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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 141 | 2025-10-05 |
Multidimensional strategies for efficient heterologous protein expression in Aspergillus niger
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108690
PMID:40845950
|
综述 | 本文总结并讨论了通过多维度策略提高黑曲霉异源蛋白表达效率的最新进展 | 从表达系统、分泌途径、代谢通量、智能发酵和多组学整合五个维度系统优化黑曲霉异源蛋白生产 | 由于不同蛋白质特性各异,构建通用的黑曲霉底盘细胞仍面临挑战 | 提高黑曲霉异源蛋白表达效率 | 黑曲霉异源蛋白表达系统 | 合成生物学 | NA | 分子生物学工具、代谢工程策略、多组学整合 | NA | NA | NA | NA | 黑曲霉 | NA | 工业生物技术 |
| 142 | 2025-10-05 |
Engineering plant hosts for high-efficiency accumulation of flavonoids: Advances, challenges and perspectives
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108692
PMID:40850536
|
综述 | 本文总结了利用系统和合成生物学方法改造植物宿主以实现高效黄酮类化合物积累的研究进展、挑战与前景 | 提出通过系统和合成生物学方法精确调控黄酮类化合物生物合成路径的创新策略 | 当前在构建下一代高效黄酮生物合成植物宿主方面仍存在技术限制 | 为利用系统和合成生物学方法改造植物黄酮类化合物生物合成提供理论指导 | 植物黄酮类化合物的分布、生物合成途径及调控机制 | 合成生物学 | NA | 系统生物学、合成生物学、蛋白质工程、代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 植物 | 黄酮类化合物生物合成路径改造、代谢通量重平衡 | 农业 |
| 143 | 2025-10-05 |
Machine learning in predictive biocatalysis: A comparative review of methods and applications
2025-Nov, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108698
PMID:40885347
|
综述 | 比较分析机器学习在预测生物催化领域的方法与应用 | 系统比较了深度神经网络、卷积网络、图架构和Transformer等不同机器学习方法在生物催化预测中的优劣 | NA | 探讨机器学习在预测生物催化中的应用前景 | 酶功能预测、生物催化剂发现、反应建模和代谢途径优化 | 机器学习 | NA | 机器学习 | 神经网络, 卷积网络, 图架构, Transformer | 生化数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 代谢工程, 绿色生物催化 |
| 144 | 2025-10-05 |
Targeted metabolomics-guided rational refinement of cyanobacterial metabolism enables enhanced photosynthetic production of L-lysine
2025-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.07.015
PMID:40754064
|
研究论文 | 本研究通过靶向代谢组学指导蓝藻代谢工程,显著提高了光合作用驱动的L-赖氨酸产量 | 首次结合靶向代谢组学与合成生物学方法系统识别并解除蓝藻赖氨酸生物合成的限速步骤 | 研究仅针对Synechococcus sp. PCC 7002菌株,未在其他蓝藻中验证通用性 | 开发碳负排放的赖氨酸光合生物合成路线 | 聚球藻Synechococcus sp. PCC 7002 | 合成生物学 | NA | 靶向代谢组学, 合成生物学 | NA | 代谢物数据 | 工程菌株系列 | 代谢工程 | Synechococcus sp. PCC 7002 | 赖氨酸生物合成途径优化 | 工业生物技术, 能源 |
| 145 | 2025-10-05 |
Genome mining of tailoring enzymes from biosynthetic gene clusters for synthetic biology: A case study with fungal methyltransferases
2025-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.08.001
PMID:40774411
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于机器学习的基因组挖掘方法,用于从真菌生物合成基因簇中识别可修饰聚酮底物的甲基转移酶 | 首次将机器学习方法应用于真菌甲基转移酶的功能预测,成功实现了对未知功能酶的精准筛选 | 仅针对甲基转移酶进行了验证,方法在其他类型修饰酶中的适用性仍需进一步验证 | 开发高效的基因组挖掘方法以识别真菌生物合成基因簇中的修饰酶 | 真菌天然产物生物合成基因簇中的甲基转移酶 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、机器学习 | 机器学习 | 基因组数据 | 101,321个真菌BGCs中的16,748个推定甲基转移酶 | NA | 微生物细胞工厂 | NA | 医药、生物工业 |
| 146 | 2025-10-05 |
Advances in metabolic engineering of Vibrio natriegens as an unconventional host for biotechnology
2025-Nov, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.08.008
PMID:40834994
|
综述 | 本文综述了非传统生物技术宿主Vibrio natriegens在代谢工程领域的最新进展 | 利用Vibrio natriegens作为非传统生物技术宿主,具有高生长速率和天然感受态等独特优势 | NA | 总结Vibrio natriegens作为生物技术宿主的工程化进展和应用潜力 | Vibrio natriegens海洋细菌 | NA | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | Vibrio natriegens | 代谢途径、生物传感器、合成生物学回路 | 工业生物技术、环境、医药 |
| 147 | 2025-10-05 |
The future of cultured meat: focusing on multidisciplinary, digitization, and nutritional customization
2025-Nov, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.117005
PMID:40922220
|
综述 | 本文综述了培养肉领域的前沿工程技术、生物材料应用,并探讨了通过生物工程、合成生物学和人工智能加速发展的未来趋势 | 重点关注培养肉的多学科融合、数字化技术和营养定制化发展方向 | NA | 促进智能细胞农业发展,实现定制化肉类产品生产 | 培养肉生产技术 | 生物技术 | NA | 组织工程、生物技术、生物工程、合成生物学、人工智能 | NA | NA | NA | NA | 干细胞 | NA | 食品工业 |
| 148 | 2025-10-05 |
Progress on the synthesis of bioengineered heparin as an alternative to animal-derived heparin active pharmaceutical ingredient
2025-Nov-15, Carbohydrate polymers
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.carbpol.2025.124099
PMID:40912801
|
综述 | 本文综述了通过微生物发酵和酶修饰合成生物工程肝素的近期进展 | 结合合成生物学与先进生物加工技术开发结构明确的生物工程肝素,作为传统动物源肝素的可持续替代品 | 仍面临肝素聚糖分子量精确控制、硫酸化模式优化、结构功能等效性验证和工业规模工艺验证等关键挑战 | 开发安全、均质且可扩展的生物工程肝素作为动物源肝素的替代品 | 生物工程肝素活性药物成分 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵、酶修饰、分析表征 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 肝素聚糖生物合成途径、酶促硫酸化策略 | 医药 |
| 149 | 2025-10-05 |
Synthetic biology-driven optoelectronic biosensor for rapid and highly sensitive norovirus detection in fecal samples
2025-Nov-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117787
PMID:40674850
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研究论文 | 开发了一种合成生物学驱动的光电生物传感器,用于快速高灵敏度检测粪便样本中的诺如病毒 | 整合诺如病毒样颗粒和高亲和力单链抗体作为生物受体,无需核酸扩增即可在45分钟内完成检测,灵敏度比传统比色生物传感器提高10-100倍 | 仅使用20例临床样本进行验证,样本规模有限 | 开发快速高灵敏度的诺如病毒检测平台 | 人类粪便样本中的诺如病毒 | 生物传感 | 诺如病毒感染 | 杆状病毒-昆虫细胞表达系统、噬菌体展示技术 | NA | 生物传感信号 | 20例人类粪便样本 | 噬菌体展示 | 昆虫细胞 | 生物传感器 | 医学诊断 |
| 150 | 2025-10-05 |
Microbial production of medium-chain-length diols: Current stage and perspectives
2025-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132932
PMID:40609762
|
综述 | 总结微生物合成中链长度二醇的当前进展与未来发展方向 | 提出适用于不同链长的通用生物合成途径,并整合合成生物学与AI驱动的酶设计等前沿技术 | 微生物底盘筛选优化速度较慢,限速酶活性不足,中间体和终产物存在毒性问题 | 开发可持续的中链长度二醇微生物合成方法以替代化石基生产工艺 | 中链长度α,ω-二醇(mcl-diols)的微生物生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、蛋白质工程、适应性实验室进化 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | 基于脂肪酸生物合成或反向β-氧化途径的通用代谢途径 | 工业生物技术,材料,能源 |
| 151 | 2025-10-05 |
Advances in the biosynthesis of β-carotene and its derivatives in yeast
2025-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132936
PMID:40614874
|
综述 | 全面总结酵母中β-胡萝卜素及其衍生物生物合成的最新进展 | 基于结构相关性将衍生物分为叶黄素和脱辅基类胡萝卜素两大类,强调共享的生物合成逻辑 | 未涉及非酵母微生物系统的比较分析 | 开发可持续的微生物生产β-胡萝卜素及其衍生物的方法 | 酿酒酵母和解脂耶氏酵母 | 合成生物学 | NA | 代谢工程策略、发酵优化 | NA | NA | NA | NA | 酿酒酵母, 解脂耶氏酵母 | β-胡萝卜素生物合成途径及其衍生物代谢工程 | 食品补充剂, 营养保健品, 药品, 色素 |
| 152 | 2025-10-05 |
Biohybrid technologies for CO2 conversion to fuels and chemicals: Advances in bio-electro-, bio-photoelectro-, and bio-photocatalysis
2025-Nov, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.132949
PMID:40639626
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综述 | 本文综述了生物混合技术(生物电催化、生物光电催化和生物光催化)在二氧化碳转化为燃料和化学品领域的最新进展 | 系统比较了三种生物混合CO₂转化技术的机理特点和优化策略,强调了界面电子转移、生物相容性等共性挑战的解决方案 | NA | 开发高效可持续的二氧化碳转化技术以实现碳中和目标 | 生物混合二氧化碳转化系统 | 能源与环境生物技术 | NA | 生物电催化(BEC)、生物光电催化(BPEC)、生物光催化(BPC) | NA | NA | NA | 合成生物学 | 酶系统、微生物系统 | NA | 能源, 环境 |
| 153 | 2025-10-05 |
Development and application of a highly specific whole-cell biosensor for supersulfide detection in environmental samples
2025-Nov-01, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117731
PMID:40592263
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研究论文 | 开发了一种基于AtBigR的高特异性全细胞生物传感器,用于环境样品中超硫化物的检测 | 首个用于超硫化物特异性检测的全细胞生物传感器,具有极低背景泄漏和高灵敏度 | NA | 开发能够准确检测超硫化物的生物传感平台 | 超硫化物(包括元素硫、无机多硫化物和有机多硫化物) | 合成生物学 | NA | 全细胞生物传感器技术 | NA | 环境样品数据 | 来自不同海底地形的海洋沉积物和锂硫电池电解质 | AtBigR调控系统 | NA | 基于超硫化物感应阻遏蛋白AtBigR的生物传感器系统 | 环境,能源 |