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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-16 |
Advances in programmable DNA nanostructures enabling stimuli-responsive drug delivery and multimodal biosensing
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00057b
PMID:40585578
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综述 | 本文综述了可编程DNA纳米结构(包括Tile组装、折纸框架、球形核酸和刺激响应水凝胶)在刺激响应药物递送和多模态生物传感中的最新进展 | 系统整合了DNA纳米结构在肿瘤微环境刺激响应药物释放与多模态生物传感(FRET探针、电化学发光放大电路、SERS基底、细胞可变区传感技术)中的创新应用,并提出人工智能驱动设计与合成生物学-临床肿瘤学桥接的未来方向 | 仍存在可规模化制造瓶颈、免疫兼容性优化以及长期纳米毒性严格评估等转化挑战,且主要基于临床前结果 | 全面分析DNA工程化纳米结构的模块化设计策略、稳定性改进和多配体靶向能力,并总结其在多模态检测和精准癌症诊疗中的应用前景 | DNA纳米结构(Tile组装体、DNA折纸框架、球形核酸、刺激响应水凝胶)及其在癌症诊疗中的应用 | 数字病理学 | 肺癌 | DNA纳米技术, FRET, 电化学发光, SERS, 循环肿瘤DNA检测, 外泌体检测 | NA | 文本 | NA | NA | NA | 刺激响应药物释放纳米平台, 荧光共振能量转移探针, 电化学发光放大电路, SERS基底 | 医学 |
| 2 | 2026-09-03 |
5'-O-P-N Linkages of Phosphoramidate Nucleotides: Chemical Construction and Biological Impact
2025-08, Chemical record (New York, N.Y.)
DOI:10.1002/tcr.202500056
PMID:40442970
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综述 | 本文综述了5'-O-P-N键连接的磷酸酰胺核苷酸的化学构建方法及其生物学影响 | 系统总结了5'-O-P-N键的合成策略,包括磷酰胺化、催化方法和新兴绿色化学技术,并探讨了其在代谢、酶相互作用及抗病毒和抗癌药物中的潜力 | 未提供具体实验数据,仅限于文献综述和理论分析 | 探讨5'-O-P-N磷酸酰胺核苷酸的化学合成方法及其在药物设计和生物技术中的应用前景 | 5'-O-P-N键连接的磷酸酰胺核苷酸 | 化学生物学 | 癌症, 病毒感染 | 化学合成 | NA | 文献数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术 |
| 3 | 2026-09-02 |
A structure-oriented kinetics dataset of enzyme-substrate interactions
2025-08-26, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05829-5
PMID:40858593
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研究论文 | 本文介绍了SKiD,一个整合酶-底物相互作用动力学参数(k和K)与三维结构数据的综合结构化数据集,通过自动化程序整合现有生物信息学资源并辅以计算预测,手动解决数据错误,保留文献与实验条件元数据,提供酶-底物复合物的三维坐标。 | 首次将酶动力学参数与三维结构数据系统性地关联起来,形成一个结构化数据集,填补了功能与结构数据之间的空白,并通过自动化整合与计算预测增强数据,且手动处理错误数据。 | 未明确提及。 | 建立一个链接酶动力学参数与三维结构的综合数据集,以增强对酶功能结构性基础的理解,支持酶设计、合成生物学和代谢工程的应用。 | 酶与底物相互作用,具体为酶动力学参数k和K以及酶-底物复合物的三维结构。 | 生物信息学 | NA | 计算预测 | NA | 结构化数据、三维结构数据、动力学参数、元数据 | 未明确提及具体样本数量。 | NA | NA | NA | 酶设计、合成生物学、代谢工程 |
| 4 | 2026-08-25 |
Dendritic Membranized Coacervate Microdroplets: A Robust Platform for Synthetic-Living Cell Consortia
2025-08-13, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09772
PMID:40751679
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研究论文 | 该研究构建了由树状大分子和肽组成的膜化凝聚物微滴,作为稳健的合成细胞平台,用于模拟细胞行为和构建合成-天然细胞联合体 | 利用树状大分子的球形刚性结构,使膜化凝聚物微滴在生理离子强度下表现出超过两倍的临界盐浓度,显著增强了稳定性,并支持酶封装和化学通讯等类细胞功能 | 摘要中未明确提及局限性,可能包含对生理环境下长期稳定性和体内应用的进一步验证需求 | 开发稳健的合成细胞平台,以模拟细胞功能并用于药物递送和组织工程等生物医学应用 | 膜化凝聚物微滴,由带相反电荷的小树状大分子和多肽组成,并带有PEG-树状共聚物膜 | 合成生物学 | NA | 自组装 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | 信号转导通路 | 医学, 组织工程, 再生医学 |
| 5 | 2026-08-08 |
Synthetic Biocatalysis in Erythrocyte Microreactors for Gasotransmitter H2S Production and Vessel Vasodilation
2025-08, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502208
PMID:40451735
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研究论文 | 开发了红细胞微反应器用于持续产生硫化氢气体递质,实现血管舒张,并在体外验证其疗效 | 首次利用红细胞作为微反应器,通过封装PLP-PLys复合物,结合血红蛋白实现级联反应合成硫化氢,提供了一种可控且持续的气体递质递送策略 | 仅在体外试验中验证,未进行体内实验 | 设计模拟天然细胞功能的治疗性微反应器,用于气体递质递送和血管舒张治疗 | 红细胞微反应器,装载PLP-PLys复合物,用于产硫化氢 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 低渗膨胀法 | NA | 实验数据 | 使用离体胸主动脉环,具体数量未提及 | NA | 红细胞 | 级联反应途径,包括PLP-PLys复合物和血红蛋白介导的L-半胱氨酸转化为硫化氢 | 医学 |
| 6 | 2026-08-03 |
Insight into the eminent biotechnological applications of xylanolytic enzymes for sustainable bioprocessing
2025-Aug, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04415-1
PMID:40657403
|
综述 | 本文全面综述了木聚糖的结构、木聚糖酶在降解中的作用及其在造纸、食品、纺织和制药等行业的工业应用,并讨论了通过纳米生物技术和CRISPR/CAS等先进工具提高木聚糖酶热稳定性的方法。 | 整合了纳米生物技术、CRISPR/CAS技术、宏基因组生物勘探、蛋白质工程和合成生物学等前沿方法,用于木聚糖酶的热稳定性提升和应用拓展,并强调了监管框架和标准化对可持续性的重要性。 | 未详细讨论木聚糖酶大规模工业应用的经济可行性和潜在环境风险。 | 全面阐述木聚糖酶在生物技术和可持续生物加工中的多功能作用,并指出未来研究创新方向。 | 木聚糖及其降解酶(木聚糖酶) | 生物技术 | NA | CRISPR/CAS技术、纳米生物技术、宏基因组学、蛋白质工程、合成生物学 | NA | 文献资料 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 代谢通路(木聚糖降解通路) | 工业生物技术 |
| 7 | 2026-06-26 |
Multiactivity of Nanozyme Liposome Regulates the Homeostasis of Biochemical Microenvironment
2025-08-18, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202501918
PMID:40545445
|
研究论文 | 开发了一种具有多酶纳米酶活性的仿生脂质体,用于调节外源植入物引起的促炎因子,从而促进组织再生 | 首次将CeO纳米颗粒与人工膜自组装形成仿生脂质体,兼具抗血液成分粘附和调节生化微环境稳态的双重功能 | NA | 设计并构建能在初始移植阶段复制天然细胞功能的治疗性脂质体,用于组织工程中的合成生物学 | 多酶纳米酶脂质体及CeO纳米颗粒 | NA | NA | 自组装 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 8 | 2026-06-26 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA Under Multifactorial Conditions
2025-08-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
|
研究论文 | 开发了一种高通量5D荧光共振能量转移熔解退火方法,解析多因素条件下三链DNA的热稳定性和pH稳定性 | 首次预测了不同温度和离子环境下三链DNA的pH稳定性,并揭示了离子强度对Hoogsteen氢键的双重作用机制 | 未明确提及 | 揭示环境和序列因素如何调节三链DNA稳定性,并建立预测模型 | 三链DNA结构 | 分子生物学、核酸结构生物学 | NA | 5D荧光共振能量转移熔解退火 | 预测模型 | 荧光信号、熔解温度数据 | 414组缓冲条件 | NA | NA | NA | 基因靶向治疗、合成生物学应用 |
| 9 | 2026-05-30 |
Marine bioactives: Pioneering sustainable solutions for advanced cosmetics and therapeutics
2025-08, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107868
PMID:40684894
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综述 | 探讨海洋来源生物活性化合物在化妆品和医药领域的应用,并强调可持续发展和创新提取方法 | 系统评估海洋生物活性物在化妆品和医药中的潜力,提出创新提取方法如酶辅助和超临界流体萃取,并展示海洋细胞培养产量比传统提取高50倍,合成生物学可持续生产稀有化合物,纯化纯度达99.5%,环境影响降低60% | 监管挑战和可持续性问题被批判性审视,但未具体说明数据来源或研究限制 | 综述海洋生物活性物在化妆品和医药中的应用,并展望可持续发展方向 | 海洋来源的多糖、肽、脂质和色素等生物活性化合物 | 自然语言处理 | NA | 酶辅助提取、超临界流体萃取、海洋细胞培养、合成生物学、先进纯化技术 | NA | 文献数据 | 不适用 | 合成生物学 | 海藻、海洋无脊椎动物、微生物 | NA | 医药、化妆品 |
| 10 | 2026-05-20 |
The Dawn of High-Throughput and Genome-Scale Kinetic Modeling: Recent Advances and Future Directions
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00868
PMID:40262025
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综述 | 本文综述了高通量和全基因组规模动力学建模的最新进展与未来方向 | 整合机器学习与机械代谢模型、开发新型动力学参数数据库以及定制化参数化策略,推动了动力学建模领域的变革 | 未提及具体局限性,但历史上对详细参数化和大量计算资源的需求仍是挑战 | 促进系统生物学、合成生物学、代谢工程和医学研究在无前例规模和速度下取得进展 | 代谢过程的动力学模型及其在细胞过程表征中的应用 | 机器学习和系统生物学 | NA | 动力学建模、机器学习 | 机械代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 系统生物学、合成生物学、代谢工程、医学研究 |
| 11 | 2026-05-20 |
Development of CRISPRi Orthogonal Repression Systems in Plant Cells Using Synthetic Variants of the Figwort Mosaic Virus 34S Promoter with Two Identical sgRNA Binding Sites
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00356
PMID:40643567
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研究论文 | 本研究利用合成的苜蓿花叶病毒34S启动子变体结合两个相同的sgRNA结合位点,在植物细胞中开发了CRISPRi正交抑制系统 | 首次系统评估不同启动子的CRISPRi抑制效率,并发现两个相同sgRNA结合位点的启动子比异质位点更易被抑制;同时结合Cre/loxP RNA支架正交系统设计了基因开关 | 研究仅在烟草叶片中进行瞬时表达评估,缺乏稳定转化和更广泛植物物种的验证 | 开发用于植物细胞基因表达精确调控的CRISPRi正交抑制系统和遗传开关 | 植物细胞中的不同启动子(尤其是34S启动子变体) | 合成生物学 | NA | CRISPRi, 瞬时基因表达, 农杆菌浸润 | NA | 表达数据 | 33个34S启动子变体 | CRISPR-Cas9, Cre/loxP | 烟草 | CRISPRi抑制系统, Cre/loxP RNA支架正交系统, 基因开关 | 农业, 合成生物学 |
| 12 | 2026-05-19 |
Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for de novo biosynthesis of hydroxytyrosol and salidroside
2025-08-20, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00712-25
PMID:40668011
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研究论文 | 通过代谢工程改造酿酒酵母实现羟基酪醇和红景天苷的从头生物合成 | 首次在酿酒酵母中实现羟基酪醇和红景天苷的高效从头合成,通过优化酪醇生产菌株并增强UDP-葡萄糖供应,显著提高了产量 | 未提及具体局限性 | 实现羟基酪醇和红景天苷在酵母中的高效生物合成,为其工业应用奠定基础 | 酿酒酵母工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,发酵 | NA | 产量数据,发酵数据 | 多个工程菌株,包括ZYT1、ZYHT1、ZYSAL1、ZYSAL9+3等 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 酪醇合成途径,羟基酪醇合成途径,红景天苷合成途径 | 工业生物技术 |
| 13 | 2026-05-19 |
Progress in the Biosynthesis of Cosmetic Ingredients through Engineering of Saccharomyces cerevisiae
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00199
PMID:40670299
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综述 | 综述了通过工程化酿酒酵母生物合成化妆品成分的最新进展 | 系统总结了利用酿酒酵母生产抗氧化、修复、保湿和结构维持等化妆品成分的先进策略,并首次探讨了人工智能和机器学习在菌株设计与过程控制中的整合应用 | 存在代谢负担等挑战 | 推动合成生物学在化妆品行业中的应用,实现化妆品成分的可持续规模化生产 | 酿酒酵母 | NA | NA | 代谢工程、遗传工程、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 代谢通路 | 化妆品 |
| 14 | 2026-05-19 |
Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica with Massive Gene Assembly and Genomic Integration
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00333
PMID:40676857
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研究论文 | 在解脂耶氏酵母中开发了一种大规模基因组装和基因组整合策略,成功实现多基因稳定整合并优化了番茄红素合成途径 | 首次在解脂耶氏酵母中实现超过30 kb的多基因(十数基因)一锅式组装和基因组整合,并构建了含35个外源基因(总长93.5 kb)的工程菌株 | 文中未具体讨论该策略在不同代谢途径中的通用性及可能存在的遗传稳定性问题 | 开发解脂耶氏酵母的大规模基因组装和整合方法,提升代谢工程能力 | 解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) | 合成生物学 | NA | 基因组装、基因组整合、代谢工程 | NA | 生物化学数据(产量、滴度) | 含15个外源基因的优化工程菌株,在5 L生物反应器中验证 | Gibson Assembly、Golden Gate Assembly | 解脂耶氏酵母 | 多基因组装整合系统,番茄红素合成代谢通路 | 工业生物技术 |
| 15 | 2026-05-19 |
Hydrogel-Immobilized Multienzyme Systems for Cell-Free Chemical Bioproduction
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00234
PMID:40689784
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研究论文 | 本文展示了一种利用聚乙二醇二丙烯酸酯水凝胶共固定多种无细胞表达酶的方法,用于化学品的可持续生物生产 | 首次将多种无细胞表达酶共同固定在甘油增强的PEGDA水凝胶中,实现酶的长期保留、可重复使用和更高活性,并利用小角X射线散射验证了水凝胶网孔与酶尺寸的匹配 | 未详细讨论固定化酶在工业规模下的放大可行性及不同底物条件下的长期稳定性 | 开发可重复使用、稳定且耐用的多酶系统,推动无细胞合成生物学在实际部署中的应用 | 三种异源无细胞酶(用于丙酮酸到苹果酸的转化)以及水凝胶固定化体系 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达、小角X射线散射、荧光测量 | NA | 散射数据、荧光测量数据 | NA | 光交联 | 大肠杆菌裂解液 | 多酶生物转化途径(丙酮酸至苹果酸) | 工业生物技术 |
| 16 | 2026-05-19 |
Engineering Cell Fate with Adaptive Feedback Control
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00299
PMID:40698642
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研究论文 | 设计一种自适应反馈控制器来引导细胞命运决策,使分化为特定细胞类型更高效 | 提出基于隔离机制的仿射前馈环结构合成控制器,无需内源网络详细知识即可实现偏向特定细胞命运 | 研究基于理论分析和计算模拟,尚未经实验验证;参数扰动下性能需进一步评估 | 通过合成生物学方法设计细胞命运控制器,优化干细胞治疗中的细胞分化产量 | 内源调控网络中的多稳态系统及目标物种 | 合成生物学 | NA | 合成基因回路设计 | 非线性模型(多稳态系统建模) | 模拟数据 | NA | NA | NA | 类非相干前馈环(IFFL)拓扑的自适应控制器,包含隔离机制和中间物种引入的延迟 | 医学 |
| 17 | 2026-05-19 |
CRISPR-Cas10-Assisted Structural Modification of Staphylococcal Kayvirus for Imaging and Biosensing Applications
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00387
PMID:40720830
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研究论文 | 利用CRISPR-Cas10技术对葡萄球菌Kayvirus进行结构修饰,并实现成像和生物传感应用 | 首次实现葡萄球菌噬菌体结构蛋白的修饰,通过插入多组氨酸标签于尾鞘蛋白暴露环,结合CRISPR-Cas10辅助反选择,获得功能完整的重组噬菌体 | 未提及长期稳定性和体内应用效果 | 通过CRISPR-Cas10辅助基因编辑技术对葡萄球菌噬菌体进行结构修饰,开发其在成像和生物传感中的应用 | 噬菌体812h1(属于Kayvirus属)的结构蛋白 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas10, 同源重组,荧光显微镜,生物层干涉测量,酶联免疫吸附试验,流式细胞术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas10 | 葡萄球菌 | 多组氨酸标签插入尾鞘蛋白暴露环 | 医学,纳米技术,合成生物学 |
| 18 | 2026-05-19 |
Optimization of Malonyl Coenzyme A Biosensors in a Reconstituted Cell-Free System for Detecting Acetyl-CoA Carboxylase Activity
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00361
PMID:40742616
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研究论文 | 优化了重组无细胞系统中的丙二酰辅酶A生物传感器,用于检测乙酰辅酶A羧化酶活性 | 通过在T7启动子和FapO操纵子之间工程化间隔序列,开发了检测范围广(50-1500 μM)、动态范围高达95.3倍的体外丙二酰辅酶A生物传感器系统,并筛选了来自不同芽孢杆菌种的同源FapR/FapO对,实现对低浓度丙二酰辅酶A的高灵敏度检测 | 未提及明显局限性,但基于合成生物学工具的无细胞系统可能面临成本和生产规模限制 | 优化丙二酰辅酶A生物传感器,实现乙酰辅酶A羧化酶活性的高灵敏度检测,以推进代谢工程和合成生物学 | 丙二酰辅酶A生物传感器和乙酰辅酶A羧化酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成系统 | FapR/FapO生物传感器 | 荧光信号 | NA | FapR/FapO系统,间隔序列工程 | 无细胞系统(大肠杆菌提取物) | 丙二酰辅酶A生物传感器电路(基于FapR/FapO系统) | 工业生物技术,代谢工程 |
| 19 | 2026-05-19 |
Bioluminescence-Driven Optimization of Geminivirus-Based Vectors as Tools for Plant Biotechnology
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00164
PMID:40758859
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研究论文 | 利用自发光技术优化基于双生病毒的载体,用于植物生物技术中的合成生物学应用 | 首次使用自发光作为实时报告系统来表征和优化三种双生病毒复制子的表达特性,实现了对TYLCV系统调控精度的提升 | BCTV系统表现出较差的控制和表达水平,限制了其应用潜力;研究仅评估了三种病毒,未涵盖所有可能的双生病毒 | 优化基于双生病毒的载体,以增强其在植物合成生物学中的应用 | 三种双生病毒复制子(BeYDV、TYLCV、BCTV) | 合成生物学 | NA | 自发光成像 | NA | 发光图像 | NA | NA | 植物 | 双生病毒复制子(基于BeYDV、TYLCV、BCTV) | 农业, 工业生物技术 |
| 20 | 2026-05-19 |
Rational Modulation of Plant Root Development Using Engineered Cytokinin Regulators
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00051
PMID:40737362
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研究论文 | 利用工程化细胞分裂素响应调控因子合理调控植物根系发育 | 通过工程化B型响应调控因子,可调节其转录活性(抑制或激活)和效力,同时降低对细胞分裂素的敏感性,利用组织特异性启动子实现对细胞分裂素调控性状的可预测调控 | 设计中涉及的合成遗传程序复杂性及信号过程间固有相互作用仍是关键挑战 | 实现对植物定量发育表型的精确控制 | 拟南芥中的侧根数量 | 合成生物学 | NA | 合成生物学载体构建、组织特异性启动子 | NA | NA | NA | 质粒构建 | 拟南芥 | 细胞分裂素信号通路调控开关 | 农业 |