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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-11-04 |
Next-generation stress-inducible Komagataella phaffii promoter variants
2025-Oct-30, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02825-7
PMID:41168757
|
研究论文 | 本研究通过系统突变方法开发了新一代甲醇非依赖型且生长解耦的Komagataella phaffii启动子变体 | 采用半理性区块扫描方法系统鉴定了PDH启动子的激活位点,开发出活性高达亲本启动子250%的多组合变体 | NA | 扩展Komagataella phaffii启动子工具箱,实现甲醇非依赖和生长解耦的蛋白生产 | Komagataella phaffii PDH启动子及其突变变体 | 合成生物学 | NA | 单碱基突变、序列区块步行突变、半理性区块扫描方法 | NA | 荧光强度数据、酶活性数据 | 152个系统生成的启动子变体 | 定点突变 | Komagataella phaffii | 启动子工程、多基因平衡表达系统 | 工业生物技术 |
| 42 | 2025-11-02 |
Mining Microbial Dark Matter: Advanced Cultivation Techniques for Bioactive Compound Discovery
2025-Oct-20, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph18101583
PMID:41155696
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综述 | 本文综述了利用先进培养技术挖掘未培养微生物资源以发现生物活性化合物的最新进展 | 结合宏基因组学、单细胞基因组学和合成生物学等先进技术开发新型培养策略,突破了传统实验室培养技术的限制 | NA | 探索和开发未培养微生物中的生物活性天然产物资源 | 环境中的未培养微生物及其天然产物 | 合成生物学 | NA | 宏基因组学, 单细胞基因组学, 合成生物学 | NA | 基因组数据, 化学数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 43 | 2025-11-02 |
Heterologous Biosynthesis of Crocin I in Solanum lycopersicum L
2025-Oct-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26209984
PMID:41155278
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研究论文 | 本研究在番茄中实现了藏花素I的异源生物合成 | 首次在番茄中成功构建藏花素I的异源生物合成途径,使藏花素I占总藏花素含量的97-99% | NA | 开发藏花素I的新型生物合成平台 | 转基因番茄植物 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化、In-fusion技术、2A自切割肽 | NA | NA | NA | 农杆菌介导转化,In-fusion技术 | 番茄 | 藏花素生物合成途径 | 医药,食品,个人护理产品 |
| 44 | 2025-11-02 |
Key Technologies of Synthetic Biology in Industrial Microbiology
2025-Oct-13, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13102343
PMID:41156802
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综述 | 本文探讨了合成生物学在工业微生物领域的关键技术及其应用前景 | 系统阐述了合成生物学如何通过基因编辑、代谢工程等技术革新工业微生物领域 | 该领域仍面临诸多挑战,需要跨学科合作推动发展 | 讨论合成生物学在工业微生物中的关键技术及应用前景 | 工业微生物 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术、代谢工程、高通量筛选、自动化平台、合成基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工业微生物 | 代谢通路优化与重构 | 生物制造, 能源生产, 环境保护, 药物开发 |
| 45 | 2025-11-02 |
Expanding the Terpene Universe: Synthetic Biology and Non-Natural Chemistry in Engineered Microorganisms
2025-Oct-13, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules30204065
PMID:41157082
|
综述 | 本文综述了通过合成生物学和非天然化学在工程微生物中扩展萜类化合物多样性的策略 | 将非生物化学转化整合到工程生物合成途径中,利用人工金属酶催化非天然卡宾转移反应,超越自然界合成能力 | NA | 开发微生物细胞工厂以实现萜类化合物的可持续生产并扩展其结构多样性 | 萜类化合物及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、非天然化学转化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 甲羟戊酸途径、甲基赤藓糖醇磷酸途径、萜类合酶系统 | 医药、香料、生物燃料 |
| 46 | 2025-10-31 |
Kinetically Programmed Signaling Cascades for Molecular Detection
2025-Oct-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c12059
PMID:41094711
|
研究论文 | 本研究利用DNA化学开发了一种基于动力学编程的信号级联系统,用于分子检测和生物传感 | 首次系统研究动力学编程对信号级联系统性能的影响,并展示了其在多种分子检测中的应用 | NA | 开发可编程的DNA信号级联系统并研究其动力学特性 | DNA分子信号级联系统 | 合成生物学 | NA | DNA化学,电化学传感 | NA | 实验数据,模拟数据 | NA | NA | NA | 四模块信号级联系统(输入、受体、处理器、输出) | 医学,生物传感,分子计算,药物递送 |
| 47 | 2025-10-31 |
Ultrafast Conversion of CO2 into C3-C4 Diols in a Synergistic Electrochemical and AI-Assisted Biosynthesis System
2025-Oct-29, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c14039
PMID:41100764
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研究论文 | 开发了一种电化学生物合成级联系统,将CO2高效转化为C3-C4二醇 | 结合电催化与AI辅助生物设计的协同系统,实现安培级电流密度下的高效转化 | 未明确说明系统长期运行的稳定性和规模化成本 | 开发可持续的二氧化碳转化技术生产高价值化学品 | C3-C4二醇(1,3-丙二醇和1,3-丁二醇) | 合成生物学 | NA | 电化学还原、AI辅助设计、分子动力学模拟、原位光谱分析 | NA | 光谱数据、动力学数据 | NA | 理性设计 | NA | 电化学生物合成级联系统,包含CO还原和C-C键延伸模块 | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 48 | 2025-10-31 |
Bio-digital feedback loop systems: a synergistic integration of predictive genomics, genome editing, and AI-driven phenomic synthesis for next-generation edible and medicinal mushroom breeding
2025-Oct-10, Antonie van Leeuwenhoek
DOI:10.1007/s10482-025-02176-8
PMID:41073589
|
综述 | 提出一种生物-数字反馈循环系统框架,整合多组学、CRISPR工程底盘菌株和AI驱动的表型组学,用于精准食用菌育种 | 首次提出将预测基因组学、基因组编辑和AI驱动的表型组学协同整合的生物-数字反馈循环系统,实现蘑菇的可编程设计 | NA | 开发下一代食用和药用蘑菇的精准育种方法 | 食用和药用蘑菇 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、CRISPR-Cas9、合成生物学工具、人工智能 | AI算法 | 基因组数据、表型组数据、图像数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 蘑菇底盘菌株 | 模块化基因电路、即插即用底盘菌株设计 | 农业, 医药, 环境 |
| 49 | 2025-10-31 |
Kinetics and Activation Strategies in Toehold-Mediated and Toehold-Free DNA Strand Displacement
2025-Oct-09, Biosensors
DOI:10.3390/bios15100683
PMID:41149335
|
综述 | 本文综述了DNA链置换反应中动力学特性及激活策略的最新进展 | 强调链邻近性作为核心驱动力,系统总结了基于邻近性的多种激活策略及其在构建动态DNA网络中的应用 | NA | 总结DNA链置换反应动力学调控策略的基本原理和最新进展 | DNA链置换反应及其激活策略 | DNA纳米技术 | NA | DNA链置换技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 链置换反应网络、动态网络 | 生物传感,合成生物学,生物计算,医学诊断 |
| 50 | 2025-10-31 |
Fungal Innovations-Advancing Sustainable Materials, Genetics, and Applications for Industry
2025-Oct-06, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof11100721
PMID:41149911
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综述 | 本文综述了真菌在可持续材料开发、遗传工程和工业应用中的创新潜力 | 重点关注合成生物学工具在真菌工程化中的应用,包括可编程调控器、CRISPR基因组编辑和组合通路优化 | 真菌复杂生物系统的控制和优化能力仍存在局限 | 探索真菌在可持续生物基技术中的潜力,促进各行业可持续发展 | 丝状真菌及其产生的刚性和柔性材料 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑、组合通路优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 丝状真菌 | 可编程调控器、代谢通路优化 | 材料,能源,工业生物技术,环境 |
| 51 | 2025-10-31 |
From Bench to Bedside: Emerging Paradigms in CAR-T Cell Therapy for Solid Malignancies
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505822
PMID:40855662
|
综述 | 本文综述CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的新兴范式与挑战 | 系统总结CRISPR编辑、现货型异体CAR-T、AI驱动靶点发现及合成生物学等前沿技术突破 | 主要基于早期临床试验数据,长期疗效与安全性仍需验证 | 探索提升CAR-T疗法在实体瘤中疗效的策略与方法 | 胃癌、肝癌、胶质瘤等实体恶性肿瘤 | NA | 实体恶性肿瘤 | CRISPR基因编辑、人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞、NK细胞、巨噬细胞 | 嵌合抗原受体设计、细胞因子装甲策略 | 医学 |
| 52 | 2025-10-30 |
A Lactose-Based Kluyveromyces lactis Cell-Free Protein Synthesis System
2025-Oct-23, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00011
PMID:41158605
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于乳酸克鲁维酵母的无细胞蛋白质合成平台,使用乳糖作为可持续碳源和能源 | 首次将乳糖作为碳源和能源整合到克鲁维酵母无细胞蛋白质合成系统中,并采用半自动化实验设计方法优化反应条件 | 仅验证了两种模型蛋白的合成效果,需要进一步测试更多蛋白质类型 | 开发可持续且经济高效的酵母无细胞蛋白质合成平台 | 乳酸克鲁维酵母无细胞提取物和蛋白质合成系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS)、实验设计(DoE)、拉丁超立方实验设计 | NA | 蛋白质合成产量数据 | 测试了128种独特的CFPS反应混合物组成 | NA | Kluyveromyces lactis(乳酸克鲁维酵母) | NA | 医药、工业生物技术 |
| 53 | 2025-10-29 |
Actin Polymerizing Motors to Assist Cytoskeleton-like Networks Formation in Artificial Cells
2025-Oct-28, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c12624
PMID:41100205
|
研究论文 | 本研究利用肌动蛋白聚合纳米马达辅助人工细胞内细胞骨架网络的形成 | 首次将肌动蛋白聚合纳米马达与人工细胞结合,模仿细菌运动机制实现主动推进 | NA | 开发能够模拟生物细胞机械响应功能的人工细胞系统 | 人工细胞和肌动蛋白聚合纳米马达 | 合成生物学 | NA | 肌动蛋白聚合反应、哺乳动物细胞裂解液环境 | NA | NA | NA | NA | NA | 肌动蛋白丝聚合形成细胞骨架样网络 | 医学, 生物技术 |
| 54 | 2025-10-28 |
The biosynthesis and diversity of taxanes: From pathway elucidation to engineering and synthetic biology
2025-Oct-13, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101460
PMID:40696759
|
综述 | 本文综述紫杉烷生物合成途径解析及通过合成生物学策略开发可持续生产方法的研究进展 | 提出整合酶工程、代谢工程和人工智能引导的定向进化等策略,构建新型紫杉烷衍生物库 | 仅I型紫杉烷骨架生物合成途径接近完全解析,其他类型骨架途径仍不明确 | 阐明多种紫杉烷骨架生物合成途径并开发可持续生产方法 | 紫杉烷类二萜天然产物及其生物合成酶 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPRi-dCas9基因回路、人工智能引导定向进化、代谢工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 本氏烟草、大肠杆菌、酿酒酵母 | 代谢途径工程、基因回路 | 医药 |
| 55 | 2025-10-22 |
HUH endonuclease-mediated DNA-protein conjugates: sequence-specific tools and cellular applications
2025-Oct-21, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc04628a
PMID:41032013
|
综述 | 本文综述了HUH内切核酸酶作为自标记蛋白标签在序列特异性共价连接未修饰ssDNA方面的最新进展及其在细胞研究中的应用 | 利用HUH内切核酸酶实现序列特异性、生物正交且生理条件下稳健的DNA-蛋白质共价连接 | NA | 开发基于HUH内切核酸酶的DNA-蛋白质偶联工具及其在细胞研究中的应用 | HUH内切核酸酶及其DNA-蛋白质偶联物 | 合成生物学 | NA | HUH内切核酸酶技术、定向进化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | DNA-蛋白质偶联系统 | 医学, 合成生物学 |
| 56 | 2025-10-18 |
Accelerated design of Escherichia coli reduced genomes using a whole-cell model and machine learning
2025-Oct-15, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101392
PMID:40997797
|
研究论文 | 本研究结合全细胞模型和机器学习加速大肠杆菌简化基因组的设计 | 使用机器学习代理模型将全细胞模型的计算时间减少95%,并成功设计出移除40%基因的简化大肠杆菌基因组 | 全细胞模型运行时间较长是主要限制因素 | 开发加速基因组设计的计算方法 | 大肠杆菌基因组 | 合成生物学 | NA | 全细胞建模、机器学习 | 机器学习代理模型 | 计算模拟数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | 简化基因组设计 | 工业生物技术 |
| 57 | 2025-10-18 |
Biochemical and structural characterization of chlorite dismutase enzyme from Pseudomonas aeruginosa
2025-Oct, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70151
PMID:40458033
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研究论文 | 本研究对铜绿假单胞菌的氯酸歧化酶进行了克隆、生化和结构表征 | 首次报道了二聚体氯酸歧化酶在原子分辨率(0.99Å)下的晶体结构,并对其催化机制提供了新见解 | NA | 表征铜绿假单胞菌氯酸歧化酶的生化特性和结构特征 | 铜绿假单胞菌的氯酸歧化酶 | 结构生物学 | NA | X射线晶体学、稳态动力学 | NA | 结构数据、动力学数据 | NA | 克隆 | 铜绿假单胞菌 | NA | 环境、生物医学、合成生物学 |
| 58 | 2025-10-12 |
A Photonastic Prototissue Capable of Photo-Mechano-Chemical Transduction
2025-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202502830
PMID:40350988
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研究论文 | 本研究通过自下而上的化学方法构建了具有光-力-化学转导能力的光敏原型组织 | 开发了包含金纳米颗粒光热转导原型细胞器和热响应聚合物原型皮层的先进原型细胞单元,首次实现了原型组织的光诱导可逆收缩与复杂运动 | NA | 构建能够模拟生物组织复杂能量转导过程的原型组织系统 | 原型细胞、原型组织、金纳米颗粒、热响应聚合物 | 合成生物学 | NA | 自下而上组装、光热转导 | NA | NA | NA | NA | NA | 光-力-化学转导系统,能够通过光控机械运动可逆开关内化酶代谢 | 材料科学、工业生物技术 |
| 59 | 2025-10-12 |
RNAtranslator: Modeling protein-conditional RNA design as sequence-to-sequence natural language translation
2025-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013541
PMID:41042819
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研究论文 | 提出RNAtranslator模型,将蛋白质条件性RNA设计建模为序列到序列的自然语言翻译问题 | 首次将蛋白质条件性RNA设计构建为序列到序列的自然语言翻译问题,无需后生成优化即可直接生成结合RNA序列 | NA | 开发能够为任意蛋白质靶标设计选择性结合RNA序列的计算方法 | 蛋白质-RNA相互作用 | 自然语言处理 | NA | 生成语言模型 | 序列到序列模型 | RNA和蛋白质序列数据 | NA | NA | NA | NA | 医学, 合成生物学 |
| 60 | 2025-10-11 |
Building climate-resilient crops: genetic, environmental, and technological strategies for heat and drought stress tolerance
2025-Oct-09, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf111
PMID:40062368
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综述 | 探讨通过遗传、环境和技术策略构建耐热耐旱作物的综合方法 | 强调将基础研究与实际农业环境相结合,并评估新兴技术对作物抗逆性的提升潜力 | 现有育种计划受限于耐受机制的复杂性和农业环境的多变性 | 开发应对气候变化的热旱胁迫耐受型作物 | 小麦、水稻、大豆、玉米等主要粮食作物 | 农业生物技术 | NA | 合成生物学、先进育种技术、高通量表型分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |