合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
61	2025-06-20	Strategy for Generating Giant Unilamellar Vesicles with Tunable Size Using the Modified cDICE Method 2025-Jun-19, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00026 PMID:40536055	研究论文	本研究探讨了一种优化策略，通过使用改良的连续液滴界面交叉封装方法，从水包油乳液滴中生成具有可调尺寸的巨型单层囊泡（GUVs）	通过系统调整关键参数（如腔室旋转时间、角频率和内溶液密度）来优化GUVs的尺寸分布，并研究了内溶液盐度对封装效率的影响	该方法在囊泡尺寸分布上存在广泛且难以控制的问题，这是构建人工细胞的一个显著缺点	优化巨型单层囊泡（GUVs）的尺寸分布，以促进合成生物学应用中具有生物相关性质的细胞大小隔室的创建	巨型单层囊泡（GUVs）	合成生物学	NA	改良的连续液滴界面交叉封装方法（modified cDICE）	NA	NA	NA
62	2025-06-20	Cardiac Regeneration From Scar to Syncytium: Mitigating the Formation of Scar Tissue 2025-Jun-18, Cardiology in review IF:2.0Q3 DOI:10.1097/CRD.0000000000000972 PMID:40530862	综述	本文综述了当前心脏再生医学中的各种方法，包括细胞疗法、细胞外囊泡、直接心脏重编程、基因编辑以及合成生物学和组织工程	探讨了从细胞疗法到基因编辑和合成生物学的多学科创新，重新定义了心脏护理的边界	未提及具体临床试验结果或大规模应用的可行性	探讨心脏再生医学的当前方法和未来方向，以改善心脏功能	心肌梗死和心力衰竭患者的心脏组织	心血管医学	心血管疾病	细胞疗法、细胞外囊泡、直接心脏重编程、基因编辑（CRISPR/Cas9）、合成生物学和组织工程	NA	NA	NA
63	2025-06-20	Synthetic biology-driven induction of mature TLS formation enhances antitumor immunity in colorectal cancer 2025-Jun-18, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.ado8395 PMID:40531967	研究论文	该研究通过合成生物学方法诱导成熟三级淋巴结构(mTLS)的形成，以增强结直肠癌(CRC)的抗肿瘤免疫反应	首次设计了一种表达LIGHT的工程菌株SLC，通过LIGHT-HVEM信号通路特异性诱导mTLS形成，并揭示了ILC3在该过程中的关键作用	研究仅在两种CRC小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验	探索通过诱导mTLS形成增强结直肠癌免疫治疗效果的新方法	结直肠癌微环境中的免疫细胞和三级淋巴结构	合成生物学	结直肠癌	工程菌株构建、免疫组化分析	NA	动物实验数据	两种不同CRC小鼠模型
64	2025-06-20	A Tn5 Transposase-Based System for High-Efficiency Genome-Wide Gene Activation in Escherichia coli 2025-Jun-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00170 PMID:40527878	研究论文	开发了一种基于Tn5转座酶的系统，用于在大肠杆菌中高效实现全基因组基因激活	利用Tn5转座酶系统实现全基因组范围的基因激活，为功能基因组学和合成生物学提供新工具	未明确说明系统的插入位点偏好性或可能的脱靶效应	开发高效的全基因组基因激活工具以促进细菌工程研究	大肠杆菌的基因组	合成生物学	NA	Tn5转座酶系统	NA	基因组数据	未明确说明具体样本数量
65	2025-06-20	Functional identification of 10-hydroxygeraniol oxidoreductases related to camptothecin biosynthesis in Ophiorrhiza pumila 2025-Jun-13, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145253 PMID:40517854	研究论文	本研究在全基因组范围内鉴定了与喜树碱生物合成相关的10-羟基香叶醇氧化还原酶，并验证了其中三个酶的功能	首次在全基因组范围内鉴定并验证了Ophiorrhiza pumila中与喜树碱生物合成相关的10HGOs酶的功能	仅验证了三个10HGOs酶的功能，未对其他12个10HGOs进行功能验证	鉴定与喜树碱生物合成相关的酶编码基因，为利用合成生物学工具在异源系统中重建喜树碱生物合成途径提供元件	Ophiorrhiza pumila中的10-羟基香叶醇氧化还原酶(10HGOs)	合成生物学	癌症	基因组学分析、酶活性测定、转基因技术	NA	基因组数据、酶活性数据	15个10HGOs基因，其中3个进行了功能验证
66	2025-06-19	AlphaDesign: a de novo protein design framework based on AlphaFold 2025-Jun-17, Molecular systems biology IF:8.5Q1 DOI:10.1038/s44320-025-00119-z PMID:40527958	research paper	介绍了一种名为AlphaDesign的从头蛋白质设计框架，结合了AlphaFold和自回归扩散模型，用于快速生成和计算验证具有可控相互作用、构象和寡聚状态的蛋白质	结合AlphaFold与自回归扩散模型，无需类别依赖的模型重新训练或微调，即可设计具有特定功能的蛋白质	未提及具体的技术限制或实验验证的局限性	开发一种通用的从头蛋白质设计框架，用于合成生物学中的蛋白质设计	细菌噬菌体防御系统中有毒效应子retrons的抑制剂	synthetic biology	NA	AlphaFold, autoregressive diffusion models	AlphaFold, autoregressive diffusion models	protein sequences and structures	NA
67	2025-06-19	Rosmarinic Acid as Bioactive Compound: Molecular and Physiological Aspects of Biosynthesis with Future Perspectives 2025-06-05, Cells IF:5.1Q2 DOI:10.3390/cells14110850 PMID:40498026	综述	本文综述了迷迭香酸（RA）的生物合成、分子机制及其生理功能，并探讨了提高其产量的生物技术方法	探讨了合成生物学和代谢工程技术在提高迷迭香酸工业产量中的应用	未提及具体实验数据或样本量，主要为基础研究和综述	研究迷迭香酸的生物合成途径及其生物活性，探索提高其产量的方法	迷迭香酸及其在植物中的生物合成	植物生物技术	NA	植物细胞组织培养、合成生物学、代谢工程	NA	NA	NA
68	2025-06-18	Investigating the Potential of Division of Labor in Synthetic Bacterial Communities for the Production of Violacein 2025-Jun-17, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.5c00120 PMID:40525226	研究论文	本研究探讨了在合成细菌群落中分工对紫胶素生产的潜在益处	通过将紫胶素生物合成途径分配到两个亚群中，实现了2.5倍的产量提升	研究仅基于E. coli的合成群落，未探索其他微生物系统	探索分工策略对复杂代谢产物生产效率的提升	合成细菌群落和紫胶素生产途径	合成生物学	NA	代谢工程	NA	NA	使用基于E. coli的合成群落进行实验
69	2025-06-18	'Intelligent' proteins 2025-Jun-14, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1 DOI:10.1007/s00018-025-05770-1 PMID:40515853	research paper	本文提出了一种挑战传统蛋白质分子观点的新理念，认为蛋白质表现出一种基本的‘智能’形式	结合整合信息理论(IIT)、网络理论和变构效应，重新定义蛋白质智能，并探讨其信息处理、环境适应和记忆行为	将智能概念应用于分子系统存在挑战，且如何设计适应性‘智能’蛋白质仍需解决	探索蛋白质的动态和适应性本质，为蛋白质工程、药物设计和合成生物学提供新视角	蛋白质分子	生物化学	NA	整合信息理论(IIT)、网络理论、变构效应分析	NA	理论分析	NA
70	2025-06-18	Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA Under Multifactorial Conditions 2025-Jun-11, Angewandte Chemie (International ed. in English) DOI:10.1002/anie.202507190 PMID:40498537	研究论文	本文开发了一种高通量5D荧光共振能量转移熔解退火(5DFRETMA)方法，用于研究环境及序列因素如何调控三链DNA的稳定性	开发了5DFRETMA方法，首次预测了可变温度和离子环境下的pH稳定性，并揭示了离子强度对三链DNA稳定性的双重影响	NA	揭示环境和序列因素如何调控三链DNA的稳定性，并开发预测模型	三链DNA	生物物理学	NA	5D荧光共振能量转移熔解退火(5DFRETMA)	预测模型	荧光数据	至少414组缓冲条件
71	2025-06-18	Real-Time Fluorescence-Based Method for Dynamic Quantification of Droplet Network Assembly 2025-Jun-10, ACS omega IF:3.7Q2 DOI:10.1021/acsomega.5c02156 PMID:40521463	research paper	该研究介绍了一种基于荧光的分子信标方法，用于实时监测液滴组装，提高了合成生物学和中尺度材料应用的精确度	与传统成像技术（如显微镜图像的皮尔逊相关性）不同，这种直接方法能够以高灵敏度连续量化动态液滴相互作用	NA	提高合成生物学和中尺度材料应用中液滴组装的精确度	液滴网络组装	合成生物学	NA	荧光基分子信标方法	NA	荧光信号	NA
72	2025-06-17	Leveraging gene editing to combat methane emissions in ruminant agriculture 2025-Jun-14, Trends in biotechnology IF:14.3Q1 DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.020 PMID:40518326	综述	探讨利用基因编辑技术减少反刍动物甲烷排放的研究进展	利用CRISPR/Cas基因编辑技术靶向改造饲料作物和瘤胃产甲烷菌，以减少甲烷排放	递送方法、基因靶向特异性、生态影响和监管接受度方面仍存在挑战	开发可持续农业和气候变化缓解的有效甲烷减排解决方案	反刍动物及其相关的饲料作物和瘤胃产甲烷菌	合成生物学	NA	CRISPR/Cas基因编辑	NA	NA	NA
73	2025-06-16	An old dog with new tricks - the value of photorespiration as a central metabolic hub with implications for environmental acclimation 2025-Jun-14, Plant physiology IF:6.5Q1 DOI:10.1093/plphys/kiaf258 PMID:40515676	research paper	本文探讨了光呼吸作为中心代谢枢纽的价值及其对环境适应的意义	揭示了光呼吸途径中的新代谢参与者、复杂的细胞器间相互作用和新的调控网络，以及光呼吸在保卫细胞中的新作用	NA	增强光合效率，提高植物对未来气候的适应能力	光呼吸及其在光合作用中的作用	植物生理学	NA	同位素标记研究、反向遗传学、合成生物学方法	NA	NA	NA
74	2025-06-16	DNA-programmed responsive microorganism assembly with controlled patterns and behaviors 2025-Jun-13, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.ads8651 PMID:40512851	研究论文	该研究展示了利用功能性DNA作为可编程表面受体来调控微生物群落的模式和行为	通过代谢标记和疏水插入方法，将DNA修饰到多种微生物上，实现了对微生物组装的精确空间控制和刺激响应性聚集	NA	开发可编程的微生物粘附方法以构建具有可控模式和行为的微生物群落	革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌和休眠孢子等多种微生物	合成生物学	NA	代谢标记、疏水插入、DNA编程	NA	NA	多种微生物（包括革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌）
75	2025-06-16	Establishing Halomonas as a chassis for industrial biotechnology: advances in synthetic biology tool development and metabolic engineering strategies 2025-Jun-12, Microbial cell factories IF:4.3Q1 DOI:10.1186/s12934-025-02757-2 PMID:40506695	综述	本文综述了Halomonas作为工业生物技术底盘生物的最新进展，包括合成生物学工具开发和代谢工程策略	突出了Halomonas在高盐条件下生长的独特优势及其在开放、非无菌条件下培养的潜力	转化困难等工具应用面临的挑战	探讨Halomonas作为工业生物技术底盘生物的潜力	Halomonas菌种	工业生物技术	NA	合成生物学工具、代谢工程	NA	NA	NA
76	2025-06-16	Fungal bioconversion of lignin-derived aromatics: Pathways, enzymes, and biotechnological potential 2025-Jun-10, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108624 PMID:40505753	综述	本文综述了真菌对木质素衍生芳香化合物的生物转化途径、酶及其生物技术潜力	系统性整合了芳香族分解代谢途径的最新研究进展，强调了真菌转运系统在芳香化合物吸收和外排中的关键作用	对芳香族分解代谢途径的系统整合仍显零散	推动基于真菌的平台用于可再生芳香族化合物的可持续生产	木质素衍生芳香化合物（如肉桂酸、没食子酸、阿魏酸和香草醛）	生物技术	NA	合成生物学、计算建模和系统生物学	NA	NA	NA
77	2025-06-16	Complexity Meets Risk-The Next Generation of Genome-Edited Plants Challenges Established Concepts for Environmental Risk Assessment in the EU 2025-Jun-05, Plants (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/plants14111723 PMID:40508397	research paper	该论文探讨了新一代基因组编辑植物对欧盟环境风险评估（ERA）现有概念的挑战，并提出了一种假设驱动的评估方法	提出了针对复杂基因组编辑植物的假设驱动评估方法，补充现有比较评估方法的不足	研究主要基于案例分析，可能缺乏广泛的实证支持	评估欧盟现行的环境风险评估方法在处理复杂基因组编辑植物时的适用性	基因组编辑植物（GMPs）及其环境风险评估	生物技术	NA	基因组编辑技术	NA	案例分析数据	NA
78	2025-06-15	Advances in engineered models of peri-gastrulation 2025-Jun-20, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.112659 PMID:40510116	research paper	本文讨论了利用干细胞技术和工程工具整合的工程模型在研究人类发育早期阶段中的应用	整合了工程技术和合成生物学工具，提高了模型的精确度，为人类早期发育阶段的研究提供了新视角	NA	研究人类发育早期阶段的细胞分化和组织形成	人类早期发育阶段的细胞和组织	synthetic biology	NA	stem cell technology, micropatterned substrates, microfluidic systems, synthetic biology tools	blastoids, 2D micropatterned systems, 3D gastruloid constructs, somitoids	NA	NA
79	2025-06-15	Unraveling the regulatory dynamics of bidirectional promoters for modulating gene co-expression and metabolic flux in Saccharomyces cerevisiae 2025-Jun-06, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaf511 PMID:40503683	研究论文	本研究通过全基因组筛选和表征酵母中的双向启动子（BDPs），揭示了其调控机制并应用于代谢通量的精细调控	利用DREAM-CNN AI预测模型识别BDPs中的保守激活剂结合热点，并通过实验验证这些热点对BDP功能的关键作用	研究仅针对酵母Saccharomyces cerevisiae，未在其他生物体中验证BDPs的普适性	探索双向启动子的调控机制并应用于合成生物学中的基因共表达和代谢通量调控	酵母Saccharomyces cerevisiae中的749个双向启动子候选者	合成生物学	NA	全基因组筛选、转录组分析、荧光报告分析、计算机模拟突变	DREAM-CNN	基因组数据、转录组数据、荧光报告数据	749个双向启动子候选者
80	2025-06-15	Prospects of Synthetic Biology-Based Approaches in the Enhanced Production of Pyocyanin in Pseudomonas aeruginosa MCCB 117 as the Drug of Choice in Aquaculture 2025-Jun-03, Current microbiology IF:2.3Q3 DOI:10.1007/s00284-025-04279-x PMID:40459729	综述	本文探讨了利用合成生物学方法提高铜绿假单胞菌MCCB 117中绿脓菌素产量的前景，以作为水产养殖中的首选药物	提出了利用合成生物学工具增强绿脓菌素生物合成的分子机制和基因水平操作的新方法	未提及具体实验数据或实施细节	研究如何通过合成生物学方法提高绿脓菌素的产量，以应用于可持续水产养殖生产系统	铜绿假单胞菌MCCB 117及其绿脓菌素生物合成途径	合成生物学	弧菌病	基因水平操作	NA	NA	NA