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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-12-30 |
[Microfluidics-driven synthetic biology and biomanufacturing: research progress in methods and applications and future perspectives]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250444
PMID:41457587
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综述 | 本文综述了微流控技术在合成生物学和生物制造中的应用,包括其在设计-构建-测试-学习循环中的作用以及在上游菌株培养改进和下游处理集成优化中的角色 | 探讨微流控技术如何通过单细胞精度、高通量筛选和快速迭代解决合成生物学和生物制造中的挑战,并分析其作为赋能技术、跨学科整合和AI驱动智能系统的未来方向 | 微流控技术在合成生物学和生物制造中面临微尺度放大和芯片材料等瓶颈 | 综述微流控技术在合成生物学和生物制造中的研究进展、应用案例及未来展望 | 微流控技术、合成生物学和生物制造 | NA | NA | 微流控技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 能源, 农业, 环境保护, 化学品与材料, 农业食品 |
| 42 | 2025-12-30 |
[DNA modification by sulfur: mechanistic insights drives synthetic biotechnologies forward]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250474
PMID:41457586
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综述 | 本文综述了DNA硫修饰的发现、机制及其在合成生物技术中的应用 | 首次聚焦于DNA硫修饰(磷硫酰化)作为天然修饰的突破性发现,并探讨其在基因编辑和工业菌株开发中的新兴应用 | NA | 阐明DNA硫修饰的分子机制及其在合成生物学中的技术应用 | DNA硫修饰(磷硫酰化)及其相关细菌防御系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | NA | 工业生物技术, 医学 |
| 43 | 2025-12-30 |
[Application of synthetic biology in contamination remediation of the petrochemical industry]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250581
PMID:41457606
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综述 | 本文综述了合成生物学在石化工业污染修复中的应用,重点介绍了生物传感器、工程降解菌株和合成微生物群落的研究进展 | 系统总结了合成生物学在石化污染修复领域的最新进展,并针对工程微生物应用中的问题提出了可能的解决方案 | NA | 开发新的生物修复技术以提高石化污染物的降解效果 | 石化污染物 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物 | 生物传感器、降解途径、合成微生物群落 | 环境 |
| 44 | 2025-12-30 |
[Generation of antibody diversity in mammals: mechanisms and synthetic biology applications]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250475
PMID:41457603
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综述 | 本文综述了哺乳动物中抗体多样性的生成机制,包括V(D)J重组、体细胞超突变和类别转换重组,并探讨了相关酶在合成生物学中的应用进展 | 强调了TdT、胞苷脱氨酶和DNA糖基化酶等关键酶在合成生物学中的最新应用进展,为生物技术和医学研究提供了新方向 | NA | 总结哺乳动物抗原受体多样化的分子机制,并探讨抗体筛选、应用及相关酶在合成生物学中的进展 | 免疫球蛋白(抗体)及其多样性生成机制,包括V(D)J重组、体细胞超突变和类别转换重组 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 重组激活基因蛋白、末端脱氧核苷酸转移酶(TdT)、激活诱导胞苷脱氨酶、DNA糖基化酶 | 哺乳动物 | NA | 医学, 生物技术 |
| 45 | 2025-12-30 |
[Applications of protein structure determination in synthetic biology]
2025-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250437
PMID:41457622
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综述 | 本文综述了蛋白质结构测定技术在合成生物学中的应用,包括蛋白质工程、代谢途径优化、生物传感器设计和人工生物系统构建 | 总结了冷冻电镜、X射线晶体学和基于人工智能的预测方法等最新技术突破在合成生物学中的应用进展 | NA | 为合成生物学相关研究领域提供理论参考和技术视角 | 蛋白质结构测定技术及其在合成生物学中的应用 | NA | NA | 冷冻电镜、X射线晶体学、人工智能预测方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 46 | 2025-12-28 |
Somatic Embryogenesis: A Biotechnological Route in the Production of Recombinant Proteins
2025-Nov-26, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech14040093
PMID:41440172
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综述 | 本文综述了体细胞胚胎发生(SE)作为一种生物技术途径在生产重组蛋白中的应用,包括疫苗抗原和治疗性蛋白 | 将体细胞胚胎发生与植物组织培养和遗传转化策略结合,作为重组蛋白生产的通用平台,并探讨了合成生物学和糖工程等创新策略 | 优化转化效率、扩大基于生物反应器的悬浮培养规模以及确保在GMP标准下进行适当的翻译后修饰仍面临挑战 | 探讨体细胞胚胎发生作为重组蛋白生产的生物技术途径,并讨论当前挑战和创新策略 | 体细胞胚胎发生过程、重组蛋白生产系统、非模式植物和复杂蛋白表达 | 生物技术 | NA | 植物组织培养、遗传转化、合成生物学、糖工程 | NA | NA | NA | NA | 植物 | NA | 医药、工业生物技术 |
| 47 | 2025-12-22 |
CAR-T cells in solid tumors: Challenges and breakthroughs
2025-Nov-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102353
PMID:40945517
|
综述 | 本文综述了CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中面临的挑战、近期临床试验的突破,以及整合合成生物学和基因工程的新策略 | 重点介绍了整合合成生物学和基因工程的突破性策略,以增强CAR-T细胞的适应性、效力、持久性,激活宿主免疫,重编程肿瘤微环境,并实现多抗原靶向 | 讨论了当前临床前模型(如免疫缺陷小鼠的人源异种移植、人源化或同基因模型)在评估CAR-T细胞疗法疗效和安全性方面的优缺点 | 探讨如何克服CAR-T细胞疗法在实体瘤治疗中的局限性,并推动下一代CAR-T疗法的发展 | CAR-T细胞疗法及其在实体瘤中的应用 | NA | 实体瘤 | 合成生物学,基因工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 48 | 2025-12-22 |
Microwave-Activated Bacterial Biorobot for Multimodal Cancer Therapy
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504603
PMID:40789052
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研究论文 | 本文开发了一种微波激活的细菌生物机器人,用于实现多模态癌症治疗 | 利用微波对工程化大肠杆菌进行局部激活,结合葡萄糖氧化酶表达与表面CuO纳米颗粒的类芬顿反应,协同诱导多种肿瘤细胞死亡方式 | 未明确说明长期生物安全性、免疫原性及临床转化潜力 | 开发一种安全、可精确控制的多模态癌症治疗平台 | 工程化大肠杆菌(MG1655)及肿瘤细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工程、纳米材料修饰、转录组分析 | NA | 体外实验数据、体内实验数据、转录组数据 | NA | 合成生物学工程 | 大肠杆菌 | 微波激活的葡萄糖氧化酶表达系统 | 医学 |
| 49 | 2025-12-17 |
Harnessing the ocean's pharmacy: marine bioactive compounds as next-generation therapeutics
2025-Nov, Natural product research
IF:1.9Q3
DOI:10.1080/14786419.2024.2373965
PMID:38954510
|
综述 | 本文综述了海洋生物活性化合物作为下一代治疗药物的潜力、应用及挑战 | 强调海洋生物活性化合物在结构独特性和生物活性方面的突破性潜力,并指出合成生物学和代谢工程为可持续生产提供了解决方案 | 面临可持续采集和复杂提取工艺等挑战 | 探讨海洋生物活性化合物的临床潜力及其在现代医学中的应用 | 海洋生物活性化合物 | NA | 癌症、慢性疼痛、传染病 | 合成生物学、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 50 | 2025-12-16 |
Degradation mechanisms and microbial remediation of micro- and nanoplastics: A comprehensive review
2025-Nov-18, Ying yong sheng tai xue bao = The journal of applied ecology
DOI:10.13287/j.1001-9332.202511.034
PMID:41392686
|
综述 | 本文全面综述了微/纳塑料的生成途径、微生物降解机制,并评估了微生物修复技术的应用潜力 | 系统整合了微/纳塑料的非生物与生物降解过程,并重点探讨了基于合成生物学的降解酶系统改造与优化这一未来研究方向 | 现有微生物处理技术存在降解效率低、环境适应性差以及工程化放大困难等瓶颈 | 为微/纳塑料污染的有效控制提供技术支撑 | 微塑料和纳米塑料 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 51 | 2025-12-15 |
Bacterial Cellulose for Sustainable Food Packaging: Production Pathways, Structural Design, and Functional Modification Strategies
2025-Nov-28, Polymers
IF:4.7Q1
DOI:10.3390/polym17233165
PMID:41374852
|
综述 | 本文综述了细菌纤维素在可持续食品包装领域的生产途径、结构设计及功能改性策略 | 系统总结了通过合成生物学、绿色化学和材料工程等方法对细菌纤维素进行原位和异位功能化的最新进展,以增强其机械、阻隔、抗氧化和抗菌性能 | 面临生产成本高、发酵周期长以及监管不确定性等挑战 | 探讨细菌纤维素作为石油基塑料替代品,在可持续食品包装中的应用潜力 | 细菌纤维素及其复合材料 | 材料科学 | NA | 微生物发酵、合成生物学、绿色化学、材料工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | Komagataeibacter属及相关菌属 | NA | 食品包装 |
| 52 | 2025-12-12 |
Governing Synthetic Biology: A Co-Evolutionary Framework for Sustainable Innovation
2025-Nov-26, Journal of microbiology and biotechnology
IF:2.5Q3
DOI:10.4014/jmb.2508.08001
PMID:41309363
|
综述 | 本文回顾了合成生物学的发展历程,分析了其面临的监管与政策挑战,并基于经合组织的框架提出了一个促进技术与制度框架共同演化的“协同演化”治理模型 | 提出了一个基于经合组织“新兴技术预见性治理框架”的“协同演化”模型,强调研发、战略情报、社会信任构建、敏捷监管和国际合作五个关键要素的协同 | 本文是一篇综述性文章,主要进行理论分析和框架构建,未涉及具体的实验验证或案例数据 | 探讨如何通过协同治理框架,使合成生物学的技术发展与社会制度、监管及公众接受度同步,以实现可持续创新 | 合成生物学领域的整体发展、监管政策框架及社会接受度 | NA | NA | NA | 协同演化模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 53 | 2025-12-12 |
A stable and antibiotic-free plasmid expression system for Salmonella typhimurium VNP20009 in tumor therapy
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113863
PMID:41362775
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研究论文 | 本研究为鼠伤寒沙门氏菌VNP20009开发了一种稳定且无抗生素的质粒表达系统,用于肿瘤治疗 | 通过比较不同复制子、转录控制和稳定模块,构建了无抗生素依赖的质粒平台,利用axe/txe毒素-抗毒素系统实现质粒稳定保留,并实现超过100倍的基因表达动态调控 | 研究仅在鼠类肿瘤模型(LLC和B16F10)中测试,未涉及其他肿瘤类型或更广泛的体内环境 | 开发用于肿瘤基因治疗的稳定无抗生素质粒表达系统 | 鼠伤寒沙门氏菌VNP20009作为肿瘤靶向载体 | 合成生物学 | 肿瘤 | 质粒工程、毒素-抗毒素系统 | NA | NA | 鼠类肿瘤模型(LLC和B16F10) | Gibson Assembly, BioBrick | Salmonella typhimurium VNP20009 | 质粒表达系统,包含复制子、可调启动子-RBS组合和axe/txe毒素-抗毒素稳定模块 | 医学 |
| 54 | 2025-12-12 |
A Computational Framework for Optimal and Model Predictive Control of Stochastic Gene Regulatory Networks
2025 Nov-Dec, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2025.3598449
PMID:40911462
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研究论文 | 本文开发了一个用于随机基因调控网络的最优和模型预测控制的计算框架,旨在高效管理分子噪声并精确调控细胞群体行为 | 通过部分积分-微分方程高效近似化学主方程,实现高计算效率、精确控制概率密度函数以微调细胞群体复杂行为,并稳健处理内在分子噪声 | NA | 为合成生物学中随机生物分子系统的精确控制提供高效计算框架 | 随机基因调控网络 | 计算生物学 | NA | 部分积分-微分方程近似、伴随优化方法 | 模型预测控制 | NA | NA | NA | NA | 诱导基因调控回路 | 合成生物学 |
| 55 | 2025-12-10 |
Microalgae-based vaccines for aquaculture
2025-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.001
PMID:40268646
|
综述 | 本文介绍了基于微藻的口服疫苗在水产养殖中的应用,旨在通过可持续方式增强鱼类免疫力并控制疾病爆发 | 提出了基于微藻的口服疫苗的理性设计,并讨论了其口服递送和免疫益处,结合合成生物学和鱼类免疫代谢的进展推动创新 | NA | 探讨微藻基疫苗在水产养殖中的可持续应用,以增强鱼类免疫力和减少疾病 | 微藻基口服疫苗及其在水产养殖鱼类中的应用 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微藻 | NA | 农业 |
| 56 | 2025-12-09 |
Halogenases and dehalogenases: mechanisms, engineering, and applications
2025-Nov-03, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00055f
PMID:41181914
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综述 | 本文综述了卤化酶和脱卤酶在机制、工程改造及应用方面的最新进展,重点关注其在生物合成和生物修复中的集成应用 | 系统总结了不同类型卤化酶和脱卤酶的最新工程化进展,并探讨了将其整合到可扩展平台中的合成生物学策略 | NA | 探讨卤化酶和脱卤酶在生物催化卤化与脱卤反应中的机制、工程改造潜力及其工业与环境应用 | 卤化有机化合物、卤化酶(包括卤过氧化物酶、黄素依赖型、α-酮戊二酸依赖型、SAM依赖型等)和脱卤酶(还原型、水解型、氧化型) | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、酶工程、生物催化 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | 医药, 农业, 环境, 材料, 工业生物技术 |
| 57 | 2025-12-07 |
Automated Genetic Manipulation for the Construction of Pichia pastoris Cell Factories
2025-Nov-27, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00033
PMID:41340629
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研究论文 | 本研究开发了一种基于BioFoundry的自动化遗传操作流程,用于快速构建毕赤酵母细胞工厂 | 首次报道了针对毕赤酵母的自动化高通量遗传操作系统,实现了高效的基于热激的转化和基因组编辑,并自动化表征了96个内源启动子 | 研究主要针对毕赤酵母,其他非模式酵母的适用性有待进一步验证 | 构建和优化微生物细胞工厂,特别是用于重组蛋白表达和天然产物生物合成 | 毕赤酵母(Pichia pastoris) | 合成生物学 | NA | 自动化遗传操作、基因组编辑、启动子表征 | NA | NA | 96个内源启动子 | BioFoundry | 毕赤酵母(Pichia pastoris) | 细胞工厂构建,用于生产倍半萜α-檀香烯和α-檀香醇 | 工业生物技术 |
| 58 | 2025-12-07 |
In silico approaches for discovering microbial antiviral defense systems
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf619
PMID:41348595
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综述 | 本文综述了用于发现微生物抗病毒防御系统的计算策略,包括序列同源性、结构引导、基因组上下文和人工智能方法 | 将计算方法分为四大策略,并讨论了新兴工具如保守基因簇发现工具和基因组基础模型,以支持合成模块的生成设计 | 序列同源性方法在检测高度分化或新系统方面有限,结构引导方法计算成本高 | 系统探索微生物免疫系统,指导理性噬菌体疗法、微生物组工程和合成生物学应用 | 原核生物的多样化抗病毒防御系统 | 生物信息学 | NA | 高通量测序 | 人工智能方法 | 基因组数据 | NA | NA | 原核生物 | NA | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 59 | 2025-12-04 |
A deep dive into plant metabolomics: Milestones, technologies, and translational impact
2025-Nov-26, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf408
PMID:40991682
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综述 | 本文综述了植物代谢组学的发展历程、技术进展及其在植物生物学和农业应用中的翻译影响 | 总结了超过500个开源计算工具,并探讨了成像质谱、单细胞代谢组学、AI驱动的代谢物识别等新兴技术 | NA | 评估植物代谢组学在功能基因组学、作物改良和合成生物学中的作用 | 植物代谢组学数据、工具和应用 | NA | NA | 代谢组学、成像质谱、单细胞代谢组学、转录组-代谢组联合分析 | NA | 代谢组学数据集 | NA | NA | NA | NA | 农业、医学、生物技术 |
| 60 | 2025-12-03 |
Architects of plant immunity: Structure-informed strategies for engineering plant nucleotide-binding leucine-rich repeat receptors
2025-Nov-30, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2025.102828
PMID:41325717
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综述 | 本文综述了基于结构信息工程化植物NLR受体以增强植物免疫系统的策略 | 结合分子结构理解和合成生物学工具,开发了针对NLR受体的工程化方法,如整合域工程和LRR表面重塑,以扩展病原体识别能力 | NA | 工程化植物核苷酸结合富含亮氨酸重复序列(NLR)受体,以增强植物对病原体的免疫反应 | 植物NLR受体及其结构 | 合成生物学 | 植物病害 | 结构建模、合成生物学工具 | NA | 结构数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |