本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-05 |
Synthetic biology: pioneering the next bio revolution for a sustainable planet
2025-Sep-01, Journal of applied microbiology
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/jambio/lxaf202
PMID:40833632
|
综述 | 本文探讨微生物合成生物学在推动生物基经济发展和应对环境挑战中的作用 | 系统整合微生物合成生物学在多领域的应用案例,强调其向生物基经济转型的变革潜力 | NA | 阐明微生物合成生物学在解决污染、粮食安全、能源需求等全球挑战中的贡献 | 微生物合成生物学的技术应用和发展趋势 | 合成生物学 | NA | 基因工程、生物合成 | NA | 多学科研究数据 | NA | CRISPR-Cas9, 基因工程 | 藻类, 异养微生物, 米曲霉, 酿酒酵母, 大肠杆菌 | 生物传感器, 代谢通路工程 | 环境, 能源, 农业, 医药, 材料, 工业生物技术 |
| 142 | 2025-10-05 |
Microbial-Derived Anti-Cancer Compounds: Advances in Drug Discovery, Bioengineering, and Therapeutic Applications
2025-Sep-01, Anti-cancer agents in medicinal chemistry
IF:2.6Q3
|
综述 | 本文综述了微生物来源抗癌化合物的发现、生物工程改造及治疗应用的最新进展 | 整合人工智能与纳米技术加速微生物来源抗癌药物的发现和递送系统开发 | 缺乏体内验证和全面的药代动力学数据,临床转化面临挑战 | 加速微生物来源抗癌化合物的发现和临床应用 | 微生物代谢产物及其衍生的抗癌化合物 | 机器学习 | 癌症 | 人工智能、机器学习、分子对接、定量构效关系建模 | QSAR模型 | 化学结构数据、生物活性数据 | NA | 合成生物学 | 微生物菌株 | 生物活性化合物增强生产途径 | 医药 |
| 143 | 2025-10-05 |
Versatile Applications of CRISPR-Based Programmable T-DNA Integration in Plants
2025-Sep-04, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70353
PMID:40905066
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR的植物靶向T-DNA整合技术CRISTTIN,用于精确的基因功能研究和转基因表达控制 | 开发了CRISPR辅助的靶向T-DNA整合技术,相比传统Cas9具有更高的整合效率,实现了基因敲除和原位互补的并行操作 | 未明确说明该技术在其它植物物种中的适用性范围及整合效率的具体量化数据 | 开发植物基因组中精确的靶向T-DNA整合技术,用于基因功能研究和合成生物学应用 | 拟南芥和水稻植物 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, Agrobacterium介导的T-DNA整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 拟南芥, 水稻 | 靶向T-DNA整合系统,基因敲除和报告基因整合 | 农业, 工业生物技术 |
| 144 | 2025-10-05 |
Topology-Engineered Guide RNAs for Programmable Control of CRISPR/Cas Activity
2025-Sep-04, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511756
PMID:40905590
|
综述 | 本文综述了通过拓扑工程化向导RNA实现CRISPR/Cas系统可编程控制的最新进展 | 开发具有明确结构架构(聚合物、环状和树状拓扑)的拓扑工程化gRNA,实现精确空间控制、可逆性和可编程激活 | NA | 克服传统线性gRNA在CRISPR/Cas系统控制中的局限性,实现精确时空调控 | 拓扑工程化向导RNA(TE-gRNAs) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 通过物理或化学响应连接器和刺激敏感基团实现可编程激活的基因编辑系统 | 医学, 合成生物学, 功能基因组学 |
| 145 | 2025-10-05 |
Guns 'N Roses: Fungal Volatile Warfare in Postharvest Disease Control
2025-Sep, Annual review of phytopathology
IF:9.1Q1
|
综述 | 本文综述真菌挥发性有机物在采后病害生物防治中的化学多样性、作用机制及应用前景 | 系统探讨真菌挥发性有机物作为生物熏蒸剂的潜力,并提出通过定向诱变、合成生物学和人工智能提升防治效率的新方向 | NA | 开发基于真菌挥发性有机物的环保型采后病害生物防治策略 | 真菌挥发性有机物及其与病原菌、农产品的相互作用 | 农业生物技术 | 采后病害 | 生物熏蒸、定向诱变、合成生物学、人工智能分析化学 | NA | NA | NA | NA | 真菌 | NA | 农业 |
| 146 | 2025-10-05 |
Enhanced phenanthrene degradation by a synthetically engineered E. coli consortium utilizing the SCRaMbLE for the evolution of key genes
2025-Sep-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139152
PMID:40628214
|
研究论文 | 本研究开发了一种合成大肠杆菌菌群,通过SCRaMbLE方法进化关键基因,显著增强了菲的降解效率 | 首次将SCRaMbLE方法应用于合成菌群的工程化改造,通过模块化设计和实验室进化协同提升多环芳烃降解能力 | 研究仅在实验室条件下验证,未在真实环境污染物中测试 | 开发高效降解菲的合成微生物菌群,用于环境生物修复 | 工程化大肠杆菌BL21(DE3)菌群及其对菲的降解能力 | 合成生物学 | NA | SCRaMbLE, 实验室进化 | NA | NA | 三种工程化大肠杆菌菌株,在含100mg/L菲的最小盐培养基中测试 | SCRaMbLE, pET-28(a)质粒 | 大肠杆菌BL21(DE3) | 模块化代谢通路,包含17个菲降解关键基因,分为三个独立功能模块 | 环境 |
| 147 | 2025-10-05 |
Plant cytochrome P450 enzymes for bioactive metabolites biosynthesis, growth regulation, and stress adaptation
2025-Sep-01, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf297
PMID:40623215
|
综述 | 本文综述了植物细胞色素P450酶在生物活性代谢物合成、生长调控和胁迫适应中的最新研究进展 | 聚焦2020-2025年最新研究进展,系统阐述CYPs在植物重要生物活性化合物合成及其生理功能中的关键作用 | 仅涵盖近五年研究进展,且目前仅有不到0.2%的CYPs完成功能表征 | 增强对植物CYPs功能的理解,为生物技术育种和合成生物学领域的创新应用提供基础 | 植物细胞色素P450酶(CYPs) | 合成生物学 | NA | NA | NA | 文献数据 | 数据库记录超过300,000个CYPs | NA | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 148 | 2025-10-05 |
Endosymbionts as hidden players in tripartite pathosystem of interactions and potential candidates for sustainable viral disease management
2025-Sep, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2024.2449403
PMID:39848650
|
综述 | 探讨内共生菌在植物-病毒-媒介昆虫三方互作系统中的作用及其在可持续病毒病害管理中的潜力 | 系统阐述内共生菌通过调控宿主反应、影响杀虫剂抗性和病毒传播等机制参与三方互作,并提出利用基因工程改造内共生菌的创新病害控制策略 | NA | 阐明内共生菌在植物病毒病害传播中的作用机制并探索可持续管理策略 | 植物-病毒-节肢动物媒介的三方互作系统及其内共生菌 | 植物病理学 | 植物病毒病 | 基因改造、生物技术、RNA干扰、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 节肢动物媒介 | NA | 农业 |
| 149 | 2025-10-05 |
DASH: a versatile and high-capacity gene stacking system for plant synthetic biology
2025-Sep, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70179
PMID:40493021
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为DASH的高容量基因堆叠系统,用于植物合成生物学应用 | 结合了Golden Gate克隆、重组工程和位点特异性重组酶系统的特点,解决了现有DNA组装系统的多个限制 | NA | 开发一种高容量且多功能的基因组装系统,用于植物合成生物学 | 基因组装系统和植物合成生物学工具 | 合成生物学 | NA | Golden Gate组装、重组工程、位点特异性重组 | NA | DNA序列数据 | NA | GoldenBraid, PhiC31整合酶, FLP重组酶, CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 基因堆叠系统,包含35个转录单元的97kb货物DNA | 农业 |
| 150 | 2025-10-05 |
Engineered Microbial-Based Therapeutics Nose No Bounds: Extending Innovation to Rhinologic Disease Management
2025-Sep, International forum of allergy & rhinology
IF:7.2Q1
DOI:10.1002/alr.23619
PMID:40825097
|
综述 | 探讨合成生物学在鼻科疾病治疗中应用工程化微生物的前景 | 首次系统提出利用鼻腔天然微生物生态系统开发工程化治疗菌株的创新策略 | 该治疗模式在鼻科疾病领域尚未充分探索,缺乏临床实践验证 | 开发针对鼻窦疾病的靶向可控精准疗法 | 鼻腔黏膜天然微生物生态系统及工程化治疗细菌 | 合成生物学 | 鼻窦疾病 | 微生物工程 | NA | NA | NA | NA | 鼻腔天然微生物 | 局部微生物群调节和免疫调节回路 | 医学 |
| 151 | 2025-10-05 |
Protease engineering: Approaches, tools, and emerging trends
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108602
PMID:40368116
|
综述 | 本文系统阐述了蛋白酶工程的方法、工具及新兴趋势,重点关注通过定向进化等技术调控蛋白酶活性与特异性的策略 | 涵盖了抗体-蛋白酶融合介导的邻近催化、外源蛋白互作驱动的特异性转换等新兴工程策略,以及分裂蛋白酶和自抑制蛋白酶的设计原理 | NA | 总结蛋白酶工程的最新进展,重点介绍实现蛋白酶活性和特异性精确控制的方法学 | 蛋白酶工程策略与工具 | 合成生物学 | NA | 定向进化、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酵母, 噬菌体, 无细胞系统 | 分裂蛋白酶电路, 自抑制蛋白酶模块, 蛋白质信号处理电路 | 生物医学, 蛋白质组学, 化学与合成生物学 |
| 152 | 2025-10-05 |
Engineering genetic circuits for dynamic control of central metabolism
2025-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.06.007
PMID:40532756
|
研究论文 | 本研究开发了响应丙酮酸的PdhR生物传感器系统,用于动态调控中心代谢的代谢通量分布 | 建立了可响应中心代谢物丙酮酸的生物传感器系统,突破了传统遗传工具对特定途径的依赖,实现了对中心代谢通量的动态调控 | NA | 开发能够动态调控中心代谢通量的遗传电路,提高微生物细胞工厂中目标化合物的生物合成效率 | PdhR生物传感器系统及其在海藻糖和4-羟基香豆素生物合成中的应用 | 合成生物学 | NA | 生物传感器表征、计算分析、定点突变 | NA | NA | NA | 生物传感器、定点突变 | 微生物细胞工厂 | 丙酮酸响应型生物传感器系统,动态调控代谢通量分布 | 工业生物技术 |
| 153 | 2025-10-05 |
Applications and prospects of synthetic receptors for therapeutic protein delivery
2025-Sep, European journal of pharmaceutics and biopharmaceutics : official journal of Arbeitsgemeinschaft fur Pharmazeutische Verfahrenstechnik e.V
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.ejpb.2025.114789
PMID:40553909
|
综述 | 本文综述了合成受体在治疗性蛋白质递送中的应用类型、特征及生物医学前景 | 系统归纳了GPCR受体系统、MESA、synNotch受体和SNIPRs等新型合成受体在蛋白质递送领域的创新应用 | 存在安全性问题、递送效率欠佳以及受体设计与优化复杂等挑战 | 探讨合成受体在治疗性蛋白质递送中的应用现状与发展前景 | 合成受体及其递送的 therapeutic proteins | 合成生物学 | 肿瘤、炎症性免疫疾病、中枢神经系统疾病、关节病、病毒感染 | 基因编辑 | NA | NA | NA | NA | NA | G蛋白偶联受体系统、模块化胞外传感架构、合成Notch受体、合成膜内蛋白水解受体 | 医学 |
| 154 | 2025-10-05 |
Improved biosynthesis of C4 derivatives by engineered thiolase
2025-Sep, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.05.001
PMID:40320002
|
研究论文 | 本研究开发了一种利用大肠杆菌从乙二醇生物合成四碳化合物的新型代谢途径 | 通过定向进化技术改良了关键酶CnBktB的催化效率,并首次实现了从PET降解产物乙二醇直接合成高价值四碳化合物 | NA | 开发从C2前体高效生物合成四碳化合物的可持续路线 | 1,4-丁二醇、1,2,4-丁三醇和琥珀酸等四碳化合物 | 合成生物学 | NA | 定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA | 定向进化 | 大肠杆菌 | 新型代谢途径,包含乙二醇转化模块和四碳化合物合成模块 | 环境,工业生物技术 |
| 155 | 2025-10-05 |
Myxobacteria: Versatile cell factories of novel commercial enzymes for bio-manufacturing
2025-Sep, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108594
PMID:40345460
|
综述 | 本文综述了黏细菌作为新型商业酶生产细胞工厂的潜力及其在生物制造中的应用 | 系统阐述了黏细菌这一未被充分开发的微生物资源在工业酶生产中的独特优势和应用前景 | 黏细菌存在遗传工程困难、生长缓慢、代谢改造和表达策略受限等技术挑战 | 探讨黏细菌作为工业细胞工厂的开发潜力和生物制造应用 | 黏细菌及其产生的天然产物和裂解酶 | 工业生物技术 | NA | 生物勘探、计算方法、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 黏细菌 | NA | 农业,工业 |
| 156 | 2025-10-05 |
Construction of a synthetic biology toolkit for the genetic manipulation in the cellulose-producing strain Kosakonia oryzendophytica
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.012
PMID:40529626
|
研究论文 | 开发了针对高产细菌纤维素菌株Kosakonia oryzendophytica的合成生物学工具包 | 首次在该底盘菌中系统表征调控元件库并建立高效CRISPR/Cas9无疤痕基因组编辑系统 | NA | 构建用于遗传操作的合成生物学工具包以开发新一代纤维素基功能材料 | Kosakonia oryzendophytica菌株及其细菌纤维素合成机制 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因组编辑、λ Red重组、扫描电子显微镜 | NA | 基因表达数据、显微镜图像 | NA | CRISPR-Cas9, λ Red重组系统 | Kosakonia oryzendophytica | 可调表达模块(启动子、核糖体结合位点、终止子)和精确基因组编辑系统 | 材料, 工业生物技术 |
| 157 | 2025-10-05 |
Addressing semantic ambiguity in biotechnology: Proposals from the European research infrastructure IBISBA
2025-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.04.010
PMID:40280273
|
讨论论文 | 分析生物技术领域术语的语义模糊性问题并提出定义统一建议 | 首次系统分析生物技术领域核心术语的语义模糊性并提出标准化定义方案 | 属于概念性讨论论文,缺乏实证研究数据支持 | 解决生物技术领域术语定义不统一的问题 | 生物技术、生物制造、工程生物学和合成生物学等核心术语 | NA | NA | NA | NA | 文本分析 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 158 | 2025-10-05 |
MutS-mediated rapid and cost-effective error correction in in vitro DNA synthesis
2025-Sep-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.05.002
PMID:40447215
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于MutS蛋白的快速、低成本体外DNA合成纠错方法 | 构建了十一种Cbm3-Egfp-MutS融合蛋白,发现TaMutS和TtMutS具有热稳定性并能有效识别错配DNA,建立了使用自制无定形纤维素旋转柱和过滤吸头的简单纠错方法 | NA | 开发简单、经济、高效的DNA合成纠错方法 | DNA寡核苷酸和较长目标分子 | 合成生物学 | NA | 蛋白质重组表达与纯化,异源双链DNA结合分析 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 159 | 2025-10-05 |
From reactants to products: computational methods for biosynthetic pathway design
2025-Sep, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.05.005
PMID:40510533
|
综述 | 本文综述了生物合成路径设计中的关键计算方法,包括生物大数据、逆合成方法和酶工程 | 整合生物大数据、逆合成方法和酶工程三个关键组件来提升生物合成路径设计的效率和准确性 | NA | 提高生物合成路径设计的效率和准确性 | 生物合成路径设计计算方法 | 合成生物学 | NA | 数据挖掘、逆合成分析、酶工程设计 | NA | 化合物、反应/路径、酶数据 | NA | NA | NA | 生物合成路径 | 工业生物技术 |
| 160 | 2025-10-05 |
Tryptophan-producing bacteria to mitigate osteoporosis and intestinal dysfunction
2025-Sep, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.05.013
PMID:40487243
|
研究论文 | 通过补充产色氨酸细菌修复肠道屏障功能并缓解骨质疏松 | 首次揭示色氨酸缺失通过破坏肠道屏障引发骨质疏松的机制,并提出基于合成生物学的产色氨酸菌株干预策略 | 研究仅基于小鼠模型,尚未进行人体临床试验 | 探究肠道微生物代谢物色氨酸在骨质疏松发病中的作用及治疗潜力 | 骨质疏松模型小鼠和老年小鼠 | 合成生物学 | 骨质疏松 | 微生物代谢组学分析 | NA | 代谢物检测数据 | 骨质疏松小鼠模型和老年小鼠模型 | 合成生物学 | 细菌 | 色氨酸生物合成途径 | 医学 |