本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-10-05 |
Therapeutic engineering of the gut microbiome using synthetic biology and metabolic tools: a comprehensive review with E. coli Nissle 1917 as a model case study
2025-Aug-06, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04417-w
PMID:40767874
|
综述 | 本文全面综述了利用合成生物学和代谢工程工具改造肠道微生物组的最新进展,特别以大肠杆菌Nissle 1917为模型案例 | 系统分析从早期重组益生菌到先进合成生物学平台的发展历程,重点阐述工程化大肠杆菌Nissle 1917产生苯丙氨酸解氨酶(PAL)和L-氨基酸脱氨酶(LAAD)用于苯丙酮尿症(PKU)治疗 | NA | 探讨微生物群落工程在生物技术领域的进展及其在肠道健康相关疾病治疗中的应用潜力 | 肠道微生物组、工程化肠道细菌、大肠杆菌Nissle 1917 | 合成生物学 | 炎症性肠病、代谢功能障碍、结直肠癌、苯丙酮尿症 | 酶工程、代谢工程、生物催化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌 | 代谢通路、生物传感器、免疫调节化合物生物合成、短链脂肪酸生产、有害代谢物分解 | 医学 |
| 62 | 2025-10-05 |
Unlocking expanded flagellin perception through rational receptor engineering
2025-Aug, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-025-02049-y
PMID:40721669
|
研究论文 | 通过理性受体工程拓展植物对细菌鞭毛蛋白的识别范围 | 首次系统鉴定FLS2受体中决定广谱识别能力的关键残基,并成功通过合成生物学方法将广谱识别特性在不同植物FLS2同源物间转移 | 研究主要聚焦于FLS2受体,尚未验证其他植物免疫受体的类似工程化潜力 | 增强植物对病原菌的识别能力以改善病原菌限制 | 植物模式识别受体FLS2及其与细菌鞭毛蛋白flg22的相互作用 | 合成生物学 | 植物细菌性病害 | 多样性分析、AlphaFold建模、氨基酸特性分析、合成生物学 | AlphaFold | 蛋白质序列、结构模拟数据 | 跨三个植物目的FLS2同源物 | 合成生物学 | 植物细胞 | FLS2受体工程改造以增强病原识别 | 农业 |
| 63 | 2025-10-05 |
Intelligent Design of Microbial Carbohydrate Factories: Integrated Chassis-Tools-Strategies Frameworks
2025-Aug-20, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05803
PMID:40788265
|
综述 | 本文综述了微生物碳水化合物工厂的智能设计方法,提出了集底盘-工具-策略于一体的综合框架 | 建立了多维度的碳水化合物生物合成系统智能设计理论框架,整合了底盘生物特性、计算与实验工具以及代谢工程策略 | NA | 开发工程化碳水化合物合成微生物工厂的综合方法 | 工业底盘生物及其碳水化合物合成代谢途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、计算建模 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌 | 代谢途径优化、途径重建、动态控制机制 | 食品, 制药, 农业, 化学工业 |
| 64 | 2025-10-05 |
Biotechnological advances in algae-based foods: applications in nutrition and microbiome health
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103335
PMID:40628054
|
综述 | 本文综述藻类在食品生物技术中的进展,重点关注其在营养和肠道微生物健康方面的应用 | 系统阐述合成生物学和发酵技术在藻类营养强化及新型功能食品开发中的应用创新 | NA | 探讨藻类作为可持续食品资源的生物技术应用潜力 | 藻类及其生物活性成分 | 食品生物技术 | NA | 合成生物学、发酵技术、酶水解 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物系统 | NA | 食品、营养 |
| 65 | 2025-10-05 |
Molecular logic gates based on programmable self-assembly of DNA origami triangles for the detection of nucleic acid molecules
2025-Aug-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-15119-0
PMID:40783588
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于DNA折纸三角形自组装的分子逻辑门平台,用于检测核酸分子 | 将DNA折纸纳米结构与分子逻辑门集成,实现了目标驱动的层次自组装和布尔逻辑运算 | NA | 开发可编程核酸检测平台,推动动态分子计算领域发展 | DNA折纸三角形结构、核酸分子生物标志物 | 分子纳米技术 | 肺癌 | DNA折纸、原子力显微镜(AFM)、链置换技术 | 布尔逻辑门(YES、AND、OR) | 纳米尺度图像数据 | NA | DNA折纸 | NA | 基于DNA折纸三角形的分子逻辑门(YES、AND、OR)、可重置自适应反馈系统 | 医学诊断、合成生物学、纳米医学 |
| 66 | 2025-10-05 |
Integrating metagenomics and high-throughput screening for bioprospecting marine producers of polyhydroxyalkanoates
2025-Aug-04, Letters in applied microbiology
IF:2.0Q4
DOI:10.1093/lambio/ovaf096
PMID:40674061
|
研究论文 | 本研究通过宏基因组分析和定向培养基开发,从海洋环境中筛选出102株PHA生产菌株,并建立了高通量筛选平台 | 开发了结合尼罗红荧光强度与PHA含量定量关联的高通量筛选方法,有效解决荧光筛选假阳性问题,并发现一株高性能新菌株Halomonas olivaria | NA | 开发可持续生产生物可降解材料聚羟基脂肪酸酯的微生物资源和生产技术 | 海洋环境微生物群落和PHA生产菌株 | 工业生物技术 | NA | 宏基因组分析, 气相色谱, 荧光定量, 高通量筛选 | NA | 基因组数据, 化学分析数据 | 102株PHA生产菌株,来自不同海洋栖息地包括咸淡水界面和深海沉积物 | NA | Halomonas olivaria | NA | 材料, 环境, 工业生物技术 |
| 67 | 2025-10-05 |
Framing synthetic biology as an innovation-driven market
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.003
PMID:39984349
|
研究论文 | 提出了一个合成生物学市场框架以统一对其商业潜力的理解 | 区分专业合成生物学市场与更广泛的产品市场,并提出专门的市场框架 | NA | 构建合成生物学市场框架以明确其商业潜力 | 合成生物学市场及其商业潜力 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 68 | 2025-10-05 |
CRISPR.BOT an autonomous platform for streamlined genetic engineering and molecular biology applications
2025-Aug-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-01655-2
PMID:40770192
|
研究论文 | 介绍CRISPR.BOT自主基因工程平台,旨在革新分子生物学实验流程 | 开发了基于乐高机器人的低成本自主基因工程平台,实现单细胞亚克隆纯度达90-100% | 未提及平台在复杂实验环境中的稳定性和长期运行可靠性 | 开发低成本自动化基因工程平台以提升实验效率和安全性 | 细菌宿主、人类细胞系、SARS CoV-2病毒 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、慢病毒转导、质粒DNA转移 | NA | 实验数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌, 人类细胞系 | GFP报告基因系统、CRISPR-gRNA编辑系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 69 | 2025-10-05 |
Large language model for knowledge synthesis and AI-enhanced biomanufacturing
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.02.008
PMID:40050157
|
综述 | 探讨大型语言模型在合成生物学教育和生物制造领域的应用前景与影响 | 系统分析LLMs在生物制造中的知识图谱构建、DBTL周期优化及自动驾驶实验室等创新应用 | NA | 评估大型语言模型在合成生物学和生物制造领域的应用潜力与发展方向 | 大型语言模型及其在合成生物学中的应用场景 | 自然语言处理 | NA | 检索增强生成、知识图谱构建 | LLM | 非结构化数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 70 | 2025-10-05 |
Pollutant degradation in saline wastewater using synthetic biology
2025-Aug, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.06.012
PMID:40544014
|
研究论文 | 开发了一种能够高效降解高盐环境中复杂有机污染物的工程化 Vibrio natriegens 菌株 | 利用合成生物学技术赋予微生物在高盐环境中降解污染物的新能力 | NA | 解决高盐废水中有机污染物的生物降解问题 | 工程化 Vibrio natriegens 菌株 | 合成生物学 | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | Vibrio natriegens | 污染物降解通路 | 环境 |
| 71 | 2025-10-05 |
Machine Learning Empowering Microbial Cell Factory: A Comprehensive Review
2025-Aug, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05260-x
PMID:40397295
|
综述 | 探讨机器学习与合成生物学在微生物细胞工厂优化中的协同应用 | 系统阐述机器学习与合成生物学的交叉融合如何推动微生物细胞工厂的升级 | NA | 为生物制造与人工智能交叉领域的研究提供指导 | 微生物细胞工厂 | 机器学习 | NA | 合成生物学技术 | 机器学习衍生模型 | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 化学品生产, 人类健康, 环境修复 |
| 72 | 2025-10-05 |
Exploring the Application and Prospects of Synthetic Biology in Engineered Living Materials
2025-Aug, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202305828
PMID:37677048
|
综述 | 探讨合成生物学在工程活性材料领域的应用前景与发展趋势 | 系统阐述具有自组织、自修复和适应性等生命特征的工程活性材料如何超越传统合成材料 | NA | 综述工程活性材料在不同应用领域的最新研究进展和设计策略 | 源自细菌、真菌和植物的工程活性材料 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌, 真菌, 植物 | NA | 环境修复, 生态建筑, 可持续能源 |
| 73 | 2025-10-05 |
Structural insights and rational engineering strategies for modular polyketide synthases: A review
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145299
PMID:40533022
|
综述 | 本文系统探讨了顺式酰基转移酶聚酮合酶的结构特征与理性工程策略 | 聚焦于基于结构机制的模块化构建块选择与催化域设计的多维度工程方法 | 未涉及具体实验验证数据(因属综述类型) | 推动聚酮类化合物的合成生物学应用与天然产物发现 | 顺式酰基转移酶聚酮合酶系统 | 合成生物学 | NA | 酶工程 | NA | 结构生物学数据 | NA | NA | NA | 多模块酶组装线 | 医药 |
| 74 | 2025-10-05 |
Rhodotorula Yeasts as Potential Chassis for Sustainable Food Biotechnology
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05298
PMID:40699591
|
综述 | 本文综述了红酵母作为食品生物技术底盘细胞的潜力,涵盖多组学研究、细胞工厂构建及食品废弃物增值转化 | 系统评估红酵母作为新型食品生物技术底盘的综合潜力,整合多组学数据与合成生物学工具开发进展 | 红酵母代谢工程面临多组学信息挖掘不足、遗传操作工具效率低下及独特代谢特征认知有限等挑战 | 探索红酵母作为可持续食品生物技术底盘细胞的开发潜力与应用前景 | 红酵母属微生物,特别是用于食品加工废弃物增值转化的菌种 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具箱 | 红酵母 | 细胞工厂设计,用于生产脂质、类胡萝卜素、酶和糖醇等食品成分 | 食品, 工业生物技术 |
| 75 | 2025-10-05 |
Mining UDP-Glucosyltransferases to Develop High-Efficiency Production Strategies for Emodin Glucosides
2025-Aug-06, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c03575
PMID:40705854
|
研究论文 | 本研究通过挖掘UDP-葡萄糖基转移酶开发大黄酚葡萄糖苷的高效生产策略 | 评估了10种高效的大黄酚UDP-葡萄糖基转移酶,开发了全细胞催化系统实现78.9%的高转化率,并揭示了OsUGT的双位点葡萄糖基化活性 | 丝状真菌中植物源蛋白表达存在挑战,阻碍了进一步优化 | 开发大黄酚葡萄糖苷的高效生物合成方法 | 大黄酚-6-β-d-葡萄糖苷(E6G)和大黄酚-8-β-d-葡萄糖苷(E8G) | 合成生物学 | NA | 序列分析、结构分析、系统发育分析 | NA | NA | 10种UDP-葡萄糖基转移酶 | 合成生物学方法 | 丝状真菌 | 大黄酚葡萄糖苷生物合成途径 | 医药 |
| 76 | 2025-10-05 |
Pathway engineering for the biosynthesis of psychedelics
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103314
PMID:40381450
|
综述 | 本文综述了迷幻化合物在真核和原核宿主中的生物合成研究进展 | 系统总结了不同类型迷幻化合物的最新生物合成成就,并整理了具有异源活性的生物合成酶列表 | NA | 开发迷幻化合物的替代生产途径 | 吲哚胺类(裸盖菇素、N,N-二甲基色胺等)、麦角碱类(麦角酸)和苯乙胺类(麦司卡林)迷幻化合物 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、异源表达 | NA | 文献数据 | NA | NA | 真核生物, 原核生物 | 代谢途径工程 | 医药 |
| 77 | 2025-10-05 |
Microbial food waste valorization: advances, challenges, and perspectives
2025-Aug, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103323
PMID:40554099
|
综述 | 探讨微生物发酵作为食物废弃物增值的可持续解决方案,将有机质转化为能源、高价值化合物和生物材料 | 强调合成生物学和代谢工程在提升微生物效率、优化底物利用和扩展工业应用方面的作用,并分析生物精炼整合路径 | NA | 研究通过微生物发酵实现食物废弃物增值的技术路径和挑战 | 食物废弃物及其微生物转化过程 | NA | NA | 微生物发酵、合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 环境, 能源, 工业生物技术 |
| 78 | 2025-10-05 |
Ingestible optoelectronic capsules enable bidirectional communication with engineered microbes for controllable therapeutic interventions
2025-Aug, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02057-w
PMID:40721535
|
研究论文 | 开发了一种结合工程微生物与可摄入光电胶囊的双向通信系统,用于可控的疾病治疗干预 | 首次建立了生物-光学-电子信号处理链,实现体内工程微生物的实时监测和远程控制 | 目前仅在猪模型中进行验证,尚未进行人体临床试验 | 开发数字健康监测和可控治疗干预的新方法 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917和猪结肠炎模型 | 合成生物学 | 结肠炎 | 光遗传学, 生物发光检测 | NA | 生物发光信号, 无线电信号 | 猪模型 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 炎症检测生物传感器和抗炎纳米抗体表达系统 | 医学 |
| 79 | 2025-10-05 |
Genetically programmable wearable devices for precision physiological and molecular monitoring
2025-Aug-04, Biofabrication
IF:8.2Q1
DOI:10.1088/1758-5090/adf25a
PMID:40690926
|
综述 | 本文综述了基因编程可穿戴设备在生理和分子监测领域的最新进展与应用前景 | 将基因工程和合成生物学整合到可穿戴平台,创建具有增强特异性、响应性和功能多样性的基因可编程生物界面 | 存在生物安全性问题、生物组件不稳定性以及临床转化障碍等挑战 | 开发用于精准医疗的基因编程可穿戴监测设备 | 可穿戴生物传感器和生物界面 | 生物医学工程 | NA | 基因工程, 合成生物学 | NA | 生物化学标记物数据 | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 哺乳动物细胞, 微生物细胞 | 生物传感器, 自调节功能电路 | 医疗, 个性化医疗 |
| 80 | 2025-10-05 |
Revolutionizing Caffeic Acid Production: Advanced Microbial Metabolic Engineering and Synthetic Biology Approaches
2025-Aug, Biotechnology journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/biot.70091
PMID:40757780
|
综述 | 本文总结了通过微生物代谢工程和合成生物学方法优化咖啡酸生产的五种策略 | 系统整合了咖啡酸生物合成的五种优化策略:生物合成途径、代谢途径修饰、系统生物学与合成生物学、辅因子工程和模块化共培养 | 微生物底盘生产咖啡酸面临前体供应有限、代谢中间体毒性、辅因子利用效率低和宿主微生物种类单一等瓶颈 | 优化咖啡酸的微生物生产方法 | 咖啡酸及其微生物生产系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 咖啡酸生物合成途径、代谢途径修饰 | 医药、食品 |