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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-01-09 |
Recent advances in nucleic acid nanotechnology-driven artificial transcriptional components
2025-Nov-27, Nanoscale
IF:5.8Q1
DOI:10.1039/d5nr03210e
PMID:41221719
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综述 | 本文综述了核酸纳米技术在转录调控中的应用,重点介绍了其在模块化设计、动态响应和逻辑信息处理方面的优势 | 利用核酸纳米技术的可编程性、时空精确性和分子级可控性,构建人工转录组件以实现精确的转录调控 | NA | 探讨核酸纳米技术在转录调控领域的应用潜力 | 人工转录组件及其在转录过程中的调控机制 | 合成生物学 | NA | 核酸纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 人工转录组件,包括模块化设计、动态响应和逻辑信息处理 | 生物计算、智能生物制造、生物传感 |
| 22 | 2026-01-07 |
Exploiting Salmonella typhimurium as a novel cancer therapeutic agent: from tumor colonization to metabolic engineering
2025-Nov-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04716-w
PMID:41307628
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综述 | 本文综述了利用鼠伤寒沙门氏菌作为新型癌症治疗剂的机制、代谢工程进展及临床转化挑战 | 首次系统整合鼠伤寒沙门氏菌的多重抗癌机制(凋亡诱导、自噬诱导、免疫调节等),并从代谢工程与合成生物学角度提出增强治疗特异性的统一视角 | 细菌介导的癌症疗法仅能作为现有癌症治疗的补充手段,无法完全替代传统疗法,且存在生物安全性与临床转化挑战 | 探讨利用细菌天然靶向肿瘤特性开发新型癌症治疗策略 | 鼠伤寒沙门氏菌及其代谢工程改造菌株 | NA | 癌症 | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 鼠伤寒沙门氏菌 | NA | 医学 |
| 23 | 2026-01-03 |
Microbial Valorization of Agricultural and Agro-Industrial Waste into Bacterial Cellulose: Innovations for Circular Bioeconomy Integration
2025-Nov-25, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13122686
PMID:41471891
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综述 | 本文综述了利用农业及农工业废弃物通过微生物发酵生产细菌纤维素(BC)的最新进展,并探讨其在循环生物经济中的整合潜力 | 系统总结了利用多样化农业废弃物作为低成本碳源生产细菌纤维素的技术路径,并整合了合成生物学、组学优化和过程创新等前沿方法以提高产量与功能化 | NA | 探讨农业废弃物微生物增值转化为细菌纤维素的技术创新及其在循环生物经济中的应用 | 农业及农工业废弃物(如果皮、甘蔗渣、谷物秸秆等)及其微生物转化过程 | NA | NA | 静态与动态发酵、共培养、分步营养供给、基因工程、组学指导优化 | NA | NA | NA | 基因工程, 合成生物学 | 细菌(具体菌种未明确列出) | NA | 食品包装, 生物医学, 化妆品, 先进生物复合材料 |
| 24 | 2026-01-03 |
Magneto-Photonic Gene Circuit for Minimally Invasive Control of Gene Expression in Mammalian Cells
2025-Nov-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.21.688514
PMID:41332601
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研究论文 | 开发了一种结合磁刺激和生物发光的基因回路,用于在哺乳动物细胞中无创控制基因表达 | 首次报道了由光和磁刺激共同激活的基因回路,利用磁敏感蛋白工程化改造了分裂型发光酶,实现了无需外部光源的光控系统 | 未在深层组织或活体动物中进行验证,磁刺激强度(50mT)的具体生物相容性和穿透性未详细讨论 | 开发无需外部光源、能精确控制基因表达的新型合成生物学工具 | 哺乳动物细胞 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、分子生物学、光遗传学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 光敏转录因子结合生物发光酶(分裂型,磁控重组)的基因回路,实现光与磁双刺激激活的逻辑门 | 医学(基因治疗、诊断) |
| 25 | 2026-01-03 |
Light-controlled synthetic communication networks via paired connexon nanopores
2025-Nov-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66621-y
PMID:41274894
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研究论文 | 本文通过工程化连接蛋白通道,在脂质体合成细胞中构建了光控合成通信网络 | 利用正交连接蛋白(连接蛋白43和连接蛋白32)设计UV和近红外响应通道,实现合成细胞间正交信号分子传输 | NA | 模拟生物细胞间通信网络,构建合成细胞通信系统 | 脂质体合成细胞和工程化连接蛋白通道 | 合成生物学 | NA | 连接蛋白工程、脂质体组装 | NA | NA | NA | 连接蛋白工程 | 脂质体合成细胞 | 光控合成通信网络,基于连接蛋白通道的正交信号传输 | 合成生物学、生物工程 |
| 26 | 2026-01-03 |
Extremophile-Derived Bioactives in Cosmeceuticals: Bridging Nutraceuticals and Skincare for Holistic Wellness
2025-Nov-21, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life15121787
PMID:41465727
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综述 | 本文综述了极端微生物来源的生物活性物质在药妆品和营养化妆品中的应用,探讨了其通过局部和系统途径改善皮肤健康的潜力 | 将极端微生物来源的独特化合物(如极端酶、类胡萝卜素、胞外多糖、类菌孢素氨基酸)整合到药妆品中,并系统阐述了其局部外用与口服营养补充相结合的全方位护肤策略 | NA | 分析极端微生物来源的生物活性物质在护肤领域的应用潜力及其生产策略 | 极端微生物及其产生的生物活性化合物(极端酶、类胡萝卜素、胞外多糖、类菌孢素氨基酸等) | NA | NA | 微生物发酵、合成生物学、绿色提取 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 极端微生物 | NA | 医药, 工业生物技术 |
| 27 | 2026-01-02 |
Advances in microbial biofuel production by metabolic and enzyme engineering, synthetic biology, metagenomics, and genome editing applications
2025-Nov-17, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20240002
PMID:41217051
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综述 | 本文综述了利用微生物通过代谢与酶工程、合成生物学、宏基因组学和基因组编辑技术生产生物燃料的不同方法 | 整合了多种先进分子技术(如宏基因组学、合成生物学和CRISPR-Cas基因组编辑)在生物燃料生产中的应用,强调了从未发现的微生物群落中获取新型酶和构建高效工程微生物系统的创新策略 | NA | 探讨微生物在生物燃料生产中的潜力,并概述相关技术进展 | 微生物及其酶系统,以及植物生物质作为原料 | NA | NA | 代谢工程、酶工程、合成生物学、宏基因组学、CRISPR-Cas基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 微生物细胞 | NA | 能源, 工业生物技术 |
| 28 | 2025-12-30 |
[Engineering Rhodotorula toruloides based on exogenous targeting signal peptides]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250498
PMID:41457588
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研究论文 | 本研究通过外源靶向信号肽工程化改造红酵母Rhodotorula toruloides,验证了其细胞器靶向性能并应用于烷烃合成 | 首次在R. toruloides中系统验证了三种细胞器靶向信号肽的功能,并成功应用于脂肪酸光脱羧酶的区室化表达 | 仅测试了三种外源信号肽,对R. toruloides内源信号肽的研究仍有限 | 开发R. toruloides的合成生物学工具并拓展其细胞区室化工程应用 | 红酵母Rhodotorula toruloides及其细胞器靶向系统 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、荧光蛋白标记、发酵工程 | NA | 荧光成像数据、代谢产物检测数据 | NA | 信号肽融合技术 | Rhodotorula toruloides | 细胞器靶向表达系统(内质网、线粒体、过氧化物酶体) | 工业生物技术、能源 |
| 29 | 2025-12-30 |
[Plant synthetic biology technologies and natural product biosynthesis]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250445
PMID:41457591
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综述 | 本文综述了植物合成生物学的基础研究现状、主要应用方向,特别是在合成启动子、精准基因组编辑和可编程基因回路方面的进展,并探讨了其在天然产物生物合成中的潜力 | 重点介绍了植物合成生物学在合成启动子、精准基因组编辑技术和可编程基因回路设计方面的最新进展,以及其在天然产物生物合成中的变革潜力 | 文章批判性地审视了该领域当前面临的挑战,但未具体说明这些挑战的细节或解决方案 | 旨在概述植物合成生物学的基础研究现状、应用方向,并探讨其在天然产物生物合成中的潜力 | 植物合成生物学技术,包括遗传元件、调控组件和代谢途径的模块化组装 | 合成生物学 | NA | 精准基因组编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 高等植物 | 可编程基因回路,如逻辑门、生物传感器或代谢途径 | 农业, 工业生物技术 |
| 30 | 2025-12-30 |
[Advances in metabolic engineering of common yeast species]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250522
PMID:41457589
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综述 | 本文综述了常见酵母物种的生理特性、作为生物合成底盘细胞的优缺点、当前应用,以及代谢工程策略的最新研究进展,并展望了未来研究方向 | 通过比较多种常见酵母物种,并总结最新的代谢工程策略,为下一代酵母底盘细胞的开发和工程应用提供指导 | NA | 探讨酵母代谢工程的最新进展和未来方向 | 常见酵母物种及其作为微生物底盘细胞的应用 | 合成生物学 | NA | 基因编辑技术、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 酿酒酵母, 毕赤酵母, 裂殖酵母 | 复杂代谢途径设计、全面代谢重布线 | 能源, 材料, 化学品, 工业生物技术 |
| 31 | 2025-12-30 |
[Microfluidics-driven synthetic biology and biomanufacturing: research progress in methods and applications and future perspectives]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250444
PMID:41457587
|
综述 | 本文综述了微流控技术在合成生物学和生物制造中的应用,包括其在设计-构建-测试-学习循环中的作用以及在上游菌株培养改进和下游处理集成优化中的角色 | 探讨微流控技术如何通过单细胞精度、高通量筛选和快速迭代解决合成生物学和生物制造中的挑战,并分析其作为赋能技术、跨学科整合和AI驱动智能系统的未来方向 | 微流控技术在合成生物学和生物制造中面临微尺度放大和芯片材料等瓶颈 | 综述微流控技术在合成生物学和生物制造中的研究进展、应用案例及未来展望 | 微流控技术、合成生物学和生物制造 | NA | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 能源, 农业, 环境保护, 化学品与材料, 农业食品 |
| 32 | 2025-12-30 |
[DNA modification by sulfur: mechanistic insights drives synthetic biotechnologies forward]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250474
PMID:41457586
|
综述 | 本文综述了DNA硫修饰的发现、机制及其在合成生物技术中的应用 | 首次聚焦于DNA硫修饰(磷硫酰化)作为天然修饰的突破性发现,并探讨其在基因编辑和工业菌株开发中的新兴应用 | NA | 阐明DNA硫修饰的分子机制及其在合成生物学中的技术应用 | DNA硫修饰(磷硫酰化)及其相关细菌防御系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | NA | 工业生物技术, 医学 |
| 33 | 2025-12-30 |
[Application of synthetic biology in contamination remediation of the petrochemical industry]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250581
PMID:41457606
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综述 | 本文综述了合成生物学在石化工业污染修复中的应用,重点介绍了生物传感器、工程降解菌株和合成微生物群落的研究进展 | 系统总结了合成生物学在石化污染修复领域的最新进展,并针对工程微生物应用中的问题提出了可能的解决方案 | NA | 开发新的生物修复技术以提高石化污染物的降解效果 | 石化污染物 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物 | 生物传感器、降解途径、合成微生物群落 | 环境 |
| 34 | 2025-12-30 |
[Generation of antibody diversity in mammals: mechanisms and synthetic biology applications]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250475
PMID:41457603
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综述 | 本文综述了哺乳动物中抗体多样性的生成机制,包括V(D)J重组、体细胞超突变和类别转换重组,并探讨了相关酶在合成生物学中的应用进展 | 强调了TdT、胞苷脱氨酶和DNA糖基化酶等关键酶在合成生物学中的最新应用进展,为生物技术和医学研究提供了新方向 | NA | 总结哺乳动物抗原受体多样化的分子机制,并探讨抗体筛选、应用及相关酶在合成生物学中的进展 | 免疫球蛋白(抗体)及其多样性生成机制,包括V(D)J重组、体细胞超突变和类别转换重组 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 重组激活基因蛋白、末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)、激活诱导胞苷脱氨酶、DNA糖基化酶 | 哺乳动物 | NA | 医学, 生物技术 |
| 35 | 2025-12-30 |
[Applications of protein structure determination in synthetic biology]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250437
PMID:41457622
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综述 | 本文综述了蛋白质结构测定技术在合成生物学中的应用,包括蛋白质工程、代谢途径优化、生物传感器设计和人工生物系统构建 | 总结了冷冻电镜、X射线晶体学和基于人工智能的预测方法等最新技术突破在合成生物学中的应用进展 | NA | 为合成生物学相关研究领域提供理论参考和技术视角 | 蛋白质结构测定技术及其在合成生物学中的应用 | NA | NA | 冷冻电镜、X射线晶体学、人工智能预测方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 36 | 2025-12-28 |
Somatic Embryogenesis: A Biotechnological Route in the Production of Recombinant Proteins
2025-Nov-26, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech14040093
PMID:41440172
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综述 | 本文综述了体细胞胚胎发生(SE)作为一种生物技术途径在生产重组蛋白中的应用,包括疫苗抗原和治疗性蛋白 | 将体细胞胚胎发生与植物组织培养和遗传转化策略结合,作为重组蛋白生产的通用平台,并探讨了合成生物学和糖工程等创新策略 | 优化转化效率、扩大基于生物反应器的悬浮培养规模以及确保在GMP标准下进行适当的翻译后修饰仍面临挑战 | 探讨体细胞胚胎发生作为重组蛋白生产的生物技术途径,并讨论当前挑战和创新策略 | 体细胞胚胎发生过程、重组蛋白生产系统、非模式植物和复杂蛋白表达 | 生物技术 | NA | 植物组织培养、遗传转化、合成生物学、糖工程 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 医药、工业生物技术 |
| 37 | 2025-12-25 |
PIONEER: A Periplasmic Display Platform for Synthetic Biology-Based Screening of Genetically Encoded Protein Regulators
2025-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.26.684622
PMID:41280029
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PIONEER的模块化平台,用于在酵母周质空间展示肽、蛋白质和纳米抗体,以直接研究膜蛋白功能 | 通过优化分泌信号和展示支架,实现了稳定的配体保留和强大的自分泌信号传导,能够通过信号传导而非单纯结合来评估配体活性,这是功能优先筛选的关键进展 | 尽管已在GPCRs上得到验证,但平台对其他膜蛋白和可溶性蛋白的适用性仍需进一步测试 | 开发一种用于合成生物学筛选的周质展示平台,以研究基因编码的蛋白质调节剂 | 肽、蛋白质、纳米抗体以及人类G蛋白偶联受体(GPCRs) | 合成生物学 | NA | 周质展示技术、自分泌信号传导 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 膜蛋白功能筛选平台 | 医学、工业生物技术 |
| 38 | 2025-12-24 |
Research progress on gut microbiota in colorectal cancer immunotherapy
2025-Nov, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189476
PMID:41130540
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综述 | 本文系统综述了肠道菌群及其代谢微环境在调节结直肠癌免疫检查点抑制剂疗效中的关键研究进展 | 聚焦于肠道菌群及其代谢产物如何影响免疫检查点抑制剂疗效,并探讨了基于微生物组的靶向干预策略,如益生菌/益生元组合、优化的抗生素使用时机、改进的粪菌移植方案以及基于合成生物学的工程菌疗法 | NA | 为开发新型个性化结直肠癌免疫治疗策略提供理论基础,重点是通过调节微生物组来优化免疫检查点抑制剂的治疗效果 | 结直肠癌患者、肠道菌群及其代谢产物 | NA | 结直肠癌 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 39 | 2025-12-23 |
Chromoproteins: visible tools for advancing synthetic biology
2025-Nov-26, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.10.020
PMID:41309430
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综述 | 本文全面概述了基于色蛋白的研究进展,包括其理化特性、分类、工程策略和应用 | 强调色蛋白作为可见工具在合成生物学中的独特优势,如裸眼可见性、广泛表达和可调性 | NA | 推动合成生物学中可见色蛋白报告基因的发展,提供更易访问和模块化的平台 | 色蛋白及其变体 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | 原核和真核系统 | NA | 合成生物学研究与应用 |
| 40 | 2025-12-23 |
codonGPT: reinforcement learning on a generative language model enables scalable mRNA design
2025-Nov-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1345
PMID:41416521
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研究论文 | 本文开发了首个专门针对mRNA序列的生成式语言模型codonGPT,并结合强化学习实现了可扩展的mRNA设计优化 | 首次将强化学习与生物语言模型结合用于mRNA设计,提出了创新的推理时掩码方法以约束同义序列,并构建了首个基于模型生物mRNA序列的生成式语言模型 | 模型训练数据仅包含338,417条模型生物mRNA序列,可能未覆盖所有生物多样性;方法在HLA-A和ACTB等示例基因中验证,需进一步扩展应用范围 | 开发可扩展的mRNA设计方法,用于治疗、合成生物学和蛋白质工程 | mRNA序列设计优化 | 自然语言处理 | NA | 强化学习、生成式语言模型 | GPT类生成模型 | mRNA序列数据 | 338,417条模型生物mRNA序列 | NA | NA | NA | 医学、合成生物学、蛋白质工程 |