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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-05 |
A roadmap to understanding and anticipating microbial gene transfer in soil communities
2025-Jun-25, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00225-24
PMID:40197024
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综述 | 提出理解土壤微生物群落中基因转移过程的路线图,以评估合成生物学技术应用时的生物安全风险 | 首次系统阐述土壤微生物基因转移的知识缺口,提出建立土壤标准体系和利用新兴技术测量基因转移宿主范围的新策略 | 目前无法预测土壤中基因转移频率,土壤复杂异质性增加了评估难度 | 提高对土壤微生物群落基因转移过程的理解,设计更安全的生物技术 | 土壤微生物群落和工程微生物 | 合成生物学 | NA | 基因转移测量技术 | 群落尺度环境特异性模型 | NA | 多种土壤类型 | 合成DNA | 环境微生物 | 生物防护措施 | 环境, 农业, 能源 |
| 22 | 2025-10-05 |
FoldMark: Safeguarding Protein Structure Generative Models with Distributional and Evolutionary Watermarking
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619960
PMID:39554012
|
研究论文 | 提出一种名为FoldMark的蛋白质结构生成模型水印策略,用于保护AI驱动的蛋白质研究安全 | 首个利用分布和进化原理的蛋白质生成模型水印策略,平衡水印容量和结构质量 | NA | 开发蛋白质生成模型的安全保护方法,防止恶意使用 | 蛋白质结构生成模型 | 计算生物学 | NA | 分布和进化水印技术 | AlphaFold3, ESMFold, RFDiffusion, RFDiffusionAA | 蛋白质结构数据 | NA | CRISPR-Cas13 | NA | NA | 生物安全, 药物发现, 合成生物学 |
| 23 | 2025-10-05 |
Bridging BioSciences and technology: The impact of AI & GenAI in life sciences and agribusiness
2025-Jun-16, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149623
PMID:40516836
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综述 | 探讨生成式人工智能在生命科学和农业综合企业中的多层面影响 | 系统阐述生成式AI在药物发现、蛋白质结构预测、作物育种及合成生物学等前沿领域的创新应用 | 未具体说明数据隐私、算法偏见和利益公平分配等伦理问题的解决方案 | 分析生成式AI与生物科学交叉融合的技术影响与发展前景 | 生成式人工智能技术在生命科学和农业领域的应用场景 | 机器学习 | NA | 生成式人工智能 | 大型语言模型(LLM) | 基因组数据、生态数据、分子数据 | NA | NA | NA | NA | 医药, 农业, 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 24 | 2025-10-05 |
Expanding salivary biomarker detection by creating a synthetic neuraminic acid sensor via chimeragenesis
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.13.598939
PMID:38915506
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研究论文 | 本研究通过合成生物学技术开发了一种用于检测口腔鳞状细胞癌唾液生物标志物的全细胞生物传感器 | 创建了新型嵌合转录因子Sphnx用于检测N-乙酰-D-神经氨酸(Neu5Ac),拓展了唾液生物标志物检测能力 | 目前仅为概念验证阶段,尚未应用于临床筛查 | 开发能够早期无创诊断口腔鳞状细胞癌的生物传感器 | N-乙酰-D-神经氨酸(Neu5Ac)唾液生物分子 | 合成生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 合成生物学技术、嵌合转录因子工程 | 全细胞生物传感器(WCB) | 生物分子检测数据 | NA | 嵌合转录因子工程 | 工程细菌 | 可溶性分子检测后触发可观察效应子表达的生物传感器电路 | 医学 |
| 25 | 2025-10-05 |
Bioremediation of complex organic pollutants by engineered Vibrio natriegens
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08947-7
PMID:40335686
|
研究论文 | 本研究利用合成生物学技术改造Vibrio natriegens,使其能够在含盐废水和土壤中生物修复复杂有机污染物 | 开发了基于tfoX扩增效应的迭代自然转化基因组工程方法,成功将五个降解基因簇(总43kb)转入V natriegens菌株Vmax | NA | 开发能够耐受盐胁迫并降解复杂有机污染物的工程微生物 | 工程化改造的Vibrio natriegens菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因组工程、化学合成 | NA | NA | NA | 合成生物学方法 | Vibrio natriegens, 酵母 | 插入tfoX主调控基因增强DNA摄取和整合能力,构建五个有机污染物降解基因簇 | 环境 |
| 26 | 2025-10-05 |
The Japan-UK Synthetic Biology Conference, Spring 2025: Strengthening Global Links to Engineer Biology
2025-Jun-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00232
PMID:40538270
|
观点文章 | 总结2025年春季日本-英国合成生物学会议的核心内容,旨在加强两国在合成生物学领域的国际合作 | 通过国际会议促进合成生物学领域的全球合作网络建设,强调专业知识、国家基础设施和资金协调的共享机制 | 仅基于会议讨论内容进行分析,缺乏具体研究数据和实证支持 | 促进日本与英国在合成生物学领域的国际合作与知识交流 | 合成生物学研究社区和国际合作机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | 会议讨论内容 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境, 能源 |
| 27 | 2025-10-05 |
Engineering artificial microbial consortia for personalized gut microbiome modulation and disease treatment
2025-Jun, Annals of the New York Academy of Sciences
IF:4.1Q1
DOI:10.1111/nyas.15352
PMID:40320966
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综述 | 提出通过工程化人工微生物群落实现个性化肠道微生物组调控和疾病治疗的新方法 | 整合合成生物学、系统生物学和先进培养技术,设计具有特定功能的人工微生物群落 | 需要开展严格的临床试验评估安全性和长期影响 | 通过精确调控肠道微生物组治疗疾病 | 人工微生物群落和肠道微生物组 | 合成生物学 | 代谢紊乱、炎症性疾病、胃肠道感染 | 合成生物学、系统生物学、先进培养技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物群落 | 具有治疗分子生产、免疫调节和病原菌竞争等功能的工程化群落 | 医学 |
| 28 | 2025-10-05 |
Design Principles Of Inorganic-Protein Hybrid Materials for Biomedicine
2025-Jun, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240182
PMID:40585774
|
综述 | 本文系统综述了无机-蛋白质杂化材料在生物医学领域的设计原理、结构基础及应用前景 | 提出原位杂化材料合成新思路,从合成生物学角度分析杂化材料反应体系构建策略 | NA | 探讨无机-蛋白质杂化材料的设计原理及其在生物医学领域的应用 | 无机-蛋白质杂化材料(IPHMs) | 材料科学 | NA | 生物医学光学成像、多模式治疗 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |
| 29 | 2025-10-05 |
Switchable RNA motifs for dynamic transcriptional control of RNA condensates
2025-Jun-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf497
PMID:40539511
|
研究论文 | 本研究开发了可通过RNA入侵链动态调控的RNA凝聚体系统 | 首次实现了通过RNA入侵链和反入侵链对星形RNA基序形成的凝聚体进行可逆调控 | 目前仅在体外实验中验证了系统功能,尚未在活细胞环境中测试 | 开发可动态调控的RNA相分离系统 | 星形RNA基序(纳米星)形成的生物分子凝聚体 | 合成生物学 | NA | 体外转录 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 基于RNA入侵链和反入侵链的可逆调控开关 | 合成生物学, 生物材料 |
| 30 | 2025-10-05 |
Plant Microbiomes Alleviate Abiotic Stress-Associated Damage in Crops and Enhance Climate-Resilient Agriculture
2025-Jun-19, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14121890
PMID:40573878
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综述 | 探讨植物微生物组在缓解非生物胁迫中的作用及其在气候智慧农业中的应用前景 | 系统阐述微生物组工程策略(合成生物学、微生物群落设计等)在增强农业气候韧性的创新应用 | 实验室研究成果向田间实际应用的转化仍面临植物-微生物互作复杂性的挑战 | 研究植物微生物组如何增强作物对非生物胁迫的抵抗能力并推动可持续农业发展 | 植物微生物组(细菌、真菌、古菌、微藻等)及其与作物的互作关系 | 农业生物技术 | NA | 宏基因组学, CRISPR-Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, 合成生物学工具 | 作物相关微生物 | 微生物群落设计 | 农业 |
| 31 | 2025-10-05 |
Unraveling Nature's Pharmacy: Transforming Medicinal Plants into Modern Therapeutic Agents
2025-Jun-07, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics17060754
PMID:40574066
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综述 | 探讨天然产物在药物发现中的潜力,重点介绍传统知识与现代药物开发技术的结合 | 强调传统知识与现代药物发现技术的融合,并重点介绍基因工程、代谢工程、合成生物学等前沿技术在天然产物药物开发中的应用 | 天然产物药物发现仍存在若干问题和固有挑战需要克服 | 探索天然产物在药物发现和开发过程中的潜力 | 天然产物和药用植物 | NA | NA | 基因工程, 代谢工程, 植物细胞培养, 合成生物学, 组学技术, 计算方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 32 | 2025-10-05 |
Protein engineering strategies to optimise recombinant product synthesis and accumulation in Nicotiana benthamiana
2025-Jun-27, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70232
PMID:40577356
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综述 | 本文讨论了通过蛋白质工程和亚细胞工程策略优化本氏烟草中重组产物合成与积累的方法 | 提出三种创新策略:信号序列引导的蛋白质靶向与工程化亚细胞环境结合、多功能融合伴侣的应用、异源酶共表达实现正交翻译后修饰 | NA | 优化本氏烟草中重组蛋白质、多肽和小分子的生产与积累 | 本氏烟草中的重组产物(蛋白质、多肽、小分子) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、亚细胞工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Nicotiana benthamiana(本氏烟草) | 信号序列融合、合成细胞器、异源酶共表达途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 33 | 2025-10-05 |
Development and flight-testing of modular autonomous cultivation systems for biological plastics upcycling aboard the ISS
2025-Jun-25, NPJ microgravity
IF:4.4Q1
DOI:10.1038/s41526-025-00463-2
PMID:40562752
|
研究论文 | 开发并测试用于国际空间站塑料生物升级回收的模块化自主培养系统 | 开发了具有全程序化连续传代和样品保存功能的自主载荷系统MOBP,并在国际空间站进行了首次塑料生物升级回收飞行测试 | NA | 实现空间环境中微生物的自主培养和塑料废弃物的生物升级回收 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)塑料的生物酶解和微生物转化 | 合成生物学 | NA | 微生物培养、酶催化、生物转化 | NA | 传感器监测数据、生物样品 | NA | NA | 微生物 | NA | 环境,能源,材料 |
| 34 | 2025-10-05 |
Systems and synthetic biology for plant natural product pathway elucidation
2025-Jun-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115715
PMID:40382775
|
综述 | 本文综述了系统生物学和合成生物学在植物天然产物代谢途径解析与工程化中的应用进展 | 整合多种系统生物学方法与深度学习技术解析植物复杂代谢途径,并提出代谢组工程和AI整合等未来发展方向 | NA | 阐明植物天然产物的生物合成途径并提高其生产效率 | 植物天然产物代谢途径 | 合成生物学 | NA | 共表达分析、基因簇鉴定、代谢物分析、深度学习、全基因组关联研究、蛋白质复合物鉴定 | 深度学习 | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据 | NA | 代谢工程 | 植物 | 代谢途径工程、代谢组工程 | 医药、工业生物技术 |
| 35 | 2025-10-05 |
Hammerhead Ribozymes: Structural Insights, Catalytic Mechanisms, and Cutting-Edge Applications in Synthetic Biology
2025-Jun-12, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125624
PMID:40565088
|
综述 | 全面回顾了锤头状核酶在合成生物学中的最新研究进展、当前挑战和未来发展方向 | 系统总结了锤头状核酶的结构特性、催化机制及其在合成生物学中的前沿应用 | NA | 为锤头状核酶的生物医学应用提供有价值的观点和见解 | 锤头状核酶(具有催化活性的小RNA分子) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基因调控, 疾病治疗, 生物传感 |
| 36 | 2025-10-05 |
The Sustainable Production of Terpenoids in Cyanobacterial Chassis
2025-Jun-10, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13061342
PMID:40572229
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综述 | 本文全面总结了萜类化合物的生物合成途径及利用蓝细菌作为底盘细胞生产萜类化合物的研究进展 | 系统综述了利用光合微生物蓝细菌通过光能和二氧化碳可持续生产外源萜类化合物的最新策略 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学技术增强蓝细菌萜类化合物产量的策略 | 萜类化合物及其在蓝细菌中的生物合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 蓝细菌 | 萜类化合物生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 37 | 2025-10-05 |
Harnessing Transient Expression Systems with Plant Viral Vectors for the Production of Biopharmaceuticals in Nicotiana benthamiana
2025-Jun-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125510
PMID:40564973
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综述 | 本文综述了利用植物病毒载体在本氏烟草中建立瞬时表达系统生产生物药物的技术进展与应用前景 | 重点探讨病毒载体瞬时表达系统在突发公共卫生事件中的快速响应能力,以及结合水培技术、可控环境农业和糖基化工程等创新方法提升系统性能 | 作为综述文章未涉及原始实验数据验证,主要基于现有文献分析 | 评估植物分子农业中瞬时表达系统在生物制药领域的应用潜力 | 本氏烟草瞬时表达系统及其在重组蛋白生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 病毒载体瞬时表达、糖基化工程、水培技术 | NA | 文献数据 | NA | 植物病毒载体 | 本氏烟草 | 重组蛋白表达系统 | 医药, 工业生物技术 |
| 38 | 2025-10-05 |
Cell-Based Therapies for Solid Tumors: Challenges and Advances
2025-Jun-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125524
PMID:40564987
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综述 | 本文综述了基于细胞的免疫疗法在实体瘤治疗中的挑战与进展 | 系统比较了肿瘤浸润淋巴细胞、T细胞受体工程化T细胞、CAR-T细胞、CAR-NK细胞和巨噬细胞等新兴细胞疗法的优缺点,并探讨了自体与异体细胞来源的临床意义 | NA | 探讨细胞免疫疗法在实体瘤治疗中的应用前景和发展方向 | 实体瘤及其微环境 | NA | 实体瘤 | 基因编辑、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞、自然杀伤细胞、巨噬细胞 | 嵌合抗原受体、药物偶联巨噬细胞 | 医学 |
| 39 | 2025-10-05 |
Small molecule- and cell contact-inducible systems for controlling expression and differentiation in mouse embryonic stem cells
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204505
PMID:40377146
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研究论文 | 本研究表征了三种小分子诱导和两种细胞接触诱导系统在小鼠胚胎干细胞中的基因表达和分化控制 | 首次在小鼠胚胎干细胞中系统表征多种合成生物学工具,并展示其可用于驱动直接神经元分化 | 现有合成生物学工具在小鼠胚胎干细胞中的表征较少 | 开发控制小鼠胚胎干细胞表达和分化的合成生物学系统 | 小鼠胚胎干细胞(mESCs) | 合成发育生物学 | NA | 合成生物学工具 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 小鼠胚胎干细胞 | 小分子诱导系统、细胞接触诱导系统 | 基础研究 |
| 40 | 2025-10-05 |
Nuclear Assembly in Giant Unilamellar Vesicles Encapsulating Xenopus Egg Extract
2025-Jun, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202412126
PMID:40390663
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研究论文 | 本研究提出了一种在巨型单层囊泡中组装细胞核的方法 | 通过改进倒置乳液法提高GUV形成效率,首次在合成脂质体环境中实现功能性核组装 | NA | 在合成细胞中重建真核细胞核结构 | 非洲爪蟾卵提取物和巨型单层囊泡 | 合成生物学 | NA | 倒置乳液法、免疫染色 | NA | 显微镜图像 | NA | 无细胞系统 | 非洲爪蟾 | 核组装系统 | 合成生物学 |