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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-26 |
Survival by Design: The BWC's Autopoietic Response at Fifty to a Disaggregated Biosecurity Ecosystem
2025 Sep-Oct, Health security
IF:2.1Q3
DOI:10.1177/23265094251381803
PMID:41043961
|
评论 | 本文分析《禁止生物武器公约》在日益复杂的全球生物安全生态系统中保持韧性的适应策略 | 将BWC概念化为自创生子系统,提出通过科学技术机制作为结构耦合装置来应对新兴生物技术挑战 | NA | 探讨BWC在生物技术快速发展背景下的适应性和有效性 | 《禁止生物武器公约》及其制度框架 | NA | NA | 合成生物学、生物信息学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2 | 2025-10-24 |
A functional and applied perspective of Vitreoscilla hemoglobin: from oxygen carriage to biotechnological innovation
2025-Sep-04, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03635-y
PMID:40908439
|
综述 | 本文从功能和应用角度全面综述了透明颤菌血红蛋白的分子特性及其在生物技术领域的创新应用 | 整合了VHb转录因子相互作用、氧化还原偶联电子传递和定点诱变揭示的结构-功能关系等最新机制见解,并系统总结了vgb启动子作为强调控元件的新兴应用 | NA | 系统梳理透明颤菌血红蛋白的研究进展并展望其未来发展方向 | 透明颤菌血红蛋白(VHb)及其相关生物技术应用 | 合成生物学 | NA | 定点诱变、CRISPR调控表达平台、高细胞密度发酵 | NA | NA | NA | CRISPR | 哺乳动物系统、微生物 | 基于VHb的模块化组件 | 环境修复、精准农业、工业生物技术 |
| 3 | 2025-10-24 |
Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology
2025-Sep, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019
PMID:39551128
|
综述 | 本文全面综述了甘草属植物的物种分类、药理活性、活性成分生物合成途径及合成生物学研究进展 | 整合多学科知识为甘草属研究提供独特而全面的视角,系统梳理活性成分生物合成途径与代谢工程策略 | NA | 为甘草分子育种和合成生物学领域的研究开发提供资源基础和理论支撑 | 甘草属植物及其活性成分(三萜类、黄酮类和多糖) | NA | NA | 多组学研究、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径 | 医药 |
| 4 | 2025-10-21 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual, single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cell
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.17.616637
PMID:39464154
|
研究论文 | 开发了STRAIGHT-IN Dual平台,实现高效双DNA负载单拷贝整合到人诱导多能干细胞 | 首次实现同时、等位基因特异性、单拷贝整合两个DNA负载,效率达100%,且一周内完成 | NA | 开发高效基因工程平台用于干细胞精准工程 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs) | 合成生物学 | NA | 基因整合技术 | NA | 基因表达数据 | NA | STRAIGHT-IN平台 | 人诱导多能干细胞 | grazoprevir诱导型synZiFTR系统,四环素诱导系统,基因回路设计 | 医学 |
| 5 | 2025-10-20 |
Transcriptomic functional characterization of recombinant adeno-associated virus producing cell line adapted to suspension-growth
2025 Sep-Oct, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70042
PMID:40396307
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法开发了可悬浮培养的重组腺相关病毒生产细胞系,并分析了其转录组功能特征 | 首次将HEK293为基础的rAAV生产细胞系成功适应于无血清悬浮培养,并通过转录组分析揭示了不同培养条件下细胞对病毒生产的响应差异 | 悬浮培养的细胞系病毒滴度显著降低,即使优化后生产力也只能恢复到贴壁培养的25%-50% | 开发可规模化生产的重组腺相关病毒生产系统 | 重组腺相关病毒生产细胞系GX6B及其悬浮适应株GX6Bs | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | HEK293衍生细胞系 | 合成生物学方法 | HEK293细胞 | 整合了AAV和腺病毒辅助组件编码基因的合成基因回路 | 医学 |
| 6 | 2025-10-15 |
A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor
2025-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.03.663076
PMID:40631274
|
研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强细菌孤儿受体蛋白稳定性的流程 | 首次将微流控调制光谱和饱和转移差NMR结合用于研究PAS结构域蛋白-配体相互作用 | 仅使用了约760种化合物的片段库,可能遗漏其他潜在配体 | 寻找细菌孤儿受体CU228的新型配体并研究其稳定机制 | CU228蛋白(一种推测的PAS-HTH转录因子) | 合成生物学 | NA | 差异扫描荧光法、微流控调制光谱、饱和转移差NMR | NA | 生物物理数据、光谱数据 | 约760种化合物片段库 | NA | 细菌 | NA | 生物技术 |
| 7 | 2025-10-15 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2025-Sep, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01831-x
PMID:39814991
|
研究论文 | 开发基于人类蛋白酶调控细胞因子分泌的合成生物学平台hDIRECT | 首次使用完全人源化蛋白质构建正交性细胞因子调控系统,避免免疫原性风险 | 仅提供概念验证,尚未进行临床前或临床试验 | 开发用于细胞疗法的人源化合成生物学调控系统 | 人类细胞因子(IL-2、IL-6、IL-10)和人源蛋白酶 | 合成生物学 | 癌症,肌肉再生疾病 | 蛋白质工程,蛋白酶调控技术 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | 人类细胞 | 基于蛋白酶切割的细胞因子活性调控回路,包含激活和失活机制 | 医学 |
| 8 | 2025-10-14 |
Engineering Spatial Control of Bacterial Organelles
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.22.677801
PMID:41040230
|
研究论文 | 本研究开发了一种可编程控制细菌细胞器空间定位的双蛋白系统 | 首次实现了对多种细菌细胞器类型的可编程空间控制,建立了合成生物学中反应位置可控的新设计原则 | NA | 探索细菌细胞器的空间组织机制并开发工程化控制方法 | 细菌细胞器(包括羧酶体、包裹蛋白、生物分子凝聚体和膜结合细胞器) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、细胞器异源表达 | NA | NA | NA | McdAB双蛋白系统 | 大肠杆菌 | 细胞器空间定位控制系统 | 工业生物技术 |
| 9 | 2025-10-14 |
Unexplored regions of the protein sequence-structure map revealed at scale by a library of foldtuned language models
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573145
PMID:38187750
|
研究论文 | 本研究通过开发foldtuned蛋白质语言模型库,大规模探索了蛋白质序列-结构映射中未开发的区域 | 提出foldtuning方法,将蛋白质语言模型重新设计为能够探索与天然蛋白质无同源性的序列空间的探针,同时保持核心结构约束 | NA | 探索远离天然序列的蛋白质序列-结构映射景观,揭示未被地球进化触及但符合生物物理规律的蛋白质折叠空间 | 700多种天然折叠结构,包括GPCRs、小GTPases、细胞表面受体、DNA结合域和信号调节域 | 计算生物学 | NA | 蛋白质语言模型(PLMs)、foldtuning方法 | 语言模型 | 蛋白质序列和结构数据 | SCOP数据库中700多种天然折叠 | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 10 | 2025-10-10 |
Systematic Optimization Enables Near-Perfect In Vitro Transformation Efficiencies for Spirodela polyrhiza (Greater Duckweed)
2025-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.10.675371
PMID:41000642
|
研究论文 | 本研究系统优化了浮萍(大浮萍)的体外转化方案,实现了接近完美的转化效率 | 开发了从起始到完成的完整体外转化流程,在愈伤组织诱导、遗传转化和植物再生各阶段均达到90%-100%的高效率 | NA | 优化浮萍的体外遗传转化方法,克服转化过程中的技术瓶颈 | 浮萍(大浮萍) | NA | NA | 体外遗传转化 | NA | NA | NA | NA | 浮萍(大浮萍) | NA | 农业, 生物技术 |
| 11 | 2025-10-06 |
Gene expression and protein abundance: Just how associated are these molecular traits?
2025-Sep-30, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108720
PMID:41038299
|
综述 | 回顾和分类研究基因表达与蛋白质丰度关系的文献,探讨其在生物技术应用中的潜力 | 系统比较不同实验环境和细胞背景下基因表达与蛋白质丰度的相关性,整合单细胞分析最新进展和蛋白质约束代谢模型 | NA | 探讨基因表达与蛋白质丰度的关联性及其在代谢工程和合成生物学中的应用潜力 | 基因表达与蛋白质丰度的相关性研究 | 生物信息学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、单细胞分析 | 统计模型、机制模型、机器学习、深度学习 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 12 | 2025-10-06 |
Metabolic engineering of microorganisms for tailor-made biopolymer production: A review
2025-Sep-30, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147922
PMID:41038478
|
综述 | 本文综述了通过微生物代谢工程生产定制生物聚合物的最新进展 | 系统比较天然与工程化微生物平台的优缺点,强调代谢工程在开发下一代生物聚合物中的关键作用 | NA | 改善生物聚合物的产量、质量和功能,支持工业创新和全球可持续发展目标 | 微生物生产的生物聚合物(如细菌纤维素、透明质酸、聚羟基脂肪酸酯、聚-γ-谷氨酸) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、系统生物学工具(蛋白质组学、基因组学、合成生物学) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 食品, 医疗, 工业生物技术 |
| 13 | 2025-10-06 |
Development of an intron-optimized dual base editor enables enhanced echinocandin B tolerance and regulatory circuit optimization in Aspergillus nidulans
2025-Sep-26, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147955
PMID:41016690
|
研究论文 | 开发内含子优化的双碱基编辑器,用于增强构巢曲霉中棘白菌素B耐受性和调控回路优化 | 采用真菌内含子策略阻断大肠杆菌中脱氨酶-nCas9融合蛋白泄露表达,开发了PAM-less SpRY-CABE系统实现高效双碱基编辑 | 未明确说明系统在其他丝状真菌中的普适性 | 解决棘白菌素B生产中的调控机制认知不足和产物抑制问题 | 构巢曲霉及其棘白菌素B生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 双碱基编辑(C-to-T和A-to-G)、启动子诱变、原位进化 | NA | 基因序列、表达数据、代谢产物 | NA | CRISPR-Cas9, 双碱基编辑器 | 构巢曲霉, 大肠杆菌 | AniJ转录调控回路优化, β-1,3-葡聚糖合成酶(FKS1)进化 | 工业生物技术, 医药 |
| 14 | 2025-10-05 |
Synthetic Whole-Cell Bioelectronic Chemical Sensing with In Situ Genetic Computing
2025-Sep-25, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00015
PMID:41031321
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建了结合全细胞细菌生物传感器与电化学传感技术的生物电子化学传感器 | 将全细胞生物传感器的多功能性与电化学传感灵敏度相结合,开发了具有遗传计算能力的模块化生物电子传感器 | NA | 开发可编程的模块化生物电子传感器用于化学检测 | 汞污染物检测、双输入逻辑计算、多通道电化学信号输出 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、电化学传感 | NA | 电化学信号 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 细菌 | T7 RNAP信号放大器、布尔逻辑计算模块、双通道电化学输出系统 | 环境监测 |
| 15 | 2025-10-05 |
Secure biosystems design in Saccharomyces cerevisiae establishes effective biocontainment strategies and mechanisms of escape
2025-Sep-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00741-25
PMID:40801494
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研究论文 | 本研究在酿酒酵母中开发了高分辨率分析平台,评估杀开关系统的生物防护效果及逃逸机制 | 建立了首个在实验室和工业酵母菌株中系统评估杀开关逃逸机制的高分辨率分析平台,揭示了多种逃逸途径 | 多拷贝整合杀开关系统虽能显著减少逃逸但仍无法建立持续生物防护 | 开发有效的生物防护策略并理解其逃逸机制 | 酿酒酵母实验室和工业菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR介导的整合、基因组重测序 | NA | 基因组测序数据、表型数据 | 实验室和工业酵母菌株 | CRISPR | 酿酒酵母 | 樟脑调控的RelE毒素杀开关系统 | 工业生物技术 |
| 16 | 2025-10-05 |
Turbocharging fundamental science translation through controlled environment agriculture
2025-Sep-30, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.014
PMID:41033905
|
综述 | 本文探讨了受控环境农业如何加速植物科学成果向农业应用的转化 | 提出将受控环境农业作为多功能研究平台和高产生产系统,整合新兴育种、基因组和合成生物学工具 | NA | 通过受控环境农业加速植物科学基础研究成果向农业应用的转化 | 作物设计和农业生产系统 | 农业生物技术 | NA | 育种技术、基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 17 | 2025-10-05 |
Beyond Purification: Evolving Roles of Fusion Tags in Biotechnology
2025-Sep-17, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090768
PMID:41020890
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综述 | 本文总结了融合标签在生物技术中的多样化应用及其发展历程 | 系统阐述了融合标签从传统纯化功能向实时成像、空间定位、靶向递送和蛋白质活性调控等新型多功能工具的演变 | 未完全涵盖所有相关研究内容 | 帮助研究人员针对特定目标设计合适的标签格式 | 蛋白质标签和肽标签及其去除方法 | 生物技术 | NA | 基因融合技术、下拉实验、免疫沉淀 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、治疗设计 |
| 18 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Terpenoid Biosynthesis in Medicinal Plants: From Genomic Insights to Biotechnological Applications
2025-Sep-05, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090723
PMID:41020846
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综述 | 本文综述了药用植物中萜类化合物生物合成的代谢工程策略及其生物技术应用 | 提出'从基因组见解到生物技术应用'的研究范式,整合多组学技术和CRISPR工具实现萜类化合物产量的显著提升 | 面临代谢通量平衡、细胞毒性和规模化经济性等持续挑战 | 加速萜类化合物生物制造从发现到商业化应用的转化 | 萜类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、代谢组学、CRISPR | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 药用植物、微生物系统、异源植物宿主 | 萜类化合物生物合成代谢途径 | 医药、工业生物技术 |
| 19 | 2025-10-05 |
Engineering Artificial Mitochondria with Self-Amplifying Proton Generation for Autonomous Energy Supply and Metabolic Coupling in Artificial Cells
2025-Sep-30, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202514980
PMID:41030094
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研究论文 | 本研究开发了一种模拟线粒体功能的人工ATP纳米发电机,通过酶共区室化实现自主能量供应 | 设计了具有自增强质子生成功能的人工线粒体,实现了跨膜质子梯度的稳健建立和高效ATP生产 | NA | 为人工细胞构建连续自主的能量供应系统 | 人工线粒体、人工细胞模型 | 合成生物学 | NA | 酶共区室化、脂质体包覆 | NA | NA | NA | Gibson Assembly | NA | 自增强酶级联反应系统、质子梯度驱动的ATP合成系统 | 合成生物学, 生物能源 |
| 20 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-driven biosensors for healthcare applications: A roadmap toward programmable and intelligent diagnostics
2025-Sep-26, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118036
PMID:41027168
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综述 | 探讨合成生物学驱动的生物传感器在医疗健康等领域的创新应用与发展路线 | 整合合成基因电路、CRISPR控制系统和逻辑门架构实现可编程诊断 | 存在电路稳定性、生物安全性和大规模部署的挑战 | 开发智能响应型生物传感器以满足精准诊断需求 | 合成生物传感器及其在医疗环境监测中的应用 | 合成生物学 | 癌症、代谢失衡、传染病 | CRISPR技术、RNA调控、逻辑门设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | 微生物平台 | 合成基因电路、逻辑门架构、生物传感器、治疗诊断系统 | 医疗健康,环境监测 |