合成生物学相关文章
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当前共找到 117 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
The XNA alphabet
2025-Jul-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf635
PMID:40650979
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综述 | 本文系统综述了糖修饰的异源核酸(XNA)的结构分类、构象特性及其在生物技术和合成生物学中的应用前景 | 提出了XNA字母表的概念，系统分类了能与天然核酸相互作用和正交的两类XNA系统，阐明了糖组分对XNA构象空间和杂交特性的决定性作用 | NA | 总结糖修饰XNA系统的构象行为原理及其在合成遗传学、核酸治疗等领域的应用潜力 | 糖修饰的异源核酸(XNA)系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术, 医学诊断, 纳米技术 |
| 42 | 2025-10-05 |
A Strictly Inducible and Orthogonal Dre-rox System for Precise and Markerless Genome Editing in Bacillus subtilis
2025-Jul-25, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2505.05006
PMID:40730489
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研究论文 | 本研究在枯草芽孢杆菌中建立了一种严格诱导且正交的Dre-rox系统，用于精确无标记基因组编辑 | 开发了茶碱诱导型核糖开关严格控制Dre表达以减少渗漏重组，首次证明Dre与Cre在各自识别位点上无串扰正交工作，支持单次诱导同步多位点切除 | NA | 扩展微生物基因组工程工具包，开发与Cre性能相当且能正交功能的位点特异性重组酶系统 | 枯草芽孢杆菌基因组编辑系统 | 合成生物学 | NA | 位点特异性重组，基因组编辑 | NA | NA | NA | Dre-rox系统，Cre-lox系统 | 枯草芽孢杆菌 | 茶碱诱导型核糖开关控制的Dre表达系统，正交重组系统 | 工业生物技术 |
| 43 | 2025-10-05 |
[Research progress in the fungal bioluminescence pathway]
2025-Jul-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250138
PMID:40769542
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综述 | 本文综述真菌生物发光途径在植物工程中的应用进展及其在生物传感和农业生物技术中的潜力 | 将真菌生物发光途径基因工程改造至植物中创建自发光标本，克服传统报告系统底物限制，并结合机器学习方法优化表型 | NA | 探讨植物真菌生物发光途径工程化应用及其在农业生物技术和环境监测中的创新机会 | 真菌生物发光途径及其在转基因植物中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因工程、机器学习 | NA | NA | NA | 基因工程 | 植物 | 真菌生物发光途径（催化内源性咖啡酸氧化产生绿色生物发光） | 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 44 | 2025-10-05 |
A framework for complex signal processing via synthetic biological operational amplifiers
2025-Jul-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62464-9
PMID:40745425
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研究论文 | 本研究开发了一种通过合成生物学运算放大器处理复杂生物信号的框架 | 通过整合正交运算放大器到标准化生物过程中，实现了高效信号分解和放大，并设计了可扩展的运算放大器 | NA | 开发能够处理复杂生物信号的合成生物学框架 | 遗传电路和全细胞生物传感器 | 合成生物学 | NA | σ/anti-σ对工程、核糖体结合位点强度调节、开环和闭环配置 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 运算放大器、全细胞生物传感器、生长状态响应诱导系统 | 代谢工程、工业生物技术 |
| 45 | 2025-10-05 |
Cholesterol modulates membrane elasticity via unified biophysical laws
2025-Jul-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62106-0
PMID:40745155
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研究论文 | 本研究通过核自旋技术和计算分析揭示了胆固醇如何通过统一生物物理定律调节膜弹性 | 发现脂质膜在介观尺度表现出统一的弹性行为，与胆固醇含量、脂质不饱和度或温度无关 | 研究主要关注介观尺度，未涉及分子和宏观尺度的完整验证 | 探索胆固醇调节膜弹性的生物物理机制 | 脂质膜的弹性特性 | 生物物理学 | NA | 核自旋技术、计算分析 | NA | 物理测量数据、计算模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、材料科学 |
| 46 | 2025-10-05 |
Thermodynamically consistent, reduced models of gene regulatory networks
2025-Jul, Royal Society open science
IF:2.9Q1
DOI:10.1098/rsos.241725
PMID:40746961
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研究论文 | 本研究开发了一种适用于细胞群体建模的热力学一致基因表达简化模型 | 结合键合图方法确保热力学一致性，并开发了适用于大规模细胞群体模拟的简化基因表达模型 | NA | 为合理设计细胞群体行为开发数学建模方法 | 基因调控网络和细胞群体 | 合成生物学 | NA | 数学建模，键合图 | 动力学模型，基于代理的模型 | NA | NA | NA | NA | 切换开关，阻遏振荡器 | 工业生物技术 |
| 47 | 2025-10-05 |
Direct high-throughput deconvolution of non-canonical bases via nanopore sequencing and bootstrapped learning
2025-Jul-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62347-z
PMID:40739090
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研究论文 | 本研究开发了一种通过纳米孔测序和自助学习方法高通量解卷积非经典碱基的技术 | 首次实现了非经典碱基的高通量纳米孔测序，并开发了基于自助学习和数据增强的通用性AI模型 | NA | 开发能够高通量识别和测序非经典碱基的技术方法 | 含有非经典碱基的合成异源核酸和寡核苷酸 | 生物信息学 | NA | 纳米孔测序，AI模型训练，数据增强 | 自助学习模型 | 纳米孔测序信号数据 | 1,024种含有非经典碱基的寡核苷酸，每个流动槽产生超过2.3×10^6条读长 | NA | NA | NA | 病毒基因组学，合成生物学，DNA存储 |
| 48 | 2025-10-05 |
Bioengineering Outer-Membrane Vesicles for Vaccine Development: Strategies, Advances, and Perspectives
2025-Jul-20, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines13070767
PMID:40733744
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综述 | 本文综述了外膜囊泡在疫苗开发中的工程化策略、研究进展和未来前景 | 系统总结了包括表面抗原基因工程、表面偶联、糖工程、纳米颗粒工程、杂交OMV和原位生产在内的新兴工程策略，并提出了合成生物学技术的整合潜力 | NA | 探索外膜囊泡作为新一代疫苗开发平台的潜力 | 革兰氏阴性菌自然分泌的外膜囊泡 | 合成生物学 | 传染病和癌症 | 基因工程、生物技术、糖工程、纳米技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 革兰氏阴性菌 | 表面抗原展示系统、生物传感器、代谢通路 | 医学 |
| 49 | 2025-10-05 |
Soilless Cultivation: Precise Nutrient Provision and Growth Environment Regulation Under Different Substrates
2025-Jul-16, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14142203
PMID:40733440
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综述 | 系统回顾无土栽培技术体系及其在精准调控作物根际环境方面的创新潜力 | 系统整合无土栽培技术体系与根际微生物互作机制，提出通过合成生物学方法优化微生物群落结构 | 有机体系中根际微生物群落结构和功能稳定性易失衡，技术成本与基质可持续性亟待解决 | 揭示无土栽培技术优势并推动其向低碳化、精准化和空间化方向发展 | 无土栽培技术体系、营养液管理策略、根际微生物互作机制 | 现代农业技术 | NA | 合成生物学方法、智能环境控制系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 环境 |
| 50 | 2025-10-05 |
Integrated Approach for Improving Lutein Production of Chlorella sp. via Adaptive Evolution and Casein Acid Hydrolysate
2025-Jul, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05279-0
PMID:40358910
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研究论文 | 本研究通过适应性进化和酪蛋白酸水解物调控开发了提高小球藻叶黄素产量的综合方法 | 结合适应性进化（苯酚胁迫）和代谢调控（NaCl与酪蛋白酸水解物）的集成策略显著提升微藻叶黄素产量 | 未探讨其他环境胁迫因子或代谢调控物质的协同效应 | 提高小球藻的叶黄素生产能力 | 小球藻（Chlorella sp.）及其进化菌株P30 | 合成生物学 | NA | 适应性进化、代谢调控 | NA | 生物化学分析数据 | 经过30代适应性进化的P30菌株及原始菌株 | 适应性进化 | 小球藻（Chlorella sp.） | NA | 工业生物技术 |
| 51 | 2025-10-05 |
How many plasmids can bacteria carry? A synthetic biology perspective
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240378
PMID:40730232
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综述 | 从合成生物学视角探讨细菌携带多重质粒的能力及其应用 | 首次系统探讨单个微生物携带独特质粒的最大数量问题 | NA | 研究细菌维持多重独特质粒的理论与实践可能性 | 细菌质粒系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 质粒载体 | 细菌 | 多质粒系统 | 代谢工程, 合成生物学 |
| 52 | 2025-10-05 |
Advances and obstacles of T cell-based immunotherapy in gynecological malignancies
2025-Jul-26, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02411-w
PMID:40713697
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综述 | 全面分析CAR-T细胞疗法在妇科肿瘤中的进展、挑战及未来策略 | 整合临床前见解与转化临床数据，建立妇科肿瘤过继性T细胞疗法的战略框架，强调CAR-T技术与个性化新抗原疫苗及微环境重编程剂的协同潜力 | 治疗持久性和制造一致性仍存在持续限制 | 推进妇科恶性肿瘤中基于T细胞的免疫治疗 | 妇科恶性肿瘤（卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌） | NA | 妇科肿瘤 | CAR-T细胞疗法、合成生物学方法、多组学引导的抗原选择 | NA | 临床数据、临床前数据 | NA | CAR-T | T淋巴细胞 | 嵌合抗原受体（CAR）设计 | 医学 |
| 53 | 2025-10-05 |
Advancements in understanding tumor-resident bacteria and their application in cancer therapy
2025-Jul-25, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-025-00623-1
PMID:40713785
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综述 | 探讨肿瘤内微生物群（特别是胞内细菌）在肿瘤演进中的作用及其在癌症治疗中的应用前景 | 系统阐述胞内细菌在肿瘤进展中的新机制，并提出基于合成生物学和工程化药物递送系统的靶向治疗新策略 | NA | 解析肿瘤内微生物群在癌症发生发展中的作用机制并探索其治疗应用 | 肿瘤内微生物群（特别是胞内细菌）及其与肿瘤细胞、免疫细胞的相互作用 | 肿瘤微生物组学 | 癌症 | 二代测序、生物信息学分析 | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 54 | 2025-10-05 |
Protein design of two-component tubular assemblies similar to cytoskeletons
2025-Jul-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-62076-3
PMID:40695817
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研究论文 | 开发了一种受自然启发的蛋白质设计方法，利用两种不同蛋白质单元构建类似细胞骨架的动态管状结构 | 首次实现了两种不同蛋白质单元在精心设计条件下组装成具有动态柔性的管状结构，能够响应环境刺激可逆组装 | NA | 探索蛋白质高级结构组装的设计原理，模拟天然细胞骨架系统的动态行为 | 两种不同蛋白质单元及其组装形成的管状结构 | 合成生物学 | NA | 冷冻电子显微镜 | NA | 结构图像数据 | NA | 蛋白质理性设计 | NA | 仿肌动蛋白丝和微管的管状组装结构 | 材料科学, 合成生物学 |
| 55 | 2025-10-05 |
Identification of cognate recombination directionality factors for large serine recombinases by virtual pulldown
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf691
PMID:40701553
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研究论文 | 本研究利用AlphaFold2-multimer预测并实验验证了大丝氨酸重组酶的匹配重组方向性因子 | 首次使用AlphaFold2-multimer系统性地预测RDFs，成功识别了超过半数测试重组酶的潜在RDFs | RDFs缺乏序列保守性且与噬菌体整合酶基因缺乏同线性，增加了识别难度 | 开发识别大丝氨酸重组酶匹配重组方向性因子的计算方法 | 98个大丝氨酸重组酶及其重组方向性因子 | 合成生物学 | NA | AlphaFold2-multimer预测、实验验证 | AlphaFold2-multimer | 蛋白质序列和结构数据 | 98个大丝氨酸重组酶测试集，其中9个作为测试案例 | 大丝氨酸重组酶系统 | NA | 整合型重组系统（噬菌体或移动元件插入模拟） | 合成生物学、基因组编辑 |
| 56 | 2025-10-05 |
Genetic "expiry-date" circuits control lifespan of synthetic scavenger bacteria for safe bioremediation
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf703
PMID:40705927
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研究论文 | 本研究开发了基因'保质期'电路来控制合成细菌的寿命，用于安全的环境修复应用 | 设计了可调节寿命的前馈激活网络电路，结合合成小调控RNA和基于asd的营养缺陷系统，实现了细菌程序化自毁 | NA | 开发合成细菌的生物安全控制策略，确保其在环境应用中的安全部署 | 工程化大肠杆菌及其基因调控电路 | 合成生物学 | NA | 基因电路设计、合成生物学工程 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 前馈激活网络、细胞裂解电路、营养缺陷系统 | 环境 |
| 57 | 2025-10-05 |
A Novel Linear Machine Learning Method Based on DNA Hybridization Reaction Circuit
2025-07, IEEE transactions on nanobioscience
IF:3.7Q3
DOI:10.1109/TNB.2025.3559480
PMID:40232911
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研究论文 | 提出了一种基于DNA杂交反应电路的新型线性机器学习方法 | 利用DNA杂交反应实现完整的合成生物学计算系统，采用'双轨'机制实现学习算法的DNA编译，支持权重更新为负值 | NA | 开发基于DNA杂交反应电路的机器学习模型 | DNA杂交反应电路 | 机器学习 | NA | DNA杂交反应 | 线性机器学习模型 | NA | NA | NA | NA | 包含计算训练组件、测试组件和学习算法的DNA杂交反应电路 | 生物计算 |
| 58 | 2025-10-05 |
Computational biology meets oncology: designing custom protein and peptide binders to outsmart cancer
2025-Jul-22, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02936-6
PMID:40694144
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综述 | 本文探讨计算生物学在癌症治疗中的应用，重点介绍从头设计蛋白质和多肽结合剂的方法与前景 | 整合计算设计、定向进化和人工智能技术，突破天然蛋白质支架限制，开发高特异性癌症靶向分子 | 计算工具（如Rosetta和AlphaFold）对无序区域和构象动力学的预测准确性仍存在局限 | 开发新型蛋白质和多肽结合剂以改善癌症精准治疗 | 从头设计的蛋白质和多肽结合剂（如DARPins、PD-1/PD-L1微型蛋白抑制剂） | 计算生物学 | 癌症 | 计算设计、定向进化、人工智能 | Rosetta、AlphaFold | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | 合成生物学回路 | 医学 |
| 59 | 2025-10-05 |
A phage transcription factor displaces the host σ factor and stabilizes its own σ factor
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf683
PMID:40682819
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研究论文 | 本研究通过冷冻电镜结构揭示了噬菌体蛋白gp79如何取代宿主σ因子并稳定自身σ因子gp36的转录调控机制 | 首次解析了gp79通过N端侵入RNA通道取代σ4，并在遇到gp36时改变构象稳定RNAP-启动子开放复合物的分子机制 | NA | 阐明噬菌体phiEco32蛋白gp79同时抑制宿主转录和激活自身转录的双重调控机制 | 大肠杆菌RNA聚合酶、噬菌体phiEco32蛋白gp79和gp36、同源启动子 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜(cryo-EM)、结构分析、生化分析 | NA | 结构数据、生化数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 60 | 2025-10-05 |
Pattern recognition in living cells through the lens of machine learning
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240377
PMID:40664239
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综述 | 本文通过机器学习视角探讨细胞内的模式识别机制，分析人工神经网络与生物信号通路之间的相似性 | 将机器学习概念框架应用于生物学系统，提出信号通路和基因调控网络具有内在计算能力的新观点 | NA | 探索人工神经网络与生物信号通路在结构和功能上的相似性与差异 | 细胞信号通路、基因调控网络、人工神经网络 | 机器学习 | NA | NA | 神经网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |