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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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81 | 2025-06-14 |
Effect of glycosylation on protein folding: From biological roles to chemical protein synthesis
2025-Jun-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112605
PMID:40502693
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review | 探讨糖基化在蛋白质折叠中的双重作用及其在化学蛋白质合成中的应用 | 提出临时糖基化支架策略,为化学蛋白质合成提供可逆的折叠引导方法 | 未提及具体实验数据或样本量,可能缺乏实证支持 | 研究糖基化对蛋白质折叠的影响及其在生物技术和合成生物学中的应用 | 蛋白质折叠及糖基化修饰 | 合成生物学 | NA | 化学蛋白质合成 | NA | NA | NA |
82 | 2025-06-14 |
Characterization of a consensus-designed trans-cinnamic acid decarboxylase for styrene biosynthesis
2025-Jun-11, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00714-25
PMID:40407334
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research paper | 该研究描述了一种共识设计的反式肉桂酸脱羧酶PSC1,用于微生物生物合成苯乙烯 | 设计了一种新型的共识蛋白PSC1,能够在微生物中高效催化反式肉桂酸脱羧生成苯乙烯,并解析了其晶体结构 | NA | 开发更环保的苯乙烯生物合成方法以替代传统石化工艺 | 反式肉桂酸脱羧酶PSC1及其在苯乙烯生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构数据 | NA |
83 | 2025-06-13 |
In Vivo Multicellular Feedback Control in Synthetic Microbial Consortia
2025-Jun-11, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00862
PMID:40499137
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research paper | 提出了一种能够在合成微生物群落中实现稳定和精确基因表达调控的生物分子控制架构 | 通过分布式多细胞反馈回路在两个菌株之间实现分工,克服了传统单细胞生物分子控制策略的复杂性和适应性限制 | NA | 开发一种能够在合成微生物群落中实现稳定和精确基因表达调控的生物分子控制架构 | 合成微生物群落中的基因表达调控 | synthetic biology | NA | biomolecular control architecture | NA | NA | NA |
84 | 2025-06-13 |
Detection of TuMV by a toehold switch sensor coupled with NASBA amplification in Pseudostellaria heterophylla
2025-Jun-09, Plant methods
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s13007-025-01394-5
PMID:40490766
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研究论文 | 开发了一种基于核酸序列扩增(NASBA)和toehold开关传感器的无细胞表达系统,用于检测太子参中的芜菁花叶病毒(TuMV) | 结合NASBA扩增和toehold开关传感器,开发了一种快速、灵敏、特异性强且适用于田间应用的TuMV检测方法 | 未提及该方法在其他病毒检测中的适用性或长期稳定性 | 开发高效诊断系统以控制和减轻太子参中的TuMV感染 | 太子参(Pseudostellaria heterophylla)及其感染的芜菁花叶病毒(TuMV) | 合成生物学 | 植物病毒感染 | NASBA, toehold开关传感器 | NA | RNA片段 | 田间样品(具体数量未提及) |
85 | 2025-06-13 |
Molecular engineering and biotechnological advancements in β-glucosidase for industrial impact: A review
2025-Jun-09, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145133
PMID:40499858
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综述 | 本文综述了β-葡萄糖苷酶(BGL)在分子工程和生物技术方面的进展及其工业应用 | 讨论了多种酶工程策略,如异源表达、CRISPR-Cas9基因编辑和组学方法,以提高BGL的催化性能和工业适用性 | 尽管有多种改进策略,BGL的低催化效率、窄底物特异性和对操作条件的敏感性仍限制其大规模应用 | 提高β-葡萄糖苷酶的催化性能和工业应用潜力,以促进可持续和经济的生物转化过程 | β-葡萄糖苷酶(BGL)及其在工业中的应用 | 生物技术 | NA | CRISPR-Cas9, 组学方法(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学), 酶固定化 | NA | NA | NA |
86 | 2025-06-13 |
Biosourced Functional Hydroxybenzoate-co-Lactide Polymers with Antimicrobial Activity
2025-Jun-04, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c04624
PMID:40380948
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研究论文 | 研究通过合成生物学和化学方法设计和制备具有抗菌活性的生物源功能羟基苯甲酸-丙交酯共聚物 | 利用工程真菌宿主异源生产单体前体,并通过化学修饰和开环聚合制备具有抗菌活性的可降解聚合物 | 仅针对革兰氏阳性菌进行了抗菌活性测试,未涉及其他类型病原体 | 开发具有抗菌活性的可降解生物源聚合物 | 4-(甲基/烯丙基/苄基)氧-6-(H/烷基)-2-氧-苯甲酸-丙交酯基聚合物库 | 合成生物学与高分子化学 | 抗菌药物耐药性 | 异源生产、化学修饰、开环聚合 | NA | 化学合成数据 | 不同聚合度的聚合物(M/I = 5-30) |
87 | 2025-06-13 |
Cell-Targeting Bio-Catalytic Killer Protocell for High-Order Assembly Guided Cancer Cell Inhibition
2025-Jun, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202500047
PMID:40270292
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research paper | 该研究设计和构建了一种能够与活细胞进行高阶组装的合成治疗性原细胞,用于靶向消除癌细胞 | 通过宿主-客体化学构建正交多糖基原细胞,并引入细胞靶向配体和类过氧化氢酶铂金纳米颗粒,形成具有生物催化功能的杀手原细胞 | 目前仅进行了体外实验,尚未进行体内验证 | 开发可编程的原细胞治疗系统用于癌症治疗 | 癌细胞 | 合成生物学与生物工程 | 癌症 | 宿主-客体化学、静电驱动自组装 | NA | NA | NA |
88 | 2025-06-12 |
Parallel DLD microfluidics for chloroplast isolation and sorting
2025-Jun-11, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00348b
PMID:40497380
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研究论文 | 本文介绍了一种基于微流控技术的平台,用于基于大小的叶绿体分离 | 该平台整合了四个平行的确定性侧向位移(DLD)阵列,能够在一个设备中同时分离不同大小的叶绿体,提高了分离效率和纯度 | 分离效率在50-85%之间,回收部分的纯度在17-66%之间,仍有提升空间 | 开发一种快速、自动化和可扩展的叶绿体分离方法,以应用于植物研究、生物技术和合成生物学 | 叶绿体 | 生物技术 | NA | 微流控技术,确定性侧向位移(DLD) | NA | NA | NA |
89 | 2025-06-12 |
Cross and unique stress adaptation strategies of the polyextremophile Natranaerobius thermophilus to individual high salt, alkaline pH, and elevated temperature
2025-Jun-06, Journal of proteomics
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.jprot.2025.105479
PMID:40482852
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研究论文 | 研究极端多环境适应菌Natranaerobius thermophilus对高盐、碱性pH和高温的交叉与独特适应策略 | 首次揭示了N. thermophilus对碱性pH和热应激的分子机制,填补了碱性特异性调控过程和热适应机制的研究空白 | 对碱性适应的机制仍不够充分,对热适应的理解仅限于基因组分析 | 解析N. thermophilus对高盐、碱性和热应激的响应机制,揭示其生存策略 | 极端多环境适应菌Natranaerobius thermophilus | 微生物学 | NA | iTRAQ定量蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组数据 | NA |
90 | 2025-06-12 |
Label-free high-throughput live-cell sorting of genome-wide random mutagenesis libraries for metabolic traits by Raman flow cytometry
2025-Jun-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2503641122
PMID:40445753
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research paper | 该论文介绍了一种基于拉曼流式细胞术的无标记高通量活细胞分选技术,用于代谢特征的基因组范围随机诱变库筛选 | 提出了一种新型的pDEP-DLD-RACS技术,能够以高精度、高通量和高效率分选代谢特征突变的活细胞,相比传统方法具有显著的时间和成本优势 | NA | 开发高效筛选代谢特征突变细胞的技术平台 | 产色素和油脂的酵母细胞 | 合成生物学 | NA | 拉曼流式细胞术(RACS), 正介电泳诱导确定性横向位移(pDEP-DLD) | NA | 拉曼光谱数据 | 基因组范围随机诱变库中超过10^7个酵母突变体 |
91 | 2025-06-12 |
Transformative protein scaffold designs for dual-modality cancer applications: Advances in therapeutic delivery and molecular imaging of tumor microenvironments
2025-Jun-03, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144881
PMID:40473172
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综述 | 本文全面分析了基于支架的递送系统在癌症免疫治疗中的最新进展,重点介绍了工程化蛋白质支架作为多功能平台的设计原则、合成方法和治疗应用 | 整合了结构生物学、计算建模和合成生物学的见解,利用AI驱动的生成模型和强化学习算法革新支架设计,同时通过无细胞蛋白质合成系统和正交翻译机制实现复杂结构的按需生产 | 在将这些有前景的平台转化为临床实践方面仍面临挑战 | 开发能够同时解决系统性毒性、肿瘤穿透不足和免疫抑制性肿瘤微环境治疗不足等问题的平台,并提供实时监测能力 | 工程化蛋白质支架 | 合成生物学 | 癌症 | AI驱动的生成模型、强化学习算法、无细胞蛋白质合成系统、正交翻译机制 | NA | NA | NA |
92 | 2025-06-12 |
Toehold Switch-Based Approach for Engineering Acid-Tolerance Modules to Enhance Production Robustness of Industrial E. coli Strains at Low pH
2025-Jun, Microbial biotechnology
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/1751-7915.70175
PMID:40485106
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研究论文 | 本研究提出了一种基于toehold switch的合成生物学方法,用于增强工业大肠杆菌菌株在低pH条件下的酸耐受性 | 利用toehold switch构建酸耐受模块,整合多种酸响应启动子和抗酸基因,显著提高工业菌株在低pH条件下的生产稳定性 | 研究仅针对特定工业赖氨酸生产菌株,未验证在其他工业菌株中的普适性 | 提高工业微生物的酸耐受性以增强发酵效率和可持续性 | 工业大肠杆菌菌株 | 合成生物学 | NA | toehold switch技术 | NA | 基因表达数据 | 约10个构建模块,包含4种酸响应启动子和18个抗酸基因 |
93 | 2025-06-11 |
DASH: a versatile and high-capacity gene stacking system for plant synthetic biology
2025-Jun-10, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70179
PMID:40493021
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研究论文 | 介绍了一种名为DASH的多功能高容量基因堆叠系统,用于植物合成生物学 | 结合了Golden Gate克隆、重组工程和位点特异性重组酶系统的特点,解决了现有DNA组装系统的多个限制 | NA | 开发一种更高效、灵活的基因组装工具,用于植物合成生物学 | 植物基因组装系统 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、重组工程、位点特异性重组酶系统 | NA | DNA序列 | 一个116 kb的DNA构建体,包含35个转录单元 |
94 | 2025-06-11 |
A discovery platform for identification of host-induced bacterial biosensors from diverse sources
2025-Jun-09, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00123-3
PMID:40490500
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研究论文 | 该研究开发了一个用于识别宿主诱导细菌生物传感器的发现平台,扩展了生物传感器筛选的灵活性和能力 | 利用细菌记忆电路构建了来自多种肠道细菌的传感器组件库,并通过超变DNA条形码实现并行追踪数千个独特克隆 | 研究中使用的传感器组件库可能仍有限,且需要进一步验证其在不同环境中的稳定性和可靠性 | 开发合成生物学工具,用于复杂环境中的部署,如肠道内的合成功能自主控制和炎症性疾病的非侵入性监测 | 肠道微生物及其传感器组件 | 合成生物学 | 炎症性疾病 | 双组分系统识别和克隆流程,超变DNA条形码技术 | NA | 基因序列数据 | 数千个独特克隆,对应约150个潜在生物传感器 |
95 | 2025-06-11 |
Modular and signal-responsive transcriptional regulation using CRISPRi-aided genetic switches in Escherichia coli
2025-Jun-06, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00526-8
PMID:40481524
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPRi的遗传开关平台,用于在大肠杆菌中实现模块化和信号响应的转录调控 | 整合了转录因子生物传感器与FnCas12a CRISPR系统,利用FndCas12a的RNase活性直接从生物传感器响应的mRNA转录物处理crRNA,实现了精确的信号依赖性转录调控 | NA | 克服现有转录调控工具的局限性,扩展合成生物学中转录调控工具的功能 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | CRISPRi, FnCas12a CRISPR系统 | NA | NA | NA |
96 | 2025-06-11 |
The Matter/Life Nexus in Biological Cells
2025-Jun, Annual review of chemical and biomolecular engineering
IF:7.6Q1
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research paper | 探讨了无生命物质与生命之间的区别,以及物理学与细胞生物化学之间的紧密耦合如何揭示物质/生命关系 | 结合实验和计算进展,探索物理学与细胞生物化学的深度耦合,为理解物质与生命的关系提供新视角 | 目前仍无法从原子和分子成分从头构建一个活细胞,表明对生命本质的理解仍有限 | 探索物质与生命之间的区别,以及如何通过物理学和生物化学的耦合来理解这一关系 | 生物细胞及其物理和生物化学特性 | systems biology | NA | whole-cell modeling and synthesis | NA | NA | NA |
97 | 2025-06-11 |
Synthetic Genetic Circuits Enabled in Komagataella phaffii Through T7 RNAP/CRISPRa System
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70036
PMID:40490955
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研究论文 | 本研究展示了在Komagataella phaffii中通过T7 RNAP/CRISPRa系统构建合成遗传电路的潜力 | 利用T7转录系统有效表达sgRNA,并通过插入tRNA序列增强转录激活效率,设计了能进行布尔逻辑运算的基因电路 | NA | 探索在工业Komagataella phaffii菌株中构建基因调控工具包 | Komagataella phaffii菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPRa, T7转录系统, Tet-on诱导系统, split-T7系统, HH-HDV RNA切割处理 | NA | NA | NA |
98 | 2025-06-11 |
Recent Advances in Genome Base Editing Technology and Its Applications in Industrial Microorganism
2025-Jun, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70052
PMID:40490981
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review | 本文系统总结了碱基编辑技术的发展历史、最新进展及其在工业微生物构建中的应用 | 全面概述了多种主要碱基编辑器(如CBEs、ABEs、CRISPR-free碱基编辑器等)及其优化策略,并探讨了其在工业微生物构建中的应用 | NA | 促进碱基编辑技术在合成生物学中的广泛应用并加速其转化潜力 | 工业微生物(如枯草芽孢杆菌、谷氨酸棒状杆菌、酿酒酵母等) | 合成生物学 | NA | 碱基编辑技术(如CBEs、ABEs、CGBEs等) | NA | NA | NA |
99 | 2025-06-11 |
The people behind the papers - Sarah Soliman and Zara Weinberg
2025-Jun-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204920
PMID:40493005
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研究论文 | 该研究介绍了一套小分子和细胞接触诱导系统,用于控制小鼠胚胎干细胞中的基因表达和分化 | 开发了新的小分子和细胞接触诱导系统,用于模拟发育过程 | NA | 研究发育生物学的原理 | 小鼠胚胎干细胞 | 合成生物学 | NA | 小分子和细胞接触诱导系统 | NA | NA | NA |
100 | 2025-06-10 |
Dynamical mechanisms of growth-feedback effects on adaptive gene circuits
2025-Jun-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.89170
PMID:40470804
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研究论文 | 本文研究了工程基因电路在宿主细胞中的动态机制,特别是生长反馈对电路性能的影响 | 系统研究了400多种拓扑结构,揭示了电路失败的三种动态机制,并发现了一种电路鲁棒性度量与生长反馈强度之间的比例关系 | 研究主要基于计算模拟,需要进一步的实验验证 | 理解基因电路与宿主细胞间的相互作用机制,特别是生长反馈对电路性能的影响 | 工程基因电路的拓扑结构和动态行为 | 合成生物学 | NA | 转录调控电路 | NA | 计算模拟数据 | 400多种拓扑结构 |