合成生物学相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1	2025-07-11	Myxobacteria: Versatile cell factories of novel commercial enzymes for bio-manufacturing 2025-Sep, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108594 PMID:40345460	综述	本文综述了粘细菌作为新型商业酶多功能细胞工厂在生物制造中的应用及其潜力	突出了粘细菌在生物技术应用中的未开发潜力及其在生物质转化等商业酶生产中的新兴作用	遗传工程挑战、生长缓慢以及代谢重塑和表达策略的限制阻碍了粘细菌细胞工厂的构建	探讨粘细菌及其酶在农业和工业中的潜在应用	粘细菌及其产生的酶	生物技术	NA	生物勘探和计算方法	NA	NA	NA
2	2025-06-21	Construction of a synthetic biology toolkit for the genetic manipulation in the cellulose-producing strain Kosakonia oryzendophytica 2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.012 PMID:40529626	research paper	开发了一个合成生物学工具包，用于在纤维素生产菌株Kosakonia oryzendophytica中进行遗传操作	构建了一个可调表达模块和精确基因组编辑能力的综合工具包，用于重编程菌株以生产具有定制特性的下一代纤维素基功能材料	NA	开发合成生物学平台以工程化高产细菌纤维素合成菌株	Kosakonia oryzendophytica菌株	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9介导的无疤痕基因组编辑系统	NA	NA	NA
3	2025-06-17	Addressing semantic ambiguity in biotechnology: Proposals from the European research infrastructure IBISBA 2025-Sep-25, New biotechnology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.nbt.2025.04.010 PMID:40280273	讨论论文	本文探讨了生物技术领域的语义模糊问题，并提出了统一核心术语定义的建议	分析了生物技术领域术语的复杂性，并提出了统一术语定义以支持高效政策制定的必要性	未提出具体的术语定义方案，仅讨论了问题的存在和统一的重要性	旨在促进生物技术领域术语的清晰化和统一化，以支持政策制定和科学传播	生物技术、生物制造、工程生物学和合成生物学等核心术语	生物技术	NA	NA	NA	文本	NA
4	2025-06-17	MutS-mediated rapid and cost-effective error correction in in vitro DNA synthesis 2025-Sep-25, New biotechnology IF:4.5Q1 DOI:10.1016/j.nbt.2025.05.002 PMID:40447215	研究论文	本研究开发了一种基于MutS蛋白的快速、经济高效的体外DNA合成错误校正方法	利用重组表达的MutS融合蛋白和自制旋转柱开发了新型错误校正方法，显著降低合成DNA的错误率	反应体积限制在10μL，可能影响大规模应用	开发高效低成本的体外DNA合成错误校正技术	DNA寡核苷酸和长链目标分子	合成生物学	NA	重组蛋白表达与纯化，异源双链DNA结合分析	NA	分子生物学数据	11种Cbm3-Egfp-MutS融合蛋白
5	2025-06-15	From reactants to products: computational methods for biosynthetic pathway design 2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.005 PMID:40510533	review	该文章回顾了生物合成途径设计中的关键计算工具	整合了生物大数据、逆合成方法和酶工程三个关键组件，显著提高了生物合成途径设计的效率和准确性	NA	提高生物合成途径设计的效率和准确性	生物合成途径设计中的计算工具	合成生物学	NA	数据挖掘、逆合成方法	NA	生物大数据（包括化合物、反应/途径和酶）	NA
6	2025-06-12	Tryptophan-producing bacteria to mitigate osteoporosis and intestinal dysfunction 2025-Sep, Bioactive materials IF:18.0Q1 DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.05.013 PMID:40487243	研究论文	研究通过补充产色氨酸细菌修复骨质疏松小鼠的肠道屏障功能并减轻骨质流失	揭示了色氨酸代谢在骨质疏松与肠道功能障碍之间的关联，并提出了一种基于合成生物学的治疗策略	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探索肠道微生物代谢物色氨酸在骨质疏松和肠道功能障碍中的作用	骨质疏松小鼠模型和老年小鼠模型	合成生物学	骨质疏松	微生物代谢组学	NA	NA	小鼠模型
7	2025-06-07	A review on the expanding biotechnological frontier of Pedobacter 2025-Sep, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108588 PMID:40294724	review	本文综述了Pedobacter属细菌的生物技术应用及其潜在的自然产物	强调了通过合成生物学方法解锁Pedobacter属细菌隐藏潜力的前景	目前仅对少数Pedobacter物种及其自然产物进行了表征	探讨Pedobacter属细菌的生物技术应用及其潜在的自然产物	Pedobacter属细菌及其衍生的自然产物	生物技术	NA	合成生物学、基因组分析	NA	基因组数据	NA
8	2025-06-07	Protease engineering: Approaches, tools, and emerging trends 2025-Sep, Biotechnology advances IF:12.1Q1 DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108602 PMID:40368116	综述	本文综述了蛋白酶工程的方法、工具和新兴趋势，重点介绍了定向进化和高通量策略在工程化蛋白酶底物特异性中的应用	讨论了新兴的蛋白酶工程策略，如抗体-蛋白酶融合实现邻近催化，以及通过外源蛋白-蛋白相互作用驱动的蛋白酶底物特异性转换	NA	探讨蛋白酶工程的最新进展，重点介绍能够精确控制蛋白酶活性和特异性的方法和策略	蛋白酶	合成生物学	NA	定向进化、高通量筛选	NA	NA	NA
9	2025-06-07	Exploring oxidosqualene cyclases and cytochrome P450s from Aralia elata for the synthesis of diverse pentacyclic triterpene sapogenins in Nicotiana benthamiana 2025-Sep, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110047 PMID:40435688	研究论文	本研究从辽东楤木中挖掘并功能表征了氧化角鲨烯环化酶（OSCs）和细胞色素P450（CYPs），用于在烟草中合成多样的五环三萜皂苷元（PTSs）	通过组合生物合成策略，成功合成了19种不同的PTSs，其中14种是首次在辽东楤木中发现	辽东楤木中PTSs的积累有限且生物合成复杂，限制了其大规模生产	探索辽东楤木中OSCs和CYPs的功能，以合成多样化的PTSs	辽东楤木中的OSCs和CYPs	合成生物学	NA	代谢组学和转录组学分析，农杆菌介导的异源表达	NA	NA	NA
10	2025-06-07	Synergistic potential of halophytes and halophilic/halotolerant plant growth-promoting bacteria in saline soil remediation: Adaptive mechanisms, challenges, and sustainable solutions 2025-Sep, Microbiological research IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.micres.2025.128227 PMID:40440870	综述	本文综述了盐生植物和嗜盐/耐盐植物生长促进细菌在盐渍土壤修复中的协同潜力及其适应机制、挑战和可持续解决方案	探讨了盐生植物与嗜盐/耐盐植物生长促进细菌的协同相互作用及其在盐渍土壤修复中的创新应用	对盐生植物与嗜盐/耐盐植物生长促进细菌的协同相互作用及特定盐适应策略的理解仍有限	研究盐胁迫耐受机制及其在可持续农业中的应用	盐生植物和嗜盐/耐盐植物生长促进细菌	可持续农业	NA	多组学方法、基因工程、机器学习辅助生物信息学、化学计量学和合成生物学	NA	NA	NA
11	2025-05-31	Promoting efficient synthesis and customization of sphingans based on metabolic engineering and synthetic biology strategies 2025-Sep-01, Carbohydrate polymers IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.carbpol.2025.123734 PMID:40441843	review	本文综述了鞘聚糖的结构、生物合成途径及其通过代谢工程和合成生物学策略高效合成与定制的方法	结合代谢工程和合成生物学策略，利用基因组代谢网络模型(GSMM)和CRISPR等高效工具调控代谢途径，以及通过分子量调控和可控取代基修饰定制不同分子量的鞘聚糖	野生型菌株研究背景不清晰及合成路径复杂等问题仍需进一步解决	提高鞘聚糖的生产能力并实现其定制化设计	鞘聚糖及其生产菌株	合成生物学	NA	基因组代谢网络模型(GSMM)、CRISPR、高通量筛选技术	NA	NA	NA
12	2025-05-24	Microbiome catalog and dynamics of the Chinese liquor fermentation process 2025-Sep, Bioresource technology IF:9.7Q1 DOI:10.1016/j.biortech.2025.132620 PMID:40334798	研究论文	该研究构建了中国白酒发酵过程中的微生物基因目录（MTFGC），揭示了发酵食品的独特性和高代谢潜力	建立了最大的发酵食品遗传资源库，发现了20%的新物种和基因，并验证了BGCs在合成香气相关脂肽中的作用	研究主要聚焦于中国白酒发酵过程，可能不适用于其他类型的发酵食品	揭示发酵食品中微生物的多样性和代谢潜力，推动传统发酵向精准合成生物学的转变	中国白酒发酵过程中的微生物群落	合成生物学	NA	宏基因组组装	NA	宏基因组数据	5,159个宏基因组组装基因组（MAGs）
13	2025-05-10	dTSR enables efficient improvement of heterologous production of spinosad in Saccharopolyspora erythraea 2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.02.003 PMID:40337009	research paper	该研究开发了一种双重转座和位点特异性重组（dTSR）方法，用于提高多杀菌素在Saccharopolyspora erythraea中的异源生产	提出了一种新的dTSR方法，能够高效生成初始异源菌株，并随机整合第二拷贝的多杀菌素生物合成基因簇，显著提高产量	研究仅针对Saccharopolyspora erythraea，未涉及其他稀有放线菌	提高多杀菌素在稀有放线菌中的异源生产效率	Saccharopolyspora erythraea和多杀菌素生物合成基因簇	合成生物学	NA	双重转座和位点特异性重组（dTSR）	NA	NA	NA
14	2025-04-29	A systematic study of regulating inorganic polyphosphates production in Saccharomyces cerevisiae 2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology IF:4.4Q1 DOI:10.1016/j.synbio.2025.04.004 PMID:40291979	研究论文	本文系统地研究了酵母中无机多磷酸盐生产的遗传调控机制	通过CRISPR/Cas9介导的过表达技术，构建了高产多磷酸盐的酵母菌株PP2，并揭示了其分子机制	研究仅针对Saccharomyces cerevisiae，未在其他微生物中进行验证	探究酵母中多磷酸盐代谢的遗传调控机制，并开发高产多磷酸盐的工程菌株	Saccharomyces cerevisiae（酿酒酵母）	合成生物学	NA	CRISPR/Cas9, qRT-PCR	NA	基因表达数据	55个单基因敲除菌株