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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-10-05 |
Coacervate Vesicles as Adaptive Platforms for Synthetic Biology and Smart Materials
2025-Sep-24, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202502268
PMID:40827771
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综述 | 本文介绍了凝聚层囊泡作为合成生物学和智能材料平台的基本特性、分类方法及应用前景 | 提出基于形成机制和能量景观的凝聚层囊泡分类体系,并系统阐述其结构特性与动态行为的关系 | 该领域仍处于发展初期,实际应用尚未成熟 | 探讨凝聚层囊泡在合成生物学和智能材料领域的应用潜力 | 凝聚层囊泡(一种结合凝聚层微滴动态特性与膜系统结构优势的原型细胞) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 材料科学 |
| 42 | 2025-10-05 |
Regulatory roles of RNA modifications in plant development and fruit ripening
2025-Sep, aBIOTECH
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s42994-025-00240-5
PMID:40994446
|
综述 | 本文综述了RNA修饰在植物发育和果实成熟中的调控作用,重点关注m6A介导的调控网络 | 提出了结合CRISPR编辑、单细胞空间表观转录组学和合成生物学方法的创新路线图,以利用RNA修饰网络实现精准农业 | 对RNA修饰的分子机制理解仍然有限,特别是m6A以外的其他修饰类型 | 解析植物表观转录组的调控机制并开发精准农业应用 | 植物RNA修饰,特别是N-甲基腺苷(m6A)修饰 | 植物分子生物学 | NA | 表观转录组测序,CRISPR,单细胞空间表观转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | RNA修饰依赖的翻译控制系统,RNA表观遗传编辑工具 | 农业 |
| 43 | 2025-10-05 |
In Situ Plant Sensors: Toward Real-Time, High-Resolution Monitoring
2025-Sep-26, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c01494
PMID:40830763
|
综述 | 本文综述了柔性可穿戴设备和基因编码传感器在植物实时原位监测中的最新进展与应用潜力 | 首次系统比较了可穿戴传感器与基因编码传感器在植物监测中的互补优势,提出了多学科融合的未来发展方向 | 存在适应性、传感稳定性、空间分辨率、参数覆盖范围有限以及不同传感模式集成等实际问题 | 推动植物传感技术向实时、高分辨率监测方向发展 | 植物生理状态和应激反应 | 农业技术 | NA | 柔性可穿戴设备、基因编码传感器 | NA | 生理参数、分子信号、环境数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 生物传感器(用于检测钙、活性氧、植物激素等信号分子) | 农业 |
| 44 | 2025-10-05 |
An Engineered Probiotic Consortium Based on Quorum-Sensing for Colorectal Cancer Immunotherapy
2025-Sep-26, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512744
PMID:40999885
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研究论文 | 设计了一种基于群体感应的工程益生菌联合体,用于结直肠癌免疫治疗 | 开发了能够整合多种肿瘤微环境信号并通过正交群体感应系统协调多治疗载荷释放的工程益生菌联合体 | NA | 开发用于癌症治疗的工程活体生物治疗产品 | 工程益生菌联合体、结直肠癌小鼠模型 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 合成生物学、正交群体感应系统 | NA | NA | 使用hPD-L1 MC38肿瘤的人源化PD-1小鼠模型和携带HT-29肿瘤的人源化外周血单核细胞小鼠模型 | CRISPR-Cas9 | 益生菌 | 正交群体感应系统、能够响应pH值、缺氧和高乳酸水平三种肿瘤微环境参数的生物传感器 | 医学 |
| 45 | 2025-10-05 |
Strategies to improve photosynthesis by modifying the RuBisCO system and its limitations
2025-Sep-26, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-11075-0
PMID:41003756
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综述 | 本文综述了通过改造RuBisCO系统提高光合作用效率的策略及其局限性 | 整合了包括直接诱变、祖先蛋白重建、异源亚基整合、碳浓缩机制和合成生物学方法在内的多学科策略,并探讨了人工智能在预测有益突变和指导蛋白质工程中的应用 | 讨论了每种改进方法的局限性 | 提高RuBisCO酶的性能以增强光合作用效率和作物生产力 | RuBisCO酶系统及其相关组件 | 合成生物学 | NA | 直接诱变、祖先蛋白重建、异源亚基整合、碳浓缩机制、合成生物学方法 | 机器学习 | NA | NA | NA | NA | 人工碳固定途径 | 农业 |
| 46 | 2025-10-05 |
Dynamic membranization results in core-shell coacervates that selectively localize particles and small molecules
2025-Sep-25, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc02423d
PMID:40905114
|
研究论文 | 开发了一种动态多相凝聚系统,能够模拟细胞区室化实现选择性分子分配 | 通过动态膜化形成核壳结构凝聚物,实现基于极性的选择性分子分配和增强的胶体稳定性 | NA | 开发模拟细胞区室化的多相凝聚系统用于选择性分子分离 | 多相凝聚物系统及其分子分配特性 | 合成生物学 | NA | pH响应平台 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 催化, 合成生物学, 仿生化学系统 |
| 47 | 2025-10-05 |
Probiotic-Based Materials as Living Therapeutics
2025-Sep-25, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202508500
PMID:40999775
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综述 | 本文综述了基于基因工程益生菌与基质结合的益生菌活性材料在生物医学应用中的潜力与挑战 | 提出了益生菌活性材料这一新概念,区别于传统活体生物治疗产品,整合了合成生物学与材料科学 | 缺乏稳健的益生菌基因工程工具包、存在生物安全性担忧、临床前研究向人体转化困难、缺乏明确的监管指南 | 探索益生菌活性材料在生物医学领域的应用前景 | 基因工程益生菌与基质材料 | 合成生物学 | NA | 基因工程技术 | NA | NA | NA | NA | 益生菌 | NA | 医学 |
| 48 | 2025-10-05 |
RNA Polymerase III Promoters Compatible with CRISPR Gene Regulation in Saccharomyces cerevisiae
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00122
PMID:40824237
|
研究论文 | 本研究鉴定并表征了20个RNA聚合酶III启动子在酿酒酵母中用于CRISPR基因调控的适用性 | 首次系统评估跨物种RNA Pol III启动子在酵母CRISPR系统中的应用,发现两个新型启动子性能与金标准pSNR52相当 | 研究仅针对有限数量的启动子进行评估,未涵盖所有可能的Pol III启动子类型 | 开发适用于酿酒酵母CRISPR系统的RNA聚合酶III启动子工具 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)基因表达调控系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑技术 | NA | 基因表达数据 | 20个RNA Pol III启动子 | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | sgRNA表达系统,基因激活和抑制回路 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 49 | 2025-10-05 |
Development of a thermophilic l-arabinose-inducible system in Acetivibrio thermocellus (Clostridium thermocellum)
2025-Sep-19, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.008
PMID:40976505
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研究论文 | 本研究开发了一种适用于热纤维梭菌的耐热L-阿拉伯糖诱导表达系统 | 首次在热纤维梭菌中构建了具有175倍诱导动态范围且泄漏可忽略的耐热L-阿拉伯糖诱导系统 | NA | 开发适用于非模式热微生物的诱导型遗传操作系统 | 热纤维梭菌(Acetivibrio thermocellus) | NA | NA | 启动子工程、条件优化 | NA | NA | NA | 启动子工程 | 热纤维梭菌(Acetivibrio thermocellus) | L-阿拉伯糖诱导系统,包含来自嗜热脂肪地芽孢杆菌T-6的诱导型启动子P和阻遏蛋白AraR | 工业生物技术, 能源 |
| 50 | 2025-10-05 |
[Advances in yeast biosynthesis of triterpenoids for cosmetic applications]
2025-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250116
PMID:40994325
|
综述 | 本文综述了酵母合成三萜类化合物在化妆品领域的研究进展,包括合成途径、产量提升策略及未来发展方向 | 系统比较甲羟戊酸和甲基赤藓糖醇磷酸两种合成途径在不同微生物宿主中的优劣,并提出酵母合成三萜类化合物的优化策略 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述进行分析 | 促进三萜类化合物在化妆品领域的应用开发 | 三萜类化合物及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 文献资料 | NA | NA | 酵母 | 甲羟戊酸途径和甲基赤藓糖醇磷酸途径 | 化妆品 |
| 51 | 2025-10-05 |
[Progress in the heterologous synthesis of sesquiterpenes by Yarrowia lipolytica]
2025-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240845
PMID:40994326
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综述 | 本文综述了利用解脂耶氏酵母异源合成倍半萜类化合物的研究进展 | 系统总结了通过合成生物学策略在解脂耶氏酵母中高效合成倍半萜的创新方法 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学策略提高解脂耶氏酵母中倍半萜产量的方法 | 倍半萜类化合物及其在解脂耶氏酵母中的异源合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 解脂耶氏酵母 | 代谢途径工程,前体增强 | 香料,制药,生物燃料,工业生物技术 |
| 52 | 2025-10-05 |
A Deep Dive into Plant Metabolomics: Milestones, Technologies, and Translational Impact
2025-Sep-24, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf408
PMID:40991682
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综述 | 本文全面回顾植物代谢组学的发展历程、技术进展及其在农业和生物技术领域的转化应用 | 系统总结了500多种开源计算工具,涵盖代谢组学数据分析全流程,并展望了成像质谱、单细胞代谢组学等新兴技术 | 作为综述文章,不涉及原始实验数据,主要基于现有文献进行整合分析 | 梳理植物代谢组学领域的发展里程碑、技术演进和转化应用前景 | 植物代谢组学研究方法、分析工具和应用案例 | 生物信息学 | NA | 代谢组学、成像质谱、单细胞代谢组学、代谢组全基因组关联分析(mGWAS)、代谢物QTL分析(mQTL) | AI辅助代谢物鉴定 | 代谢组学数据、转录组数据 | NA | NA | 药用植物、作物 | NA | 农业, 医药, 生物技术 |
| 53 | 2025-10-05 |
Cultivation and sequencing of microbiota members unveil the functional potential of yak gut microbiota
2025-Sep-23, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00367-25
PMID:40815469
|
研究论文 | 通过培养和测序牦牛肠道微生物群成员,揭示其功能潜力 | 建立了首个牦牛粪便细菌基因组参考库(YFR),包含548个高质量基因组,其中216株为新分类单元,将反刍动物肠道细菌培养物种比例提高19.39% | NA | 揭示牦牛肠道微生物群的功能潜力和生态适应性 | 牦牛肠道微生物群 | 微生物组学 | NA | 好氧和厌氧培养、基因组测序 | NA | 基因组数据 | 548个高质量基因组,216个新分类单元 | NA | 牦牛 | NA | 工业酶发现、合成生物学 |
| 54 | 2025-10-05 |
The marine diatom Phaeodactylum tricornutum as a versatile bioproduction chassis: Current progress, challenges and perspectives
2025-Sep-23, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101519
PMID:40994005
|
综述 | 本文综述了海洋硅藻三角褐指藻作为多功能生物生产底盘的研究进展、挑战与前景 | 系统总结了该硅藻在合成生物学领域的应用潜力,包括遗传工具开发、代谢工程和规模化生产策略 | 存在产物产量欠佳、生物量限制和生产成本过高等工业化障碍 | 探讨三角褐指藻从模式硅藻向规模化生物制造平台转型的路径 | 海洋硅藻三角褐指藻 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、高效转化系统、DNA定点整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 三角褐指藻 | 代谢途径工程(岩藻黄素、脂肪酸、三酰甘油、萜类、治疗性肽类) | 工业生物技术, 能源, 材料 |
| 55 | 2025-10-05 |
Strong Translation Elongation Factor 1-Alpha (tef1α) Promoter Reporter Systems for Aspergillus niger
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00368
PMID:40844977
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研究论文 | 本研究在黑曲霉中开发了基于翻译延伸因子1-α基因启动子的高效报告系统 | 发现了迄今黑曲霉中最强的启动子,其活性比常用启动子高20倍以上,并开发了多功能共表达系统 | NA | 开发用于真菌合成生物学的高性能遗传工具 | 黑曲霉的翻译延伸因子1-α基因启动子 | 合成生物学 | NA | 甲基伞形酮报告基因检测、荧光蛋白标记、共聚焦显微镜 | NA | 荧光信号、染色信号、共定位数据 | NA | P2A肽、融合构建体 | 黑曲霉 | 启动子报告系统、双顺反子表达系统、核定位信号识别系统 | 工业生物技术 |
| 56 | 2025-10-05 |
Catalytic Residue Reprogramming Enhances Enzyme Activity at Alkaline pH via Phenolate-Mediated Proton Transfer
2025-Sep-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00379
PMID:40891340
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研究论文 | 提出一种通过催化残基重编程增强酶在碱性pH下活性的工程策略 | 将保守的催化残基替换为更高pKa的可电离残基,实现从羧酸盐介导到酚盐介导的质子转移机制转变 | NA | 开发在极端pH条件下保持高效酶催化活性的方法 | TEM β-内酰胺酶及其工程变体 | 合成生物学 | NA | 理性设计、定向进化、分子动力学模拟 | NA | 动力学数据、模拟数据 | NA | 定向进化 | 大肠杆菌 | NA | 工业生物催化, 环境生物催化 |
| 57 | 2025-10-05 |
Engineering Nicotinamide Adenine Dinucleotide Oxidase for Regeneration of Oxidized Non-natural Cofactor
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500254
PMID:40400447
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研究论文 | 本研究通过工程化改造NADH氧化酶,实现了非天然辅因子NCDH向NCD的高效转化 | 首次开发了能够高效氧化非天然辅因子NCDH的工程化酶,解决了氧化反应中NCD生成的技术瓶颈 | NA | 开发非天然辅因子NCD的再生工具,拓展合成生物学中氧化还原反应的应用能力 | NADH氧化酶及其突变体、非天然辅因子NCD/NCDH | 合成生物学 | NA | 酶工程、分子对接分析 | NA | 酶活性数据、分子对接模拟数据 | NA | 酶定向进化 | 大肠杆菌Escherichia coli BW14329 | NCDH氧化再生系统,与磷酸脱氢酶偶联的代谢通路 | 工业生物技术, 化学生物学 |
| 58 | 2025-10-05 |
Engineering and Functional Expression of the Type III Secretion System in Xenorhabdus: Enhancing Insecticidal Efficacy and Expanding T3SE Libraries
2025-Sep-24, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08269
PMID:40928961
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在昆虫病原线虫共生细菌中构建并功能表达了III型分泌系统,显著增强了其杀虫效果 | 首次使用Red/ET重组工程技术克隆完整32-kb T3SS基因簇并在T3SS缺陷菌株中实现功能性表达,发现新型效应蛋白XopA | 研究主要基于实验室模型,尚未在真实田间环境中验证工程菌株的实际应用效果 | 通过合成生物学方法增强昆虫病原细菌的杀虫能力并扩展T3SS效应蛋白库 | 昆虫病原线虫共生细菌Xenorhabdus spp.及其III型分泌系统 | 合成生物学 | 昆虫病害控制 | Red/ET重组工程, 基因克隆, 异源表达 | NA | 分子生物学数据, 细胞实验数据, 生物测定数据 | CF-203细胞系和昆虫模型 | Red/ET recombineering | Xenorhabdus | 完整的32-kb III型分泌系统基因簇,包含新型效应蛋白XopA的递送机制 | 农业, 生物防治 |
| 59 | 2025-10-05 |
On-Demand Nanoliter Delivering Platform via Electrical-Activated Microdroplet Assembling
2025-Sep-24, Nano letters
IF:9.6Q1
DOI:10.1021/acs.nanolett.5c02928
PMID:40929287
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研究论文 | 开发了一种通过电激活微滴组装实现按需纳升级试剂输送的平台 | 将电传感、触发式液滴融合和被动分选集成在单一连续流中,实现基于阻抗检测的选择性液滴融合 | NA | 开发高精度纳升级试剂输送平台 | 微滴和细菌样品 | 微流控技术 | NA | 阻抗检测、电聚结融合、流体动力学分选 | NA | 电信号数据 | 每分钟超过6000个事件 | NA | 细菌 | NA | 药物发现,合成生物学,单细胞分析 |
| 60 | 2025-10-05 |
Expanding the quorum sensing toolbox: Promoter libraries and hybrid promoter for dynamic genetic circuits
2025-Sep-12, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.09.004
PMID:40945582
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研究论文 | 本研究通过构建群体感应启动子库和新型混合启动子,扩展了合成生物学工具箱并实现了动态遗传电路的精确调控 | 创建了P(LasI/LasR)和P(EsaI/EsaR)系统的启动子库,并设计了一种需要两种自诱导物激活的新型混合启动子 | NA | 扩展群体感应工具箱,实现遗传电路的动态调控和精确调谐 | 群体感应系统、遗传电路、启动子工程 | 合成生物学 | NA | 启动子工程、遗传电路设计 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | E. coli | 多阶段遗传开关、混合启动子电路、需要3-氧代-己酰基和3-氧代-十二酰基-高丝氨酸内酯两种自诱导物激活的逻辑门 | 工业生物技术 |