本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Synthetic biology strategies for cyanobacterial systems to heterologously produce cyanobacterial natural products
2025-Aug-13, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00009b
PMID:40237791
|
综述 | 本文综述了2014-2024年间利用合成生物学策略在蓝藻系统中异源生产蓝藻天然产物的最新进展 | 聚焦蓝藻系统合成生物学创新,解决天然宿主操作困难和异源表达平台有限的障碍 | NA | 促进多样化蓝藻天然产物家族的发现和生产 | 蓝藻生物合成基因簇和天然产物 | 合成生物学 | 癌症 | 基因组测序、组合生物合成、转录和翻译调控 | NA | NA | NA | NA | Synechocystis sp. PCC 6803, Synechococcus UTEX 2973, Anabaena sp. PCC 7120 | 生物合成基因簇克隆、宿主工程 | 医药 |
| 42 | 2025-10-05 |
Harnessing the Power of Photosynthesis: from Current Engineering Strategies to Cell Factory Applications
2025-Aug, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202402147
PMID:39930847
|
综述 | 本文综述光合作用工程化策略及其在细胞工厂应用中的潜力 | 系统整合纳米材料辅助、微流控技术、合成生物学和光生物电化学系统等多种工程策略优化光合作用 | NA | 探讨工程化光合系统在能源和物质转化领域的应用潜力 | 光合作用系统及其工程化改造 | 合成生物学 | NA | 纳米材料辅助技术、微流控技术、合成生物学技术、光生物电化学系统 | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | 代谢通路优化 | 能源, 环境, 医学, 工业生物技术 |
| 43 | 2025-10-05 |
Molecular and biochemical insights from natural and engineered photosynthetic endosymbiotic systems
2025-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102598
PMID:40252292
|
综述 | 探讨光合内共生系统的分子与生化特征,比较自然系统与工程化系统的异同 | 整合自然内共生系统研究与人工工程化尝试,揭示内共生转化为细胞器的关键分子机制 | NA | 理解光合内共生系统的进化机制与工程化应用潜力 | 线粒体、叶绿体等内共生细胞器及人工构建的光合内共生系统 | 合成生物学 | NA | 基因工程、比较基因组学 | NA | 文献数据、实验数据 | NA | iGEM | 光合细菌、宿主细胞 | 内共生代谢通路、基因转移系统 | 能源, 环境 |
| 44 | 2025-10-05 |
Active Armoring of Protocell Condensates with Metal-Phenolic Networks
2025-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503077
PMID:40351056
|
研究论文 | 本研究开发了利用金属-酚网络(MPN)对肽基凝聚体进行可移除膜化包覆的方法,显著增强了凝聚体的结构稳定性和化学耐受性 | 首次将金属-酚网络应用于凝聚体的可控制膜化包覆,实现了膜厚度和渗透性的可调调控,并能通过氧化还原反应实现膜的可逆组装与解离 | 研究主要聚焦于铁离子和单宁酸体系,尚未系统探索其他金属-酚网络组合的效果 | 开发一种稳定和保护肽基凝聚体免受化学有害物质影响的膜化策略 | 聚-L-赖氨酸和三磷酸腺苷(ATP)凝聚体 | 合成生物学 | NA | 核磁共振波谱 | NA | 光谱数据 | NA | 金属-酚网络(MPN) | NA | 凝聚体膜化保护系统 | 合成生物学, 前生命化学 |
| 45 | 2025-10-05 |
From Code to Life: The AI-Driven Revolution in Genome Editing
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417029
PMID:40538131
|
综述 | 探讨人工智能与基因组编辑技术的融合及其在生物技术领域的革命性应用 | 首次系统阐述AI技术如何通过优化sgRNA设计、发现新型Cas蛋白和增强基因调控网络分析来推动基因组编辑发展 | 存在数据偏差、算法透明度不足和潜在非预期基因修饰等伦理问题 | 研究人工智能与基因组编辑技术的交叉融合及其应用前景 | 基因组编辑技术及其AI增强方法 | 机器学习 | 遗传疾病 | CRISPR基因编辑技术 | 深度学习预测器, 蛋白质语言模型 | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 46 | 2025-10-05 |
Microbial proteases as emerging anti-inflammatory therapeutics: a comprehensive review
2025-Aug-19, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04409-w
PMID:40828296
|
综述 | 本文全面探讨微生物蛋白酶作为抗炎治疗药物的潜力,包括其分子机制、生产策略及作为传统抗炎药物替代方案的临床应用前景 | 重点关注未充分研究的细菌属类,提出连接实验室发现与实际治疗应用的转化视角,并强调通过菌株工程、封装技术和合成生物学方法提升治疗效果 | 存在免疫系统敏感性、生理条件下稳定性差、与其他酶源比较数据有限、监管审批和靶向递送挑战等临床转化障碍 | 评估微生物蛋白酶在炎症管理中的治疗潜力 | 微生物蛋白酶及其抗炎机制 | 生物医学工程 | 炎症性疾病 | 发酵技术、基因改造、菌株工程、封装技术、合成生物学方法 | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学方法 | 微生物 | NA | 医药 |
| 47 | 2025-10-05 |
Recent advances of muconic acid production using microbial synthetic biology
2025-Aug-11, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04419-8
PMID:40788366
|
综述 | 本文重点介绍了利用合成生物学技术生产粘康酸的最新研究进展 | 系统总结了包括辅因子工程、模块化共培养和人工智能辅助酶优化在内的新型生产策略 | NA | 探讨微生物合成生物学在粘康酸生产中的应用 | 粘康酸生物合成 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 48 | 2025-10-05 |
Therapeutic engineering of the gut microbiome using synthetic biology and metabolic tools: a comprehensive review with E. coli Nissle 1917 as a model case study
2025-Aug-06, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04417-w
PMID:40767874
|
综述 | 本文全面综述了利用合成生物学和代谢工程工具改造肠道微生物组的最新进展,特别以大肠杆菌Nissle 1917为模型案例 | 系统分析从早期重组益生菌到先进合成生物学平台的发展历程,重点阐述工程化大肠杆菌Nissle 1917产生苯丙氨酸解氨酶(PAL)和L-氨基酸脱氨酶(LAAD)用于苯丙酮尿症(PKU)治疗 | NA | 探讨微生物群落工程在生物技术领域的进展及其在肠道健康相关疾病治疗中的应用潜力 | 肠道微生物组、工程化肠道细菌、大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 炎症性肠病、代谢功能障碍、结直肠癌、苯丙酮尿症 | 酶工程、代谢工程、生物催化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 代谢通路、生物传感器、免疫调节化合物生物合成、短链脂肪酸生产、有害代谢物分解 | 医学 |
| 49 | 2025-10-05 |
Unlocking expanded flagellin perception through rational receptor engineering
2025-Aug, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02049-y
PMID:40721669
|
研究论文 | 通过理性受体工程拓展植物对细菌鞭毛蛋白的识别范围 | 首次系统鉴定FLS2受体中决定广谱识别能力的关键残基,并成功通过合成生物学方法将广谱识别特性在不同植物FLS2同源物间转移 | 研究主要聚焦于FLS2受体,尚未验证其他植物免疫受体的类似工程化潜力 | 增强植物对病原菌的识别能力以改善病原菌限制 | 植物模式识别受体FLS2及其与细菌鞭毛蛋白flg22的相互作用 | 合成生物学 | 植物细菌性病害 | 多样性分析、AlphaFold建模、氨基酸特性分析、合成生物学 | AlphaFold | 蛋白质序列、结构模拟数据 | 跨三个植物目的FLS2同源物 | 合成生物学 | 植物细胞 | FLS2受体工程改造以增强病原识别 | 农业 |
| 50 | 2025-10-05 |
Intelligent Design of Microbial Carbohydrate Factories: Integrated Chassis-Tools-Strategies Frameworks
2025-Aug-20, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05803
PMID:40788265
|
综述 | 本文综述了微生物碳水化合物工厂的智能设计方法,提出了集底盘-工具-策略于一体的综合框架 | 建立了多维度的碳水化合物生物合成系统智能设计理论框架,整合了底盘生物特性、计算与实验工具以及代谢工程策略 | NA | 开发工程化碳水化合物合成微生物工厂的综合方法 | 工业底盘生物及其碳水化合物合成代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、计算建模 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌 | 代谢途径优化、途径重建、动态控制机制 | 食品, 制药, 农业, 化学工业 |
| 51 | 2025-10-05 |
Biotechnological advances in algae-based foods: applications in nutrition and microbiome health
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103335
PMID:40628054
|
综述 | 本文综述藻类在食品生物技术中的进展,重点关注其在营养和肠道微生物健康方面的应用 | 系统阐述合成生物学和发酵技术在藻类营养强化及新型功能食品开发中的应用创新 | NA | 探讨藻类作为可持续食品资源的生物技术应用潜力 | 藻类及其生物活性成分 | 食品生物技术 | NA | 合成生物学、发酵技术、酶水解 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物系统 | NA | 食品、营养 |
| 52 | 2025-10-05 |
Molecular logic gates based on programmable self-assembly of DNA origami triangles for the detection of nucleic acid molecules
2025-Aug-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-15119-0
PMID:40783588
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于DNA折纸三角形自组装的分子逻辑门平台,用于检测核酸分子 | 将DNA折纸纳米结构与分子逻辑门集成,实现了目标驱动的层次自组装和布尔逻辑运算 | NA | 开发可编程核酸检测平台,推动动态分子计算领域发展 | DNA折纸三角形结构、核酸分子生物标志物 | 分子纳米技术 | 肺癌 | DNA折纸、原子力显微镜(AFM)、链置换技术 | 布尔逻辑门(YES、AND、OR) | 纳米尺度图像数据 | NA | DNA折纸 | NA | 基于DNA折纸三角形的分子逻辑门(YES、AND、OR)、可重置自适应反馈系统 | 医学诊断、合成生物学、纳米医学 |
| 53 | 2025-10-05 |
Integrating metagenomics and high-throughput screening for bioprospecting marine producers of polyhydroxyalkanoates
2025-Aug-04, Letters in applied microbiology
IF:2.0Q4
DOI:10.1093/lambio/ovaf096
PMID:40674061
|
研究论文 | 本研究通过宏基因组分析和定向培养基开发,从海洋环境中筛选出102株PHA生产菌株,并建立了高通量筛选平台 | 开发了结合尼罗红荧光强度与PHA含量定量关联的高通量筛选方法,有效解决荧光筛选假阳性问题,并发现一株高性能新菌株Halomonas olivaria | NA | 开发可持续生产生物可降解材料聚羟基脂肪酸酯的微生物资源和生产技术 | 海洋环境微生物群落和PHA生产菌株 | 工业生物技术 | NA | 宏基因组分析, 气相色谱, 荧光定量, 高通量筛选 | NA | 基因组数据, 化学分析数据 | 102株PHA生产菌株,来自不同海洋栖息地包括咸淡水界面和深海沉积物 | NA | Halomonas olivaria | NA | 材料, 环境, 工业生物技术 |
| 54 | 2025-10-05 |
Framing synthetic biology as an innovation-driven market
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.003
PMID:39984349
|
研究论文 | 提出了一个合成生物学市场框架以统一对其商业潜力的理解 | 区分专业合成生物学市场与更广泛的产品市场,并提出专门的市场框架 | NA | 构建合成生物学市场框架以明确其商业潜力 | 合成生物学市场及其商业潜力 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 55 | 2025-10-05 |
Deciphering and Predicting Thermal and pH Stabilities of Triplex DNA Under Multifactorial Conditions
2025-Aug-11, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202507190
PMID:40498537
|
研究论文 | 本研究通过开发高通量5DFRETMA方法,系统解析了环境因素和序列特征对三链DNA稳定性的影响 | 开发了高通量5D荧光共振能量转移熔解退火方法,首次实现了多因素条件下三链DNA热稳定性和pH稳定性的预测 | NA | 揭示环境和序列因素如何调控三链DNA稳定性 | 三链DNA | 合成生物学 | NA | 5D荧光共振能量转移熔解退火 | 预测模型 | 荧光共振能量转移数据 | 测试了414组缓冲条件 | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 56 | 2025-10-05 |
Exploring lipid diversity and minimalism to define membrane requirements for synthetic cells
2025-Aug-11, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70131
PMID:40787853
|
综述 | 探讨合成细胞膜系统的脂质多样性与最小化要求 | 通过对比自下而上和自上而下的合成细胞构建方法,强调膜蛋白与脂质环境的关键相互作用 | NA | 定义自繁殖合成细胞所需的最小脂质组要求 | 合成细胞的脂质膜系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术, 环境科学 |
| 57 | 2025-10-05 |
Enhancing the β-Oxidation-Like Pathway for the Optimal Production of the Immunosuppressant Mycophenolic Acid
2025-Aug-11, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508826
PMID:40788096
|
研究论文 | 本研究首次在真菌中重构了负责合成免疫抑制剂霉酚酸的β-氧化样酶级联反应 | 首次实现真菌β-氧化级联反应的功能性重构,揭示了将分解代谢模块重新用于生物合成的新策略 | NA | 优化免疫抑制剂霉酚酸的生产途径 | 真菌β-氧化酶级联反应和霉酚酸生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 体外酶活性测定、途径优化 | NA | 酶活性数据、代谢产物产量数据 | 短密青霉NRRL864菌株 | 基因过表达 | Penicillium brevicompactum | β-氧化样代谢途径,包含氧化、脱氢、水合、还原、异构化和逆克莱森缩合反应 | 医药 |
| 58 | 2025-10-05 |
CRISPR.BOT an autonomous platform for streamlined genetic engineering and molecular biology applications
2025-Aug-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01655-2
PMID:40770192
|
研究论文 | 介绍CRISPR.BOT自主基因工程平台,旨在革新分子生物学实验流程 | 开发了基于乐高机器人的低成本自主基因工程平台,实现单细胞亚克隆纯度达90-100% | 未提及平台在复杂实验环境中的稳定性和长期运行可靠性 | 开发低成本自动化基因工程平台以提升实验效率和安全性 | 细菌宿主、人类细胞系、SARS CoV-2病毒 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、慢病毒转导、质粒DNA转移 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌, 人类细胞系 | GFP报告基因系统、CRISPR-gRNA编辑系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 59 | 2025-10-05 |
Cancer stem cells: landscape, challenges and emerging therapeutic innovations
2025-Aug-05, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02360-2
PMID:40759634
|
综述 | 本文综述癌症干细胞(CSCs)的生物学特性、代谢可塑性及其在肿瘤治疗抵抗中的作用,并探讨新兴治疗策略 | 整合单细胞测序、空间转录组学与多组学数据揭示CSCs异质性,提出代谢重编程与免疫调节相结合的精准靶向治疗新范式 | 缺乏普适性CSCs生物标志物,难以实现针对CSCs的特异性靶向而不影响正常干细胞 | 探索癌症干细胞的治疗抵抗机制并开发创新治疗策略 | 癌症干细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞测序, 空间转录组学, 多组学整合, CRISPR筛选, AI驱动分析 | 3D类器官模型 | 多组学数据 | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 60 | 2025-10-05 |
Large language model for knowledge synthesis and AI-enhanced biomanufacturing
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.008
PMID:40050157
|
综述 | 探讨大型语言模型在合成生物学教育和生物制造领域的应用前景与影响 | 系统分析LLMs在生物制造中的知识图谱构建、DBTL周期优化及自动驾驶实验室等创新应用 | NA | 评估大型语言模型在合成生物学和生物制造领域的应用潜力与发展方向 | 大型语言模型及其在合成生物学中的应用场景 | 自然语言处理 | NA | 检索增强生成、知识图谱构建 | LLM | 非结构化数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |