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当前共找到 153 篇文献，本页显示第 41 - 60 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2025-12-09 |
Halogenases and dehalogenases: mechanisms, engineering, and applications
2025-Nov-03, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00055f
PMID:41181914
|
综述 | 本文综述了卤化酶和脱卤酶在机制、工程改造及应用方面的最新进展，重点关注其在生物合成和生物修复中的集成应用 | 系统总结了不同类型卤化酶和脱卤酶的最新工程化进展，并探讨了将其整合到可扩展平台中的合成生物学策略 | NA | 探讨卤化酶和脱卤酶在生物催化卤化与脱卤反应中的机制、工程改造潜力及其工业与环境应用 | 卤化有机化合物、卤化酶（包括卤过氧化物酶、黄素依赖型、α-酮戊二酸依赖型、SAM依赖型等）和脱卤酶（还原型、水解型、氧化型） | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、酶工程、生物催化 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | NA | NA | 医药, 农业, 环境, 材料, 工业生物技术 |
| 42 | 2025-12-07 |
Engineering lignin pathway, plant cell wall modification, and genome editing for advanced renewable bioenergy and material applications
2025-Nov-29, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108772
PMID:41325824
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综述 | 本文综述了木质素生物合成、调控与工程化，以及植物细胞壁修饰和基因组编辑在可再生生物能源和可持续生物材料应用中的最新进展与未来方向 | 整合了CRISPR/Cas基因组编辑、合成启动子、代谢重编程等新兴工具，并提出了结合多组学、单细胞技术、机器学习和田间验证的未来研究方向 | 从实验室到田间的转化应用仍然有限，且存在单木质醇运输、代谢通量控制和物种特异性调控差异等未解决的挑战 | 通过工程化木质素和修饰植物细胞壁，为可再生生物能源、可持续生物材料和循环生物经济提供技术支持 | 木质素生物合成途径、植物细胞壁、相关遗传与代谢网络 | 合成生物学与植物生物技术 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、合成启动子、代谢重编程、多组学分析、单细胞技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 木质素生物合成途径工程、代谢网络重编程 | 能源, 材料, 工业生物技术, 医药 |
| 43 | 2025-12-07 |
Automated Genetic Manipulation for the Construction of Pichia pastoris Cell Factories
2025-Nov-27, Chem & bio engineering
DOI:10.1021/cbe.5c00033
PMID:41340629
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研究论文 | 本研究开发了一种基于BioFoundry的自动化遗传操作流程，用于快速构建毕赤酵母细胞工厂 | 首次报道了针对毕赤酵母的自动化高通量遗传操作系统，实现了高效的基于热激的转化和基因组编辑，并自动化表征了96个内源启动子 | 研究主要针对毕赤酵母，其他非模式酵母的适用性有待进一步验证 | 构建和优化微生物细胞工厂，特别是用于重组蛋白表达和天然产物生物合成 | 毕赤酵母（Pichia pastoris） | 合成生物学 | NA | 自动化遗传操作、基因组编辑、启动子表征 | NA | NA | 96个内源启动子 | BioFoundry | 毕赤酵母（Pichia pastoris） | 细胞工厂构建，用于生产倍半萜α-檀香烯和α-檀香醇 | 工业生物技术 |
| 44 | 2025-12-07 |
In silico approaches for discovering microbial antiviral defense systems
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf619
PMID:41348595
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综述 | 本文综述了用于发现微生物抗病毒防御系统的计算策略，包括序列同源性、结构引导、基因组上下文和人工智能方法 | 将计算方法分为四大策略，并讨论了新兴工具如保守基因簇发现工具和基因组基础模型，以支持合成模块的生成设计 | 序列同源性方法在检测高度分化或新系统方面有限，结构引导方法计算成本高 | 系统探索微生物免疫系统，指导理性噬菌体疗法、微生物组工程和合成生物学应用 | 原核生物的多样化抗病毒防御系统 | 生物信息学 | NA | 高通量测序 | 人工智能方法 | 基因组数据 | NA | NA | 原核生物 | NA | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 45 | 2025-12-05 |
Geminivirus vectors: From gene silencing to synthetic biology
2025-Nov-29, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108771
PMID:41325825
|
综述 | 本文综述了双生病毒载体从基因沉默到合成生物学的应用发展 | 强调双生病毒载体在病毒诱导基因沉默和合成生物学中的突出作用，包括作为质粒样DNA支持植物合成生物学设计，以及跨王国应用的潜力 | NA | 探讨双生病毒载体在作物改良、生物制造和合成生物学中的创新应用 | 双生病毒及其衍生的功能复制子 | 合成生物学 | NA | 病毒诱导基因沉默、CRISPR/Cas基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas | 植物 | 基因调控元件，如组织特异性启动子和基因表达增强序列 | 农业, 工业生物技术 |
| 46 | 2025-12-04 |
A deep dive into plant metabolomics: Milestones, technologies, and translational impact
2025-Nov-26, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiaf408
PMID:40991682
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综述 | 本文综述了植物代谢组学的发展历程、技术进展及其在植物生物学和农业应用中的翻译影响 | 总结了超过500个开源计算工具，并探讨了成像质谱、单细胞代谢组学、AI驱动的代谢物识别等新兴技术 | NA | 评估植物代谢组学在功能基因组学、作物改良和合成生物学中的作用 | 植物代谢组学数据、工具和应用 | NA | NA | 代谢组学、成像质谱、单细胞代谢组学、转录组-代谢组联合分析 | NA | 代谢组学数据集 | NA | NA | NA | NA | 农业、医学、生物技术 |
| 47 | 2025-12-03 |
Architects of plant immunity: Structure-informed strategies for engineering plant nucleotide-binding leucine-rich repeat receptors
2025-Nov-30, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2025.102828
PMID:41325717
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综述 | 本文综述了基于结构信息工程化植物NLR受体以增强植物免疫系统的策略 | 结合分子结构理解和合成生物学工具，开发了针对NLR受体的工程化方法，如整合域工程和LRR表面重塑，以扩展病原体识别能力 | NA | 工程化植物核苷酸结合富含亮氨酸重复序列（NLR）受体，以增强植物对病原体的免疫反应 | 植物NLR受体及其结构 | 合成生物学 | 植物病害 | 结构建模、合成生物学工具 | NA | 结构数据 | NA | NA | 植物 | NA | 农业 |
| 48 | 2025-12-02 |
Optogenetic tools for optimizing key signalling nodes in synthetic biology
2025-Nov-27, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108770
PMID:41317977
|
综述 | 本文综述了光遗传学工具在合成生物学中调控关键信号节点的应用，包括其在微生物代谢、植物科学和疾病治疗中的最新进展 | 将光遗传学工具按不同应用分为五类，系统阐述了其在时空精确调控酶活性或基因表达方面的创新潜力，超越了传统的化学诱导或基因过表达/敲除策略 | NA | 为合成生物学领域的基础研究和生物产业提供全面的光遗传学策略概述 | 光遗传学工具及其在微生物、植物和动物系统中的调控应用 | 合成生物学 | NA | 光遗传学 | NA | NA | NA | NA | 微生物, 植物, 动物 | 光诱导基因表达调控、光触发液-液相分离模块、光诱导亚细胞定位光感受器、光调控酶、光门控离子通道和泵 | 工业生物技术, 农业, 医学 |
| 49 | 2025-12-02 |
Artificial cells with liquid-liquid phase separation-regulated cell-free protein synthesis
2025-Nov-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2511283122
PMID:41269793
|
研究论文 | 本文通过液-液相分离调控无细胞蛋白质合成，构建了具有可控蛋白质表达的人工细胞 | 利用含多价关联基团的工程聚合物，通过液-液相分离诱导蛋白质聚集，实现无细胞蛋白质合成活性的可逆调控和精确时间控制 | 未明确提及具体限制，但暗示在工程化人工细胞调控蛋白质表达方面仍存在显著局限 | 开发能够调控蛋白质表达的人工细胞，并探索其在生物医学应用中的潜力 | 人工细胞、无细胞蛋白质合成系统、工程聚合物、微流控平台制备的巨型单层囊泡 | 合成生物学 | 肝损伤 | 液-液相分离、微流控技术、无细胞蛋白质合成 | NA | 实验数据 | 使用胆管结扎小鼠模型进行体内研究 | NA | NA | 基于液-液相分离的蛋白质聚集调控机制，用于可控反应过程 | 医学 |
| 50 | 2025-12-02 |
The International Risk Governance Council: Reflections on a 20-Year Experiment in Support of Improved Risk Governance
2025-Nov, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis
IF:3.0Q1
DOI:10.1111/risa.70117
PMID:41047369
|
评论 | 本文回顾了国际风险治理理事会（IRGC）20年的历史、活动及其在多个新兴风险领域的工作成果 | 通过六个案例研究（如太阳辐射管理、合成生物学等）系统总结了IRGC在风险治理方面的贡献，并强调了中立召集机构的重要性 | NA | 评估IRGC作为风险治理支持机构的历史作用与影响 | 国际风险治理理事会（IRGC）及其在多个风险领域的治理活动 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 51 | 2025-12-01 |
Microbial computing: Review and perspectives
2025-Nov-27, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108766
PMID:41317976
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综述 | 回顾微生物计算的发展历程，分析当前面临的挑战，并提出基于储层计算的新研究视角 | 提出采用自上而下的储层计算框架，利用生物系统固有的动态计算能力解决复杂任务 | 当前自下而上策略仍不足以模拟细胞信号处理系统的计算复杂性 | 探索微生物计算在生物生产、生物修复和生物医学等领域的应用潜力 | 微生物计算机和生物计算系统 | 合成生物学 | NA | NA | 数字逻辑、模拟架构、神经形态架构、储层计算 | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 微生物 | 逻辑门、切换开关、振荡器、生物传感器 | 医学, 农业, 环境, 工业生物技术 |
| 52 | 2025-12-01 |
Autonomous Bioluminescence Systems: From Molecular Mechanisms to Emerging Applications
2025-Nov-24, JACS Au
IF:8.5Q1
DOI:10.1021/jacsau.5c01072
PMID:41311942
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综述 | 本文综述了自主生物发光系统的分子机制、蛋白质工程策略及其在实时无创成像中的新兴应用 | 系统比较了细菌和真菌自主生物发光系统的优劣，并提出通过AI引导诱变和代谢途径优化等策略解决现有挑战 | 细菌生物发光系统存在量子产率低的问题，真菌生物发光系统受底物可用性限制 | 评估自主生物发光系统的发展现状并展望下一代系统的设计目标 | 细菌和真菌自主生物发光系统 | 合成生物学 | NA | AI引导诱变, 蛋白质设计, 代谢途径优化 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 真菌 | 自主生物发光系统（整合荧光素酶与完整底物生物合成途径） | 生物医学研究, 环境监测, 合成生物学 |
| 53 | 2025-12-01 |
MeJA Elicitation on Flavonoid Biosynthesis and Gene Expression in the Hairy Roots of Glycyrrhiza glabra L
2025-Nov-18, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16111387
PMID:41300839
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研究论文 | 本研究通过建立甘草毛状根培养系统，探究茉莉酸甲酯对黄酮类化合物生物合成及基因表达的影响 | 首次在甘草毛状根系统中结合代谢工程与基因工程技术，通过MeJA诱导和UGT基因过表达显著提高黄酮类化合物含量 | 研究仅针对特定黄酮类化合物，其他活性成分的变化未全面评估；功能基因研究仍需进一步验证 | 提高甘草中黄酮类活性成分的生物合成效率 | 甘草毛状根及其黄酮类化合物 | 合成生物学 | NA | 转录组分析、qRT-PCR、悬浮培养 | NA | 基因表达数据、代谢物含量数据 | 28天悬浮培养的毛状根样本 | 代谢工程、基因工程 | 甘草毛状根 | 黄酮类生物合成途径 | 医药 |
| 54 | 2025-11-30 |
From Biocontrol to Synthesis: Innovative Progress of Paenibacillus in Mechanism Analysis, Gene Editing and Platform Construction
2025-Nov-10, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262210886
PMID:41303372
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综述 | 本文综述了类芽孢杆菌从生物防治到合成生物学的创新进展，包括机制解析、基因编辑和平台构建 | 系统总结了类芽孢杆菌多种生物防治机制的协同作用及其对环境因素的响应，并探讨了其在合成生物学平台构建中的创新应用 | NA | 探讨类芽孢杆菌在生物防治和合成生物学领域的应用潜力与发展前景 | 类芽孢杆菌及其生物合成机制 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、合成生物学策略 | NA | NA | NA | NA | 类芽孢杆菌 | NA | 农业,工业生物技术 |
| 55 | 2025-12-01 |
Phage Therapy for Acinetobacter baumannii Infections: A Review on Advances in Classification, Applications, and Translational Roadblocks
2025-Nov-08, Antibiotics (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antibiotics14111134
PMID:41301629
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综述 | 本文系统综述了噬菌体疗法在治疗鲍曼不动杆菌感染领域的最新进展，包括分类学更新、治疗策略优化和临床转化挑战 | 基于全基因组系统发育的现代分类学将大多数噬菌体重新分类为Caudoviricetes纲，揭示了与宿主趋向性和生物学特性相关的独特进化支；通过尾丝重组和CRISPR/Cas介导的溶原性消除等基因工程方法扩展宿主范围 | 工程噬菌体的遗传稳定性需要进一步验证；宿主谱有限、缺乏临床转化标准和滞后的监管框架仍是当前挑战 | 总结噬菌体疗法在治疗碳青霉烯类耐药鲍曼不动杆菌感染领域的研究进展和转化障碍 | 鲍曼不动杆菌噬菌体及其治疗应用 | NA | 细菌感染 | 全基因组系统发育分析、基因工程、CRISPR/Cas、宏基因组挖掘 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 鲍曼不动杆菌 | NA | 医学 |
| 56 | 2025-12-01 |
Key Challenges in Plant Microbiome Research in the Next Decade
2025-Nov-07, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13112546
PMID:41304231
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综述 | 本文系统分析植物微生物组研究面临的关键挑战并提出未来十年的发展路线图 | 提出整合实验与计算策略的路线图，强调合成生物学、多组学工具和人工智能在工程化植物-微生物互作中的应用前景 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于现有研究现状的分析与展望 | 推动植物微生物组研究向田间规模应用转化，建立具有气候适应性和资源高效性的农业系统 | 植物微生物组 | NA | NA | 多组学数据整合、测序技术、人工智能 | NA | 多组学数据 | NA | 合成生物学 | 植物 | 植物-微生物互作工程化 | 农业 |
| 57 | 2025-12-01 |
Probiotic Potential of Traditional and Emerging Microbial Strains in Functional Foods: From Characterization to Applications and Health Benefits
2025-Nov-02, Microorganisms
IF:4.1Q2
DOI:10.3390/microorganisms13112521
PMID:41304207
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综述 | 本文综述了传统和新兴益生菌菌株在功能性食品中的潜力，涵盖表征方法、作用机制、技术限制和健康益处 | 重点关注具有新功能特性的新兴微生物候选菌株，并强调通过组学技术和合成生物学解决现有挑战 | 缺乏长期临床验证、菌株特异性研究不足、个性化应用存在空白以及消费者沟通不充分 | 评估传统和新兴益生菌菌株在功能性食品中的应用潜力和健康效益 | 传统和新兴益生菌微生物菌株 | NA | NA | 组学技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 医药 |
| 58 | 2025-11-30 |
Self-assembled cell-scale containers made from DNA origami membranes
2025-Nov-28, Nature materials
IF:37.2Q1
DOI:10.1038/s41563-025-02418-0
PMID:41315785
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研究论文 | 本研究报道了一种受脂质结构启发的DNA折纸单层膜自组装方法，可形成细胞尺度的囊泡和空心管状结构 | 首次实现了径向对称DNA折纸亚基的自组装，突破了传统DNA纳米技术局限于刚性笼状结构的限制 | 未提供具体应用验证数据，结构稳定性与功能整合仍需进一步研究 | 开发新型生物相容性隔室化结构，拓展自下而上合成生物学和细胞尺度软机器人技术 | DNA折纸单层膜自组装结构 | 合成生物学 | NA | DNA折纸技术，自组装技术 | NA | 结构表征数据 | NA | DNA折纸 | NA | 径向对称DNA折纸亚基自组装形成膜结构 | 生物技术，软机器人 |
| 59 | 2025-11-30 |
Efficient site-specific integration of kilobase-length DNA fragments in plant cells via Kp03 recombinase
2025-Nov-25, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116508
PMID:41187057
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研究论文 | 本研究评估了Kp03重组酶在植物细胞中实现大片段DNA定点整合的效率 | 首次证明Kp03重组酶能在植物细胞中高效整合长达27.3 kb的DNA片段，并确定仅需15-bp attB序列即可实现整合 | 研究主要基于瞬时原生质体实验和愈伤组织，尚未在完整植株中验证整合效率 | 开发植物基因组工程中大片段DNA定点整合的新方法 | 水稻和拟南芥的细胞及愈伤组织 | 合成生物学 | NA | 重组酶介导的整合、基因组编辑 | NA | 分子生物学实验数据 | 水稻和拟南芥原生质体及愈伤组织（具体数量未明确说明） | Kp03重组酶, NM-PE基因组编辑系统 | 水稻, 拟南芥 | 基于attB-attP重组系统的DNA整合平台 | 农业, 工业生物技术 |
| 60 | 2025-11-30 |
Analog epigenetic memory revealed by targeted chromatin editing
2025-Nov-12, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100985
PMID:40930103
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研究论文 | 本研究通过靶向染色质编辑揭示了表观遗传记忆的模拟特性，证明染色质修饰可维持不同水平的基因表达 | 首次发现DNA甲基化梯度可对应维持不同水平的基因表达，揭示了模拟表观遗传记忆的存在机制 | 未明确说明实验使用的具体细胞类型和样本规模 | 探索染色质修饰如何维持不同基因表达状态及其记忆机制 | 染色质修饰状态与基因表达动态关系 | 合成生物学 | NA | 靶向染色质编辑、DNA甲基化分析 | 染色质修饰模型 | 基因表达动态数据 | NA | 基因组报告系统、表观遗传效应器 | NA | 表观遗传记忆系统 | 合成生物学 |