合成生物学相关文章
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当前共找到 146 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-02 |
Intratumoral microorganisms and artificial antitumor bacteria
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2023.06.002
PMID:41613448
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综述 | 本文综述了肿瘤内微生物在癌症进展和治疗中的作用，并探讨了基于合成生物学技术编程的人工抗肿瘤细菌在精准癌症诊断和治疗中的应用前景 | 强调了通过合成生物学技术编程细菌以增强时空可控性，结合免疫疗法或其他强效抗肿瘤剂，可能开启下一代精准癌症诊断和治疗 | NA | 探讨肿瘤内微生物在癌症发展和治疗中的角色，以及基于活菌的新型治疗和诊断方法 | 肿瘤内微生物和人工编程的抗肿瘤细菌 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 2 | 2026-02-02 |
Gene circuit-based sensors
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.06.011
PMID:41613450
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综述 | 本文综述了基于合成生物学基因回路构建的生物传感器的设计原理、工程化方法及其在多个领域的应用，并重点探讨了基于无细胞系统的生物传感器的研究进展 | 整合合成生物学基本概念，全面描述了基因回路的设计与工程化，并重点聚焦于基于无细胞系统的生物传感器的设计理念、构建原则及其在生物检测领域的新前沿 | NA | 综述基于合成生物学基因回路的生物传感器的设计、构建与应用，并讨论该领域的新前沿与待解决的挑战 | 基于合成生物学基因回路的生物传感器，特别是基于无细胞系统的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物（泛指），无细胞系统 | 基因回路，包括具有不同响应机制、逻辑门和逻辑回路的传感器 | 生物制造过程监控, 环境监测, 食品安全, 医疗诊断与监测 |
| 3 | 2026-02-02 |
Nano-synthetic biology for disease diagnosis and treatment
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2025.07.002
PMID:41613477
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4 | 2026-02-02 |
Nanoscale synthetic biology with innovative medicinal applications
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.11.006
PMID:41613444
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综述 | 本文综述了纳米尺度合成生物学（NSB）在生物医学领域的应用，包括常见纳米载体、纳米生物组装系统及具体应用 | 整合合成生物学与纳米科学，通过纳米尺度操控实现更高效可控的生物工程，促进疾病治疗、生物成像、生物催化和生物传感的创新 | NA | 探讨NSB在生物医学中的应用，以推动科学技术进步并应对重大社会挑战 | 包括细胞、细菌和病毒在内的各种生物体 | 合成生物学 | NA | 基因调控系统（如CRISPR、mRNA、siRNA、质粒）、纳米酶、药物和特定纳米探针的递送 | NA | NA | NA | CRISPR, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细胞, 细菌, 病毒 | 生物传感器, 代谢途径 | 医学 |
| 5 | 2026-01-11 |
The tae-miR164-TaNAC6A Module from Winter Wheat Could Enhance Cold Tolerance in Transgenic Arabidopsis thaliana
2025-Sep-12, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182849
PMID:41012001
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研究论文 | 本研究揭示了冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块在增强植物耐冷性中的功能与分子机制 | 首次阐明冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块的耐冷调控机制，并通过异源表达策略验证其功能 | 研究主要在拟南芥异源系统中进行，尚未在小麦本物种中完全验证；分子调控网络细节需进一步解析 | 探究非编码RNA调控植物耐冷性的分子机制，为作物分子模块育种提供理论基础 | 冬小麦品种东农冬麦1号（Dn1）及转基因拟南芥 | 植物分子生物学 | 非疾病研究（植物非生物胁迫） | 基因表达分析、转基因技术、抗氧化酶活性检测、ROS与MDA含量测定 | NA | 基因表达数据、生理生化数据 | 冬小麦品种及转基因拟南芥株系（具体数量未明确说明） | 转基因技术 | 拟南芥（Arabidopsis thaliana） | NA | 农业 |
| 6 | 2025-12-29 |
Strategies to improve photosynthesis by modifying the RuBisCO system and its limitations
2025-Sep-26, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-11075-0
PMID:41003756
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综述 | 本文综述了通过改造RuBisCO系统以提高光合效率的策略及其局限性 | 综合评述了包括直接诱变、祖先蛋白重建、嵌合/异源亚基整合、碳浓缩机制引入以及合成生物学途径在内的多学科策略，并强调了人工智能在预测有益突变和指导蛋白质工程中的应用 | 讨论了每种改造方法自身存在的局限性 | 提高RuBisCO的催化效率与稳定性，以增强光合作用能力和作物生产力 | RuBisCO酶及其相关系统（如RuBisCO激活酶、碳浓缩机制） | 合成生物学 | NA | 直接诱变、祖先蛋白重建、蛋白质工程、合成生物学途径 | NA | NA | NA | NA | NA | 人工碳固定途径 | 农业 |
| 7 | 2025-12-24 |
MULTIMODAL CELL CONTEXT INSTRUCTION TUNING FOR CONDITIONAL DNA REGULATORY SEQUENCE GENERATION WITH LARGE LANGUAGE MODELS
2025-Sep, Proceedings. International Conference on Image Processing
DOI:10.1109/icip55913.2025.11084625
PMID:41426347
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研究论文 | 提出了一种名为Leonine的新型框架，通过多模态细胞上下文指令调优，利用大型语言模型生成条件性DNA调控序列 | 将增强子序列设计重新定义为细胞上下文中的多模态问答任务，整合DNA序列、启动子序列、基因表达谱和细胞类型信息 | NA | 设计具有细胞类型特异性的生物合理调控序列，特别是增强子 | DNA调控序列（增强子） | 合成生物学 | NA | 大型语言模型（LLMs） | LLM | DNA序列、启动子序列、基因表达谱、细胞类型信息 | 超过150万个细胞类型特异性启动子-增强子对 | NA | NA | 增强子设计 | 医学 |
| 8 | 2025-12-22 |
Computational tools for nonnatural pathway design: Algorithms, applications, and challenges
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100041
PMID:41415682
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综述 | 本文综述了用于非天然代谢途径设计的计算工具，包括算法、应用及挑战 | 系统比较了基于模板和无模板两类主要计算方法，并汇编了55个实验验证的非天然途径数据集以评估方法优劣 | 计算预测与实验可行性之间存在差距，代谢负担增加和有毒中间体积累等挑战尚未完全解决 | 通过理性设计非天然代谢途径扩展生物转化的范围和效率 | 非天然代谢途径的计算设计方法 | 合成生物学 | NA | 计算建模与生物信息学分析 | NA | 代谢途径数据与文献数据集 | 55个实验验证的非天然途径 | NA | 微生物细胞工厂 | 非天然代谢途径 | 工业生物技术 |
| 9 | 2025-12-22 |
Recent advances of engineered probiotics for therapeutic applications
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100039
PMID:41415685
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综述 | 本文综述了工程化益生菌在癌症、胃肠道疾病、传染病和代谢性疾病等人类疾病治疗中的最新应用进展 | 利用合成生物学技术开发工程化益生菌作为诊断工具和疾病治疗方法，强调其在多因素疾病治疗中的创新应用 | NA | 总结工程化益生菌在人类疾病治疗领域的最新研究进展，并探讨其发展挑战与机遇 | 工程化益生菌及其在人类疾病治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症、胃肠道疾病、传染病、代谢性疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 益生菌 | NA | 医学 |
| 10 | 2025-12-22 |
Enzyme promiscuity in the field of synthetic biology applied to white biotechnology: Opportunities and weaknesses
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100026
PMID:41415683
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综述 | 本文探讨了酶的多功能性在合成生物学应用于白色生物技术中的机遇与弱点 | 强调了酶多功能性作为地下代谢的来源，在构建高效生产路径中的优势，同时指出其可能导致产量损失和代谢干扰的挑战 | 未提供具体实验数据或案例研究，主要基于理论分析和展望 | 改善微生物细胞工厂在生物生产中的性能，通过理解酶多功能性来优化工程策略 | 微生物代谢网络和酶的多功能性 | 合成生物学 | NA | 系统生物学和合成生物学工具 | 机器学习 | 遗传、代谢、酶学和发酵过程数据 | NA | NA | 微生物 | 代谢网络工程 | 工业生物技术 |
| 11 | 2025-12-19 |
Precision in Predicting Protein-Nucleic Acid Complexes: Establishing a Benchmark Data Set and Comparative Metrics
2025-Sep-22, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c01372
PMID:40932245
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研究论文 | 本研究建立了蛋白质-核酸复合物结构预测的基准数据集ProNASet，并系统评估了多种深度学习和物理驱动对接方法的性能 | 首次创建了包含100个实验解析结构的蛋白质-核酸复合物基准数据集，并建立了多维评估框架 | 基准数据集规模有限（100个结构），且当前深度学习方法在该任务上表现显著落后 | 评估和比较蛋白质-核酸复合物结构预测的计算方法 | 蛋白质-核酸复合物结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习算法、分子对接方法 | AlphaFold3, Chai-1, HelixFold3, Protenix | 蛋白质-核酸复合物三维结构数据 | 100个实验解析的蛋白质-核酸复合物结构 | NA | NA | NA | 基因组编辑、合成生物学 |
| 12 | 2025-12-19 |
Guns 'N Roses: Fungal Volatile Warfare in Postharvest Disease Control
2025-09, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
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综述 | 本文综述了真菌挥发性有机化合物在采后病害控制中的应用，包括其化学多样性、作用机制以及作为生物熏蒸剂的潜力 | 聚焦于真菌挥发性有机化合物在生物防治中的关键作用，并探讨了通过定向诱变、合成生物学和人工智能提升其效率的未来研究方向 | 作为一篇综述，未涉及原始实验数据，且具体应用案例和效果可能因物种和环境条件而异 | 探索真菌挥发性有机化合物作为环保替代品，用于控制采后病害和食品腐败微生物 | 真菌挥发性有机化合物、微生物生物防治剂、病原真菌以及处理后的农产品 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 食品 |
| 13 | 2025-12-09 |
Streptomyces as a versatile host platform for heterologous production of microbial natural products
2025-Sep-09, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00036j
PMID:40923873
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综述 | 本文全面分析了2004年至2024年间超过450项关于在链霉菌宿主中异源表达生物合成基因簇的研究，探讨了其在天然产物发现和合成生物学中的应用 | 首次从数据驱动角度提供了该领域二十年来的定量趋势分析，包括BGC类型、供体物种和宿主菌株偏好，并整合了合成生物学工具和基因组工程进展 | NA | 评估链霉菌作为异源表达平台在微生物天然产物生物合成中的潜力和应用 | 链霉菌宿主和来自不同微生物来源的生物合成基因簇 | 合成生物学 | NA | 异源表达、基因组工程、合成生物学工具 | NA | 文本（文献综述） | 超过450项同行评审研究 | CRISPR-Cas9, 基因组工程 | 链霉菌 | 生物合成基因簇的异源表达、组合生物合成 | 药物发现、工业生物技术 |
| 14 | 2025-11-15 |
Systematic discovery and engineering of synthetic immune receptors in plants
2025-Sep-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx2508
PMID:40906849
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研究论文 | 通过生物信息学和合成生物学方法系统发现并工程化植物中的合成免疫受体SCORE，使其能够感知多种病原体冷休克蛋白肽 | 首次在285种植物中系统表征LRR-RLK-XII受体家族，发现并工程化能够识别多种病原体CSP肽的SCORE受体变体 | 研究主要聚焦于LRR-RLK-XII受体家族，可能未涵盖其他类型的植物免疫受体 | 探索植物免疫受体的多样性并开发工程化免疫受体的策略 | 285种植物中的LRR-RLK-XII受体家族，特别是SCORE受体及其变体 | 合成生物学 | 植物病害 | 生物信息学分析，蛋白质结构预测，合成生物学工程 | NA | 基因组数据，蛋白质序列，结构预测数据 | 285种植物物种 | 合成生物学方法 | 植物，特别是多年生作物 | 工程化免疫受体，能够检测多种植物病原体CSP肽 | 农业 |
| 15 | 2025-11-07 |
Next-generation oncology: integrative therapeutic frontiers at the crossroads of precision genomics, immuno-engineering, and tumor microenvironment modulation
2025-Sep-20, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03042-3
PMID:40974488
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综述 | 探讨肿瘤学从传统细胞毒性疗法向整合精准基因组学、免疫工程和肿瘤微环境调制的智能驱动框架转变 | 提出将癌症视为复杂适应系统，整合AI引导的适应性给药、合成生物学增强的CAR-T细胞和代谢重编程等协同治疗方法 | 存在治疗耐药性、毒性、可及性和伦理问题等挑战 | 推动肿瘤治疗向整合性、系统性和精准化方向发展 | 癌症作为复杂适应系统的多维度治疗策略 | 数字病理 | 肿瘤 | 多组学分析、分子图谱、量子生物学、合成肿瘤学、暗基因组挖掘 | 数字孪生 | 基因组数据、微环境数据 | NA | 合成生物学 | CAR-T细胞 | 逻辑门控CAR-T细胞 | 医学 |
| 16 | 2025-11-06 |
Regulatory roles of RNA modifications in plant development and fruit ripening
2025-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-025-00240-5
PMID:40994446
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综述 | 本文综述了RNA修饰在植物发育和果实成熟中的调控作用，重点关注m6A介导的调控网络 | 提出了结合CRISPR编辑、单细胞空间表观转录组学和合成生物学方法的创新路线图，用于精准农业应用 | 对RNA修饰的分子机制理解仍有限，特别是m6A以外的其他修饰类型 | 解析植物表观转录组的调控机制并开发精准农业应用 | 植物RNA修饰网络及其在发育和果实成熟中的功能 | 植物分子生物学 | NA | 表观转录组测序，CRISPR，单细胞空间表观转录组学 | NA | 表观转录组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物系统 | RNA修饰依赖的翻译控制系统，RNA表观遗传编辑工具 | 农业 |
| 17 | 2025-10-30 |
Evaluating the Potential of Co-supplementation of Zinc and Ferrous Iron Ion for Itaconic Acid Fermentation of Aspergillus terreus
2025-Sep, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05317-x
PMID:40591109
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研究论文 | 评估锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的影响 | 首次系统评估锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的协同促进作用，并通过转录组测序揭示其分子机制 | 仅使用纯葡萄糖和木糖作为碳源，未验证其他碳源或实际工业原料的效果 | 探究锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的促进效果及机制 | 土曲霉(Aspergillus terreus)及其衣康酸发酵过程 | 工业生物技术 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据、发酵性能数据 | NA | 合成生物学工具 | 土曲霉(Aspergillus terreus) | 衣康酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 18 | 2025-10-26 |
Survival by Design: The BWC's Autopoietic Response at Fifty to a Disaggregated Biosecurity Ecosystem
2025 Sep-Oct, Health security
IF:2.1Q3
DOI:10.1177/23265094251381803
PMID:41043961
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评论 | 本文分析《禁止生物武器公约》在日益复杂的全球生物安全生态系统中保持韧性的适应策略 | 将BWC概念化为自创生子系统，提出通过科学技术机制作为结构耦合装置来应对新兴生物技术挑战 | NA | 探讨BWC在生物技术快速发展背景下的适应性和有效性 | 《禁止生物武器公约》及其制度框架 | NA | NA | 合成生物学、生物信息学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2025-10-24 |
A functional and applied perspective of Vitreoscilla hemoglobin: from oxygen carriage to biotechnological innovation
2025-Sep-04, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03635-y
PMID:40908439
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综述 | 本文从功能和应用角度全面综述了透明颤菌血红蛋白的分子特性及其在生物技术领域的创新应用 | 整合了VHb转录因子相互作用、氧化还原偶联电子传递和定点诱变揭示的结构-功能关系等最新机制见解，并系统总结了vgb启动子作为强调控元件的新兴应用 | NA | 系统梳理透明颤菌血红蛋白的研究进展并展望其未来发展方向 | 透明颤菌血红蛋白(VHb)及其相关生物技术应用 | 合成生物学 | NA | 定点诱变、CRISPR调控表达平台、高细胞密度发酵 | NA | NA | NA | CRISPR | 哺乳动物系统、微生物 | 基于VHb的模块化组件 | 环境修复、精准农业、工业生物技术 |
| 20 | 2025-10-24 |
Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology
2025-Sep, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019
PMID:39551128
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综述 | 本文全面综述了甘草属植物的物种分类、药理活性、活性成分生物合成途径及合成生物学研究进展 | 整合多学科知识为甘草属研究提供独特而全面的视角，系统梳理活性成分生物合成途径与代谢工程策略 | NA | 为甘草分子育种和合成生物学领域的研究开发提供资源基础和理论支撑 | 甘草属植物及其活性成分（三萜类、黄酮类和多糖） | NA | NA | 多组学研究、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径 | 医药 |