合成生物学相关文章
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当前共找到 141 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-12-22 |
Recent advances of engineered probiotics for therapeutic applications
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100039
PMID:41415685
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综述 | 本文综述了工程化益生菌在癌症、胃肠道疾病、传染病和代谢性疾病等人类疾病治疗中的最新应用进展 | 利用合成生物学技术开发工程化益生菌作为诊断工具和疾病治疗方法，强调其在多因素疾病治疗中的创新应用 | NA | 总结工程化益生菌在人类疾病治疗领域的最新研究进展，并探讨其发展挑战与机遇 | 工程化益生菌及其在人类疾病治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症、胃肠道疾病、传染病、代谢性疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 益生菌 | NA | 医学 |
| 42 | 2025-12-22 |
Enzyme promiscuity in the field of synthetic biology applied to white biotechnology: Opportunities and weaknesses
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100026
PMID:41415683
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综述 | 本文探讨了酶的多功能性在合成生物学应用于白色生物技术中的机遇与弱点 | 强调了酶多功能性作为地下代谢的来源，在构建高效生产路径中的优势，同时指出其可能导致产量损失和代谢干扰的挑战 | 未提供具体实验数据或案例研究，主要基于理论分析和展望 | 改善微生物细胞工厂在生物生产中的性能，通过理解酶多功能性来优化工程策略 | 微生物代谢网络和酶的多功能性 | 合成生物学 | NA | 系统生物学和合成生物学工具 | 机器学习 | 遗传、代谢、酶学和发酵过程数据 | NA | NA | 微生物 | 代谢网络工程 | 工业生物技术 |
| 43 | 2025-12-19 |
Precision in Predicting Protein-Nucleic Acid Complexes: Establishing a Benchmark Data Set and Comparative Metrics
2025-Sep-22, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c01372
PMID:40932245
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研究论文 | 本研究建立了蛋白质-核酸复合物结构预测的基准数据集ProNASet，并系统评估了多种深度学习和物理驱动对接方法的性能 | 首次创建了包含100个实验解析结构的蛋白质-核酸复合物基准数据集，并建立了多维评估框架 | 基准数据集规模有限（100个结构），且当前深度学习方法在该任务上表现显著落后 | 评估和比较蛋白质-核酸复合物结构预测的计算方法 | 蛋白质-核酸复合物结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习算法、分子对接方法 | AlphaFold3, Chai-1, HelixFold3, Protenix | 蛋白质-核酸复合物三维结构数据 | 100个实验解析的蛋白质-核酸复合物结构 | NA | NA | NA | 基因组编辑、合成生物学 |
| 44 | 2025-12-19 |
Guns 'N Roses: Fungal Volatile Warfare in Postharvest Disease Control
2025-09, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
|
综述 | 本文综述了真菌挥发性有机化合物在采后病害控制中的应用，包括其化学多样性、作用机制以及作为生物熏蒸剂的潜力 | 聚焦于真菌挥发性有机化合物在生物防治中的关键作用，并探讨了通过定向诱变、合成生物学和人工智能提升其效率的未来研究方向 | 作为一篇综述，未涉及原始实验数据，且具体应用案例和效果可能因物种和环境条件而异 | 探索真菌挥发性有机化合物作为环保替代品，用于控制采后病害和食品腐败微生物 | 真菌挥发性有机化合物、微生物生物防治剂、病原真菌以及处理后的农产品 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 食品 |
| 45 | 2025-11-15 |
Systematic discovery and engineering of synthetic immune receptors in plants
2025-Sep-04, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.adx2508
PMID:40906849
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研究论文 | 通过生物信息学和合成生物学方法系统发现并工程化植物中的合成免疫受体SCORE，使其能够感知多种病原体冷休克蛋白肽 | 首次在285种植物中系统表征LRR-RLK-XII受体家族，发现并工程化能够识别多种病原体CSP肽的SCORE受体变体 | 研究主要聚焦于LRR-RLK-XII受体家族，可能未涵盖其他类型的植物免疫受体 | 探索植物免疫受体的多样性并开发工程化免疫受体的策略 | 285种植物中的LRR-RLK-XII受体家族，特别是SCORE受体及其变体 | 合成生物学 | 植物病害 | 生物信息学分析，蛋白质结构预测，合成生物学工程 | NA | 基因组数据，蛋白质序列，结构预测数据 | 285种植物物种 | 合成生物学方法 | 植物，特别是多年生作物 | 工程化免疫受体，能够检测多种植物病原体CSP肽 | 农业 |
| 46 | 2025-11-07 |
Next-generation oncology: integrative therapeutic frontiers at the crossroads of precision genomics, immuno-engineering, and tumor microenvironment modulation
2025-Sep-20, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03042-3
PMID:40974488
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综述 | 探讨肿瘤学从传统细胞毒性疗法向整合精准基因组学、免疫工程和肿瘤微环境调制的智能驱动框架转变 | 提出将癌症视为复杂适应系统，整合AI引导的适应性给药、合成生物学增强的CAR-T细胞和代谢重编程等协同治疗方法 | 存在治疗耐药性、毒性、可及性和伦理问题等挑战 | 推动肿瘤治疗向整合性、系统性和精准化方向发展 | 癌症作为复杂适应系统的多维度治疗策略 | 数字病理 | 肿瘤 | 多组学分析、分子图谱、量子生物学、合成肿瘤学、暗基因组挖掘 | 数字孪生 | 基因组数据、微环境数据 | NA | 合成生物学 | CAR-T细胞 | 逻辑门控CAR-T细胞 | 医学 |
| 47 | 2025-11-06 |
Regulatory roles of RNA modifications in plant development and fruit ripening
2025-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-025-00240-5
PMID:40994446
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综述 | 本文综述了RNA修饰在植物发育和果实成熟中的调控作用，重点关注m6A介导的调控网络 | 提出了结合CRISPR编辑、单细胞空间表观转录组学和合成生物学方法的创新路线图，用于精准农业应用 | 对RNA修饰的分子机制理解仍有限，特别是m6A以外的其他修饰类型 | 解析植物表观转录组的调控机制并开发精准农业应用 | 植物RNA修饰网络及其在发育和果实成熟中的功能 | 植物分子生物学 | NA | 表观转录组测序，CRISPR，单细胞空间表观转录组学 | NA | 表观转录组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物系统 | RNA修饰依赖的翻译控制系统，RNA表观遗传编辑工具 | 农业 |
| 48 | 2025-10-30 |
Evaluating the Potential of Co-supplementation of Zinc and Ferrous Iron Ion for Itaconic Acid Fermentation of Aspergillus terreus
2025-Sep, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05317-x
PMID:40591109
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研究论文 | 评估锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的影响 | 首次系统评估锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的协同促进作用，并通过转录组测序揭示其分子机制 | 仅使用纯葡萄糖和木糖作为碳源，未验证其他碳源或实际工业原料的效果 | 探究锌和亚铁离子共同补充对土曲霉衣康酸发酵的促进效果及机制 | 土曲霉(Aspergillus terreus)及其衣康酸发酵过程 | 工业生物技术 | NA | 转录组测序 | NA | 基因表达数据、发酵性能数据 | NA | 合成生物学工具 | 土曲霉(Aspergillus terreus) | 衣康酸生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 49 | 2025-10-26 |
Survival by Design: The BWC's Autopoietic Response at Fifty to a Disaggregated Biosecurity Ecosystem
2025 Sep-Oct, Health security
IF:2.1Q3
DOI:10.1177/23265094251381803
PMID:41043961
|
评论 | 本文分析《禁止生物武器公约》在日益复杂的全球生物安全生态系统中保持韧性的适应策略 | 将BWC概念化为自创生子系统，提出通过科学技术机制作为结构耦合装置来应对新兴生物技术挑战 | NA | 探讨BWC在生物技术快速发展背景下的适应性和有效性 | 《禁止生物武器公约》及其制度框架 | NA | NA | 合成生物学、生物信息学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 50 | 2025-10-24 |
A functional and applied perspective of Vitreoscilla hemoglobin: from oxygen carriage to biotechnological innovation
2025-Sep-04, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03635-y
PMID:40908439
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综述 | 本文从功能和应用角度全面综述了透明颤菌血红蛋白的分子特性及其在生物技术领域的创新应用 | 整合了VHb转录因子相互作用、氧化还原偶联电子传递和定点诱变揭示的结构-功能关系等最新机制见解，并系统总结了vgb启动子作为强调控元件的新兴应用 | NA | 系统梳理透明颤菌血红蛋白的研究进展并展望其未来发展方向 | 透明颤菌血红蛋白(VHb)及其相关生物技术应用 | 合成生物学 | NA | 定点诱变、CRISPR调控表达平台、高细胞密度发酵 | NA | NA | NA | CRISPR | 哺乳动物系统、微生物 | 基于VHb的模块化组件 | 环境修复、精准农业、工业生物技术 |
| 51 | 2025-10-24 |
Glycyrrhiza, a commonly used medicinal herb: Review of species classification, pharmacology, active ingredient biosynthesis, and synthetic biology
2025-Sep, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.11.019
PMID:39551128
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综述 | 本文全面综述了甘草属植物的物种分类、药理活性、活性成分生物合成途径及合成生物学研究进展 | 整合多学科知识为甘草属研究提供独特而全面的视角，系统梳理活性成分生物合成途径与代谢工程策略 | NA | 为甘草分子育种和合成生物学领域的研究开发提供资源基础和理论支撑 | 甘草属植物及其活性成分（三萜类、黄酮类和多糖） | NA | NA | 多组学研究、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物合成途径 | 医药 |
| 52 | 2025-10-20 |
Transcriptomic functional characterization of recombinant adeno-associated virus producing cell line adapted to suspension-growth
2025 Sep-Oct, Biotechnology progress
IF:2.5Q3
DOI:10.1002/btpr.70042
PMID:40396307
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法开发了可悬浮培养的重组腺相关病毒生产细胞系，并分析了其转录组功能特征 | 首次将HEK293为基础的rAAV生产细胞系成功适应于无血清悬浮培养，并通过转录组分析揭示了不同培养条件下细胞对病毒生产的响应差异 | 悬浮培养的细胞系病毒滴度显著降低，即使优化后生产力也只能恢复到贴壁培养的25%-50% | 开发可规模化生产的重组腺相关病毒生产系统 | 重组腺相关病毒生产细胞系GX6B及其悬浮适应株GX6Bs | 合成生物学 | NA | 转录组分析 | NA | 基因表达数据 | HEK293衍生细胞系 | 合成生物学方法 | HEK293细胞 | 整合了AAV和腺病毒辅助组件编码基因的合成基因回路 | 医学 |
| 53 | 2025-10-15 |
A Pipeline for Screening Small Molecule-Enhanced Protein Stability in A Bacterial Orphan Receptor
2025-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.03.663076
PMID:40631274
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研究论文 | 本研究开发了一种筛选小分子增强细菌孤儿受体蛋白稳定性的流程 | 首次将微流控调制光谱和饱和转移差NMR结合用于研究PAS结构域蛋白-配体相互作用 | 仅使用了约760种化合物的片段库，可能遗漏其他潜在配体 | 寻找细菌孤儿受体CU228的新型配体并研究其稳定机制 | CU228蛋白（一种推测的PAS-HTH转录因子） | 合成生物学 | NA | 差异扫描荧光法、微流控调制光谱、饱和转移差NMR | NA | 生物物理数据、光谱数据 | 约760种化合物片段库 | NA | 细菌 | NA | 生物技术 |
| 54 | 2025-10-15 |
Orthogonalized human protease control of secreted signals
2025-Sep, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01831-x
PMID:39814991
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研究论文 | 开发基于人类蛋白酶调控细胞因子分泌的合成生物学平台hDIRECT | 首次使用完全人源化蛋白质构建正交性细胞因子调控系统，避免免疫原性风险 | 仅提供概念验证，尚未进行临床前或临床试验 | 开发用于细胞疗法的人源化合成生物学调控系统 | 人类细胞因子（IL-2、IL-6、IL-10）和人源蛋白酶 | 合成生物学 | 癌症，肌肉再生疾病 | 蛋白质工程，蛋白酶调控技术 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | 人类细胞 | 基于蛋白酶切割的细胞因子活性调控回路，包含激活和失活机制 | 医学 |
| 55 | 2025-10-14 |
Unexplored regions of the protein sequence-structure map revealed at scale by a library of foldtuned language models
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.22.573145
PMID:38187750
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研究论文 | 本研究通过开发foldtuned蛋白质语言模型库，大规模探索了蛋白质序列-结构映射中未开发的区域 | 提出foldtuning方法，将蛋白质语言模型重新设计为能够探索与天然蛋白质无同源性的序列空间的探针，同时保持核心结构约束 | NA | 探索远离天然序列的蛋白质序列-结构映射景观，揭示未被地球进化触及但符合生物物理规律的蛋白质折叠空间 | 700多种天然折叠结构，包括GPCRs、小GTPases、细胞表面受体、DNA结合域和信号调节域 | 计算生物学 | NA | 蛋白质语言模型(PLMs)、foldtuning方法 | 语言模型 | 蛋白质序列和结构数据 | SCOP数据库中700多种天然折叠 | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 56 | 2025-10-10 |
Systematic Optimization Enables Near-Perfect In Vitro Transformation Efficiencies for Spirodela polyrhiza (Greater Duckweed)
2025-Sep-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.10.675371
PMID:41000642
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研究论文 | 本研究系统优化了浮萍（大浮萍）的体外转化方案，实现了接近完美的转化效率 | 开发了从起始到完成的完整体外转化流程，在愈伤组织诱导、遗传转化和植物再生各阶段均达到90%-100%的高效率 | NA | 优化浮萍的体外遗传转化方法，克服转化过程中的技术瓶颈 | 浮萍（大浮萍） | NA | NA | 体外遗传转化 | NA | NA | NA | NA | 浮萍（大浮萍） | NA | 农业, 生物技术 |
| 57 | 2025-10-05 |
Synthetic Whole-Cell Bioelectronic Chemical Sensing with In Situ Genetic Computing
2025-Sep-25, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00015
PMID:41031321
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建了结合全细胞细菌生物传感器与电化学传感技术的生物电子化学传感器 | 将全细胞生物传感器的多功能性与电化学传感灵敏度相结合，开发了具有遗传计算能力的模块化生物电子传感器 | NA | 开发可编程的模块化生物电子传感器用于化学检测 | 汞污染物检测、双输入逻辑计算、多通道电化学信号输出 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、电化学传感 | NA | 电化学信号 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 细菌 | T7 RNAP信号放大器、布尔逻辑计算模块、双通道电化学输出系统 | 环境监测 |
| 58 | 2025-10-05 |
Turbocharging fundamental science translation through controlled environment agriculture
2025-Sep-30, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.014
PMID:41033905
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综述 | 本文探讨了受控环境农业如何加速植物科学成果向农业应用的转化 | 提出将受控环境农业作为多功能研究平台和高产生产系统，整合新兴育种、基因组和合成生物学工具 | NA | 通过受控环境农业加速植物科学基础研究成果向农业应用的转化 | 作物设计和农业生产系统 | 农业生物技术 | NA | 育种技术、基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 59 | 2025-10-05 |
Beyond Purification: Evolving Roles of Fusion Tags in Biotechnology
2025-Sep-17, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090768
PMID:41020890
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综述 | 本文总结了融合标签在生物技术中的多样化应用及其发展历程 | 系统阐述了融合标签从传统纯化功能向实时成像、空间定位、靶向递送和蛋白质活性调控等新型多功能工具的演变 | 未完全涵盖所有相关研究内容 | 帮助研究人员针对特定目标设计合适的标签格式 | 蛋白质标签和肽标签及其去除方法 | 生物技术 | NA | 基因融合技术、下拉实验、免疫沉淀 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、治疗设计 |
| 60 | 2025-10-05 |
Metabolic Engineering of Terpenoid Biosynthesis in Medicinal Plants: From Genomic Insights to Biotechnological Applications
2025-Sep-05, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47090723
PMID:41020846
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综述 | 本文综述了药用植物中萜类化合物生物合成的代谢工程策略及其生物技术应用 | 提出'从基因组见解到生物技术应用'的研究范式，整合多组学技术和CRISPR工具实现萜类化合物产量的显著提升 | 面临代谢通量平衡、细胞毒性和规模化经济性等持续挑战 | 加速萜类化合物生物制造从发现到商业化应用的转化 | 萜类化合物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 基因组学、转录组学、代谢组学、CRISPR | NA | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 药用植物、微生物系统、异源植物宿主 | 萜类化合物生物合成代谢途径 | 医药、工业生物技术 |