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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2025-12-28 |
Somatic Embryogenesis: A Biotechnological Route in the Production of Recombinant Proteins
2025-Nov-26, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech14040093
PMID:41440172
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综述 | 本文综述了体细胞胚胎发生(SE)作为一种生物技术途径在生产重组蛋白中的应用,包括疫苗抗原和治疗性蛋白 | 将体细胞胚胎发生与植物组织培养和遗传转化策略结合,作为重组蛋白生产的通用平台,并探讨了合成生物学和糖工程等创新策略 | 优化转化效率、扩大基于生物反应器的悬浮培养规模以及确保在GMP标准下进行适当的翻译后修饰仍面临挑战 | 探讨体细胞胚胎发生作为重组蛋白生产的生物技术途径,并讨论当前挑战和创新策略 | 体细胞胚胎发生过程、重组蛋白生产系统、非模式植物和复杂蛋白表达 | 生物技术 | NA | 植物组织培养、遗传转化、合成生物学、糖工程 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 医药、工业生物技术 |
| 22 | 2025-12-25 |
Engineered bacteria for cancer therapy: Advancements, challenges, and future directions
2025-Nov-17, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003807
PMID:41243447
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综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展、挑战与未来方向 | 系统总结了利用合成生物学和基因工程改造细菌,使其靶向肿瘤微环境并作为局部递送治疗药物的创新平台,以及与传统疗法结合的协同策略 | NA | 探讨工程化细菌在癌症治疗中的应用潜力与发展方向 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的设计与应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 细菌 | 生物传感器、逻辑门、代谢通路 | 医学 |
| 23 | 2025-12-25 |
PIONEER: A Periplasmic Display Platform for Synthetic Biology-Based Screening of Genetically Encoded Protein Regulators
2025-Nov-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.26.684622
PMID:41280029
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研究论文 | 本文介绍了一种名为PIONEER的模块化平台,用于在酵母周质空间展示肽、蛋白质和纳米抗体,以直接研究膜蛋白功能 | 通过优化分泌信号和展示支架,实现了稳定的配体保留和强大的自分泌信号传导,能够通过信号传导而非单纯结合来评估配体活性,这是功能优先筛选的关键进展 | 尽管已在GPCRs上得到验证,但平台对其他膜蛋白和可溶性蛋白的适用性仍需进一步测试 | 开发一种用于合成生物学筛选的周质展示平台,以研究基因编码的蛋白质调节剂 | 肽、蛋白质、纳米抗体以及人类G蛋白偶联受体(GPCRs) | 合成生物学 | NA | 周质展示技术、自分泌信号传导 | NA | NA | NA | NA | 酵母 | 膜蛋白功能筛选平台 | 医学、工业生物技术 |
| 24 | 2025-12-24 |
Research progress on gut microbiota in colorectal cancer immunotherapy
2025-Nov, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2025.189476
PMID:41130540
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综述 | 本文系统综述了肠道菌群及其代谢微环境在调节结直肠癌免疫检查点抑制剂疗效中的关键研究进展 | 聚焦于肠道菌群及其代谢产物如何影响免疫检查点抑制剂疗效,并探讨了基于微生物组的靶向干预策略,如益生菌/益生元组合、优化的抗生素使用时机、改进的粪菌移植方案以及基于合成生物学的工程菌疗法 | NA | 为开发新型个性化结直肠癌免疫治疗策略提供理论基础,重点是通过调节微生物组来优化免疫检查点抑制剂的治疗效果 | 结直肠癌患者、肠道菌群及其代谢产物 | NA | 结直肠癌 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 25 | 2025-12-23 |
Chromoproteins: visible tools for advancing synthetic biology
2025-Nov-26, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.10.020
PMID:41309430
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综述 | 本文全面概述了基于色蛋白的研究进展,包括其理化特性、分类、工程策略和应用 | 强调色蛋白作为可见工具在合成生物学中的独特优势,如裸眼可见性、广泛表达和可调性 | NA | 推动合成生物学中可见色蛋白报告基因的发展,提供更易访问和模块化的平台 | 色蛋白及其变体 | 合成生物学 | NA | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | 原核和真核系统 | NA | 合成生物学研究与应用 |
| 26 | 2025-12-23 |
codonGPT: reinforcement learning on a generative language model enables scalable mRNA design
2025-Nov-26, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1345
PMID:41416521
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研究论文 | 本文开发了首个专门针对mRNA序列的生成式语言模型codonGPT,并结合强化学习实现了可扩展的mRNA设计优化 | 首次将强化学习与生物语言模型结合用于mRNA设计,提出了创新的推理时掩码方法以约束同义序列,并构建了首个基于模型生物mRNA序列的生成式语言模型 | 模型训练数据仅包含338,417条模型生物mRNA序列,可能未覆盖所有生物多样性;方法在HLA-A和ACTB等示例基因中验证,需进一步扩展应用范围 | 开发可扩展的mRNA设计方法,用于治疗、合成生物学和蛋白质工程 | mRNA序列设计优化 | 自然语言处理 | NA | 强化学习、生成式语言模型 | GPT类生成模型 | mRNA序列数据 | 338,417条模型生物mRNA序列 | NA | NA | NA | 医学、合成生物学、蛋白质工程 |
| 27 | 2025-12-22 |
CAR-T cells in solid tumors: Challenges and breakthroughs
2025-Nov-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102353
PMID:40945517
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综述 | 本文综述了CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中面临的挑战、近期临床试验的突破,以及整合合成生物学和基因工程的新策略 | 重点介绍了整合合成生物学和基因工程的突破性策略,以增强CAR-T细胞的适应性、效力、持久性,激活宿主免疫,重编程肿瘤微环境,并实现多抗原靶向 | 讨论了当前临床前模型(如免疫缺陷小鼠的人源异种移植、人源化或同基因模型)在评估CAR-T细胞疗法疗效和安全性方面的优缺点 | 探讨如何克服CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的局限性,并推动下一代CAR-T疗法的发展 | CAR-T细胞疗法及其在实体瘤中的应用 | NA | 实体瘤 | 合成生物学,基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 28 | 2025-12-22 |
Microwave-Activated Bacterial Biorobot for Multimodal Cancer Therapy
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504603
PMID:40789052
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研究论文 | 本文开发了一种微波激活的细菌生物机器人,用于实现多模态癌症治疗 | 利用微波对工程化大肠杆菌进行局部激活,结合葡萄糖氧化酶表达与表面CuO纳米颗粒的类芬顿反应,协同诱导多种肿瘤细胞死亡方式 | 未明确说明长期生物安全性、免疫原性及临床转化潜力 | 开发一种安全、可精确控制的多模态癌症治疗平台 | 工程化大肠杆菌(MG1655)及肿瘤细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工程、纳米材料修饰、转录组分析 | NA | 体外实验数据、体内实验数据、转录组数据 | NA | 合成生物学工程 | 大肠杆菌 | 微波激活的葡萄糖氧化酶表达系统 | 医学 |
| 29 | 2025-12-21 |
Genomic assembly, rescue, and characterization of a functional pseudorabies virus
2025-Nov-28, Virologica Sinica
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.virs.2025.11.010
PMID:41319833
|
研究论文 | 本研究开发了一个基于酵母转化相关重组(TAR)技术的伪狂犬病病毒(PRV)基因组组装平台,用于功能拯救和表征合成病毒 | 利用TAR技术成功组装和拯救了高GC含量、重复序列复杂的PRV基因组,并引入CRISPR/Cas9编辑插入egfp基因 | 合成的PRV-GX-Syn1病毒滴度降低、噬斑变小,且在BALB/c小鼠中仍引起致死性感染,毒力未完全减弱 | 开发快速灵活的PRV基因组修饰平台,以促进基础研究和基于PRV的疫苗载体开发 | 伪狂犬病病毒(PRV),特别是基因型II变异株PRV-GX-2011 | 合成生物学 | 伪狂犬病(由伪狂犬病病毒引起) | 酵母转化相关重组(TAR)、CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | 基因组序列数据 | 使用PRV-GX-2011株进行基因组组装,并在Vero细胞和BALB/c小鼠中进行功能测试 | CRISPR-Cas9, TAR | 酿酒酵母(用于TAR组装)、Vero细胞(用于病毒拯救) | NA | 医学(疫苗开发) |
| 30 | 2025-12-18 |
Synthetic biology approaches to generate temperature-sensitive alleles for the Sterile Insect Technique
2025-Nov-03, Insect science
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/1744-7917.70186
PMID:41178318
|
综述 | 本文综述了利用合成生物学方法开发温度敏感等位基因以改进昆虫不育技术中雄性品系培育的策略 | 提出结合CRISPR/Cas基因组编辑、理性蛋白质设计及合成生物学工具(如温度诱导型N端降解子、温度敏感内含肽)创建非转基因温度敏感品系的新范式 | 在雄性决定染色体或基因座上整合和表达外源基因的技术尚未完全成熟,需要开发更多将温度敏感表型与雌性发育关联的策略 | 开发适用于昆虫不育技术的温度敏感遗传性别品系,实现环境友好的害虫防控 | 昆虫不育技术目标物种的遗传性别品系 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、蛋白质理性设计、温度诱导型N端降解子、温度敏感内含肽 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 昆虫(SIT目标物种) | 温度敏感等位基因系统、性别特异性致死/转换通路 | 农业 |
| 31 | 2025-12-17 |
A membrane-driven biochemical oscillator tunable by the volume to surface area ratio
2025-Nov-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.14.688573
PMID:41292784
|
研究论文 | 本文介绍并建模了一种基于膜磷脂浓度动态变化驱动的质量守恒生化振荡器,其振荡频率可通过系统的体积与表面积比(V/A)进行调节 | 提出了一种不依赖转录翻译机制、通过膜定位维度缩减放大反应的新型生化振荡器设计,首次实现通过几何参数(V/A比)直接调控振荡特性 | 模型验证主要依赖计算模拟,需要实验体系进一步验证实际生物系统的可行性 | 开发可编程的合成生物学定时模块,探索几何传感在工程化系统中的应用潜力 | 基于内存机制启发的膜驱动生化振荡系统 | 合成生物学 | NA | 质量作用反应动力学、反应-扩散模拟、随机模拟 | 确定性振荡器模型、随机整数拷贝数模型 | 计算模拟数据 | NA | NA | 无细胞系统 | 膜定位振荡器、自组装三聚体耦合系统 | 合成生物学、生物工程 |
| 32 | 2025-12-17 |
Harnessing the ocean's pharmacy: marine bioactive compounds as next-generation therapeutics
2025-Nov, Natural product research
IF:1.9Q3
DOI:10.1080/14786419.2024.2373965
PMID:38954510
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综述 | 本文综述了海洋生物活性化合物作为下一代治疗药物的潜力、应用及挑战 | 强调海洋生物活性化合物在结构独特性和生物活性方面的突破性潜力,并指出合成生物学和代谢工程为可持续生产提供了解决方案 | 面临可持续采集和复杂提取工艺等挑战 | 探讨海洋生物活性化合物的临床潜力及其在现代医学中的应用 | 海洋生物活性化合物 | NA | 癌症、慢性疼痛、传染病 | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 33 | 2025-12-16 |
Cellulase secretion by engineered Pseudomonas putida enables growth on cellulose oligomers
2025-Nov-25, Applied microbiology and biotechnology
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s00253-025-13617-9
PMID:41291027
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研究论文 | 本研究通过工程化改造恶臭假单胞菌,使其分泌纤维素酶,从而能够利用纤维素寡聚物作为唯一碳源和能量来源生长 | 首次在恶臭假单胞菌中实现非天然纤维素酶的功能性分泌,并鉴定了高效的双精氨酸转运酶分泌信号肽 | 研究仅针对纤维素寡聚物(纤维三糖和纤维四糖),未验证对完整纤维素聚合物的降解能力 | 开发恶臭假单胞菌作为合成生物学平台,用于从低品位原料进行化学合成 | 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) | 合成生物学 | NA | 分子工程、分泌信号肽筛选 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 恶臭假单胞菌(Pseudomonas putida) | 纤维素酶分泌系统(包括外切和内切纤维素酶) | 工业生物技术、能源 |
| 34 | 2025-12-16 |
Degradation mechanisms and microbial remediation of micro- and nanoplastics: A comprehensive review
2025-Nov-18, Ying yong sheng tai xue bao = The journal of applied ecology
DOI:10.13287/j.1001-9332.202511.034
PMID:41392686
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综述 | 本文全面综述了微/纳塑料的生成途径、微生物降解机制,并评估了微生物修复技术的应用潜力 | 系统整合了微/纳塑料的非生物与生物降解过程,并重点探讨了基于合成生物学的降解酶系统改造与优化这一未来研究方向 | 现有微生物处理技术存在降解效率低、环境适应性差以及工程化放大困难等瓶颈 | 为微/纳塑料污染的有效控制提供技术支撑 | 微塑料和纳米塑料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 35 | 2025-12-15 |
Bacterial Cellulose for Sustainable Food Packaging: Production Pathways, Structural Design, and Functional Modification Strategies
2025-Nov-28, Polymers
IF:4.7Q1
DOI:10.3390/polym17233165
PMID:41374852
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综述 | 本文综述了细菌纤维素在可持续食品包装领域的生产途径、结构设计及功能改性策略 | 系统总结了通过合成生物学、绿色化学和材料工程等方法对细菌纤维素进行原位和异位功能化的最新进展,以增强其机械、阻隔、抗氧化和抗菌性能 | 面临生产成本高、发酵周期长以及监管不确定性等挑战 | 探讨细菌纤维素作为石油基塑料替代品,在可持续食品包装中的应用潜力 | 细菌纤维素及其复合材料 | 材料科学 | NA | 微生物发酵、合成生物学、绿色化学、材料工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | Komagataeibacter属及相关菌属 | NA | 食品包装 |
| 36 | 2025-12-12 |
Governing Synthetic Biology: A Co-Evolutionary Framework for Sustainable Innovation
2025-Nov-26, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2508.08001
PMID:41309363
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综述 | 本文回顾了合成生物学的发展历程,分析了其面临的监管与政策挑战,并基于经合组织的框架提出了一个促进技术与制度框架共同演化的“协同演化”治理模型 | 提出了一个基于经合组织“新兴技术预见性治理框架”的“协同演化”模型,强调研发、战略情报、社会信任构建、敏捷监管和国际合作五个关键要素的协同 | 本文是一篇综述性文章,主要进行理论分析和框架构建,未涉及具体的实验验证或案例数据 | 探讨如何通过协同治理框架,使合成生物学的技术发展与社会制度、监管及公众接受度同步,以实现可持续创新 | 合成生物学领域的整体发展、监管政策框架及社会接受度 | NA | NA | NA | 协同演化模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 37 | 2025-12-12 |
A stable and antibiotic-free plasmid expression system for Salmonella typhimurium VNP20009 in tumor therapy
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113863
PMID:41362775
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研究论文 | 本研究为鼠伤寒沙门氏菌VNP20009开发了一种稳定且无抗生素的质粒表达系统,用于肿瘤治疗 | 通过比较不同复制子、转录控制和稳定模块,构建了无抗生素依赖的质粒平台,利用axe/txe毒素-抗毒素系统实现质粒稳定保留,并实现超过100倍的基因表达动态调控 | 研究仅在鼠类肿瘤模型(LLC和B16F10)中测试,未涉及其他肿瘤类型或更广泛的体内环境 | 开发用于肿瘤基因治疗的稳定无抗生素质粒表达系统 | 鼠伤寒沙门氏菌VNP20009作为肿瘤靶向载体 | 合成生物学 | 肿瘤 | 质粒工程、毒素-抗毒素系统 | NA | NA | 鼠类肿瘤模型(LLC和B16F10) | Gibson Assembly, BioBrick | Salmonella typhimurium VNP20009 | 质粒表达系统,包含复制子、可调启动子-RBS组合和axe/txe毒素-抗毒素稳定模块 | 医学 |
| 38 | 2025-12-12 |
A Computational Framework for Optimal and Model Predictive Control of Stochastic Gene Regulatory Networks
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3598449
PMID:40911462
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研究论文 | 本文开发了一个用于随机基因调控网络的最优和模型预测控制的计算框架,旨在高效管理分子噪声并精确调控细胞群体行为 | 通过部分积分-微分方程高效近似化学主方程,实现高计算效率、精确控制概率密度函数以微调细胞群体复杂行为,并稳健处理内在分子噪声 | NA | 为合成生物学中随机生物分子系统的精确控制提供高效计算框架 | 随机基因调控网络 | 计算生物学 | NA | 部分积分-微分方程近似、伴随优化方法 | 模型预测控制 | NA | NA | NA | NA | 诱导基因调控回路 | 合成生物学 |
| 39 | 2025-12-10 |
Microalgae-based vaccines for aquaculture
2025-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.001
PMID:40268646
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综述 | 本文介绍了基于微藻的口服疫苗在水产养殖中的应用,旨在通过可持续方式增强鱼类免疫力并控制疾病爆发 | 提出了基于微藻的口服疫苗的理性设计,并讨论了其口服递送和免疫益处,结合合成生物学和鱼类免疫代谢的进展推动创新 | NA | 探讨微藻基疫苗在水产养殖中的可持续应用,以增强鱼类免疫力和减少疾病 | 微藻基口服疫苗及其在水产养殖鱼类中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微藻 | NA | 农业 |
| 40 | 2025-12-09 |
AI and mechanistic modeling for characterizing biosynthetic pathways of natural products
2025-Nov-07, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00059a
PMID:41200906
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综述 | 本文综述了2020年至2025年间,人工智能和机制建模在表征天然产物生物合成途径中的应用与进展 | 整合人工智能预测方法和机制模拟,以加速天然产物的发现、工程化及应用,特别是在药物发现和生物技术领域 | NA | 加速天然产物的发现、工程化及其在药物发现、生物技术和合成生物学中的应用 | 天然产物的生物合成途径 | 机器学习 | NA | 人工智能、机制建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 生物技术, 合成生物学 |