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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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101 | 2025-06-10 |
From molecular mechanisms to clinical translation: Silk fibroin-based biomaterials for next-generation wound healing
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144266
PMID:40381758
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综述 | 本文系统总结了丝素蛋白(SF)及其复合材料在伤口愈合中的制备策略、功能修饰和多维应用机制 | 整合了SF分子机制和材料设计的最新进展,并强调其在精准医学中的潜力,如开发基因工程SF用于定制免疫调节网络 | 当前SF材料开发面临的挑战包括机械稳定性、降解可控性以及大规模生产的标准化 | 开发高效、多功能且可临床转化的SF基材料用于伤口愈合 | 丝素蛋白(SF)及其复合材料 | 生物材料 | 伤口愈合 | 3D生物打印和合成生物学技术 | NA | NA | NA |
102 | 2025-06-09 |
DNA-Based Signal Circuit for Self-Regulated Bidirectional Communication in Protocell-Living Cell Communities
2025-Jun-10, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202503903
PMID:40195061
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研究论文 | 设计了一种基于DNA的信号电路,用于在原始细胞与活细胞群落中实现自我调节的双向通信 | 开发了一种包含识别模块、激活模块和反馈模块的DNA电路,使原始细胞能够通过感知和响应活细胞释放的信号来自主调节与活细胞的相互作用 | NA | 开发合成生物学工具以控制细胞间信号传导,从而编程所需的细胞行为 | 原始细胞与活细胞群落的相互作用 | 合成生物学 | NA | DNA电路设计 | NA | NA | NA |
103 | 2025-06-09 |
QM/MM Unlocks The Catalytic Mechanism of YtfE: The Structural Reorganization of The Active Site Enables Nitrite-to-NO Conversion
2025-Jun-06, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202500817
PMID:40296212
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研究论文 | 本研究通过多尺度计算方法揭示了YtfE蛋白在亚硝酸盐还原过程中的催化机制 | 揭示了活性位点结构重组对亚硝酸盐还原机制的关键调控作用,特别是氢键网络变化和HONO中间体配位转换的影响 | 研究主要基于计算模拟,需要后续实验验证 | 阐明YtfE蛋白催化亚硝酸盐还原的分子机制 | 大肠杆菌铁中心修复蛋白(YtfE) | 计算生物学 | NA | QM/MM, QM/MM MD, QM计算 | NA | 计算模拟数据 | NA |
104 | 2025-06-07 |
Current AI technologies in cancer diagnostics and treatment
2025-Jun-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02369-9
PMID:40457408
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综述 | 本文系统回顾了当前人工智能技术在癌症诊断和治疗中的应用现状 | 强调了深度学习在早期癌症检测中的日益重要作用,并探讨了AI在基因组学、生物标志物发现、液体活检和非侵入性诊断中的应用 | 讨论了数据隐私、可解释性和监管问题等重要挑战 | 评估人工智能在癌症诊疗领域的应用潜力 | 癌症诊断和治疗技术 | 数字病理学 | 癌症 | 深度学习 | NA | 多模态医学影像(CT、MRI、PET、超声)和数字病理数据 | NA |
105 | 2025-06-07 |
CRISPR-Cas: a game-changer in vaccine development and the fight against viral infections
2025-Jun, Trends in microbiology
IF:14.0Q1
DOI:10.1016/j.tim.2025.02.006
PMID:40069074
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review | 本文综述了CRISPR-Cas系统在病毒-宿主相互作用研究、抗病毒治疗及疫苗开发中的最新进展 | 探讨了CRISPR-Cas系统在识别病毒关键受体和宿主因子以及作为抗病毒策略和疫苗开发工具的创新应用 | 未具体提及CRISPR-Cas技术在临床应用中的潜在限制或挑战 | 推进对病毒-宿主相互作用的理解并开发有效的抗病毒策略 | 病毒-宿主相互作用、抗病毒治疗及疫苗开发 | synthetic biology | viral infections | CRISPR-Cas | NA | NA | NA |
106 | 2025-06-07 |
SubtiToolKit: a bioengineering kit for Bacillus subtilis and Gram-positive bacteria
2025-Jun, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.004
PMID:40074634
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research paper | 介绍SubtiToolKit(STK),一种针对枯草芽孢杆菌和革兰氏阳性菌的高效克隆工具包 | 填补了革兰氏阳性菌在合成生物学工具包领域的空白,提供模块化标准DNA部件库,支持转录单元、操纵子及基因敲入/敲除应用 | 未提及具体实验验证数据或与其他工具包的性能对比 | 开发适用于革兰氏阳性菌的标准化DNA构建工具,推动合成生物学研究 | 枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)及其他革兰氏阳性菌(如Geobacillus和Parageobacillus工业菌株) | 合成生物学 | NA | Golden Gate(GG)克隆方法 | NA | DNA序列 | 未明确说明具体菌株数量,但包含多类标准化DNA部件(启动子、RBS、荧光蛋白等) |
107 | 2025-06-07 |
From academia to real-life biotech: 'It takes a village'
2025-Jun, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.014
PMID:40089442
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research paper | 本文描述了一个分析合成生物学在学术界与产业界交界处应用的研讨会 | 探讨了如何将学术研究成功转化为生物技术企业,并讨论了支持这一转化的基础设施 | NA | 分析学术研究向生物技术企业转化的过程及所需支持 | 合成生物学在学术界与产业界的交界处 | 生物技术 | NA | NA | NA | NA | NA |
108 | 2025-06-06 |
Magnetically driven lipid vesicles for directed motion and light-triggered cargo release
2025-Jun-05, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr00942a
PMID:40396421
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研究论文 | 本研究探讨了磁性驱动的脂质囊泡在定向运动和光触发货物释放中的应用 | 开发了一种结合磁性驱动和光诱导不对称氧化的脂质囊泡系统,实现了定向运动和按需释放 | 研究仍处于概念验证阶段,尚未进行体内实验验证 | 开发具有导航控制和按需释放能力的脂质基药物递送载体 | 磁性颗粒包裹的巨型单层囊泡(magGUVs) | 合成生物学 | NA | 微流控技术、光诱导不对称氧化 | 晶格玻尔兹曼模拟框架 | 实验测量数据 | NA |
109 | 2025-06-06 |
MOSAIC: A Highly Efficient, One-Step Recombineering Approach to Plasmid Editing and Diversification
2025-Jun-05, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00657
PMID:40471122
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research paper | 介绍了一种名为MOSAIC的高效一步重组工程方法,用于质粒编辑和多样化 | 提出了一种快速、高效的质粒编辑和组合质粒库生成方法,利用单链DNA退火蛋白CspRecT,单次转化即可实现高达90%的单目标质粒编辑效率,并能生成跨越四个不同目标区域的组合质粒库 | 未提及具体的应用限制或技术瓶颈 | 开发一种简单、快速且资源高效的质粒编辑和多样化方法,用于分子和合成生物学应用 | 质粒和组合质粒库 | 合成生物学 | NA | 单链DNA退火蛋白CspRecT和Nanopore测序 | NA | DNA序列数据 | 未提及具体样本数量 |
110 | 2025-06-06 |
Harnessing flavonoids to control probiotic function: in situ application of a naringenin-responsive genetic circuit
2025-Jun-03, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02890-24
PMID:40277392
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research paper | 该研究开发了一种基于黄酮类化合物的遗传电路,用于控制益生菌功能,并在小鼠肠道中进行了原位应用 | 首次在宿主-微生物条件下应用了黄酮类化合物响应的遗传电路,并展示了其在小鼠肠道中的功能 | 未来研究需要评估更低剂量的柚皮素及富含柚皮素的食物作为替代输入 | 通过合成生物学增强益生菌的功能,利用黄酮类化合物作为遗传电路的输入 | 益生菌Escherichia coli Nissle 1917 (EcN)和小鼠肠道 | 合成生物学 | NA | 遗传电路设计,荧光素酶报告系统 | NA | 生物发光数据 | 小鼠实验 |
111 | 2025-06-06 |
Trends in sustainable single-cell protein from non-grain feedstocks
2025-Jun-03, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.018
PMID:40467368
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research paper | 探讨利用非谷物原料通过微生物发酵生产可持续单细胞蛋白(SCP)的趋势和挑战 | 重点研究非谷物原料的多样化利用、多功能应用扩展以及混合生物系统的整合,特别是合成生物学突破使非谷物原料的利用范围从传统的一碳原料(如甲醇)扩展到二氧化碳 | SCP规模化生产面临菌株鲁棒性不足、基因组编辑精度不够、低密度非谷物原料物流问题以及电化学能源载体安全风险等限制 | 探索可持续蛋白质生产的替代方案,以应对全球粮食需求增长和环境危机 | 非谷物原料生产的单细胞蛋白(SCP) | 生物技术 | NA | 微生物发酵、合成生物学、基因组编辑 | NA | NA | NA |
112 | 2025-06-06 |
Engineering microbial carbon metabolism for sustainable resource utilization
2025-Jun-02, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108622
PMID:40467014
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综述 | 本文综述了通过代谢工程利用可再生碳源进行微生物生物合成化学品的研究进展 | 强调了利用多组学测序、机器学习和人工智能指导菌株工程以提高可持续碳源利用效率的前景 | 未提及具体实验验证或案例研究 | 开发绿色节能资源以替代化石燃料 | 微生物碳代谢 | 合成生物学 | NA | 多组学测序、机器学习、人工智能 | NA | NA | NA |
113 | 2025-06-06 |
Living Fiber Dispersions from Mycelium as a New Sustainable Platform for Advanced Materials
2025-Jun, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202418464
PMID:39998258
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research paper | 该研究提出了一种从菌丝体中生成活体纤维分散体的可持续方法,用于开发具有智能特性的先进材料 | 结合生物聚合物纤维的材料形成特性和活体材料的高度动态特性,提出了一种可持续的活体纤维分散体生成方法 | 未提及具体局限性 | 开发可持续的先进材料平台 | 菌丝体生成的活体纤维分散体 | advanced materials | NA | 液体培养和机械脱纤维方法 | NA | NA | NA |
114 | 2025-06-06 |
Redesigning and rethinking genetic circuits: the potential of transcriptional rewiring in filamentous fungi
2025-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103301
PMID:40179610
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review | 本文探讨了丝状真菌中基因调控网络(GRN)操作的分子工具包,重点关注转录重连和启动子工程 | 利用对光和温度等物理线索敏感的顺式元件,实现了前所未有的时空精确基因表达控制 | 主要关注丝状真菌,对其他真菌类型的应用讨论较少 | 探索丝状真菌中基因调控网络的重设计和重新思考 | 丝状真菌,特别是以粗糙脉孢菌(Neurospora crassa)为模型 | 合成生物学 | NA | 转录重连,启动子工程 | NA | NA | NA |
115 | 2025-06-06 |
Glycosyltransferases in human milk oligosaccharide synthesis: structural mechanisms and rational design
2025-Jun, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103315
PMID:40347686
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综述 | 本文系统分析了糖基转移酶在人类母乳寡糖合成中的结构机制与理性设计 | 结合结构生物学和深度学习算法,提出了糖基转移酶的优化策略和从头设计方法 | 未提及具体实验验证或工业应用的实际效果 | 探讨糖基转移酶在人类母乳寡糖合成中的结构机制与优化设计 | 糖基转移酶及其在人类母乳寡糖合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 结晶学研究、深度学习算法 | NA | 结构生物学数据 | NA |
116 | 2025-06-06 |
Catalytic mechanism and engineering of aromatic prenyltransferase: A review
2025-Jun, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.144214
PMID:40379159
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review | 本文系统总结了芳香族异戊二烯基转移酶的催化机制及其工程化改造的最新进展 | 提出了整合人工智能和深度学习的创新工程方法,以开发高性能生物催化剂 | 当前面临的挑战包括催化活性不足、底物特异性狭窄以及多酶级联系统和固定化技术的限制 | 指导芳香族异戊二烯基转移酶在合成生物学和药物创新中的工程化与规模化应用 | 芳香族异戊二烯基转移酶及其工程化改造 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、人工智能、深度学习 | NA | NA | NA |
117 | 2025-06-05 |
Crucial roles of intracellular cyclic di-GMP in impacting the genes important for extracellular electron transfer by Geobacter metallireducens
2025-Jun-04, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00727-25
PMID:40464557
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研究论文 | 研究细胞内c-di-GMP在Geobacter metallireducens细菌胞外电子传递(EET)中的作用 | 揭示了细胞内c-di-GMP对细菌胞外电子传递过程中多个基因表达的调控作用,包括细胞色素和菌毛蛋白PilA-N的基因 | c-di-GMP如何影响这些基因表达的具体机制尚不清楚 | 探究细胞内c-di-GMP在细菌胞外电子传递中的调控作用 | Geobacter metallireducens细菌 | 微生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | 基因表达数据 | 3种不同c-di-GMP水平的菌株(Gme-H, Gme-C, Gme-L) |
118 | 2025-06-03 |
Correction to "Synthetic Biology-Based Bacterial Extracellular Vesicles Displaying BMP-2 and CXCR4 to Ameliorate Osteoporosis"
2025-Jun, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70095
PMID:40452467
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
119 | 2025-06-04 |
Bridging chemistry and biology for light-driven new-to-nature enantioselective photoenzymatic catalysis
2025-Jun-03, Chemical Society reviews
IF:40.4Q1
DOI:10.1039/d4cs00561a
PMID:40351234
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教程综述 | 本文综述了光驱动酶催化领域的基本原理和策略,旨在介绍这一新兴的跨学科研究方向 | 结合光激发的高反应性与生物催化的高选择性,探索新型对映选择性光酶催化系统 | 未提及具体实验数据或案例研究的局限性 | 推动可持续不对称合成的发展 | 光酶催化系统 | 合成生物学 | NA | 光催化与酶催化协同 | NA | NA | NA |
120 | 2025-06-04 |
Biochemical and structural characterization of chlorite dismutase enzyme from Pseudomonas aeruginosa
2025-Jun-03, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70151
PMID:40458033
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研究论文 | 本研究对铜绿假单胞菌中的氯酸歧化酶进行了生化和结构表征 | 首次报道了铜绿假单胞菌中二聚体氯酸歧化酶的高分辨率晶体结构及其催化机制 | 未探讨该酶在实际环境修复应用中的效果 | 研究氯酸歧化酶在环境污染物降解中的应用 | 铜绿假单胞菌中的氯酸歧化酶 | 生物化学 | NA | X射线晶体学 | NA | 蛋白质结构数据 | NA |