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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-driven induction of mature TLS formation enhances antitumor immunity in colorectal cancer
2025-Jun-18, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ado8395
PMID:40531967
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建工程菌株诱导成熟三级淋巴结构形成,增强结直肠癌抗肿瘤免疫 | 首次利用合成生物学工程菌株特异性诱导肿瘤部位三级淋巴结构成熟,并阐明LIGHT-HVEM信号通路在ILC3细胞中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 开发通过诱导成熟三级淋巴结构增强结直肠癌免疫治疗效果的新方法 | 结直肠癌小鼠模型、工程菌株SLC、三级淋巴结构、免疫细胞 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 基因工程、免疫荧光分析、动物模型 | NA | 实验数据、免疫组化数据 | 两种不同的结直肠癌小鼠模型 | CRISPR-Cas9 | 工程菌株 | LIGHT蛋白表达系统 | 医学 |
| 62 | 2025-10-05 |
Rosmarinic Acid as Bioactive Compound: Molecular and Physiological Aspects of Biosynthesis with Future Perspectives
2025-06-05, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110850
PMID:40498026
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综述 | 本文综述迷迭香酸的生物合成途径、分子机制及其生物技术生产方法 | 系统探讨了合成生物学和代谢工程在提高迷迭香酸工业产量方面的最新进展 | NA | 研究迷迭香酸的生物合成机制及其生物技术生产方法 | 迷迭香酸(一种咖啡酸酯类生物活性化合物) | 合成生物学 | NA | 植物细胞组织培养、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物细胞(特别是药用植物) | 迷迭香酸生物合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 63 | 2025-10-05 |
'Intelligent' proteins
2025-Jun-14, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-05770-1
PMID:40515853
|
研究论文 | 提出蛋白质分子具有基本形式'智能'的新观点,挑战传统将蛋白质视为简单分子机器的认知 | 将整合信息理论(IIT)应用于蛋白质研究,提出蛋白质智能的可量化参数Φ,并建立核心-外围平衡的智能框架 | 将智能概念应用于分子系统存在争议,创建适应性'智能'蛋白质面临技术挑战 | 探索蛋白质的信息处理能力、环境适应性和记忆样行为,重新定义蛋白质智能概念 | 蛋白质分子及其构象记忆、变构调控、内在无序等特性 | 系统生物学 | NA | 整合信息理论(IIT)、网络理论、变构理论分析 | NA | 理论分析 | NA | NA | NA | NA | 蛋白质工程, 药物设计, 合成生物学 |
| 64 | 2025-10-05 |
Real-Time Fluorescence-Based Method for Dynamic Quantification of Droplet Network Assembly
2025-Jun-10, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c02156
PMID:40521463
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研究论文 | 本研究开发了一种基于荧光的分子信标方法,用于实时监测液滴网络的组装过程 | 与传统显微成像技术相比,该方法能够连续量化动态液滴相互作用,具有更高的灵敏度 | NA | 提高合成生物学和中尺度材料应用中液滴组装的精确度 | 液滴网络组装过程 | 合成生物学 | NA | 荧光分子信标方法,单链DNA信标技术 | NA | 荧光信号 | NA | NA | NA | 基于互补单链DNA序列结合的分子信标系统 | 环境监测,药物递送,生物传感 |
| 65 | 2025-10-05 |
Leveraging gene editing to combat methane emissions in ruminant agriculture
2025-Jun-14, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.020
PMID:40518326
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综述 | 探讨利用CRISPR基因编辑技术降低反刍动物甲烷排放的策略 | 整合针对饲料作物和产甲烷古菌的双重基因编辑策略,提出跨学科解决方案 | 存在递送方法、基因靶向特异性、生态影响和监管接受度等挑战 | 开发可持续农业的气候变化缓解方案 | 反刍动物甲烷排放机制及调控方法 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 饲料作物, 产甲烷古菌 | 甲烷生成代谢通路调控 | 农业, 环境 |
| 66 | 2025-10-05 |
DNA-programmed responsive microorganism assembly with controlled patterns and behaviors
2025-Jun-13, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ads8651
PMID:40512851
|
研究论文 | 通过DNA编程实现微生物的响应式组装与行为控制 | 首次利用功能性DNA作为可编程表面受体调控微生物群落的空间模式和行为,实现了多组分微生物的精确空间组装和刺激响应性聚集 | 需要外源性DNA修饰和特定的化学标记过程 | 开发可编程的微生物相互作用控制方法 | 革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和休眠孢子等多种微生物 | 合成生物学 | NA | 代谢标记、疏水插入、DNA编程技术 | NA | NA | 多种微生物类型 | DNA编程 | 革兰氏阳性菌,革兰氏阴性菌,休眠孢子 | DNA介导的微生物组装系统,包括核心-壳结构和选择性簇状结构,具有刺激响应功能的生物传感器设计 | 合成生物学,医学 |
| 67 | 2025-10-05 |
Establishing Halomonas as a chassis for industrial biotechnology: advances in synthetic biology tool development and metabolic engineering strategies
2025-Jun-12, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02757-2
PMID:40506695
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综述 | 本文综述了盐单胞菌作为工业生物技术底盘生物的发展现状,重点介绍了合成生物学工具开发和代谢工程策略 | 将盐单胞菌确立为新一代工业生物技术的底盘生物,利用其耐高盐特性实现开放非无菌培养 | NA | 建立盐单胞菌作为工业生物技术的底盘生物平台 | 盐单胞菌属微生物 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 克隆载体, 基因组编辑系统 | 盐单胞菌 | 代谢工程, 生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 68 | 2025-10-05 |
Complexity Meets Risk-The Next Generation of Genome-Edited Plants Challenges Established Concepts for Environmental Risk Assessment in the EU
2025-Jun-05, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14111723
PMID:40508397
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研究论文 | 分析新一代基因组编辑植物对欧盟环境风险评估框架的挑战 | 提出针对复杂代谢途径修饰植物的假设驱动评估方法,补充现有比较评估的不足 | 基于案例研究分析,需要更多实证研究验证建议方法的有效性 | 评估欧盟现行环境风险评估方法对复杂基因组编辑植物的适用性 | 基因组编辑植物及其环境风险评估方法 | NA | NA | 基因组编辑技术 | NA | 案例研究数据 | NA | 基因组编辑 | 植物 | 复杂代谢途径修饰 | 农业,环境 |
| 69 | 2025-10-05 |
Unraveling the regulatory dynamics of bidirectional promoters for modulating gene co-expression and metabolic flux in Saccharomyces cerevisiae
2025-Jun-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf511
PMID:40503683
|
研究论文 | 本研究通过全基因组筛选和表征酵母双向启动子,揭示了其调控机制并开发了AI指导的工程化方法 | 首次系统鉴定749个酵母双向启动子,发现启动子强度不对称性,并利用AI模型DREAM-CNN预测关键调控基序 | 研究仅限于酿酒酵母体系,未在其他生物系统中验证 | 解析双向启动子的调控机制并开发合成生物学应用 | 酿酒酵母中的749个双向启动子候选序列 | 合成生物学 | NA | 全基因组筛选、转录组分析、荧光报告基因分析、计算机诱变 | DREAM-CNN | 基因组序列、转录组数据、荧光表达数据 | 749个双向启动子候选序列 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 双向启动子调控的基因共表达系统、代谢通路调控 | 工业生物技术 |
| 70 | 2025-10-05 |
Prospects of Synthetic Biology-Based Approaches in the Enhanced Production of Pyocyanin in Pseudomonas aeruginosa MCCB 117 as the Drug of Choice in Aquaculture
2025-Jun-03, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04279-x
PMID:40459729
|
综述 | 探讨利用合成生物学方法提高铜绿假单胞菌中绿脓菌素产量的前景 | 首次系统探讨合成生物学工具在绿脓菌素生物合成中的应用潜力 | NA | 通过基因水平操作提高绿脓菌素产量以满足水产养殖需求 | 铜绿假单胞菌MCCB 117及其绿脓菌素生物合成途径 | 合成生物学 | 弧菌病 | 基因水平操作 | NA | NA | NA | NA | 铜绿假单胞菌 | 绿脓菌素生物合成途径 | 农业 |
| 71 | 2025-10-05 |
Effect of glycosylation on protein folding: From biological roles to chemical protein synthesis
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112605
PMID:40502693
|
综述 | 本文综述了糖基化在蛋白质折叠中的双重作用及其在化学蛋白质合成中的应用 | 提出了临时糖基化支架策略,为化学蛋白质合成提供可逆的折叠引导方法 | NA | 探讨糖基化对蛋白质折叠的影响及其在合成生物学中的应用 | 糖基化修饰的蛋白质 | 合成生物学 | NA | 化学蛋白质合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 医药 |
| 72 | 2025-10-05 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-Jun-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
|
研究论文 | 本研究表征了一种共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,用于微生物合成苯乙烯 | 通过真菌铁酸盐脱羧酶的多序列比对设计出首个共识蛋白PSC1,解决了苯乙烯生物合成中关键脱羧步骤的挑战 | NA | 开发高效的微生物合成苯乙烯的生物工艺 | 共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1及其在苯乙烯生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质晶体学、定点突变、共识设计 | NA | 蛋白质结构数据、酶活性数据 | NA | 遗传工程 | 恶臭假单胞菌DOT-T1E | 苯乙烯生物合成途径:L-苯丙氨酸→反式肉桂酸→苯乙烯的两步代谢途径 | 工业生物技术 |
| 73 | 2025-10-05 |
Detection of TuMV by a toehold switch sensor coupled with NASBA amplification in Pseudostellaria heterophylla
2025-Jun-09, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-025-01394-5
PMID:40490766
|
研究论文 | 开发了一种基于核酸序列扩增和toehold开关传感器的无细胞表达系统,用于检测太子参中的芜菁花叶病毒 | 结合NASBA扩增和toehold开关传感器,实现了快速、高灵敏度的病毒检测,可直接用于田间样品 | 未明确说明检测系统的稳定性和长期保存性能 | 开发高效检测太子参中芜菁花叶病毒的诊断系统 | 太子参植物和芜菁花叶病毒 | 合成生物学 | 植物病毒感染 | 核酸序列扩增(NASBA), toehold开关传感器 | NA | RNA片段 | 田间样品(纯化和粗提RNA提取物) | toehold开关 | 无细胞表达系统 | toehold开关传感器结合视觉报告基因 | 农业,医学 |
| 74 | 2025-10-05 |
Biosourced Functional Hydroxybenzoate-co-Lactide Polymers with Antimicrobial Activity
2025-Jun-04, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c04624
PMID:40380948
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研究论文 | 本研究通过合成生物学和化学方法开发了具有抗菌活性的可降解生物源聚合物 | 结合真菌工程宿主异源生产单体前体与化学修饰,构建了新型羟基苯甲酸-丙交酯共聚物库 | 仅针对革兰氏阳性菌进行了测试,缺乏对其他病原体的广谱抗菌活性验证 | 开发具有抗菌活性的可降解生物源聚合物以应对抗生素耐药性问题 | 4-(甲基/烯丙基/苄基)氧基-6-(H/烷基)-2-氧-苯甲酸-丙交酯基聚合物 | 合成生物学 | 细菌感染 | 异源生产、化学修饰、开环聚合 | NA | 实验数据 | 通过改变[单体]/[引发剂]比例(M/I = 5-30)制备不同聚合度的聚合物 | 合成生物学 | 工程真菌 | NA | 医药 |
| 75 | 2025-10-05 |
Cell-Targeting Bio-Catalytic Killer Protocell for High-Order Assembly Guided Cancer Cell Inhibition
2025-Jun, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202500047
PMID:40270292
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研究论文 | 开发了一种能够通过高阶组装靶向癌细胞的合成治疗性原细胞 | 利用主客体化学构建正交多糖基原细胞,整合靶向配体和催化纳米颗粒实现程序化空间耦合催化反应 | 目前仅进行体外实验验证 | 开发可编程的原细胞治疗系统用于癌症治疗 | 合成原细胞与癌细胞的相互作用 | 合成生物学 | 癌症 | 主客体化学、静电驱动自组装 | NA | 实验数据 | NA | Gibson Assembly | NA | GOx/Pt-AuNP催化反应级联系统,用于生成一氧化氮 | 医学 |
| 76 | 2025-10-05 |
Label-free high-throughput live-cell sorting of genome-wide random mutagenesis libraries for metabolic traits by Raman flow cytometry
2025-Jun-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503641122
PMID:40445753
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研究论文 | 开发了一种基于正介电泳诱导确定性横向位移的拉曼流式细胞分选技术,用于无标记高通量分选代谢性状的基因组随机突变库 | 首次将pDEP-DLD技术应用于拉曼激活细胞分选,实现了对快速运动单细胞的高精度、高通量、无标记分选 | NA | 开发高效筛选代谢性状的细胞分选平台 | 色素和油脂生产酵母的基因组随机突变库 | 合成生物学 | NA | 拉曼流式细胞术 | NA | 拉曼光谱数据 | 超过10个物种的突变体 | 基因组随机突变 | 酵母 | NA | 工业生物技术 |
| 77 | 2025-10-05 |
Toehold Switch-Based Approach for Engineering Acid-Tolerance Modules to Enhance Production Robustness of Industrial E. coli Strains at Low pH
2025-Jun, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70175
PMID:40485106
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研究论文 | 本研究提出了一种基于toehold switch的合成生物学方法,通过构建酸耐受模块来增强工业大肠杆菌菌株在低pH条件下的生产稳定性 | 首次将toehold switch技术应用于构建酸耐受模块,创建了包含约10个构建体的合成模块库,整合了4种酸响应启动子和18个酸抗性基因 | NA | 增强工业微生物的酸耐受性以提高发酵效率和可持续性 | 工业大肠杆菌菌株,特别是赖氨酸生产菌株 | 合成生物学 | NA | toehold switch技术,合成生物学方法 | NA | 转录分析数据,发酵性能数据 | 约10个合成模块构建体 | toehold switch | 大肠杆菌 | 酸耐受模块,包含触发块和开关块,整合酸响应启动子和酸抗性基因 | 工业生物技术 |
| 78 | 2025-10-05 |
Modular and signal-responsive transcriptional regulation using CRISPRi-aided genetic switches in Escherichia coli
2025-Jun-06, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00526-8
PMID:40481524
|
研究论文 | 开发了一种基于CRISPRi的遗传开关平台,通过整合转录因子生物传感器与FnCas12a系统实现精确的转录调控 | 利用FndCas12a的RNase活性直接从生物传感器响应mRNA转录本加工crRNA,结合转录终止子过滤器减少基础转录 | NA | 开发能够克服现有转录调控工具局限性的CRISPRi辅助遗传开关平台 | 大肠杆菌中的转录调控系统 | 合成生物学 | NA | CRISPRi, FnCas12a系统, 转录终止子过滤 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas12a | 大肠杆菌 | 配体诱导遗传开关, 信号放大电路, 代谢遗传开关, 代谢通路重编程 | 工业生物技术, 医药 |
| 79 | 2025-10-05 |
Synthetic Genetic Circuits Enabled in Komagataella phaffii Through T7 RNAP/CRISPRa System
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70036
PMID:40490955
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研究论文 | 本研究在Komagataella phaffii中开发了基于T7转录系统和CRISPRa的合成基因回路 | 首次在Komagataella phaffii中实现T7 RNAP/CRISPRa系统,开发了PT7-tRNA-sgRNA阵列增强转录效率,构建了布尔逻辑基因回路和UPR自响应系统 | NA | 开发适用于工业Komagataella phaffii菌株的基因调控工具包 | Komagataella phaffii工业菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPRa、T7转录系统、Tet-on诱导系统、split-T7系统、HH-HDV RNA切割 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, T7 RNAP | Komagataella phaffii | 布尔逻辑基因回路(AND和OR逻辑运算)、UPR自响应系统、PT7-tRNA-sgRNA阵列 | 工业生物技术 |
| 80 | 2025-10-05 |
Recent Advances in Genome Base Editing Technology and Its Applications in Industrial Microorganism
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70052
PMID:40490981
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综述 | 系统总结基因组碱基编辑技术的发展历程及其在工业微生物中的应用 | 全面涵盖多种碱基编辑器类型及其优化策略,重点关注工业微生物应用场景 | NA | 促进碱基编辑技术在合成生物学中的广泛应用并加速其转化潜力 | 碱基编辑技术及其在工业微生物中的应用 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑技术,CRISPR/Cas9系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌, 谷氨酸棒杆菌, 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母, 黑曲霉 | NA | 工业生物技术 |