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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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21 | 2025-08-09 |
Decoding NF-κB: nucleocytoplasmic shuttling dynamics, synthetic modulation and post-therapeutic behavior in cancer
2025-Aug-07, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10917-1
PMID:40775128
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综述 | 本文回顾了核因子κB(NF-κB)的结构、功能及其在癌症治疗中的行为,并探讨了通过合成生物学工具调控NF-κB的潜力 | 探讨了NF-κB核质穿梭的时空调节和分子动力学,以及利用合成基因电路和光遗传学工具精确控制NF-κB的创新方法 | NF-κB复合物的随机变异性导致单细胞水平的异质性反应,且缺乏明确的药物靶点,使其在癌细胞中的完全抑制具有挑战性和不确定性 | 研究NF-κB的调控机制及其在癌症治疗后的行为,以克服耐药性 | 核因子κB(NF-κB)及其在癌症中的调控机制 | 合成生物学 | 癌症 | 合成基因电路、光遗传学工具 | NA | NA | NA |
22 | 2025-08-09 |
CloneFast: A simple plasmid design and construction guide for labs venturing into synthetic biology
2025-Aug-06, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104025
PMID:40773353
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research paper | 介绍CloneFast指南,一种简化质粒构建的方法 | 提出CloneFast指南,通过生物信息学设计和实验步骤优化,实现高效质粒构建 | 未提及具体实验验证数据或与其他方法的比较 | 简化质粒构建过程,提高效率和可及性 | 质粒设计和构建 | 合成生物学 | NA | CompetePCR, 碘介导的切割 | NA | 生物信息学设计数据 | NA |
23 | 2025-08-09 |
Utilizing the SacB-mediated gene editing system in Komagataeibacter xylinus to explore the function of bacterial cellulose synthase
2025-Aug-05, Journal of biotechnology
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.jbiotec.2025.08.003
PMID:40774389
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研究论文 | 本研究开发了一种基于SacB的基因编辑系统,用于探索细菌纤维素合酶在细菌纤维素合成和结构中的功能 | 开发了pK18mobsacB系统,实现了标记自由的基因编辑,效率高达83.33%,并成功应用于细菌纤维素合酶的功能研究 | NA | 提高细菌纤维素生产菌株的基因编辑效率,简化操作流程,实现无疤痕修饰,并探索细菌纤维素合酶的功能 | Komagataeibacter xylinus CGMCC 2955及其细菌纤维素合酶 | 合成生物学 | NA | SacB介导的基因编辑系统 | NA | NA | NA |
24 | 2025-08-09 |
Molecular circuits for genomic recording of cellular events
2025-Aug, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.04.004
PMID:40335327
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综述 | 本文综述了基因组记录领域的最新进展,特别是基于CRISPR的基因组编辑技术在细胞事件记录中的应用 | 探讨了构建多样化传感器的新策略,并探索新兴合成生物学工具如何帮助构建用于记录多样化细胞事件的分子电路 | 直接记录和重建过去细胞事件的方法仍然有限,其在揭示细胞命运决定新见解方面的潜力尚未实现 | 开发新的传感模块和遗传电路架构,将过去的细胞状态忠实编码到基因组DNA记录中 | 细胞事件 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based genome editing | NA | 基因组数据 | NA |
25 | 2025-08-09 |
Machine Learning Empowering Microbial Cell Factory: A Comprehensive Review
2025-Aug, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05260-x
PMID:40397295
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review | 本文综述了机器学习与合成生物学在微生物细胞工厂升级中的协同作用及其在生物技术中的应用 | 探讨了机器学习与合成生物学结合在生物制造中的创新应用,包括化学生产、人类健康和环境修复 | NA | 为生物制造与人工智能交叉领域的未来研究提供有价值的指导 | 微生物细胞工厂 | machine learning | NA | synthetic biology | NA | NA | NA |
26 | 2025-08-09 |
Synthetic Biocatalysis in Erythrocyte Microreactors for Gasotransmitter H2S Production and Vessel Vasodilation
2025-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502208
PMID:40451735
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研究论文 | 本研究开发了一种能够持续产生硫化氢(H₂S)以实现治疗性血管舒张的红细胞微反应器 | 通过将PLP-PLys复合物封装到红细胞中,创建了一种新型微反应器,能够持续产生H₂S并有效诱导血管舒张 | 研究仅在体外实验中验证了微反应器的效果,尚未进行体内实验 | 开发一种能够模拟天然细胞执行重要代谢过程并与生物系统相互作用的治疗性微反应器 | 红细胞微反应器及其在H₂S产生和血管舒张中的应用 | 合成生物学与生物工程 | 心血管疾病 | 低渗膨胀法、荧光成像 | NA | 体外实验数据、荧光成像数据 | 体外实验使用分离的胸主动脉环 |
27 | 2025-08-09 |
Exploring the Application and Prospects of Synthetic Biology in Engineered Living Materials
2025-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202305828
PMID:37677048
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程活性材料(ELMs)中的应用与前景,探讨了其在环境修复、生态建筑和可持续能源等领域的潜力 | 全面概述了ELMs的最新研究进展和新兴设计策略,并探讨了不同种类ELMs之间的协同应用可能性 | 未提及具体实验数据或案例研究,主要基于文献综述 | 探讨合成生物学在工程活性材料中的应用及未来发展 | 细菌、真菌和植物衍生的工程活性材料(ELMs) | 合成生物学与材料科学 | NA | NA | NA | NA | NA |
28 | 2025-08-08 |
Prospects for synthetic biology in 21st century agriculture
2025-Aug, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
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research paper | 本文探讨了植物合成生物学在21世纪农业中的前景及其在提高粮食安全、应对气候变化和实现可持续农业实践方面的潜力 | 整合先进的遗传工具、计算模型和系统生物学,精确修改植物基因组以增强产量、胁迫耐受性和养分利用效率等性状 | 面临监管审批和公众接受的挑战,需要严格的跨领域测试以确保可重复性 | 探讨植物合成生物学在农业中的应用,以解决全球粮食安全挑战 | 植物基因组及其在农业中的应用 | 合成生物学 | NA | 遗传工具、计算模型、系统生物学、人工智能 | NA | NA | NA |
29 | 2025-08-08 |
Structural insights and rational engineering strategies for modular polyketide synthases: A review
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145299
PMID:40533022
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综述 | 本文综述了模块化聚酮合酶(PKSs)的结构见解和理性工程策略,特别关注顺式酰基转移酶(AT)PKSs的设计和改造 | 系统总结了基于结构和机制见解的模块化构建块选择和催化域设计策略,为合成生物学和天然产物发现提供了新思路 | 对单个结构域的微小改变可能在整个组装线上传播结构和功能变化,这对理性设计提出了重大挑战 | 探索顺式AT PKS的多维设计,以增强产品产量并扩大可获得的聚酮化合物库 | 顺式酰基转移酶(AT)聚酮合酶(PKSs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA |
30 | 2025-08-07 |
Rhodotorula Yeasts as Potential Chassis for Sustainable Food Biotechnology
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05298
PMID:40699591
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综述 | 本文综述了红酵母作为可持续食品生物技术潜在底盘的研究进展 | 探讨了红酵母在多组学生物学、细胞工厂创建及合成生物学工具箱方面的最新进展 | 红酵母代谢工程仍面临多组学信息挖掘不足、遗传工具箱效率低下及独特代谢特征理解不充分等挑战 | 探索红酵母作为食品成分生产细胞工厂的潜力 | 红酵母(Rhodotorula spp.) | 食品生物技术 | NA | 多组学分析、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
31 | 2025-08-07 |
Mining UDP-Glucosyltransferases to Develop High-Efficiency Production Strategies for Emodin Glucosides
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c03575
PMID:40705854
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法全面研究了丝状真菌中大黄素葡萄糖苷的生物合成,并开发了一种高效生产策略 | 评估了十种高效的大黄素UDP-葡萄糖基转移酶(EUGTs),并开发了一种全细胞催化系统,实现了78.9%的高转化率 | 植物源蛋白在丝状真菌中表达的挑战阻碍了进一步优化 | 开发大黄素葡萄糖苷的高效生产策略 | 大黄素-6-β-d-葡萄糖苷(E6G)和大黄素-8-β-d-葡萄糖苷(E8G) | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法,全细胞催化系统 | NA | NA | 十种大黄素UDP-葡萄糖基转移酶(EUGTs) |
32 | 2025-08-07 |
Plant prenyltransferases: Diversity, catalytic activities, mechanisms, and application in heterologous production of prenylated natural products
2025-Aug-06, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70004
PMID:40765501
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review | 本文综述了植物异戊二烯基转移酶(PTs)的多样性、催化活性、机制及其在异源生产异戊二烯化天然产物(PNPs)中的应用 | 系统总结了160多种已报道的植物UbiA型PTs和代表性异戊二烯二磷酸合成酶(IDSs),并探讨了它们的分类、功能、催化机制及酶工程策略 | 植物PTs的功能多样性仍未得到充分理解 | 推进PTs的表征和应用,为基于PNPs的药物开发奠定基础 | 植物异戊二烯基转移酶(PTs)和异戊二烯化天然产物(PNPs) | 合成生物学 | NA | 基因组学和合成生物学 | NA | NA | 超过160种植物UbiA型PTs和代表性IDSs |
33 | 2025-08-07 |
Iterative recombinase technologies for efficient and precise genome engineering across kilobase to megabase scales
2025-Aug-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.07.011
PMID:40763736
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研究论文 | 介绍两种可编程染色体编辑系统PCE和RePCE,实现植物和人类细胞中无疤痕的千碱基到兆碱基DNA操作 | 开发了Lox位点的高通量工程和AI辅助重组酶工程方法(AiCE),显著提高了重组效率和编辑精度 | 未提及在更复杂生物体中的应用效果 | 扩大基因组编辑在分子育种、治疗开发和合成生物学中的应用范围 | 植物和人类细胞 | 合成生物学 | NA | AI辅助重组酶工程(AiCE)、Re-pegRNA介导的无疤痕策略 | NA | DNA序列数据 | 未明确提及具体样本数量,但包括水稻和人类细胞 |
34 | 2025-08-06 |
Bioluminescence-Driven Optimization of Geminivirus-Based Vectors as Tools for Plant Biotechnology
2025-Aug-04, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00164
PMID:40758859
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研究论文 | 本研究通过生物发光技术优化基于双生病毒的载体,用于植物生物技术中的合成生物学应用 | 利用自生物发光作为敏感、实时的报告系统来表征基因表达,优化了三种双生病毒载体的性能 | 研究中BCTV载体表现出较差的表达水平和控制能力 | 优化基于双生病毒的载体,以增强其在植物合成生物学中的应用 | 基于豆黄花叶病毒(BeYDV)、番茄黄曲叶病毒(TYLCV)和甜菜曲顶病毒(BCTV)的合成复制子 | 植物生物技术 | NA | 生物发光技术 | NA | NA | NA |
35 | 2025-08-06 |
Pathway engineering for the biosynthesis of psychedelics
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103314
PMID:40381450
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研究论文 | 本文综述了迷幻药物生物合成的最新进展,重点关注了在真核和原核生产宿主中合成吲哚胺、麦角胺和苯乙胺类化合物的生物合成成就 | 总结了迷幻药物生物合成的最新进展,并整理了一系列在异源表达中具有活性的相关生物合成酶 | NA | 开发迷幻药物的替代生产途径 | 迷幻药物(如psilocybin、DMT、5-MeO-DMT、bufotenine、lysergic acid和mescaline) | 合成生物学 | NA | 生物合成 | NA | NA | NA |
36 | 2025-08-06 |
Microbial food waste valorization: advances, challenges, and perspectives
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103323
PMID:40554099
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综述 | 本文综述了微生物发酵作为食物垃圾可持续解决方案的进展、挑战和前景 | 强调了合成生物学和代谢工程在提高微生物效率、优化底物利用和扩大工业应用方面的作用 | 讨论了底物异质性、可扩展性和经济可行性等关键挑战 | 探讨微生物发酵在食物垃圾资源化利用中的潜力 | 食物垃圾及其微生物转化 | 生物技术 | NA | 微生物发酵、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA |
37 | 2025-08-06 |
Biotechnological advances in algae-based foods: applications in nutrition and microbiome health
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103335
PMID:40628054
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review | 本文综述了藻类在食品生物技术中的进展,特别是在营养和微生物组健康方面的应用 | 探讨了藻类作为可持续、营养丰富的资源在功能性食品开发中的潜力,以及合成生物学和发酵技术在藻类营养增强和新应用中的作用 | 未提及具体藻类种类或应用中的具体技术限制 | 研究藻类在食品生物技术中的应用,特别是在营养和微生物组健康方面的潜力 | 藻类及其衍生物 | 食品生物技术 | NA | 合成生物学、发酵技术、酶解 | NA | NA | NA |
38 | 2025-08-06 |
Ingestible optoelectronic capsules enable bidirectional communication with engineered microbes for controllable therapeutic interventions
2025-Aug, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02057-w
PMID:40721535
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研究论文 | 本文提出了一种结合工程微生物、可摄入光电胶囊和无线智能手机的双向通信系统,用于可控的治疗干预 | 通过结合工程微生物和光电技术,实现了体内微生物的实时监测和远程控制 | 研究仅在猪模型中进行验证,尚未进行人体试验 | 开发一种用于疾病诊断和治疗的可控生物电子系统 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917和猪模型 | 合成生物学与光电技术 | 结肠炎 | 光遗传学工程、无线通信技术 | NA | 生物发光信号、无线电信号 | 猪模型 |
39 | 2025-08-05 |
Genetically programmable wearable devices for precision physiological and molecular monitoring
2025-Aug-04, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/adf25a
PMID:40690926
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综述 | 本文综述了基因可编程可穿戴设备在精确生理和分子监测中的应用及其未来发展 | 整合基因工程和合成生物学到可穿戴平台,增强特异性、响应性和功能多样性 | 生物安全性问题、生物组件的不稳定性以及转化障碍限制了更广泛的临床应用 | 推动精确医疗和实时疾病管理的下一代生物混合系统 | 可穿戴设备及其在临床和个性化医疗中的应用 | 生物医学工程 | NA | 基因工程、合成生物学 | NA | 生理和分子数据 | NA |
40 | 2025-08-05 |
Revolutionizing Caffeic Acid Production: Advanced Microbial Metabolic Engineering and Synthetic Biology Approaches
2025-Aug, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70091
PMID:40757780
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review | 本文综述了通过微生物代谢工程和合成生物学方法优化咖啡酸生产的五种策略 | 整合五种策略(咖啡酸生物合成途径、代谢途径修饰、系统生物学与合成生物学、辅因子工程和模块化共培养)以突破微生物生产咖啡酸的瓶颈 | 微生物底盘生产咖啡酸面临前体供应有限、代谢中间体毒性、辅因子利用效率低以及对传统宿主微生物过度依赖等瓶颈 | 优化咖啡酸的微生物生产 | 咖啡酸及其微生物生产 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA |