合成生物学相关文章
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当前共找到 166 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-11-14 |
Development of an intron-optimized dual base editor enables enhanced echinocandin B tolerance and regulatory circuit optimization in Aspergillus nidulans
2025-Nov, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147955
PMID:41016690
|
研究论文 | 开发了一种内含子优化的双碱基编辑器，用于增强构巢曲霉中棘球白素B的耐受性并优化调控回路 | 采用真菌内含子策略阻断大肠杆菌中的翻译，开发了PAM-less SpRY-CABE系统，实现了高效双碱基编辑 | NA | 解决棘球白素B生产中的调控机制理解不足和产物抑制问题 | 构巢曲霉及其棘球白素B生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 双碱基编辑(CABE)、启动子诱变、发酵优化 | NA | 基因序列、表达数据、代谢产物数据 | NA | CRISPR-Cas9, 双碱基编辑器 | 构巢曲霉, 大肠杆菌 | 调控回路优化、启动子工程、β-1,3-葡聚糖合成酶进化 | 工业生物技术, 医药 |
| 122 | 2025-11-13 |
Engineering the Link: From Genome Interaction Maps to Functional Insight
2025-Nov-12, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202500525
PMID:41221676
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综述 | 探讨利用基因组工程技术操控3D染色质结构以揭示基因组结构与功能间因果联系的研究进展 | 提出通过可编程DNA结合平台（锌指蛋白、TALEs、CRISPR-Cas9）定向操纵染色质三维结构来建立基因组结构与功能的因果关系 | 当前方法在效率、可扩展性和特异性方面存在局限 | 阐明3D染色质结构与细胞功能之间的因果关系 | 染色质三维结构（特别是DNA环）与基因表达调控 | 合成生物学 | NA | 染色体构象捕获测序、基因组工程 | NA | 基因组相互作用数据 | NA | CRISPR-Cas9, 锌指蛋白, TALEN | 哺乳动物细胞 | 通过工程化染色质环重编程增强子-启动子通讯 | 医学, 工业生物技术 |
| 123 | 2025-11-13 |
TEDD: a comprehensive database for translation efficiency dynamics
2025-Nov-11, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1125
PMID:41217970
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研究论文 | 开发了一个名为TEDD的综合数据库，用于探索人类翻译效率动态及其与UTR特征的调控关系 | 首次系统整合了翻译效率(TE)、起始效率(TR)和延伸速度(EVI)在基因和转录本水平的量化数据，并关联UTR特征分析 | 目前仅涵盖人类数据，尚未包含其他物种的信息 | 构建一个全面的翻译效率动态数据库，支持翻译调控机制研究 | 人类基因和转录本的翻译效率动态 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, Ribo-seq, RNC-seq | NA | 基因组学数据，序列数据 | 1518个样本，来自143个人类项目(279个数据集)，涵盖24种组织/细胞类型、74种细胞系和52种条件 | NA | 人类 | NA | 医学，合成生物学 |
| 124 | 2025-11-13 |
A parts list of promoters and gRNA scaffolds for mammalian genome engineering and molecular recording
2025-Nov-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-025-02896-2
PMID:41219485
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研究论文 | 本研究开发了用于哺乳动物基因组工程和分子记录的标准化启动子和gRNA支架元件库 | 创建了首个针对哺乳动物系统的标准化遗传元件库，包含数千个经过验证的高效编辑元件 | 研究主要在人源和小鼠细胞系中进行验证，尚未在更多生物模型或体内环境中测试 | 开发用于哺乳动物系统基因组工程和分子记录的标准化遗传元件工具 | 聚合酶III启动子和引导RNA(gRNA)支架的变体库 | 合成生物学 | NA | 多重prime editing、饱和突变筛选 | NA | 基因组编辑效率数据 | 人类和小鼠细胞系 | CRISPR-Cas9, prime editing | 人类细胞, 小鼠细胞 | 分子记录阵列、十键阵列、复杂遗传电路 | 医学, 工业生物技术 |
| 125 | 2025-11-12 |
A Comprehensive Review on Engineering Lactic Acid Bacteria: Emerging Genetic Tools and Synthetic Biology Strategies
2025-Nov-10, Biotechnology and applied biochemistry
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/bab.70079
PMID:41215480
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综述 | 本文系统综述了乳酸菌基因工程和合成生物学策略的最新进展及其在食品、医药和环境领域的应用 | 整合了CRISPR-Cas系统等新兴基因编辑工具和合成生物学方法在乳酸菌工程化中的应用前景 | 存在质粒不稳定性、代谢负担和监管障碍等技术挑战 | 探讨通过基因工程和合成生物学策略增强乳酸菌功能性的方法 | 乳酸菌（如乳酸杆菌和乳酸球菌）的基因组结构和代谢特性 | 合成生物学 | NA | 电穿孔、接合转移、CRISPR-Cas系统、基因电路、核糖开关、生物传感器 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | 乳酸菌, Lactobacillus, Lactococcus | 基因电路、生物传感器、代谢途径优化 | 食品, 医药, 环境, 工业生物技术, 农业 |
| 126 | 2025-11-09 |
Enhancing the β-Oxidation-Like Pathway for the Optimal Production of the Immunosuppressant Mycophenolic Acid
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508826
PMID:40788096
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研究论文 | 本研究通过重构真菌β-氧化样酶级联反应，优化了免疫抑制剂霉酚酸的生产途径 | 首次在真菌天然产物生物合成中实现了完整β-氧化样酶级联反应的功能重构 | 研究仅针对特定真菌菌株，未验证在其他宿主中的普适性 | 优化免疫抑制剂霉酚酸的生物合成途径 | 短密青霉菌NRRL864及其β-氧化酶系统 | 合成生物学 | 免疫抑制治疗 | 体外酶活性测定、途径工程 | NA | 酶活性数据、代谢产物产量数据 | NA | 途径优化、基因过表达 | 短密青霉菌 | β-氧化样代谢途径，包含氧化、脱氢、水合、还原、异构化和逆克莱森缩合反应 | 医药 |
| 127 | 2025-11-09 |
Insights into microalgal biotechnology: Current applications, key challenges, and future prospects
2025-Nov, Journal of environmental management
IF:8.0Q1
DOI:10.1016/j.jenvman.2025.127263
PMID:40961787
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综述 | 本文综述微藻生物技术的当前应用、关键挑战与未来前景 | 系统整合了微藻在碳捕集、能源生产与环境修复中的多功能应用，并指出合成生物学与光生物反应器设计的突破性进展 | 大规模部署仍受制于技术经济壁垒，特别是生物质收获与脱水的高成本 | 探讨微藻生物技术的综合潜力与实现路径 | 微藻及其在生物制造中的应用系统 | 生物技术 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、生物絮凝、磁分离、太阳能辅助干燥 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微藻 | 增强脂质、碳水化合物和氢气产量的代谢工程 | 能源, 环境, 工业生物技术 |
| 128 | 2025-11-09 |
Microwave-Activated Bacterial Biorobot for Multimodal Cancer Therapy
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504603
PMID:40789052
|
研究论文 | 开发了一种微波激活的细菌生物机器人，用于多模式癌症治疗 | 利用微波精确控制工程细菌在肿瘤部位的激活，结合葡萄糖氧化酶表达和CuO纳米颗粒催化，实现多模式肿瘤细胞死亡 | NA | 开发精确可控的癌症治疗新方法 | 工程大肠杆菌生物机器人和肿瘤细胞 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学工程、微波激活技术 | NA | 体外实验数据、体内实验数据、转录组分析数据 | NA | 合成生物学工具 | 大肠杆菌MG1655 | 微波激活的基因表达系统，用于表达葡萄糖氧化酶 | 医学 |
| 129 | 2025-11-08 |
Electron-Mediator-Free Microfluidic Photocatalytic Coenzyme Regeneration with 100% Conversion Efficiency within 126 S
2025-Nov-07, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513720
PMID:41201076
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研究论文 | 设计了一种无需电子介体的微流控光催化平台，用于辅酶NAD(P)H再生，在126秒内实现100%转化效率 | 通过集成超薄BiOBr纳米片实现直接电子-质子耦合，无需电子介体即可高效再生辅酶 | NA | 开发高效光催化辅酶再生系统 | 辅酶NAD(P)H的再生过程 | 生物催化 | NA | 微流控技术、光催化 | NA | 催化效率数据 | NA | NA | NA | NA | 生物催化、合成生物学、可再生能源 |
| 130 | 2025-11-08 |
A comprehensive review of genomic-scale genetic engineering as a strategy to improve bacterial productivity
2025-Nov, Microbiology (Reading, England)
DOI:10.1099/mic.0.001628
PMID:41182907
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综述 | 本文系统回顾了基因组规模遗传工程作为提高细菌生产力的策略发展历程 | 首次整合多种基因组工程方法，提供统一视角来总结细菌基因组工程工具的历史里程碑和实际应用 | CRISPR/Cas等工具仍需持续改进才能完全成熟 | 总结基因组工程工具在提高细菌生产力方面的发展和应用 | 细菌基因组工程工具 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas, 随机诱变, 多重化策略 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌 | NA | 工业生物技术 |
| 131 | 2025-11-07 |
Microplastic pollution in rice systems: Impacts, mechanisms and green remediation strategies
2025-Nov-10, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2025.180734
PMID:41124903
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综述 | 本文系统综述了稻田系统中微塑料污染的来源、分布、影响机制及绿色修复策略 | 首次全面整合了稻田微塑料污染的多维度影响机制，并系统提出了涵盖植物修复、生物修复和生物技术干预的综合性绿色修复方案 | 许多生物修复方法在控制环境中表现良好，但在实际田间条件下面临应用挑战 | 评估稻田微塑料污染的影响机制并探索绿色修复策略 | 稻田系统中的微塑料污染 | 环境科学 | NA | NA | NA | 文献综述数据 | NA | 合成生物学, 酶封装技术 | 细菌, 真菌, 藻类, 土壤大型动物 | 生物降解通路, 生物传感器 | 农业, 环境 |
| 132 | 2025-11-07 |
Leveraging synthetic biology for the commercialization of renewable fuels and chemicals aligning sustainable development goals
2025-Nov-05, Preparative biochemistry & biotechnology
IF:2.0Q3
DOI:10.1080/10826068.2025.2578270
PMID:41191734
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综述 | 探讨合成生物学在生物燃料和绿色化学品生产中的作用，重点关注可再生能源开发应用 | 利用DNA建模、代谢工程和微生物发酵等合成生物学创新方法优化生物燃料生产，特别是来自非粮原料 | 存在生物安全、知识产权和监管方面的挑战，以及合成生物学可能被滥用于生物安全和生物剽窃的担忧 | 研究合成生物学在可再生燃料和化学品商业化中的应用，以支持可持续发展目标 | 工程微生物、木质纤维素生物质、生物燃料和生物化学品 | NA | NA | DNA建模、代谢工程、微生物发酵 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物 | 代谢途径工程 | 能源, 环境 |
| 133 | 2025-11-07 |
A minimal SufB2C2 complex functions as a [4Fe-4S] cluster scaffold in methanogenic archaea
2025-Nov-04, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02134-25
PMID:41060016
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研究论文 | 本研究揭示了产甲烷古菌中由SufB和SufC组成的最小SUF系统作为[4Fe-4S]簇支架的功能机制 | 发现仅由两个蛋白组成的最小SUF系统，揭示SufC是主要簇结合组分，代表铁硫簇生物合成的祖先形式 | NA | 阐明专性厌氧古菌中铁硫簇的生物合成机制 | 产甲烷古菌中的SufB和SufC蛋白复合物 | 生物化学 | NA | 突变分析、进化比较、蛋白相互作用研究 | NA | 生物化学数据 | NA | NA | 产甲烷古菌 | NA | 合成生物学 |
| 134 | 2025-11-07 |
A tool for modeling gene regulatory networks (GRN_modeler) and its applications to synthetic biology
2025-Nov, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00148-8
PMID:41023501
|
研究论文 | 开发了一个用于基因调控网络建模的用户友好工具GRN_modeler，并展示了其在合成生物学中的应用 | 开发了具有图形界面的GRN_modeler工具，使无编程经验的用户能够创建现象学模型，同时支持命令行操作，并展示了设计具有偶数节点的振荡器家族和光检测生物传感器的新应用 | NA | 开发易用的基因调控网络建模工具以促进合成生物学研究 | 基因调控网络的建模与仿真 | 合成生物学 | NA | 基因调控网络建模与仿真 | 现象学模型 | NA | NA | GRN_modeler | 大肠杆菌 | 振荡器电路、光检测生物传感器电路 | 合成生物学 |
| 135 | 2025-11-06 |
Synthetic Biology of Terpenoid and Flavonoid Natural Food Additives: Research Progress and Future Challenges
2025-Nov-05, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c05422
PMID:41124328
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综述 | 本文总结了萜类和黄酮类天然食品添加剂的研究进展，重点介绍了合成生物学技术在生物生产中的应用 | 系统总结了提高萜类和黄酮类天然食品添加剂产量的前沿代谢工程策略 | NA | 探讨合成生物学在天然食品添加剂生产中的应用前景与挑战 | 萜类和黄酮类天然食品添加剂 | 合成生物学 | NA | 代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物传感器动态调控、微生物群落工程 | 食品,工业生物技术 |
| 136 | 2025-11-06 |
Orthogonal in vivo and in vitro membrane engineering enables human-like lipid remodeling of bacterial magnetosomes for functional TrkA display
2025-Nov-05, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01710-25
PMID:41190832
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研究论文 | 通过正交膜工程技术改造细菌磁小体脂质双层，实现人源TrkA受体的功能性展示 | 结合体内磷脂酰胆碱生物合成与体外胆固醇加载的双重脂质策略，首次实现细菌磁小体膜的人类脂质重塑 | 研究主要聚焦TrkA受体，未验证该策略对其他膜蛋白的普适性 | 建立功能性人类膜受体的微生物表达平台 | 磁螺菌AMB-1产生的磁小体及人源神经营养因子受体TrkA | 合成生物学 | 阿尔茨海默病，癌症 | 膜工程，脂质重塑，甲基-β-环糊精胆固醇加载 | NA | 蛋白质功能数据 | NA | CRISPR-Cas9，Gibson Assembly | 磁螺菌AMB-1 | 磷脂酰胆碱合成通路，人类膜受体展示系统 | 医学，工业生物技术 |
| 137 | 2025-11-06 |
Open Enzyme Database: a community-wide repository for sharing enzyme data
2025-Nov-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf1082
PMID:41188073
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研究论文 | 开发了一个名为开放酶数据库的社区范围存储库，用于促进酶数据的共享和探索 | 提供全面标准化的酶数据，集成人工智能预测工具和化学信息学算法，支持机器学习和酶工程应用 | 未提及数据库的具体数据覆盖范围和更新频率 | 构建一个社区范围的酶数据库基础设施，解决现有数据库更新不及时、缺乏标准化和机器学习支持不足的问题 | 酶及其相关数据，包括动力学参数、结构数据、酶促反应、测定条件和功能注释 | 生物信息学 | NA | 人工智能、化学信息学、数据挖掘 | NA | 酶动力学参数、结构数据、反应数据、注释数据 | NA | NA | NA | NA | 生物催化、系统生物学、合成生物学、酶工程、人工智能 |
| 138 | 2025-11-06 |
Bacteriophage-based therapies in oral cancer: A new frontier in oncology
2025-Nov, Cancer pathogenesis and therapy
DOI:10.1016/j.cpt.2025.03.003
PMID:41179940
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综述 | 探讨噬菌体在口腔癌发生机制和治疗干预中的新兴作用 | 提出噬菌体作为精准靶向致病菌和肿瘤微环境的新型治疗策略，并展示基因工程噬菌体在靶向癌症治疗中的创新应用 | 噬菌体耐药性、免疫系统清除和监管障碍等挑战尚未完全解决，噬菌体与宿主免疫及肿瘤微环境的复杂相互作用需进一步研究 | 探索噬菌体与口腔健康在口腔癌发生中的相互作用及其治疗潜力 | 口腔微生物组中的噬菌体及其与口腔癌的关联 | 肿瘤学 | 口腔癌 | 噬菌体疗法、合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 细菌 | 治疗性载体（抗癌肽、细胞毒性剂、免疫调节剂递送系统）、癌症疫苗载体 | 医学 |
| 139 | 2025-11-05 |
Ultrasensitive Multiplexed Detection of Protein Biomarkers via Aptamer-Driven T7 RNA Polymerase Amplification
2025-Nov-04, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c04805
PMID:41123957
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研究论文 | 开发了一种基于适配体驱动T7 RNA聚合酶级联放大的超灵敏蛋白质生物标志物检测系统 | 首次将适配体识别与T7 RNA聚合酶等温扩增相结合，实现蛋白质生物标志物的可视化双通道检测 | NA | 建立一种简单、高灵敏度、无干扰的蛋白质生物标志物同时检测方法 | 血清中的蛋白质生物标志物（以甲胎蛋白和人血清白蛋白为模型） | 合成生物学 | NA | 适配体识别、T7 RNA聚合酶等温扩增、荧光RNA-染料复合物检测 | NA | 荧光信号 | 加标样品和临床样品 | NA | NA | 蛋白质响应性核酸电路、信号放大系统 | 医学诊断、即时检测 |
| 140 | 2025-11-05 |
A Novel Salicylaldehyde Dehydrogenase from Alpine Soil Metagenome Reveals a Unique Catalytic Mechanism
2025-Nov-03, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05445-4
PMID:41182549
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研究论文 | 本研究从高山土壤宏基因组中发现并表征了一种新型水杨醛脱氢酶，揭示了其独特的催化机制 | 首次实验表征了α-变形菌纲来源的SALD酶，发现其形成独立的进化分支，并揭示了涉及ASN-137的非经典催化构型 | 高浓度金属和溶剂会抑制酶活性，生态功能验证仍需进一步研究 | 探索高山土壤宏基因组中新型酶的催化特性和生态意义 | 从高山土壤宏基因组中鉴定的水杨醛脱氢酶(SALD) | 酶学与微生物学 | NA | 宏基因组学、系统发育分析、动力学分析、差示扫描荧光法、分子对接 | NA | 酶学数据、序列数据、结构数据 | NA | NA | NA | NA | 环境修复、合成生物学 |