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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-10-05 |
Development and Recent Advances in SLIPT-PM: A Chemogenetic Platform for Manipulating Signaling at the Plasma Membrane
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500327
PMID:40400158
|
综述 | 本文回顾了SLIPT-PM化学遗传平台的发展历程、主要特性及其在细胞信号操控中的应用 | 开发了基于自定位配体的蛋白质易位技术,能够可逆且重复地操控细胞内膜信号传导 | NA | 开发用于解析细胞信号网络和工程化细胞功能的化学遗传工具 | 细胞信号蛋白和脂质 | 合成生物学 | NA | SLIPT(自定位配体诱导蛋白易位) | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞, 大肠杆菌 | 蛋白质易位系统,光诱导空间调控蛋白招募,多重信号操控 | 医学 |
| 102 | 2025-10-05 |
Engineering Proteinosomes with Cellular-Like Functionalities
2025-Sep-12, Chembiochem : a European journal of chemical biology
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/cbic.202500448
PMID:40810682
|
综述 | 本文综述了蛋白质体作为仿生结构在模拟细胞功能方面的研究进展,包括构建方法、功能化策略及其在人工细胞模型和生物医学应用中的潜力 | 详细阐述了通过界面自组装、聚合物膜模板和混合脂质-聚合物系统构建具有可调渗透性、机械稳定性和刺激响应行为的蛋白质体,并强调了其在构建原型组织方面的创新 | NA | 探索蛋白质体作为人工细胞模型的构建方法和功能化策略 | 蛋白质体及其仿生结构 | 合成生物学 | 癌症 | 界面自组装、聚合物膜模板、混合脂质-聚合物系统 | NA | NA | NA | NA | NA | 刺激响应材料、多室结构、原型组织构建 | 医学 |
| 103 | 2025-10-05 |
CAR-T cells in solid tumors: Challenges and breakthroughs
2025-Sep-12, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102353
PMID:40945517
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综述 | 本文探讨CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中面临的挑战及突破性进展 | 整合合成生物学与基因工程技术开发新一代CAR-T疗法,增强细胞适应性、靶向能力和抗肿瘤效果 | 现有临床前模型(如免疫缺陷小鼠异种移植模型)在评估疗效和安全性方面存在局限性 | 克服CAR-T细胞在实体瘤治疗中的障碍并推动临床应用 | CAR-T细胞疗法及其在实体瘤中的应用 | NA | 实体瘤 | 合成生物学,基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | 多抗原靶向系统,肿瘤微环境重编程 | 医学 |
| 104 | 2025-10-05 |
From marsh to market: taming Vibrio natriegens for sustainable bioproduction
2025-Sep-11, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103353
PMID:40945411
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综述 | 本文探讨了利用天然最快生长细菌Vibrio natriegens作为生物技术底盘实现可持续生物生产的发展前景 | 提出通过系统生物技术方法结合菌株与工艺工程,优化Vibrio natriegens用于可扩展的新一代生物制造 | 在实现高产品产量和处理难降解底物方面仍存在重要限制 | 开发Vibrio natriegens作为可持续生物生产的生物技术底盘 | Vibrio natriegens细菌及其生物合成能力 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、系统水平分析 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | Vibrio natriegens | 代谢途径工程 | 工业生物技术 |
| 105 | 2025-10-05 |
Peptide Coacervates Can Protect Sequestered Oligonucleotides from Nucleases and Release Them for Transcription and Translation
2025-Sep-08, Biomacromolecules
IF:5.5Q1
DOI:10.1021/acs.biomac.5c00600
PMID:40802871
|
研究论文 | 本文证明肽凝聚层可通过液-液相分离形成无膜细胞器,有效隔离并保护短DNA报告基因和功能性荧光素酶基因免受多种核酸酶降解 | 发现基于聚组氨酸肽与ATP静电相互作用的关联性凝聚层能高效保护寡核苷酸,并可通过离子强度或温度变化实现可控释放 | 基于黏附-间隔模型肽的简单凝聚层保护效果有限 | 开发能够保护和可控释放功能性遗传物质的生物相容性递送系统 | 短DNA报告基因和功能性荧光素酶基因 | 合成生物学 | NA | 无细胞转录翻译系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 106 | 2025-10-05 |
Expanding Immunotherapy Beyond CAR T Cells: Engineering Diverse Immune Cells to Target Solid Tumors
2025-Sep-05, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17172917
PMID:40941014
|
综述 | 本文综述了除CAR-T细胞外多种工程化免疫细胞在实体瘤治疗中的最新进展 | 探讨γδ T细胞、iNKT细胞、病毒特异性T细胞、NK细胞及髓系效应细胞等作为CAR平台替代方案的独特优势 | NA | 扩展细胞免疫疗法在实体瘤治疗中的应用范围 | 工程化免疫细胞(γδ T细胞、iNKT细胞、NK细胞、巨噬细胞、树突状细胞等) | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | CAR工程技术 | 人类免疫细胞 | 嵌合抗原受体(CAR)设计 | 医学 |
| 107 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology-Based Heterologous Expression and Purification of Enterocin A: Advancing Antimicrobial Peptide Applications
2025-Sep-12, Molecular nutrition & food research
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/mnfr.70260
PMID:40936353
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法异源表达和纯化肠球菌素A,开发了一种生产抗菌肽的有效策略 | 首次从头设计合成完整的肠球菌素A基因盒,建立从包涵体高效回收活性抗菌肽的优化工艺 | 表达产物主要形成包涵体,需要复杂的变复性过程 | 开发替代抗生素的新型抗菌策略 | 肠球菌素A及其对多重耐药病原菌的抗菌活性 | 合成生物学 | 细菌感染 | 基因合成,PCR,DNA测序,Ni-NTA亲和层析 | NA | NA | 5种病原菌:金黄色葡萄球菌ATCC 25923、铜绿假单胞菌ATCC 27853、鲁氏不动杆菌GPE 3002、藤黄微球菌GPE 3001、蜡样芽孢杆菌GPE 3003 | Gibson Assembly | 大肠杆菌BL21(DE3) | 包含功能调控元件和N端His标签的肠球菌素A基因盒 | 医药,食品 |
| 108 | 2025-10-05 |
Engineering Conditional Transgene Expression in Nicotiana benthamiana
2025-Sep-12, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70350
PMID:40937882
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研究论文 | 本文综述了在本氏烟草中构建条件性转基因表达系统的合成生物学策略 | 开发了响应化学和电磁信号的新型传感器系统、与可编程转录因子整合的合成启动子、基于重组酶的处理器以及病毒衍生复制子 | 存在转基因沉默、产量低和代谢毒性等限制可扩展性的挑战 | 实现本氏烟草中转基因的精确表达控制和代谢途径优化 | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成生物学 | NA | CRISPR系统、病毒衍生复制子、重组酶技术 | NA | NA | NA | CRISPR | 本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成基因电路、传感器系统、合成启动子、逻辑门、生物传感器 | 农业,工业生物技术,环境 |
| 109 | 2025-10-05 |
Development of a modified RNA circularization system to improve circRNA-based protein expression in mammalian cells
2025-Sep-11, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080733.125
PMID:40935594
|
研究论文 | 开发了一种改进的RNA环化系统,显著提高哺乳动物细胞中基于环状RNA的蛋白质表达 | 通过优化IRES与CMV启动子间距、揭示HRV-B3 IRES的双重功能、整合HIV-1 LTR和WPRE元件来增强Tornado系统的环化效率和转录效率 | NA | 开发新型策略增强哺乳动物细胞中RNA环化效率 | 环状RNA在哺乳动物细胞中的蛋白质表达系统 | 合成生物学 | NA | RNA环化技术 | NA | 分子生物学数据 | NA | Tornado系统 | 哺乳动物细胞 | 改进的RNA环化系统,包含IRES、CMV启动子、HIV-1 LTR和WPRE调控元件 | 医学 |
| 110 | 2025-10-05 |
The growth benefits and toxicity of quinone biosynthesis are balanced by a dual regulatory mechanism and substrate limitations
2025-Sep-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.00887-25
PMID:40788026
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸菌中醌类前体DHNA生物合成的双相调控机制及其与底物限制的协同作用 | 发现MenF和MenD酶通过可逆通量和变构反馈抑制形成双相调控模式,并首次阐明底物可用性对DHNA过量生产的限制作用 | 研究聚焦于乳酸菌中的DHNA调控机制,在其他微生物中的普适性仍需验证 | 阐明微生物调控醌类水平的分子机制,为代谢工程改造微生物生产醌类提供理论基础 | 乳酸菌中醌类前体1,4-二羟基-2-萘甲酸(DHNA)的生物合成调控机制 | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法、数学模型 | 数学模型 | 酶活性数据、代谢通量数据 | NA | 合成生物学方法 | 乳酸菌 | 醌类生物合成途径调控网络 | 工业生物技术 |
| 111 | 2025-10-05 |
Advancing biomaterial innovation for tissue engineering through microbial synthetic biology: A review
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146771
PMID:40803465
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综述 | 本文综述了微生物合成生物学在组织工程生物材料创新中的应用与前景 | 系统阐述了利用工程化微生物生产生物材料的新策略及其在组织工程中的创新应用 | 面临技术挑战,具体限制未详细说明 | 探讨微生物合成生物学在组织工程生物材料开发中的应用 | 工程化微生物及其生产的生物材料 | 合成生物学 | NA | 微生物基因组改造、代谢调控 | NA | NA | NA | NA | 多种微生物宿主 | 代谢途径工程 | 医学 |
| 112 | 2025-10-05 |
Analog epigenetic memory revealed by targeted chromatin editing
2025-Sep-09, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100985
PMID:40930103
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研究论文 | 通过靶向染色质编辑揭示模拟表观遗传记忆机制 | 首次证明染色质修饰可维持连续梯度基因表达水平,揭示模拟表观遗传记忆的存在 | 未明确说明实验模型系统的具体局限性 | 探索染色质修饰如何维持不同基因表达状态 | DNA甲基化与组蛋白修饰的表观遗传调控系统 | 合成生物学 | NA | 靶向染色质编辑、表观遗传效应器工程 | 染色质修饰模型 | 基因表达动态数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 基因组报告系统与表观遗传效应器 | 合成生物学 |
| 113 | 2025-10-05 |
Hybrid AI in synthetic biology: next era in agriculture
2025-Sep-09, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.08.011
PMID:40930858
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研究论文 | 本文探讨混合人工智能在合成生物学农业应用中的潜力与挑战 | 提出混合AI方法能更有效处理多组学复杂性,实现气候智能型高产量作物设计 | 需要清晰流程、精选数据集和自动化平台才能充分发挥潜力 | 利用混合AI技术推动合成生物学在农业领域的应用发展 | 多基因组、多性状和多环境数据驱动的作物工程 | 合成生物学 | NA | 多组学数据分析 | 混合AI | 多组学数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 作物植物 | 复杂基因网络 | 农业 |
| 114 | 2025-10-05 |
Food production from air: gas precision fermentation with hydrogen-oxidising bacteria
2025-Sep-09, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.08.003
PMID:40930898
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综述 | 本文探讨利用氢氧化细菌通过气体发酵从空气中生产食品的可持续方法 | 提出将氢氧化细菌工程化为细胞工厂进行精密发酵,超越传统单细胞蛋白生产 | NA | 开发不依赖农业的可持续食品生产技术 | 氢氧化细菌及其工程化应用 | 合成生物学 | NA | 气体发酵、合成生物学、代谢工程、计算建模 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 氢氧化细菌 | 细胞工厂设计、重组蛋白分泌系统 | 食品, 工业生物技术 |
| 115 | 2025-10-05 |
PCR-Free Site-Directed Mutagenesis on Repetitive Sequences Using Single-Stranded DNA-Assisted Double-Stranded DNA Nicking by DNAzymes
2025-Sep-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202509127
PMID:40626944
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研究论文 | 开发了一种无需PCR的位点定向诱变方法,使用DNA切割脱氧核酶和单链DNA辅助实现对重复序列的突变操作 | 首次将DNA切割脱氧核酶的应用范围扩展到双链超螺旋质粒,无需PCR或限制性内切酶即可在重复序列上进行位点定向诱变 | NA | 开发一种能够处理重复序列的PCR-free位点定向诱变技术 | 含有PCR不兼容重复序列的质粒 | 合成生物学 | NA | DNA切割脱氧核酶技术,单链DNA辅助双链DNA切割 | NA | NA | NA | DNA切割脱氧核酶 | NA | 单链DNA辅助双链DNA切割系统(DANDA) | 生物技术, 生物化学 |
| 116 | 2025-10-05 |
Controlling complex rhythms: A hierarchical approach to limit cycle switching
2025-Sep-01, Chaos (Woodbury, N.Y.)
DOI:10.1063/5.0296708
PMID:40932349
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研究论文 | 本文提出一种分层控制方法,通过周期性调制实现非线性动力系统中极限环之间的可靠切换 | 开发了通过分层逐步周期性调制控制多节律性的方法,能够在保持系统其他特性的同时实现节律状态间的可靠切换 | NA | 研究非线性动力系统中极限环之间的分层动力学转变 | 非线性动力系统中的极限环和节律行为 | 动力系统理论 | NA | 周期性调制控制 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 神经工程,合成生物学 |
| 117 | 2025-10-05 |
Spatial Organization of the Metabolic Pathway for Enhancing l-Fucose Biosynthesis in Engineered Escherichia coli
2025-Sep-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c06801
PMID:40853549
|
研究论文 | 本研究通过空间组织策略优化工程大肠杆菌中l-岩藻糖的生物合成途径 | 采用无支架酶组装和工程蛋白质区室化两种空间组织策略,首次系统性地优化l-岩藻糖生物合成途径的空间构型 | NA | 通过合成空间组织提高微生物生物合成效率 | 工程大肠杆菌中的l-岩藻糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、多酶复合物组装、蛋白质区室化 | NA | NA | NA | RIAD-RIDD肽相互作用、DIX结构域 | 大肠杆菌 | l-岩藻糖生物合成途径,包含WbgL和AfcA关键酶的多酶复合物,代谢通量导向系统 | 工业生物技术 |
| 118 | 2025-10-05 |
The oxidative rearrangements in bacterial aromatic polyketide biosynthesis
2025-Sep-10, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00049a
PMID:40927919
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综述 | 系统阐述细菌芳香聚酮化合物生物合成中氧化重排反应的关键作用及机制 | 首次全面总结氧化重排反应在细菌芳香聚酮生物合成中的多样性催化机制,揭示黄素依赖单加氧酶、酮还原酶和双加氧酶等酶的创新催化功能 | NA | 阐明天然酶如何利用氧化还原化学在细菌芳香聚酮生物合成中构建新碳骨架 | 细菌芳香聚酮化合物的生物合成途径及相关氧化重排酶 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医药,合成生物学 |
| 119 | 2025-10-05 |
STAGE: A compact and versatile TnpB-based genome editing toolkit for Streptomyces
2025-Sep-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2509146122
PMID:40857323
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研究论文 | 开发基于TnpB的紧凑型基因组编辑工具包STAGE,用于链霉菌的高效基因编辑 | 使用尺寸仅为Cas9三分之一的ISDra2 TnpB开发基因组编辑工具,实现高效精确编辑并通过AI辅助蛋白工程获得近100%编辑效率的变体 | NA | 开发适用于链霉菌的高效基因组编辑工具 | 链霉菌菌株 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、AI辅助蛋白工程 | NA | NA | 两种工业重要链霉菌菌株 | CRISPR-TnpB, STAGE, STAGE-cBEST, STAGE-McBEST | 链霉菌 | 基因组编辑系统、碱基编辑系统 | 工业生物技术, 医药 |
| 120 | 2025-10-05 |
FluxRETAP: a REaction TArget Prioritization genome-scale modeling technique for selecting genetic targets
2025-Sep-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf471
PMID:40848245
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研究论文 | 开发了一种基于基因组尺度模型的反应靶点优先排序技术FluxRETAP,用于选择遗传工程目标 | 结合机制性知识和机器学习流程,提供计算成本低廉的遗传靶点选择方法 | 需要依赖先前的生物学知识,不能完全独立使用机器学习方法 | 提高目标代谢物产量的遗传工程靶点选择 | 代谢工程中的遗传过表达、下调或删除靶点 | 机器学习 | NA | 基因组尺度建模 | NA | 代谢模型数据 | 在大肠杆菌和恶臭假单胞菌中验证 | NA | Escherichia coli, Pseudomonas putida | NA | 工业生物技术 |