合成生物学相关文章
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当前共找到 120 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Computational biology meets oncology: designing custom protein and peptide binders to outsmart cancer
2025-Jul-22, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02936-6
PMID:40694144
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综述 | 本文探讨计算生物学在癌症治疗中的应用，重点介绍从头设计蛋白质和多肽结合剂的方法与前景 | 整合计算设计、定向进化和人工智能技术，突破天然蛋白质支架限制，开发高特异性癌症靶向分子 | 计算工具（如Rosetta和AlphaFold）对无序区域和构象动力学的预测准确性仍存在局限 | 开发新型蛋白质和多肽结合剂以改善癌症精准治疗 | 从头设计的蛋白质和多肽结合剂（如DARPins、PD-1/PD-L1微型蛋白抑制剂） | 计算生物学 | 癌症 | 计算设计、定向进化、人工智能 | Rosetta、AlphaFold | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | 合成生物学回路 | 医学 |
| 42 | 2025-10-05 |
A phage transcription factor displaces the host σ factor and stabilizes its own σ factor
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf683
PMID:40682819
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研究论文 | 本研究通过冷冻电镜结构揭示了噬菌体蛋白gp79如何取代宿主σ因子并稳定自身σ因子gp36的转录调控机制 | 首次解析了gp79通过N端侵入RNA通道取代σ4，并在遇到gp36时改变构象稳定RNAP-启动子开放复合物的分子机制 | NA | 阐明噬菌体phiEco32蛋白gp79同时抑制宿主转录和激活自身转录的双重调控机制 | 大肠杆菌RNA聚合酶、噬菌体phiEco32蛋白gp79和gp36、同源启动子 | 结构生物学 | NA | 冷冻电镜(cryo-EM)、结构分析、生化分析 | NA | 结构数据、生化数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 43 | 2025-10-05 |
Deciphering plasmid replication dynamics: a computational approach to predict ColE1-like plasmid copy number
2025-Jul, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2024.0783
PMID:40664234
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研究论文 | 开发了一种基于机器学习的计算工具，用于从复制起点序列预测ColE1类质粒的拷贝数 | 首个能够从复制起点序列计算预测质粒拷贝数的软件工具，强调了启动子强度和RNA折叠动力学的重要性 | NA | 简化质粒拷贝数设计，重新定义质粒工程工作流程 | ColE1类质粒的复制起点序列 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 机器学习模型 | DNA序列数据 | NA | 质粒工程 | NA | 质粒复制起点设计 | 工业生物技术,医学 |
| 44 | 2025-10-05 |
Pattern recognition in living cells through the lens of machine learning
2025-Jul, Open biology
IF:4.5Q1
DOI:10.1098/rsob.240377
PMID:40664239
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综述 | 本文通过机器学习视角探讨细胞内的模式识别机制，分析人工神经网络与生物信号通路之间的相似性 | 将机器学习概念框架应用于生物学系统，提出信号通路和基因调控网络具有内在计算能力的新观点 | NA | 探索人工神经网络与生物信号通路在结构和功能上的相似性与差异 | 细胞信号通路、基因调控网络、人工神经网络 | 机器学习 | NA | NA | 神经网络 | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 45 | 2025-10-05 |
High-Throughput 19F NMR Chiral Analysis for Screening and Directed Evolution of Imine Reductases
2025-Jul-23, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.5c00498
PMID:40726787
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研究论文 | 开发了一种基于19F NMR的高通量手性分析方法，用于亚胺还原酶的筛选和定向进化 | 首次将19F NMR技术应用于高通量手性分析，能够同时评估对映选择性、立体偏好性和反应产率 | NA | 开发高效快速的手性分析方法以推动生物催化和合成生物学发展 | 亚胺还原酶及其在合成抗帕金森药物罗替戈汀中间体中的应用 | 合成生物学 | 帕金森病 | 19F NMR | NA | NMR光谱数据 | NA | 定向进化 | NA | NA | 医药 |
| 46 | 2025-10-05 |
Unraveling the Complexity of Plant Trichomes: Models, Mechanisms, and Bioengineering Strategies
2025-Jul-21, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26147008
PMID:40725255
|
综述 | 本文综述了植物表皮毛的发育、结构和功能研究进展，重点探讨腺毛在植物合成生物学中的应用潜力 | 整合分子机制与新兴技术，提出了利用表皮毛进行可持续农业和生物制造的前瞻性框架 | NA | 探讨植物表皮毛的发育机制及其在合成生物学中的应用策略 | 植物表皮毛，特别是关键物种的腺毛分泌毛(GSTs) | 植物合成生物学 | NA | 模块化基因工程、代谢通道策略 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 可持续农业,天然产物发现,生物制造 |
| 47 | 2025-10-05 |
The V5-Epitope Tag for Cell Engineering and Its Use in Immunohistochemistry and Quantitative Flow Cytometry
2025-Jul-20, Biology
DOI:10.3390/biology14070890
PMID:40723447
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研究论文 | 系统评估V5表位标签及其抗体在细胞工程中的应用，包括免疫组织化学和定量流式细胞术 | 首次系统评估鼠源和人源化抗V5标签抗体在不同实验条件下的性能，并优化免疫组织化学方法以减少非特异性信号 | V5标签信号受特定固定剂和分离试剂影响，可能限制其在某些实验条件下的应用 | 开发用于合成生物学应用的V5标签检测工具箱 | V5标签融合蛋白、鼠源和人源化抗V5抗体、体外和体内实验样本 | 合成生物学 | NA | 免疫组织化学、流式细胞术、抗体人源化 | NA | 组织样本图像、流式细胞数据 | 46种人类正常或癌组织样本 | 表位标签技术 | 哺乳动物细胞 | 异源融合蛋白组装 | 医学 |
| 48 | 2025-10-05 |
Natural CCD2 Variants and RNA Interference for Boosting Crocin Biosynthesis in Tomato
2025-Jul-12, Biology
DOI:10.3390/biology14070850
PMID:40723408
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研究论文 | 本研究通过引入不同来源的CCD2酶等位基因和RNA干扰技术，成功提高了番茄中藏花素的生物合成水平 | 首次在番茄中同时表达藏红花和雄黄兰来源的CCD2等位基因，并结合RNA干扰技术调控类胡萝卜素代谢通路 | 研究仅针对番茄模型，未在其他作物中验证；转基因作物的生物安全性需要进一步评估 | 通过合成生物学方法提高番茄中藏花素的生物合成效率 | 番茄果实及其类胡萝卜素代谢途径 | 合成生物学 | NA | RNA干扰，基因工程，转基因技术 | NA | 生物化学数据，基因表达数据 | 转基因番茄植株 | RNA干扰，基因导入 | 番茄 | 藏花素生物合成途径，包括CCD2酶催化的玉米黄质转化为藏红花酸，以及后续的醛脱氢酶和葡萄糖基转移酶修饰步骤 | 农业，食品，医药 |
| 49 | 2025-10-05 |
Enhancing ELISA Sensitivity: From Surface Engineering to Synthetic Biology
2025-Jul-06, Biosensors
DOI:10.3390/bios15070434
PMID:40710084
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综述 | 本综述系统总结了提升ELISA检测灵敏度的策略，重点介绍了合成生物学在改进传统免疫检测方法中的应用 | 强调无细胞合成生物学技术在ELISA灵敏度提升中的新兴作用，包括表达免疫分析、CRISPR联用免疫分析(CLISA)和T7 RNA聚合酶联用免疫传感分析(TLISA)等创新方法 | NA | 提升酶联免疫吸附测定(ELISA)的检测灵敏度，缩小与核酸检测方法之间的灵敏度差距 | 蛋白质生物标志物检测技术 | 合成生物学 | NA | ELISA, 无细胞合成生物学, CRISPR, T7 RNA聚合酶系统 | NA | NA | NA | CRISPR, T7 RNA聚合酶系统 | 无细胞系统 | 可编程核酸和蛋白质合成系统 | 医学诊断 |
| 50 | 2025-10-05 |
Core biological principles and tools stemming from basic Arabidopsis research
2025-Jul-01, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf141
PMID:40479512
|
综述 | 本文探讨拟南芥基础研究在免疫机制、基因组学、合成生物学和工具开发等领域的核心贡献 | 系统阐述拟南芥研究在跨物种生物学原理探索和技术工具开发中的桥梁作用 | NA | 总结拟南芥基础研究对生物学各领域的原理性贡献和工具开发 | 拟南芥及其衍生研究工具 | 植物生物学 | 弗里德赖希共济失调 | 泛基因组学、重复序列扩展分析、生长素诱导降解技术 | NA | NA | NA | NA | 拟南芥 | NA | 医学、生物技术 |
| 51 | 2025-10-05 |
Protein-glycan engineering in vaccine design: merging immune mechanisms with biotechnological innovation
2025-Jul-24, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.06.022
PMID:40713219
|
综述 | 本文综述了蛋白质-聚糖工程技术在疫苗设计中的应用及其免疫机制 | 整合CRISPR糖基编辑、合成生物学和糖修饰纳米颗粒等前沿生物技术实现聚糖结构的精准控制 | NA | 探讨蛋白质-聚糖工程如何提升疫苗效力并推动下一代糖工程疫苗开发 | 聚糖介导的免疫识别机制及其在疫苗设计中的应用 | 合成生物学 | 传染病、癌症、自身免疫性疾病 | CRISPR糖基编辑、合成生物学、纳米颗粒技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 52 | 2025-10-05 |
A Review of DNA Restriction-Free Overlapping Sequence Cloning Techniques for Synthetic Biology
2025-Jul, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70084
PMID:40713804
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综述 | 系统总结合成生物学中主要使用的无限制性酶重叠序列克隆技术及其发展与应用 | 首次系统比较各类RFOSC技术的效率、实用性和应用场景，提出方法选择应基于项目规模与需求的创新观点 | 未涉及传统限制性内切酶克隆方法的对比分析 | 评估合成生物学中DNA无酶克隆技术的发展现状与未来趋势 | 体外组装方法（Gibson Assembly、CPEC等）和体内重组方法（YHR、TAR等） | 合成生物学 | NA | DNA克隆技术 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, In-Fusion, LIC, SLIC, TEDA, YHR, IVA, TAR, PEDA | 酵母, 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 53 | 2025-10-05 |
Crucial roles of intracellular cyclic di-GMP in impacting the genes important for extracellular electron transfer by Geobacter metallireducens
2025-Jul-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00727-25
PMID:40464557
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建不同c-di-GMP水平的菌株，探究该分子对地杆菌胞外电子传递的调控机制 | 首次系统揭示c-di-GMP通过调控多血红素c型细胞色素和菌毛蛋白基因表达影响地杆菌胞外电子传递全过程 | c-di-GMP如何调控这些基因表达的具体机制尚不明确 | 探究细胞内c-di-GMP在细菌胞外电子传递中的调控作用 | Geobacter metallireducens细菌及其胞外电子传递相关基因 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、基因表达分析、基因敲除 | NA | 基因表达数据、电化学数据、生物膜形成数据 | 三种工程菌株（Gme-H、Gme-C、Gme-L） | 合成生物学方法 | Geobacter metallireducens | 通过调控c-di-GMP水平构建不同表型菌株 | 环境,能源 |
| 54 | 2025-10-05 |
Extracellular Peptide-Ligand Dimerization Actuator Receptor Design for Reversible and Spatially Dosed 3D Cell-Material Communication
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00482
PMID:39705005
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研究论文 | 本研究开发了一种可逆响应生物材料配体的合成跨膜受体平台EPDA，实现三维细胞-材料通讯 | 开发了新型EPDA受体平台，通过胞外肽配体二聚化可逆激活细胞响应，并创建了计算算法PETEI筛选配体-受体对 | NA | 连接合成生物学与生物材料领域，开发可感知和响应生物材料结合配体的跨膜受体 | 哺乳动物细胞、合成受体、肽配体 | 合成生物学 | NA | 硫醇-降冰片烯化学、肽配体图案化、计算算法设计 | NA | 荧光成像数据、结合亲和力预测数据 | 测试了基于预测结合亲和力排名前30的单体抗体 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 哺乳动物细胞 | 刺激性和抑制性受体对、肽配体二聚化激活系统、可逆蛋白合并/分离开关 | 医学, 再生医学 |
| 55 | 2025-10-05 |
Bacterial Therapeutics: Addressing the Affordability Gap in Cancer Therapy
2025-Jul-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0870
PMID:40660814
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综述 | 探讨细菌疗法作为低成本癌症免疫治疗替代方案的潜力 | 提出利用合成生物学和人工智能开发下一代细菌疗法，实现超过3万倍的成本节约 | NA | 解决癌症治疗中日益增长的经济负担问题 | 细菌免疫疗法 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 56 | 2025-10-05 |
Three cytochrome P450 88A subfamily enzymes, CYP88A108, CYP88A164, and CYP88A222, act as β-amyrin 11-oxidases involved in triterpenoid biosynthesis in Melia azedarach L
2025-Jul, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145362
PMID:40541870
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研究论文 | 本研究鉴定并功能表征了苦楝中三个CYP88A亚家族细胞色素P450基因作为β-香树脂醇11-氧化酶参与三萜类化合物生物合成 | 发现CYP88A108和CYP88A164具有双重功能，既能参与五环三萜合成也能参与柠檬苦素类合成，揭示了植物CYP88A P450s独特的催化多功能性 | NA | 阐明苦楝中五环三萜类化合物生物合成的酶学机制 | 苦楝(Melia azedarach L)中的CYP88A亚家族细胞色素P450基因 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、瞬时表达系统、酵母微粒体功能表征、系统发育重建、结构建模 | NA | 基因序列、蛋白质结构、酶活性数据 | NA | NA | 本氏烟(Nicotiana benthamiana)、酵母 | 三萜类化合物生物合成途径 | 医药、工业生物技术 |
| 57 | 2025-10-05 |
In Vivo Multicellular Feedback Control in Synthetic Microbial Consortia
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00862
PMID:40499137
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研究论文 | 本文提出了一种能够在合成微生物群落中实现稳定精确基因表达调控的生物分子控制架构 | 通过两个菌株间的分布式多细胞反馈回路实现分工合作，突破了传统单细胞生物分子控制的局限性 | NA | 开发能够保证基因表达稳定精确调控的生物分子控制架构 | 合成微生物群落中的两个细胞群体 | 合成生物学 | NA | 生物分子工程 | NA | 实验数据 | NA | NA | 微生物 | 分布式多细胞反馈回路 | 工业生物技术 |
| 58 | 2025-10-05 |
Investigating the Potential of Division of Labor in Synthetic Bacterial Communities for the Production of Violacein
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00120
PMID:40525226
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研究论文 | 本研究探索了在合成细菌群落中采用分工策略提高紫色杆菌素产量的潜力 | 通过将紫色杆菌素生物合成途径拆分到两个大肠杆菌亚群中，实现了2.5倍的产量提升 | 需要两个亚群具有相似的代谢负担水平和足够高的比例才能发挥优势 | 研究分工策略在合成微生物群落中提高代谢产物产量的效果 | 合成细菌群落和紫色杆菌素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 代谢途径分工设计，将紫色杆菌素合成途径拆分为VioABE和VioDC两个模块 | 工业生物技术, 医药 |
| 59 | 2025-10-05 |
Strategy for Generating Giant Unilamellar Vesicles with Tunable Size Using the Modified cDICE Method
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00026
PMID:40536055
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研究论文 | 本研究通过改进的连续液滴界面交叉封装方法，开发了一种可调控尺寸的巨型单层囊泡生成策略 | 通过系统调控腔室旋转时间、角频率和内溶液密度等关键参数，实现了对巨型单层囊泡尺寸分布的精确控制 | NA | 优化巨型单层囊泡的尺寸分布控制，为人工细胞构建提供技术支持 | 水包油乳液液滴生成的巨型单层囊泡 | 合成生物学 | NA | 改进的连续液滴界面交叉封装方法 | 物理模型 | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 60 | 2025-10-05 |
Engineered Membrane Vesicle Production via oprF or oprI Deletion Has Distinct Phenotypic Effects in Pseudomonas putida
2025-Jul-18, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00171
PMID:40607986
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研究论文 | 本研究通过删除oprF或oprI基因在恶臭假单胞菌中诱导高囊泡化，评估了不同基因工程策略对膜囊泡产量和菌株表型的影响 | 首次系统比较oprF和oprI基因缺失在恶臭假单胞菌中产生的高囊泡化表型差异，并发现plsB过表达可改善膜完整性 | 研究仅限于恶臭假单胞菌KT2440平台，未在其他细菌系统中验证 | 开发用于工业生物过程的膜囊泡合成生物学工具 | 恶臭假单胞菌KT2440及其膜囊泡 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、膜囊泡分析 | NA | 生物学实验数据 | 恶臭假单胞菌野生型和基因工程菌株 | 基因敲除 | 恶臭假单胞菌 | 高囊泡化表型工程 | 工业生物技术 |