合成生物学相关文章
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当前共找到 140 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-05-18 |
Catalytic Residue Reprogramming Enhances Enzyme Activity at Alkaline pH via Phenolate-Mediated Proton Transfer
2025-09-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00379
PMID:40891340
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研究论文 | 通过重新编程酶的催化残基，将通用碱基替换为具有更高固有pKa值的可电离残基，实现酶在碱性pH下的高效催化 | 提出了一种整合理性设计催化残基与定向进化的酶工程策略，通过将羧酸盐介导的质子转移机制转变为酚盐介导的机制，实现了酶在碱性pH下的高效催化，并将最优pH值移动了超过3个单位 | 该策略目前主要在TEM β-内酰胺酶中验证，对其他类型水解酶的普适性有待进一步研究 | 开发一种通用的酶工程方法，使酶能够在碱性pH条件下发挥功能，扩展酶在工业和环境生物催化中的应用范围 | TEM β-内酰胺酶及其工程变体YR5-2 | 生物催化 | NA | 定向进化、分子动力学模拟 | NA | 酶动力学数据、模拟数据 | 涉及多种变体（E166Y、YR5-2及Y166E回复突变体）的动力学表征 | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物催化、环境生物催化 |
| 42 | 2026-05-10 |
Myxobacteria: Versatile cell factories of novel commercial enzymes for bio-manufacturing
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108594
PMID:40345460
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综述 | 综述了粘细菌作为新型商业酶多功能细胞工厂在生物制造中的应用潜力 | 系统总结了粘细菌基因组多样性和裂解酶挖掘的最新进展，强调了粘细菌作为工业细胞工厂的未充分利用潜力 | 基因工程改造困难、生长缓慢、代谢重塑和表达策略限制等挑战尚未解决 | 探讨粘细菌及其酶在农业和工业生物制造中的应用前景 | 粘细菌及其裂解酶 | 机器学习 | NA | NA | NA | 基因组数据 | NA | 合成生物学策略 | 粘细菌 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 43 | 2026-04-23 |
Tunable Low-Rate Genomic Recombination with Cre-lox in Escherichia coli : A Versatile Tool for Environmental Biosensing and Synthetic Biology
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.02.616356
PMID:40949998
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研究论文 | 本文开发了一种在Escherichia coli中可调控的低速率Cre-lox基因组重组系统，用于环境生物传感和合成生物学应用 | 实现了紧密调控、可滴定且具有低重组率和最小基础活性的Cre重组酶系统，并成功应用于缺氧环境下的砷酸盐生物传感 | NA | 开发一种可调控的低速率基因组重组工具，以增强环境生物传感和合成生物学的应用能力 | Escherichia coli（大肠杆菌）中的Cre-lox重组系统 | 合成生物学 | NA | Cre-lox重组技术 | NA | NA | NA | Cre-lox | Escherichia coli | 可调控的低速率基因组重组系统，用于环境生物传感 | 环境, 工业生物技术 |
| 44 | 2026-04-13 |
Using the Droplet Transfer Method to Reliably Prepare Giant Unilamellar Vesicles
2025-09-19, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/68340
PMID:41052083
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研究论文 | 本文介绍了一种可靠制备巨型单层囊泡（GUVs）的液滴转移方法，并提供了详细的实验协议和关键参数分析 | 提出了针对GUV制备中关键参数的系统性指南，包括成本有效的氧气和湿度控制措施，以及一次性去除油相的简便方法 | 方法可能因不同磷脂和油的选择而需要调整，且对初学者可能存在学习曲线 | 优化GUVs的制备方法，以促进其在合成生物学和微机器人等领域的应用 | 巨型单层囊泡（GUVs）的制备过程 | 合成生物学 | NA | 液滴转移方法（倒置乳液法） | NA | 实验协议 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 微机器人 |
| 45 | 2026-03-25 |
Construction of complex bacteriogenic protocells from living material assembly
2025-09, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01148-6
PMID:40044914
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研究论文 | 本文提出了一种通过利用原核生物作为现场组分、功能和结构构建块库来构建细菌源性原始细胞的协议 | 采用空间分离的细菌菌落捕获和处理策略，在单个凝聚微滴中生产膜结合、分子拥挤、组成、结构和功能复杂的合成细胞，并实现内源性重塑以获取多种原始细胞器 | 协议完成需约27天，且需要微生物学、相分离、生物化学和分子生物学相关技术的专业知识 | 构建具有高组织和功能复杂性的逼真合成细胞，以理解细胞过程和生命基础 | 细菌源性原始细胞 | 合成生物学 | NA | 微生物学、相分离、生物化学和分子生物学相关技术 | NA | NA | NA | NA | 原核生物（细菌） | 膜结合、分子拥挤的合成细胞，包含空间分区核样DNA/组蛋白凝聚物、膜结合水泡、F-肌动蛋白原始细胞骨架网络和原始线粒体 | 工程合成生物学, 生物医学 |
| 46 | 2026-03-16 |
On-Demand Nanoliter Delivering Platform via Electrical-Activated Microdroplet Assembling
2025-09-24, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.5c02928
PMID:40929287
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研究论文 | 本文介绍了一种按需纳升输送平台，通过电激活微滴组装实现实时控制和选择性内容融合 | 该平台创新性地整合了电传感、触发式液滴合并和被动分选于单一连续流中，利用基于阻抗的内容检测选择性识别目标液滴并启动电聚结融合 | NA | 开发一种高精度、可编程的纳升输送平台，用于提高生化检测的吞吐量和特异性 | 微滴液滴及其内容物，应用于细菌筛选等场景 | NA | NA | 阻抗检测、电聚结融合、流体动力学偏转 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现、合成生物学、单细胞分析 |
| 47 | 2026-02-28 |
STAGE: A compact and versatile TnpB-based genome editing toolkit for Streptomyces
2025-Sep-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509146122
PMID:40857323
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研究论文 | 本研究开发了一种基于TnpB的紧凑型基因组编辑工具包STAGE，用于链霉菌的高效、精确基因编辑 | 首次在链霉菌中建立了基于ISDra2 TnpB的基因组编辑平台，其效应蛋白大小仅为Cas9的三分之一，并开发了单碱基编辑和多重编辑系统，通过AI辅助蛋白质工程将编辑效率提升至近100% | NA | 开发适用于链霉菌的高效、精确基因组编辑工具 | 链霉菌（Streptomyces） | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、TnpB辅助基因组编辑、AI辅助蛋白质工程 | NA | NA | 两种工业重要链霉菌菌株 | CRISPR-Cas, TnpB | 链霉菌（Streptomyces） | 基因组编辑平台、单碱基编辑系统（C·G-to-T·A）、多重编辑系统 | 工业生物技术 |
| 48 | 2026-02-19 |
The tae-miR164-TaNAC6A Module from Winter Wheat Could Enhance Cold Tolerance in Transgenic Arabidopsis thaliana
2025-Sep-12, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants14182849
PMID:41012001
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研究论文 | 本研究揭示了冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块在增强植物耐冷性中的功能，并首次在拟南芥中验证了该模块的调控机制 | 首次阐明冬小麦中tae-miR164-TaNAC6A模块的耐冷调控机制，并利用异源表达策略验证其功能 | 研究主要在模式植物拟南芥中进行异源验证，尚未在小麦本物种中完成完整功能验证 | 探究非编码RNA调控植物冷胁迫响应的分子机制，开发增强作物耐冷性的分子育种策略 | 冬小麦品种东农冬麦1号（Dn1）及转基因拟南芥植株 | 植物分子生物学 | NA | 基因表达分析、转基因技术、抗氧化酶活性检测、ROS和MDA含量测定 | NA | 基因表达数据、生理生化指标数据 | 冬小麦品种及转基因拟南芥植株（具体数量未明确说明） | 转基因技术 | 拟南芥（Arabidopsis thaliana） | tae-miR164-TaNAC6A基因调控模块 | 农业 |
| 49 | 2026-02-02 |
Intratumoral microorganisms and artificial antitumor bacteria
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2023.06.002
PMID:41613448
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综述 | 本文综述了肿瘤内微生物在癌症进展和治疗中的作用，并探讨了基于合成生物学技术编程的人工抗肿瘤细菌在精准癌症诊断和治疗中的应用前景 | 强调了通过合成生物学技术编程细菌以增强时空可控性，结合免疫疗法或其他强效抗肿瘤剂，可能开启下一代精准癌症诊断和治疗 | NA | 探讨肿瘤内微生物在癌症发展和治疗中的角色，以及基于活菌的新型治疗和诊断方法 | 肿瘤内微生物和人工编程的抗肿瘤细菌 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 50 | 2026-02-02 |
Gene circuit-based sensors
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.06.011
PMID:41613450
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综述 | 本文综述了基于合成生物学基因回路构建的生物传感器的设计原理、工程化方法及其在多个领域的应用，并重点探讨了基于无细胞系统的生物传感器的研究进展 | 整合合成生物学基本概念，全面描述了基因回路的设计与工程化，并重点聚焦于基于无细胞系统的生物传感器的设计理念、构建原则及其在生物检测领域的新前沿 | NA | 综述基于合成生物学基因回路的生物传感器的设计、构建与应用，并讨论该领域的新前沿与待解决的挑战 | 基于合成生物学基因回路的生物传感器，特别是基于无细胞系统的生物传感器 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物（泛指），无细胞系统 | 基因回路，包括具有不同响应机制、逻辑门和逻辑回路的传感器 | 生物制造过程监控, 环境监测, 食品安全, 医疗诊断与监测 |
| 51 | 2026-02-02 |
Nano-synthetic biology for disease diagnosis and treatment
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2025.07.002
PMID:41613477
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2026-02-02 |
Nanoscale synthetic biology with innovative medicinal applications
2025-Sep, Fundamental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.fmre.2024.11.006
PMID:41613444
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综述 | 本文综述了纳米尺度合成生物学（NSB）在生物医学领域的应用，包括常见纳米载体、纳米生物组装系统及具体应用 | 整合合成生物学与纳米科学，通过纳米尺度操控实现更高效可控的生物工程，促进疾病治疗、生物成像、生物催化和生物传感的创新 | NA | 探讨NSB在生物医学中的应用，以推动科学技术进步并应对重大社会挑战 | 包括细胞、细菌和病毒在内的各种生物体 | 合成生物学 | NA | 基因调控系统（如CRISPR、mRNA、siRNA、质粒）、纳米酶、药物和特定纳米探针的递送 | NA | NA | NA | CRISPR, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细胞, 细菌, 病毒 | 生物传感器, 代谢途径 | 医学 |
| 53 | 2025-12-29 |
Strategies to improve photosynthesis by modifying the RuBisCO system and its limitations
2025-Sep-26, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-11075-0
PMID:41003756
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综述 | 本文综述了通过改造RuBisCO系统以提高光合效率的策略及其局限性 | 综合评述了包括直接诱变、祖先蛋白重建、嵌合/异源亚基整合、碳浓缩机制引入以及合成生物学途径在内的多学科策略，并强调了人工智能在预测有益突变和指导蛋白质工程中的应用 | 讨论了每种改造方法自身存在的局限性 | 提高RuBisCO的催化效率与稳定性，以增强光合作用能力和作物生产力 | RuBisCO酶及其相关系统（如RuBisCO激活酶、碳浓缩机制） | 合成生物学 | NA | 直接诱变、祖先蛋白重建、蛋白质工程、合成生物学途径 | NA | NA | NA | NA | NA | 人工碳固定途径 | 农业 |
| 54 | 2025-12-22 |
Computational tools for nonnatural pathway design: Algorithms, applications, and challenges
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100041
PMID:41415682
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综述 | 本文综述了用于非天然代谢途径设计的计算工具，包括算法、应用及挑战 | 系统比较了基于模板和无模板两类主要计算方法，并汇编了55个实验验证的非天然途径数据集以评估方法优劣 | 计算预测与实验可行性之间存在差距，代谢负担增加和有毒中间体积累等挑战尚未完全解决 | 通过理性设计非天然代谢途径扩展生物转化的范围和效率 | 非天然代谢途径的计算设计方法 | 合成生物学 | NA | 计算建模与生物信息学分析 | NA | 代谢途径数据与文献数据集 | 55个实验验证的非天然途径 | NA | 微生物细胞工厂 | 非天然代谢途径 | 工业生物技术 |
| 55 | 2025-12-22 |
Recent advances of engineered probiotics for therapeutic applications
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100039
PMID:41415685
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综述 | 本文综述了工程化益生菌在癌症、胃肠道疾病、传染病和代谢性疾病等人类疾病治疗中的最新应用进展 | 利用合成生物学技术开发工程化益生菌作为诊断工具和疾病治疗方法，强调其在多因素疾病治疗中的创新应用 | NA | 总结工程化益生菌在人类疾病治疗领域的最新研究进展，并探讨其发展挑战与机遇 | 工程化益生菌及其在人类疾病治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症、胃肠道疾病、传染病、代谢性疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 益生菌 | NA | 医学 |
| 56 | 2025-12-22 |
Enzyme promiscuity in the field of synthetic biology applied to white biotechnology: Opportunities and weaknesses
2025-Sep, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100026
PMID:41415683
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综述 | 本文探讨了酶的多功能性在合成生物学应用于白色生物技术中的机遇与弱点 | 强调了酶多功能性作为地下代谢的来源，在构建高效生产路径中的优势，同时指出其可能导致产量损失和代谢干扰的挑战 | 未提供具体实验数据或案例研究，主要基于理论分析和展望 | 改善微生物细胞工厂在生物生产中的性能，通过理解酶多功能性来优化工程策略 | 微生物代谢网络和酶的多功能性 | 合成生物学 | NA | 系统生物学和合成生物学工具 | 机器学习 | 遗传、代谢、酶学和发酵过程数据 | NA | NA | 微生物 | 代谢网络工程 | 工业生物技术 |
| 57 | 2025-12-19 |
Precision in Predicting Protein-Nucleic Acid Complexes: Establishing a Benchmark Data Set and Comparative Metrics
2025-Sep-22, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c01372
PMID:40932245
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研究论文 | 本研究建立了蛋白质-核酸复合物结构预测的基准数据集ProNASet，并系统评估了多种深度学习和物理驱动对接方法的性能 | 首次创建了包含100个实验解析结构的蛋白质-核酸复合物基准数据集，并建立了多维评估框架 | 基准数据集规模有限（100个结构），且当前深度学习方法在该任务上表现显著落后 | 评估和比较蛋白质-核酸复合物结构预测的计算方法 | 蛋白质-核酸复合物结构 | 计算生物学 | NA | 深度学习算法、分子对接方法 | AlphaFold3, Chai-1, HelixFold3, Protenix | 蛋白质-核酸复合物三维结构数据 | 100个实验解析的蛋白质-核酸复合物结构 | NA | NA | NA | 基因组编辑、合成生物学 |
| 58 | 2025-12-19 |
Guns 'N Roses: Fungal Volatile Warfare in Postharvest Disease Control
2025-09, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
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综述 | 本文综述了真菌挥发性有机化合物在采后病害控制中的应用，包括其化学多样性、作用机制以及作为生物熏蒸剂的潜力 | 聚焦于真菌挥发性有机化合物在生物防治中的关键作用，并探讨了通过定向诱变、合成生物学和人工智能提升其效率的未来研究方向 | 作为一篇综述，未涉及原始实验数据，且具体应用案例和效果可能因物种和环境条件而异 | 探索真菌挥发性有机化合物作为环保替代品，用于控制采后病害和食品腐败微生物 | 真菌挥发性有机化合物、微生物生物防治剂、病原真菌以及处理后的农产品 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 食品 |
| 59 | 2025-11-07 |
Next-generation oncology: integrative therapeutic frontiers at the crossroads of precision genomics, immuno-engineering, and tumor microenvironment modulation
2025-Sep-20, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-03042-3
PMID:40974488
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综述 | 探讨肿瘤学从传统细胞毒性疗法向整合精准基因组学、免疫工程和肿瘤微环境调制的智能驱动框架转变 | 提出将癌症视为复杂适应系统，整合AI引导的适应性给药、合成生物学增强的CAR-T细胞和代谢重编程等协同治疗方法 | 存在治疗耐药性、毒性、可及性和伦理问题等挑战 | 推动肿瘤治疗向整合性、系统性和精准化方向发展 | 癌症作为复杂适应系统的多维度治疗策略 | 数字病理 | 肿瘤 | 多组学分析、分子图谱、量子生物学、合成肿瘤学、暗基因组挖掘 | 数字孪生 | 基因组数据、微环境数据 | NA | 合成生物学 | CAR-T细胞 | 逻辑门控CAR-T细胞 | 医学 |
| 60 | 2025-11-06 |
Regulatory roles of RNA modifications in plant development and fruit ripening
2025-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-025-00240-5
PMID:40994446
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综述 | 本文综述了RNA修饰在植物发育和果实成熟中的调控作用，重点关注m6A介导的调控网络 | 提出了结合CRISPR编辑、单细胞空间表观转录组学和合成生物学方法的创新路线图，用于精准农业应用 | 对RNA修饰的分子机制理解仍有限，特别是m6A以外的其他修饰类型 | 解析植物表观转录组的调控机制并开发精准农业应用 | 植物RNA修饰网络及其在发育和果实成熟中的功能 | 植物分子生物学 | NA | 表观转录组测序，CRISPR，单细胞空间表观转录组学 | NA | 表观转录组数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物系统 | RNA修饰依赖的翻译控制系统，RNA表观遗传编辑工具 | 农业 |