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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-05 |
Astaxanthin biosynthesis for functional food development and space missions
2025-Jun, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2410364
PMID:39428346
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综述 | 本文综述了虾青素的生物合成策略及其在功能性食品开发和太空任务中的应用前景 | 系统比较不同天然来源虾青素的质差异,评估不同底盘生物中虾青素表达的上游程序,并探索基于合成生物学和细胞工厂的工业化生产策略 | NA | 为虾青素的高效精准基因工程提供理论基础,推动虾青素及其他生物代谢物的生物制造研究 | 虾青素的生物合成途径、不同天然来源的虾青素、微藻底盘生物 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微藻、植物、微生物 | 虾青素生物合成途径 | 食品,医药,化妆品,水产养殖,太空探索 |
| 102 | 2025-10-05 |
Microbial secondary metabolites: advancements to accelerate discovery towards application
2025-Jun, Nature reviews. Microbiology
DOI:10.1038/s41579-024-01141-y
PMID:39824928
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综述 | 本文综述了微生物次级代谢产物的研究进展及其在生物经济中的应用潜力 | 整合基因组测序、生物信息预测工具与合成生物学技术,加速新型次级代谢产物的发现 | NA | 推动微生物次级代谢产物从基础研究到实际应用的转化 | 微生物次级代谢产物及其生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 基因组测序、生物信息学分析、细胞/无细胞表达系统 | NA | 基因组数据、代谢组数据 | NA | 合成生物学工具 | 微生物 | 生物合成基因簇及其调控通路 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 103 | 2025-10-05 |
Integrated metabolome and transcriptome analyses revealed key cytochrome P450 genes involved in the biosynthesis of oleanane-type saponins in Hedera helix L
2025-Jun, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109818
PMID:40147328
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研究论文 | 本研究通过整合代谢组和转录组分析,揭示了常春藤中参与齐墩果烷型皂苷生物合成的关键细胞色素P450基因 | 首次系统鉴定并功能验证了常春藤中CYP716和CYP72家族的6个P450基因在齐墩果烷型三萜皂苷生物合成中的关键作用 | 对常春藤的研究仍较浅,特别是五环三萜骨架修饰阶段CYP450基因的功能表征尚不充分 | 阐明常春藤中齐墩果烷型皂苷生物合成的分子机制 | 常春藤(Hedera helix L.)及其三萜皂苷成分 | 植物代谢工程 | 咳嗽和上呼吸道疾病 | 转录组分析、代谢组分析、RT-qPCR、体外和体内验证 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | NA | 代谢工程 | 常春藤 | 齐墩果烷型三萜皂苷生物合成途径 | 医药, 农业, 工业生物技术 |
| 104 | 2025-10-05 |
Dynamic Analysis and Robust Strategy for the Delayed Paradoxical Cell Population Control Circuit
2025-Jun, IEEE transactions on cybernetics
IF:9.4Q1
DOI:10.1109/TCYB.2025.3556585
PMID:40198292
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研究论文 | 通过分析延迟悖论细胞群体控制电路的双稳态切换和振荡行为,提出实现稳健群体控制的策略 | 揭示了两种双稳态切换机制(初始细胞密度驱动和博来霉素诱导细胞死亡时间延迟驱动),并提出通过调节初始细胞密度和博来霉素浓度的稳健控制策略 | NA | 实现合成悖论控制电路的稳健群体控制 | 延迟悖论细胞群体控制电路 | 合成生物学 | NA | 动态分析、双稳态分析、Hopf分岔分析 | NA | NA | NA | 合成生物学电路设计 | 细胞群体 | 悖论控制电路、双稳态开关、群体控制电路 | 合成生物学, 细胞治疗 |
| 105 | 2025-10-05 |
Remediation of wastewater by using CdS-based biohybrids: Challenges and enhancement strategies
2025-Jun, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132379
PMID:40064454
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综述 | 本文综述了基于CdS的光催化-微生物生物杂合系统在修复含重金属和有机污染物废水中的应用、机制及优化策略 | 整合全细胞生物催化剂与半导体纳米材料的优势,实现重金属离子回收与污染物同步去除的协同增效 | NA | 探讨CdS基生物杂合系统在废水修复中的开发策略与应用机制 | 含重金属和有机化合物的废水污染物 | 环境工程 | NA | 光催化 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | 生物杂合系统 | 环境 |
| 106 | 2025-10-05 |
Be a GEM: Biocontained, environmentally applied, genetically engineered microbes
2025-Jun, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115578
PMID:40222715
|
观点文章 | 讨论基因工程微生物的生物防护技术及其环境影响、监管问题和公众认知 | 系统梳理基因工程微生物生物防护相关的技术与非技术问题 | NA | 探讨基因工程微生物实际应用前需要解决的生物防护问题 | 基因工程微生物 | 合成生物学 | NA | 基因工程技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医学, 环境 |
| 107 | 2025-10-05 |
Designing live bacterial therapeutics for cancer
2025-Jun, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115579
PMID:40228606
|
综述 | 本文全面探讨了利用合成生物学技术设计活细菌疗法治疗癌症的策略与前景 | 系统阐述了如何利用肿瘤微环境特异性定植的细菌作为药物递送平台,并通过合成生物学手段实现精准时空控制的治疗策略 | NA | 为细菌癌症治疗提供全面的技术指导和发展路线 | 肿瘤微环境中的细菌及其工程化改造 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 药物递送系统、时空控制回路 | 医学 |
| 108 | 2025-10-05 |
Paving the way for bacteria-based drug delivery: biohybrid microrobots emerging from microrobotics and synthetic biology
2025-Jun, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115577
PMID:40250568
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综述 | 探讨微机器人学与合成生物学融合推动细菌基药物递送系统发展的研究进展 | 提出整合微机器人外部控制模式(光/超声/磁场)与合成生物学细菌工程化的生物混合微型机器人新范式 | 需解决生物与合成组件的兼容性、规模化制造工艺和活体治疗剂监管路径定义等关键挑战 | 开发具有精准靶向治疗能力的生物混合细菌微型机器人系统 | 工程化细菌与微机器人结合的混合系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 109 | 2025-10-05 |
Advances in innovative extraction techniques for polysaccharides, peptides, and polyphenols from distillery by-products: Common extraction techniques, emerging technologies, and AI-driven optimization
2025-Jun-01, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2025.143326
PMID:39986087
|
综述 | 本文综述了从酿酒副产物中提取多糖、肽和多酚的创新提取技术进展,包括传统方法、新兴技术及人工智能优化策略 | 系统比较了酶法、超声辅助、微波辅助等新兴提取技术,并首次探讨了合成生物学和人工智能在提取工艺优化中的应用潜力 | 未提供具体实验数据验证不同提取技术的实际效果比较 | 促进酿酒行业可持续发展,实现副产物高值化利用 | 酿酒副产物(酒糟、酒精废液、葡萄酒渣)中的生物活性物质(多糖、肽、多酚) | 工业生物技术 | NA | 酶法提取、超声辅助提取、微波辅助提取、超临界流体萃取、加压液体萃取、脉冲电场、合成生物学 | 机器学习、人工智能 | 工艺参数数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 工业 biotechnology, 食品, 环境 |
| 110 | 2025-10-05 |
CYP98A monooxygenases: a key enzyme family in plant phenolic compound biosynthesis
2025-Jun, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf074
PMID:40303436
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综述 | 本文系统综述了CYP98A单加氧酶家族在植物酚类化合物生物合成中的分子特征与功能 | 首次对碎片化的CYP98A氧化酶家族研究进行系统性总结,提出通过代谢工程和合成生物学优化该酶的应用潜力 | 当前针对该氧化酶家族的研究仍较为分散,缺乏系统性的实验验证 | 阐明CYP98A单加氧酶在植物酚类化合物生物合成中的作用机制与应用前景 | CYP98A单加氧酶家族及其催化的酚类化合物生物合成途径 | 植物代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | 文献数据 | NA | 代谢工程 | 园艺植物 | 酚类化合物生物合成途径 | 农业,医药,食品工业 |
| 111 | 2025-10-05 |
Recent advance in macrolactams: Structure, bioactivity, and biosynthesis
2025-Jun-01, Bioorganic chemistry
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.bioorg.2025.108406
PMID:40184666
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综述 | 本文系统总结了2004-2023年间报道的105个大环内酰胺类化合物的结构、生物活性和生物合成研究进展 | 首次系统梳理大环内酰胺家族的最新进展,重点关注非共线规则的新型生物合成途径和构效关系 | 仅涵盖2004-2023年间报道的化合物,可能遗漏早期重要研究成果 | 为大环内酰胺类化合物的发现和合成生物学可持续生产提供参考 | 105种大环内酰胺类天然产物 | 天然产物化学 | NA | 生物合成基因簇分析,酶机制研究 | NA | 化学结构数据,生物活性数据,基因序列数据 | 105种大环内酰胺化合物,来源于海洋沉积物、土壤、植物和动物等多种环境的微生物菌株 | 合成生物学方法 | 微生物菌株 | 大环内酰胺生物合成途径 | 医药 |
| 112 | 2025-10-05 |
Synthetic pathways for microbial biosynthesis of valuable pyrazine derivatives using genetically modified Pseudomonas putida KT2440
2025-Jun, Metabolic engineering communications
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mec.2025.e00258
PMID:40236303
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研究论文 | 本研究通过基因工程改造Pseudomonas putida KT2440,构建了合成吡嗪衍生物的新型代谢途径 | 结合微生物宿主与非血红素二铁单加氧酶的异源表达,首次实现了2,5-二甲基吡嗪及其羧酸和氧化物衍生物的微生物生物合成 | 研究仍处于早期阶段,产物滴度有待进一步提高 | 开发微生物合成高价值吡嗪衍生物的生物技术方法 | 基因工程改造的Pseudomonas putida KT2440菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因编辑、异源表达 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Pseudomonas putida KT2440 | L-苏氨酸代谢途径改造、吡嗪合成途径、单加氧酶催化途径 | 工业生物技术 |
| 113 | 2025-10-05 |
Exploration and mutagenesis of the germacrene A synthase from Solidago canadensis to enhance germacrene A production in E. coli
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.015
PMID:40151792
|
研究论文 | 通过探索和诱变加拿大一枝黄花中的germacrene A合酶,在大肠杆菌中提高germacrene A产量 | 结合分子对接和系统发育分析确定关键残基进行诱变,获得产量提高近10倍的Y376L突变体 | NA | 构建高产germacrene A的萜类化合物底盘细胞 | 加拿大一枝黄花中的germacrene A合酶(ScGAS) | 合成生物学 | 癌症 | 分子对接、系统发育分析、定点诱变 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 异源MVA途径、germacrene A生物合成途径 | 医药 |
| 114 | 2025-10-05 |
Modulating ion channels with nanobodies
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.005
PMID:40103710
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综述 | 本文综述了纳米抗体在调控离子通道功能方面的最新研究进展和应用潜力 | 纳米抗体凭借其小尺寸、高特异性和识别隐蔽表位的能力,为离子通道研究提供了优于传统抗体的新工具 | NA | 探讨纳米抗体在离子通道结构功能研究和治疗干预中的潜在应用 | 离子通道和纳米抗体 | 合成生物学 | NA | 纳米抗体技术 | NA | NA | NA | NA | 骆驼科动物 | NA | 医学 |
| 115 | 2025-10-05 |
Development of CRISPR-Cas9-based genome editing tools for non-model microorganism Erwinia persicina
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.006
PMID:40092160
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研究论文 | 本研究开发了基于CRISPR-Cas9的基因组编辑工具,用于非模式微生物桃色欧文氏菌的基因操作 | 成功将CRISPR-Cas9系统应用于桃色欧文氏菌,通过优化gRNA启动子和设计实现高效基因组编辑,并实现大片段删除和迭代敲除 | NA | 开发适用于非模式微生物桃色欧文氏菌的高效基因组编辑工具 | 桃色欧文氏菌(Erwinia persicina) | 合成生物学 | 植物病害 | CRISPR-Cas9基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Erwinia persicina | 单质粒系统(pRed_Cas9_Δ),双gRNA介导的大片段删除,筛选标记介导的迭代敲除 | 农业,工业生物技术 |
| 116 | 2025-10-05 |
A dual light-controlled co-culture system enables the regulation of population composition
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.012
PMID:40092159
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研究论文 | 本研究开发了一种双光控共培养系统,能够动态调控微生物种群比例 | 整合优化光遗传学系统和正交群体感应系统,首次实现双波长光照对共培养种群组成的动态调控 | NA | 建立能够动态调控种群比例的多菌株共培养系统 | 微生物共培养系统中的种群组成调控 | 合成生物学 | NA | 光遗传学调控、群体感应系统、毒素-抗毒素系统 | NA | NA | NA | CcaS/R系统, YF1-FixJ-PhlF系统 | 微生物 | 双光控共培养系统,包含光诱导模块、通讯模块和效应模块 | 代谢工程, 合成生物学 |
| 117 | 2025-10-05 |
Designer mammalian living materials through genetic engineering
2025-Jun, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.02.007
PMID:40034809
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综述 | 探讨通过基因工程策略构建具有定制化功能和空间排列的哺乳动物活体材料的最新进展 | 提出结合由内而外和由外而内细胞工程方法的协同作用,实现前所未有的细胞排列控制和可定制治疗功能 | NA | 开发具有定制化细胞功能和空间排列的哺乳动物活体材料 | 哺乳动物细胞密集材料和细胞组装体 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、合成生物学工具箱 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 定制化细胞功能电路、空间排列控制电路 | 医学、组织工程 |
| 118 | 2025-10-05 |
Enhancing rufomycin production by CRISPR/Cas9-based genome editing and promoter engineering in Streptomyces sp. MJM3502
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.01.002
PMID:39925944
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研究论文 | 通过CRISPR/Cas9基因组编辑和启动子工程增强链霉菌MJM3502中rufomycin的产量 | 首次建立该菌株的遗传操作平台,并利用CRISPR/Cas9技术在rufomycin生物合成基因簇上游插入强启动子 | 对菌株基因组序列和生物合成途径的理解仍存在显著空白 | 提高rufomycin类抗结核先导化合物的产量 | 链霉菌MJM3502及其rufomycin生物合成基因簇 | 合成生物学 | 结核病 | CRISPR/Cas9基因组编辑,启动子工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Streptomyces sp. MJM3502 | 在rufomycin生物合成基因簇上游插入强启动子,在细胞色素P450酶编码基因上游插入启动子 | 医药 |
| 119 | 2025-10-06 |
Environment signal dependent biocontainment systems for engineered organisms: Leveraging triggered responses and combinatorial systems
2025-Jun, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2024.12.005
PMID:39830078
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综述 | 评估基于环境信号触发响应和组合系统的工程生物安全防护策略 | 系统分析多种环境触发因子(化学、光、温度、pH)与组合式生物防护系统的协同应用 | NA | 评估工程生物的环境信号依赖性生物防护系统 | 基因工程生物(GEOs)的生物防护系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境信号响应系统、组合式生物防护系统 | 环境, 工业生物技术 |