合成生物学相关文章
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当前共找到 131 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-06-12 |
Toehold Switch-Based Approach for Engineering Acid-Tolerance Modules to Enhance Production Robustness of Industrial E. coli Strains at Low pH
2025-Jun, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70175
PMID:40485106
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研究论文 | 本研究提出了一种基于toehold switch的合成生物学方法，用于增强工业大肠杆菌菌株在低pH条件下的酸耐受性 | 利用toehold switch构建酸耐受模块，整合多种酸响应启动子和抗酸基因，显著提高工业菌株在低pH条件下的生产稳定性 | 研究仅针对特定工业赖氨酸生产菌株，未验证在其他工业菌株中的普适性 | 提高工业微生物的酸耐受性以增强发酵效率和可持续性 | 工业大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | toehold switch技术 | NA | 基因表达数据 | 约10个构建模块，包含4种酸响应启动子和18个抗酸基因 |
| 82 | 2025-06-11 |
DASH: a versatile and high-capacity gene stacking system for plant synthetic biology
2025-Jun-10, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70179
PMID:40493021
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研究论文 | 介绍了一种名为DASH的多功能高容量基因堆叠系统，用于植物合成生物学 | 结合了Golden Gate克隆、重组工程和位点特异性重组酶系统的特点，解决了现有DNA组装系统的多个限制 | NA | 开发一种更高效、灵活的基因组装工具，用于植物合成生物学 | 植物基因组装系统 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、重组工程、位点特异性重组酶系统 | NA | DNA序列 | 一个116 kb的DNA构建体，包含35个转录单元 |
| 83 | 2025-06-11 |
A discovery platform for identification of host-induced bacterial biosensors from diverse sources
2025-Jun-09, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00123-3
PMID:40490500
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研究论文 | 该研究开发了一个用于识别宿主诱导细菌生物传感器的发现平台，扩展了生物传感器筛选的灵活性和能力 | 利用细菌记忆电路构建了来自多种肠道细菌的传感器组件库，并通过超变DNA条形码实现并行追踪数千个独特克隆 | 研究中使用的传感器组件库可能仍有限，且需要进一步验证其在不同环境中的稳定性和可靠性 | 开发合成生物学工具，用于复杂环境中的部署，如肠道内的合成功能自主控制和炎症性疾病的非侵入性监测 | 肠道微生物及其传感器组件 | 合成生物学 | 炎症性疾病 | 双组分系统识别和克隆流程，超变DNA条形码技术 | NA | 基因序列数据 | 数千个独特克隆，对应约150个潜在生物传感器 |
| 84 | 2025-06-11 |
Modular and signal-responsive transcriptional regulation using CRISPRi-aided genetic switches in Escherichia coli
2025-Jun-06, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00526-8
PMID:40481524
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPRi的遗传开关平台，用于在大肠杆菌中实现模块化和信号响应的转录调控 | 整合了转录因子生物传感器与FnCas12a CRISPR系统，利用FndCas12a的RNase活性直接从生物传感器响应的mRNA转录物处理crRNA，实现了精确的信号依赖性转录调控 | NA | 克服现有转录调控工具的局限性，扩展合成生物学中转录调控工具的功能 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPRi, FnCas12a CRISPR系统 | NA | NA | NA |
| 85 | 2025-06-11 |
The Matter/Life Nexus in Biological Cells
2025-Jun, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
|
research paper | 探讨了无生命物质与生命之间的区别，以及物理学与细胞生物化学之间的紧密耦合如何揭示物质/生命关系 | 结合实验和计算进展，探索物理学与细胞生物化学的深度耦合，为理解物质与生命的关系提供新视角 | 目前仍无法从原子和分子成分从头构建一个活细胞，表明对生命本质的理解仍有限 | 探索物质与生命之间的区别，以及如何通过物理学和生物化学的耦合来理解这一关系 | 生物细胞及其物理和生物化学特性 | systems biology | NA | whole-cell modeling and synthesis | NA | NA | NA |
| 86 | 2025-06-11 |
Synthetic Genetic Circuits Enabled in Komagataella phaffii Through T7 RNAP/CRISPRa System
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70036
PMID:40490955
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研究论文 | 本研究展示了在Komagataella phaffii中通过T7 RNAP/CRISPRa系统构建合成遗传电路的潜力 | 利用T7转录系统有效表达sgRNA，并通过插入tRNA序列增强转录激活效率，设计了能进行布尔逻辑运算的基因电路 | NA | 探索在工业Komagataella phaffii菌株中构建基因调控工具包 | Komagataella phaffii菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPRa, T7转录系统, Tet-on诱导系统, split-T7系统, HH-HDV RNA切割处理 | NA | NA | NA |
| 87 | 2025-06-11 |
Recent Advances in Genome Base Editing Technology and Its Applications in Industrial Microorganism
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70052
PMID:40490981
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review | 本文系统总结了碱基编辑技术的发展历史、最新进展及其在工业微生物构建中的应用 | 全面概述了多种主要碱基编辑器（如CBEs、ABEs、CRISPR-free碱基编辑器等）及其优化策略，并探讨了其在工业微生物构建中的应用 | NA | 促进碱基编辑技术在合成生物学中的广泛应用并加速其转化潜力 | 工业微生物（如枯草芽孢杆菌、谷氨酸棒状杆菌、酿酒酵母等） | 合成生物学 | NA | 碱基编辑技术（如CBEs、ABEs、CGBEs等） | NA | NA | NA |
| 88 | 2025-06-11 |
The people behind the papers - Sarah Soliman and Zara Weinberg
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204920
PMID:40493005
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研究论文 | 该研究介绍了一套小分子和细胞接触诱导系统，用于控制小鼠胚胎干细胞中的基因表达和分化 | 开发了新的小分子和细胞接触诱导系统，用于模拟发育过程 | NA | 研究发育生物学的原理 | 小鼠胚胎干细胞 | 合成生物学 | NA | 小分子和细胞接触诱导系统 | NA | NA | NA |
| 89 | 2025-06-10 |
Dynamical mechanisms of growth-feedback effects on adaptive gene circuits
2025-Jun-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89170
PMID:40470804
|
研究论文 | 本文研究了工程基因电路在宿主细胞中的动态机制，特别是生长反馈对电路性能的影响 | 系统研究了400多种拓扑结构，揭示了电路失败的三种动态机制，并发现了一种电路鲁棒性度量与生长反馈强度之间的比例关系 | 研究主要基于计算模拟，需要进一步的实验验证 | 理解基因电路与宿主细胞间的相互作用机制，特别是生长反馈对电路性能的影响 | 工程基因电路的拓扑结构和动态行为 | 合成生物学 | NA | 转录调控电路 | NA | 计算模拟数据 | 400多种拓扑结构 |
| 90 | 2025-06-10 |
From molecular mechanisms to clinical translation: Silk fibroin-based biomaterials for next-generation wound healing
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144266
PMID:40381758
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综述 | 本文系统总结了丝素蛋白（SF）及其复合材料在伤口愈合中的制备策略、功能修饰和多维应用机制 | 整合了SF分子机制和材料设计的最新进展，并强调其在精准医学中的潜力，如开发基因工程SF用于定制免疫调节网络 | 当前SF材料开发面临的挑战包括机械稳定性、降解可控性以及大规模生产的标准化 | 开发高效、多功能且可临床转化的SF基材料用于伤口愈合 | 丝素蛋白（SF）及其复合材料 | 生物材料 | 伤口愈合 | 3D生物打印和合成生物学技术 | NA | NA | NA |
| 91 | 2025-06-09 |
DNA-Based Signal Circuit for Self-Regulated Bidirectional Communication in Protocell-Living Cell Communities
2025-Jun-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202503903
PMID:40195061
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研究论文 | 设计了一种基于DNA的信号电路，用于在原始细胞与活细胞群落中实现自我调节的双向通信 | 开发了一种包含识别模块、激活模块和反馈模块的DNA电路，使原始细胞能够通过感知和响应活细胞释放的信号来自主调节与活细胞的相互作用 | NA | 开发合成生物学工具以控制细胞间信号传导，从而编程所需的细胞行为 | 原始细胞与活细胞群落的相互作用 | 合成生物学 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | NA |
| 92 | 2025-06-09 |
QM/MM Unlocks The Catalytic Mechanism of YtfE: The Structural Reorganization of The Active Site Enables Nitrite-to-NO Conversion
2025-Jun-06, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202500817
PMID:40296212
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研究论文 | 本研究通过多尺度计算方法揭示了YtfE蛋白在亚硝酸盐还原过程中的催化机制 | 揭示了活性位点结构重组对亚硝酸盐还原机制的关键调控作用，特别是氢键网络变化和HONO中间体配位转换的影响 | 研究主要基于计算模拟，需要后续实验验证 | 阐明YtfE蛋白催化亚硝酸盐还原的分子机制 | 大肠杆菌铁中心修复蛋白(YtfE) | 计算生物学 | NA | QM/MM, QM/MM MD, QM计算 | NA | 计算模拟数据 | NA |
| 93 | 2025-06-07 |
Current AI technologies in cancer diagnostics and treatment
2025-Jun-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02369-9
PMID:40457408
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综述 | 本文系统回顾了当前人工智能技术在癌症诊断和治疗中的应用现状 | 强调了深度学习在早期癌症检测中的日益重要作用，并探讨了AI在基因组学、生物标志物发现、液体活检和非侵入性诊断中的应用 | 讨论了数据隐私、可解释性和监管问题等重要挑战 | 评估人工智能在癌症诊疗领域的应用潜力 | 癌症诊断和治疗技术 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习 | NA | 多模态医学影像（CT、MRI、PET、超声）和数字病理数据 | NA |
| 94 | 2025-06-07 |
CRISPR-Cas: a game-changer in vaccine development and the fight against viral infections
2025-Jun, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2025.02.006
PMID:40069074
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review | 本文综述了CRISPR-Cas系统在病毒-宿主相互作用研究、抗病毒治疗及疫苗开发中的最新进展 | 探讨了CRISPR-Cas系统在识别病毒关键受体和宿主因子以及作为抗病毒策略和疫苗开发工具的创新应用 | 未具体提及CRISPR-Cas技术在临床应用中的潜在限制或挑战 | 推进对病毒-宿主相互作用的理解并开发有效的抗病毒策略 | 病毒-宿主相互作用、抗病毒治疗及疫苗开发 | synthetic biology | viral infections | CRISPR-Cas | NA | NA | NA |
| 95 | 2025-06-07 |
SubtiToolKit: a bioengineering kit for Bacillus subtilis and Gram-positive bacteria
2025-Jun, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.004
PMID:40074634
|
research paper | 介绍SubtiToolKit（STK），一种针对枯草芽孢杆菌和革兰氏阳性菌的高效克隆工具包 | 填补了革兰氏阳性菌在合成生物学工具包领域的空白，提供模块化标准DNA部件库，支持转录单元、操纵子及基因敲入/敲除应用 | 未提及具体实验验证数据或与其他工具包的性能对比 | 开发适用于革兰氏阳性菌的标准化DNA构建工具，推动合成生物学研究 | 枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）及其他革兰氏阳性菌（如Geobacillus和Parageobacillus工业菌株） | 合成生物学 | NA | Golden Gate（GG）克隆方法 | NA | DNA序列 | 未明确说明具体菌株数量，但包含多类标准化DNA部件（启动子、RBS、荧光蛋白等） |
| 96 | 2025-06-07 |
From academia to real-life biotech: 'It takes a village'
2025-Jun, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.014
PMID:40089442
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research paper | 本文描述了一个分析合成生物学在学术界与产业界交界处应用的研讨会 | 探讨了如何将学术研究成功转化为生物技术企业，并讨论了支持这一转化的基础设施 | NA | 分析学术研究向生物技术企业转化的过程及所需支持 | 合成生物学在学术界与产业界的交界处 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 97 | 2025-06-06 |
Magnetically driven lipid vesicles for directed motion and light-triggered cargo release
2025-Jun-05, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr00942a
PMID:40396421
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研究论文 | 本研究探讨了磁性驱动的脂质囊泡在定向运动和光触发货物释放中的应用 | 开发了一种结合磁性驱动和光诱导不对称氧化的脂质囊泡系统，实现了定向运动和按需释放 | 研究仍处于概念验证阶段，尚未进行体内实验验证 | 开发具有导航控制和按需释放能力的脂质基药物递送载体 | 磁性颗粒包裹的巨型单层囊泡(magGUVs) | 合成生物学 | NA | 微流控技术、光诱导不对称氧化 | 晶格玻尔兹曼模拟框架 | 实验测量数据 | NA |
| 98 | 2025-06-06 |
MOSAIC: A Highly Efficient, One-Step Recombineering Approach to Plasmid Editing and Diversification
2025-Jun-05, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00657
PMID:40471122
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research paper | 介绍了一种名为MOSAIC的高效一步重组工程方法，用于质粒编辑和多样化 | 提出了一种快速、高效的质粒编辑和组合质粒库生成方法，利用单链DNA退火蛋白CspRecT，单次转化即可实现高达90%的单目标质粒编辑效率，并能生成跨越四个不同目标区域的组合质粒库 | 未提及具体的应用限制或技术瓶颈 | 开发一种简单、快速且资源高效的质粒编辑和多样化方法，用于分子和合成生物学应用 | 质粒和组合质粒库 | 合成生物学 | NA | 单链DNA退火蛋白CspRecT和Nanopore测序 | NA | DNA序列数据 | 未提及具体样本数量 |
| 99 | 2025-06-06 |
Harnessing flavonoids to control probiotic function: in situ application of a naringenin-responsive genetic circuit
2025-Jun-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02890-24
PMID:40277392
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research paper | 该研究开发了一种基于黄酮类化合物的遗传电路，用于控制益生菌功能，并在小鼠肠道中进行了原位应用 | 首次在宿主-微生物条件下应用了黄酮类化合物响应的遗传电路，并展示了其在小鼠肠道中的功能 | 未来研究需要评估更低剂量的柚皮素及富含柚皮素的食物作为替代输入 | 通过合成生物学增强益生菌的功能，利用黄酮类化合物作为遗传电路的输入 | 益生菌Escherichia coli Nissle 1917 (EcN)和小鼠肠道 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计，荧光素酶报告系统 | NA | 生物发光数据 | 小鼠实验 |
| 100 | 2025-06-06 |
Trends in sustainable single-cell protein from non-grain feedstocks
2025-Jun-03, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.018
PMID:40467368
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research paper | 探讨利用非谷物原料通过微生物发酵生产可持续单细胞蛋白(SCP)的趋势和挑战 | 重点研究非谷物原料的多样化利用、多功能应用扩展以及混合生物系统的整合，特别是合成生物学突破使非谷物原料的利用范围从传统的一碳原料(如甲醇)扩展到二氧化碳 | SCP规模化生产面临菌株鲁棒性不足、基因组编辑精度不够、低密度非谷物原料物流问题以及电化学能源载体安全风险等限制 | 探索可持续蛋白质生产的替代方案，以应对全球粮食需求增长和环境危机 | 非谷物原料生产的单细胞蛋白(SCP) | 生物技术 | NA | 微生物发酵、合成生物学、基因组编辑 | NA | NA | NA |