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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-10-05 |
Guns 'N Roses: Fungal Volatile Warfare in Postharvest Disease Control
2025-Sep, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
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综述 | 本文综述真菌挥发性有机物在采后病害生物防治中的化学多样性、作用机制及应用前景 | 系统探讨真菌挥发性有机物作为生物熏蒸剂的潜力,并提出通过定向诱变、合成生物学和人工智能提升防治效率的新方向 | NA | 开发基于真菌挥发性有机物的环保型采后病害生物防治策略 | 真菌挥发性有机物及其与病原菌、农产品的相互作用 | 农业生物技术 | 采后病害 | 生物熏蒸、定向诱变、合成生物学、人工智能分析化学 | NA | NA | NA | NA | 真菌 | NA | 农业 |
| 122 | 2025-10-05 |
Enhanced phenanthrene degradation by a synthetically engineered E. coli consortium utilizing the SCRaMbLE for the evolution of key genes
2025-Sep-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139152
PMID:40628214
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研究论文 | 本研究开发了一种合成大肠杆菌菌群,通过SCRaMbLE方法进化关键基因,显著增强了菲的降解效率 | 首次将SCRaMbLE方法应用于合成菌群的工程化改造,通过模块化设计和实验室进化协同提升多环芳烃降解能力 | 研究仅在实验室条件下验证,未在真实环境污染物中测试 | 开发高效降解菲的合成微生物菌群,用于环境生物修复 | 工程化大肠杆菌BL21(DE3)菌群及其对菲的降解能力 | 合成生物学 | NA | SCRaMbLE, 实验室进化 | NA | NA | 三种工程化大肠杆菌菌株,在含100mg/L菲的最小盐培养基中测试 | SCRaMbLE, pET-28(a)质粒 | 大肠杆菌BL21(DE3) | 模块化代谢通路,包含17个菲降解关键基因,分为三个独立功能模块 | 环境 |
| 123 | 2025-10-05 |
Plant cytochrome P450 enzymes for bioactive metabolites biosynthesis, growth regulation, and stress adaptation
2025-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf297
PMID:40623215
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综述 | 本文综述了植物细胞色素P450酶在生物活性代谢物合成、生长调控和胁迫适应中的最新研究进展 | 聚焦2020-2025年最新研究进展,系统阐述CYPs在植物重要生物活性化合物合成及其生理功能中的关键作用 | 仅涵盖近五年研究进展,且目前仅有不到0.2%的CYPs完成功能表征 | 增强对植物CYPs功能的理解,为生物技术育种和合成生物学领域的创新应用提供基础 | 植物细胞色素P450酶(CYPs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | 数据库记录超过300,000个CYPs | NA | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 124 | 2025-10-05 |
Endosymbionts as hidden players in tripartite pathosystem of interactions and potential candidates for sustainable viral disease management
2025-Sep, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2449403
PMID:39848650
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综述 | 探讨内共生菌在植物-病毒-媒介昆虫三方互作系统中的作用及其在可持续病毒病害管理中的潜力 | 系统阐述内共生菌通过调控宿主反应、影响杀虫剂抗性和病毒传播等机制参与三方互作,并提出利用基因工程改造内共生菌的创新病害控制策略 | NA | 阐明内共生菌在植物病毒病害传播中的作用机制并探索可持续管理策略 | 植物-病毒-节肢动物媒介的三方互作系统及其内共生菌 | 植物病理学 | 植物病毒病 | 基因改造、生物技术、RNA干扰、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 节肢动物媒介 | NA | 农业 |
| 125 | 2025-10-05 |
DASH: a versatile and high-capacity gene stacking system for plant synthetic biology
2025-Sep, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70179
PMID:40493021
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研究论文 | 本研究开发了一种名为DASH的高容量基因堆叠系统,用于植物合成生物学应用 | 结合了Golden Gate克隆、重组工程和位点特异性重组酶系统的特点,解决了现有DNA组装系统的多个限制 | NA | 开发一种高容量且多功能的基因组装系统,用于植物合成生物学 | 基因组装系统和植物合成生物学工具 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、重组工程、位点特异性重组 | NA | DNA序列数据 | NA | GoldenBraid, PhiC31整合酶, FLP重组酶, CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 基因堆叠系统,包含35个转录单元的97kb货物DNA | 农业 |
| 126 | 2025-10-05 |
Engineered Microbial-Based Therapeutics Nose No Bounds: Extending Innovation to Rhinologic Disease Management
2025-Sep, International forum of allergy & rhinology
IF:7.2Q1
DOI:10.1002/alr.23619
PMID:40825097
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综述 | 探讨合成生物学在鼻科疾病治疗中应用工程化微生物的前景 | 首次系统提出利用鼻腔天然微生物生态系统开发工程化治疗菌株的创新策略 | 该治疗模式在鼻科疾病领域尚未充分探索,缺乏临床实践验证 | 开发针对鼻窦疾病的靶向可控精准疗法 | 鼻腔黏膜天然微生物生态系统及工程化治疗细菌 | 合成生物学 | 鼻窦疾病 | 微生物工程 | NA | NA | NA | NA | 鼻腔天然微生物 | 局部微生物群调节和免疫调节回路 | 医学 |
| 127 | 2025-10-05 |
Protease engineering: Approaches, tools, and emerging trends
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108602
PMID:40368116
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综述 | 本文系统阐述了蛋白酶工程的方法、工具及新兴趋势,重点关注通过定向进化等技术调控蛋白酶活性与特异性的策略 | 涵盖了抗体-蛋白酶融合介导的邻近催化、外源蛋白互作驱动的特异性转换等新兴工程策略,以及分裂蛋白酶和自抑制蛋白酶的设计原理 | NA | 总结蛋白酶工程的最新进展,重点介绍实现蛋白酶活性和特异性精确控制的方法学 | 蛋白酶工程策略与工具 | 合成生物学 | NA | 定向进化、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酵母, 噬菌体, 无细胞系统 | 分裂蛋白酶电路, 自抑制蛋白酶模块, 蛋白质信号处理电路 | 生物医学, 蛋白质组学, 化学与合成生物学 |
| 128 | 2025-10-05 |
Engineering genetic circuits for dynamic control of central metabolism
2025-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.06.007
PMID:40532756
|
研究论文 | 本研究开发了响应丙酮酸的PdhR生物传感器系统,用于动态调控中心代谢的代谢通量分布 | 建立了可响应中心代谢物丙酮酸的生物传感器系统,突破了传统遗传工具对特定途径的依赖,实现了对中心代谢通量的动态调控 | NA | 开发能够动态调控中心代谢通量的遗传电路,提高微生物细胞工厂中目标化合物的生物合成效率 | PdhR生物传感器系统及其在海藻糖和4-羟基香豆素生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 生物传感器表征、计算分析、定点突变 | NA | NA | NA | 生物传感器、定点突变 | 微生物细胞工厂 | 丙酮酸响应型生物传感器系统,动态调控代谢通量分布 | 工业生物技术 |
| 129 | 2025-10-05 |
Applications and prospects of synthetic receptors for therapeutic protein delivery
2025-Sep, European journal of pharmaceutics and biopharmaceutics : official journal of Arbeitsgemeinschaft fur Pharmazeutische Verfahrenstechnik e.V
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.ejpb.2025.114789
PMID:40553909
|
综述 | 本文综述了合成受体在治疗性蛋白质递送中的应用类型、特征及生物医学前景 | 系统归纳了GPCR受体系统、MESA、synNotch受体和SNIPRs等新型合成受体在蛋白质递送领域的创新应用 | 存在安全性问题、递送效率欠佳以及受体设计与优化复杂等挑战 | 探讨合成受体在治疗性蛋白质递送中的应用现状与发展前景 | 合成受体及其递送的 therapeutic proteins | 合成生物学 | 肿瘤、炎症性免疫疾病、中枢神经系统疾病、关节病、病毒感染 | 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | G蛋白偶联受体系统、模块化胞外传感架构、合成Notch受体、合成膜内蛋白水解受体 | 医学 |
| 130 | 2025-10-05 |
Improved biosynthesis of C4 derivatives by engineered thiolase
2025-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.05.001
PMID:40320002
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研究论文 | 本研究开发了一种利用大肠杆菌从乙二醇生物合成四碳化合物的新型代谢途径 | 通过定向进化技术改良了关键酶CnBktB的催化效率,并首次实现了从PET降解产物乙二醇直接合成高价值四碳化合物 | NA | 开发从C2前体高效生物合成四碳化合物的可持续路线 | 1,4-丁二醇、1,2,4-丁三醇和琥珀酸等四碳化合物 | 合成生物学 | NA | 定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA | 定向进化 | 大肠杆菌 | 新型代谢途径,包含乙二醇转化模块和四碳化合物合成模块 | 环境,工业生物技术 |
| 131 | 2025-10-05 |
Myxobacteria: Versatile cell factories of novel commercial enzymes for bio-manufacturing
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108594
PMID:40345460
|
综述 | 本文综述了黏细菌作为新型商业酶生产细胞工厂的潜力及其在生物制造中的应用 | 系统阐述了黏细菌这一未被充分开发的微生物资源在工业酶生产中的独特优势和应用前景 | 黏细菌存在遗传工程困难、生长缓慢、代谢改造和表达策略受限等技术挑战 | 探讨黏细菌作为工业细胞工厂的开发潜力和生物制造应用 | 黏细菌及其产生的天然产物和裂解酶 | 工业生物技术 | NA | 生物勘探、计算方法、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 黏细菌 | NA | 农业,工业 |
| 132 | 2025-10-05 |
Construction of a synthetic biology toolkit for the genetic manipulation in the cellulose-producing strain Kosakonia oryzendophytica
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.012
PMID:40529626
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研究论文 | 开发了针对高产细菌纤维素菌株Kosakonia oryzendophytica的合成生物学工具包 | 首次在该底盘菌中系统表征调控元件库并建立高效CRISPR/Cas9无疤痕基因组编辑系统 | NA | 构建用于遗传操作的合成生物学工具包以开发新一代纤维素基功能材料 | Kosakonia oryzendophytica菌株及其细菌纤维素合成机制 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因组编辑、λ Red重组、扫描电子显微镜 | NA | 基因表达数据、显微镜图像 | NA | CRISPR-Cas9, λ Red重组系统 | Kosakonia oryzendophytica | 可调表达模块(启动子、核糖体结合位点、终止子)和精确基因组编辑系统 | 材料, 工业生物技术 |
| 133 | 2025-10-05 |
Addressing semantic ambiguity in biotechnology: Proposals from the European research infrastructure IBISBA
2025-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.04.010
PMID:40280273
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讨论论文 | 分析生物技术领域术语的语义模糊性问题并提出定义统一建议 | 首次系统分析生物技术领域核心术语的语义模糊性并提出标准化定义方案 | 属于概念性讨论论文,缺乏实证研究数据支持 | 解决生物技术领域术语定义不统一的问题 | 生物技术、生物制造、工程生物学和合成生物学等核心术语 | NA | NA | NA | NA | 文本分析 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 134 | 2025-10-05 |
MutS-mediated rapid and cost-effective error correction in in vitro DNA synthesis
2025-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.05.002
PMID:40447215
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于MutS蛋白的快速、低成本体外DNA合成纠错方法 | 构建了十一种Cbm3-Egfp-MutS融合蛋白,发现TaMutS和TtMutS具有热稳定性并能有效识别错配DNA,建立了使用自制无定形纤维素旋转柱和过滤吸头的简单纠错方法 | NA | 开发简单、经济、高效的DNA合成纠错方法 | DNA寡核苷酸和较长目标分子 | 合成生物学 | NA | 蛋白质重组表达与纯化,异源双链DNA结合分析 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 135 | 2025-10-05 |
From reactants to products: computational methods for biosynthetic pathway design
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.005
PMID:40510533
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综述 | 本文综述了生物合成路径设计中的关键计算方法,包括生物大数据、逆合成方法和酶工程 | 整合生物大数据、逆合成方法和酶工程三个关键组件来提升生物合成路径设计的效率和准确性 | NA | 提高生物合成路径设计的效率和准确性 | 生物合成路径设计计算方法 | 合成生物学 | NA | 数据挖掘、逆合成分析、酶工程设计 | NA | 化合物、反应/路径、酶数据 | NA | NA | NA | 生物合成路径 | 工业生物技术 |
| 136 | 2025-10-05 |
Tryptophan-producing bacteria to mitigate osteoporosis and intestinal dysfunction
2025-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.05.013
PMID:40487243
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研究论文 | 通过补充产色氨酸细菌修复肠道屏障功能并缓解骨质疏松 | 首次揭示色氨酸缺失通过破坏肠道屏障引发骨质疏松的机制,并提出基于合成生物学的产色氨酸菌株干预策略 | 研究仅基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 探究肠道微生物代谢物色氨酸在骨质疏松发病中的作用及治疗潜力 | 骨质疏松模型小鼠和老年小鼠 | 合成生物学 | 骨质疏松 | 微生物代谢组学分析 | NA | 代谢物检测数据 | 骨质疏松小鼠模型和老年小鼠模型 | 合成生物学 | 细菌 | 色氨酸生物合成途径 | 医学 |
| 137 | 2025-10-05 |
A review on the expanding biotechnological frontier of Pedobacter
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108588
PMID:40294724
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综述 | 本文综述了Pedobacter属细菌的生物技术应用潜力及其天然产物的研究进展 | 通过生物信息学分析揭示该属细菌基因组中蕴含大量未被发现的天然产物,并整合合成生物学方法开发其工业应用潜力 | 目前仅对少数Pedobacter物种进行了表征,且只有一小部分天然产物被鉴定 | 探索Pedobacter属细菌的生物技术应用前景和天然产物开发 | Pedobacter属细菌及其天然产物 | 生物技术 | NA | 基因组生物信息学分析 | NA | 基因组数据 | NA | 合成生物学 | Pedobacter属细菌 | NA | 医药, 水产养殖, 能源, 工业生物技术 |
| 138 | 2025-10-05 |
Exploring oxidosqualene cyclases and cytochrome P450s from Aralia elata for the synthesis of diverse pentacyclic triterpene sapogenins in Nicotiana benthamiana
2025-Sep, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110047
PMID:40435688
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研究论文 | 本研究通过挖掘辽东楤木中的氧化角鲨烯环化酶和细胞色素P450,在烟草中合成多种五环三萜皂苷元 | 首次系统鉴定辽东楤木中PTS生物合成关键酶,并通过组合生物合成策略在异源宿主中产生19种PTS(其中14种为新发现) | 辽东楤木中PTS积累量有限且生物合成途径复杂,工业化应用面临挑战 | 解析辽东楤木中五环三萜皂苷元的生物合成途径并实现异源生产 | 辽东楤木(Aralia elata)和本氏烟草(Nicotiana benthamiana) | 合成生物学 | NA | 代谢组学、转录组学、农杆菌介导的异源表达 | NA | 代谢组数据、转录组数据 | NA | 农杆菌介导的转化 | 本氏烟草 | 氧化角鲨烯环化酶与细胞色素P450的组合表达系统 | 食品,化妆品,制药 |
| 139 | 2025-10-05 |
Synergistic potential of halophytes and halophilic/halotolerant plant growth-promoting bacteria in saline soil remediation: Adaptive mechanisms, challenges, and sustainable solutions
2025-Sep, Microbiological research
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.micres.2025.128227
PMID:40440870
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综述 | 探讨盐生植物与嗜盐/耐盐植物促生细菌在盐渍土壤修复中的协同作用机制与应用前景 | 系统阐述盐生植物与HP/HT PGPB的协同互作机制,并提出多组学、合成生物学等整合策略 | 对具体协同互作机制和盐适应策略的理解仍有限 | 研究盐胁迫耐受机制及其在盐渍土壤修复中的应用 | 盐生植物和嗜盐/耐盐植物促生细菌 | 可持续农业 | NA | 多组学方法、基因工程、机器学习辅助生物信息学、化学计量学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业, 环境 |
| 140 | 2025-10-05 |
Promoting efficient synthesis and customization of sphingans based on metabolic engineering and synthetic biology strategies
2025-Sep-01, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2025.123734
PMID:40441843
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综述 | 本文综述了基于代谢工程和合成生物学策略促进鞘聚糖高效合成与定制的方法 | 结合基因组代谢网络模型和CRISPR等高效工具调控代谢途径,通过分子量调控和可控取代基修饰实现鞘聚糖定制 | 野生型菌株研究背景不清晰及复杂合成路径等限制因素尚未完全解决 | 解决鞘聚糖生产能力受限和设计难题,实现高性能鞘聚糖的高效合成与定制 | 鞘聚糖(外多糖)及其生产菌株 | 合成生物学 | NA | 经典诱变、高通量筛选、CRISPR | 基因组代谢网络模型(GSMM) | NA | NA | CRISPR | 底盘细胞 | 代谢途径调控、分子量调控、取代基修饰 | 工业生物技术 |