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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-30 |
Marine bioactives: Pioneering sustainable solutions for advanced cosmetics and therapeutics
2025-08, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107868
PMID:40684894
|
综述 | 探讨海洋来源生物活性化合物在化妆品和医药领域的应用,并强调可持续发展和创新提取方法 | 系统评估海洋生物活性物在化妆品和医药中的潜力,提出创新提取方法如酶辅助和超临界流体萃取,并展示海洋细胞培养产量比传统提取高50倍,合成生物学可持续生产稀有化合物,纯化纯度达99.5%,环境影响降低60% | 监管挑战和可持续性问题被批判性审视,但未具体说明数据来源或研究限制 | 综述海洋生物活性物在化妆品和医药中的应用,并展望可持续发展方向 | 海洋来源的多糖、肽、脂质和色素等生物活性化合物 | 自然语言处理 | NA | 酶辅助提取、超临界流体萃取、海洋细胞培养、合成生物学、先进纯化技术 | NA | 文献数据 | 不适用 | 合成生物学 | 海藻、海洋无脊椎动物、微生物 | NA | 医药、化妆品 |
| 2 | 2026-05-20 |
The Dawn of High-Throughput and Genome-Scale Kinetic Modeling: Recent Advances and Future Directions
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.4c00868
PMID:40262025
|
综述 | 本文综述了高通量和全基因组规模动力学建模的最新进展与未来方向 | 整合机器学习与机械代谢模型、开发新型动力学参数数据库以及定制化参数化策略,推动了动力学建模领域的变革 | 未提及具体局限性,但历史上对详细参数化和大量计算资源的需求仍是挑战 | 促进系统生物学、合成生物学、代谢工程和医学研究在无前例规模和速度下取得进展 | 代谢过程的动力学模型及其在细胞过程表征中的应用 | 机器学习和系统生物学 | NA | 动力学建模、机器学习 | 机械代谢模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 系统生物学、合成生物学、代谢工程、医学研究 |
| 3 | 2026-05-20 |
Development of CRISPRi Orthogonal Repression Systems in Plant Cells Using Synthetic Variants of the Figwort Mosaic Virus 34S Promoter with Two Identical sgRNA Binding Sites
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00356
PMID:40643567
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研究论文 | 本研究利用合成的苜蓿花叶病毒34S启动子变体结合两个相同的sgRNA结合位点,在植物细胞中开发了CRISPRi正交抑制系统 | 首次系统评估不同启动子的CRISPRi抑制效率,并发现两个相同sgRNA结合位点的启动子比异质位点更易被抑制;同时结合Cre/loxP RNA支架正交系统设计了基因开关 | 研究仅在烟草叶片中进行瞬时表达评估,缺乏稳定转化和更广泛植物物种的验证 | 开发用于植物细胞基因表达精确调控的CRISPRi正交抑制系统和遗传开关 | 植物细胞中的不同启动子(尤其是34S启动子变体) | 合成生物学 | NA | CRISPRi, 瞬时基因表达, 农杆菌浸润 | NA | 表达数据 | 33个34S启动子变体 | CRISPR-Cas9, Cre/loxP | 烟草 | CRISPRi抑制系统, Cre/loxP RNA支架正交系统, 基因开关 | 农业, 合成生物学 |
| 4 | 2026-05-19 |
Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for de novo biosynthesis of hydroxytyrosol and salidroside
2025-08-20, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00712-25
PMID:40668011
|
研究论文 | 通过代谢工程改造酿酒酵母实现羟基酪醇和红景天苷的从头生物合成 | 首次在酿酒酵母中实现羟基酪醇和红景天苷的高效从头合成,通过优化酪醇生产菌株并增强UDP-葡萄糖供应,显著提高了产量 | 未提及具体局限性 | 实现羟基酪醇和红景天苷在酵母中的高效生物合成,为其工业应用奠定基础 | 酿酒酵母工程菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,发酵 | NA | 产量数据,发酵数据 | 多个工程菌株,包括ZYT1、ZYHT1、ZYSAL1、ZYSAL9+3等 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | 酪醇合成途径,羟基酪醇合成途径,红景天苷合成途径 | 工业生物技术 |
| 5 | 2026-05-19 |
Progress in the Biosynthesis of Cosmetic Ingredients through Engineering of Saccharomyces cerevisiae
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00199
PMID:40670299
|
综述 | 综述了通过工程化酿酒酵母生物合成化妆品成分的最新进展 | 系统总结了利用酿酒酵母生产抗氧化、修复、保湿和结构维持等化妆品成分的先进策略,并首次探讨了人工智能和机器学习在菌株设计与过程控制中的整合应用 | 存在代谢负担等挑战 | 推动合成生物学在化妆品行业中的应用,实现化妆品成分的可持续规模化生产 | 酿酒酵母 | NA | NA | 代谢工程、遗传工程、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母 | 代谢通路 | 化妆品 |
| 6 | 2026-05-19 |
Metabolic Engineering of Yarrowia lipolytica with Massive Gene Assembly and Genomic Integration
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00333
PMID:40676857
|
研究论文 | 在解脂耶氏酵母中开发了一种大规模基因组装和基因组整合策略,成功实现多基因稳定整合并优化了番茄红素合成途径 | 首次在解脂耶氏酵母中实现超过30 kb的多基因(十数基因)一锅式组装和基因组整合,并构建了含35个外源基因(总长93.5 kb)的工程菌株 | 文中未具体讨论该策略在不同代谢途径中的通用性及可能存在的遗传稳定性问题 | 开发解脂耶氏酵母的大规模基因组装和整合方法,提升代谢工程能力 | 解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica) | 合成生物学 | NA | 基因组装、基因组整合、代谢工程 | NA | 生物化学数据(产量、滴度) | 含15个外源基因的优化工程菌株,在5 L生物反应器中验证 | Gibson Assembly、Golden Gate Assembly | 解脂耶氏酵母 | 多基因组装整合系统,番茄红素合成代谢通路 | 工业生物技术 |
| 7 | 2026-05-19 |
Hydrogel-Immobilized Multienzyme Systems for Cell-Free Chemical Bioproduction
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00234
PMID:40689784
|
研究论文 | 本文展示了一种利用聚乙二醇二丙烯酸酯水凝胶共固定多种无细胞表达酶的方法,用于化学品的可持续生物生产 | 首次将多种无细胞表达酶共同固定在甘油增强的PEGDA水凝胶中,实现酶的长期保留、可重复使用和更高活性,并利用小角X射线散射验证了水凝胶网孔与酶尺寸的匹配 | 未详细讨论固定化酶在工业规模下的放大可行性及不同底物条件下的长期稳定性 | 开发可重复使用、稳定且耐用的多酶系统,推动无细胞合成生物学在实际部署中的应用 | 三种异源无细胞酶(用于丙酮酸到苹果酸的转化)以及水凝胶固定化体系 | 合成生物学 | NA | 无细胞基因表达、小角X射线散射、荧光测量 | NA | 散射数据、荧光测量数据 | NA | 光交联 | 大肠杆菌裂解液 | 多酶生物转化途径(丙酮酸至苹果酸) | 工业生物技术 |
| 8 | 2026-05-19 |
Engineering Cell Fate with Adaptive Feedback Control
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00299
PMID:40698642
|
研究论文 | 设计一种自适应反馈控制器来引导细胞命运决策,使分化为特定细胞类型更高效 | 提出基于隔离机制的仿射前馈环结构合成控制器,无需内源网络详细知识即可实现偏向特定细胞命运 | 研究基于理论分析和计算模拟,尚未经实验验证;参数扰动下性能需进一步评估 | 通过合成生物学方法设计细胞命运控制器,优化干细胞治疗中的细胞分化产量 | 内源调控网络中的多稳态系统及目标物种 | 合成生物学 | NA | 合成基因回路设计 | 非线性模型(多稳态系统建模) | 模拟数据 | NA | NA | NA | 类非相干前馈环(IFFL)拓扑的自适应控制器,包含隔离机制和中间物种引入的延迟 | 医学 |
| 9 | 2026-05-19 |
CRISPR-Cas10-Assisted Structural Modification of Staphylococcal Kayvirus for Imaging and Biosensing Applications
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00387
PMID:40720830
|
研究论文 | 利用CRISPR-Cas10技术对葡萄球菌Kayvirus进行结构修饰,并实现成像和生物传感应用 | 首次实现葡萄球菌噬菌体结构蛋白的修饰,通过插入多组氨酸标签于尾鞘蛋白暴露环,结合CRISPR-Cas10辅助反选择,获得功能完整的重组噬菌体 | 未提及长期稳定性和体内应用效果 | 通过CRISPR-Cas10辅助基因编辑技术对葡萄球菌噬菌体进行结构修饰,开发其在成像和生物传感中的应用 | 噬菌体812h1(属于Kayvirus属)的结构蛋白 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas10, 同源重组,荧光显微镜,生物层干涉测量,酶联免疫吸附试验,流式细胞术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas10 | 葡萄球菌 | 多组氨酸标签插入尾鞘蛋白暴露环 | 医学,纳米技术,合成生物学 |
| 10 | 2026-05-19 |
Optimization of Malonyl Coenzyme A Biosensors in a Reconstituted Cell-Free System for Detecting Acetyl-CoA Carboxylase Activity
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00361
PMID:40742616
|
研究论文 | 优化了重组无细胞系统中的丙二酰辅酶A生物传感器,用于检测乙酰辅酶A羧化酶活性 | 通过在T7启动子和FapO操纵子之间工程化间隔序列,开发了检测范围广(50-1500 μM)、动态范围高达95.3倍的体外丙二酰辅酶A生物传感器系统,并筛选了来自不同芽孢杆菌种的同源FapR/FapO对,实现对低浓度丙二酰辅酶A的高灵敏度检测 | 未提及明显局限性,但基于合成生物学工具的无细胞系统可能面临成本和生产规模限制 | 优化丙二酰辅酶A生物传感器,实现乙酰辅酶A羧化酶活性的高灵敏度检测,以推进代谢工程和合成生物学 | 丙二酰辅酶A生物传感器和乙酰辅酶A羧化酶 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成系统 | FapR/FapO生物传感器 | 荧光信号 | NA | FapR/FapO系统,间隔序列工程 | 无细胞系统(大肠杆菌提取物) | 丙二酰辅酶A生物传感器电路(基于FapR/FapO系统) | 工业生物技术,代谢工程 |
| 11 | 2026-05-19 |
Bioluminescence-Driven Optimization of Geminivirus-Based Vectors as Tools for Plant Biotechnology
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00164
PMID:40758859
|
研究论文 | 利用自发光技术优化基于双生病毒的载体,用于植物生物技术中的合成生物学应用 | 首次使用自发光作为实时报告系统来表征和优化三种双生病毒复制子的表达特性,实现了对TYLCV系统调控精度的提升 | BCTV系统表现出较差的控制和表达水平,限制了其应用潜力;研究仅评估了三种病毒,未涵盖所有可能的双生病毒 | 优化基于双生病毒的载体,以增强其在植物合成生物学中的应用 | 三种双生病毒复制子(BeYDV、TYLCV、BCTV) | 合成生物学 | NA | 自发光成像 | NA | 发光图像 | NA | NA | 植物 | 双生病毒复制子(基于BeYDV、TYLCV、BCTV) | 农业, 工业生物技术 |
| 12 | 2026-05-19 |
Rational Modulation of Plant Root Development Using Engineered Cytokinin Regulators
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00051
PMID:40737362
|
研究论文 | 利用工程化细胞分裂素响应调控因子合理调控植物根系发育 | 通过工程化B型响应调控因子,可调节其转录活性(抑制或激活)和效力,同时降低对细胞分裂素的敏感性,利用组织特异性启动子实现对细胞分裂素调控性状的可预测调控 | 设计中涉及的合成遗传程序复杂性及信号过程间固有相互作用仍是关键挑战 | 实现对植物定量发育表型的精确控制 | 拟南芥中的侧根数量 | 合成生物学 | NA | 合成生物学载体构建、组织特异性启动子 | NA | NA | NA | 质粒构建 | 拟南芥 | 细胞分裂素信号通路调控开关 | 农业 |
| 13 | 2026-05-18 |
Critical Analysis of Preprints and Inquiry-Based Lessons Improve the Synthetic Biology Learning Experience
2025-08-15, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00014
PMID:40814254
|
研究论文 | 提出利用预印本批判性分析和探究式实验课程提升合成生物学学习体验的教学方法 | 将预印本引入教学,通过对比手稿与最终发表版本培养学生的批判性分析能力,并结合基于CRISPRi基因电路的实践实验,完整覆盖设计-构建-测试-学习循环 | 未具体指出研究局限性 | 改进合成生物学教学模式,结合主动学习工作流提升学生批判性分析能力与概念掌握程度 | 大学合成生物学课程的学生 | 合成生物学 | NA | CRISPRi | NA | NA | 学生群体,具体数量未说明 | CRISPRi | NA | 基于CRISPRi的基因电路 | 教育 |
| 14 | 2026-05-08 |
Molecular circuits for genomic recording of cellular events
2025-Aug, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.04.004
PMID:40335327
|
综述 | 本文综述了用于基因组记录细胞事件的分子电路的发展策略 | 提出了构建能忠实将过去细胞状态编码到基因组DNA记录中的新传感模块和遗传电路架构的需求 | 直接记录和重建过去细胞事件的方法仍然有限,其揭示细胞命运决定新见解的潜力尚未实现 | 探索构建用于基因组记录多种细胞事件的分子电路 | 基于CRISPR的基因组编辑技术和合成生物学工具 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 传感模块和遗传电路架构 | NA |
| 15 | 2026-04-10 |
Decoding the Minimal Translation System of the Plasmodium falciparum Apicoplast: Essential tRNA-modifying Enzymes and Their Roles in Organelle Maintenance
2025-Aug-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169156
PMID:40335414
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研究论文 | 本研究通过鉴定恶性疟原虫顶质体必需的tRNA修饰酶,揭示了其最小翻译系统的组成与功能 | 首次系统鉴定了顶质体定位的tRNA修饰酶,并证明其中6个催化反密码子环修饰的酶对寄生虫生存和细胞器维持至关重要 | 有两个基因无法被敲除,其中一个可能具有顶质体外的必需功能,另一个的作用机制尚未完全阐明 | 阐明恶性疟原虫顶质体最小翻译系统中tRNA修饰酶的作用及其对细胞器维持的影响 | 恶性疟原虫顶质体中的tRNA修饰酶 | 合成生物学 | 疟疾 | 比较基因组学、蛋白质定位预测、基因敲除技术 | NA | 基因组数据、蛋白质定位数据 | NA | 基因敲除工具 | 恶性疟原虫 | NA | 医学 |
| 16 | 2026-03-30 |
Protein Translocation Control in E. coli via Temperature-Dependent Aggregation: Application to a Conditionally Lethal Enzyme, Levansucrase
2025-08-20, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15081199
PMID:40867643
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研究论文 | 本文提出了一种基于温度响应性弹性蛋白样多肽(ELP)的系统,用于调控大肠杆菌中条件致死酶(levansucrase)的转运,实现蛋白质定位和分泌的可逆控制 | 利用ELP标签的温度依赖性聚集特性,设计了一种可逆调控蛋白质分泌的策略,应用于条件致死酶系统,为合成生物学和生物安全提供新方法 | NA | 开发一种温度响应性蛋白质转运控制系统,用于合成生物学和蛋白质工程 | 大肠杆菌中的条件致死酶levansucrase及其ELP融合蛋白 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、ELP标签技术 | NA | NA | NA | ELP标签 | 大肠杆菌 | 温度响应性蛋白质分泌控制系统,基于ELP聚集机制 | 合成生物学、代谢工程、生物安全 |
| 17 | 2026-03-25 |
Synthetic biology strategies for cyanobacterial systems to heterologously produce cyanobacterial natural products
2025-08-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00009b
PMID:40237791
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综述 | 本文综述了2014至2024年间利用合成生物学策略在蓝藻系统中异源生产蓝藻天然产物的最新进展 | 聚焦于针对蓝藻系统的合成生物学创新,以解决天然宿主操作困难和异源表达平台有限的障碍,促进多样化蓝藻天然产物家族的生产 | NA | 扩大蓝藻天然产物的发现和生产 | 蓝藻系统及其天然产物 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组测序、生物信息学工具、组合生物合成、转录与翻译调控 | NA | 基因组数据 | NA | NA | Synechocystis sp. PCC 6803, Synechococcus elongatus UTEX 2973, Anabaena sp. PCC 7120 | 生物合成基因簇(BGCs)克隆、宿主工程 | 医药 |
| 18 | 2026-03-25 |
Remodeling of ribosomally synthesized peptide backbones based on posttranslational modifications
2025-08-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00018a
PMID:40392103
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综述 | 本文综述了过去十年中通过翻译后修饰重塑核糖体合成肽骨架的酶,强调了其在合成生物学中设计功能性肽制剂的应用潜力 | 突出了通过翻译后修饰重塑肽骨架的酶,这些酶能超越二十种蛋白质氨基酸的限制,产生结构复杂多样的肽类,为合成生物学提供新工具 | NA | 探索核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPP)的翻译后修饰酶,以促进功能性肽制剂的理性设计和生产 | 核糖体合成和翻译后修饰肽(RiPP)及其翻译后修饰酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 19 | 2026-03-22 |
Prospects for synthetic biology in 21st century agriculture
2025-08, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
|
综述 | 本文综述了21世纪农业中合成生物学的前景,重点介绍了植物合成生物学在增强粮食安全、应对气候变化和促进可持续农业方面的创新应用 | 整合先进遗传工具、计算建模和系统生物学,精准修饰植物基因组以提升产量、胁迫耐受性和养分利用效率,并结合人工智能优化设计 | 面临监管审批和公众接受度方面的挑战,且需要严格的多领域测试以确保可重复性 | 探讨合成生物学在农业中的应用潜力,以解决全球粮食安全和环境可持续性问题 | 植物基因组及其在光合效率、固氮、耐旱、病原抗性、养分利用效率、生物强化、气候韧性等关键农业性状的工程化改造 | NA | NA | 合成生物学、遗传工程、计算建模、系统生物学、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物 | 合成植物基因组、生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器、切换开关 | 农业 |
| 20 | 2026-03-18 |
Human Synthetic Biology and Programmable Gene Regulation Control
2025-08, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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综述 | 本文回顾了人类合成生物学领域在可编程基因调控系统方面的最新进展,重点介绍了多层级基因表达控制工具的发展及其在治疗应用中的潜力 | 强调了高通量人类合成生物学方法的发展,实现了在DNA、RNA和蛋白质水平上的模块化调控,并展示了合成基因程序在操纵细胞行为和提供信息方面的创新应用 | NA | 探讨人类合成生物学中可编程基因调控系统的开发与应用,以控制细胞表型和功能 | 人类细胞中的合成基因系统和调控工具 | 合成生物学 | NA | 高通量合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 人类细胞 | 合成基因电路、逻辑门、生物传感器 | 医学 |