物活性化合物 | 明永冰川景观中的土壤放线菌 | 微生物学 | NA | 16S rRNA基因序列分析 | NA | 微生物分离物 | 6个土壤样本,分离出73株放线菌 |
16 | 2025-07-12 |
Multiactivity of Nanozyme Liposome Regulates the Homeostasis of Biochemical Microenvironment
2025-Jun-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202501918
PMID:40545445
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研究论文 | 本文开发了一种具有多酶活性的仿生脂质体,用于调节外源性植入物诱导的促炎因子 | 开发了一种具有多酶活性的仿生脂质体,能够模拟天然细胞功能,调节生化微环境的稳态 | 未提及具体的临床应用效果或长期稳定性数据 | 设计并构建能够调节生化微环境稳态的治疗性脂质体,以促进组织再生 | 仿生脂质体及其在调节生化微环境中的应用 | 合成生物学与组织工程 | NA | 自组装技术、纳米酶活性调控 | NA | NA | NA |
17 | 2025-07-08 |
FoldMark: Safeguarding Protein Structure Generative Models with Distributional and Evolutionary Watermarking
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619960
PMID:39554012
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研究论文 | 本文介绍了FoldMark,一种基于分布和进化原理的水印策略,用于保护蛋白质生成模型 | 首次提出针对蛋白质生成模型的分布和进化水印策略,平衡水印容量和结构质量 | 未明确提及具体限制 | 开发一种保护AI驱动的蛋白质研究的安全措施 | 蛋白质生成模型 | 计算蛋白质科学 | NA | 水印技术 | AlphaFold3, ESMFold, RFDiffusion, RFDiffusionAA | 蛋白质结构数据 | 包括EGFP和CRISPR-Cas13在内的蛋白质设计案例 |
18 | 2025-07-05 |
Bridging BioSciences and technology: The impact of AI & GenAI in life sciences and agribusiness
2025-Jun-16, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149623
PMID:40516836
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综述 | 本文探讨了生成式人工智能(GenAI)在生命科学和农业业务中的多方面影响 | GenAI作为催化剂,加速药物发现、蛋白质折叠预测、基因组学研究、疾病诊断和生物标志物识别,同时在农业中优化作物育种和提高生产力 | 讨论了GenAI在生命科学和农业业务中的伦理问题,如数据隐私、算法偏见和利益公平分配 | 探讨GenAI在生命科学和农业业务中的应用及其影响 | 生命科学和农业业务中的GenAI应用 | 生命科学与农业技术 | NA | 生成式人工智能(GenAI) | NA | 基因组和生态信息数据集 | NA |
19 | 2025-07-04 |
Expanding salivary biomarker detection by creating a synthetic neuraminic acid sensor via chimeragenesis
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598939
PMID:38915506
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research paper | 该研究通过合成生物学技术开发了一种全细胞生物传感器,用于检测与口腔鳞状细胞癌相关的唾液生物标志物 | 利用合成生物学技术构建了一种新型嵌合转录因子(Sphnx),用于检测唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸(Neu5Ac) | 目前仅为概念验证,尚未应用于临床筛查 | 开发一种非侵入性早期诊断口腔鳞状细胞癌的生物传感器 | 唾液中的N-乙酰-D-神经氨酸(Neu5Ac) | 合成生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 合成生物学技术 | 全细胞生物传感器(WCB) | 生物分子数据 | NA |
20 | 2025-07-04 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法改造Vibrio natriegens菌株,使其能够在含盐废水和土壤中生物修复复杂的有机污染物 | 利用合成生物学技术将tfoX基因插入Vibrio natriegens染色体并过表达,增强了DNA摄取和整合能力,构建了能够降解多种有机污染物的工程菌株 | 研究仅针对五种有机污染物进行了测试,未涉及其他可能的环境污染物 | 开发能够在高盐环境中生物修复复杂有机污染物的微生物技术 | 工业废水、石油污染和塑料污染中的有机污染物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因组工程 | NA | NA | 来自氯碱厂和石油精炼厂的工业废水样品 |