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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 61 | 2025-11-02 |
Heterologous Biosynthesis of Crocin I in Solanum lycopersicum L
2025-Oct-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26209984
PMID:41155278
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研究论文 | 本研究在番茄中实现了藏花素I的异源生物合成 | 首次在番茄中成功构建藏花素I的异源生物合成途径,使藏花素I占总藏花素含量的97-99% | NA | 开发藏花素I的新型生物合成平台 | 转基因番茄植物 | 合成生物学 | NA | 农杆菌介导转化、In-fusion技术、2A自切割肽 | NA | NA | NA | 农杆菌介导转化,In-fusion技术 | 番茄 | 藏花素生物合成途径 | 医药,食品,个人护理产品 |
| 62 | 2025-11-02 |
Key Technologies of Synthetic Biology in Industrial Microbiology
2025-Oct-13, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13102343
PMID:41156802
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综述 | 本文探讨了合成生物学在工业微生物领域的关键技术及其应用前景 | 系统阐述了合成生物学如何通过基因编辑、代谢工程等技术革新工业微生物领域 | 该领域仍面临诸多挑战,需要跨学科合作推动发展 | 讨论合成生物学在工业微生物中的关键技术及应用前景 | 工业微生物 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术、代谢工程、高通量筛选、自动化平台、合成基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 工业微生物 | 代谢通路优化与重构 | 生物制造, 能源生产, 环境保护, 药物开发 |
| 63 | 2025-11-02 |
Expanding the Terpene Universe: Synthetic Biology and Non-Natural Chemistry in Engineered Microorganisms
2025-Oct-13, Molecules (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/molecules30204065
PMID:41157082
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综述 | 本文综述了通过合成生物学和非天然化学在工程微生物中扩展萜类化合物多样性的策略 | 将非生物化学转化整合到工程生物合成途径中,利用人工金属酶催化非天然卡宾转移反应,超越自然界合成能力 | NA | 开发微生物细胞工厂以实现萜类化合物的可持续生产并扩展其结构多样性 | 萜类化合物及其非天然衍生物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、非天然化学转化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 甲羟戊酸途径、甲基赤藓糖醇磷酸途径、萜类合酶系统 | 医药、香料、生物燃料 |
| 64 | 2025-10-31 |
Bio-digital feedback loop systems: a synergistic integration of predictive genomics, genome editing, and AI-driven phenomic synthesis for next-generation edible and medicinal mushroom breeding
2025-Oct-10, Antonie van Leeuwenhoek
DOI:10.1007/s10482-025-02176-8
PMID:41073589
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综述 | 提出一种生物-数字反馈循环系统框架,整合多组学、CRISPR工程底盘菌株和AI驱动的表型组学,用于精准食用菌育种 | 首次提出将预测基因组学、基因组编辑和AI驱动的表型组学协同整合的生物-数字反馈循环系统,实现蘑菇的可编程设计 | NA | 开发下一代食用和药用蘑菇的精准育种方法 | 食用和药用蘑菇 | 合成生物学 | NA | 多组学分析、CRISPR-Cas9、合成生物学工具、人工智能 | AI算法 | 基因组数据、表型组数据、图像数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 蘑菇底盘菌株 | 模块化基因电路、即插即用底盘菌株设计 | 农业, 医药, 环境 |
| 65 | 2025-10-31 |
Kinetics and Activation Strategies in Toehold-Mediated and Toehold-Free DNA Strand Displacement
2025-Oct-09, Biosensors
DOI:10.3390/bios15100683
PMID:41149335
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综述 | 本文综述了DNA链置换反应中动力学特性及激活策略的最新进展 | 强调链邻近性作为核心驱动力,系统总结了基于邻近性的多种激活策略及其在构建动态DNA网络中的应用 | NA | 总结DNA链置换反应动力学调控策略的基本原理和最新进展 | DNA链置换反应及其激活策略 | DNA纳米技术 | NA | DNA链置换技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 链置换反应网络、动态网络 | 生物传感,合成生物学,生物计算,医学诊断 |
| 66 | 2025-10-31 |
Fungal Innovations-Advancing Sustainable Materials, Genetics, and Applications for Industry
2025-Oct-06, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof11100721
PMID:41149911
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综述 | 本文综述了真菌在可持续材料开发、遗传工程和工业应用中的创新潜力 | 重点关注合成生物学工具在真菌工程化中的应用,包括可编程调控器、CRISPR基因组编辑和组合通路优化 | 真菌复杂生物系统的控制和优化能力仍存在局限 | 探索真菌在可持续生物基技术中的潜力,促进各行业可持续发展 | 丝状真菌及其产生的刚性和柔性材料 | 合成生物学 | NA | CRISPR基因组编辑、组合通路优化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 丝状真菌 | 可编程调控器、代谢通路优化 | 材料,能源,工业生物技术,环境 |
| 67 | 2025-10-31 |
From Bench to Bedside: Emerging Paradigms in CAR-T Cell Therapy for Solid Malignancies
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202505822
PMID:40855662
|
综述 | 本文综述CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的新兴范式与挑战 | 系统总结CRISPR编辑、现货型异体CAR-T、AI驱动靶点发现及合成生物学等前沿技术突破 | 主要基于早期临床试验数据,长期疗效与安全性仍需验证 | 探索提升CAR-T疗法在实体瘤中疗效的策略与方法 | 胃癌、肝癌、胶质瘤等实体恶性肿瘤 | NA | 实体恶性肿瘤 | CRISPR基因编辑、人工智能、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞、NK细胞、巨噬细胞 | 嵌合抗原受体设计、细胞因子装甲策略 | 医学 |
| 68 | 2025-10-30 |
A Lactose-Based Kluyveromyces lactis Cell-Free Protein Synthesis System
2025-Oct-23, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00011
PMID:41158605
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研究论文 | 本研究开发了一种基于乳酸克鲁维酵母的无细胞蛋白质合成平台,使用乳糖作为可持续碳源和能源 | 首次将乳糖作为碳源和能源整合到克鲁维酵母无细胞蛋白质合成系统中,并采用半自动化实验设计方法优化反应条件 | 仅验证了两种模型蛋白的合成效果,需要进一步测试更多蛋白质类型 | 开发可持续且经济高效的酵母无细胞蛋白质合成平台 | 乳酸克鲁维酵母无细胞提取物和蛋白质合成系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白质合成(CFPS)、实验设计(DoE)、拉丁超立方实验设计 | NA | 蛋白质合成产量数据 | 测试了128种独特的CFPS反应混合物组成 | NA | Kluyveromyces lactis(乳酸克鲁维酵母) | NA | 医药、工业生物技术 |
| 69 | 2025-10-29 |
Actin Polymerizing Motors to Assist Cytoskeleton-like Networks Formation in Artificial Cells
2025-Oct-28, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c12624
PMID:41100205
|
研究论文 | 本研究利用肌动蛋白聚合纳米马达辅助人工细胞内细胞骨架网络的形成 | 首次将肌动蛋白聚合纳米马达与人工细胞结合,模仿细菌运动机制实现主动推进 | NA | 开发能够模拟生物细胞机械响应功能的人工细胞系统 | 人工细胞和肌动蛋白聚合纳米马达 | 合成生物学 | NA | 肌动蛋白聚合反应、哺乳动物细胞裂解液环境 | NA | NA | NA | NA | NA | 肌动蛋白丝聚合形成细胞骨架样网络 | 医学, 生物技术 |
| 70 | 2025-10-22 |
HUH endonuclease-mediated DNA-protein conjugates: sequence-specific tools and cellular applications
2025-Oct-21, Chemical communications (Cambridge, England)
DOI:10.1039/d5cc04628a
PMID:41032013
|
综述 | 本文综述了HUH内切核酸酶作为自标记蛋白标签在序列特异性共价连接未修饰ssDNA方面的最新进展及其在细胞研究中的应用 | 利用HUH内切核酸酶实现序列特异性、生物正交且生理条件下稳健的DNA-蛋白质共价连接 | NA | 开发基于HUH内切核酸酶的DNA-蛋白质偶联工具及其在细胞研究中的应用 | HUH内切核酸酶及其DNA-蛋白质偶联物 | 合成生物学 | NA | HUH内切核酸酶技术、定向进化 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | DNA-蛋白质偶联系统 | 医学, 合成生物学 |
| 71 | 2025-10-18 |
Biochemical and structural characterization of chlorite dismutase enzyme from Pseudomonas aeruginosa
2025-Oct, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70151
PMID:40458033
|
研究论文 | 本研究对铜绿假单胞菌的氯酸歧化酶进行了克隆、生化和结构表征 | 首次报道了二聚体氯酸歧化酶在原子分辨率(0.99Å)下的晶体结构,并对其催化机制提供了新见解 | NA | 表征铜绿假单胞菌氯酸歧化酶的生化特性和结构特征 | 铜绿假单胞菌的氯酸歧化酶 | 结构生物学 | NA | X射线晶体学、稳态动力学 | NA | 结构数据、动力学数据 | NA | 克隆 | 铜绿假单胞菌 | NA | 环境、生物医学、合成生物学 |
| 72 | 2025-10-12 |
A Photonastic Prototissue Capable of Photo-Mechano-Chemical Transduction
2025-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202502830
PMID:40350988
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研究论文 | 本研究通过自下而上的化学方法构建了具有光-力-化学转导能力的光敏原型组织 | 开发了包含金纳米颗粒光热转导原型细胞器和热响应聚合物原型皮层的先进原型细胞单元,首次实现了原型组织的光诱导可逆收缩与复杂运动 | NA | 构建能够模拟生物组织复杂能量转导过程的原型组织系统 | 原型细胞、原型组织、金纳米颗粒、热响应聚合物 | 合成生物学 | NA | 自下而上组装、光热转导 | NA | NA | NA | NA | NA | 光-力-化学转导系统,能够通过光控机械运动可逆开关内化酶代谢 | 材料科学、工业生物技术 |
| 73 | 2025-10-11 |
Building climate-resilient crops: genetic, environmental, and technological strategies for heat and drought stress tolerance
2025-Oct-09, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/eraf111
PMID:40062368
|
综述 | 探讨通过遗传、环境和技术策略构建耐热耐旱作物的综合方法 | 强调将基础研究与实际农业环境相结合,并评估新兴技术对作物抗逆性的提升潜力 | 现有育种计划受限于耐受机制的复杂性和农业环境的多变性 | 开发应对气候变化的热旱胁迫耐受型作物 | 小麦、水稻、大豆、玉米等主要粮食作物 | 农业生物技术 | NA | 合成生物学、先进育种技术、高通量表型分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 74 | 2025-10-11 |
Flippase-Mediated Hybrid Vesicle Division
2025-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202504519
PMID:40613217
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研究论文 | 本研究在聚合物-脂质杂化囊泡中重构活性脂质翻转酶,实现了蛋白质介导的囊泡分裂 | 首次在杂化囊泡中重构Drs2p-Cdc50p脂质翻转酶,通过诱导跨膜不对称性实现合成系统的分裂能力 | 仅验证了特定组成和浓度的杂化囊泡系统,尚未实现完全自复制的功能单元 | 在自下而上的合成生物学中构建具有蛋白质介导分裂能力的合成系统 | 聚合物-脂质杂化囊泡和Drs2p-Cdc50p脂质翻转酶复合物 | 合成生物学 | NA | 脂质翻转酶重构技术、杂化囊泡组装技术 | NA | 实验数据 | 使用不同摩尔百分比(1或2.5 mol%)的两亲性嵌段共聚物和多种疏水嵌段组合的杂化囊泡系统 | NA | NA | 基于脂质翻转酶的跨膜不对称性诱导系统,通过改变双层自发曲率实现囊泡收缩和分裂 | 合成生物学、基础研究 |
| 75 | 2025-10-10 |
Population-level bistability in Pseudomonas aeruginosa quorum sensing
2025-Oct-08, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01713-25
PMID:40928267
|
研究论文 | 本研究通过实验证明了铜绿假单胞菌群体感应系统在群体水平上具有双稳态特性 | 首次实验证实天然群体感应系统具有群体水平的双稳态和滞后特性 | 仅研究了铜绿假单胞菌的LasI/LasR系统及部分QS控制基因 | 验证群体感应系统是否作为基因表达开关在群体水平同步响应 | 铜绿假单胞菌的LasI/LasR群体感应系统 | 合成生物学 | 机会性感染 | 单细胞水平表达测量、数学建模 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 铜绿假单胞菌 | 正自调控信号合酶基因回路、双稳态开关 | 医学、合成生物学 |
| 76 | 2025-10-06 |
Design principles of gene circuits for longevity
2025-Oct, Trends in cell biology
IF:13.0Q1
DOI:10.1016/j.tcb.2025.02.006
PMID:40082090
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综述 | 探讨影响寿命的基因回路设计原则,重点关注反馈回路在维持细胞稳态中的作用 | 从基因回路层面系统分析衰老机制,提出通过工程化稳定固定点或振荡来延长寿命的合成生物学策略 | 主要基于酵母模型的研究,在高等生物中的适用性需要进一步验证 | 揭示基因回路在衰老过程中的调控机制并探索延长寿命的工程化方法 | 基因调控网络和反馈回路,特别是酵母中的SIR2-HAP回路 | 合成生物学 | 衰老相关疾病 | 系统生物学、合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 反馈回路、相互抑制通路、稳定固定点、振荡电路 | 医学 |
| 77 | 2025-10-05 |
The mechanism of thioamide formation by the YcfA-YcfC system in 6-thioguanine biosynthesis
2025-Oct-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63937-7
PMID:41044055
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研究论文 | 本研究揭示了YcfA-YcfC系统在6-硫代鸟嘌呤生物合成中形成硫酰胺键的分子机制 | 首次通过生化与结构生物学方法阐明了YcfA的七聚体组装机制及其与GTP和PLP的相互作用,并成功合成具有抗菌活性的硒代类似物 | 未在完整细胞环境中验证该系统的功能,且对YcfC的具体催化机制仍需进一步研究 | 阐明6-硫代鸟嘌呤生物合成中关键硫酰胺基团形成的分子机制 | YcfA-YcfC酶系统及其在6-硫代鸟嘌呤生物合成中的作用 | 结构生物学与生物化学 | 儿童急性淋巴细胞白血病 | 晶体结构解析、冷冻电镜(cryo-EM)、功能分析、多组学分析 | NA | 结构数据、生化数据、组学数据 | NA | NA | NA | NA | 药物开发、合成生物学 |
| 78 | 2025-10-05 |
Mutation-induced filaments of folded proteins are inert and non-toxic in a cellular system
2025-Oct, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00144-y
PMID:40954318
|
研究论文 | 本研究系统表征了由折叠蛋白质聚合形成的丝状组装体(聚集体),并揭示了其在细胞中的惰性和无毒性特征 | 首次明确定义并系统表征了区别于传统聚集体的蛋白质折叠态聚集体,开发了区分这两种组装体的细胞实验方法 | 研究仅基于特定细胞系统,尚未验证在其他生物体系中的普适性 | 探究突变诱导的折叠蛋白质丝状组装体的细胞生物学特性 | 蛋白质丝状组装体(聚集体) | 合成生物学 | NA | 定量蛋白质组学、细胞共定位分析 | NA | 蛋白质组数据、细胞成像数据 | NA | NA | 细胞系统 | NA | 合成生物学, 细胞内工程 |
| 79 | 2025-10-05 |
Advances in Metabolic Engineering for the Accumulation of Astaxanthin Biosynthesis
2025-Oct, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01289-1
PMID:39373956
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综述 | 本文全面综述了虾青素生物合成的研究进展,重点关注微生物发酵生产策略 | 系统比较了天然宿主Xanthophyllomyces dendrorhous与异源宿主Yarrowia lipolytica和Saccharomyces cerevisiae在虾青素生物合成中的应用 | NA | 探讨通过代谢工程和合成生物学方法实现虾青素的大规模微生物生产 | 虾青素生物合成途径及相关微生物宿主 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、合成生物学、微生物发酵 | NA | NA | NA | NA | Xanthophyllomyces dendrorhous, Yarrowia lipolytica, Saccharomyces cerevisiae | 虾青素生物合成途径 | 饲料,食品,化妆品,医药 |
| 80 | 2025-10-05 |
Rubisco-Centric Strategies for Carbon Conservation in Synthetic Biology
2025-Oct-01, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04813
PMID:41031513
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综述 | 本文系统总结了Rubisco酶的基础研究及其在合成生物学中提升碳固定效率的策略与应用 | 首次系统整合了从经典定向进化到人工智能理性设计的五种酶效率提升策略,并提出了跨尺度的设计框架 | NA | 开发碳效率更高的生物制造技术以应对全球气候危机 | Rubisco酶及其在自养和异养微生物中的应用 | 合成生物学 | NA | 定向进化、人工智能理性设计 | NA | NA | NA | NA | 自养微生物,异养微生物 | 卡尔文循环碳固定途径 | 工业生物技术,环境 |