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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-10-05 |
Advances in the sustainable biosynthesis of valuable terpenoid flavor compounds and precursors in micro-organisms
2025-Sep-25, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-025-02699-2
PMID:40999400
|
综述 | 综述微生物可持续生物合成高价值萜类风味化合物及其前体的研究进展 | 整合合成生物学技术开发微生物细胞工厂,实现萜类风味化合物的绿色高效生产 | NA | 支持可持续生产技术的发展并促进风味香料行业的工业应用 | 萜类风味化合物及其前体 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、合成途径设计 | NA | NA | NA | NA | 微生物底盘细胞 | 新型目标产物的合成途径设计 | 医药,食品,香料工业 |
| 82 | 2025-10-05 |
Phase Separation-Regulated Fungal Growth, Sexual Development, Adaptation and Synthetic Biology Applications
2025-Sep-17, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof11090680
PMID:41003226
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综述 | 本文综述了液-液相分离(LLPS)在真菌生长、发育和适应中的调控作用及其在合成生物学中的应用 | 系统总结了环境信号通过LLPS调控真菌生物学过程的机制,并探讨了工程化合成生物分子凝聚体在微生物细胞工厂中的应用策略 | NA | 探讨液-液相分离在真菌生物学过程中的调控机制及其在合成生物学中的潜在应用 | 真菌蛋白质的液-液相分离现象及其形成的无膜细胞器 | 合成生物学 | NA | 液-液相分离(LLPS)技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物细胞工厂 | 合成生物分子凝聚体工程 | 生物技术, 生物合成, 代谢工程 |
| 83 | 2025-10-05 |
Automated and Programmable Cell-Free Systems for Scalable Synthetic Biology with a Focus on Biofoundry Integration
2025-Sep-16, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2507.07019
PMID:40967915
|
综述 | 本文综述了无细胞蛋白质合成技术与自动化生物铸造平台融合的技术创新、当前能力和未来发展方向 | 重点介绍了无细胞系统与自动化生物铸造平台集成如何加速设计-构建-测试-学习循环,并结合机器学习实现遗传构件和生物合成系统的预测性优化 | NA | 探讨无细胞系统与自动化生物铸造平台融合的技术发展和应用前景 | 无细胞蛋白质合成系统和自动化生物铸造平台 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成、液体处理机器人技术、数字微流控 | 机器学习 | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | NA | 生物传感器、代谢通路原型设计、逻辑门 | 工业生物技术、医药、环境、能源、材料 |
| 84 | 2025-10-05 |
Coacervate Vesicles as Adaptive Platforms for Synthetic Biology and Smart Materials
2025-Sep-24, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202502268
PMID:40827771
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综述 | 本文介绍了凝聚层囊泡作为合成生物学和智能材料平台的基本特性、分类方法及应用前景 | 提出基于形成机制和能量景观的凝聚层囊泡分类体系,并系统阐述其结构特性与动态行为的关系 | 该领域仍处于发展初期,实际应用尚未成熟 | 探讨凝聚层囊泡在合成生物学和智能材料领域的应用潜力 | 凝聚层囊泡(一种结合凝聚层微滴动态特性与膜系统结构优势的原型细胞) | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药, 材料科学 |
| 85 | 2025-10-05 |
In Situ Plant Sensors: Toward Real-Time, High-Resolution Monitoring
2025-Sep-26, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c01494
PMID:40830763
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综述 | 本文综述了柔性可穿戴设备和基因编码传感器在植物实时原位监测中的最新进展与应用潜力 | 首次系统比较了可穿戴传感器与基因编码传感器在植物监测中的互补优势,提出了多学科融合的未来发展方向 | 存在适应性、传感稳定性、空间分辨率、参数覆盖范围有限以及不同传感模式集成等实际问题 | 推动植物传感技术向实时、高分辨率监测方向发展 | 植物生理状态和应激反应 | 农业技术 | NA | 柔性可穿戴设备、基因编码传感器 | NA | 生理参数、分子信号、环境数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 生物传感器(用于检测钙、活性氧、植物激素等信号分子) | 农业 |
| 86 | 2025-10-05 |
Dynamic membranization results in core-shell coacervates that selectively localize particles and small molecules
2025-Sep-25, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc02423d
PMID:40905114
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研究论文 | 开发了一种动态多相凝聚系统,能够模拟细胞区室化实现选择性分子分配 | 通过动态膜化形成核壳结构凝聚物,实现基于极性的选择性分子分配和增强的胶体稳定性 | NA | 开发模拟细胞区室化的多相凝聚系统用于选择性分子分离 | 多相凝聚物系统及其分子分配特性 | 合成生物学 | NA | pH响应平台 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 催化, 合成生物学, 仿生化学系统 |
| 87 | 2025-10-05 |
[Advances in yeast biosynthesis of triterpenoids for cosmetic applications]
2025-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250116
PMID:40994325
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综述 | 本文综述了酵母合成三萜类化合物在化妆品领域的研究进展,包括合成途径、产量提升策略及未来发展方向 | 系统比较甲羟戊酸和甲基赤藓糖醇磷酸两种合成途径在不同微生物宿主中的优劣,并提出酵母合成三萜类化合物的优化策略 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述进行分析 | 促进三萜类化合物在化妆品领域的应用开发 | 三萜类化合物及其衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | 文献资料 | NA | NA | 酵母 | 甲羟戊酸途径和甲基赤藓糖醇磷酸途径 | 化妆品 |
| 88 | 2025-10-05 |
[Progress in the heterologous synthesis of sesquiterpenes by Yarrowia lipolytica]
2025-Sep-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.240845
PMID:40994326
|
综述 | 本文综述了利用解脂耶氏酵母异源合成倍半萜类化合物的研究进展 | 系统总结了通过合成生物学策略在解脂耶氏酵母中高效合成倍半萜的创新方法 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学策略提高解脂耶氏酵母中倍半萜产量的方法 | 倍半萜类化合物及其在解脂耶氏酵母中的异源合成 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 解脂耶氏酵母 | 代谢途径工程,前体增强 | 香料,制药,生物燃料,工业生物技术 |
| 89 | 2025-10-05 |
Cultivation and sequencing of microbiota members unveil the functional potential of yak gut microbiota
2025-Sep-23, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00367-25
PMID:40815469
|
研究论文 | 通过培养和测序牦牛肠道微生物群成员,揭示其功能潜力 | 建立了首个牦牛粪便细菌基因组参考库(YFR),包含548个高质量基因组,其中216株为新分类单元,将反刍动物肠道细菌培养物种比例提高19.39% | NA | 揭示牦牛肠道微生物群的功能潜力和生态适应性 | 牦牛肠道微生物群 | 微生物组学 | NA | 好氧和厌氧培养、基因组测序 | NA | 基因组数据 | 548个高质量基因组,216个新分类单元 | NA | 牦牛 | NA | 工业酶发现、合成生物学 |
| 90 | 2025-10-05 |
Engineering Nicotinamide Adenine Dinucleotide Oxidase for Regeneration of Oxidized Non-natural Cofactor
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500254
PMID:40400447
|
研究论文 | 本研究通过工程化改造NADH氧化酶,实现了非天然辅因子NCDH向NCD的高效转化 | 首次开发了能够高效氧化非天然辅因子NCDH的工程化酶,解决了氧化反应中NCD生成的技术瓶颈 | NA | 开发非天然辅因子NCD的再生工具,拓展合成生物学中氧化还原反应的应用能力 | NADH氧化酶及其突变体、非天然辅因子NCD/NCDH | 合成生物学 | NA | 酶工程、分子对接分析 | NA | 酶活性数据、分子对接模拟数据 | NA | 酶定向进化 | 大肠杆菌Escherichia coli BW14329 | NCDH氧化再生系统,与磷酸脱氢酶偶联的代谢通路 | 工业生物技术, 化学生物学 |
| 91 | 2025-10-05 |
Engineering and Functional Expression of the Type III Secretion System in Xenorhabdus: Enhancing Insecticidal Efficacy and Expanding T3SE Libraries
2025-Sep-24, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08269
PMID:40928961
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法在昆虫病原线虫共生细菌中构建并功能表达了III型分泌系统,显著增强了其杀虫效果 | 首次使用Red/ET重组工程技术克隆完整32-kb T3SS基因簇并在T3SS缺陷菌株中实现功能性表达,发现新型效应蛋白XopA | 研究主要基于实验室模型,尚未在真实田间环境中验证工程菌株的实际应用效果 | 通过合成生物学方法增强昆虫病原细菌的杀虫能力并扩展T3SS效应蛋白库 | 昆虫病原线虫共生细菌Xenorhabdus spp.及其III型分泌系统 | 合成生物学 | 昆虫病害控制 | Red/ET重组工程, 基因克隆, 异源表达 | NA | 分子生物学数据, 细胞实验数据, 生物测定数据 | CF-203细胞系和昆虫模型 | Red/ET recombineering | Xenorhabdus | 完整的32-kb III型分泌系统基因簇,包含新型效应蛋白XopA的递送机制 | 农业, 生物防治 |
| 92 | 2025-10-05 |
Microbial mineralization for remediating heavy metal-contaminated groundwater: mechanisms, applications, advances, and perspectives
2025-Sep-23, Environmental geochemistry and health
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10653-025-02753-w
PMID:40986195
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综述 | 本文系统综述了微生物矿化修复重金属污染地下水的机制、应用、进展与前景 | 结合文献计量学分析与工程案例,阐明了碳酸盐、硫化物和磷酸盐矿物形成驱动重金属固定的机制,并识别了当前研究前沿 | 极端环境中微生物活性受抑制,复杂污染系统处理效率低,矿化产物长期稳定性监测不足 | 探讨微生物矿化修复重金属污染地下水的机制与应用 | 重金属污染地下水及参与矿化修复的微生物 | 环境生物技术 | NA | 微生物矿化,文献计量分析 | NA | 文献数据,工程案例 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 93 | 2025-10-05 |
Protocol for fabricating a reusable plate-well insert with a 3D-printed mounter and hydrogel scaffolds for 3D cell culture and functional assays
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104014
PMID:40782348
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研究论文 | 介绍了一种用于标准24孔板的可重复使用插入件的制造方案,包含3D打印支架和水凝胶支架 | 开发了结合3D打印支架和水凝胶支架的可重复使用插入件系统,简化水凝胶制备过程并减少批次差异 | NA | 为3D细胞培养和功能分析提供标准化、可重复使用的实验平台 | 细胞培养插入件和水凝胶支架 | 组织工程 | NA | 3D打印、水凝胶合成、冻干、qPCR | NA | NA | NA | 3D打印 | NA | NA | 医学研究、合成生物学 |
| 94 | 2025-10-05 |
Creating a designer cyanobacterial ecosystem for the sustainable production of biomass rich in sun-protecting compounds: mycosporine-like amino acids and scytonemin
2025-Sep-04, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04450-9
PMID:40906293
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综述 | 探讨通过合成生物学方法构建特殊蓝藻生态系统以可持续生产富含紫外线防护化合物生物质的研究 | 提出通过基因和代谢工程优化蓝藻代谢途径的创新生物技术策略,提高紫外线防护化合物的产量 | 蓝藻中有益代谢物浓度通常很低,工业化生产经济可行性不足 | 开发可持续生产富含紫外线防护化合物生物质的蓝藻生态系统 | 蓝藻及其产生的甾醇霉素和类菌孢素氨基酸 | 合成生物学 | NA | 基因工程、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | 代谢途径优化 | 工业生物技术,材料,医药 |
| 95 | 2025-10-05 |
Multiview Deep Learning Framework for Precise Prediction of Transcription Factor Binding Sites
2025-Sep-22, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c01054
PMID:40914877
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研究论文 | 提出一种多视图深度学习框架MDNet-TFP,用于精确预测转录因子结合位点 | 开发了双向反向互补模块(BiRC-Mamba)和多尺度卷积循环注意力网络(MCRAN),能够有效建模DNA序列的双向特性和多维度特征 | NA | 提高转录因子结合位点预测的准确性 | DNA序列中的转录因子结合位点 | 生物信息学 | NA | ChIP-seq | 多视图深度学习, 双向反向互补模块, 多尺度卷积循环注意力网络 | DNA序列数据 | 165个ChIP-seq数据集(验证集)和690个ChIP-seq数据集(扩展测试集) | NA | NA | NA | 生物医学研究, 合成生物学 |
| 96 | 2025-10-05 |
Evo-Inspired Engineering of Radical Phenotypes and Emergent Traits
2025-Sep-13, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icaf107
PMID:40795044
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综述 | 探讨如何整合进化生物学见解与合成生物学技术来设计超越自然限制的全新细胞功能 | 提出将进化启示与高通量平台、人工智能工具结合,突破现有性状改造局限,开创合成生物学新前沿 | NA | 推动合成生物学从改造现有性状向设计全新细胞功能发展 | 极端适应表型、人工细胞、基因型-表型关系 | 合成生物学 | NA | 高通量平台、人工智能驱动设计工具 | NA | NA | NA | NA | 非传统模式系统 | 激进表型、涌现性状 | 生物经济 |
| 97 | 2025-10-05 |
Mechanisms, detection, and impact of horizontal gene transfer in plant functional evolution
2025-Sep-09, The Plant cell
DOI:10.1093/plcell/koaf195
PMID:40834228
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综述 | 探讨水平基因转移在植物功能进化中的机制、检测方法及其影响 | 系统揭示植物界微生物-植物和植物-植物间水平基因转移的普遍性,并提出结合合成生物学与实验进化的未来研究方向 | 依赖现有植物基因组数据,尚未完全揭示水平基因转移的全貌 | 阐明水平基因转移在植物进化中的机制与适应性意义 | 植物界的水平基因转移事件 | 进化生物学 | NA | 系统发育基因组学方法、原位测序 | NA | 基因组序列数据 | 数百个近期测序的植物基因组 | 合成生物学 | 植物 | NA | NA |
| 98 | 2025-10-05 |
The Rise of Mechanobiology for Advanced Cell Engineering and Manufacturing
2025-Sep, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202501640
PMID:40576525
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综述 | 探讨力学生物学在细胞工程和制造中的最新进展及其应用潜力 | 强调机械信号作为关键工具增强或替代传统可溶性因子的创新理念 | 当前制造路线在生产效率、安全性、监管、成本效益和可扩展性方面存在局限 | 推动细胞工程和制造技术的发展以满足细胞治疗和再生医学需求 | 诱导多能干细胞、嵌合抗原受体T细胞等治疗性细胞 | 合成生物学 | NA | 微纳米技术、生物材料设计、机械限制 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | NA | 医学 |
| 99 | 2025-10-05 |
Microbial therapeutics for cancer: emerging strategies and biomedical applications
2025-Sep-18, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc03618f
PMID:40891348
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综述 | 系统阐述工程化微生物在癌症治疗中的设计策略、功能优化及生物医学应用 | 整合合成生物学与纳米技术实现微生物的精准药物递送和时空调控功能 | 临床转化面临挑战,需要跨学科整合 | 开发基于工程微生物的下一代癌症治疗方法 | 工程化微生物及其在肿瘤治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因编辑、表面修饰 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 药物释放系统、免疫调节回路 | 医学 |
| 100 | 2025-10-05 |
Probiotic Bacteria as Therapeutics and Biohybrid Drug Carriers: Advances, Design Strategies, and Future Outlook
2025-Sep-15, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c00959
PMID:40888536
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综述 | 探讨益生菌作为药物递送平台的多样化策略及其在精准医疗中的应用前景 | 系统整合了益生菌作为生物杂交药物载体的多种工程化策略(包括细菌幽灵、外膜囊泡等),并重点探讨了与纳米颗粒系统的整合方法 | NA | 分析益生菌在靶向药物递送领域的最新进展和未来发展方向 | 益生菌及其工程化衍生物(细菌幽灵、外膜囊泡、孢子等) | 合成生物学 | 癌症, 胃肠道疾病 | 基因工程, 纳米技术, 合成生物学 | NA | NA | NA | 质粒表达, 基因组整合 | 益生菌 | 靶向治疗系统, 免疫调节系统, 刺激响应机制 | 医药 |