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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Pollutant degradation in saline wastewater using synthetic biology
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.06.012
PMID:40544014
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研究论文 | 开发了一种能够高效降解高盐环境中复杂有机污染物的工程化 Vibrio natriegens 菌株 | 利用合成生物学技术赋予微生物在高盐环境中降解污染物的新能力 | NA | 解决高盐废水中有机污染物的生物降解问题 | 工程化 Vibrio natriegens 菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | 污染物降解通路 | 环境 |
| 62 | 2025-10-05 |
Decoding NF-κB: nucleocytoplasmic shuttling dynamics, synthetic modulation and post-therapeutic behavior in cancer
2025-Aug-07, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10917-1
PMID:40775128
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综述 | 本文综述了NF-κB的结构功能、核质穿梭动力学、合成生物学调控方法及其在癌症治疗后的行为特征 | 系统整合了NF-κB核质穿梭的时空调控机制,并提出通过合成基因电路和光遗传学工具实现精准调控的创新方法 | NF-κB复合物存在随机变异性且缺乏明确的药物结合口袋,使其在癌细胞中的完全抑制具有挑战性 | 深入解析NF-κB信号通路的复杂调控机制及其在癌症耐药中的作用 | 核因子κB(NF-κB)信号通路及其在癌细胞中的行为 | 合成生物学 | 癌症 | 光遗传学工具 | NA | NA | NA | 合成基因电路 | NA | 肿瘤微环境免疫调节电路 | 医学 |
| 63 | 2025-10-05 |
Molecular circuits for genomic recording of cellular events
2025-Aug, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.04.004
PMID:40335327
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综述 | 本文综述了用于细胞事件基因组记录的分子电路策略,探讨了新兴合成生物学工具在构建多样化传感器和遗传电路架构中的应用 | 系统梳理了基因组记录领域的最新进展,重点探讨如何利用新兴合成生物学工具构建能够将细胞状态忠实编码到基因组DNA记录中的新型传感器和分子电路 | 目前直接记录和重建过去细胞事件的方法仍然有限,其在揭示细胞命运决定新见解方面的潜力尚未完全实现 | 开发能够记录细胞事件的基因组记录技术和分子电路 | 细胞事件、基因组记录、分子电路 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因编辑 | NA | 基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 传感器模块、遗传电路架构、基因组记录电路 | 医学 |
| 64 | 2025-10-05 |
Machine Learning Empowering Microbial Cell Factory: A Comprehensive Review
2025-Aug, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05260-x
PMID:40397295
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综述 | 探讨机器学习与合成生物学在微生物细胞工厂优化中的协同应用 | 系统阐述机器学习与合成生物学的交叉融合如何推动微生物细胞工厂的升级 | NA | 为生物制造与人工智能交叉领域的研究提供指导 | 微生物细胞工厂 | 机器学习 | NA | 合成生物学技术 | 机器学习衍生模型 | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 化学品生产, 人类健康, 环境修复 |
| 65 | 2025-10-05 |
Synthetic Biocatalysis in Erythrocyte Microreactors for Gasotransmitter H2S Production and Vessel Vasodilation
2025-Aug, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202502208
PMID:40451735
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研究论文 | 开发能够持续产生硫化氢治疗血管舒张的红细胞微反应器 | 首次将PLP-PLys复合物封装到红细胞中构建微反应器,实现持续可控的H2S生产和局部血管舒张 | 仅进行了体外实验验证,尚未开展体内研究 | 开发用于心血管治疗的气体递质H2S可控释放平台 | 红细胞微反应器和离体胸主动脉环 | 合成生物学 | 心血管疾病 | 低渗膨胀法、荧光成像、体外血管环实验 | NA | 生物化学数据、荧光成像数据 | NA | 低渗膨胀封装技术 | 红细胞 | 级联反应系统:PLP-PLys复合物和血红蛋白介导的L-半胱氨酸转化为H2S | 医学 |
| 66 | 2025-10-05 |
Exploring the Application and Prospects of Synthetic Biology in Engineered Living Materials
2025-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202305828
PMID:37677048
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综述 | 探讨合成生物学在工程活性材料领域的应用前景与发展趋势 | 系统阐述具有自组织、自修复和适应性等生命特征的工程活性材料如何超越传统合成材料 | NA | 综述工程活性材料在不同应用领域的最新研究进展和设计策略 | 源自细菌、真菌和植物的工程活性材料 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌, 真菌, 植物 | NA | 环境修复, 生态建筑, 可持续能源 |
| 67 | 2025-10-05 |
Prospects for synthetic biology in 21st century agriculture
2025-Aug, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2024.12.016
PMID:39742963
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综述 | 本文探讨了植物合成生物学在21世纪农业中的发展前景和应用潜力 | 整合先进遗传工具、计算建模和系统生物学,实现植物基因组的精确修饰,并强调人工智能与合成生物学的融合 | 面临监管审批和公众接受的挑战,需要进行严格的多领域测试以确保可重复性 | 通过合成生物学技术解决全球粮食安全挑战,建立更具韧性和可持续的农业系统 | 植物基因组和农业系统 | 合成生物学 | NA | 遗传工程、计算建模、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 光合作用效率优化、固氮途径、抗逆性通路、生物强化代谢途径 | 农业 |
| 68 | 2025-10-05 |
Structural insights and rational engineering strategies for modular polyketide synthases: A review
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145299
PMID:40533022
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综述 | 本文系统探讨了顺式酰基转移酶聚酮合酶的结构特征与理性工程策略 | 聚焦于基于结构机制的模块化构建块选择与催化域设计的多维度工程方法 | 未涉及具体实验验证数据(因属综述类型) | 推动聚酮类化合物的合成生物学应用与天然产物发现 | 顺式酰基转移酶聚酮合酶系统 | 合成生物学 | NA | 酶工程 | NA | 结构生物学数据 | NA | NA | NA | 多模块酶组装线 | 医药 |
| 69 | 2025-10-05 |
Rhodotorula Yeasts as Potential Chassis for Sustainable Food Biotechnology
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05298
PMID:40699591
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综述 | 本文综述了红酵母作为食品生物技术底盘细胞的潜力,涵盖多组学研究、细胞工厂构建及食品废弃物增值转化 | 系统评估红酵母作为新型食品生物技术底盘的综合潜力,整合多组学数据与合成生物学工具开发进展 | 红酵母代谢工程面临多组学信息挖掘不足、遗传操作工具效率低下及独特代谢特征认知有限等挑战 | 探索红酵母作为可持续食品生物技术底盘细胞的开发潜力与应用前景 | 红酵母属微生物,特别是用于食品加工废弃物增值转化的菌种 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具箱 | 红酵母 | 细胞工厂设计,用于生产脂质、类胡萝卜素、酶和糖醇等食品成分 | 食品, 工业生物技术 |
| 70 | 2025-10-05 |
Mining UDP-Glucosyltransferases to Develop High-Efficiency Production Strategies for Emodin Glucosides
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c03575
PMID:40705854
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研究论文 | 本研究通过挖掘UDP-葡萄糖基转移酶开发大黄酚葡萄糖苷的高效生产策略 | 评估了10种高效的大黄酚UDP-葡萄糖基转移酶,开发了全细胞催化系统实现78.9%的高转化率,并揭示了OsUGT的双位点葡萄糖基化活性 | 丝状真菌中植物源蛋白表达存在挑战,阻碍了进一步优化 | 开发大黄酚葡萄糖苷的高效生物合成方法 | 大黄酚-6-β-d-葡萄糖苷(E6G)和大黄酚-8-β-d-葡萄糖苷(E8G) | 合成生物学 | NA | 序列分析、结构分析、系统发育分析 | NA | NA | 10种UDP-葡萄糖基转移酶 | 合成生物学方法 | 丝状真菌 | 大黄酚葡萄糖苷生物合成途径 | 医药 |
| 71 | 2025-10-05 |
Plant prenyltransferases: Diversity, catalytic activities, mechanisms, and application in heterologous production of prenylated natural products
2025-Aug-06, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.70004
PMID:40765501
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综述 | 系统总结植物异戊烯基转移酶的多样性、催化机制及其在异源生产异戊烯化天然产物中的应用 | 首次对160余种植物UbiA型异戊烯基转移酶和代表性异戊烯二磷酸合酶进行系统性总结,涵盖酶工程策略和异源生产应用 | 植物异戊烯基转移酶的功能多样性仍未完全阐明 | 推进植物异戊烯基转移酶的表征与应用,为基于异戊烯化天然产物的药物开发奠定基础 | 植物异戊烯基转移酶和异戊烯二磷酸合酶 | 合成生物学 | NA | 基因组学、合成生物学、酶工程 | NA | 文献数据 | 超过160种植物UbiA型异戊烯基转移酶及代表性异戊烯二磷酸合酶 | NA | NA | NA | 医药 |
| 72 | 2025-10-05 |
Pathway engineering for the biosynthesis of psychedelics
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103314
PMID:40381450
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综述 | 本文综述了迷幻化合物在真核和原核宿主中的生物合成研究进展 | 系统总结了不同类型迷幻化合物的最新生物合成成就,并整理了具有异源活性的生物合成酶列表 | NA | 开发迷幻化合物的替代生产途径 | 吲哚胺类(裸盖菇素、N,N-二甲基色胺等)、麦角碱类(麦角酸)和苯乙胺类(麦司卡林)迷幻化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、异源表达 | NA | 文献数据 | NA | NA | 真核生物, 原核生物 | 代谢途径工程 | 医药 |
| 73 | 2025-10-05 |
Microbial food waste valorization: advances, challenges, and perspectives
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103323
PMID:40554099
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综述 | 探讨微生物发酵作为食物废弃物增值的可持续解决方案,将有机质转化为能源、高价值化合物和生物材料 | 强调合成生物学和代谢工程在提升微生物效率、优化底物利用和扩展工业应用方面的作用,并分析生物精炼整合路径 | NA | 研究通过微生物发酵实现食物废弃物增值的技术路径和挑战 | 食物废弃物及其微生物转化过程 | NA | NA | 微生物发酵、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 74 | 2025-10-05 |
Ingestible optoelectronic capsules enable bidirectional communication with engineered microbes for controllable therapeutic interventions
2025-Aug, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02057-w
PMID:40721535
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研究论文 | 开发了一种结合工程微生物与可摄入光电胶囊的双向通信系统,用于可控的疾病治疗干预 | 首次建立了生物-光学-电子信号处理链,实现体内工程微生物的实时监测和远程控制 | 目前仅在猪模型中进行验证,尚未进行人体临床试验 | 开发数字健康监测和可控治疗干预的新方法 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917和猪结肠炎模型 | 合成生物学 | 结肠炎 | 光遗传学, 生物发光检测 | NA | 生物发光信号, 无线电信号 | 猪模型 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 炎症检测生物传感器和抗炎纳米抗体表达系统 | 医学 |
| 75 | 2025-10-05 |
Genetically programmable wearable devices for precision physiological and molecular monitoring
2025-Aug-04, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/adf25a
PMID:40690926
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综述 | 本文综述了基因编程可穿戴设备在生理和分子监测领域的最新进展与应用前景 | 将基因工程和合成生物学整合到可穿戴平台,创建具有增强特异性、响应性和功能多样性的基因可编程生物界面 | 存在生物安全性问题、生物组件不稳定性以及临床转化障碍等挑战 | 开发用于精准医疗的基因编程可穿戴监测设备 | 可穿戴生物传感器和生物界面 | 生物医学工程 | NA | 基因工程, 合成生物学 | NA | 生物化学标记物数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞, 微生物细胞 | 生物传感器, 自调节功能电路 | 医疗, 个性化医疗 |
| 76 | 2025-10-05 |
Revolutionizing Caffeic Acid Production: Advanced Microbial Metabolic Engineering and Synthetic Biology Approaches
2025-Aug, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70091
PMID:40757780
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综述 | 本文总结了通过微生物代谢工程和合成生物学方法优化咖啡酸生产的五种策略 | 系统整合了咖啡酸生物合成的五种优化策略:生物合成途径、代谢途径修饰、系统生物学与合成生物学、辅因子工程和模块化共培养 | 微生物底盘生产咖啡酸面临前体供应有限、代谢中间体毒性、辅因子利用效率低和宿主微生物种类单一等瓶颈 | 优化咖啡酸的微生物生产方法 | 咖啡酸及其微生物生产系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 咖啡酸生物合成途径、代谢途径修饰 | 医药、食品 |
| 77 | 2025-10-05 |
Plant synthetic biology-based biofortification, strategies and recent progresses
2025-Aug, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13934
PMID:40376763
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综述 | 本文概述了基于植物合成生物学的生物强化策略及其最新进展 | 系统总结了合成生物学在植物生物强化中的五大核心策略,并重点介绍了中国研究团队的最新突破 | NA | 通过植物合成生物学方法解决全球微量营养素缺乏问题 | 植物生物强化策略和技术 | 合成生物学 | 营养缺乏症 | NA | NA | NA | NA | NA | 植物 | 内源生物合成基因过表达、异源生物合成途径引入、营养特异性转运蛋白表达、转录调控优化、蛋白质定向进化 | 农业, 食品 |
| 78 | 2025-10-05 |
Marine bioactives: Pioneering sustainable solutions for advanced cosmetics and therapeutics
2025-Aug, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107868
PMID:40684894
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综述 | 本文综述海洋生物活性化合物在化妆品和药物领域的应用潜力及可持续发展解决方案 | 系统阐述海洋生物活性化合物的创新提取方法(酶辅助和超临界流体提取)、合成生物学可持续生产稀有化合物、以及海洋细胞培养实现50倍产量提升等技术突破 | NA | 探索海洋来源生物活性化合物在化妆品和制药领域的应用前景及可持续发展路径 | 海洋来源的多糖、肽类、脂质和色素等生物活性化合物 | NA | NA | 酶辅助提取、超临界流体提取、合成生物学、海洋细胞培养、生命周期评估 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 海洋藻类、无脊椎动物、微生物 | NA | 医药, 化妆品 |
| 79 | 2025-10-05 |
Codes across (life)sciences
2025-Aug, Bio Systems
DOI:10.1016/j.biosystems.2025.105515
PMID:40490067
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综述 | 本文探讨了“代码”概念在不同科学领域的含义、形式化及其在生命科学中的核心作用 | 跨学科视角整合数学、计算机科学到心理文化领域的代码研究,提出基于代码的统一生命理论框架 | 代码概念在不同学科中存在形式化程度差异,部分定义仍显模糊 | 构建跨学科代码研究的整体框架,探索生命系统中代码的通用理论 | 从细胞过程到文化实践的各类生物和社会系统中的代码现象 | 跨学科研究 | NA | NA | NA | 概念分析 | NA | NA | NA | NA | 跨学科科学、合成生物学、人工智能 |
| 80 | 2025-10-05 |
Cross and unique stress adaptation strategies of the polyextremophile Natranaerobius thermophilus to individual high salt, alkaline pH, and elevated temperature
2025-Aug-15, Journal of proteomics
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.jprot.2025.105479
PMID:40482852
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研究论文 | 本研究通过定量蛋白质组学分析揭示了嗜盐碱热菌Natranaerobius thermophilus对高盐、碱性pH和高温三种极端胁迫的交叉和独特适应策略 | 首次系统阐明该菌的碱性适应机制和热适应机制,发现其采用保守的交叉胁迫机制与独特胁迫适应相结合的策略 | 研究主要基于蛋白质组学分析,对具体分子机制的验证和功能研究仍需深入 | 解析多极端微生物对高盐、碱性和高温胁迫的分子适应机制 | 嗜盐碱热菌Natranaerobius thermophilus | 微生物学 | NA | iTRAQ定量蛋白质组学分析 | NA | 蛋白质组数据 | NA | NA | Natranaerobius thermophilus | NA | 合成生物学、生物技术 |