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当前共找到 113 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-19 |
Synthetic multicolor antigen-stabilizable nanobody platform for intersectional labelling and functional imaging
2025-Oct-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684934
PMID:41278670
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研究论文 | 该文章介绍了一种合成多色抗原稳定化纳米抗体平台（VIS-Fbs），可在450 nm至660 nm可见光谱范围内实现无背景荧光成像，用于细胞内蛋白追踪、多抗原检测及功能成像 | 通过将二十多种荧光蛋白和生物传感器工程化到八种纳米抗体中，建立了通用型VIS-Fbs设计，仅在与同源抗原结合时才发出明亮荧光，并实现了组成型、光激活和光转换荧光蛋白及基于荧光蛋白的生物传感器的整合 | 摘要中未明确提及该研究的局限性 | 开发一种合成多色抗原稳定化纳米抗体平台，用于交叉标记和功能成像，以实现对蛋白质动态、细胞过程及复杂生物系统的高特异性、低背景研究 | 纳米抗体、荧光蛋白、生物传感器、小鼠脑组织、斑马鱼胚胎、β-catenin蛋白、Wnt/β-catenin信号通路 | 合成生物学、荧光成像、细胞生物学 | NA | 荧光蛋白工程、纳米抗体工程、生物传感器构建、荧光成像、光激活、光转换 | NA | 图像 | NA | NA | 小鼠、斑马鱼 | 抗原稳定化荧光纳米抗体（VIS-Fbs），包含组成型、光激活和光转换荧光蛋白，以及基于荧光蛋白的生物传感器 | 医学、基础生物学研究 |
| 2 | 2026-09-18 |
From Nano to Quantum: Ethics Through a Lens of Continuity
2025-10-13, Science and engineering ethics
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s11948-025-00557-w
PMID:41082020
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研究论文 | 本文通过连续性视角，借鉴纳米技术伦理讨论的经验教训，分析和指导量子技术伦理话语的塑造 | 提出使用连续性视角，将纳米伦理讨论中的关键特征作为分析工具，用于评估和分析新兴的量子技术伦理话语，避免重复过去的错误 | 文章主要基于理论分析和文献回顾，缺乏实证数据支持，且未提供具体的量子技术伦理框架或操作指南 | 探讨如何借鉴纳米技术伦理讨论的经验，指导量子技术伦理和负责任创新的早期话语发展 | 纳米技术和量子技术的伦理讨论话语 | 机器学习 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 3 | 2026-09-16 |
Turbo-charging crop improvement: harnessing multiplex editing for polygenic trait engineering and beyond
2025-10, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70527
PMID:41092254
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综述 | 本文综述了多重CRISPR编辑技术在作物改良中的应用，涵盖多基因性状工程、基因家族功能解析、染色体工程及无转基因编辑等方面，并讨论了载体结构创新、高通量测序检测及计算工作流程等最新进展 | 系统整合了多重CRISPR编辑在作物改良中的前沿应用，包括表观遗传调控、转录调控、染色体工程及无转基因编辑；强调了启动子和支架工程等载体结构创新对编辑效率的提升；指出长读长测序技术可解析标准基因分型常遗漏的结构重排；提出对用户友好、合成生物学兼容的可扩展计算工作流程的迫切需求 | 多重编辑仍面临技术挑战，包括复杂的构建体设计和对稳健、可扩展突变检测的需求；缺乏实验验证的诱导型或组织特异性启动子以实现时空精准调控；针对重复或串联间隔位点时结构重排常被标准基因分型遗漏；多倍体、未驯化野生近缘种和长世代物种的编辑难度较大 | 探讨多重CRISPR编辑技术在作物改良中的应用潜力，总结当前工具包和最新创新，分析技术挑战，并展望其作为下一代作物改良基础技术的发展方向，以应对农业、可持续性和气候韧性方面的挑战 | 作物基因组，包括一年生物种、多倍体、未驯化野生近缘种和长世代物种 | 农业基因组学, 合成生物学 | NA | 多重CRISPR编辑, 高通量测序, 长读长测序 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 多重gRNA表达盒, 启动子工程, 支架工程 | 农业 |
| 4 | 2026-09-16 |
Synthetic allopolyploidy unveils hybridization-driven transcriptional reprogramming underlying thermal adaptation in Cucumis
2025-10, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.70507
PMID:41056532
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研究论文 | 通过实验重建的同源四倍体黄瓜属物种（C. × hytivus）及其二倍体种间杂交亲本（异源二倍体），解析杂交与全基因组加倍对异源多倍体形成及热适应性的独立与联合贡献 | 首次利用人工合成的异源四倍体及其异源二倍体亲本，解耦杂交与全基因组加倍在异源多倍体热适应中的相对贡献，揭示杂交主导热响应转录可塑性，而全基因组加倍稳定这些适应 | 研究仅基于一个实验重建的异源四倍体系统，且聚焦于热胁迫下的短期转录响应，未涉及长期进化或田间多环境验证 | 解耦并探究种间杂交与全基因组加倍对异源多倍体形成后遗传与表型后果的独立和联合贡献，特别是热适应性 | 实验重建的异源四倍体黄瓜属物种C. × hytivus（2n=4x=38）及其二倍体种间杂交亲本异源二倍体（2n=2x=19），以及亲本物种 | 植物基因组学与进化生物学 | NA | RNA-seq（转录组测序）、WGCNA、比较转录组分析 | NA | 转录组数据、生理表型数据 | 异源二倍体和异源四倍体在热胁迫（45°C）和对照（28°C）条件下的15,680个同源基因对 | NA | 黄瓜属植物（Cucumis） | NA | 农业 |
| 5 | 2026-09-07 |
Kinetically Programmed Signaling Cascades for Molecular Detection
2025-10-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c12059
PMID:41094711
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研究论文 | 本文介绍了一种基于DNA化学的动力学编程信号级联系统，用于分子检测，并展示了其在提高检测速率、增益和灵敏度方面的优势。 | 首次系统探索了编程信号级联动力学对检测性能的影响，并开发了适用于多种分子检测和即时医疗诊断的模块化系统。 | 未提及明显的局限性，但可能对非专业用户的操作或特定环境下的稳定性存在挑战。 | 开发并优化基于DNA的信号级联系统，实现快速、灵敏的分子检测，并展示其在治疗药物监测中的潜在应用。 | DNA信号级联系统，包括四种不同的目标分子（小分子和蛋白质）和血液样本。 | 合成生物学 | NA | DNA化学，电化学传感 | 动力学模型（基于速率常数） | 模拟和实验数据 | 四种分子，血液样本（具体数量未提及） | DNA化学 | NA | 信号级联，包括输入、受体、处理器和输出模块 | 生物传感，医疗诊断，药物监测 |
| 6 | 2026-09-07 |
Ultrafast Conversion of CO2 into C3-C4 Diols in a Synergistic Electrochemical and AI-Assisted Biosynthesis System
2025-10-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c14039
PMID:41100764
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研究论文 | 本文介绍了一种结合电化学和人工智能辅助生物合成的协同系统，将二氧化碳超快速转化为C3-C4二醇，实现了高产量合成1,3-丙二醇和1,3-丁二醇 | 创新点在于将铜锌催化电化学还原与工程化DERA酶生物催化模块集成，并通过人工智能辅助理性设计提升酶活性，实现二氧化碳到C3-C4二醇的高效转化 | 摘要中未提及明确局限性，可能包括系统放大和实际应用中的挑战 | 实现从二氧化碳到高价值C3-C4二醇（如1,3-丙二醇和1,3-丁二醇）的可持续、高效合成 | 二氧化碳、乙醇、1,3-丙二醇、1,3-丁二醇、DERA酶变体（S233D/F43T） | 合成生物学 | NA | 电化学还原、生物催化、分子动力学模拟、原位光谱 | NA | 光谱数据、分子动力学模拟数据 | NA | 人工智能辅助设计 | NA | 电化学-生物合成级联系统 | 能源、工业生物技术 |
| 7 | 2026-09-05 |
Bio-Photo Dual Action of Intracellular Radical Polymerization
2025-10-01, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c10871
PMID:40977043
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研究论文 | 本文介绍了一种基于刺激响应性光催化剂的策略，通过生物标志物和光双重控制实现细胞内自由基聚合，从而选择性破坏内质网并诱导细胞死亡。 | 首次将光催化剂设计为受内源性活性氧/硫物种或酶调控的AND门控机制，实现了仅在目标细胞中聚合的时空控制，并利用该机制诱导内质网应激和paraptosis。 | 摘要未提及具体局限性。 | 实现细胞内聚合的时空控制，为精准细胞器干预和合成生物学应用提供新方法。 | 细胞内聚合反应及内质网完整性。 | 合成生物学 | NA | PET-RAFT聚合 | NA | NA | NA | NA | 细胞 | AND门控光催化聚合系统 | 医学 |
| 8 | 2026-09-03 |
RNAtranslator: Modeling protein-conditional RNA design as sequence-to-sequence natural language translation
2025-10, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013541
PMID:41042819
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研究论文 | RNAtranslator是一种生成式语言模型，首次将蛋白质条件下的RNA序列设计视为序列到序列的自然语言翻译问题，直接从给定蛋白质生成结合RNA序列。 | 首次将RNA设计问题转化为序列到序列的自然语言翻译，实现了直接从目标蛋白质生成RNA序列而无需后续优化。 | 可能对无RNA互作数据的蛋白质生成序列的特异性有限，未明确讨论。 | 开发一种新方法，从蛋白质序列直接高效生成结合RNA序列，以支持RNA治疗和合成生物学应用。 | RNA和蛋白质相互作用，特别是RNA结合蛋白的目标序列。 | 自然语言处理、生成模型适用于生物信息 | NA | 序列-到-序列翻译，生成语言模型（如Transformer） | 生成语言模型（seq2seq） | 序列数据（RNA和蛋白质序列） | 大规模数据集（具体样本量未在摘要中说明） | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 9 | 2026-08-28 |
AI-directed gene fusing prolongs the evolutionary half-life of synthetic gene circuits
2025-10-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx0796
PMID:41032600
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研究论文 | 本文提出了一种名为STABLES的基因融合策略，通过将目标基因与必需内源基因连接并引入漏终止密码子，利用机器学习优化设计，以延长合成基因回路的进化半衰期，并在大肠杆菌中验证了其提高稳定性和产量的效果 | 创新性地采用机器学习框架预测最优基因融合对，并优化连接肽和DNA序列，以对抗进化不稳定性，且该策略具有物种无关性和可扩展性 | 实验验证仅限于特定宿主和部分目标基因，可能未涵盖所有生物体和复杂环境下的长期稳定性 | 提高合成基因回路的进化稳定性，减少异源基因表达随时间丢失的问题 | 合成基因回路中的目标基因（如荧光蛋白和人胰岛素原），以及其与必需内源基因的融合 | 合成生物学 | NA | 基因融合、机器学习、生物信息学分析、生物物理特征分析 | 机器学习模型（具体类型未指定） | 生物序列数据、生物物理特征数据 | 实验涉及多种目标基因，包括荧光蛋白和人胰岛素原，具体样本数量未说明 | 基因融合技术 | 大肠杆菌 | 基因融合回路，包含目标基因、必需内源基因和漏终止密码子，旨在施加选择压力并维持表达 | 工业生物技术、合成生物学 |
| 10 | 2026-08-28 |
A minimal genetic circuit for cellular anticipation
2025-10, Journal of the Royal Society, Interface
DOI:10.1098/rsif.2025.0528
PMID:41119990
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研究论文 | 本文提出一种基于合成生物学的最小遗传电路，用于实现细胞对环境趋势的预判，并通过确定性和随机分析验证其稳健性 | 将金融趋势分析中的移动平均收敛发散原理引入合成生物学，设计了可实现预测功能的最小遗传电路 | 尚未进行实验验证，仅通过数学模型和模拟分析 | 研究细胞如何通过简单遗传电路实现环境预判，为工程化预测性生物系统提供基础 | 最小遗传电路 | 合成生物学 | NA | 确定性分析，随机分析 | NA | 模拟数据 | NA | NA | NA | 最小预测性遗传电路 | 工业生物技术 |
| 11 | 2026-08-23 |
Biosensor-driven strain engineering reveals key cellular processes for maximizing isoprenol production in Pseudomonas putida
2025-10-24, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady2677
PMID:41134890
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research paper | 本研究开发了一种基于生物传感器的生长偶联筛选策略，在恶臭假单胞菌中优化异戊烯醇的生产，通过迭代组合菌株工程实现了36倍的滴度提升，并揭示了关键的宿主代谢过程 | 发现并表征了一个非经典信号通路，涉及杂合组氨酸激酶与醇脱氢酶的功能和物理复合物，其活性受异源二聚化调节；利用该生物传感器在CRISPRi文库筛选中识别宿主限制因素，并通过整合组学分析揭示了氨基酸分解代谢的重塑对产量提升的关键作用 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 开发一种生物传感器驱动的菌株工程策略，以优化恶臭假单胞菌中异戊烯醇的生产，并揭示宿主细胞的关键限制因素 | 恶臭假单胞菌菌株及其代谢途径 | 合成生物学、代谢工程 | NA | CRISPRi筛选、组学分析 | NA | 组学数据、生物传感器信号 | 使用CRISPRi文库进行筛选，具体样本数量未提及 | CRISPRi | 恶臭假单胞菌 | 生物传感器驱动的生长偶联选择系统 | 工业生物技术 |
| 12 | 2026-08-20 |
Classifying Convergences in the Light of Horizontal Gene Transfer: Epaktovars and Xenotypes
2025-10-29, Molecular biology and evolution
IF:11.0Q1
DOI:10.1093/molbev/msaf279
PMID:41152006
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观点文章 | 本文提出并澄清了用于描述具有非树状进化历史的生物体的术语，引入了epaktovars和xenotypes两个互补概念，并探讨了它们在合成生物学和去灭绝研究中的应用。 | 提出了两个新术语：epaktovars（通过独立获取相似功能而展现趋同表型的生物群）和xenotypes（通过水平基因转移共享同源基因的生物体），从而扩展了现有的epaktologs和xenologs概念到基因组水平。 | 未提供实证数据或详细案例研究，主要基于理论视角进行概念阐述。 | 旨在整合和澄清用于描述非树状进化历史的生物体的术语，并提供分类框架。 | 具有水平基因转移或趋同进化的生物体，以及合成生物学和去灭绝中的基因改造生物。 | 进化生物学, 合成生物学 | NA | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 保护生物学 |
| 13 | 2026-08-20 |
Accurate prediction of thermoresponsive phase behavior of disordered proteins
2025-10, Protein science : a publication of the Protein Society
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/pro.70284
PMID:40944421
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研究论文 | 开发了一个名为Mpipi-T的残基级模型，用于准确预测无序蛋白质的热响应相分离行为，特别是下临界溶解温度（LCST）型转变。 | 首次整合原子级溶剂化自由能数据和实验浊点测量，参数化短程非键相互作用，并解析缩放长程静电相互作用，从而定量预测蛋白质的LCST型相分离。 | 模型预测依赖于特定实验数据，可能不适用于所有蛋白质，且计算效率虽高，但尚未验证其在大规模蛋白质设计中的通用性。 | 解释热应激下蛋白质凝聚的机制，并提供一种从序列直接设计热响应蛋白质的工具。 | 无序蛋白质，包括hTau40、Pab1和ELF3。 | 计算生物学 | 阿尔茨海默病 | NA | Mpipi-T（残基级模型，基于物理统计） | 蛋白质序列和相分离实验数据 | 三种蛋白质（hTau40、Pab1、ELF3） | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 14 | 2026-08-18 |
Current status and future perspectives of multi-modal bacteria-based cancer therapies
2025-10, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70485
PMID:41121752
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综述 | 本文综述了基于细菌的多模式癌症治疗方法的当前状况和未来前景，重点探讨细菌的肿瘤靶向机制、免疫调节功能及其作为药物递送平台的潜力。 | 系统总结了基因工程和纳米生物技术在细菌介导的癌症治疗中的整合，提出了多模式协同治疗策略，并展望了人工智能在优化合成生物学设计和预测细菌-宿主相互作用中的应用。 | 未明确指出具体的临床前或临床研究局限性，可能包括细菌治疗的毒性、安全性和临床转化挑战。 | 探讨细菌在肿瘤治疗中的应用，特别是其肿瘤靶向性、免疫调节功能以及作为多效应协同治疗平台的潜力。 | 细菌作为癌症治疗载体，以及其与免疫治疗、光动力治疗、声动力治疗等方法的组合应用。 | 癌症治疗，合成生物学，纳米技术 | 癌症 | 基因工程，纳米技术 | NA | 临床前研究数据，临床进展 | NA | 基因工程 | 细菌 | 基因线路，用于增强肿瘤特异性和治疗效果的合成生物学设计 | 医学 |
| 15 | 2026-08-13 |
Smart closed-loop drug delivery systems
2025-Oct, Nature reviews bioengineering
DOI:10.1038/s44222-025-00328-z
PMID:42583055
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综述 | 本文综述了智能闭环药物递送系统的最新进展，探讨了可穿戴和可植入设备在连续生物标志物监测和响应性治疗中的应用，并强调了人工智能在优化控制算法中的作用 | 强调了将合成生物学和工程细胞整合到可植入设备中的前景，以及人工智能用于增强闭环系统自适应治疗的能力 | 未具体说明，可能受限于当前技术成熟度和临床转化挑战 | 探讨智能闭环药物递送系统的现状、挑战和未来发展方向，以改善慢性病管理的精准性和个性化 | 智能闭环药物递送系统，包括可穿戴和可植入技术，以及相关控制算法 | 生物医学工程 | 慢性疾病 | 实时生物传感 | NA | 生物标志物数据 | NA | NA | NA | 闭环控制回路 | 医学 |
| 16 | 2026-08-12 |
Accelerated design of Escherichia coli reduced genomes using a whole-cell model and machine learning
2025-10-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101392
PMID:40997797
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研究论文 | 本文展示了利用机器学习替代模型加速全细胞模型运行，从而设计具有减少基因组的大肠杆菌细胞。 | 首次将机器学习替代模型应用于全细胞模型以提高计算效率，并成功设计出删除40%基因的大肠杆菌减量基因组。 | 未提及具体局限性，但可能包括依赖全细胞模型的准确性及模拟环境与实验验证的差异。 | 利用机器学习加速全细胞模型，实现高效设计定制化减量基因组的大肠杆菌。 | 大肠杆菌全细胞模型和机器学习替代模型。 | 机器学习, 合成生物学 | NA | 全细胞模型, 机器学习 | 机器学习替代模型 | 全细胞模型模拟数据 | 一个大肠杆菌全细胞模型 | NA | 大肠杆菌 | 减量基因组设计 | 工业生物技术, 合成生物学 |
| 17 | 2026-08-06 |
Kappa(κ)Chip: a modular microfluidic device for analyte screening using parallelized assays and a multiple shear rate approach
2025-10-22, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d5lc00349k
PMID:40878128
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研究论文 | 本文介绍了一种新型微流控芯片κChip，通过并行化设计和多剪切率方法，实现对多种蛋白质粘附性能的高通量筛选。 | κChip芯片采用并行化设计，可从单一输入流同时进行24次粘附测试，大幅减少实验时间和试剂消耗，并首次结合微加工、微流控、材料科学、合成生物学、多物理场模拟和机器学习，实现对生物粘合剂的快速筛选。 | 摘要中未提及明确的局限性。 | 开发一种高通量微流控筛选平台，用于评估蛋白质（如疏水蛋白）对底物的粘附性能，并促进新型生物粘合剂的发现。 | 真菌疏水蛋白经工程化展示在细胞表面，用于评估粘附特性。 | 微流控、合成生物学 | NA | 微流控、细胞粘附测试 | 机器学习模型（具体类型未指定） | 粘附性能数据（图像或定量数据） | 24个并行测试（具体样本数量未说明） | NA | 真菌细胞（用于展示疏水蛋白） | 微流控芯片设计（包括微通道和剪切率控制） | 材料科学、生物医学、海洋防污 |
| 18 | 2026-07-29 |
Harnessing transposable elements for plant functional genomics and genome engineering
2025-10, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.03.007
PMID:40240259
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综述 | 全面概述转座因子在植物功能基因组学和基因组工程中的应用 | 系统整合了植物转座因子的功能机制与前沿生物技术应用，为作物育种和植物合成生物学提供新视角 | 未提及具体实验验证或定量比较不同转座子方法的优缺点 | 综述转座因子在植物功能基因组学和基因组工程中的发现、机制与技术应用 | 植物转座因子 | 基因组学 | NA | 功能基因组学、表观遗传调控 | NA | 基因组序列 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 19 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology and Biomaterials Strategies to Deceive the Tumor Microenvironment in CAR-T Immunotherapy
2025-10, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506429
PMID:40888234
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综述 | 探讨合成生物学和生物材料在改善CAR-T细胞免疫疗法对抗实体瘤效果中的创新策略 | 将生物材料作为精准递送载体、人工抗原呈递细胞和高通量筛选平台，结合合成生物学电路设计增强CAR-T细胞在肿瘤微环境中的功能 | NA | 通过合成生物学和生物材料技术克服CAR-T细胞在实体瘤治疗中的局限性 | CAR-T细胞免疫疗法和肿瘤微环境 | 合成生物学 | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 合成生物学电路设计用于增强CAR-T细胞功能 | 医学 |
| 20 | 2026-07-20 |
The biosynthesis and diversity of taxanes: From pathway elucidation to engineering and synthetic biology
2025-10-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101460
PMID:40696759
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综述 | 该文章综述了紫杉烷类化合物的生物合成途径、多样性及其在合成生物学和工程化生产方面的研究进展 | 提出了通过人工智能引导的定向进化改造细胞色素P450酶、利用植物或微生物底盘以及基因回路技术来扩大紫杉烷类化合物库和可持续生产的策略 | 论文未提供实验验证，仅为策略性综述，缺乏具体实施结果和实际产率数据 | 阐明紫杉烷类化合物的生物合成途径并开发可持续生产方法 | 紫杉烷类化合物及其生物合成途径中的关键酶，如二萜合酶、细胞色素P450酶、乙酰转移酶和BAHD酰基转移酶 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPRi-dCas9基因调控、人工智能引导的定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPRi-dCas9基因回路、代谢分区化技术 | 本氏烟草、大肠杆菌、酿酒酵母 | 代谢通量调控回路、代谢分区化酶复合体 | 医学 |