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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Sophisticated Interfaces Between Biosensors and Organoids: Advancing Towards Intelligent Multimodal Monitoring Physiological Parameters
2025-Aug-22, Biosensors
DOI:10.3390/bios15090557
PMID:41002297
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综述 | 本文系统综述了类器官与生物传感器集成的多模态监测技术及其在生理参数智能监测中的应用 | 提出了类器官传感技术向增强仿生性和智能化发展的综合框架,系统比较了多种技术集成方法 | 未涉及传感器在血管化类器官中植入、长期培养信号稳定性及临床转化标准化等具体技术挑战的解决方案 | 为研究人员提供选择合适技术方法的框架,推动类器官传感技术发展 | 类器官与生物传感器的集成系统 | 生物医学工程 | NA | 微流控集成系统、微电极阵列电生理记录、光学传感、机械力传感、场效应晶体管传感、合成生物学工具、无标记技术 | NA | 电信号、光学信号、机械信号、化学信号 | NA | 合成生物学工具 | NA | NA | 药物开发、毒性测试、个性化医疗 |
| 42 | 2025-10-05 |
Modular multi-enzyme cascades enable green and sustainable synthesis of non-canonical amino acids from glycerol
2025-Aug-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63341-1
PMID:40883312
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研究论文 | 开发模块化多酶级联平台,利用甘油可持续合成非经典氨基酸 | 通过定向进化OPSS酶将C-N键形成催化效率提升5.6倍,建立可扩展至2升反应系统的模块化平台 | NA | 开发绿色可持续的非经典氨基酸合成方法 | 非经典氨基酸(含C-S、C-Se和C-N侧链) | 合成生物学 | NA | 定向进化、多酶级联催化 | NA | NA | 22种非经典氨基酸,克至十克级规模 | NA | NA | 模块化多酶级联系统 | 医药, 合成生物学, 生物材料 |
| 43 | 2025-10-05 |
Introduction to "Biomolecular Technologies"
2025-Aug-27, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb90031j
PMID:40843437
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综述 | 介绍生物分子技术领域的最新进展及其在基础科学和实际应用中的机会 | 汇集了基于工程生物分子的多种技术,涵盖小分子、核酸和蛋白质,展示生物分子设计的模块化和可调性 | NA | 概述生物分子技术在生物催化、生物传感和合成生物学等领域的应用 | 工程生物分子(小分子、核酸、蛋白质) | 合成生物学 | NA | 生物分子工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物催化, 生物传感, 合成生物学 |
| 44 | 2025-10-05 |
Gene duplication and clustering underlie the conservation and diversification of benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis in plants
2025-Aug-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63175-x
PMID:40826018
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研究论文 | 本研究揭示了植物中苄基异喹啉生物碱(BIA)生物合成途径的保守性与多样化机制,重点关注基因复制和基因簇形成的作用 | 首次在木兰类植物中发现CYP80G介导的酚偶联反应,揭示了BIA骨架形成基因在木兰类和毛茛目之间的保守性,并发现CYP80B与4'OMT、6-OMT基因的动态簇聚现象 | 研究主要集中于蕺菜(Houttuynia cordata),对其他木兰类植物的BIA生物合成研究仍较少 | 探究植物中苄基异喹啉生物碱生物合成的进化机制和基因组织方式 | 蕺菜(Houttuynia cordata)及其他被子植物中的BIA生物合成基因 | 植物分子生物学 | NA | 功能分析、全基因组分析、酶学表征 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 45 | 2025-10-05 |
One-pot cloning and protein expression platform for genetic engineering
2025-Aug-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.28.672974
PMID:40909620
|
研究论文 | 开发了一种集成突变、质粒组装和功能蛋白测试的一锅法克隆与蛋白表达平台 | 将Golden Gate克隆与无细胞转录翻译系统结合,实现无需中间纯化或细菌扩增的遗传变异高效生成与筛选 | NA | 建立高通量克隆和蛋白质工程的通用自动化方法 | 荧光蛋白、荧光素酶、抗生素转化酶和紫色杆菌素生物合成途径 | 合成生物学 | NA | Golden Gate克隆、无细胞转录翻译 | NA | NA | NA | Golden Gate Assembly | 无细胞系统 | 生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术 |
| 46 | 2025-10-05 |
Molecular Mechanisms of Herbicide Resistance in Rapeseed: Current Status and Future Prospects for Resistant Germplasm Development
2025-Aug-26, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178292
PMID:40943213
|
综述 | 系统总结油菜除草剂抗性分子机制及抗性种质开发策略 | 首次系统整合非靶标抗性机制、多组学与AI技术在抗除草剂油菜育种中的应用潜力 | NA | 为抗除草剂油菜的可持续发展提供安全有效的创新方法指导 | 油菜及其除草剂抗性机制 | 农业生物技术 | NA | 基因编辑、合成生物学、定向蛋白进化、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 油菜 | NA | 农业 |
| 47 | 2025-10-05 |
Unlocking Casein Bioactivity: Lactic Acid Bacteria and Molecular Strategies for Peptide Release
2025-Aug-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26178119
PMID:40943047
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综述 | 本文综述了利用乳酸菌和分子生物学策略释放牛β-酪蛋白中生物活性肽的方法 | 系统整合合成生物学、分子生物技术和系统生物学方法增强β-酪蛋白源生物活性肽的靶向发现与生产 | NA | 提高β-酪蛋白源生物活性肽的靶向发现和生产效率 | 牛β-酪蛋白中的生物活性肽 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统、多组学方法(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 乳酸菌 | 诱导型表达平台、无细胞系统 | 食品, 医药 |
| 48 | 2025-10-05 |
Reinforcement Learning-Based Target-Specific De Novo Design of Cyclic Peptide Binders
2025-Aug-28, Journal of medicinal chemistry
IF:6.8Q1
DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c00789
PMID:40824037
|
研究论文 | 提出基于强化学习的环肽结合剂从头设计框架CYC_BUILDER | 采用蒙特卡洛树搜索指导片段选择、肽链生长和结构优化,实现高效环化 | 仅实验验证了9个设计肽中的4个具有活性 | 开发计算设计环肽结合剂的新方法 | 环肽-蛋白质复合物 | 机器学习 | NA | 强化学习,蒙特卡洛树搜索 | 强化学习 | 蛋白质结构数据 | 9个设计肽的实验验证 | NA | NA | NA | 医药,合成生物学 |
| 49 | 2025-10-05 |
An old dog with new tricks-the value of photorespiration as a central metabolic hub with implications for environmental acclimation
2025-Aug-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf258
PMID:40515676
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综述 | 探讨光呼吸作为中心代谢枢纽在环境适应中的新功能与价值 | 揭示光呼吸与气孔代谢调控的新联系,发现新型代谢参与者及细胞器间互作网络 | NA | 阐明光呼吸在光合作用和环境适应中的核心作用 | 光养生物的光呼吸代谢途径 | 植物代谢工程 | NA | 同位素标记、反向遗传学、合成生物学 | NA | 代谢通量数据 | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 旁路途径整合、天然酶优化 | 农业 |
| 50 | 2025-10-05 |
Microbial strategies on polyhydroxyalkanoates production from food waste to support the circular bioeconomy
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146023
PMID:40669653
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综述 | 本文重点探讨利用餐厨垃圾生产聚羟基脂肪酸酯的微生物策略及其在循环生物经济中的应用前景 | 系统总结了代谢工程和合成生物学在餐厨垃圾生物转化生产聚羟基脂肪酸酯中的最新微生物策略 | NA | 促进餐厨垃圾资源化利用和循环生物经济发展 | 餐厨垃圾和聚羟基脂肪酸酯 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物底盘细胞 | NA | 环境,工业生物技术 |
| 51 | 2025-10-05 |
Combing Directed Enzyme Evolution with Metabolic Engineering to Develop Efficient Microbial Cell Factories
2025-Aug-28, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00002
PMID:40901576
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综述 | 本文综述了将定向酶进化与代谢工程相结合开发高效微生物细胞工厂的策略与方法 | 系统整合传统与数据驱动的定向进化策略(包括随机文库设计、半理性设计、智能文库设计和连续进化)与代谢工程方法,突破经典代谢工程仅关注基因表达水平的局限 | 未具体说明应用案例的详细实验数据,主要聚焦于方法论层面的讨论 | 开发高效微生物细胞工厂以实现可再生原料的可持续化学生产 | 微生物细胞工厂中的酶蛋白和代谢途径 | 合成生物学 | NA | 定向进化、蛋白质工程、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径优化 | 工业生物技术 |
| 52 | 2025-10-05 |
Toward a monocot SynBio toolkit: assessing regulatory element performance and eudicot compatibility
2025-Aug-08, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03583-x
PMID:40779074
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研究论文 | 本研究构建并评估了一个包含80个遗传调控元件的组合库,用于单子叶植物的合成生物学应用 | 开发了新颖的CaMV 35S启动子与病毒5'UTR序列组合,其表达水平接近强病毒启动子融合;新发现的植物小热休克蛋白3'UTR序列能显著增强报告基因表达 | 研究主要基于玉米原生质体和本氏烟的瞬时表达系统,尚未在完整植株中进行长期验证 | 解决禾谷类作物和禾草遗传工程中合适调控元件相对缺乏的问题 | 玉米原生质体和本氏烟叶片 | 合成生物学 | NA | 原生质体转化、农杆菌浸润、荧光测定 | NA | 荧光表达数据 | 80个遗传调控元件组合,在两种植物系统中测试 | 农杆菌浸润 | 玉米, 本氏烟 | 遗传调控元件组合库,包括启动子、5'UTR、启动子-5'UTR融合和3'UTR序列 | 农业, 工业生物技术 |
| 53 | 2025-10-05 |
Advancements in DNA-Driven Precision Modulation of Cell Surface Receptor for Programmable Cellular Functions
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505073
PMID:40588818
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综述 | 本文系统总结了基于DNA的受体工程策略在精确调控细胞表面受体功能方面的最新进展 | 整合遗传和非遗传DNA工程策略,利用DNA纳米结构、功能性核酸和可编程动态DNA反应实现受体功能的多维调控 | NA | 开发精确调控细胞表面受体的DNA工程策略,推动智能细胞系统发展 | 细胞表面受体及其信号传导机制 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、DNA折纸、功能性核酸 | NA | NA | NA | DNA纳米结构、DNA逻辑电路、DNA纳米机器人 | 哺乳动物细胞 | DNA逻辑电路、DNA纳米机器人、受体二聚化和寡聚化调控 | 医学 |
| 54 | 2025-10-05 |
Iterative recombinase technologies for efficient and precise genome engineering across kilobase to megabase scales
2025-Aug-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.07.011
PMID:40763736
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研究论文 | 开发了两种可编程染色体编辑系统PCE和RePCE,实现植物和人类细胞中无痕的千碱基到兆碱基尺度DNA操作 | 通过高通量工程获得逆转性降低10倍的Lox位点,利用AI辅助重组酶工程方法生成重组效率提高3.5倍的Cre变体,结合Re-pegRNA介导的无痕策略增强编辑精度 | NA | 解决基因组编辑技术在高等生物中实现精确、大规模DNA操作面临的挑战 | 植物和人类细胞 | 合成生物学 | NA | 可编程染色体编辑系统,AI辅助重组酶工程,Re-pegRNA介导的无痕策略 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9, 重组酶技术 | 水稻, 人类细胞 | 染色体水平编辑系统,支持插入、删除、替换、倒位和易位操作 | 分子育种, 治疗开发, 合成生物学 |
| 55 | 2025-10-05 |
Harnessing the Power of Photosynthesis: from Current Engineering Strategies to Cell Factory Applications
2025-Aug, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202402147
PMID:39930847
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综述 | 本文综述光合作用工程化策略及其在细胞工厂应用中的潜力 | 系统整合纳米材料辅助、微流控技术、合成生物学和光生物电化学系统等多种工程策略优化光合作用 | NA | 探讨工程化光合系统在能源和物质转化领域的应用潜力 | 光合作用系统及其工程化改造 | 合成生物学 | NA | 纳米材料辅助技术、微流控技术、合成生物学技术、光生物电化学系统 | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | 代谢通路优化 | 能源, 环境, 医学, 工业生物技术 |
| 56 | 2025-10-05 |
Molecular and biochemical insights from natural and engineered photosynthetic endosymbiotic systems
2025-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102598
PMID:40252292
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综述 | 探讨光合内共生系统的分子与生化特征,比较自然系统与工程化系统的异同 | 整合自然内共生系统研究与人工工程化尝试,揭示内共生转化为细胞器的关键分子机制 | NA | 理解光合内共生系统的进化机制与工程化应用潜力 | 线粒体、叶绿体等内共生细胞器及人工构建的光合内共生系统 | 合成生物学 | NA | 基因工程、比较基因组学 | NA | 文献数据、实验数据 | NA | iGEM | 光合细菌、宿主细胞 | 内共生代谢通路、基因转移系统 | 能源, 环境 |
| 57 | 2025-10-05 |
Active Armoring of Protocell Condensates with Metal-Phenolic Networks
2025-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503077
PMID:40351056
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研究论文 | 本研究开发了利用金属-酚网络(MPN)对肽基凝聚体进行可移除膜化包覆的方法,显著增强了凝聚体的结构稳定性和化学耐受性 | 首次将金属-酚网络应用于凝聚体的可控制膜化包覆,实现了膜厚度和渗透性的可调调控,并能通过氧化还原反应实现膜的可逆组装与解离 | 研究主要聚焦于铁离子和单宁酸体系,尚未系统探索其他金属-酚网络组合的效果 | 开发一种稳定和保护肽基凝聚体免受化学有害物质影响的膜化策略 | 聚-L-赖氨酸和三磷酸腺苷(ATP)凝聚体 | 合成生物学 | NA | 核磁共振波谱 | NA | 光谱数据 | NA | 金属-酚网络(MPN) | NA | 凝聚体膜化保护系统 | 合成生物学, 前生命化学 |
| 58 | 2025-10-05 |
From Code to Life: The AI-Driven Revolution in Genome Editing
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417029
PMID:40538131
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综述 | 探讨人工智能与基因组编辑技术的融合及其在生物技术领域的革命性应用 | 首次系统阐述AI技术如何通过优化sgRNA设计、发现新型Cas蛋白和增强基因调控网络分析来推动基因组编辑发展 | 存在数据偏差、算法透明度不足和潜在非预期基因修饰等伦理问题 | 研究人工智能与基因组编辑技术的交叉融合及其应用前景 | 基因组编辑技术及其AI增强方法 | 机器学习 | 遗传疾病 | CRISPR基因编辑技术 | 深度学习预测器, 蛋白质语言模型 | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 59 | 2025-10-05 |
Microbial proteases as emerging anti-inflammatory therapeutics: a comprehensive review
2025-Aug-19, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04409-w
PMID:40828296
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综述 | 本文全面探讨微生物蛋白酶作为抗炎治疗药物的潜力,包括其分子机制、生产策略及作为传统抗炎药物替代方案的临床应用前景 | 重点关注未充分研究的细菌属类,提出连接实验室发现与实际治疗应用的转化视角,并强调通过菌株工程、封装技术和合成生物学方法提升治疗效果 | 存在免疫系统敏感性、生理条件下稳定性差、与其他酶源比较数据有限、监管审批和靶向递送挑战等临床转化障碍 | 评估微生物蛋白酶在炎症管理中的治疗潜力 | 微生物蛋白酶及其抗炎机制 | 生物医学工程 | 炎症性疾病 | 发酵技术、基因改造、菌株工程、封装技术、合成生物学方法 | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学方法 | 微生物 | NA | 医药 |
| 60 | 2025-10-05 |
Recent advances of muconic acid production using microbial synthetic biology
2025-Aug-11, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04419-8
PMID:40788366
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综述 | 本文重点介绍了利用合成生物学技术生产粘康酸的最新研究进展 | 系统总结了包括辅因子工程、模块化共培养和人工智能辅助酶优化在内的新型生产策略 | NA | 探讨微生物合成生物学在粘康酸生产中的应用 | 粘康酸生物合成 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |