本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['synthetic biology']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价9.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-11-19 |
In silico evolutionary origin, structural properties, molecular docking, following expression analysis of the nitrate transporters in maize to explore their roles in abiotic stress tolerance
2025-Nov, Physiology and molecular biology of plants : an international journal of functional plant biology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s12298-025-01669-0
PMID:41245216
|
研究论文 | 通过生物信息学分析和实验验证研究玉米硝酸盐转运蛋白的进化起源、结构特性及其在非生物胁迫耐受中的作用 | 首次系统分析玉米硝酸盐转运蛋白的进化起源、结构特性,并通过分子对接和表达分析揭示其在热胁迫、盐胁迫和干旱胁迫中的功能 | 研究主要基于生物信息学预测,实验验证相对有限,需要更多功能验证实验 | 探索玉米硝酸盐转运蛋白在养分平衡、氮积累和非生物胁迫耐受中的关键作用 | 玉米硝酸盐转运蛋白家族成员 | 生物信息学 | NA | 系统发育分析、分子对接、qRT-PCR、RNA-Seq、亚细胞定位 | NA | 基因组数据、表达数据、蛋白质结构数据 | 83个转运蛋白 | GFP标记、合成生物学方法 | 玉米 | 基于NRT的遗传回路,用于改善氮吸收、转运、动员和积累 | 农业 |
| 102 | 2025-11-18 |
Engineered bacteria for cancer therapy: Advancements, challenges, and future directions
2025-Nov-17, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003807
PMID:41243447
|
综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展、挑战和未来发展方向 | 利用合成生物学技术编程细菌使其能够选择性定植肿瘤微环境并局部递送治疗剂 | 需要克服肿瘤内异质性等挑战才能充分发挥其治疗潜力 | 探索工程化细菌在癌症治疗中的应用前景 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 沙门氏菌, 乳酸菌 | 生物传感器, 治疗剂递送系统, 免疫调节回路 | 医学 |
| 103 | 2025-11-18 |
Design of a Multienzyme Derived from Mouse Fatty Acid Synthase for the Compartmentalized Production of 2-Pyrone Polyketides
2025-Nov-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202511726
PMID:41243670
|
研究论文 | 本研究设计了一种基于小鼠脂肪酸合酶的多酶系统,用于区室化生产2-吡喃酮类聚酮化合物 | 通过酮合酶结构域的两个氨基酸替换增强非天然底物合成能力,并利用SpyTag/SpyCatcher系统整合4-香豆酸连接酶加载模块 | NA | 开发区室化生物合成平台用于高效生产2-吡喃酮类聚酮化合物 | 小鼠脂肪酸合酶衍生的多酶系统及其催化的2-吡喃酮化合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、化学酶法合成 | NA | NA | NA | SpyTag/SpyCatcher系统 | NA | 多酶区室化系统,包含改造的脂肪酸合酶和4-香豆酸连接酶加载模块 | 医药 |
| 104 | 2025-11-18 |
Harnessing CRISPR-Cas9 for Lactobacillus improvement in silage production: current knowledge and future perspectives
2025-Nov-15, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01282-x
PMID:41239469
|
综述 | 系统回顾CRISPR-Cas9基因编辑技术在乳酸杆菌改良及其在青贮饲料生产中应用的现状与前景 | 首次系统探讨如何利用CRISPR-Cas9技术定向优化乳酸杆菌特性以开发新一代青贮微生物接种剂 | 主要基于现有研究进展进行综述,缺乏实际工程化应用的详细验证数据 | 探讨合成生物学技术在青贮饲料乳酸杆菌改良中的应用潜力 | 乳酸杆菌及其在青贮发酵中的功能特性 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 文献资料 | NA | CRISPR-Cas9 | 乳酸杆菌 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 105 | 2025-11-18 |
Engineering strategies for microbial synthesis, customized modification, and application of hemoglobin
2025-Nov-14, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108752
PMID:41242508
|
综述 | 系统探讨血红蛋白的微生物合成策略、功能定制化修饰方法及其多领域应用前景 | 重点介绍利用人工智能算法定制血红蛋白功能修饰,以及整合帕累托最优和迭代生物工程框架等先进技术 | NA | 解决血红蛋白微生物合成的关键挑战并拓展其应用领域 | 血红蛋白及其突变体和衍生物 | 合成生物学 | NA | 人工智能算法、深度学习、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 医学, 生物技术, 农业, 食品, 工业生物技术 |
| 106 | 2025-11-18 |
Recent advances and perspectives in biosynthesis of paclitaxel: key enzymes and intermediates
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148049
PMID:41043740
|
综述 | 本文综述了紫杉醇生物合成的最新进展,重点关注关键酶和中间体的研究 | 强调合成生物学策略在紫杉醇关键中间体生物合成中的新兴趋势 | NA | 探索紫杉醇的可持续生产策略以满足市场需求 | 紫杉醇生物合成途径中的关键酶和中间体 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程、微生物发酵技术、生物信息学 | NA | NA | NA | NA | 异源表达系统 | 紫杉醇生物合成途径 | 医药 |
| 107 | 2025-11-16 |
M3Site: multiclass multimodal learning for protein active site identification and classification
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf590
PMID:41222559
|
研究论文 | 提出一种多模态多类别学习框架M3Site,用于蛋白质活性位点的识别与分类 | 整合蛋白质序列嵌入、结构图表示和功能文本注释进行残基级多类别活性位点预测,采用功能感知交叉注意力模块和自适应加权融合机制 | NA | 开发更准确的蛋白质活性位点识别与分类方法 | 蛋白质活性位点 | 生物信息学 | NA | 蛋白质语言模型、等变图神经网络、生物医学语言模型 | 多模态深度学习框架 | 蛋白质序列、结构图、功能文本注释 | 25,883个蛋白质(来自UniProt和AlphaFold2) | NA | NA | NA | 药物设计、合成生物学 |
| 108 | 2025-11-16 |
Precision therapeutics for inflammatory bowel disease using engineered probiotics: Strategies and optimization
2025-Nov, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2025.10.012
PMID:41083038
|
综述 | 本文总结了工程化益生菌在炎症性肠病治疗中的研究进展,包括底盘菌株基因编辑策略、微生物多维作用、生物工程改造、递送系统优化及人工智能驱动的菌株筛选设计 | 通过基因改造和合成生物学使益生菌具备微环境响应能力和精准治疗靶向性,显著提升IBD治疗效果 | NA | 探索工程化益生菌作为IBD精准治疗策略的开发与应用 | 工程化益生菌及其在炎症性肠病治疗中的应用 | 合成生物学 | 炎症性肠病 | 基因编辑、合成生物学、人工智能驱动筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 合成生物学工具 | 益生菌底盘菌株 | 微环境响应系统、精准靶向治疗电路 | 医学 |
| 109 | 2025-11-15 |
Reprogramming the SARS-CoV-1 Neutralizing Antibody S230 to SARS-CoV-2 via Directed Evolution and Molecular Docking-Based Binding Mode Analysis
2025-Nov-14, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00425
PMID:41236374
|
研究论文 | 通过定向进化和分子对接分析,将SARS-CoV-1中和抗体S230重新编程为可识别SARS-CoV-2的中和抗体 | 结合定向进化与分子对接分析,仅通过两个协同突变(R56W和N57Y)成功重构抗体抗原识别特异性 | NA | 开发基于合成生物学原理的抗体重编程平台,快速适应新兴病原体 | SARS-CoV-1中和抗体S230及其对SARS-CoV-2的重新编程变体 | 合成生物学 | COVID-19 | 定向进化、分子对接、细菌展示 | NA | 蛋白质序列、结构数据 | NA | 细菌展示 | 大肠杆菌 | 抗体重编程平台 | 医学 |
| 110 | 2025-11-15 |
From prebiotics to engineered microbes: microbe-inspired therapies for atopic dermatitis
2025-Nov-13, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljaf451
PMID:41231731
|
综述 | 本文综述了针对特应性皮炎皮肤微生物组的各种治疗方法,并展望了利用合成生物学开发工程化活菌治疗产品的未来方向 | 提出了利用合成生物学工程化皮肤微生物作为下一代益生菌的治疗策略,能够感知皮肤信号并按需产生治疗物质 | NA | 探索通过调节皮肤微生物组来治疗特应性皮炎的新方法 | 特应性皮炎患者的皮肤微生物组,特别是金黄色葡萄球菌 | 合成生物学 | 特应性皮炎 | 合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 皮肤微生物 | 生物传感器,能够感知皮肤免疫信号和环境因素 | 医学 |
| 111 | 2025-11-15 |
Bacteria-mediated cancer therapy (BMCT): Therapeutic applications, clinical insights, and the microbiome as an emerging hallmark of cancer
2025-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118559
PMID:40967079
|
综述 | 探讨微生物群在癌症治疗中的关键作用及工程菌在癌症治疗中的多维度应用 | 提出微生物组作为癌症新兴标志物,系统阐述工程菌与免疫检查点抑制剂的协同机制 | 存在安全性、递送特异性和监管问题等挑战 | 阐明细菌介导癌症疗法(BMCT)的作用机制与临床转化前景 | 共生菌与工程菌(梭菌属、双歧杆菌属、李斯特菌属、沙门氏菌属、大肠杆菌属) | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、精准微生物组工程、粪便微生物群移植 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 112 | 2025-11-15 |
Metabolic engineering of microorganisms for tailor-made biopolymer production: A review
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147922
PMID:41038478
|
综述 | 本文综述了通过微生物代谢工程生产定制生物聚合物的最新进展 | 系统比较天然与工程化微生物平台的优缺点,强调代谢工程在开发下一代生物聚合物中的关键作用 | 作为综述文章,未包含原始实验数据 | 提高生物聚合物的产量、质量和功能特性 | 微生物生产的生物聚合物(细菌纤维素、透明质酸、聚羟基脂肪酸酯、聚-γ-谷氨酸等) | 合成生物学 | NA | 代谢工程、系统生物学工具(蛋白质组学、基因组学、合成生物学) | NA | 文献数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | 代谢通路工程 | 食品,医疗,工业生物技术 |
| 113 | 2025-11-14 |
Systematic and synthetic biology insights into copper homeostasis in Escherichia coli
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113715
PMID:41210969
|
研究论文 | 通过系统与合成生物学方法研究大肠杆菌铜稳态调控机制 | 揭示了Cus系统特异性响应Cu⁺而非Cu²⁺,发现CusR存在信号串扰导致基线表达,并阐明CusS根据铜存在状态兼具激酶和磷酸酶功能 | NA | 阐明大肠杆菌铜稳态调控机制 | 大肠杆菌铜稳态调控系统(cueR和cus) | 合成生物学 | NA | 系统生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌 | 铜稳态调控网络 | 工业生物技术 |
| 114 | 2025-11-14 |
Rational Construction of a Robust Bacillus amyloliquefaciens Cell Factory for Acid-Stable α Amylase Production
2025-Nov-12, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c04227
PMID:41165493
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法构建了能够高效生产耐酸α-淀粉酶的解淀粉芽孢杆菌细胞工厂 | 建立了高效的CRISPR-nCas9编辑流程,理性删除了导致细胞自溶的前噬菌体基因簇和阻碍外源蛋白表达的次级代谢生物合成基因簇 | 研究主要针对解淀粉芽孢杆菌,结果在其他底盘细胞中的适用性需要进一步验证 | 开发高效的工业蛋白生产底盘细胞 | 解淀粉芽孢杆菌细胞工厂 | 合成生物学 | NA | CRISPR-nCas9基因编辑,分批补料发酵 | NA | NA | 5升发酵规模 | CRISPR-Cas9 | 解淀粉芽孢杆菌 | 前噬菌体基因簇删除,次级代谢生物合成基因簇优化 | 工业生物技术 |
| 115 | 2025-11-14 |
From Plants to Microbes: Harnessing Enzyme Promiscuity for Natural Product Synthesis
2025-Nov-12, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c09273
PMID:41171120
|
综述 | 系统探讨酶混杂性在微生物天然产物合成中的表现及缓解策略 | 首次系统剖析酶混杂性在微生物天然产物生物合成中的双重作用并评估当代缓解策略 | 未涉及具体实验验证,主要基于文献综述 | 推进对酶混杂性机制的理解并建立高效生物合成平台基础框架 | 植物和微生物系统中的酶混杂性现象 | 合成生物学 | NA | 生物催化、生物合成、蛋白质工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | 天然产物生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 116 | 2025-11-14 |
The marine diatom Phaeodactylum tricornutum as a versatile bioproduction chassis: Current progress, challenges, and perspectives
2025-Nov-10, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101519
PMID:40994005
|
综述 | 本文综述了海洋硅藻三角褐指藻作为多功能光合底盘在可持续生物生产中的应用进展、挑战与前景 | 系统总结了三角褐指藻从模式生物向可扩展生物制造平台的转型路径,提出了整合基因工具开发、底盘优化和规模化策略的新范式 | 当前存在产物产量欠佳、生物量限制和生产成本过高等工业转化障碍 | 探讨三角褐指藻作为可持续生物生产平台的开发策略与应用潜力 | 海洋硅藻三角褐指藻及其遗传改造系统 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas基因组编辑、转基因元件优化、高效转化系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 三角褐指藻 | 叶绿体基因表达、DNA位点特异性整合、营养方式改造 | 能源, 材料, 工业生物技术 |
| 117 | 2025-11-14 |
Engineering artificial biosynthetic pathways for efficient microbial production of psilocybin and psilocin
2025-Nov-05, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.11.002
PMID:41202968
|
研究论文 | 本研究通过设计和优化人工生物合成途径,在大肠杆菌中实现了裸盖菇素和脱磷酸裸盖菇素的高效微生物生产 | 开发了绕过天然途径中CYP450羟化酶(PsiH)瓶颈的人工生物合成途径,创下了裸盖菇素生产的最高记录 | NA | 开发高效的微生物生产方法以替代从天然蘑菇中提取裸盖菇素 | 裸盖菇素和脱磷酸裸盖菇素 | 合成生物学 | 抑郁症 | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 人工生物合成途径,代谢途径工程 | 医药 |
| 118 | 2025-11-14 |
Biotransformation of Pesticides across Biological Systems: Molecular Mechanisms, Omics Insights, and Biotechnological Advances for Environmental Sustainability
2025-Nov-04, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c06484
PMID:41210834
|
综述 | 全面探讨农药在不同生物系统中的生物转化机制、关键酶类、环境影响因素及生物技术应用 | 整合组学技术和合成生物学最新进展,系统分析农药生物转化产物的环境归趋 | 存在未解决的科学问题和技术挑战,部分转化产物的环境行为尚不明确 | 阐明农药生物转化机制以减轻化学污染,促进环境可持续发展 | 有机磷、有机氯和三嗪类农药在微生物、植物和动物系统中的生物转化过程 | 环境生物技术 | NA | 组学技术(omics)、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 微生物、植物、动物 | 增强降解能力的工程化设计 | 环境、农业 |
| 119 | 2025-11-14 |
Towards establishing functional nitrogenase activities within plants
2025-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.04.020
PMID:40441921
|
研究论文 | 本文探讨在非豆科植物中建立功能性固氮酶活性的挑战与前景 | 利用合成生物学和人工智能设计,在大肠杆菌和酵母线粒体中实现部分固氮酶重构,并通过低氧环境规避氧敏感性限制 | 尚未完全解决能量需求高和氮水平反馈调节的问题 | 开发具有自主固氮能力的非豆科作物以减少化肥依赖 | 固氮酶在非豆科植物中的功能表达 | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术、人工智能辅助设计 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌, 酿酒酵母 | 固氮酶代谢通路重构 | 农业, 环境 |
| 120 | 2025-11-14 |
Leveraging gene editing to combat methane emissions in ruminant agriculture
2025-Nov, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.05.020
PMID:40518326
|
综述 | 探讨利用CRISPR基因编辑技术降低反刍动物甲烷排放的研究进展与挑战 | 提出通过同时编辑饲料作物和瘤胃产甲烷古菌基因组来减少甲烷排放的创新策略 | 存在递送方法、基因靶向特异性、生态影响和监管接受度等方面的挑战 | 开发可持续农业中减少反刍动物甲烷排放的有效解决方案 | 反刍动物、饲料作物、瘤胃产甲烷古菌 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 饲料作物, 产甲烷古菌 | 产甲烷途径干扰、脂质和次级代谢物合成途径增强 | 农业, 环境 |