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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-10-13 |
Multigene engineering in plants: Technologies, applications, and future prospects
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108697
PMID:40882716
|
综述 | 本文综述了植物多基因工程的技术、应用及未来前景,重点介绍了合成生物学驱动的设计-构建-测试-学习框架 | 系统总结了多基因工程在合成生物学DBTL框架下的完整技术流程,并提出了优化路径和未来发展方向 | 在多基因构建稳定性、协调性基因表达和调控可预测性方面仍存在挑战 | 促进多基因工程在可持续农业中的部署应用 | 植物多基因工程技术体系 | 合成生物学 | NA | 多基因工程 | 计算建模 | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物 | 代谢通路、调控通路 | 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 2 | 2025-10-13 |
Engineered microbial production of carotenoids and their cleavage products: Recent advances and prospects
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108708
PMID:40921259
|
综述 | 总结类胡萝卜素及其裂解产物微生物合成的最新进展与前景 | 系统阐述代谢工程和合成生物学在异源生物合成中的应用,重点关注类胡萝卜素裂解酶的研究进展 | NA | 探讨类胡萝卜素及其裂解产物的可持续微生物生产策略 | 类胡萝卜素和脱辅基类胡萝卜素 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 甲羟戊酸途径和甲基赤藓糖醇磷酸途径的代谢通路设计 | 制药,医疗保健,化妆品,食品 |
| 3 | 2025-10-13 |
Intersecting precision fermentation for global cell-based food production innovation: Challenges and opportunities
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108712
PMID:40930311
|
综述 | 探讨精准发酵与全球细胞基食品生产交叉领域的挑战与机遇 | 提出融合合成生物学与精准营养的愿景框架,分析计算机辅助工程和人工智能在发酵过程中的应用潜力 | 存在技术扩展瓶颈、监管碎片化、区域可及性和消费者接受度等实施障碍 | 推动发酵食品生产向高效可持续制造转型 | 微生物细胞工厂生产的食品成分 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学、代谢工程、计算机辅助工程(CAE)、人工智能(AI)、自动化 | NA | 案例研究、建模分析 | NA | 合成生物学工具、代谢工程工具 | 微生物细胞工厂 | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 4 | 2025-10-13 |
Genetically engineered Escherichia coli: The new recyclers of PET plastic waste
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108713
PMID:40934993
|
综述 | 本文综述了基因工程改造的大肠杆菌作为PET塑料废物生物降解与转化平台的最新进展 | 将PET水解酶在工程化大肠杆菌中进行异源表达和蛋白质工程改造,并整合合成生物学策略构建多酶级联系统和表面展示系统 | NA | 开发能够实现PET塑料高效生物降解和转化的工程微生物平台 | 基因工程改造的大肠杆菌及其在PET生物转化中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 多酶级联系统、表面展示系统、代谢通路 | 环境 |
| 5 | 2025-10-05 |
Synthetic biology meets diagnostics: Engineering biosensing platforms for rapid and accurate pathogen and viral detection
2025-Dec-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117946
PMID:40939269
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综述 | 本文综述了合成生物学与生物传感技术结合在病原体和病毒快速精准检测诊断系统开发中的应用 | 整合CRISPR系统、argonaute蛋白和模块化遗传电路等合成生物学工具与人工智能、纳米技术相结合,开发自动化、低成本、高通量诊断系统 | NA | 推进病原体检测和体外诊断技术的发展 | 病原体和病毒检测诊断系统 | 合成生物学 | 传染病 | CRISPR系统、argonaute蛋白、模块化遗传电路、无细胞系统、纳米材料增强平台 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | 模块化遗传电路、生物传感器 | 医学, 公共卫生, 食品安全 |
| 6 | 2025-10-05 |
De novo biosynthesis of Asperosaponin VI in Saccharomyces cerevisiae
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.007
PMID:40951686
|
研究论文 | 本研究首次在酿酒酵母中实现了Asperosaponin VI的完整生物合成途径重构 | 首次在酿酒酵母中采用模块化合成生物学策略完整重建ASA VI生物合成途径,包括UDP-阿拉伯糖原位生物合成和多个糖基化步骤 | 产量仍处于痕量水平(395 ng/L),下游糖基化步骤和UDP-阿拉伯糖供应可能是主要限速因素 | 开发可持续生产Asperosaponin VI及相关阿拉伯糖基化皂苷的微生物平台 | Asperosaponin VI(ASA VI)三萜皂苷及其生物合成中间体 | 合成生物学 | NA | 模块化合成生物学策略、LC-MS分析、异源表达 | NA | 代谢物分析数据 | NA | 异源基因表达、多拷贝表达 | 酿酒酵母 | 完整生物合成途径包括:UDP-阿拉伯糖原位生物合成、三萜骨架生成(齐墩果酸生产)、下游修饰(C-23羟基化、C-28逐步葡萄糖基化、C-3阿拉伯糖基化) | 医药 |
| 7 | 2025-10-05 |
Microreactors derived from water-in-water pickering emulsions for Bacillus amyloliquefaciens proliferation and synthesis of 4-methyl-5-thiazoleethanol
2025-Dec, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133231
PMID:40882929
|
研究论文 | 开发了一种基于水包水Pickering乳液微反应器,用于提高枯草芽孢杆菌增殖和4-甲基-5-噻唑乙醇的生物合成效率 | 结合合成生物学与胶体组装技术构建新型微反应器平台,通过工程化硫胺素酶II突变体和界面屏障优化酶-底物相互作用 | NA | 解决4-甲基-5-噻唑乙醇生物合成中产率低和挥发性损失的问题 | 枯草芽孢杆菌及其工程化硫胺素酶II突变体 | 合成生物学 | NA | 水包水Pickering乳液、甲基纤维素/羟丙基甲基纤维素水相分离、液体发酵 | NA | NA | NA | 蛋白质工程 | 枯草芽孢杆菌 | 硫胺素酶II突变体(A82Y/Y113A/T163K/F169L)的代谢工程改造 | 食品工业,香料工业 |
| 8 | 2025-10-05 |
Genome mining and characterization of a heme-dependent enzyme catalyzing intermolecular Nitrogen-Nitrogen bond formation in hydrazinosuccinic acid biosynthesis
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.006
PMID:40918557
|
研究论文 | 通过基因组挖掘发现并表征了一种新型血红素依赖性酶系统,该酶催化分子间氮-氮键形成生成肼基琥珀酸 | 发现首个血红素依赖性酶系统能够催化分子间氮-氮键形成,并提出了涉及活性氮中间体的催化机制 | NA | 探索氮-氮键形成酶在天然产物生物合成中的作用机制 | 血红素酶与铁硫蛋白复合物系统 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘、体内外重组、定点诱变、结构建模 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术 |
| 9 | 2025-10-05 |
Advances in adaptive laboratory evolution applications for Escherichia coli
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.07.011
PMID:40893470
|
综述 | 本文综述了大肠杆菌适应性实验室进化(ALE)应用的最新进展 | 整合高通量组学和分子工具与ALE技术,显著增强基因型-表型关系图谱构建和突变景观表征 | NA | 探讨ALE在大肠杆菌研究中的方法原理、实验设计范式和应用进展 | 大肠杆菌 | 合成生物学 | NA | 下一代测序, 分子生物学, 高通量组学 | NA | NA | NA | 适应性实验室进化(ALE) | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 10 | 2025-10-05 |
Development of precise genome editing and multi-copy integration tools in Hansenula polymorpha DL-1
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.06.009
PMID:40735059
|
研究论文 | 开发了针对多形汉逊酵母DL-1菌株的精确基因组编辑和多拷贝整合工具包 | 建立了高效CRISPR-Cas9基因组编辑系统,部分抑制NHEJ通路增强同源重组效率,鉴定了36个中性位点用于单拷贝整合,开发了靶向rDNA和Ty元件的多拷贝整合工具 | NA | 解决多形汉逊酵母DL-1菌株因强NHEJ机制和有限遗传工具而受限的代谢工程问题 | 多形汉逊酵母DL-1菌株 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑,同源重组,多拷贝整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Hansenula polymorpha DL-1 | 代谢途径工程 | 工业生物技术 |
| 11 | 2025-10-05 |
From consultors to collaborators - An SOP for advancing ethics engagement in science
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.06.006
PMID:40689230
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研究论文 | 提出一种结构化标准操作程序,用于系统地将伦理学融入科学研究过程 | 开发了分阶段的标准操作程序框架,将伦理学从外部咨询角色转变为科学探究核心的协作伙伴 | NA | 解决合成生物学等领域的伦理关切,促进伦理学在科学研究中的系统整合 | 早期职业研究人员和伦理学家 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗保健, 可持续性, 食品生产 |
| 12 | 2025-10-05 |
The secret life of RNA and lipids
2025-Dec, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2025.2526903
PMID:40613519
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综述 | 探讨RNA与脂质之间的相互作用及其在合成生物学和生命起源中的意义 | 提出RNA可通过序列特异性方式选择性结合脂质膜,为工程化RNA传感器和调控元件提供新机制 | NA | 探索RNA与脂质相互作用的化学基础及其在合成生物学、RNA世界假说和现代细胞生物学中的应用 | RNA分子与脂质膜的相互作用机制 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | RNA传感器、调控元件 | 医学, 合成生物学 |
| 13 | 2025-10-05 |
Minimal logic gates for probiotic Escherichia coli Nissle 1917 sensing and treatment of dual-bacteria intestinal infection
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2530156
PMID:40619672
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研究论文 | 本研究设计最小逻辑门编程大肠杆菌Nissle 1917,用于检测和治疗双细菌肠道感染 | 开发了正交基因电路和AND逻辑门,使益生菌能同时检测并杀灭两种病原体 | 概念验证阶段,仅在小鼠模型中测试 | 开发针对双细菌感染的治疗方法 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917和两种肠道病原菌 | 合成生物学 | 肠道感染 | 基因电路设计,细菌化学趋向性分析 | NA | 体外实验数据,动物模型数据 | 小鼠感染模型 | 合成生物学基因电路 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 最小逻辑门(AND门),正交基因电路,病原体检测与杀灭系统 | 医学 |