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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Reinforcement Learning-Based Target-Specific De Novo Design of Cyclic Peptide Binders
2025-Aug-28, Journal of medicinal chemistry
IF:6.8Q1
DOI:10.1021/acs.jmedchem.5c00789
PMID:40824037
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研究论文 | 提出基于强化学习的环肽结合剂从头设计框架CYC_BUILDER | 采用蒙特卡洛树搜索指导片段选择、肽链生长和结构优化,实现高效环化 | 仅实验验证了9个设计肽中的4个具有活性 | 开发计算设计环肽结合剂的新方法 | 环肽-蛋白质复合物 | 机器学习 | NA | 强化学习,蒙特卡洛树搜索 | 强化学习 | 蛋白质结构数据 | 9个设计肽的实验验证 | NA | NA | NA | 医药,合成生物学 |
| 42 | 2025-10-05 |
Multiactivity of Nanozyme Liposome Regulates the Homeostasis of Biochemical Microenvironment
2025-Aug-18, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202501918
PMID:40545445
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研究论文 | 开发具有多酶活性的仿生脂质体纳米酶,用于调节外源性植入物引起的炎症反应并促进组织再生 | 通过在人造膜上自组装CeO纳米颗粒构建仿生脂质体,同时具备内皮细胞膜特性和多酶催化活性 | 未提及具体的临床前或临床试验数据 | 设计能够模拟天然细胞功能的治疗性脂质体以调控生化微环境稳态 | 仿生脂质体纳米酶及其对炎症因子和血小板聚集的调控作用 | 合成生物学 | 组织工程相关疾病 | 纳米酶技术、自组装技术 | NA | 实验数据 | NA | 自组装 | NA | 仿生信号调节系统 | 医学 |
| 43 | 2025-10-05 |
Dendritic Membranized Coacervate Microdroplets: A Robust Platform for Synthetic-Living Cell Consortia
2025-Aug-13, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09772
PMID:40751679
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研究论文 | 本研究开发了一种基于树枝状聚合物的膜包被凝聚微滴平台,用于构建合成-天然细胞联合体 | 利用树枝状聚合物的球状刚性结构,显著提高了凝聚微滴在生理盐浓度下的稳定性,临界盐浓度比传统多肽或支链聚电解质形成的凝聚体提高两倍以上 | NA | 构建结构稳定且具有细胞样功能的合成细胞平台,用于生物医学应用 | 树枝状聚合物膜包被凝聚微滴 | 合成生物学 | NA | 共凝聚技术、聚合物组装 | NA | NA | NA | NA | NA | 具有酶封装、内部快速动力学和化学通讯功能的合成细胞平台 | 医学, 组织工程, 再生医学 |
| 44 | 2025-10-05 |
An old dog with new tricks-the value of photorespiration as a central metabolic hub with implications for environmental acclimation
2025-Aug-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf258
PMID:40515676
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综述 | 探讨光呼吸作为中心代谢枢纽在环境适应中的新功能与价值 | 揭示光呼吸与气孔代谢调控的新联系,发现新型代谢参与者及细胞器间互作网络 | NA | 阐明光呼吸在光合作用和环境适应中的核心作用 | 光养生物的光呼吸代谢途径 | 植物代谢工程 | NA | 同位素标记、反向遗传学、合成生物学 | NA | 代谢通量数据 | NA | 合成生物学方法 | 植物 | 旁路途径整合、天然酶优化 | 农业 |
| 45 | 2025-10-05 |
5'-O-P-N Linkages of Phosphoramidate Nucleotides: Chemical Construction and Biological Impact
2025-Aug, Chemical record (New York, N.Y.)
DOI:10.1002/tcr.202500056
PMID:40442970
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综述 | 本文系统综述了5'-O-P-N磷酰胺核苷酸的化学合成方法及其生物学影响 | 重点关注5'-羟基位置磷酰胺(P-N)连接这一新兴核苷酸类似物的合成策略与生物功能研究 | NA | 探讨磷酰胺核苷酸的合成方法、生物学功能及其在医药和生物技术中的应用前景 | 5'-O-P-N磷酰胺核苷酸及其化学修饰 | 生物化学与合成生物学 | NA | 磷酰胺化策略、催化方法、绿色化学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药化学、生物技术 |
| 46 | 2025-10-05 |
Microbial strategies on polyhydroxyalkanoates production from food waste to support the circular bioeconomy
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146023
PMID:40669653
|
综述 | 本文重点探讨利用餐厨垃圾生产聚羟基脂肪酸酯的微生物策略及其在循环生物经济中的应用前景 | 系统总结了代谢工程和合成生物学在餐厨垃圾生物转化生产聚羟基脂肪酸酯中的最新微生物策略 | NA | 促进餐厨垃圾资源化利用和循环生物经济发展 | 餐厨垃圾和聚羟基脂肪酸酯 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物底盘细胞 | NA | 环境,工业生物技术 |
| 47 | 2025-10-05 |
Combing Directed Enzyme Evolution with Metabolic Engineering to Develop Efficient Microbial Cell Factories
2025-Aug-28, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00002
PMID:40901576
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综述 | 本文综述了将定向酶进化与代谢工程相结合开发高效微生物细胞工厂的策略与方法 | 系统整合传统与数据驱动的定向进化策略(包括随机文库设计、半理性设计、智能文库设计和连续进化)与代谢工程方法,突破经典代谢工程仅关注基因表达水平的局限 | 未具体说明应用案例的详细实验数据,主要聚焦于方法论层面的讨论 | 开发高效微生物细胞工厂以实现可再生原料的可持续化学生产 | 微生物细胞工厂中的酶蛋白和代谢途径 | 合成生物学 | NA | 定向进化、蛋白质工程、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 代谢途径优化 | 工业生物技术 |
| 48 | 2025-10-05 |
Toward a monocot SynBio toolkit: assessing regulatory element performance and eudicot compatibility
2025-Aug-08, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03583-x
PMID:40779074
|
研究论文 | 本研究构建并评估了一个包含80个遗传调控元件的组合库,用于单子叶植物的合成生物学应用 | 开发了新颖的CaMV 35S启动子与病毒5'UTR序列组合,其表达水平接近强病毒启动子融合;新发现的植物小热休克蛋白3'UTR序列能显著增强报告基因表达 | 研究主要基于玉米原生质体和本氏烟的瞬时表达系统,尚未在完整植株中进行长期验证 | 解决禾谷类作物和禾草遗传工程中合适调控元件相对缺乏的问题 | 玉米原生质体和本氏烟叶片 | 合成生物学 | NA | 原生质体转化、农杆菌浸润、荧光测定 | NA | 荧光表达数据 | 80个遗传调控元件组合,在两种植物系统中测试 | 农杆菌浸润 | 玉米, 本氏烟 | 遗传调控元件组合库,包括启动子、5'UTR、启动子-5'UTR融合和3'UTR序列 | 农业, 工业生物技术 |
| 49 | 2025-10-05 |
Advancements in DNA-Driven Precision Modulation of Cell Surface Receptor for Programmable Cellular Functions
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505073
PMID:40588818
|
综述 | 本文系统总结了基于DNA的受体工程策略在精确调控细胞表面受体功能方面的最新进展 | 整合遗传和非遗传DNA工程策略,利用DNA纳米结构、功能性核酸和可编程动态DNA反应实现受体功能的多维调控 | NA | 开发精确调控细胞表面受体的DNA工程策略,推动智能细胞系统发展 | 细胞表面受体及其信号传导机制 | 合成生物学 | NA | DNA纳米技术、DNA折纸、功能性核酸 | NA | NA | NA | DNA纳米结构、DNA逻辑电路、DNA纳米机器人 | 哺乳动物细胞 | DNA逻辑电路、DNA纳米机器人、受体二聚化和寡聚化调控 | 医学 |
| 50 | 2025-10-05 |
Iterative recombinase technologies for efficient and precise genome engineering across kilobase to megabase scales
2025-Aug-21, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.07.011
PMID:40763736
|
研究论文 | 开发了两种可编程染色体编辑系统PCE和RePCE,实现植物和人类细胞中无痕的千碱基到兆碱基尺度DNA操作 | 通过高通量工程获得逆转性降低10倍的Lox位点,利用AI辅助重组酶工程方法生成重组效率提高3.5倍的Cre变体,结合Re-pegRNA介导的无痕策略增强编辑精度 | NA | 解决基因组编辑技术在高等生物中实现精确、大规模DNA操作面临的挑战 | 植物和人类细胞 | 合成生物学 | NA | 可编程染色体编辑系统,AI辅助重组酶工程,Re-pegRNA介导的无痕策略 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9, 重组酶技术 | 水稻, 人类细胞 | 染色体水平编辑系统,支持插入、删除、替换、倒位和易位操作 | 分子育种, 治疗开发, 合成生物学 |
| 51 | 2025-10-05 |
Harnessing the Power of Photosynthesis: from Current Engineering Strategies to Cell Factory Applications
2025-Aug, Small methods
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/smtd.202402147
PMID:39930847
|
综述 | 本文综述光合作用工程化策略及其在细胞工厂应用中的潜力 | 系统整合纳米材料辅助、微流控技术、合成生物学和光生物电化学系统等多种工程策略优化光合作用 | NA | 探讨工程化光合系统在能源和物质转化领域的应用潜力 | 光合作用系统及其工程化改造 | 合成生物学 | NA | 纳米材料辅助技术、微流控技术、合成生物学技术、光生物电化学系统 | NA | NA | NA | 合成生物学技术 | NA | 代谢通路优化 | 能源, 环境, 医学, 工业生物技术 |
| 52 | 2025-10-05 |
Molecular and biochemical insights from natural and engineered photosynthetic endosymbiotic systems
2025-Aug, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102598
PMID:40252292
|
综述 | 探讨光合内共生系统的分子与生化特征,比较自然系统与工程化系统的异同 | 整合自然内共生系统研究与人工工程化尝试,揭示内共生转化为细胞器的关键分子机制 | NA | 理解光合内共生系统的进化机制与工程化应用潜力 | 线粒体、叶绿体等内共生细胞器及人工构建的光合内共生系统 | 合成生物学 | NA | 基因工程、比较基因组学 | NA | 文献数据、实验数据 | NA | iGEM | 光合细菌、宿主细胞 | 内共生代谢通路、基因转移系统 | 能源, 环境 |
| 53 | 2025-10-05 |
Active Armoring of Protocell Condensates with Metal-Phenolic Networks
2025-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202503077
PMID:40351056
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研究论文 | 本研究开发了利用金属-酚网络(MPN)对肽基凝聚体进行可移除膜化包覆的方法,显著增强了凝聚体的结构稳定性和化学耐受性 | 首次将金属-酚网络应用于凝聚体的可控制膜化包覆,实现了膜厚度和渗透性的可调调控,并能通过氧化还原反应实现膜的可逆组装与解离 | 研究主要聚焦于铁离子和单宁酸体系,尚未系统探索其他金属-酚网络组合的效果 | 开发一种稳定和保护肽基凝聚体免受化学有害物质影响的膜化策略 | 聚-L-赖氨酸和三磷酸腺苷(ATP)凝聚体 | 合成生物学 | NA | 核磁共振波谱 | NA | 光谱数据 | NA | 金属-酚网络(MPN) | NA | 凝聚体膜化保护系统 | 合成生物学, 前生命化学 |
| 54 | 2025-10-05 |
From Code to Life: The AI-Driven Revolution in Genome Editing
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417029
PMID:40538131
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综述 | 探讨人工智能与基因组编辑技术的融合及其在生物技术领域的革命性应用 | 首次系统阐述AI技术如何通过优化sgRNA设计、发现新型Cas蛋白和增强基因调控网络分析来推动基因组编辑发展 | 存在数据偏差、算法透明度不足和潜在非预期基因修饰等伦理问题 | 研究人工智能与基因组编辑技术的交叉融合及其应用前景 | 基因组编辑技术及其AI增强方法 | 机器学习 | 遗传疾病 | CRISPR基因编辑技术 | 深度学习预测器, 蛋白质语言模型 | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学, 农业, 工业生物技术 |
| 55 | 2025-10-05 |
Microbial proteases as emerging anti-inflammatory therapeutics: a comprehensive review
2025-Aug-19, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04409-w
PMID:40828296
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综述 | 本文全面探讨微生物蛋白酶作为抗炎治疗药物的潜力,包括其分子机制、生产策略及作为传统抗炎药物替代方案的临床应用前景 | 重点关注未充分研究的细菌属类,提出连接实验室发现与实际治疗应用的转化视角,并强调通过菌株工程、封装技术和合成生物学方法提升治疗效果 | 存在免疫系统敏感性、生理条件下稳定性差、与其他酶源比较数据有限、监管审批和靶向递送挑战等临床转化障碍 | 评估微生物蛋白酶在炎症管理中的治疗潜力 | 微生物蛋白酶及其抗炎机制 | 生物医学工程 | 炎症性疾病 | 发酵技术、基因改造、菌株工程、封装技术、合成生物学方法 | NA | 文献资料 | NA | 合成生物学方法 | 微生物 | NA | 医药 |
| 56 | 2025-10-05 |
Recent advances of muconic acid production using microbial synthetic biology
2025-Aug-11, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04419-8
PMID:40788366
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综述 | 本文重点介绍了利用合成生物学技术生产粘康酸的最新研究进展 | 系统总结了包括辅因子工程、模块化共培养和人工智能辅助酶优化在内的新型生产策略 | NA | 探讨微生物合成生物学在粘康酸生产中的应用 | 粘康酸生物合成 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 57 | 2025-10-05 |
Therapeutic engineering of the gut microbiome using synthetic biology and metabolic tools: a comprehensive review with E. coli Nissle 1917 as a model case study
2025-Aug-06, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04417-w
PMID:40767874
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综述 | 本文全面综述了利用合成生物学和代谢工程工具改造肠道微生物组的最新进展,特别以大肠杆菌Nissle 1917为模型案例 | 系统分析从早期重组益生菌到先进合成生物学平台的发展历程,重点阐述工程化大肠杆菌Nissle 1917产生苯丙氨酸解氨酶(PAL)和L-氨基酸脱氨酶(LAAD)用于苯丙酮尿症(PKU)治疗 | NA | 探讨微生物群落工程在生物技术领域的进展及其在肠道健康相关疾病治疗中的应用潜力 | 肠道微生物组、工程化肠道细菌、大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 炎症性肠病、代谢功能障碍、结直肠癌、苯丙酮尿症 | 酶工程、代谢工程、生物催化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 代谢通路、生物传感器、免疫调节化合物生物合成、短链脂肪酸生产、有害代谢物分解 | 医学 |
| 58 | 2025-10-05 |
Unlocking expanded flagellin perception through rational receptor engineering
2025-Aug, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02049-y
PMID:40721669
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研究论文 | 通过理性受体工程拓展植物对细菌鞭毛蛋白的识别范围 | 首次系统鉴定FLS2受体中决定广谱识别能力的关键残基,并成功通过合成生物学方法将广谱识别特性在不同植物FLS2同源物间转移 | 研究主要聚焦于FLS2受体,尚未验证其他植物免疫受体的类似工程化潜力 | 增强植物对病原菌的识别能力以改善病原菌限制 | 植物模式识别受体FLS2及其与细菌鞭毛蛋白flg22的相互作用 | 合成生物学 | 植物细菌性病害 | 多样性分析、AlphaFold建模、氨基酸特性分析、合成生物学 | AlphaFold | 蛋白质序列、结构模拟数据 | 跨三个植物目的FLS2同源物 | 合成生物学 | 植物细胞 | FLS2受体工程改造以增强病原识别 | 农业 |
| 59 | 2025-10-05 |
Intelligent Design of Microbial Carbohydrate Factories: Integrated Chassis-Tools-Strategies Frameworks
2025-Aug-20, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05803
PMID:40788265
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综述 | 本文综述了微生物碳水化合物工厂的智能设计方法,提出了集底盘-工具-策略于一体的综合框架 | 建立了多维度的碳水化合物生物合成系统智能设计理论框架,整合了底盘生物特性、计算与实验工具以及代谢工程策略 | NA | 开发工程化碳水化合物合成微生物工厂的综合方法 | 工业底盘生物及其碳水化合物合成代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、计算建模 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌 | 代谢途径优化、途径重建、动态控制机制 | 食品, 制药, 农业, 化学工业 |
| 60 | 2025-10-05 |
Biotechnological advances in algae-based foods: applications in nutrition and microbiome health
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103335
PMID:40628054
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综述 | 本文综述藻类在食品生物技术中的进展,重点关注其在营养和肠道微生物健康方面的应用 | 系统阐述合成生物学和发酵技术在藻类营养强化及新型功能食品开发中的应用创新 | NA | 探讨藻类作为可持续食品资源的生物技术应用潜力 | 藻类及其生物活性成分 | 食品生物技术 | NA | 合成生物学、发酵技术、酶水解 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物系统 | NA | 食品、营养 |