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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Pepper RNA variants reveal decoupling of HBC530 binding thermodynamics and fluorescence activation
2025-Jun-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660466
PMID:40667133
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研究论文 | 通过分析Pepper RNA变体揭示了HBC530结合热力学与荧光激活之间的解耦关系 | 发现配体识别与荧光强度之间存在解耦现象,并证明远端结构元件对结合热力学和荧光强度的重要影响 | 仅研究了53种变体,可能未覆盖所有关键序列变异 | 理解RNA适配体配体识别和荧光激活的序列-结构-功能关系,为理性设计荧光RNA适配体提供框架 | Pepper RNA适配体及其53种变体 | 合成生物学 | NA | RNA变体库构建、结合亲和力测定、荧光强度测量 | NA | 生物化学数据、荧光数据 | 53种Pepper变体 | NA | NA | 荧光RNA适配体 | 医学, 合成生物学 |
| 42 | 2025-10-05 |
A quantitative analysis of biosafety and biosecurity using attack trees in low-to-moderate risk scenarios: Evidence from iGEM
2025-06, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis
IF:3.0Q1
DOI:10.1111/risa.17678
PMID:39552172
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研究论文 | 本研究通过攻击树方法对iGEM竞赛中的生物安全和生物安保风险进行定量分析 | 将传统定性风险分析扩展为定量评估,构建了针对iGEM项目的攻击树模型 | 主要针对中低风险场景,且参与者经验相对不足可能影响评估准确性 | 评估合成生物学项目中的生物安全和生物安保风险 | 2022年iGEM竞赛项目 | 合成生物学 | NA | 攻击树分析 | 攻击树模型 | 项目风险评估数据 | 2022年iGEM项目 | iGEM | NA | NA | 生物安全 |
| 43 | 2025-10-05 |
Unlocking hidden bioactive compounds: from indolocarbazole and RiPP biosynthesis to the activation of cryptic secondary metabolism via microbial interactions
2025-06, The Journal of antibiotics
IF:2.1Q3
DOI:10.1038/s41429-025-00828-5
PMID:40379949
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综述 | 本文综述了放线菌次级代谢产物的三大研究方向:吲哚咔唑和RiPPs的生物合成机制,以及通过微生物相互作用激活隐性次级代谢途径 | 开发了无细胞一锅合成平台用于RiPPs类似物生产,并通过放线菌与含分枝杆菌的共培养策略发现了42种新化合物 | NA | 探索放线菌次级代谢产物的生物合成机制及其在药物发现中的应用潜力 | 放线菌(特别是链霉菌)及其产生的次级代谢产物 | 合成生物学 | 癌症 | 共培养策略、无细胞一锅合成、基因修饰 | NA | NA | NA | NA | 放线菌、链霉菌、含分枝杆菌的细菌 | 隐性生物合成途径激活、肽类天然产物生物合成途径 | 医药 |
| 44 | 2025-10-05 |
Armed Phages: A New Weapon in the Battle Against Antimicrobial Resistance
2025-Jun-27, Viruses
DOI:10.3390/v17070911
PMID:40733529
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综述 | 本文探讨了细菌防御系统对噬菌体疗法的限制,并重点介绍了通过合成生物学技术改造的'武装噬菌体'在对抗耐药菌感染中的潜力 | 提出'武装噬菌体'概念,通过基因工程改造使其能够规避细菌免疫系统,并携带抗菌肽、CRISPR基因编辑工具等增强治疗功能 | NA | 探索替代性抗菌策略以应对多重耐药菌感染 | 噬菌体及其与细菌防御系统的相互作用 | 合成生物学 | 细菌感染 | 合成生物学、基因工程、CRISPR基因编辑 | NA | NA | 涉及SNIPR001一期临床试验和LBP-EC01二期临床试验 | CRISPR-Cas, 合成生物学工具 | 噬菌体 | 受体结合蛋白工程、抗CRISPR基因整合、甲基化模式改变、酶降解细菌保护屏障 | 医学 |
| 45 | 2025-10-05 |
Advances in engineered models of peri-gastrulation
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112659
PMID:40510116
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综述 | 本文讨论工程化模型在研究生殖层形成前后阶段的应用进展 | 整合干细胞技术与工程工具研究人类早期发育,提供前所未有的发育机制见解 | NA | 研究哺乳动物生殖层形成前后阶段的发育过程 | 胚泡样结构、二维微图案系统、三维原肠胚样结构、体节样结构等工程化模型 | 发育生物学 | NA | 干细胞技术、微图案基底、微流体系统、合成生物学工具 | NA | NA | NA | 微图案基底、微流体系统、合成生物学工具 | 人类干细胞 | NA | 医学 |
| 46 | 2025-10-05 |
Exploring pigment-producing Streptomyces as an alternative source to synthetic pigments: diversity, biosynthesis, and biotechnological applications. A review
2025-Jun-25, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04379-7
PMID:40555885
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综述 | 探讨色素产生链霉菌作为合成色素替代来源的多样性、生物合成途径及生物技术应用 | 系统整合链霉菌色素研究的生态多样性、生物合成机制及CRISPR/Cas基因编辑技术在激活沉默基因簇中的应用 | 存在毒理学评估不足、工业条件下色素稳定性问题、未探索菌株高通量筛选缺乏以及AI预测工具整合不充分等研究缺口 | 开发链霉菌天然色素作为合成色素的可持续替代品 | 色素产生链霉菌及其次级代谢产物 | 工业生物技术 | NA | CRISPR/Cas基因编辑、发酵优化、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 链霉菌 | 沉默生物合成基因簇激活 | 食品,制药,化妆品,纺织,环境 |
| 47 | 2025-10-05 |
Innovation in Swine Nutrition in China over the Past Decade
2025-Jun-24, The Journal of nutrition
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.tjnut.2025.06.009
PMID:40571101
|
综述 | 系统回顾中国过去十年在猪营养领域的研究进展与创新策略 | 首次系统总结中国现代化猪营养标准体系,提出低碳高效国际化生产模式及精准饲喂等针对性解决方案 | NA | 应对猪产业面临的饲料短缺、肉质下降、抗生素滥用等挑战,推动可持续畜牧业发展 | 猪营养标准、饲料质量控制、养殖环境管理 | NA | NA | 合成生物学、分子技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 48 | 2025-10-05 |
Biodegradation of Neonicotinoid Insecticides Thiacloprid and Thiamethoxam by Microorganisms: Metabolic Process, Metabolic Enzymes and Toxicity Assessments of their Metabolites
2025-Jun-25, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04326-7
PMID:40555881
|
综述 | 系统综述新烟碱类杀虫剂噻虫啉和噻虫胺的微生物降解机制、代谢途径及代谢产物毒性评估 | 重点关注微生物群落通过互补代谢途径的协同降解潜力,以及多组学技术、计算生物学和合成生物学在生物修复中的整合应用 | NA | 阐明新烟碱类杀虫剂的微生物降解机制及代谢产物生态毒性 | 噻虫啉(THI)和噻虫胺(THIA)两种新烟碱类杀虫剂 | 环境微生物学 | NA | 多组学技术、计算生物学、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 环境 |
| 49 | 2025-10-05 |
Light-orchestrated multi-step solid-phase picodroplet reactors
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.23.660884
PMID:40666841
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研究论文 | 开发了一种光控固相皮升液滴反应器平台,用于实现多步生化反应 | 利用光镊技术操控皮升液滴和微珠,首次实现了八步点击化学DNA连接合成循环 | NA | 克服现有皮升液滴微流控技术无法执行多步反应的局限性 | 皮升液滴反应器和微珠 | 微流控技术 | NA | 光电子镊子技术、实时原位荧光检测 | NA | 荧光检测数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、药物发现 |
| 50 | 2025-10-05 |
Reprogramming Hairy Root Cultures: A Synthetic Biology Framework for Precision Metabolite Biosynthesis
2025-Jun-23, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14131928
PMID:40647937
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综述 | 探讨发根培养物在可持续生产植物源高价值化合物中的合成生物学框架与应用潜力 | 提出整合发根系统与转录组学、CRISPR技术等先进基因组工具的合成生物学框架,用于加速途径特异性代谢工程 | 未涉及具体实验验证数据,主要基于文献综述提出理论框架 | 优化发根培养物规模化生产高价值植物源化合物 | 发根培养物及其代谢产物 | 合成生物学 | NA | 转录组学, CRISPR技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物发根组织 | 代谢途径工程, 生物合成通路优化 | 工业生物技术, 制药, 农业 |
| 51 | 2025-10-05 |
Reviving the Dire Wolf? A Case Study in Welfare Ethics, Legal Gaps, and Ontological Ambiguity
2025-Jun-21, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani15131839
PMID:40646738
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研究论文 | 通过基因编辑和克隆技术复活灭绝物种的案例研究,分析其涉及的动物福利、伦理问题和法律监管空白 | 首次使用五领域模型框架评估工程动物福利风险,并从多种伦理角度分析功能性灭绝复活项目 | 基于单个案例研究,缺乏长期观察数据,法律分析主要针对欧盟框架 | 评估基因工程复活灭绝物种项目的伦理正当性、动物福利风险和监管需求 | 基因改造犬科动物(表型类似灭绝的恐狼)、代孕母狼和可能受影响的生态系统动物 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、克隆技术 | 五领域模型框架 | 案例研究数据、伦理分析框架 | 3只基因改造犬科动物及相关代孕母体 | CRISPR-Cas9 | 灰狼细胞 | 功能性灭绝复活工程 | 生物技术 |
| 52 | 2025-10-05 |
Unveiling the Diversity of Culturable Microbes from the Underexplored Mingyong Glacier Landscape: A Roadmap for Leveraging the Potential of Actinomycetota
2025-Jun, Indian journal of microbiology
IF:2.1Q3
DOI:10.1007/s12088-025-01449-0
PMID:40655354
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研究论文 | 本研究从明永冰川景观分离并表征了73株土壤放线菌,揭示了该极端环境中放线菌的多样性和生物技术潜力 | 首次系统探索明永冰川景观的放线菌多样性,发现多个放线菌目下的不同属,为新型生物活性化合物发现提供新资源 | 仅基于培养方法分离微生物,可能低估真实多样性;样本数量有限(6个样本) | 探索极端环境微生物多样性以发现新型生物活性化合物 | 明永冰川景观土壤中的放线菌 | 微生物学 | NA | 16S rRNA基因测序,微生物分离培养 | NA | 基因序列数据,微生物培养数据 | 6个土壤样本,73株放线菌分离株 | NA | NA | NA | 医药,生物技术 |
| 53 | 2025-10-05 |
Glycosyltransferases in human milk oligosaccharide synthesis: structural mechanisms and rational design
2025-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103315
PMID:40347686
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综述 | 系统分析糖基转移酶在母乳寡糖合成中的结构机制与理性设计策略 | 整合结构生物学与深度学习算法实现糖基转移酶的理性设计与从头设计 | NA | 阐明糖基转移酶的结构机制并建立碳水化合物活性酶的精准工程框架 | 糖基转移酶及其在母乳寡糖生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 晶体学研究、深度学习算法 | NA | 结构生物学数据 | NA | 结构引导理性设计 | 微生物平台 | 酶催化乳糖糖基化途径 | 医药, 食品 |
| 54 | 2025-10-05 |
FoldMark: Safeguarding Protein Structure Generative Models with Distributional and Evolutionary Watermarking
2025-Jun-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619960
PMID:39554012
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研究论文 | 提出一种名为FoldMark的蛋白质结构生成模型水印策略,用于保护AI驱动的蛋白质研究安全 | 首个利用分布和进化原理的蛋白质生成模型水印策略,平衡水印容量和结构质量 | NA | 开发蛋白质生成模型的安全保护方法,防止恶意使用 | 蛋白质结构生成模型 | 计算生物学 | NA | 分布和进化水印技术 | AlphaFold3, ESMFold, RFDiffusion, RFDiffusionAA | 蛋白质结构数据 | NA | CRISPR-Cas13 | NA | NA | 生物安全, 药物发现, 合成生物学 |
| 55 | 2025-10-05 |
Bridging BioSciences and technology: The impact of AI & GenAI in life sciences and agribusiness
2025-Jun-16, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149623
PMID:40516836
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综述 | 探讨生成式人工智能在生命科学和农业综合企业中的多层面影响 | 系统阐述生成式AI在药物发现、蛋白质结构预测、作物育种及合成生物学等前沿领域的创新应用 | 未具体说明数据隐私、算法偏见和利益公平分配等伦理问题的解决方案 | 分析生成式AI与生物科学交叉融合的技术影响与发展前景 | 生成式人工智能技术在生命科学和农业领域的应用场景 | 机器学习 | NA | 生成式人工智能 | 大型语言模型(LLM) | 基因组数据、生态数据、分子数据 | NA | NA | NA | NA | 医药, 农业, 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 56 | 2025-10-05 |
Design Principles Of Inorganic-Protein Hybrid Materials for Biomedicine
2025-Jun, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240182
PMID:40585774
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综述 | 本文系统综述了无机-蛋白质杂化材料在生物医学领域的设计原理、结构基础及应用前景 | 提出原位杂化材料合成新思路,从合成生物学角度分析杂化材料反应体系构建策略 | NA | 探讨无机-蛋白质杂化材料的设计原理及其在生物医学领域的应用 | 无机-蛋白质杂化材料(IPHMs) | 材料科学 | NA | 生物医学光学成像、多模式治疗 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学 |
| 57 | 2025-10-05 |
Switchable RNA motifs for dynamic transcriptional control of RNA condensates
2025-Jun-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf497
PMID:40539511
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研究论文 | 本研究开发了可通过RNA入侵链动态调控的RNA凝聚体系统 | 首次实现了通过RNA入侵链和反入侵链对星形RNA基序形成的凝聚体进行可逆调控 | 目前仅在体外实验中验证了系统功能,尚未在活细胞环境中测试 | 开发可动态调控的RNA相分离系统 | 星形RNA基序(纳米星)形成的生物分子凝聚体 | 合成生物学 | NA | 体外转录 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 基于RNA入侵链和反入侵链的可逆调控开关 | 合成生物学, 生物材料 |
| 58 | 2025-10-05 |
Plant Microbiomes Alleviate Abiotic Stress-Associated Damage in Crops and Enhance Climate-Resilient Agriculture
2025-Jun-19, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14121890
PMID:40573878
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综述 | 探讨植物微生物组在缓解非生物胁迫中的作用及其在气候智慧农业中的应用前景 | 系统阐述微生物组工程策略(合成生物学、微生物群落设计等)在增强农业气候韧性的创新应用 | 实验室研究成果向田间实际应用的转化仍面临植物-微生物互作复杂性的挑战 | 研究植物微生物组如何增强作物对非生物胁迫的抵抗能力并推动可持续农业发展 | 植物微生物组(细菌、真菌、古菌、微藻等)及其与作物的互作关系 | 农业生物技术 | NA | 宏基因组学, CRISPR-Cas | NA | NA | NA | CRISPR-Cas, 合成生物学工具 | 作物相关微生物 | 微生物群落设计 | 农业 |
| 59 | 2025-10-05 |
Unraveling Nature's Pharmacy: Transforming Medicinal Plants into Modern Therapeutic Agents
2025-Jun-07, Pharmaceutics
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/pharmaceutics17060754
PMID:40574066
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综述 | 探讨天然产物在药物发现中的潜力,重点介绍传统知识与现代药物开发技术的结合 | 强调传统知识与现代药物发现技术的融合,并重点介绍基因工程、代谢工程、合成生物学等前沿技术在天然产物药物开发中的应用 | 天然产物药物发现仍存在若干问题和固有挑战需要克服 | 探索天然产物在药物发现和开发过程中的潜力 | 天然产物和药用植物 | NA | NA | 基因工程, 代谢工程, 植物细胞培养, 合成生物学, 组学技术, 计算方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 60 | 2025-10-05 |
Development and flight-testing of modular autonomous cultivation systems for biological plastics upcycling aboard the ISS
2025-Jun-25, NPJ microgravity
IF:4.4Q1
DOI:10.1038/s41526-025-00463-2
PMID:40562752
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研究论文 | 开发并测试用于国际空间站塑料生物升级回收的模块化自主培养系统 | 开发了具有全程序化连续传代和样品保存功能的自主载荷系统MOBP,并在国际空间站进行了首次塑料生物升级回收飞行测试 | NA | 实现空间环境中微生物的自主培养和塑料废弃物的生物升级回收 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)塑料的生物酶解和微生物转化 | 合成生物学 | NA | 微生物培养、酶催化、生物转化 | NA | 传感器监测数据、生物样品 | NA | NA | 微生物 | NA | 环境,能源,材料 |