合成生物学相关文章
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当前共找到 70 篇文献，本页显示第 21 - 40 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-10-10 |
Expanding horizons of CRISPR applications beyond genome editing
2025-Oct, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2025.06.003
PMID:40645879
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综述 | 本文系统综述了CRISPR技术在基因组编辑以外的多样化应用及其未来发展前景 | 全面总结了CRISPR技术在分子诊断、生物传感、转录调控等非编辑领域的创新应用 | NA | 探讨CRISPR技术超越基因组编辑的多元化应用场景 | CRISPR-Cas系统及其衍生技术 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas技术, 单细胞分析, 空间组学, 微流控 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 生物传感器, 合成生物学组件 | 医学诊断, 生物技术, 分子成像 |
| 22 | 2025-10-06 |
Design principles of gene circuits for longevity
2025-Oct, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2025.02.006
PMID:40082090
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综述 | 探讨影响寿命的基因回路设计原则，重点关注反馈回路在维持细胞稳态中的作用 | 从基因回路层面系统分析衰老机制，提出通过工程化稳定固定点或振荡来延长寿命的合成生物学策略 | 主要基于酵母模型的研究，在高等生物中的适用性需要进一步验证 | 揭示基因回路在衰老过程中的调控机制并探索延长寿命的工程化方法 | 基因调控网络和反馈回路，特别是酵母中的SIR2-HAP回路 | 合成生物学 | 衰老相关疾病 | 系统生物学、合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 反馈回路、相互抑制通路、稳定固定点、振荡电路 | 医学 |
| 23 | 2025-10-05 |
Pseudomonas spp. and antimicrobial resistance: unlocking new horizons with 1-hydroxyphenazine
2025-Oct-04, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-025-01355-4
PMID:41045408
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综述 | 本文系统综述了1-羟基吩嗪作为新型抗菌策略在对抗耐药菌方面的潜力 | 首次全面整合1-羟基吩嗪作为病原代谢物和先导化合物的双重作用机制及应用前景 | NA | 探索新型抗菌策略以应对日益严重的抗生素耐药性问题 | 1-羟基吩嗪及其在微生物竞争和抗菌治疗中的应用 | NA | 细菌感染 | 合成生物学、代谢工程、纳米载体递送系统 | NA | 文献资料 | NA | NA | 假单胞菌属 | NA | 医学, 农业, 生物技术 |
| 24 | 2025-10-05 |
AI-directed gene fusing prolongs the evolutionary half-life of synthetic gene circuits
2025-Oct-03, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx0796
PMID:41032600
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研究论文 | 提出一种名为STABLES的基因融合策略，通过机器学习优化基因配对和连接设计，显著提高合成基因电路的进化稳定性 | 开发了结合机器学习预测的基因融合策略，通过将目的基因与必需内源基因连接并在中间插入“渗漏”终止密码子，同时实现选择压力和高表达 | NA | 解决合成生物学中异源基因表达随时间丢失的进化不稳定性问题 | 合成基因电路、荧光蛋白、人胰岛素原 | 合成生物学 | NA | 机器学习、生物信息学分析、生物物理特征分析 | 机器学习框架 | 生物信息学数据、生物物理特征数据 | NA | 基因融合技术 | 大肠杆菌 | 基因融合电路，包含目的基因、必需内源基因和中间渗漏终止密码子 | 工业生物技术,合成生物学 |
| 25 | 2025-10-05 |
The mechanism of thioamide formation by the YcfA-YcfC system in 6-thioguanine biosynthesis
2025-Oct-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63937-7
PMID:41044055
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研究论文 | 本研究揭示了YcfA-YcfC系统在6-硫代鸟嘌呤生物合成中形成硫酰胺键的分子机制 | 首次通过生化与结构生物学方法阐明了YcfA的七聚体组装机制及其与GTP和PLP的相互作用，并成功合成具有抗菌活性的硒代类似物 | 未在完整细胞环境中验证该系统的功能，且对YcfC的具体催化机制仍需进一步研究 | 阐明6-硫代鸟嘌呤生物合成中关键硫酰胺基团形成的分子机制 | YcfA-YcfC酶系统及其在6-硫代鸟嘌呤生物合成中的作用 | 结构生物学与生物化学 | 儿童急性淋巴细胞白血病 | 晶体结构解析、冷冻电镜(cryo-EM)、功能分析、多组学分析 | NA | 结构数据、生化数据、组学数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发、合成生物学 |
| 26 | 2025-10-05 |
How hard is it to encapsulate life? The general constraints on encapsulation
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0297
PMID:41035324
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研究论文 | 本文探讨了生命系统封装面临的一般性约束条件 | 通过分析现存生物化学系统和通用自催化系统，揭示了封装生命系统的速率和体积分数限制 | 基于地球现有生物系统的分析可能不具普适性 | 研究生命系统封装的基本约束条件 | 地球现存生物化学系统、通用自催化系统 | 合成生物学 | NA | 理论建模 | NA | 理论分析 | NA | NA | NA | NA | 生命起源研究, 天体生物学, 合成生物学 |
| 27 | 2025-10-05 |
Before LUCA: unearthing the chemical roots of metabolism
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0292
PMID:41035332
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研究论文 | 探讨从地球化学到生物化学的转变过程，通过计算方法和系统化学研究原始生化系统的演化 | 将LUCA代谢反应规则映射到前生物反应，探索非生物化学与早期生命之间的可能联系 | 连接原始地球化学与LUCA更复杂代谢能力仍存在挑战 | 研究生命起源过程中代谢系统的演化机制 | 原始生化系统、前生物反应、LUCA代谢 | 系统化学、计算生物学 | NA | 计算方法、生成模型 | 生成模型 | 化学反应数据、热力学数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 28 | 2025-10-05 |
Towards origins of virtual artificial life: an overview
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0298
PMID:41035322
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综述 | 本文概述了人工生命领域特别是虚拟生命在定义、检测和起源机制方面的研究现状 | 提出了基于工程视角的人工生命定义框架，将生命系统分解为抽象需求、通用设计和具体实现机制三个层次 | 目前尚未展示出完全满足所有工程要求的虚拟人工生命系统 | 探讨人工生命特别是虚拟生命的起源机制和定义标准 | 人工生命系统，重点关注虚拟生命形式 | 人工生命 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 29 | 2025-10-05 |
Origins of life: the possible and the actual
2025-Oct-02, Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences
DOI:10.1098/rstb.2024.0281
PMID:41035333
|
综述 | 本文探讨生命起源的核心问题，包括生命形成的可能途径、必然性及多样性表现 | 整合多学科视角系统分析生命起源的理论框架与实验方法，强调原始细胞系统的关键作用 | NA | 理解生命起源的机制与约束条件 | 原始细胞系统与生命起源过程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 30 | 2025-10-05 |
Harnessing transposable elements for plant functional genomics and genome engineering
2025-Oct, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.03.007
PMID:40240259
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综述 | 本文系统阐述了植物转座元件的功能机制及其在功能基因组学和基因组工程中的前沿应用 | 整合转座元件的基础发现与前沿生物技术应用，提出将转座元件知识应用于作物育种和植物合成生物学的新视角 | NA | 系统梳理植物转座元件的综合知识与生物技术应用 | 植物转座元件 | 植物功能基因组学 | NA | 基因组工程 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业, 合成生物学 |
| 31 | 2025-10-05 |
Synthetic Biology and Biomaterials Strategies to Deceive the Tumor Microenvironment in CAR-T Immunotherapy
2025-Oct, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506429
PMID:40888234
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综述 | 探讨合成生物学和生物材料在改善CAR-T细胞免疫疗法对抗实体瘤效果中的创新策略 | 将生物材料作为精准递送载体、人工抗原呈递细胞和高通量筛选平台，结合合成生物学电路设计增强CAR-T细胞在肿瘤微环境中的功能 | NA | 通过合成生物学和生物材料技术克服CAR-T细胞在实体瘤治疗中的局限性 | CAR-T细胞免疫疗法和肿瘤微环境 | 合成生物学 | 实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | T细胞 | 合成生物学电路设计用于增强CAR-T细胞功能 | 医学 |
| 32 | 2025-10-05 |
Mutation-induced filaments of folded proteins are inert and non-toxic in a cellular system
2025-Oct, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00144-y
PMID:40954318
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研究论文 | 本研究系统表征了由折叠蛋白质聚合形成的丝状组装体（聚集体），并揭示了其在细胞中的惰性和无毒性特征 | 首次明确定义并系统表征了区别于传统聚集体的蛋白质折叠态聚集体，开发了区分这两种组装体的细胞实验方法 | 研究仅基于特定细胞系统，尚未验证在其他生物体系中的普适性 | 探究突变诱导的折叠蛋白质丝状组装体的细胞生物学特性 | 蛋白质丝状组装体（聚集体） | 合成生物学 | NA | 定量蛋白质组学、细胞共定位分析 | NA | 蛋白质组数据、细胞成像数据 | NA | NA | 细胞系统 | NA | 合成生物学, 细胞内工程 |
| 33 | 2025-10-05 |
Advances in Metabolic Engineering for the Accumulation of Astaxanthin Biosynthesis
2025-Oct, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01289-1
PMID:39373956
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综述 | 本文全面综述了虾青素生物合成的研究进展，重点关注微生物发酵生产策略 | 系统比较了天然宿主Xanthophyllomyces dendrorhous与异源宿主Yarrowia lipolytica和Saccharomyces cerevisiae在虾青素生物合成中的应用 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学方法实现虾青素的大规模微生物生产 | 虾青素生物合成途径及相关微生物宿主 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学、微生物发酵 | NA | NA | NA | NA | Xanthophyllomyces dendrorhous, Yarrowia lipolytica, Saccharomyces cerevisiae | 虾青素生物合成途径 | 饲料,食品,化妆品,医药 |
| 34 | 2025-10-05 |
Bio-Photo Dual Action of Intracellular Radical Polymerization
2025-Oct-01, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c10871
PMID:40977043
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研究论文 | 开发了一种生物标志物和光门控的细胞内自由基聚合策略，用于精确细胞器干预 | 首次提出刺激响应型光催化剂策略，通过AND门控机制实现生物标志物和光照双重控制的细胞内聚合 | NA | 实现细胞内聚合的时空控制，推进治疗发现和合成生物学应用 | 细胞内自由基聚合过程 | 合成生物学 | NA | 光诱导电子/能量转移-可逆加成-断裂链转移(PET-RAFT)聚合 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞 | AND门控生物传感器，响应内源性活性氧/硫物种(ROS/RSS)或酶 | 医学, 合成生物学 |
| 35 | 2025-10-05 |
Rubisco-Centric Strategies for Carbon Conservation in Synthetic Biology
2025-Oct-01, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04813
PMID:41031513
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综述 | 本文系统总结了Rubisco酶的基础研究及其在合成生物学中提升碳固定效率的策略与应用 | 首次系统整合了从经典定向进化到人工智能理性设计的五种酶效率提升策略，并提出了跨尺度的设计框架 | NA | 开发碳效率更高的生物制造技术以应对全球气候危机 | Rubisco酶及其在自养和异养微生物中的应用 | 合成生物学 | NA | 定向进化、人工智能理性设计 | NA | NA | NA | NA | 自养微生物,异养微生物 | 卡尔文循环碳固定途径 | 工业生物技术,环境 |
| 36 | 2025-10-05 |
A fragment in the 5' untranslated region of alcohol oxidase 1 promoter significantly influencing gene expression of Komagataella phaffii
2025-Oct-15, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149745
PMID:40902693
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研究论文 | 本研究在Komagataella phaffii的醇氧化酶1启动子5'非翻译区鉴定出一个13bp的负调控元件D3，敲除该片段可使异源蛋白表达提高3.5倍 | 首次在K. phaffii醇氧化酶1启动子5'UTR区鉴定出具有负调控功能的13bp顺式作用元件D3 | NA | 解析K. phaffii醇氧化酶1启动子调控机制并提高异源蛋白表达效率 | Komagataella phaffii醇氧化酶1启动子的5'非翻译区 | 合成生物学 | NA | 基因片段敲除、转录组分析、电泳迁移率变动分析、DNA pull-down、液相色谱-质谱联用 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | NA | 基因敲除 | Komagataella phaffii | 启动子工程改造 | 工业生物技术 |
| 37 | 2025-10-05 |
Glyceollin biosynthesis in a plant chassis engineered for isoflavone production
2025-Oct, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-025-01914-3
PMID:40437134
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研究论文 | 本研究通过代谢工程在烟草叶片中重建了glyceollin的生物合成途径，实现了异黄酮类化合物的高效生产 | 成功鉴定了6种glyceollin合成酶，完成了15步生物合成途径的解析，并在植物底盘细胞中实现了glyceollin的从头全合成 | NA | 解析glyceollin生物合成途径并建立合成生物学生产平台 | 大豆glyceollin生物合成途径及相关酶 | 合成生物学 | 植物病害 | 代谢工程、酶筛选、体外抑菌实验 | NA | 代谢物分析、酶活性数据 | NA | 代谢工程 | 本氏烟草 | 15步glyceollin生物合成途径，包含异黄酮前体daidzein生产模块和glyceollin合成模块 | 农业,医药 |
| 38 | 2025-10-05 |
Bacterial exopolysaccharides and live biotherapeutics: Orchestrating immune modulation and therapeutic potential in the gut microbiome era
2025-Oct, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118510
PMID:40902409
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综述 | 本文综述了肠道微生物产生的胞外多糖在免疫调节中的关键作用及其治疗潜力 | 重点关注肠道共生菌和益生菌产生的免疫调节性胞外多糖，提出了通过合成生物学设计下一代免疫疗法的路线图 | 存在结构-功能知识空白，在连接特定结构基序与可预测免疫结果方面存在挑战，规模化生产方法仍需改进 | 探讨细菌胞外多糖的免疫调节功能及其在肠道微生物组时代的治疗应用 | 肠道共生菌和益生菌产生的微生物胞外多糖 | 合成生物学 | 免疫相关疾病 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 肠道共生菌, 益生菌 | 定制化胞外多糖原位生产系统 | 医学 |
| 39 | 2025-10-05 |
Recent advances in microbially derived chlorinated antiparasitic compounds
2025-Oct, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-024-11018-0
PMID:39476277
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综述 | 系统回顾微生物来源的氯化抗寄生虫化合物研究进展及其药物开发潜力 | 首次对1963年至今微生物来源的氯化抗寄生虫化合物进行全面梳理，发现28种具有明确抗寄生虫活性的氯化化合物 | 微生物来源的氯化抗寄生虫化合物相关文献资料有限 | 开发更安全、选择性更高、环境友好且疗效增强的抗寄生虫药物 | 微生物来源的氯化天然代谢产物 | 药物化学与合成生物学 | 寄生虫病 | PKS、NRPS、PKS-NRPS生物合成途径 | NA | 文献数据 | 28种氯化化合物 | 合成生物学、组合化学、有机合成 | 微生物 | NA | 医药 |
| 40 | 2025-10-05 |
Identification and application of bioparts for plant synthetic biology
2025-Oct, Molecules and cells
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.mocell.2025.100273
PMID:40902856
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综述 | 本文综述植物合成生物学中生物元件的鉴定与应用，重点关注启动子和终止子在基因表达调控中的作用 | 系统阐述双向启动子在基因叠加中的应用价值，以及启动子与终止子组合平衡对转基因表达稳定性的重要性 | NA | 探讨植物合成生物学中生物元件的鉴定方法和应用策略 | 植物合成生物学中的生物元件（启动子、终止子等） | 合成生物学 | NA | ATAC-seq, STARR-seq, 深度学习 | 深度学习模型 | 基因组序列数据 | NA | NA | 植物 | 基因回路设计，基因表达调控系统 | 医药，疫苗，生物燃料，生物材料 |