本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-12-02 |
A comprehensive review on marine algal polysaccharide-mediated siRNA delivery systems for biofuel production
2025-Nov-29, Carbohydrate research
IF:2.4Q2
DOI:10.1016/j.carres.2025.109779
PMID:41319500
|
综述 | 本文全面综述了利用海洋藻类多糖(如海藻酸盐、卡拉胶、岩藻聚糖和绿藻多糖)作为siRNA递送载体,用于调控微藻代谢途径以促进生物燃料生产的研究进展 | 系统评估了多种海洋多糖作为siRNA递送载体的结构特性与性能,并探讨了将CRISPR RNAi混合策略、AI辅助纳米载体优化和可编程藻类基因电路等新兴技术整合到该平台中的潜力 | 讨论了物种依赖性摄取差异、生态学考量以及与多糖提取和纳米颗粒配方相关的技术经济限制 | 开发基于海洋多糖的siRNA递送系统,以克服微藻生物燃料生产中的代谢瓶颈,实现可扩展和精准控制的代谢工程 | 海洋藻类(如微拟球藻和衣藻)及其代谢途径 | 合成生物学与代谢工程 | NA | siRNA介导的基因沉默、代谢通量建模、纳米颗粒递送系统 | NA | NA | NA | CRISPR RNAi混合策略、可编程藻类基因电路 | Nannochloropsis, Chlamydomonas | 动态基因电路设计 | 能源, 工业生物技术 |
| 22 | 2025-12-02 |
Nanobody CAR-T cells in cancer: From molecular design to clinical translation
2025-Nov-29, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118819
PMID:41319516
|
综述 | 本文综述了基于纳米抗体的嵌合抗原受体T细胞疗法,从分子设计到临床转化的全过程 | 利用单域抗体设计结构上的进步,增强了肿瘤靶向性、安全性和可制造性,为开发双特异性、三价和逻辑门控CAR形式提供了灵活平台 | 面临肿瘤异质性、免疫逃逸和T细胞耗竭等挑战 | 探讨纳米抗体CAR-T细胞疗法在癌症治疗中的应用潜力 | 纳米抗体CAR-T细胞 | NA | 血液系统恶性肿瘤、实体瘤 | 嵌合抗原受体T细胞疗法 | NA | NA | NA | 合成生物学回路 | T细胞 | 双特异性、三价、逻辑门控CAR形式 | 医学 |
| 23 | 2025-12-02 |
Genomic assembly, rescue, and characterization of a functional pseudorabies virus
2025-Nov-28, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.11.010
PMID:41319833
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于酵母转化相关重组(TAR)技术的伪狂犬病毒(PRV)基因组组装平台,成功从头合成并拯救了功能性病毒 | 利用TAR技术构建PRV基因组组装平台,结合体外CRISPR/Cas9编辑插入egfp基因,实现了对高GC含量、复杂重复序列病毒基因组的快速灵活修饰 | 拯救的病毒PRV-GX-Syn1在体外表现出病毒滴度降低和噬斑尺寸减小,且在BALB/c小鼠中仍能引起致死性感染,毒力未完全减弱 | 开发伪狂犬病毒(PRV)的基因组编辑平台,以促进病毒减毒和疫苗载体开发 | 伪狂犬病毒(PRV),特别是基因型II变异株PRV-GX-2011 | 合成生物学 | 伪狂犬病(由伪狂犬病毒引起) | 酵母转化相关重组(TAR),CRISPR/Cas9基因组编辑,噬斑纯化 | NA | 基因组序列数据 | 一个病毒株(PRV-GX-2011)及其衍生合成病毒(PRV-GX-Syn1),使用Vero细胞和BALB/c小鼠进行实验 | CRISPR-Cas9, TAR | 酿酒酵母(用于TAR组装),Vero细胞(哺乳动物细胞,用于病毒拯救) | NA | 医学(疫苗开发) |
| 24 | 2025-12-02 |
Optogenetic tools for optimizing key signalling nodes in synthetic biology
2025-Nov-27, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108770
PMID:41317977
|
综述 | 本文综述了光遗传学工具在合成生物学中调控关键信号节点的应用,包括其在微生物代谢、植物科学和疾病治疗中的最新进展 | 将光遗传学工具按不同应用分为五类,系统阐述了其在时空精确调控酶活性或基因表达方面的创新潜力,超越了传统的化学诱导或基因过表达/敲除策略 | NA | 为合成生物学领域的基础研究和生物产业提供全面的光遗传学策略概述 | 光遗传学工具及其在微生物、植物和动物系统中的调控应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 微生物, 植物, 动物 | 光诱导基因表达调控、光触发液-液相分离模块、光诱导亚细胞定位光感受器、光调控酶、光门控离子通道和泵 | 工业生物技术, 农业, 医学 |
| 25 | 2025-12-02 |
Artificial cells with liquid-liquid phase separation-regulated cell-free protein synthesis
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2511283122
PMID:41269793
|
研究论文 | 本文通过液-液相分离调控无细胞蛋白质合成,构建了具有可控蛋白质表达的人工细胞 | 利用含多价关联基团的工程聚合物,通过液-液相分离诱导蛋白质聚集,实现无细胞蛋白质合成活性的可逆调控和精确时间控制 | 未明确提及具体限制,但暗示在工程化人工细胞调控蛋白质表达方面仍存在显著局限 | 开发能够调控蛋白质表达的人工细胞,并探索其在生物医学应用中的潜力 | 人工细胞、无细胞蛋白质合成系统、工程聚合物、微流控平台制备的巨型单层囊泡 | 合成生物学 | 肝损伤 | 液-液相分离、微流控技术、无细胞蛋白质合成 | NA | 实验数据 | 使用胆管结扎小鼠模型进行体内研究 | NA | NA | 基于液-液相分离的蛋白质聚集调控机制,用于可控反应过程 | 医学 |
| 26 | 2025-12-02 |
PIONEER: A Periplasmic Display Platform for Synthetic Biology-Based Screening of Genetically Encoded Protein Regulators
2025-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.26.684622
PMID:41280029
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为PIONEER的模块化平台,用于在酵母的周质空间中展示肽、蛋白质和纳米抗体,以直接研究膜蛋白功能 | PIONEER平台通过优化分泌信号和展示支架,实现了稳定的配体保留和强大的自分泌信号传导,标志着从单纯结合筛选向功能优先筛选的关键进步 | 尽管已应用于GPCRs,但平台对其他膜蛋白和可溶性蛋白目标的适应性仍需进一步验证 | 开发一种用于合成生物学筛选的周质展示平台,以研究遗传编码的蛋白质调节剂 | 肽、蛋白质、纳米抗体以及人类G蛋白偶联受体(GPCRs) | 合成生物学 | NA | 周质展示技术 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 自分泌信号传导系统 | 医学 |
| 27 | 2025-12-02 |
The International Risk Governance Council: Reflections on a 20-Year Experiment in Support of Improved Risk Governance
2025-Nov, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis
IF:3.0Q1
DOI:10.1111/risa.70117
PMID:41047369
|
评论 | 本文回顾了国际风险治理理事会(IRGC)20年的历史、活动及其在多个新兴风险领域的工作成果 | 通过六个案例研究(如太阳辐射管理、合成生物学等)系统总结了IRGC在风险治理方面的贡献,并强调了中立召集机构的重要性 | NA | 评估IRGC作为风险治理支持机构的历史作用与影响 | 国际风险治理理事会(IRGC)及其在多个风险领域的治理活动 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 28 | 2025-12-01 |
Synthetic bacterium-facilitated colonization of nitrogen-fixing bacteria for remodeling the rhizosphere microbiome and improving plant yield
2025-Nov-29, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-025-02189-5
PMID:41318663
|
研究论文 | 本研究开发了一种合成细菌EcCMC,通过表达多糖识别蛋白增强固氮菌在豆科植物根际的定殖能力,从而提高土壤肥力和植物产量 | 首次利用合成生物学方法设计表达多糖结合蛋白的工程菌,显著增强固氮菌在植物根系的定殖效率 | 研究仅针对两种豆科植物进行测试,样本量较小(n=3),且未评估长期生态影响 | 通过合成生物学方法改善根际微生物组,增强生物固氮作用和提高作物产量 | 紫云英(Astragalus sinicus)和紫花苜蓿(Medicago sativa)及其根际微生物组 | 合成生物学 | NA | 16S rRNA基因扩增子测序,代谢组学分析,固氮酶活性测定 | NA | 微生物组测序数据,代谢组数据,生化指标数据 | 每组3个重复,共9个样本 | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌(E. coli) | 表达表面展示多糖识别蛋白Cmc的合成细菌系统 | 农业 |
| 29 | 2025-12-01 |
Microbial computing: Review and perspectives
2025-Nov-27, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108766
PMID:41317976
|
综述 | 回顾微生物计算的发展历程,分析当前面临的挑战,并提出基于储层计算的新研究视角 | 提出采用自上而下的储层计算框架,利用生物系统固有的动态计算能力解决复杂任务 | 当前自下而上策略仍不足以模拟细胞信号处理系统的计算复杂性 | 探索微生物计算在生物生产、生物修复和生物医学等领域的应用潜力 | 微生物计算机和生物计算系统 | 合成生物学 | NA | NA | 数字逻辑、模拟架构、神经形态架构、储层计算 | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 微生物 | 逻辑门、切换开关、振荡器、生物传感器 | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 30 | 2025-12-01 |
Construction of an mKate-based fluorescent protein reporting system in Limosilactobacillus reuteri
2025-Nov-26, Journal of microbiological methods
IF:1.7Q4
DOI:10.1016/j.mimet.2025.107347
PMID:41314353
|
研究论文 | 本研究在罗伊氏乳杆菌中建立了mKate红色荧光蛋白报告系统 | 首次在罗伊氏乳杆菌中构建基于mKate的荧光报告系统,实现了细菌定位和基因表达的实时监测 | NA | 开发适用于罗伊氏乳杆菌的合成生物学工具平台 | 罗伊氏乳杆菌 | 合成生物学 | NA | 遗传转化系统、荧光蛋白报告系统 | NA | 荧光成像数据 | NA | 遗传转化 | 罗伊氏乳杆菌 | mKate红色荧光蛋白报告系统 | 工业生物技术 |
| 31 | 2025-12-01 |
Autonomous Bioluminescence Systems: From Molecular Mechanisms to Emerging Applications
2025-Nov-24, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c01072
PMID:41311942
|
综述 | 本文综述了自主生物发光系统的分子机制、蛋白质工程策略及其在实时无创成像中的新兴应用 | 系统比较了细菌和真菌自主生物发光系统的优劣,并提出通过AI引导诱变和代谢途径优化等策略解决现有挑战 | 细菌生物发光系统存在量子产率低的问题,真菌生物发光系统受底物可用性限制 | 评估自主生物发光系统的发展现状并展望下一代系统的设计目标 | 细菌和真菌自主生物发光系统 | 合成生物学 | NA | AI引导诱变, 蛋白质设计, 代谢途径优化 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 真菌 | 自主生物发光系统(整合荧光素酶与完整底物生物合成途径) | 生物医学研究, 环境监测, 合成生物学 |
| 32 | 2025-12-01 |
MeJA Elicitation on Flavonoid Biosynthesis and Gene Expression in the Hairy Roots of Glycyrrhiza glabra L
2025-Nov-18, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16111387
PMID:41300839
|
研究论文 | 本研究通过建立甘草毛状根培养系统,探究茉莉酸甲酯对黄酮类化合物生物合成及基因表达的影响 | 首次在甘草毛状根系统中结合代谢工程与基因工程技术,通过MeJA诱导和UGT基因过表达显著提高黄酮类化合物含量 | 研究仅针对特定黄酮类化合物,其他活性成分的变化未全面评估;功能基因研究仍需进一步验证 | 提高甘草中黄酮类活性成分的生物合成效率 | 甘草毛状根及其黄酮类化合物 | 合成生物学 | NA | 转录组分析、qRT-PCR、悬浮培养 | NA | 基因表达数据、代谢物含量数据 | 28天悬浮培养的毛状根样本 | 代谢工程、基因工程 | 甘草毛状根 | 黄酮类生物合成途径 | 医药 |
| 33 | 2025-11-30 |
From Biocontrol to Synthesis: Innovative Progress of Paenibacillus in Mechanism Analysis, Gene Editing and Platform Construction
2025-Nov-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262210886
PMID:41303372
|
综述 | 本文综述了类芽孢杆菌从生物防治到合成生物学的创新进展,包括机制解析、基因编辑和平台构建 | 系统总结了类芽孢杆菌多种生物防治机制的协同作用及其对环境因素的响应,并探讨了其在合成生物学平台构建中的创新应用 | NA | 探讨类芽孢杆菌在生物防治和合成生物学领域的应用潜力与发展前景 | 类芽孢杆菌及其生物合成机制 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、合成生物学策略 | NA | NA | NA | NA | 类芽孢杆菌 | NA | 农业,工业生物技术 |
| 34 | 2025-12-01 |
Phage Therapy for Acinetobacter baumannii Infections: A Review on Advances in Classification, Applications, and Translational Roadblocks
2025-Nov-08, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14111134
PMID:41301629
|
综述 | 本文系统综述了噬菌体疗法在治疗鲍曼不动杆菌感染领域的最新进展,包括分类学更新、治疗策略优化和临床转化挑战 | 基于全基因组系统发育的现代分类学将大多数噬菌体重新分类为Caudoviricetes纲,揭示了与宿主趋向性和生物学特性相关的独特进化支;通过尾丝重组和CRISPR/Cas介导的溶原性消除等基因工程方法扩展宿主范围 | 工程噬菌体的遗传稳定性需要进一步验证;宿主谱有限、缺乏临床转化标准和滞后的监管框架仍是当前挑战 | 总结噬菌体疗法在治疗碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌感染领域的研究进展和转化障碍 | 鲍曼不动杆菌噬菌体及其治疗应用 | NA | 细菌感染 | 全基因组系统发育分析、基因工程、CRISPR/Cas、宏基因组挖掘 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 鲍曼不动杆菌 | NA | 医学 |
| 35 | 2025-12-01 |
Key Challenges in Plant Microbiome Research in the Next Decade
2025-Nov-07, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13112546
PMID:41304231
|
综述 | 本文系统分析植物微生物组研究面临的关键挑战并提出未来十年的发展路线图 | 提出整合实验与计算策略的路线图,强调合成生物学、多组学工具和人工智能在工程化植物-微生物互作中的应用前景 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于现有研究现状的分析与展望 | 推动植物微生物组研究向田间规模应用转化,建立具有气候适应性和资源高效性的农业系统 | 植物微生物组 | NA | NA | 多组学数据整合、测序技术、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 植物-微生物互作工程化 | 农业 |
| 36 | 2025-12-01 |
Probiotic Potential of Traditional and Emerging Microbial Strains in Functional Foods: From Characterization to Applications and Health Benefits
2025-Nov-02, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13112521
PMID:41304207
|
综述 | 本文综述了传统和新兴益生菌菌株在功能性食品中的潜力,涵盖表征方法、作用机制、技术限制和健康益处 | 重点关注具有新功能特性的新兴微生物候选菌株,并强调通过组学技术和合成生物学解决现有挑战 | 缺乏长期临床验证、菌株特异性研究不足、个性化应用存在空白以及消费者沟通不充分 | 评估传统和新兴益生菌菌株在功能性食品中的应用潜力和健康效益 | 传统和新兴益生菌微生物菌株 | NA | NA | 组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 医药 |
| 37 | 2025-11-30 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2025-Nov-28, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
|
研究论文 | 本研究报道了一种受脂质结构启发的DNA折纸单层膜自组装方法,可形成细胞尺度的囊泡和空心管状结构 | 首次实现了径向对称DNA折纸亚基的自组装,突破了传统DNA纳米技术局限于刚性笼状结构的限制 | 未提供具体应用验证数据,结构稳定性与功能整合仍需进一步研究 | 开发新型生物相容性隔室化结构,拓展自下而上合成生物学和细胞尺度软机器人技术 | DNA折纸单层膜自组装结构 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术,自组装技术 | NA | 结构表征数据 | NA | DNA折纸 | NA | 径向对称DNA折纸亚基自组装形成膜结构 | 生物技术,软机器人 |
| 38 | 2025-11-30 |
Efficient site-specific integration of kilobase-length DNA fragments in plant cells via Kp03 recombinase
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116508
PMID:41187057
|
研究论文 | 本研究评估了Kp03重组酶在植物细胞中实现大片段DNA定点整合的效率 | 首次证明Kp03重组酶能在植物细胞中高效整合长达27.3 kb的DNA片段,并确定仅需15-bp attB序列即可实现整合 | 研究主要基于瞬时原生质体实验和愈伤组织,尚未在完整植株中验证整合效率 | 开发植物基因组工程中大片段DNA定点整合的新方法 | 水稻和拟南芥的细胞及愈伤组织 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的整合、基因组编辑 | NA | 分子生物学实验数据 | 水稻和拟南芥原生质体及愈伤组织(具体数量未明确说明) | Kp03重组酶, NM-PE基因组编辑系统 | 水稻, 拟南芥 | 基于attB-attP重组系统的DNA整合平台 | 农业, 工业生物技术 |
| 39 | 2025-11-30 |
Peptide-based approaches to quorum-sensing disruption: emerging trends and applications in antimicrobial therapy
2025-Nov-23, Bioorganic & medicinal chemistry
IF:3.3Q1
DOI:10.1016/j.bmc.2025.118496
PMID:41313971
|
综述 | 本文总结了基于肽的群体感应干扰方法在抗菌治疗中的新兴趋势和应用 | 聚焦于肽类群体感应抑制剂作为非致死性抗菌策略,涵盖工程化肽和肽-纳米复合系统的设计进展 | 存在肽不稳定性、低生物利用度、脱靶效应和潜在耐药性发展等挑战 | 开发不依赖传统杀菌方法的替代性抗菌治疗策略 | 细菌群体感应系统和病原体致病性 | NA | 感染性疾病 | 肽工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 40 | 2025-11-30 |
Analog epigenetic memory revealed by targeted chromatin editing
2025-Nov-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100985
PMID:40930103
|
研究论文 | 本研究通过靶向染色质编辑揭示了表观遗传记忆的模拟特性,证明染色质修饰可维持不同水平的基因表达 | 首次发现DNA甲基化梯度可对应维持不同水平的基因表达,揭示了模拟表观遗传记忆的存在机制 | 未明确说明实验使用的具体细胞类型和样本规模 | 探索染色质修饰如何维持不同基因表达状态及其记忆机制 | 染色质修饰状态与基因表达动态关系 | 合成生物学 | NA | 靶向染色质编辑、DNA甲基化分析 | 染色质修饰模型 | 基因表达动态数据 | NA | 基因组报告系统、表观遗传效应器 | NA | 表观遗传记忆系统 | 合成生物学 |