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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-21 |
STRAIGHT-IN Dual: a platform for dual, single-copy integrations of DNA payloads and gene circuits into human induced pluripotent stem cell
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.17.616637
PMID:39464154
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研究论文 | 开发了STRAIGHT-IN Dual平台,实现高效双DNA负载单拷贝整合到人诱导多能干细胞 | 首次实现同时、等位基因特异性、单拷贝整合两个DNA负载,效率达100%,且一周内完成 | NA | 开发高效基因工程平台用于干细胞精准工程 | 人诱导多能干细胞(hiPSCs) | 合成生物学 | NA | 基因整合技术 | NA | 基因表达数据 | NA | STRAIGHT-IN平台 | 人诱导多能干细胞 | grazoprevir诱导型synZiFTR系统,四环素诱导系统,基因回路设计 | 医学 |
| 22 | 2025-10-20 |
Transcriptomic functional characterization of recombinant adeno-associated virus producing cell line adapted to suspension-growth
2025 Sep-Oct, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70042
PMID:40396307
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法开发了可悬浮培养的重组腺相关病毒生产细胞系,并分析了其转录组功能特征 | 首次将HEK293为基础的rAAV生产细胞系成功适应于无血清悬浮培养,并通过转录组分析揭示了不同培养条件下细胞对病毒生产的响应差异 | 悬浮培养的细胞系病毒滴度显著降低,即使优化后生产力也只能恢复到贴壁培养的25%-50% | 开发可规模化生产的重组腺相关病毒生产系统 | 重组腺相关病毒生产细胞系GX6B及其悬浮适应株GX6Bs | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | HEK293衍生细胞系 | 合成生物学方法 | HEK293细胞 | 整合了AAV和腺病毒辅助组件编码基因的合成基因回路 | 医学 |
| 23 | 2025-10-15 |
A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor
2025-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.03.663076
PMID:40631274
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研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强细菌孤儿受体蛋白稳定性的流程 | 首次将微流控调制光谱和饱和转移差NMR结合用于研究PAS结构域蛋白-配体相互作用 | 仅使用了约760种化合物的片段库,可能遗漏其他潜在配体 | 寻找细菌孤儿受体CU228的新型配体并研究其稳定机制 | CU228蛋白(一种推测的PAS-HTH转录因子) | 合成生物学 | NA | 差异扫描荧光法、微流控调制光谱、饱和转移差NMR | NA | 生物物理数据、光谱数据 | 约760种化合物片段库 | NA | 细菌 | NA | 生物技术 |
| 24 | 2025-10-15 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2025-Sep, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01831-x
PMID:39814991
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研究论文 | 开发基于人类蛋白酶调控细胞因子分泌的合成生物学平台hDIRECT | 首次使用完全人源化蛋白质构建正交性细胞因子调控系统,避免免疫原性风险 | 仅提供概念验证,尚未进行临床前或临床试验 | 开发用于细胞疗法的人源化合成生物学调控系统 | 人类细胞因子(IL-2、IL-6、IL-10)和人源蛋白酶 | 合成生物学 | 癌症,肌肉再生疾病 | 蛋白质工程,蛋白酶调控技术 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | 人类细胞 | 基于蛋白酶切割的细胞因子活性调控回路,包含激活和失活机制 | 医学 |
| 25 | 2025-10-14 |
Engineering Spatial Control of Bacterial Organelles
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.22.677801
PMID:41040230
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研究论文 | 本研究开发了一种可编程控制细菌细胞器空间定位的双蛋白系统 | 首次实现了对多种细菌细胞器类型的可编程空间控制,建立了合成生物学中反应位置可控的新设计原则 | NA | 探索细菌细胞器的空间组织机制并开发工程化控制方法 | 细菌细胞器(包括羧酶体、包裹蛋白、生物分子凝聚体和膜结合细胞器) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、细胞器异源表达 | NA | NA | NA | McdAB双蛋白系统 | 大肠杆菌 | 细胞器空间定位控制系统 | 工业生物技术 |
| 26 | 2025-10-14 |
Unexplored regions of the protein sequence-structure map revealed at scale by a library of foldtuned language models
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573145
PMID:38187750
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研究论文 | 本研究通过开发foldtuned蛋白质语言模型库,大规模探索了蛋白质序列-结构映射中未开发的区域 | 提出foldtuning方法,将蛋白质语言模型重新设计为能够探索与天然蛋白质无同源性的序列空间的探针,同时保持核心结构约束 | NA | 探索远离天然序列的蛋白质序列-结构映射景观,揭示未被地球进化触及但符合生物物理规律的蛋白质折叠空间 | 700多种天然折叠结构,包括GPCRs、小GTPases、细胞表面受体、DNA结合域和信号调节域 | 计算生物学 | NA | 蛋白质语言模型(PLMs)、foldtuning方法 | 语言模型 | 蛋白质序列和结构数据 | SCOP数据库中700多种天然折叠 | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 27 | 2025-10-10 |
Systematic Optimization Enables Near-Perfect In Vitro Transformation Efficiencies for Spirodela polyrhiza (Greater Duckweed)
2025-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.10.675371
PMID:41000642
|
研究论文 | 本研究系统优化了浮萍(大浮萍)的体外转化方案,实现了接近完美的转化效率 | 开发了从起始到完成的完整体外转化流程,在愈伤组织诱导、遗传转化和植物再生各阶段均达到90%-100%的高效率 | NA | 优化浮萍的体外遗传转化方法,克服转化过程中的技术瓶颈 | 浮萍(大浮萍) | NA | NA | 体外遗传转化 | NA | NA | NA | NA | 浮萍(大浮萍) | NA | 农业, 生物技术 |
| 28 | 2025-10-05 |
Synthetic Whole-Cell Bioelectronic Chemical Sensing with In Situ Genetic Computing
2025-Sep-25, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00015
PMID:41031321
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建了结合全细胞细菌生物传感器与电化学传感技术的生物电子化学传感器 | 将全细胞生物传感器的多功能性与电化学传感灵敏度相结合,开发了具有遗传计算能力的模块化生物电子传感器 | NA | 开发可编程的模块化生物电子传感器用于化学检测 | 汞污染物检测、双输入逻辑计算、多通道电化学信号输出 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、电化学传感 | NA | 电化学信号 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 细菌 | T7 RNAP信号放大器、布尔逻辑计算模块、双通道电化学输出系统 | 环境监测 |
| 29 | 2025-10-05 |
Secure biosystems design in Saccharomyces cerevisiae establishes effective biocontainment strategies and mechanisms of escape
2025-Sep-17, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.00741-25
PMID:40801494
|
研究论文 | 本研究在酿酒酵母中开发了高分辨率分析平台,评估杀开关系统的生物防护效果及逃逸机制 | 建立了首个在实验室和工业酵母菌株中系统评估杀开关逃逸机制的高分辨率分析平台,揭示了多种逃逸途径 | 多拷贝整合杀开关系统虽能显著减少逃逸但仍无法建立持续生物防护 | 开发有效的生物防护策略并理解其逃逸机制 | 酿酒酵母实验室和工业菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR介导的整合、基因组重测序 | NA | 基因组测序数据、表型数据 | 实验室和工业酵母菌株 | CRISPR | 酿酒酵母 | 樟脑调控的RelE毒素杀开关系统 | 工业生物技术 |
| 30 | 2025-10-05 |
Turbocharging fundamental science translation through controlled environment agriculture
2025-Sep-30, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.014
PMID:41033905
|
综述 | 本文探讨了受控环境农业如何加速植物科学成果向农业应用的转化 | 提出将受控环境农业作为多功能研究平台和高产生产系统,整合新兴育种、基因组和合成生物学工具 | NA | 通过受控环境农业加速植物科学基础研究成果向农业应用的转化 | 作物设计和农业生产系统 | 农业生物技术 | NA | 育种技术、基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 31 | 2025-10-05 |
Beyond Purification: Evolving Roles of Fusion Tags in Biotechnology
2025-Sep-17, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090768
PMID:41020890
|
综述 | 本文总结了融合标签在生物技术中的多样化应用及其发展历程 | 系统阐述了融合标签从传统纯化功能向实时成像、空间定位、靶向递送和蛋白质活性调控等新型多功能工具的演变 | 未完全涵盖所有相关研究内容 | 帮助研究人员针对特定目标设计合适的标签格式 | 蛋白质标签和肽标签及其去除方法 | 生物技术 | NA | 基因融合技术、下拉实验、免疫沉淀 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、治疗设计 |
| 32 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Terpenoid Biosynthesis in Medicinal Plants: From Genomic Insights to Biotechnological Applications
2025-Sep-05, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090723
PMID:41020846
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综述 | 本文综述了药用植物中萜类化合物生物合成的代谢工程策略及其生物技术应用 | 提出'从基因组见解到生物技术应用'的研究范式,整合多组学技术和CRISPR工具实现萜类化合物产量的显著提升 | 面临代谢通量平衡、细胞毒性和规模化经济性等持续挑战 | 加速萜类化合物生物制造从发现到商业化应用的转化 | 萜类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、代谢组学、CRISPR | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 药用植物、微生物系统、异源植物宿主 | 萜类化合物生物合成代谢途径 | 医药、工业生物技术 |
| 33 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-driven biosensors for healthcare applications: A roadmap toward programmable and intelligent diagnostics
2025-Sep-26, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.118036
PMID:41027168
|
综述 | 探讨合成生物学驱动的生物传感器在医疗健康等领域的创新应用与发展路线 | 整合合成基因电路、CRISPR控制系统和逻辑门架构实现可编程诊断 | 存在电路稳定性、生物安全性和大规模部署的挑战 | 开发智能响应型生物传感器以满足精准诊断需求 | 合成生物传感器及其在医疗环境监测中的应用 | 合成生物学 | 癌症、代谢失衡、传染病 | CRISPR技术、RNA调控、逻辑门设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas系统 | 微生物平台 | 合成基因电路、逻辑门架构、生物传感器、治疗诊断系统 | 医疗健康,环境监测 |
| 34 | 2025-10-05 |
Molecular Paleontology Meets Drug Discovery: The Case for De-extinct Antimicrobials
2025-Sep-23, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05530
PMID:41018632
|
综述 | 探讨从灭绝生物中重建抗菌分子的新兴领域及其在药物开发中的应用 | 将古基因组学、古蛋白质组学与合成生物学相结合,从灭绝生物中重建抗菌分子 | 面临技术挑战和伦理考量 | 开发新型抗菌剂以应对抗生素耐药性问题 | 从灭绝生物中重建的生物活性肽、抗生素和其他生物活性剂 | 合成生物学 | 抗生素耐药性感染 | 高通量DNA测序, 质谱分析, 计算生物学, 古基因组学, 古蛋白质组学 | NA | 遗传序列, 蛋白质序列 | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术 |
| 35 | 2025-10-05 |
Synthetic antimicrobial peptides: Combatting antimicrobial resistance for sustainable aquaculture
2025-Sep-16, Microbial pathogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.micpath.2025.108029
PMID:40967516
|
综述 | 本文综述了合成抗菌肽在水产养殖中作为抗生素替代品的设计策略、计算工具应用及环境意义 | 整合合成生物学与计算建模方法设计具有增强稳定性、靶向抗菌活性的合成抗菌肽 | NA | 开发可持续水产养殖疾病控制的抗生素替代方案 | 合成抗菌肽及其设计策略 | 计算生物学 | 水产养殖疾病 | 机器学习、计算建模 | 机器学习 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 水产养殖, 环境 |
| 36 | 2025-10-05 |
Advances in Genetic Transformation of Lactic Acid Bacteria: Overcoming Barriers and Enhancing Plasmid Tools
2025-Sep-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26189146
PMID:41009708
|
综述 | 综述乳酸菌遗传转化方法的最新进展及其在食品和益生菌生物技术中的应用 | 系统整合多种DNA导入方法,强调食品级策略和无标记工程技术的最新突破 | 存在菌株间变异性和宿主特异性障碍,仍需定制化解决方案 | 克服乳酸菌遗传转化障碍并增强质粒工具开发 | 乳酸菌(LAB) | 合成生物学 | NA | 自然感受态、电穿孔、接合、噬菌体介导转导、基因枪 | NA | NA | NA | 基因组编辑平台 | 乳酸菌 | 表达载体系统、染色体编辑、风味质地通路、食品级性状 | 食品, 工业生物技术 |
| 37 | 2025-10-05 |
Smart Phages: Leveraging Artificial Intelligence to Tackle Prosthetic Joint Infections
2025-Sep-19, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14090949
PMID:41009927
|
综述 | 本文探讨如何利用人工智能和机器学习技术优化噬菌体疗法以应对假体关节感染 | 首次系统提出将人工智能与机器学习工具应用于噬菌体疗法开发,通过提升可扩展性、效率和精准度来克服传统疗法的局限性 | 未提供具体的实验验证数据,主要停留在概念探讨和应用前景分析层面 | 探索人工智能技术在噬菌体疗法研究和临床应用中的潜在价值 | 噬菌体疗法及其在假体关节感染治疗中的应用 | 机器学习 | 假体关节感染 | 基因组学、合成生物学 | 机器学习、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 38 | 2025-10-05 |
Protein and Peptide in Cancer Research: From Biomarker to Biotherapeutics
2025-Sep-17, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17183031
PMID:41008874
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综述 | 全面概述基于蛋白质和肽的癌症诊断与治疗策略的最新研究进展和技术发展 | 系统整合了蛋白质和肽在癌症诊疗中的多重应用,涵盖诊断标志物、治疗策略及新兴技术解决方案 | 肽类存在稳定性差、易被酶降解和递送效率低等局限性 | 探讨蛋白质和肽在精准癌症诊断与个性化治疗中的应用潜力 | 蛋白质、肽及其在癌症诊疗中的生物标志物和治疗剂 | 生物医学 | 癌症 | ELISA、质谱分析、CyTOF、合成生物学、计算设计、组学整合分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 39 | 2025-10-05 |
The Role of AI-Driven De Novo Protein Design in the Exploration of the Protein Functional Universe
2025-Sep-15, Biology
DOI:10.3390/biology14091268
PMID:41007412
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综述 | 本文系统综述了人工智能驱动的从头蛋白质设计在探索蛋白质功能宇宙中的作用、方法和应用 | 通过三种互补途径突破自然进化限制:探索新型折叠拓扑、从头设计功能位点、探索序列-结构-功能关系图谱 | 存在持续的技术挑战和限制 | 探索蛋白质功能宇宙并开发定制化生物分子 | 蛋白质序列、结构和功能 | 计算生物学 | NA | AI驱动的计算设计方法 | 先进计算框架 | 蛋白质序列和结构数据 | NA | NA | NA | NA | 治疗、催化、合成生物学 |
| 40 | 2025-10-05 |
Engineering Antioxidants with Pharmacological Applications: Biotechnological Perspectives
2025-Sep-12, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox14091110
PMID:41009014
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综述 | 本文综述了通过生物技术方法生产抗氧化剂的最新进展及其在疾病治疗中的应用潜力 | 系统探讨了利用微生物细胞工厂、酶催化合成、植物细胞培养和代谢工程等生物技术方法生产抗氧化剂的创新策略 | NA | 探索生物技术在抗氧化剂生产中的潜力及其在疾病防治中的应用 | 生物技术生产的抗氧化剂,包括酶类和非酶类抗氧化分子 | 生物技术 | 恶性肿瘤、心血管疾病、神经退行性疾病、衰老相关疾病 | 微生物发酵、酶催化合成、植物细胞培养、代谢工程、生物勘探、合成生物学 | NA | 临床前和临床研究数据 | NA | NA | 微生物细胞、植物细胞 | 代谢通路工程 | 医药 |