合成生物学相关文章
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当前共找到 120 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-05-17 |
Standardized Quorum Sensing Tools for Gram-Negative Bacteria
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00036
PMID:40476774
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研究论文 | 开发了一套标准化的群体感应工具，用于革兰氏阴性菌的合成生物学应用 | 基于SEVA载体库构建标准化、可互换的群体感应收发模块，并提供数学模型和参数以支持工程设计 | NA | 为革兰氏阴性菌提供标准化的群体感应工具，实现可预测的多细胞功能工程 | 群体感应系统及其收发模块 | 合成生物学 | NA | 群体感应系统的标准化构建与表征 | 数学模型 | NA | NA | SEVA载体库 | 革兰氏阴性菌 | 群体感应收发模块 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 22 | 2026-05-17 |
Robust Synthetic Biology Toolkit to Advance Carboxysome Study and Redesign
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00144
PMID:40488673
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研究论文 | 设计和验证了pXpressome工具包，用于稳健表达和重新设计α-羧酶体 | 开发了pXpressome工具包，实现α-羧酶体的稳健表达、纯化后保持完整和功能，并通过基因缺失实验揭示蛋白质比例可理性影响形态 | 未提及，但可能涉及工具包在复杂环境或不同宿主中的适用性限制 | 促进羧酶体的研究和重新设计，以增强碳固定或作为纳米封装平台 | α-羧酶体及其组成蛋白（Rubisco、碳酸酐酶、顶点蛋白、面形成蛋白） | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | pXpressome工具包，Gibson Assembly | 大肠杆菌（E. coli） | 羧酶体表达系统，包括荧光标记构建体 | 环境，工业生物技术 |
| 23 | 2026-05-16 |
The Japan-UK Synthetic Biology Conference, Spring 2025: Strengthening Global Links to Engineer Biology
2025-06-20, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00232
PMID:40538270
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评论 | 总结2025年春季日英合成生物学会议，探讨国际合作如何推动工程生物学发展 | 强调通过跨国合作促进合成生物学从研究向可持续生物经济转型的视角 | 未深入分析具体技术瓶颈，仅概述会议讨论的挑战与趋势 | 促进合成生物学领域的全球协作，推动生物基经济转型 | 合成生物学研究者及国际合作机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 能源, 材料, 工业生物技术 |
| 24 | 2026-05-16 |
Engineered Biomolecular Condensates Limit Tobacco Mosaic Virus Accumulation and Symptom Development
2025-06, Molecular plant pathology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/mpp.70113
PMID:40544335
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研究论文 | 本文通过工程化生物分子凝聚体限制烟草花叶病毒积累和症状发展 | 首次利用液-液相分离形成的工程化人工凝聚体作为靶向抗病毒策略，限制植物病毒积累 | NA | 开发工程化生物分子凝聚体以减轻植物病毒积累和疾病严重程度 | 烟草花叶病毒（TMV）和本氏烟草 | 合成生物学 | 植物病毒病 | 液-液相分离（LLPS） | NA | 生物分子数据 | NA | MS2噬菌体发夹、MS2外壳蛋白（MCP） | 本氏烟草 | 人工生物分子凝聚体（基于TDP-43的凝聚体） | 农业 |
| 25 | 2026-05-12 |
Understanding carboxysomes to enhance carbon fixation in crops
2025-06-30, Biochemical Society transactions
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BST20253072
PMID:40570186
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综述 | 本文综述了羧酶体在提高农作物光合固碳效率方面的潜在应用及当前理解 | 系统总结羧酶体生物发生、Rubisco组织和外壳功能的最新进展，并提出将其与碳酸氢盐转运蛋白共同移植到叶绿体中以增强光合作用的新思路 | 仍存在关键问题未解决，如外壳精确作用机制尚不明确，以及需要识别合适的碳酸氢盐转运体和调控表达水平 | 探讨利用羧酶体和蓝藻CO2浓缩机制提高农作物光合效率的可行性与挑战 | 羧酶体、Rubisco、碳酸氢盐转运蛋白、农作物 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 26 | 2026-04-29 |
Harnessing Transient Expression Systems with Plant Viral Vectors for the Production of Biopharmaceuticals in Nicotiana benthamiana
2025-Jun-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125510
PMID:40564973
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综述 | 综述了利用植物病毒载体在本氏烟中瞬时表达系统生产生物制药的关键作用与最新进展 | 阐述了病毒载体修饰、水培法和受控环境农业等创新技术如何提升可扩展性和法规合规性，并通过糖基化工程拓宽可生产的生物制药范围 | 未明确讨论瞬时表达系统在工业生产中的长期稳定性或大规模生产成本控制的具体挑战 | 强调瞬时表达系统在生物制药生产、教育、合成生物学和基因编辑中的应用潜力，并推动植物分子农业成为现代生物技术的关键组成部分 | 本氏烟中的瞬时表达系统及植物病毒载体 | 合成生物学 | NA | 瞬时表达 | NA | NA | NA | 病毒载体 | 本氏烟 | 植物病毒载体驱动的瞬时表达系统 | 医药, 生物技术 |
| 27 | 2026-04-22 |
Recent advance in macrolactams: Structure, bioactivity, and biosynthesis
2025-06-01, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108406
PMID:40184666
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综述 | 本文系统综述了2004年至2023年间报道的105个大环内酰胺，涵盖其来源、结构、生物活性及17种已知生物合成途径，并深入分析了相关基因簇、关键酶机制及其在生物合成中的作用 | 首次系统讨论大环内酰胺家族的最新进展，特别关注结构-活性关系及偏离传统共线性规则的新生物合成途径 | NA | 为大环内酰胺的发现及其通过合成生物学方法的可持续生产提供参考 | 105种由微生物菌株产生的大环内酰胺，这些菌株分离自海洋沉积物、土壤、植物和动物等多样环境 | NA | NA | NA | NA | NA | 105种大环内酰胺 | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2026-04-16 |
Advances in synthetic microbial ecosystems approach for studying ecological interactions and their influencing factors
2025-Jun, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100205
PMID:41982405
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综述 | 本文综述了合成微生物生态系统在生态相互作用及其影响因素研究方面的进展 | 系统整合了当前关于合成微生物生态系统的知识，并强调了其相较于自然生态系统的简化性和可控性优势 | NA | 增强对微生物群落相互作用的理解，特别是群落稳定性、关键物种识别和群落结构调控等生态学关键问题 | 合成微生物生态系统及其中的生态相互作用 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 环境 |
| 29 | 2026-04-16 |
The Kongming defense: Host-pathogen battles take a new face
2025-Jun, Engineering microbiology
DOI:10.1016/j.engmic.2025.100209
PMID:41982408
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评论 | 本文评论了Kongming细菌防御系统的新机制，该系统利用噬菌体衍生的酶合成dITP，通过消耗NAD+触发宿主免疫，揭示了宿主与病原体间持续的进化军备竞赛 | 首次揭示了Kongming防御系统利用噬菌体酶合成dITP并触发NAD+消耗的独特免疫机制，以及噬菌体相应进化出对抗策略 | NA | 探讨细菌免疫系统与噬菌体之间的进化相互作用机制 | 细菌防御系统（特别是Kongming系统）与噬菌体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 生物医学研究, 合成生物学 |
| 30 | 2026-03-18 |
Purification of post-transcriptionally modified tRNAs for enhanced cell-free translation systems
2025-Jun-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.658963
PMID:40661628
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研究论文 | 本文开发了一种结合tRNA过表达和DNA杂交纯化的方法，用于纯化具有天然转录后修饰的tRNA，以增强无细胞翻译系统的性能 | 提出了一种灵活的方法，能高产高纯地生成修饰tRNA，解决了RNA生物化学中长期存在的挑战，并首次提供了关键tRNA的完整修饰谱 | NA | 开发一种纯化方法，以生产保留天然转录后修饰的tRNA，用于改进无细胞翻译系统和遗传密码扩展 | tRNA（转移RNA），特别是来自大肠杆菌和酿酒酵母的tRNA，以及工程化tRNA变体 | 合成生物学 | NA | DNA杂交纯化、tRNA过表达、细胞无翻译反应 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 31 | 2026-02-17 |
Integrating chemical artificial intelligence and cognitive computing for predictive analysis of biological pathways: a case for intrinsically disordered proteins
2025-Jun, Biophysical reviews
IF:4.9Q1
DOI:10.1007/s12551-025-01286-x
PMID:40727659
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研究论文 | 本文探讨了将化学人工智能与认知计算相结合，用于生物通路预测分析，特别是针对内在无序蛋白的应用 | 提出通过化学人工智能整合生物分子相互作用到认知计算中，以模拟人类思维过程并增强决策，为蛋白质工程和药物发现等领域提供新方法 | 生物数据复杂性和规模大，整合生物过程与认知计算仍面临挑战 | 旨在连接认知计算与生物知识，以开发更精确的蛋白质相互作用、基因调控和代谢通路模型，促进个性化治疗和早期疾病检测 | 内在无序蛋白及其在大脑功能和信息处理中的关键作用 | 生物信息学 | NA | 机器学习、自然语言处理、语音识别 | 认知计算模型 | 生物数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、蛋白质工程、药物发现、合成生物学、非传统计算 |
| 32 | 2026-01-29 |
Temporal gene regulation enables controlled expression of gas vesicles and preserves bacterial viability
2025-Jun-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.20.660610
PMID:40667317
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研究论文 | 本研究开发了一种双诱导转录调控系统，通过时序控制气囊蛋白的组装因子和外壳蛋白的表达，以解决异源表达气囊时引起的细胞生长抑制和裂解问题 | 首次观察到气囊诱导后8-16小时细胞密度下降的现象，并设计了时序诱导策略，在维持气囊产量的同时恢复了细菌正常生长 | 研究仅在大肠杆菌中进行验证，未在其他宿主中测试该调控系统的普适性 | 优化气囊在非天然宿主中的异源表达，减少其对细胞生长的负面影响 | 气囊蛋白的组装过程及其对宿主细胞的影响 | 合成生物学 | NA | 双诱导转录调控系统、时序诱导策略 | NA | NA | NA | 双诱导转录调控系统 | 大肠杆菌 | 时序调控的基因回路，通过正交控制组装因子蛋白和外壳蛋白的表达时序与化学计量比 | 生物医学工程、合成生物学 |
| 33 | 2025-12-22 |
Innovative tools for customized yeast cell factory
2025-Jun, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100010
PMID:41416100
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综述 | 本文简要综述了合成生物学创新工具在定制化酵母细胞工厂开发中的最新重要进展与前景 | 系统性地总结了推动酵母细胞工厂快速发展的多种创新工具，包括基因组编辑工具、计算工具、适应性实验室进化和生物DNA部件的标准化，并提供了实用指南 | NA | 为定制化酵母细胞工厂的新型、有效和高效开发提供实用指南 | 酵母细胞工厂及其相关的合成生物学工具 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑，适应性实验室进化，DNA部件标准化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 基因、回路、通路和网络的重编程 | 食品，能源，医药，工业生物技术 |
| 34 | 2025-12-22 |
Utilizing plant synthetic biology to accelerate plant-microbe interactions research
2025-Jun, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100007
PMID:41416106
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综述 | 本文综述了植物合成生物学在加速植物-微生物互作研究中的应用，包括分子机制解析、抗病性增强和合成共生工程 | 利用合成生物学工具进行多基因表征和工程化，以解决传统方法在解析复杂通路交叉对话方面的不足 | NA | 加速植物-微生物互作研究，以提升生态系统韧性和作物产量 | 植物与有益及病原微生物的互作机制 | 合成生物学 | NA | 分子生物学、遗传学、合成生物学工具 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 合成共生工程 | 农业 |
| 35 | 2025-12-02 |
Label-free high-throughput live-cell sorting of genome-wide random mutagenesis libraries for metabolic traits by Raman flow cytometry
2025-Jun-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503641122
PMID:40445753
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研究论文 | 本文介绍了一种基于正介电泳诱导确定性横向位移的拉曼激活细胞分选技术，用于无标记高通量分选基因组范围随机诱变库中的代谢性状细胞 | 开发了pDEP-DLD-RACS技术，首次实现了对快速移动单细胞的高精度、高通量、长时稳定分选，并直接应用于基因组范围诱变库的代谢性状筛选 | NA | 开发一种无标记、非侵入性的高通量细胞分选平台，用于筛选代谢性状 | 色素和油脂生产酵母细胞，以及基因组范围随机诱变库中的突变体 | 合成生物学 | NA | 拉曼流式细胞术，正介电泳诱导确定性横向位移 | NA | 拉曼光谱数据 | 基因组范围随机诱变库中超过10个物种的突变体 | NA | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 36 | 2025-10-05 |
The Matter/Life Nexus in Biological Cells
2025-06, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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综述 | 探讨物理学与细胞生物化学的深度耦合如何揭示物质与生命界限的研究进展 | 整合过去十年实验与计算进展，聚焦空间组织和区室化对生命特征形成的作用 | 目前仍无法从原子和分子成分从头构建活细胞 | 探索物质与生命界限的本质特征 | 生物细胞及其物理化学特性 | 系统生物学与合成生物学 | NA | 全细胞建模与合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基础科学研究 |
| 37 | 2025-10-05 |
Pepper RNA variants reveal decoupling of HBC530 binding thermodynamics and fluorescence activation
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660466
PMID:40667133
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研究论文 | 通过分析Pepper RNA变体揭示了HBC530结合热力学与荧光激活之间的解耦关系 | 发现配体识别与荧光强度之间存在解耦现象，并证明远端结构元件对结合热力学和荧光强度的重要影响 | 仅研究了53种变体，可能未覆盖所有关键序列变异 | 理解RNA适配体配体识别和荧光激活的序列-结构-功能关系，为理性设计荧光RNA适配体提供框架 | Pepper RNA适配体及其53种变体 | 合成生物学 | NA | RNA变体库构建、结合亲和力测定、荧光强度测量 | NA | 生物化学数据、荧光数据 | 53种Pepper变体 | NA | NA | 荧光RNA适配体 | 医学, 合成生物学 |
| 38 | 2025-10-05 |
A quantitative analysis of biosafety and biosecurity using attack trees in low-to-moderate risk scenarios: Evidence from iGEM
2025-06, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis
IF:3.0Q1
DOI:10.1111/risa.17678
PMID:39552172
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研究论文 | 本研究通过攻击树方法对iGEM竞赛中的生物安全和生物安保风险进行定量分析 | 将传统定性风险分析扩展为定量评估，构建了针对iGEM项目的攻击树模型 | 主要针对中低风险场景，且参与者经验相对不足可能影响评估准确性 | 评估合成生物学项目中的生物安全和生物安保风险 | 2022年iGEM竞赛项目 | 合成生物学 | NA | 攻击树分析 | 攻击树模型 | 项目风险评估数据 | 2022年iGEM项目 | iGEM | NA | NA | 生物安全 |
| 39 | 2025-10-05 |
Unlocking hidden bioactive compounds: from indolocarbazole and RiPP biosynthesis to the activation of cryptic secondary metabolism via microbial interactions
2025-06, The Journal of antibiotics
IF:2.1Q3
DOI:10.1038/s41429-025-00828-5
PMID:40379949
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综述 | 本文综述了放线菌次级代谢产物的三大研究方向：吲哚咔唑和RiPPs的生物合成机制，以及通过微生物相互作用激活隐性次级代谢途径 | 开发了无细胞一锅合成平台用于RiPPs类似物生产，并通过放线菌与含分枝杆菌的共培养策略发现了42种新化合物 | NA | 探索放线菌次级代谢产物的生物合成机制及其在药物发现中的应用潜力 | 放线菌（特别是链霉菌）及其产生的次级代谢产物 | 合成生物学 | 癌症 | 共培养策略、无细胞一锅合成、基因修饰 | NA | NA | NA | NA | 放线菌、链霉菌、含分枝杆菌的细菌 | 隐性生物合成途径激活、肽类天然产物生物合成途径 | 医药 |
| 40 | 2025-10-05 |
Armed Phages: A New Weapon in the Battle Against Antimicrobial Resistance
2025-Jun-27, Viruses
DOI:10.3390/v17070911
PMID:40733529
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综述 | 本文探讨了细菌防御系统对噬菌体疗法的限制，并重点介绍了通过合成生物学技术改造的'武装噬菌体'在对抗耐药菌感染中的潜力 | 提出'武装噬菌体'概念，通过基因工程改造使其能够规避细菌免疫系统，并携带抗菌肽、CRISPR基因编辑工具等增强治疗功能 | NA | 探索替代性抗菌策略以应对多重耐药菌感染 | 噬菌体及其与细菌防御系统的相互作用 | 合成生物学 | 细菌感染 | 合成生物学、基因工程、CRISPR基因编辑 | NA | NA | 涉及SNIPR001一期临床试验和LBP-EC01二期临床试验 | CRISPR-Cas, 合成生物学工具 | 噬菌体 | 受体结合蛋白工程、抗CRISPR基因整合、甲基化模式改变、酶降解细菌保护屏障 | 医学 |