合成生物学相关文章
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当前共找到 143 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-12-12 |
A stable and antibiotic-free plasmid expression system for Salmonella typhimurium VNP20009 in tumor therapy
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113863
PMID:41362775
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研究论文 | 本研究为鼠伤寒沙门氏菌VNP20009开发了一种稳定且无抗生素的质粒表达系统，用于肿瘤治疗 | 通过比较不同复制子、转录控制和稳定模块，构建了无抗生素依赖的质粒平台，利用axe/txe毒素-抗毒素系统实现质粒稳定保留，并实现超过100倍的基因表达动态调控 | 研究仅在鼠类肿瘤模型（LLC和B16F10）中测试，未涉及其他肿瘤类型或更广泛的体内环境 | 开发用于肿瘤基因治疗的稳定无抗生素质粒表达系统 | 鼠伤寒沙门氏菌VNP20009作为肿瘤靶向载体 | 合成生物学 | 肿瘤 | 质粒工程、毒素-抗毒素系统 | NA | NA | 鼠类肿瘤模型（LLC和B16F10） | Gibson Assembly, BioBrick | Salmonella typhimurium VNP20009 | 质粒表达系统，包含复制子、可调启动子-RBS组合和axe/txe毒素-抗毒素稳定模块 | 医学 |
| 42 | 2025-12-12 |
A Computational Framework for Optimal and Model Predictive Control of Stochastic Gene Regulatory Networks
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3598449
PMID:40911462
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研究论文 | 本文开发了一个用于随机基因调控网络的最优和模型预测控制的计算框架，旨在高效管理分子噪声并精确调控细胞群体行为 | 通过部分积分-微分方程高效近似化学主方程，实现高计算效率、精确控制概率密度函数以微调细胞群体复杂行为，并稳健处理内在分子噪声 | NA | 为合成生物学中随机生物分子系统的精确控制提供高效计算框架 | 随机基因调控网络 | 计算生物学 | NA | 部分积分-微分方程近似、伴随优化方法 | 模型预测控制 | NA | NA | NA | NA | 诱导基因调控回路 | 合成生物学 |
| 43 | 2025-12-10 |
Microalgae-based vaccines for aquaculture
2025-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.001
PMID:40268646
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综述 | 本文介绍了基于微藻的口服疫苗在水产养殖中的应用，旨在通过可持续方式增强鱼类免疫力并控制疾病爆发 | 提出了基于微藻的口服疫苗的理性设计，并讨论了其口服递送和免疫益处，结合合成生物学和鱼类免疫代谢的进展推动创新 | NA | 探讨微藻基疫苗在水产养殖中的可持续应用，以增强鱼类免疫力和减少疾病 | 微藻基口服疫苗及其在水产养殖鱼类中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微藻 | NA | 农业 |
| 44 | 2025-12-09 |
AI and mechanistic modeling for characterizing biosynthetic pathways of natural products
2025-Nov-07, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00059a
PMID:41200906
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综述 | 本文综述了2020年至2025年间，人工智能和机制建模在表征天然产物生物合成途径中的应用与进展 | 整合人工智能预测方法和机制模拟，以加速天然产物的发现、工程化及应用，特别是在药物发现和生物技术领域 | NA | 加速天然产物的发现、工程化及其在药物发现、生物技术和合成生物学中的应用 | 天然产物的生物合成途径 | 机器学习 | NA | 人工智能、机制建模 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现, 生物技术, 合成生物学 |
| 45 | 2025-12-09 |
Halogenases and dehalogenases: mechanisms, engineering, and applications
2025-Nov-03, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00055f
PMID:41181914
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综述 | 本文综述了卤化酶和脱卤酶在机制、工程改造及应用方面的最新进展，重点关注其在生物合成和生物修复中的集成应用 | 系统总结了不同类型卤化酶和脱卤酶的最新工程化进展，并探讨了将其整合到可扩展平台中的合成生物学策略 | NA | 探讨卤化酶和脱卤酶在生物催化卤化与脱卤反应中的机制、工程改造潜力及其工业与环境应用 | 卤化有机化合物、卤化酶（包括卤过氧化物酶、黄素依赖型、α-酮戊二酸依赖型、SAM依赖型等）和脱卤酶（还原型、水解型、氧化型） | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、酶工程、生物催化 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | 医药, 农业, 环境, 材料, 工业生物技术 |
| 46 | 2025-12-07 |
Automated Genetic Manipulation for the Construction of Pichia pastoris Cell Factories
2025-Nov-27, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00033
PMID:41340629
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研究论文 | 本研究开发了一种基于BioFoundry的自动化遗传操作流程，用于快速构建毕赤酵母细胞工厂 | 首次报道了针对毕赤酵母的自动化高通量遗传操作系统，实现了高效的基于热激的转化和基因组编辑，并自动化表征了96个内源启动子 | 研究主要针对毕赤酵母，其他非模式酵母的适用性有待进一步验证 | 构建和优化微生物细胞工厂，特别是用于重组蛋白表达和天然产物生物合成 | 毕赤酵母（Pichia pastoris） | 合成生物学 | NA | 自动化遗传操作、基因组编辑、启动子表征 | NA | NA | 96个内源启动子 | BioFoundry | 毕赤酵母（Pichia pastoris） | 细胞工厂构建，用于生产倍半萜α-檀香烯和α-檀香醇 | 工业生物技术 |
| 47 | 2025-12-07 |
In silico approaches for discovering microbial antiviral defense systems
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf619
PMID:41348595
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综述 | 本文综述了用于发现微生物抗病毒防御系统的计算策略，包括序列同源性、结构引导、基因组上下文和人工智能方法 | 将计算方法分为四大策略，并讨论了新兴工具如保守基因簇发现工具和基因组基础模型，以支持合成模块的生成设计 | 序列同源性方法在检测高度分化或新系统方面有限，结构引导方法计算成本高 | 系统探索微生物免疫系统，指导理性噬菌体疗法、微生物组工程和合成生物学应用 | 原核生物的多样化抗病毒防御系统 | 生物信息学 | NA | 高通量测序 | 人工智能方法 | 基因组数据 | NA | NA | 原核生物 | NA | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 48 | 2025-12-04 |
A deep dive into plant metabolomics: Milestones, technologies, and translational impact
2025-Nov-26, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf408
PMID:40991682
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综述 | 本文综述了植物代谢组学的发展历程、技术进展及其在植物生物学和农业应用中的翻译影响 | 总结了超过500个开源计算工具，并探讨了成像质谱、单细胞代谢组学、AI驱动的代谢物识别等新兴技术 | NA | 评估植物代谢组学在功能基因组学、作物改良和合成生物学中的作用 | 植物代谢组学数据、工具和应用 | NA | NA | 代谢组学、成像质谱、单细胞代谢组学、转录组-代谢组联合分析 | NA | 代谢组学数据集 | NA | NA | NA | NA | 农业、医学、生物技术 |
| 49 | 2025-12-03 |
Architects of plant immunity: Structure-informed strategies for engineering plant nucleotide-binding leucine-rich repeat receptors
2025-Nov-30, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2025.102828
PMID:41325717
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综述 | 本文综述了基于结构信息工程化植物NLR受体以增强植物免疫系统的策略 | 结合分子结构理解和合成生物学工具，开发了针对NLR受体的工程化方法，如整合域工程和LRR表面重塑，以扩展病原体识别能力 | NA | 工程化植物核苷酸结合富含亮氨酸重复序列（NLR）受体，以增强植物对病原体的免疫反应 | 植物NLR受体及其结构 | 合成生物学 | 植物病害 | 结构建模、合成生物学工具 | NA | 结构数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 50 | 2025-12-02 |
Artificial cells with liquid-liquid phase separation-regulated cell-free protein synthesis
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2511283122
PMID:41269793
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研究论文 | 本文通过液-液相分离调控无细胞蛋白质合成，构建了具有可控蛋白质表达的人工细胞 | 利用含多价关联基团的工程聚合物，通过液-液相分离诱导蛋白质聚集，实现无细胞蛋白质合成活性的可逆调控和精确时间控制 | 未明确提及具体限制，但暗示在工程化人工细胞调控蛋白质表达方面仍存在显著局限 | 开发能够调控蛋白质表达的人工细胞，并探索其在生物医学应用中的潜力 | 人工细胞、无细胞蛋白质合成系统、工程聚合物、微流控平台制备的巨型单层囊泡 | 合成生物学 | 肝损伤 | 液-液相分离、微流控技术、无细胞蛋白质合成 | NA | 实验数据 | 使用胆管结扎小鼠模型进行体内研究 | NA | NA | 基于液-液相分离的蛋白质聚集调控机制，用于可控反应过程 | 医学 |
| 51 | 2025-12-02 |
The International Risk Governance Council: Reflections on a 20-Year Experiment in Support of Improved Risk Governance
2025-Nov, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis
IF:3.0Q1
DOI:10.1111/risa.70117
PMID:41047369
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评论 | 本文回顾了国际风险治理理事会（IRGC）20年的历史、活动及其在多个新兴风险领域的工作成果 | 通过六个案例研究（如太阳辐射管理、合成生物学等）系统总结了IRGC在风险治理方面的贡献，并强调了中立召集机构的重要性 | NA | 评估IRGC作为风险治理支持机构的历史作用与影响 | 国际风险治理理事会（IRGC）及其在多个风险领域的治理活动 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 52 | 2025-12-01 |
Autonomous Bioluminescence Systems: From Molecular Mechanisms to Emerging Applications
2025-Nov-24, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c01072
PMID:41311942
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综述 | 本文综述了自主生物发光系统的分子机制、蛋白质工程策略及其在实时无创成像中的新兴应用 | 系统比较了细菌和真菌自主生物发光系统的优劣，并提出通过AI引导诱变和代谢途径优化等策略解决现有挑战 | 细菌生物发光系统存在量子产率低的问题，真菌生物发光系统受底物可用性限制 | 评估自主生物发光系统的发展现状并展望下一代系统的设计目标 | 细菌和真菌自主生物发光系统 | 合成生物学 | NA | AI引导诱变, 蛋白质设计, 代谢途径优化 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 真菌 | 自主生物发光系统（整合荧光素酶与完整底物生物合成途径） | 生物医学研究, 环境监测, 合成生物学 |
| 53 | 2025-12-01 |
MeJA Elicitation on Flavonoid Biosynthesis and Gene Expression in the Hairy Roots of Glycyrrhiza glabra L
2025-Nov-18, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16111387
PMID:41300839
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研究论文 | 本研究通过建立甘草毛状根培养系统，探究茉莉酸甲酯对黄酮类化合物生物合成及基因表达的影响 | 首次在甘草毛状根系统中结合代谢工程与基因工程技术，通过MeJA诱导和UGT基因过表达显著提高黄酮类化合物含量 | 研究仅针对特定黄酮类化合物，其他活性成分的变化未全面评估；功能基因研究仍需进一步验证 | 提高甘草中黄酮类活性成分的生物合成效率 | 甘草毛状根及其黄酮类化合物 | 合成生物学 | NA | 转录组分析、qRT-PCR、悬浮培养 | NA | 基因表达数据、代谢物含量数据 | 28天悬浮培养的毛状根样本 | 代谢工程、基因工程 | 甘草毛状根 | 黄酮类生物合成途径 | 医药 |
| 54 | 2025-11-30 |
From Biocontrol to Synthesis: Innovative Progress of Paenibacillus in Mechanism Analysis, Gene Editing and Platform Construction
2025-Nov-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262210886
PMID:41303372
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综述 | 本文综述了类芽孢杆菌从生物防治到合成生物学的创新进展，包括机制解析、基因编辑和平台构建 | 系统总结了类芽孢杆菌多种生物防治机制的协同作用及其对环境因素的响应，并探讨了其在合成生物学平台构建中的创新应用 | NA | 探讨类芽孢杆菌在生物防治和合成生物学领域的应用潜力与发展前景 | 类芽孢杆菌及其生物合成机制 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、合成生物学策略 | NA | NA | NA | NA | 类芽孢杆菌 | NA | 农业,工业生物技术 |
| 55 | 2025-12-01 |
Phage Therapy for Acinetobacter baumannii Infections: A Review on Advances in Classification, Applications, and Translational Roadblocks
2025-Nov-08, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14111134
PMID:41301629
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综述 | 本文系统综述了噬菌体疗法在治疗鲍曼不动杆菌感染领域的最新进展，包括分类学更新、治疗策略优化和临床转化挑战 | 基于全基因组系统发育的现代分类学将大多数噬菌体重新分类为Caudoviricetes纲，揭示了与宿主趋向性和生物学特性相关的独特进化支；通过尾丝重组和CRISPR/Cas介导的溶原性消除等基因工程方法扩展宿主范围 | 工程噬菌体的遗传稳定性需要进一步验证；宿主谱有限、缺乏临床转化标准和滞后的监管框架仍是当前挑战 | 总结噬菌体疗法在治疗碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌感染领域的研究进展和转化障碍 | 鲍曼不动杆菌噬菌体及其治疗应用 | NA | 细菌感染 | 全基因组系统发育分析、基因工程、CRISPR/Cas、宏基因组挖掘 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 鲍曼不动杆菌 | NA | 医学 |
| 56 | 2025-12-01 |
Key Challenges in Plant Microbiome Research in the Next Decade
2025-Nov-07, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13112546
PMID:41304231
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综述 | 本文系统分析植物微生物组研究面临的关键挑战并提出未来十年的发展路线图 | 提出整合实验与计算策略的路线图，强调合成生物学、多组学工具和人工智能在工程化植物-微生物互作中的应用前景 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于现有研究现状的分析与展望 | 推动植物微生物组研究向田间规模应用转化，建立具有气候适应性和资源高效性的农业系统 | 植物微生物组 | NA | NA | 多组学数据整合、测序技术、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 植物-微生物互作工程化 | 农业 |
| 57 | 2025-12-01 |
Probiotic Potential of Traditional and Emerging Microbial Strains in Functional Foods: From Characterization to Applications and Health Benefits
2025-Nov-02, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13112521
PMID:41304207
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综述 | 本文综述了传统和新兴益生菌菌株在功能性食品中的潜力，涵盖表征方法、作用机制、技术限制和健康益处 | 重点关注具有新功能特性的新兴微生物候选菌株，并强调通过组学技术和合成生物学解决现有挑战 | 缺乏长期临床验证、菌株特异性研究不足、个性化应用存在空白以及消费者沟通不充分 | 评估传统和新兴益生菌菌株在功能性食品中的应用潜力和健康效益 | 传统和新兴益生菌微生物菌株 | NA | NA | 组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 医药 |
| 58 | 2025-11-30 |
Efficient site-specific integration of kilobase-length DNA fragments in plant cells via Kp03 recombinase
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116508
PMID:41187057
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研究论文 | 本研究评估了Kp03重组酶在植物细胞中实现大片段DNA定点整合的效率 | 首次证明Kp03重组酶能在植物细胞中高效整合长达27.3 kb的DNA片段，并确定仅需15-bp attB序列即可实现整合 | 研究主要基于瞬时原生质体实验和愈伤组织，尚未在完整植株中验证整合效率 | 开发植物基因组工程中大片段DNA定点整合的新方法 | 水稻和拟南芥的细胞及愈伤组织 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的整合、基因组编辑 | NA | 分子生物学实验数据 | 水稻和拟南芥原生质体及愈伤组织（具体数量未明确说明） | Kp03重组酶, NM-PE基因组编辑系统 | 水稻, 拟南芥 | 基于attB-attP重组系统的DNA整合平台 | 农业, 工业生物技术 |
| 59 | 2025-11-30 |
Analog epigenetic memory revealed by targeted chromatin editing
2025-Nov-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100985
PMID:40930103
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研究论文 | 本研究通过靶向染色质编辑揭示了表观遗传记忆的模拟特性，证明染色质修饰可维持不同水平的基因表达 | 首次发现DNA甲基化梯度可对应维持不同水平的基因表达，揭示了模拟表观遗传记忆的存在机制 | 未明确说明实验使用的具体细胞类型和样本规模 | 探索染色质修饰如何维持不同基因表达状态及其记忆机制 | 染色质修饰状态与基因表达动态关系 | 合成生物学 | NA | 靶向染色质编辑、DNA甲基化分析 | 染色质修饰模型 | 基因表达动态数据 | NA | 基因组报告系统、表观遗传效应器 | NA | 表观遗传记忆系统 | 合成生物学 |
| 60 | 2025-11-30 |
Genetic Surfaceome E. coli Reprogramming Enables Selective Water Oxidation
2025-Nov, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202508100
PMID:40817601
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研究论文 | 通过合成生物学方法重构大肠杆菌表面组，实现选择性水氧化催化 | 开发了合成操纵子系统，通过正交诱导控制和密码子优化表达，在微生物表面展示真菌胆红素氧化酶并实现活性重构 | NA | 设计可再生微生物平台用于选择性催化和人工光合作用 | 大肠杆菌表面展示的胆红素氧化酶系统 | 合成生物学 | NA | 合成生物学、基因工程、生物电催化 | NA | NA | NA | 合成操纵子、IPTG诱导系统、冰核蛋白锚定 | 大肠杆菌 | 合成操纵子系统，包含正交IPTG诱导控制、密码子优化表达和表面蛋白展示 | 能源、环境 |