合成生物学相关文章
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当前共找到 93 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-13 |
Human Synthetic Biology and Programmable Gene Regulation Control
2025-08, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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综述 | 本文回顾了人类合成生物学领域的最新进展，重点关注可编程基因表达控制工具的开发与应用 | 整合了高通量方法，开发了在DNA、RNA和蛋白质水平上模块化调控的多层次基因表达控制工具，并应用于治疗领域 | NA | 探讨人类合成生物学中可编程基因调控控制的发展，以操纵细胞表型和功能 | 人类细胞中的合成基因系统和可编程遗传工具 | 合成生物学 | NA | 高通量合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 人类细胞 | 合成基因电路、逻辑门、生物传感器 | 医学 |
| 2 | 2025-11-25 |
Toehold-VISTA: A machine learning approach to decipher programmable RNA sensor-target interactions
2025-Aug-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.12.669990
PMID:40832290
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研究论文 | 提出一种结合机器学习的RNA传感器设计框架Toehold-VISTA，用于快速设计高性能RNA传感器 | 整合RNA生物物理建模与机器学习（PLS-DA），通过高通量实验数据训练预测模型，实现RNA传感器性能关键决定因素的捕捉 | NA | 加速RNA传感器的设计与工程化应用 | RNA传感器与靶标RNA的相互作用 | 机器学习 | COVID-19 | 高通量实验测量、序列-结构特征提取 | PLS-DA（偏最小二乘判别分析） | RNA序列与结构数据 | NA | toehold switches | NA | RNA生物传感器 | 生物技术, 诊断 |
| 3 | 2025-11-18 |
Innovative approaches in bioremediation: the role of halophilic microorganisms in mitigating hydrocarbons, toxic metals, and microplastics in hypersaline environments
2025-Aug-14, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02817-7
PMID:40804729
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综述 | 本文综述了嗜盐微生物在高盐环境中修复碳氢化合物、有毒金属和微塑料污染的作用及生物技术应用 | 系统探讨了工程化嗜盐微生物在极端环境生物修复中的创新应用，结合基因编辑和合成生物学技术提升污染物降解效率 | 存在基因工程菌株优化难度大、生物安全性保障不足、微生物生态理解不深以及规模化应用成本较高等挑战 | 研究嗜盐微生物在高盐环境污染物生物修复中的应用潜力 | 嗜盐和耐盐微生物及其在高盐环境中的生物修复功能 | 环境生物技术 | NA | 基因编辑、重组DNA技术、组学方法 | NA | NA | NA | 基因编辑, 重组DNA | 嗜盐微生物 | 污染物降解代谢通路 | 环境 |
| 4 | 2025-11-11 |
Characterization of recombinase activity across cellular growth phases
2025-Aug-25, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17024-y
PMID:40855116
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研究论文 | 研究细菌生长阶段如何影响重组酶Bxb1介导的DNA修饰效率 | 首次系统揭示静止期重组酶活性特征及诱导时机对重组效率的优化作用 | 仅使用大肠杆菌和Bxb1重组酶作为模型系统 | 探索细菌生长阶段对重组酶活性的影响机制 | 大肠杆菌和丝氨酸重组酶Bxb1 | 合成生物学 | NA | 遗传工程系统、重组效率定量分析 | NA | 分子生物学实验数据 | NA | 遗传工程系统 | 大肠杆菌 | 重组酶介导的DNA修饰系统 | 生物医学研究, 基因治疗, 合成生物学 |
| 5 | 2025-11-03 |
Cancer stem cells: landscape, challenges and emerging therapeutic innovations
2025-Aug-05, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02360-2
PMID:40759634
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综述 | 本文综述癌症干细胞（CSCs）的特性、研究挑战及新兴治疗策略 | 整合单细胞测序、空间转录组学与多组学数据揭示CSCs异质性，提出双代谢抑制与合成生物学干预等创新疗法 | 缺乏普适性CSCs生物标志物，难以靶向CSCs同时不影响正常干细胞 | 探讨CSCs在肿瘤治疗抵抗中的作用机制及靶向治疗策略 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组学, 多组学整合, CRISPR筛选, AI驱动分析 | 3D类器官模型 | 多组学数据 | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 6 | 2025-10-05 |
SpyRing-Mediated Cyclization of TEV Protease, Guided by AlphaFold, Improves Thermostability
2025-Aug-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05386
PMID:40787351
|
研究论文 | 本研究通过SpyRing系统实现TEV蛋白酶环化，结合AlphaFold结构预测优化设计，显著提高了酶的热稳定性 | 首次将SpyTag/SpyCatcher介导的环化系统与AlphaFold结构预测相结合，成功实现了N端和C端相距较远（约40 Å）的TEV蛋白酶环化 | 研究仅针对特定TEVp变体（L56V, S135G, S219V, Δ238-242），未验证在其他蛋白酶或蛋白质中的普适性 | 开发一种计算引导的蛋白质环化策略，提高蛋白酶的热稳定性 | 烟草蚀纹病毒蛋白酶（TEVp）及其环化变体 | 蛋白质工程 | NA | SpyTag/SpyCatcher环化系统，AlphaFold结构预测 | NA | 蛋白质结构数据，酶活性数据 | NA | SpyRing系统 | NA | 通过SpyTag和SpyCatcher结构域融合实现分子内环化 | 合成生物学，工业生物技术 |
| 7 | 2025-10-05 |
Unveiling the Frontiers of Synthetic Biology in Brazil: Pioneering the National Synthetic Biology Network
2025-Aug-05, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c03077
PMID:40787363
|
综述 | 本文探讨巴西合成生物学发展现状及国家合成生物学网络的建立意义 | 首次系统阐述巴西合成生物学网络的建设框架与发展潜力 | 国际社会对巴西科研监管环境认知不足 | 分析巴西合成生物学生态系统关键要素并推动国家生物技术能力建设 | 巴西合成生物学研究群体与基础设施 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术, 环境 |
| 8 | 2025-10-06 |
Streamline automated biomedical discoveries with agentic bioinformatics
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf505
PMID:41016012
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综述 | 探讨基于大语言模型的智能代理在计算生物学中形成的代理生物信息学新领域的核心原理、方法和应用 | 提出将自主、自适应和智能代理系统应用于解决复杂生物问题的新型研究范式 | NA | 探索代理生物信息学在推动生物医学发现和临床应用的潜力 | 代理生物信息学系统及其在生物医学领域的应用 | 计算生物学 | NA | 大语言模型 | 智能代理系统 | 生物数据集 | NA | NA | NA | NA | 个性化医疗, 药物发现, 合成生物学 |
| 9 | 2025-10-05 |
Biofilms Exposed: Innovative Imaging and Therapeutic Platforms for Persistent Infections
2025-Aug-28, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14090865
PMID:41009844
|
综述 | 探讨生物膜持久性感染的分子机制、诊断治疗局限及新兴技术解决方案 | 整合超分辨率显微镜、微流控、AI建模与合成生物学技术，提出从反应性抗生素治疗转向精准生物膜管理的范式转变 | NA | 构建突破生物膜结构、重新定义感染治疗的综合性框架 | 临床和工业环境中的生物膜 | NA | 慢性感染 | 超分辨率显微镜, 微流控, AI建模, CRISPR-Cas, 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | 工程化益生菌基因回路, 自我调节微生物群落 | 医学 |
| 10 | 2025-10-05 |
Untangling the Complexity of Two-Component Signal Transduction in Bacteria
2025-Aug-28, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13092013
PMID:41011345
|
综述 | 本文探讨细菌双组分信号转导系统的非典型结构与调控机制 | 系统阐述非典型双组分系统的转录调控多样性、替代性反应调节蛋白活性及磷酸化控制机制 | 对非典型双组分系统的生理相关性及工程化潜力仍存在知识空白 | 解析细菌双组分信号转导系统的多样性及其在生物技术和医学中的应用潜力 | 细菌双组分信号转导系统（TCSs） | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | NA | NA | 细菌 | 双组分信号转导系统（包含组氨酸激酶和反应调节蛋白） | 生物技术, 医学 |
| 11 | 2025-10-05 |
Microalgae-Based 3D Bioprinting: Recent Advances, Applications and Perspectives
2025-Aug-27, Marine drugs
IF:4.9Q1
DOI:10.3390/md23090342
PMID:41003311
|
综述 | 本文综述了微藻基3D生物打印技术的最新进展、应用领域及未来展望 | 将微藻封装于生物活性基质并结合3D生物打印技术构建定制化结构，突破传统液体浸没培养的限制 | NA | 分析3D生物打印的基质与方法，总结微藻基3D生物打印在六大领域的发展 | 微藻及3D生物打印技术 | 合成生物学 | NA | 3D生物打印 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | NA | 生物材料, 能源, 生物制造, 环境修复, 组织工程, 食品工程 |
| 12 | 2025-10-05 |
Sophisticated Interfaces Between Biosensors and Organoids: Advancing Towards Intelligent Multimodal Monitoring Physiological Parameters
2025-Aug-22, Biosensors
DOI:10.3390/bios15090557
PMID:41002297
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综述 | 本文系统综述了类器官与生物传感器集成的多模态监测技术及其在生理参数智能监测中的应用 | 提出了类器官传感技术向增强仿生性和智能化发展的综合框架，系统比较了多种技术集成方法 | 未涉及传感器在血管化类器官中植入、长期培养信号稳定性及临床转化标准化等具体技术挑战的解决方案 | 为研究人员提供选择合适技术方法的框架，推动类器官传感技术发展 | 类器官与生物传感器的集成系统 | 生物医学工程 | NA | 微流控集成系统、微电极阵列电生理记录、光学传感、机械力传感、场效应晶体管传感、合成生物学工具、无标记技术 | NA | 电信号、光学信号、机械信号、化学信号 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | 药物开发、毒性测试、个性化医疗 |
| 13 | 2025-10-05 |
Modular multi-enzyme cascades enable green and sustainable synthesis of non-canonical amino acids from glycerol
2025-Aug-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63341-1
PMID:40883312
|
研究论文 | 开发模块化多酶级联平台，利用甘油可持续合成非经典氨基酸 | 通过定向进化OPSS酶将C-N键形成催化效率提升5.6倍，建立可扩展至2升反应系统的模块化平台 | NA | 开发绿色可持续的非经典氨基酸合成方法 | 非经典氨基酸（含C-S、C-Se和C-N侧链） | 合成生物学 | NA | 定向进化、多酶级联催化 | NA | NA | 22种非经典氨基酸，克至十克级规模 | NA | NA | 模块化多酶级联系统 | 医药, 合成生物学, 生物材料 |
| 14 | 2025-10-05 |
Advances in programmable DNA nanostructures enabling stimuli-responsive drug delivery and multimodal biosensing
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00057b
PMID:40585578
|
综述 | 本文系统分析DNA纳米结构在刺激响应型药物递送和多模式生物传感中的创新应用 | 重点阐述DNA纳米结构对肿瘤微环境刺激的动态响应能力及其在多模式检测中的创新应用 | 存在规模化制造瓶颈、免疫兼容性优化不足以及长期纳米毒性评估不充分等关键转化挑战 | 解决精准医疗中靶向药物递送和生物医学成像的关键挑战 | DNA工程纳米结构（包括瓦片组装体、折纸框架、球形核酸和刺激响应水凝胶） | 合成生物学 | 癌症 | FRET探针、电化学发光放大电路、SERS底物、细胞可变区传感技术 | NA | NA | NA | DNA纳米技术 | NA | 刺激响应型药物递送系统、多模式生物传感电路 | 医学 |
| 15 | 2025-10-05 |
Introduction to "Biomolecular Technologies"
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb90031j
PMID:40843437
|
综述 | 介绍生物分子技术领域的最新进展及其在基础科学和实际应用中的机会 | 汇集了基于工程生物分子的多种技术，涵盖小分子、核酸和蛋白质，展示生物分子设计的模块化和可调性 | NA | 概述生物分子技术在生物催化、生物传感和合成生物学等领域的应用 | 工程生物分子（小分子、核酸、蛋白质） | 合成生物学 | NA | 生物分子工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 生物传感, 合成生物学 |
| 16 | 2025-10-05 |
Gene duplication and clustering underlie the conservation and diversification of benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis in plants
2025-Aug-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63175-x
PMID:40826018
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研究论文 | 本研究揭示了植物中苄基异喹啉生物碱（BIA）生物合成途径的保守性与多样化机制，重点关注基因复制和基因簇形成的作用 | 首次在木兰类植物中发现CYP80G介导的酚偶联反应，揭示了BIA骨架形成基因在木兰类和毛茛目之间的保守性，并发现CYP80B与4'OMT、6-OMT基因的动态簇聚现象 | 研究主要集中于蕺菜（Houttuynia cordata），对其他木兰类植物的BIA生物合成研究仍较少 | 探究植物中苄基异喹啉生物碱生物合成的进化机制和基因组织方式 | 蕺菜（Houttuynia cordata）及其他被子植物中的BIA生物合成基因 | 植物分子生物学 | NA | 功能分析、全基因组分析、酶学表征 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 17 | 2025-10-05 |
Engineering Cell Fate with Adaptive Feedback Control
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00299
PMID:40698642
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研究论文 | 提出一种生物分子自适应控制器，通过合成生物学方法优化干细胞分化过程中的细胞命运决策 | 设计了一种类似非相干前馈环（IFFL）拓扑结构的自适应控制器，无需详细内源网络机制知识即可实现细胞命运偏置 | 需要足够的隔离速率才能实现理想的微分输出特性，且性能受参数扰动影响 | 优化基于干细胞的治疗方法，提高特定细胞类型的产量 | 干细胞分化过程中的细胞命运决策机制 | 合成生物学 | 创伤或疾病相关的细胞替代治疗 | 合成基因电路设计 | 自适应控制器 | 理论分析和计算模拟 | NA | 合成基因电路 | 干细胞 | 基于隔离机制和中间物种延迟的非相干前馈环（IFFL）拓扑结构 | 医学 |
| 18 | 2025-10-05 |
CRISPR-Cas10-Assisted Structural Modification of Staphylococcal Kayvirus for Imaging and Biosensing Applications
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00387
PMID:40720830
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研究论文 | 利用CRISPR-Cas10辅助技术对葡萄球菌Kay病毒进行结构修饰，实现成像和生物传感应用 | 首次报道葡萄球菌噬菌体结构蛋白的修饰，开发了双菌株编辑策略结合CRISPR-Cas10反选系统 | 仅针对812h1噬菌体进行验证，未测试其他噬菌体系统的适用性 | 开发噬菌体结构蛋白工程化方法并验证其生物应用 | 葡萄球菌噬菌体812h1及其尾部鞘蛋白 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas10基因编辑、同源重组、荧光显微镜、生物层干涉术、ELISA、流式细胞术 | NA | 图像数据、生物传感数据 | NA | CRISPR-Cas10 | 葡萄球菌噬菌体 | 在尾部鞘蛋白暴露环中插入多组氨酸标签 | 医学,纳米技术,合成生物学 |
| 19 | 2025-10-05 |
Optimization of Malonyl Coenzyme A Biosensors in a Reconstituted Cell-Free System for Detecting Acetyl-CoA Carboxylase Activity
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00361
PMID:40742616
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研究论文 | 本研究通过优化FapR/FapO生物传感器，开发了一种用于检测乙酰辅酶A羧化酶活性的重构无细胞系统 | 通过工程化T7启动子与FapO操纵子间的间隔序列，开发了具有宽检测范围（50-1500 μM）的无细胞丙二酰辅酶A生物传感器系统，最大动态范围达到95.3倍 | NA | 开发高灵敏度的丙二酰辅酶A生物传感器用于ACC的高通量筛选和定向进化 | FapR/FapO生物传感器系统和乙酰辅酶A羧化酶（ACC） | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成系统，定向进化，高通量筛选 | NA | 荧光信号数据 | NA | 启动子工程，同源筛选 | NA | FapR/FapO生物传感器系统，可将丙二酰辅酶A浓度转换为荧光信号 | 工业生物技术，医药 |
| 20 | 2025-10-05 |
Bioluminescence-Driven Optimization of Geminivirus-Based Vectors as Tools for Plant Biotechnology
2025-Aug-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00164
PMID:40758859
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研究论文 | 本研究利用自主生物发光技术优化了三种双生病毒载体在植物合成生物学中的应用 | 首次使用自主生物发光作为实时报告系统来表征双生病毒载体的基因表达特性 | BCTV载体表现出较差的表达控制水平 | 优化双生病毒载体作为植物生物技术工具 | 菜豆黄矮病毒(BeYDV)、番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)和甜菜曲顶病毒(BCTV)的合成复制子 | 合成生物学 | NA | 自主生物发光报告系统 | NA | 生物发光信号数据 | 三种双生病毒复制子系统 | Gibson Assembly | 植物 | 合成复制子、多基因表达系统 | 农业,工业生物技术 |