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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-14 |
Synthetic multicolor antigen-stabilizable nanobody platform for intersectional labelling and functional imaging
2025-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684934
PMID:41278670
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研究论文 | 开发了一套覆盖可见光全谱的抗原稳定化荧光纳米抗体工具包,用于多色标记和功能成像 | 首次构建了覆盖450-660nm全可见光谱的抗原稳定化荧光纳米抗体平台,实现了背景自由的细胞内蛋白可视化、多抗原多色检测及特定细胞群/区室的选择性靶向 | NA | 开发用于蛋白质动态、细胞过程和复杂生物系统精确研究的合成生物学成像平台 | 荧光纳米抗体、细胞内蛋白质、细胞代谢物、小鼠脑组织、斑马鱼胚胎 | 合成生物学 | NA | 荧光蛋白工程、生物传感器构建、功能成像 | NA | 荧光成像数据 | 超过20种荧光蛋白和生物传感器被工程化改造 | 合成生物学方法 | NA | 抗原依赖性荧光激活系统、代谢物生物传感器整合电路 | 医学研究、基础生物学研究 |
| 2 | 2025-12-11 |
Screening and machine learning-based prediction of translation-enhancing peptides that reduce ribosomal stalling in Escherichia coli
2025-Oct-22, RSC chemical biology
IF:4.2Q2
DOI:10.1039/d5cb00199d
PMID:41142649
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研究论文 | 本研究通过筛选和机器学习预测,鉴定了能减少大肠杆菌中核糖体停滞的翻译增强肽 | 首次使用随机化人工四肽库进行翻译增强肽的全面筛选,并开发了基于随机森林算法的机器学习模型来预测肽活性 | 研究主要关注SecM AP诱导的翻译停滞,可能未涵盖所有类型的停滞肽或翻译系统 | 开发一种减少核糖体停滞的肽工具包和数据驱动方法,以应用于合成生物学 | 翻译增强肽及其对SecM AP诱导的翻译停滞的影响 | 机器学习 | NA | 随机化人工四肽库筛选、翻译分析 | 随机森林 | 肽序列和活性数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 3 | 2025-12-06 |
Targeting and tracking mRNA lipid nanoparticles at the particle, transcript and protein level
2025-Oct, Nature biomedical engineering
IF:26.8Q1
DOI:10.1038/s41551-025-01511-8
PMID:41102346
|
综述 | 本文综述了用于监测RNA负载脂质纳米颗粒体内行为的现有及新兴技术,并讨论了改善组织与细胞靶向的策略,以扩展该技术的应用范围 | 系统整合了脂质纳米颗粒化学修饰、生物工程及合成生物学方法(如利用microRNA靶位点)来调控mRNA递送与表达,并探讨了通过修饰编码蛋白来控制有效载荷的稳定性与亚细胞定位 | NA | 扩展RNA负载脂质纳米颗粒在非肝脏疾病治疗中的应用,并加速其临床转化 | RNA负载脂质纳米颗粒 | NA | NA | 脂质纳米颗粒技术、合成生物学方法、microRNA靶向技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 4 | 2025-12-01 |
A Rapid, High-Throughput Method for the Construction of Mutagenesis Libraries
2025-Oct-25, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15111511
PMID:41301429
|
研究论文 | 开发了一种基于芯片寡核苷酸合成的高通量、精确控制的诱变文库构建方法 | 利用芯片寡核苷酸合成技术实现精确控制的诱变文库构建,达到93.75%的突变覆盖率 | 存在寡核苷酸合成错误和嵌合序列形成等技术因素影响文库质量 | 开发高效、可扩展、精确控制的诱变文库构建策略 | 诱变文库构建方法 | 合成生物学 | NA | 芯片寡核苷酸合成,PCR | NA | DNA序列数据 | 评估了5种聚合酶 | 芯片寡核苷酸合成 | NA | 琥珀密码子扫描诱变文库 | 工业生物技术 |
| 5 | 2025-12-01 |
Metabolic Engineering of Yeasts for the Production of the Triterpene Squalene: Current Status and Future Prospective
2025-Oct-22, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13112422
PMID:41304107
|
综述 | 系统总结酵母生产角鲨烯的代谢工程策略及下游衍生物应用 | 整合系统代谢工程与合成生物学工具提出经济可行角鲨烯生物制造的路线图 | 微生物平台实现工业化可行滴度仍存在未解决挑战 | 推进酵母菌株工程实现经济可行角鲨烯生物制造 | 酵母底盘细胞及其角鲨烯生物合成途径 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 甲羟戊酸途径角鲨烯生物合成途径及其下游衍生物合成途径 | 医药、营养保健品、化妆品 |
| 6 | 2025-11-29 |
Harnessing plant agriculture to mitigate climate change: A framework to evaluate synthetic biology (and other) interventions
2025-Oct-31, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf410
PMID:41004568
|
研究论文 | 本文提出一个评估合成生物学干预措施在植物农业中减缓气候变化潜力的框架 | 首次使用费米估计量化多种合成生物学策略的碳减排潜力,并与非工程化方法进行基准比较 | 基于100年时间跨度的预测存在不确定性,需要定期重新评估策略有效性 | 识别和优先考虑通过植物农业减缓气候变化的合成生物学策略 | 植物农业系统中的碳减排和碳封存技术 | 合成生物学 | NA | 费米估计、生命周期评估 | NA | 定量分析数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 改进的CO2固定、根系沉积生物聚合物、工程化固氮、甲烷减排 | 农业,环境 |
| 7 | 2025-11-27 |
Yohimban acetylation in Rauvolfia is mediated by a leaf-specific acetyltransferase in reserpine biosynthetic gene cluster
2025-Oct-30, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110714
PMID:41289712
|
研究论文 | 本研究鉴定并表征了萝芙木中负责育亨宾乙酰化的叶片特异性乙酰转移酶YAT | 首次发现位于利血平生物合成基因簇中的叶片特异性乙酰转移酶YAT,揭示了育亨宾生物代谢中先前未知的分支点 | NA | 阐明萝芙木中单萜吲哚生物碱生物合成的酶学基础和进化动态 | 萝芙木中的育亨宾O-乙酰转移酶(YAT)及其在育亨宾生物碱代谢中的作用 | 合成生物学 | NA | 同源建模、底物对接实验 | NA | 基因表达数据、酶活性数据 | NA | NA | 萝芙木 | 利血平生物合成基因簇 | 医药 |
| 8 | 2025-11-23 |
Next-generation perspectives on microbially synthesized siderophores: molecular engineering, multi-omics insights, and applications for smart climate-resilient crops
2025-Oct-16, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04575-5
PMID:41099996
|
综述 | 本文综述微生物合成铁载体的生物合成、调控机制及其在智能气候韧性作物中的应用前景 | 整合合成生物学与多组学技术揭示铁载体合成调控网络,开发纳米制剂和智能递送系统增强田间应用效果 | NA | 探讨微生物铁载体在可持续农业中的分子机制与应用策略 | 微生物铁载体及其合成基因簇,植物根际促生菌(PGPR) | 合成生物学 | NA | 多组学(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学),CRISPR/Cas基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物根际促生菌(PGPR) | 铁载体生物合成基因簇 | 农业 |
| 9 | 2025-11-23 |
Application progress and biosafety challenges of gene editing and synthetic biotechnology in diagnosis, treatment and prevention of infectious diseases
2025-Oct, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.09.002
PMID:41262458
|
综述 | 本文系统综述了基因编辑和合成生物技术在传染病防治中的应用进展与生物安全挑战 | 系统分析了2015-2025年间CRISPR诊断技术、合成疫苗和工程益生菌在传染病防治中的最新应用,并首次全面评估其生物安全风险 | 基于文献综述,缺乏原始实验数据验证;主要关注技术层面,社会接受度和经济可行性分析不足 | 评估合成生物技术在传染病诊断、治疗和预防中的应用进展及相关的生物安全挑战 | CRISPR诊断系统、合成疫苗平台和工程益生菌等合成生物技术产品 | 合成生物学 | 传染病 | CRISPR/Cas系统(DETECTR、SHERLOCK)、mRNA疫苗技术、病毒载体疫苗技术、工程益生菌技术 | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9, Cas12a, Cas13a | 工程益生菌 | 病原体检测生物传感器、免疫调节回路 | 医学 |
| 10 | 2025-11-23 |
Beyond evolution: De novo designed protein toolkit rewriting the rules of synthetic biology
2025-Oct, Biosafety and health
IF:3.5Q1
DOI:10.1016/j.bsheal.2025.09.004
PMID:41262455
|
综述 | 本文探讨人工智能驱动的蛋白质设计如何通过超越进化约束的全新蛋白质工具包革新合成生物学 | 提出超越已知结构模板和进化约束的全新蛋白质设计范式,建立从蛋白质设计到系统级实施的层次化框架 | 新型蛋白质在细胞系统中表达存在功能不可预测性,需要更完善的风险评估体系 | 系统分析AI驱动蛋白质设计的计算框架及其在合成生物学中的应用前景 | 从头设计的蛋白质工具包及其在合成生物学系统中的应用 | 合成生物学 | NA | 人工智能蛋白质设计、多组学分析 | NA | NA | NA | NA | NA | 结构导向的理性基因电路设计 | 工业生物技术 |
| 11 | 2025-11-21 |
Advancing Genetically Encoded Lysine (GEK) Chemistry: From Precision Modulation to Therapeutic Innovation
2025-Oct-07, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.5c00401
PMID:41004624
|
研究论文 | 本文系统介绍了基因编码赖氨酸化学的发展及其在蛋白质工程和精准治疗中的应用 | 开发了工程化的吡咯赖氨酰-tRNA合成酶变体,能够高效整合具有定制化学反应性的多样化赖氨酸衍生物 | NA | 推进基因编码赖氨酸化学技术,实现蛋白质精确修饰和功能调控 | 赖氨酸衍生物、蛋白质工程工具、治疗性分子 | 化学生物学 | NA | 基因编码赖氨酸化学、蛋白质工程、生物正交化学 | NA | NA | NA | PylRS变体 | NA | NA | 医学、生物技术 |
| 12 | 2025-11-21 |
Before LUCA: unearthing the chemical roots of metabolism
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0292
PMID:41035332
|
研究论文 | 探索从地球化学到生物化学过渡过程中原始代谢系统的演化,提出连接非生物化学与早期生命的潜在途径 | 将LUCA代谢反应规则映射到前生物反应,建立综合建模框架测试非生物化学与早期生命的连接假说 | 连接原始地球化学与LUCA复杂代谢能力仍存在挑战,模型需要进一步验证 | 研究生命起源过程中代谢系统的演化机制和化学根源 | 最后共同祖先(LUCA)的代谢系统、前生物化学反应 | 系统化学、计算生物学 | NA | 生成模型、计算建模 | 生成模型 | 化学反应数据、热力学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 13 | 2025-11-19 |
Reprogramming encapsulins into modular carbon-fixing nanocompartments
2025-Oct-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65307-9
PMID:41168233
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于封装蛋白纳米隔室的模块化固碳系统,为在C3作物中引入二氧化碳浓缩机制提供了新方法 | 利用来自嗜热拟杆菌的封装蛋白纳米隔室,通过融合短肽实现多种Rubisco同工型的靶向封装,建立了植物兼容的合成羧酶体模拟系统 | 碳酸酐酶尚未整合到系统中 | 开发模块化固碳纳米隔室系统以增强作物光合效率 | 封装蛋白纳米隔室和Rubisco酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、纳米隔室技术 | NA | 实验数据 | NA | 蛋白质融合技术 | 嗜热拟杆菌 | 固碳纳米隔室系统、合成羧酶体模拟 | 农业 |
| 14 | 2025-11-17 |
In Vivo and In Vitro Mechanisms of Equol Synthesis and Key Influencing Factors: A Critical Review
2025-Oct-31, Nutrients
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/nu17213449
PMID:41228520
|
综述 | 本文系统综述了雌马酚的体内外合成机制、关键影响因素及其潜在分子机制 | 重点探讨了基于合成生物学和基因编辑技术的雌马酚高效体外合成突破路径 | 传统合成技术存在效率低、副产物生成和环境问题等限制因素 | 阐明雌马酚的合成机制及影响因素,推动其高效合成技术发展 | 雌马酚(S-雌马酚和R-雌马酚)及其合成微生物 | 合成生物学 | 更年期症状、衰老、心血管疾病 | 合成生物学、基因编辑技术 | NA | NA | NA | 基因编辑 | 肠道细菌 | NA | 医药 |
| 15 | 2025-11-15 |
Automated Strain Construction for Biosynthetic Pathway Screening in Yeast
2025-Oct-17, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00554
PMID:41063332
|
技术说明 | 开发用于酵母生物合成途径筛选的自动化菌株构建工作流程 | 通过集成化机器人平台实现高通量酵母转化,每周可完成2000次转化,并提供参数定制化用户界面 | NA | 加速合成生物学设计-构建-测试-学习循环中的构建步骤 | 工程化酵母菌株及其生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 自动化菌株构建、途径筛选 | NA | NA | NA | Hamilton Microlab VANTAGE, Hamilton VENUS | 酵母 | 甾体生物碱生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 16 | 2025-11-14 |
Classifying Convergences in the Light of Horizontal Gene Transfer: Epaktovars and Xenotypes
2025-Oct-29, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf279
PMID:41152006
|
perspective | 提出新的分类概念来描述非树状进化模式的生物体 | 引入epaktovars和xenotypes两个互补概念,为描述水平基因转移导致的进化模式提供新框架 | 概念性论文,缺乏实证数据验证 | 澄清和统一描述非树状进化生物体的术语 | 具有水平基因转移特征的生物体 | 进化生物学 | NA | NA | NA | 概念分析 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 灭绝物种重建 |
| 17 | 2025-11-14 |
Biparental plastid inheritance and its implications in plastid genome engineering
2025-Oct-10, Plant cell reports
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s00299-025-03631-6
PMID:41073605
|
综述 | 本文综述了植物质体双亲遗传的机制及其在质体基因组工程中的应用潜力 | 系统探讨了通过调控遗传和环境因素将母系质体遗传转变为双亲遗传的机制,及其在植物适应性和质体工程中的重要意义 | 质体双亲遗传机制相对研究不足,许多具体分子机制尚不明确 | 探讨质体遗传模式(特别是双亲遗传)的机制、进化意义及在植物工程中的应用 | 植物质体(叶绿体)和线粒体的遗传模式 | 植物遗传学 | NA | 质体基因组工程 | NA | 文献综述数据 | 约20%的被子植物表现出双亲质体遗传 | NA | 被子植物 | NA | 农业,合成生物学 |
| 18 | 2025-11-10 |
Genetically engineered pig-to-human liver xenotransplantation
2025-Oct-09, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2025.08.044
PMID:41076089
|
研究论文 | 报道世界首例基因编辑猪辅助肝异种移植到活人体的成功案例,患者存活达171天 | 首次实现基因编辑猪到活人体肝脏异种移植,使用10基因编辑平台,突破合成生物学在临床移植中的界限 | 术后出现异种移植相关血栓性微血管病,反复上消化道出血导致患者死亡 | 探索猪到人肝脏异种移植作为人类肝移植桥梁方法的可行性 | 患有大型肝细胞癌且不适合根治性切除的患者 | 合成生物学 | 肝细胞癌 | 基因编辑 | NA | 临床监测数据 | 1例患者 | CRISPR-Cas9 | 猪 | 敲除异种抗原基因,敲入7个人类转基因以实现免疫和凝血兼容性 | 医学 |
| 19 | 2025-11-09 |
[Application and prospects of synthetic biology in the genetic improvement of rice]
2025-Oct-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250347
PMID:41203287
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综述 | 系统总结合成生物学在水稻遗传改良中的应用进展与突破成果 | 通过模块化、标准化和系统化方法实现精准基因组和代谢途径工程,有效克服传统育种周期长和性状改良能力受限的局限性 | NA | 探讨合成生物学在水稻遗传改良中的应用前景 | 水稻遗传改良 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、遗传电路设计、代谢工程、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 水稻 | 遗传电路设计、代谢途径工程 | 农业 |
| 20 | 2025-11-05 |
Efficiency of Digital Photolithographic Synthesis of Large, High-Quality DNA Libraries and Microarrays using a Guanine O6 Dephosphitylation Strategy
2025-Oct-31, Communications chemistry
IF:5.9Q1
DOI:10.1038/s42004-025-01755-0
PMID:41174019
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研究论文 | 本研究通过数字无掩膜光刻方法结合鸟嘌呤O6去磷酸化策略,提高了大型DNA文库和微阵列的合成效率 | 采用标准封端试剂引入极短的去分支步骤,有效抑制脱嘌呤导致的片段化,显著提高合成产率 | NA | 解决DNA微阵列合成中的寡核苷酸片段化问题,提高大规模核酸合成质量 | DNA文库和微阵列 | 合成生物学 | NA | 数字无掩膜光刻合成 | NA | NA | NA | 光刻合成 | NA | NA | 基因组学, 核酸治疗, 合成生物学 |