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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-05 |
PCR-Free Site-Directed Mutagenesis on Repetitive Sequences Using Single-Stranded DNA-Assisted Double-Stranded DNA Nicking by DNAzymes
2025-Sep-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202509127
PMID:40626944
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研究论文 | 开发了一种无需PCR的位点定向诱变方法,使用DNA切割脱氧核酶和单链DNA辅助实现对重复序列的突变操作 | 首次将DNA切割脱氧核酶的应用范围扩展到双链超螺旋质粒,无需PCR或限制性内切酶即可在重复序列上进行位点定向诱变 | NA | 开发一种能够处理重复序列的PCR-free位点定向诱变技术 | 含有PCR不兼容重复序列的质粒 | 合成生物学 | NA | DNA切割脱氧核酶技术,单链DNA辅助双链DNA切割 | NA | NA | NA | DNA切割脱氧核酶 | NA | 单链DNA辅助双链DNA切割系统(DANDA) | 生物技术, 生物化学 |
| 102 | 2025-10-05 |
Controlling complex rhythms: A hierarchical approach to limit cycle switching
2025-Sep-01, Chaos (Woodbury, N.Y.)
DOI:10.1063/5.0296708
PMID:40932349
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研究论文 | 本文提出一种分层控制方法,通过周期性调制实现非线性动力系统中极限环之间的可靠切换 | 开发了通过分层逐步周期性调制控制多节律性的方法,能够在保持系统其他特性的同时实现节律状态间的可靠切换 | NA | 研究非线性动力系统中极限环之间的分层动力学转变 | 非线性动力系统中的极限环和节律行为 | 动力系统理论 | NA | 周期性调制控制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 神经工程,合成生物学 |
| 103 | 2025-10-05 |
Spatial Organization of the Metabolic Pathway for Enhancing l-Fucose Biosynthesis in Engineered Escherichia coli
2025-Sep-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c06801
PMID:40853549
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研究论文 | 本研究通过空间组织策略优化工程大肠杆菌中l-岩藻糖的生物合成途径 | 采用无支架酶组装和工程蛋白质区室化两种空间组织策略,首次系统性地优化l-岩藻糖生物合成途径的空间构型 | NA | 通过合成空间组织提高微生物生物合成效率 | 工程大肠杆菌中的l-岩藻糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、多酶复合物组装、蛋白质区室化 | NA | NA | NA | RIAD-RIDD肽相互作用、DIX结构域 | 大肠杆菌 | l-岩藻糖生物合成途径,包含WbgL和AfcA关键酶的多酶复合物,代谢通量导向系统 | 工业生物技术 |
| 104 | 2025-10-05 |
STAGE: A compact and versatile TnpB-based genome editing toolkit for Streptomyces
2025-Sep-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509146122
PMID:40857323
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研究论文 | 开发基于TnpB的紧凑型基因组编辑工具包STAGE,用于链霉菌的高效基因编辑 | 使用尺寸仅为Cas9三分之一的ISDra2 TnpB开发基因组编辑工具,实现高效精确编辑并通过AI辅助蛋白工程获得近100%编辑效率的变体 | NA | 开发适用于链霉菌的高效基因组编辑工具 | 链霉菌菌株 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、AI辅助蛋白工程 | NA | NA | 两种工业重要链霉菌菌株 | CRISPR-TnpB, STAGE, STAGE-cBEST, STAGE-McBEST | 链霉菌 | 基因组编辑系统、碱基编辑系统 | 工业生物技术, 医药 |
| 105 | 2025-10-05 |
FluxRETAP: a REaction TArget Prioritization genome-scale modeling technique for selecting genetic targets
2025-Sep-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf471
PMID:40848245
|
研究论文 | 开发了一种基于基因组尺度模型的反应靶点优先排序技术FluxRETAP,用于选择遗传工程目标 | 结合机制性知识和机器学习流程,提供计算成本低廉的遗传靶点选择方法 | 需要依赖先前的生物学知识,不能完全独立使用机器学习方法 | 提高目标代谢物产量的遗传工程靶点选择 | 代谢工程中的遗传过表达、下调或删除靶点 | 机器学习 | NA | 基因组尺度建模 | NA | 代谢模型数据 | 在大肠杆菌和恶臭假单胞菌中验证 | NA | Escherichia coli, Pseudomonas putida | NA | 工业生物技术 |
| 106 | 2025-10-05 |
Parallel DLD microfluidics for chloroplast isolation and sorting
2025-Sep-09, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00348b
PMID:40497380
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研究论文 | 开发了一种基于确定性侧向位移(DLD)的微流控平台,用于实现叶绿体按尺寸分离 | 集成四个平行DLD阵列实现带通过滤,可在单一设备中同时分离不同尺寸的叶绿体 | 分离效率为50-85%,回收组分纯度为17-66%,仍有提升空间 | 解决传统叶绿体分离方法的技术挑战,开发快速自动化的分离平台 | 植物细胞叶绿体 | 微流控技术 | NA | 确定性侧向位移(DLD)微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 植物研究, 生物技术, 合成生物学 |
| 107 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-driven design and bioproduction of mechanical proteins
2025-Sep-09, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5bm00646e
PMID:40827630
|
综述 | 本文系统总结了结构蛋白异源生物合成的工程策略与最新进展 | 全面整合了表达宿主改造、分子设计创新和培养条件优化等关键方法 | NA | 推动高性能结构蛋白基生物材料的创新发展 | 重组结构蛋白 | 合成生物学 | NA | 异源生物合成 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 材料 |
| 108 | 2025-10-05 |
Engineering Motile Coacervate Droplets via Nanomotor Stabilization
2025-Sep-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c09366
PMID:40834351
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研究论文 | 本研究通过纳米马达稳定化技术开发了具有运动能力的凝聚层液滴人工细胞系统 | 首次实现了通过金纳米颗粒包覆的纳米马达与三元聚合物膜协同稳定凝聚层液滴,并赋予其光驱动运动能力 | NA | 开发具有运动功能的凝聚层基人工细胞系统 | 凝聚层液滴和纳米马达复合系统 | 合成生物学 | NA | 表面等离子体热效应 | NA | NA | NA | 纳米马达,三元聚合物膜 | 人工细胞系统 | 光驱动微马达平台 | 合成生物学,生物医学工程 |
| 109 | 2025-10-05 |
Isoprenoids in eukaryotic phytoplankton: Metabolic diversity, eco-physiology, and biotechnological opportunities
2025-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf314
PMID:40707021
|
综述 | 本文全面评估了真核浮游植物中异戊二烯类化合物的生物合成、调控机制及其生态生理功能和生物技术应用 | 系统比较了不同微藻类群中MEP和MVA途径的区室化差异,揭示了藻类特有的酶适应性和谱系特异性类胡萝卜素生物合成酶 | NA | 阐明真核浮游植物中异戊二烯类化合物的代谢多样性、生态生理功能和生物技术潜力 | 真核浮游植物(微藻)的异戊二烯类代谢系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微藻 | 异戊二烯类生物合成途径(MEP和MVA途径) | 生物技术,工业生物技术 |
| 110 | 2025-10-05 |
In vivo self-assembled siRNAs ameliorate neurological pathology in TDP-43-associated neurodegenerative disease
2025-Sep-08, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf330
PMID:40916343
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研究论文 | 本研究开发了一种基于合成生物学的体内自组装siRNA递送系统,用于改善TDP-43相关神经退行性疾病的神经病理 | 利用内源性小RNA加工机制自组装siRNA封装小细胞外囊泡,并通过宿主天然循环系统实现siRNA向中枢神经系统的递送 | 研究仅在小鼠模型中进行验证,尚未进行人体临床试验 | 开发治疗TDP-43相关神经退行性疾病的新型基因治疗方法 | TDP-43蛋白异常积累相关的肌萎缩侧索硬化症(ALS)和额颞叶变性(FTLD) | 合成生物学 | 神经退行性疾病 | siRNA技术,小细胞外囊泡(sEVs)递送,腺相关病毒(AAV)递送系统 | NA | NA | TDP-43病理小鼠模型 | 腺相关病毒(AAV) | 小鼠肝细胞 | 狂犬病毒糖蛋白(RVG)标记的小细胞外囊泡siRNA递送系统 | 医学 |
| 111 | 2025-10-05 |
Heavy metals toxicity in plants: understanding mechanisms and developing coping strategies for remediation: a review
2025-Sep-04, Bioresources and bioprocessing
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s40643-025-00930-4
PMID:40906247
|
综述 | 本文综述重金属对植物的毒性机制及基于自然的生物修复策略 | 系统整合分子耐受机制与新型生物修复技术,强调合成生物学在增强修复效率中的应用 | 未涉及具体田间应用的规模化挑战和长期生态影响评估 | 探讨重金属毒性机制及开发可持续环境修复策略 | 受重金属污染的植物及修复生物(植物、微生物) | 环境生物技术 | NA | 分子生物学、合成生物学、遗传工程 | NA | 文献数据 | NA | 遗传工程 | 超富集植物物种、耐金属微生物 | NA | 环境 |
| 112 | 2025-10-05 |
Current advances and emerging prospects of specifically targeted antimicrobial peptides: A comprehensive review
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147037
PMID:40848790
|
综述 | 全面总结特异性靶向抗菌肽(STAMPs)的最新研究进展,包括其结构、抗菌活性、设计策略、应用领域及未来展望 | 系统阐述STAMPs的靶向-连接-杀伤三域结构设计理念及其精准消除特定病原体的创新机制 | 未明确提及具体实验数据或临床研究案例 | 探讨STAMPs作为精准抗菌策略的开发与应用前景 | 特异性靶向抗菌肽(STAMPs) | 合成生物学 | NA | 计算机辅助设计(CAD) | NA | 文献资料 | NA | NA | NA | 靶向-连接-杀伤三域结构设计 | 临床医学, 农业, 生物材料, 食品保鲜 |
| 113 | 2025-10-05 |
Bioprinting and synthetic biology approaches to engineer functional endocrine pancreatic constructs
2025-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.03.005
PMID:40185667
|
综述 | 本文探讨了生物打印和合成生物学在构建功能性内分泌胰腺组织中的最新进展 | 将合成生物学、细胞工程与生物打印技术相结合,为开发先进体外模型和可移植移植物开辟新途径 | NA | 开发能够模拟器官功能的内分泌胰腺组织构建体,为糖尿病治疗提供新方案 | 内分泌胰腺组织构建体 | 组织工程 | 糖尿病 | 生物打印 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 114 | 2025-10-05 |
Bottom-up development of lipid-based synthetic cells for practical applications
2025-Sep, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.03.009
PMID:40263003
|
综述 | 全面概述自下而上构建脂质基合成细胞的当前技术状态及其实际应用前景 | 系统总结了从概念验证到实际应用过渡阶段的关键设计原则、材料和制造技术 | NA | 推动合成细胞技术从概念验证向实际应用转化 | 脂质基合成细胞 | 合成生物学 | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物递送, 生物传感器, 生物生产, 疫苗开发, 环境修复 |
| 115 | 2025-10-05 |
A discovery platform for identification of host-induced bacterial biosensors from diverse sources
2025-Sep, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00123-3
PMID:40490500
|
研究论文 | 开发了一种基于细菌记忆电路的生物传感器筛选平台,用于从多种肠道细菌中识别宿主诱导的生物传感器 | 使用超变DNA条形码并行追踪数千个独特克隆,扩展了生物传感器筛选平台的灵活性和能力 | 肠道内感知健康和疾病相关条件的特征化电路组件仍然有限 | 促进快速生物传感器工程,推进复杂环境中合成生物学工具的开发 | 肠道细菌来源的传感组件和生物传感器 | 合成生物学 | 炎症性疾病 | 双组分系统识别和克隆流程,超变DNA条形码标记 | NA | NA | 约150个推定的生物传感器,数千个独特克隆 | 细菌记忆电路 | 肠道细菌,小鼠模型 | 双组分系统,生物传感器,感应-响应治疗 | 医学,临床研究 |
| 116 | 2025-10-05 |
The Global Decarbonisation Potential of Synthetic Biology
2025-Sep, Global change biology
IF:10.8Q1
DOI:10.1111/gcb.70478
PMID:40905760
|
综述 | 评估合成生物学技术在实现全球脱碳目标方面的潜力及其量化分析 | 采用自上而下的方法量化不同合成生物学应用的脱碳潜力,并首次系统比较各技术路径对碳价格和土地价格的敏感性 | 采用宏观层面的估算方法,未涉及具体技术实施细节和区域差异性分析 | 评估合成生物学技术对气候变化减缓的长期贡献潜力 | 合成生物学在能源、农业、工业等领域的脱碳应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境, 农业, 工业, 能源 |
| 117 | 2025-10-05 |
Construction of complex bacteriogenic protocells from living material assembly
2025-Sep, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01148-6
PMID:40044914
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研究论文 | 提出利用原核生物作为构建模块制备细菌源原细胞的新方法 | 开发基于空间分离细菌菌落捕获的活材料组装策略,构建具有高复杂度的膜结合合成细胞 | 实验周期较长(约27天),需要微生物学、相分离、生物化学和分子生物学等多领域专业知识 | 构建具有高度组织和功能复杂度的类生命合成细胞 | 细菌源原细胞 | 合成生物学 | NA | 相分离、微生物培养、分子生物学技术 | NA | NA | NA | 活材料组装 | 原核生物 | 具有多种原始细胞器的合成细胞结构,包括核样DNA/组蛋白凝聚体、膜结合水泡、F-肌动蛋白原细胞骨架和原线粒体 | 工程合成生物学, 生物医学 |
| 118 | 2025-10-05 |
Current advancements in the investigation of mitochondria-targeting organic sensitizers in cancer immunotherapy
2025-Sep-05, Biomaterials science
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5bm01193k
PMID:40910367
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综述 | 系统总结线粒体靶向有机敏化剂在癌症免疫治疗中的最新研究进展 | 聚焦2023-2025年新兴的线粒体靶向有机敏化剂,揭示其通过破坏线粒体稳态诱导多种程序性细胞死亡并协调抗肿瘤免疫应答的创新机制 | 存在线粒体靶向效率受跨膜转运和肿瘤微环境pH波动影响、金属有机复合物非特异性金属离子释放的全身毒性风险、长期生物相容性评估不足、以及主要依赖简化肿瘤模型未能充分反映临床异质性等问题 | 探讨线粒体靶向有机敏化剂在癌症免疫治疗中的应用潜力 | 线粒体靶向有机敏化剂及其介导的免疫调节机制 | 癌症免疫治疗 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 119 | 2025-10-05 |
Structural basis of the RNA-mediated Retron-Eco2 oligomerization
2025-Sep-02, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00823-y
PMID:40897710
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研究论文 | 本研究揭示了Retron-Eco2抗噬菌体防御系统的结构与功能机制 | 首次解析了Retron-Eco2形成自抑制性三聚体组装的分子机制,并发现其效应结构域具有RNase活性 | NA | 阐明Retron-Eco2抗噬菌体防御系统的结构与功能机制 | Retron-Eco2复合物(包含ncRNA、msDNA和RT-Toprim融合蛋白) | 结构生物学 | NA | 结构生物学分析 | NA | 结构数据 | NA | NA | 细菌 | 抗噬菌体防御系统 | 生物技术,合成生物学 |
| 120 | 2025-10-05 |
AlphaDesign: a de novo protein design framework based on AlphaFold
2025-Sep, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00119-z
PMID:40527958
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研究论文 | 介绍基于AlphaFold的从头蛋白质设计框架AlphaDesign,能够快速生成具有可控相互作用、构象和寡聚状态的蛋白质 | 将AlphaFold与自回归扩散模型相结合,无需类别依赖的模型重新训练或微调即可实现蛋白质设计 | NA | 开发通用的从头蛋白质设计框架 | 蛋白质设计与细菌噬菌体防御系统抑制剂 | 合成生物学 | NA | 自回归扩散模型 | AlphaFold, 扩散模型 | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |