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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-12-30 |
[Advances in metabolic engineering of common yeast species]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250522
PMID:41457589
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综述 | 本文综述了常见酵母物种的生理特性、作为生物合成底盘细胞的优缺点、当前应用,以及代谢工程策略的最新研究进展,并展望了未来研究方向 | 通过比较多种常见酵母物种,并总结最新的代谢工程策略,为下一代酵母底盘细胞的开发和工程应用提供指导 | NA | 探讨酵母代谢工程的最新进展和未来方向 | 常见酵母物种及其作为微生物底盘细胞的应用 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 酿酒酵母, 毕赤酵母, 裂殖酵母 | 复杂代谢途径设计、全面代谢重布线 | 能源, 材料, 化学品, 工业生物技术 |
| 22 | 2025-12-30 |
[Microfluidics-driven synthetic biology and biomanufacturing: research progress in methods and applications and future perspectives]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250444
PMID:41457587
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综述 | 本文综述了微流控技术在合成生物学和生物制造中的应用,包括其在设计-构建-测试-学习循环中的作用以及在上游菌株培养改进和下游处理集成优化中的角色 | 探讨微流控技术如何通过单细胞精度、高通量筛选和快速迭代解决合成生物学和生物制造中的挑战,并分析其作为赋能技术、跨学科整合和AI驱动智能系统的未来方向 | 微流控技术在合成生物学和生物制造中面临微尺度放大和芯片材料等瓶颈 | 综述微流控技术在合成生物学和生物制造中的研究进展、应用案例及未来展望 | 微流控技术、合成生物学和生物制造 | NA | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 能源, 农业, 环境保护, 化学品与材料, 农业食品 |
| 23 | 2025-12-30 |
[DNA modification by sulfur: mechanistic insights drives synthetic biotechnologies forward]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250474
PMID:41457586
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综述 | 本文综述了DNA硫修饰的发现、机制及其在合成生物技术中的应用 | 首次聚焦于DNA硫修饰(磷硫酰化)作为天然修饰的突破性发现,并探讨其在基因编辑和工业菌株开发中的新兴应用 | NA | 阐明DNA硫修饰的分子机制及其在合成生物学中的技术应用 | DNA硫修饰(磷硫酰化)及其相关细菌防御系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | NA | 工业生物技术, 医学 |
| 24 | 2025-12-30 |
[Application of synthetic biology in contamination remediation of the petrochemical industry]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250581
PMID:41457606
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综述 | 本文综述了合成生物学在石化工业污染修复中的应用,重点介绍了生物传感器、工程降解菌株和合成微生物群落的研究进展 | 系统总结了合成生物学在石化污染修复领域的最新进展,并针对工程微生物应用中的问题提出了可能的解决方案 | NA | 开发新的生物修复技术以提高石化污染物的降解效果 | 石化污染物 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物 | 生物传感器、降解途径、合成微生物群落 | 环境 |
| 25 | 2025-12-30 |
[Generation of antibody diversity in mammals: mechanisms and synthetic biology applications]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250475
PMID:41457603
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综述 | 本文综述了哺乳动物中抗体多样性的生成机制,包括V(D)J重组、体细胞超突变和类别转换重组,并探讨了相关酶在合成生物学中的应用进展 | 强调了TdT、胞苷脱氨酶和DNA糖基化酶等关键酶在合成生物学中的最新应用进展,为生物技术和医学研究提供了新方向 | NA | 总结哺乳动物抗原受体多样化的分子机制,并探讨抗体筛选、应用及相关酶在合成生物学中的进展 | 免疫球蛋白(抗体)及其多样性生成机制,包括V(D)J重组、体细胞超突变和类别转换重组 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 重组激活基因蛋白、末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)、激活诱导胞苷脱氨酶、DNA糖基化酶 | 哺乳动物 | NA | 医学, 生物技术 |
| 26 | 2025-12-30 |
[Applications of protein structure determination in synthetic biology]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250437
PMID:41457622
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综述 | 本文综述了蛋白质结构测定技术在合成生物学中的应用,包括蛋白质工程、代谢途径优化、生物传感器设计和人工生物系统构建 | 总结了冷冻电镜、X射线晶体学和基于人工智能的预测方法等最新技术突破在合成生物学中的应用进展 | NA | 为合成生物学相关研究领域提供理论参考和技术视角 | 蛋白质结构测定技术及其在合成生物学中的应用 | NA | NA | 冷冻电镜、X射线晶体学、人工智能预测方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 27 | 2025-12-28 |
Somatic Embryogenesis: A Biotechnological Route in the Production of Recombinant Proteins
2025-Nov-26, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech14040093
PMID:41440172
|
综述 | 本文综述了体细胞胚胎发生(SE)作为一种生物技术途径在生产重组蛋白中的应用,包括疫苗抗原和治疗性蛋白 | 将体细胞胚胎发生与植物组织培养和遗传转化策略结合,作为重组蛋白生产的通用平台,并探讨了合成生物学和糖工程等创新策略 | 优化转化效率、扩大基于生物反应器的悬浮培养规模以及确保在GMP标准下进行适当的翻译后修饰仍面临挑战 | 探讨体细胞胚胎发生作为重组蛋白生产的生物技术途径,并讨论当前挑战和创新策略 | 体细胞胚胎发生过程、重组蛋白生产系统、非模式植物和复杂蛋白表达 | 生物技术 | NA | 植物组织培养、遗传转化、合成生物学、糖工程 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 医药、工业生物技术 |
| 28 | 2025-12-25 |
Engineered bacteria for cancer therapy: Advancements, challenges, and future directions
2025-Nov-17, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003807
PMID:41243447
|
综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展、挑战与未来方向 | 系统总结了利用合成生物学和基因工程改造细菌,使其靶向肿瘤微环境并作为局部递送治疗药物的创新平台,以及与传统疗法结合的协同策略 | NA | 探讨工程化细菌在癌症治疗中的应用潜力与发展方向 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的设计与应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 细菌 | 生物传感器、逻辑门、代谢通路 | 医学 |
| 29 | 2025-12-25 |
PIONEER: A Periplasmic Display Platform for Synthetic Biology-Based Screening of Genetically Encoded Protein Regulators
2025-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.26.684622
PMID:41280029
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PIONEER的模块化平台,用于在酵母周质空间展示肽、蛋白质和纳米抗体,以直接研究膜蛋白功能 | 通过优化分泌信号和展示支架,实现了稳定的配体保留和强大的自分泌信号传导,能够通过信号传导而非单纯结合来评估配体活性,这是功能优先筛选的关键进展 | 尽管已在GPCRs上得到验证,但平台对其他膜蛋白和可溶性蛋白的适用性仍需进一步测试 | 开发一种用于合成生物学筛选的周质展示平台,以研究基因编码的蛋白质调节剂 | 肽、蛋白质、纳米抗体以及人类G蛋白偶联受体(GPCRs) | 合成生物学 | NA | 周质展示技术、自分泌信号传导 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 膜蛋白功能筛选平台 | 医学、工业生物技术 |
| 30 | 2025-12-24 |
Research progress on gut microbiota in colorectal cancer immunotherapy
2025-Nov, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189476
PMID:41130540
|
综述 | 本文系统综述了肠道菌群及其代谢微环境在调节结直肠癌免疫检查点抑制剂疗效中的关键研究进展 | 聚焦于肠道菌群及其代谢产物如何影响免疫检查点抑制剂疗效,并探讨了基于微生物组的靶向干预策略,如益生菌/益生元组合、优化的抗生素使用时机、改进的粪菌移植方案以及基于合成生物学的工程菌疗法 | NA | 为开发新型个性化结直肠癌免疫治疗策略提供理论基础,重点是通过调节微生物组来优化免疫检查点抑制剂的治疗效果 | 结直肠癌患者、肠道菌群及其代谢产物 | NA | 结直肠癌 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 31 | 2025-12-23 |
Chromoproteins: visible tools for advancing synthetic biology
2025-Nov-26, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.10.020
PMID:41309430
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综述 | 本文全面概述了基于色蛋白的研究进展,包括其理化特性、分类、工程策略和应用 | 强调色蛋白作为可见工具在合成生物学中的独特优势,如裸眼可见性、广泛表达和可调性 | NA | 推动合成生物学中可见色蛋白报告基因的发展,提供更易访问和模块化的平台 | 色蛋白及其变体 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | 原核和真核系统 | NA | 合成生物学研究与应用 |
| 32 | 2025-12-23 |
codonGPT: reinforcement learning on a generative language model enables scalable mRNA design
2025-Nov-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1345
PMID:41416521
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研究论文 | 本文开发了首个专门针对mRNA序列的生成式语言模型codonGPT,并结合强化学习实现了可扩展的mRNA设计优化 | 首次将强化学习与生物语言模型结合用于mRNA设计,提出了创新的推理时掩码方法以约束同义序列,并构建了首个基于模型生物mRNA序列的生成式语言模型 | 模型训练数据仅包含338,417条模型生物mRNA序列,可能未覆盖所有生物多样性;方法在HLA-A和ACTB等示例基因中验证,需进一步扩展应用范围 | 开发可扩展的mRNA设计方法,用于治疗、合成生物学和蛋白质工程 | mRNA序列设计优化 | 自然语言处理 | NA | 强化学习、生成式语言模型 | GPT类生成模型 | mRNA序列数据 | 338,417条模型生物mRNA序列 | NA | NA | NA | 医学、合成生物学、蛋白质工程 |
| 33 | 2025-12-22 |
CAR-T cells in solid tumors: Challenges and breakthroughs
2025-Nov-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102353
PMID:40945517
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综述 | 本文综述了CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中面临的挑战、近期临床试验的突破,以及整合合成生物学和基因工程的新策略 | 重点介绍了整合合成生物学和基因工程的突破性策略,以增强CAR-T细胞的适应性、效力、持久性,激活宿主免疫,重编程肿瘤微环境,并实现多抗原靶向 | 讨论了当前临床前模型(如免疫缺陷小鼠的人源异种移植、人源化或同基因模型)在评估CAR-T细胞疗法疗效和安全性方面的优缺点 | 探讨如何克服CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的局限性,并推动下一代CAR-T疗法的发展 | CAR-T细胞疗法及其在实体瘤中的应用 | NA | 实体瘤 | 合成生物学,基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 34 | 2025-12-22 |
Microwave-Activated Bacterial Biorobot for Multimodal Cancer Therapy
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504603
PMID:40789052
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研究论文 | 本文开发了一种微波激活的细菌生物机器人,用于实现多模态癌症治疗 | 利用微波对工程化大肠杆菌进行局部激活,结合葡萄糖氧化酶表达与表面CuO纳米颗粒的类芬顿反应,协同诱导多种肿瘤细胞死亡方式 | 未明确说明长期生物安全性、免疫原性及临床转化潜力 | 开发一种安全、可精确控制的多模态癌症治疗平台 | 工程化大肠杆菌(MG1655)及肿瘤细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工程、纳米材料修饰、转录组分析 | NA | 体外实验数据、体内实验数据、转录组数据 | NA | 合成生物学工程 | 大肠杆菌 | 微波激活的葡萄糖氧化酶表达系统 | 医学 |
| 35 | 2025-12-18 |
Synthetic biology approaches to generate temperature-sensitive alleles for the Sterile Insect Technique
2025-Nov-03, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.70186
PMID:41178318
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法开发温度敏感等位基因以改进昆虫不育技术中雄性品系培育的策略 | 提出结合CRISPR/Cas基因组编辑、理性蛋白质设计及合成生物学工具(如温度诱导型N端降解子、温度敏感内含肽)创建非转基因温度敏感品系的新范式 | 在雄性决定染色体或基因座上整合和表达外源基因的技术尚未完全成熟,需要开发更多将温度敏感表型与雌性发育关联的策略 | 开发适用于昆虫不育技术的温度敏感遗传性别品系,实现环境友好的害虫防控 | 昆虫不育技术目标物种的遗传性别品系 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、蛋白质理性设计、温度诱导型N端降解子、温度敏感内含肽 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 昆虫(SIT目标物种) | 温度敏感等位基因系统、性别特异性致死/转换通路 | 农业 |
| 36 | 2025-12-17 |
A membrane-driven biochemical oscillator tunable by the volume to surface area ratio
2025-Nov-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.14.688573
PMID:41292784
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研究论文 | 本文介绍并建模了一种基于膜磷脂浓度动态变化驱动的质量守恒生化振荡器,其振荡频率可通过系统的体积与表面积比(V/A)进行调节 | 提出了一种不依赖转录翻译机制、通过膜定位维度缩减放大反应的新型生化振荡器设计,首次实现通过几何参数(V/A比)直接调控振荡特性 | 模型验证主要依赖计算模拟,需要实验体系进一步验证实际生物系统的可行性 | 开发可编程的合成生物学定时模块,探索几何传感在工程化系统中的应用潜力 | 基于内存机制启发的膜驱动生化振荡系统 | 合成生物学 | NA | 质量作用反应动力学、反应-扩散模拟、随机模拟 | 确定性振荡器模型、随机整数拷贝数模型 | 计算模拟数据 | NA | NA | 无细胞系统 | 膜定位振荡器、自组装三聚体耦合系统 | 合成生物学、生物工程 |
| 37 | 2025-12-17 |
Harnessing the ocean's pharmacy: marine bioactive compounds as next-generation therapeutics
2025-Nov, Natural product research
IF:1.9Q3
DOI:10.1080/14786419.2024.2373965
PMID:38954510
|
综述 | 本文综述了海洋生物活性化合物作为下一代治疗药物的潜力、应用及挑战 | 强调海洋生物活性化合物在结构独特性和生物活性方面的突破性潜力,并指出合成生物学和代谢工程为可持续生产提供了解决方案 | 面临可持续采集和复杂提取工艺等挑战 | 探讨海洋生物活性化合物的临床潜力及其在现代医学中的应用 | 海洋生物活性化合物 | NA | 癌症、慢性疼痛、传染病 | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 38 | 2025-12-16 |
Degradation mechanisms and microbial remediation of micro- and nanoplastics: A comprehensive review
2025-Nov-18, Ying yong sheng tai xue bao = The journal of applied ecology
DOI:10.13287/j.1001-9332.202511.034
PMID:41392686
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综述 | 本文全面综述了微/纳塑料的生成途径、微生物降解机制,并评估了微生物修复技术的应用潜力 | 系统整合了微/纳塑料的非生物与生物降解过程,并重点探讨了基于合成生物学的降解酶系统改造与优化这一未来研究方向 | 现有微生物处理技术存在降解效率低、环境适应性差以及工程化放大困难等瓶颈 | 为微/纳塑料污染的有效控制提供技术支撑 | 微塑料和纳米塑料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 39 | 2025-12-15 |
Bacterial Cellulose for Sustainable Food Packaging: Production Pathways, Structural Design, and Functional Modification Strategies
2025-Nov-28, Polymers
IF:4.7Q1
DOI:10.3390/polym17233165
PMID:41374852
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综述 | 本文综述了细菌纤维素在可持续食品包装领域的生产途径、结构设计及功能改性策略 | 系统总结了通过合成生物学、绿色化学和材料工程等方法对细菌纤维素进行原位和异位功能化的最新进展,以增强其机械、阻隔、抗氧化和抗菌性能 | 面临生产成本高、发酵周期长以及监管不确定性等挑战 | 探讨细菌纤维素作为石油基塑料替代品,在可持续食品包装中的应用潜力 | 细菌纤维素及其复合材料 | 材料科学 | NA | 微生物发酵、合成生物学、绿色化学、材料工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | Komagataeibacter属及相关菌属 | NA | 食品包装 |
| 40 | 2025-12-12 |
Governing Synthetic Biology: A Co-Evolutionary Framework for Sustainable Innovation
2025-Nov-26, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2508.08001
PMID:41309363
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综述 | 本文回顾了合成生物学的发展历程,分析了其面临的监管与政策挑战,并基于经合组织的框架提出了一个促进技术与制度框架共同演化的“协同演化”治理模型 | 提出了一个基于经合组织“新兴技术预见性治理框架”的“协同演化”模型,强调研发、战略情报、社会信任构建、敏捷监管和国际合作五个关键要素的协同 | 本文是一篇综述性文章,主要进行理论分析和框架构建,未涉及具体的实验验证或案例数据 | 探讨如何通过协同治理框架,使合成生物学的技术发展与社会制度、监管及公众接受度同步,以实现可持续创新 | 合成生物学领域的整体发展、监管政策框架及社会接受度 | NA | NA | NA | 协同演化模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |