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当前共找到 187 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-02-03 |
Wheat Plasma Membrane Receptors: Orchestrating Immunity and Bridging to Crop Improvement
2025-Dec-19, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48010002
PMID:41614833
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综述 | 本文综述了小麦质膜受体的多样性、分类、信号机制及其在植物免疫中的核心作用，并探讨了其在作物改良中的应用潜力 | 系统整合了小麦质膜受体在大型六倍体基因组背景下的功能特征化挑战，并首次详细阐述了其家族规模从10个到3424个成员的巨大差异，以及将基础研究与作物改良策略（如标记辅助选择、基因叠加和受体工程）相连接 | 小麦基因组庞大、基因重复和功能冗余阻碍了质膜受体的功能表征，且遗传冗余和多效性效应是主要障碍 | 阐明小麦质膜受体的功能、信号机制及其在免疫与作物抗病改良中的作用 | 小麦质膜受体，特别是受体样激酶家族 | 植物生物学/作物遗传改良 | 植物病害（如小麦叶锈病） | 多组学、系统生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 小麦 | NA | 农业 |
| 2 | 2026-02-03 |
Cancer Reversion Therapy: Prospects, Progress and Future Directions
2025-Dec-15, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47121049
PMID:41614813
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综述 | 本文综述了癌症逆转疗法的前景、进展和未来方向，这是一种通过重编程恶性细胞使其恢复为非恶性状态而非摧毁它们的新型治疗范式 | 系统性地整合了癌症逆转疗法的生物学基础、现有策略、新兴技术，并提出了未来发展的关键方向，强调从“摧毁”到“重编程”的范式转变 | 许多报道的“逆转”现象可能只是刺激依赖的可塑性或短暂生长停滞，而非稳定的表型正常化；真正的癌症逆转需要持久、可遗传的表型改变，这在实现上仍面临重大挑战 | 探讨将恶性细胞重编程为非恶性状态的癌症治疗新策略 | 癌症细胞及其微环境 | NA | 癌症 | 单细胞分析、CRISPR基因编辑、患者来源类器官、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 3 | 2026-02-02 |
Intracellularly coupled oscillators for synthetic biology
2025-Dec-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67893-0
PMID:41423683
|
研究论文 | 本文提出并建模了细胞内耦合振荡器作为合成生物学的高级构建模块，旨在指导未来细菌合成生物学实验 | 基于耦合强度对振荡器进行分类，并预测了包括混沌和同步在内的多种动态行为，为振荡器计算提供新方向 | NA | 工程化或重新设计生命系统以实现复杂功能 | 细胞内耦合振荡器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 基于振荡器的电路设计，包括独立、弱耦合、强耦合和深度耦合振荡器 | 工业生物技术 |
| 4 | 2026-01-30 |
DNABERT2-CAMP: A Hybrid Transformer-CNN Model for E. coli Promoter Recognition
2025-Dec-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010027
PMID:41595447
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研究论文 | 提出了一种名为DNABERT2-CAMP的混合深度学习模型，用于准确识别大肠杆菌的启动子序列 | 首次将预训练的DNABERT-2 Transformer与定制的CAMP模块（CNN-注意力-平均池化）相结合，以同时建模长距离基因组依赖性和细粒度局部基序 | NA | 开发一个强大的、可推广的基因组注释和合成生物学应用工具 | 大肠杆菌的启动子序列 | 自然语言处理 | NA | 深度学习 | Transformer, CNN | DNA序列 | 8720个经过实验验证的81-bp序列（正负样本） | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 5 | 2026-01-30 |
Systemic engineering and global regulation enabling high-level bilirubin biosynthesis
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67804-3
PMID:41436472
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研究论文 | 本研究通过系统工程和全局调控，开发了一种高效、可扩展的体外胆红素生物合成途径 | 揭示了Fe²⁺诱导中间体氧化降解的隐藏挑战，并通过竞争性铁螯合、质子化状态调控以及引入一氧化碳脱氢酶解决酶活性抑制问题，实现了胆红素合成效率的20倍提升 | 研究基于体外系统，其在体内应用的效果和稳定性仍需进一步验证 | 提高胆红素生物合成的产量和效率，解决合成生物学中血红素相关途径的稳定性问题 | 胆红素生物合成途径及其关键酶和中间体 | 合成生物学 | NA | DFT计算、酶筛选、机理分析 | NA | NA | NA | NA | NA | 体外胆红素生物合成途径，包含血红素加氧酶、一氧化碳脱氢酶和甲酸脱氢酶（用于NADPH循环） | 工业生物技术 |
| 6 | 2026-01-28 |
Antifungal Biocontrol in Sustainable Crop Protection: Microbial Lipopeptides, Polyketides, and Plant-Derived Agents
2025-Dec-27, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof12010022
PMID:41590434
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综述 | 本文综述了微生物和植物来源的抗真菌生物防治剂在可持续作物保护中的应用，重点介绍了环状脂肽和聚酮类等次级代谢产物的结构、生物合成途径及作用机制 | 整合了当前关于微生物次级代谢产物（特别是环状脂肽和聚酮类）和植物来源抗真菌剂的最新知识，并强调了基因组学、代谢工程和合成生物学在加速菌株改良和新化合物发现方面的进展 | NA | 探讨抗真菌生物防治剂作为合成杀菌剂替代品在可持续作物保护中的作用 | 微生物（如芽孢杆菌属、假单胞菌属、链霉菌属）和植物产生的抗真菌次级代谢产物 | NA | NA | 基因组学、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 7 | 2026-01-28 |
Genetically Encoded Sensors for Monitoring Intracellular Redox Health of the Pathogenic Fungus Cryptococcus neoformans
2025-Dec-26, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c01883
PMID:41273792
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研究论文 | 本研究为致病真菌新型隐球菌开发了基因编码的氧化还原传感器，用于实时监测细胞内氧化还原状态 | 首次为新型隐球菌优化设计了基因编码的氧化还原传感器，并建立了多种基于荧光的实时监测技术 | 该研究主要针对新型隐球菌，在其它真菌中的应用仍需进一步验证 | 开发用于致病真菌的氧化还原生物传感器，研究真菌毒力相关的氧化还原调控机制 | 致病真菌新型隐球菌及其氧化还原蛋白 | 合成生物学 | 真菌感染 | 基因编码传感器技术、荧光监测技术 | NA | 荧光信号数据 | NA | 基因编码传感器 | Cryptococcus neoformans | 氧化还原生物传感器 | 医学 |
| 8 | 2026-01-25 |
Epigenetic landscape of Leishmania-host interactions
2025-Dec, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2025.2574836
PMID:41099169
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综述 | 本文综述了利什曼原虫与宿主相互作用中的表观遗传调控机制及其在疾病发病中的作用 | 系统总结了不同物种利什曼原虫的表观遗传变化，并探讨了寄生虫如何通过表观遗传途径操纵宿主免疫信号，同时提出了合成基因回路调控宿主和寄生虫表观基因组的新策略 | 本文为综述性文章，未报告原始实验数据，主要基于现有文献进行整合分析 | 探讨利什曼病中寄生虫与宿主相互作用的表观遗传调控机制，并评估基于表观遗传学和合成生物学的治疗策略潜力 | 利什曼原虫及其宿主（包括人类）的表观遗传修饰与相互作用 | NA | 利什曼病 | 文献综述（Web of Science、PubMed、Scopus数据库检索） | NA | 文本（文献数据） | NA | 合成基因回路 | 人类（宿主） | 用于调控宿主和寄生虫表观基因组的合成基因回路 | 医学 |
| 9 | 2025-12-19 |
Engineered Clostridium butyricum: a promising application of synthetic biology in comprehensive health
2025-Dec-17, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02901-y
PMID:41408287
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 10 | 2026-01-24 |
Medium dependent factors govern the functionality of engineered type III secretion systems
2025-Dec-16, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00600-1
PMID:41402848
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研究论文 | 本研究探讨了细菌宿主培养条件对基于III型分泌系统（T3SS）的工程化电路功能的影响，并开发了可诱导的iT3SS系统 | 首次系统研究了培养介质对T3SS工程化系统性能的影响，揭示了介质依赖性因素如何通过宿主资源分配策略影响分泌效率 | 研究仅基于沙门氏菌模型，未在其他细菌宿主中验证；提出的翻译和翻译后负担假设需要进一步实验验证 | 优化工程化分泌系统在合成生物学应用中的性能，理解培养条件对T3SS功能的影响机制 | 沙门氏菌中的工程化III型分泌系统（iT3SS），包括PrgH-GFP融合蛋白和效应蛋白SptP | 合成生物学 | NA | RNA-seq分析，GFP荧光监测，IPTG诱导系统 | NA | 基因表达数据，蛋白质分泌效率数据，RNA-seq转录组数据 | 在丰富LB培养基和葡萄糖最小培养基中培养的沙门氏菌细胞，使用不同IPTG浓度处理 | 基因融合，IPTG诱导系统 | 沙门氏菌（Salmonella enterica） | IPTG诱导的工程化III型分泌系统（iT3SS），将prgH基因与GFP编码序列融合以监测表达 | 工业生物技术，合成生物学 |
| 11 | 2026-01-18 |
Research progress and applications of reverse genetics systems for infectious bronchitis virus
2025-Dec-19, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.106312
PMID:41447763
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综述 | 本文系统综述了传染性支气管炎病毒反向遗传学系统的发展、应用与挑战 | 全面比较了包括痘病毒支持系统、体外连接转录、靶向RNA重组、细菌人工染色体克隆、转化相关重组和环状聚合酶延伸反应在内的多种反向遗传学平台，并展望了CRISPR/Cas9、合成生物学与计算方法的整合应用前景 | 未涉及具体实验数据验证，主要基于现有文献进行归纳分析 | 为研究者选择适当的反向遗传学策略提供指导，并启发IBV防控的创新解决方案 | 传染性支气管炎病毒 | NA | 禽类传染病 | 反向遗传学、CRISPR/Cas9、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 农业 |
| 12 | 2026-01-17 |
Rewiring central metabolism in Komagataella phaffii for efficient mannose synthesis
2025-Dec-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02886-8
PMID:41366679
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造Komagataella phaffii酵母，优化其中心代谢途径，实现了高效甘露糖合成 | 采用双碳源系统（甘油用于生物质生成，葡萄糖用于甘露糖合成），通过敲除和下调关键基因（如pfk2、pfk1、zwf1）来重定向碳通量，并过表达大肠杆菌来源的磷酸酶基因yniC以促进甘露糖生物合成，最终在发酵中达到约121.1 g/L的甘露糖产量，创下微生物发酵的最高纪录 | NA | 通过代谢工程改造Komagataella phaffii酵母，实现高效甘露糖生产 | Komagataella phaffii酵母及其甘露糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因敲除、基因下调、过表达、高细胞密度补料分批发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii | 甘露糖生物合成途径的重构，包括碳通量重定向至果糖-6-磷酸积累、抑制副产物生成 | 工业生物技术 |
| 13 | 2026-01-16 |
Decoding necrosome assembly: harmonizing signal amplification and attenuation through optimal RIP3 stoichiometry
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67098-5
PMID:41436733
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研究论文 | 本研究通过定量STORM和数学建模揭示了坏死小体组装中RIP3与RIP1的最优化学计量比约为3:1，以调控坏死性凋亡的信号放大与衰减 | 首次定义了坏死小体中RIP3与RIP1的最优化学计量比，并发现过度RIP3寡聚化可作为内在尺寸控制机制来衰减信号 | NA | 探究坏死小体组装的时空规则及其在坏死性凋亡中的作用机制 | 坏死小体、RIP3、RIP1、MLKL、Caspase-8、c-FLIP | 分子生物学 | 神经退行性疾病、缺血性损伤、炎症性疾病 | 定量STORM、数学建模 | NA | 成像数据、数学模型 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 14 | 2026-01-16 |
Reconstituting transcription-translation-coupled DNA replication within complex in vitro biological systems
2025-Dec-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67411-2
PMID:41398169
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研究论文 | 本研究开发了一种名为LoopReX的无细胞系统，利用大肠杆菌粗提物重建了转录-翻译耦合的DNA复制过程，为合成生命构建提供了新平台 | 首次使用粗提物而非纯化组分重建TTcDR，引入机器学习优化系统效率，并利用CipB介导的区室化形成人工核样结构 | 系统仍依赖外源添加的phi29和T7聚合酶，且长期稳定性和遗传保真度有待进一步验证 | 在人工系统中重建转录-翻译耦合的DNA复制过程以推进合成生命构建 | 无细胞转录翻译系统与DNA复制机制 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统构建、机器学习优化 | NA | 实验性能数据 | NA | Gibson Assembly, iGEM | 大肠杆菌 | 转录-翻译耦合的DNA复制系统、人工核样区室化结构 | 合成生物学、生物技术、生物混合系统 |
| 15 | 2026-01-15 |
Molecular life sciences in the era of the Fourth Industrial Revolution: sequencing, multi-omics and artificial intelligence
2025-Dec-11, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20253019
PMID:41385245
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综述 | 本文探讨了第四次工业革命背景下，人工智能与多组学技术在分子生命科学中的整合应用及其未来发展趋势 | 综述了人工智能与低成本高通量测序在多组学领域的结合，实现了前所未有的数据解析速度 | NA | 概述人工智能如何整合到多组学研究中，并预测该领域未来的研究方向 | 分子生命科学中的多组学数据 | 机器学习 | NA | 高通量测序 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 16 | 2026-01-14 |
Host Factors Promoting the LTR Retrotransposon Life Cycle in Plant Cells: Current Knowledge and Future Directions
2025-Dec-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010374
PMID:41516247
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综述 | 本文综述了植物细胞中促进LTR反转座子生命周期的主机因素，探讨了其与宿主过程的整合及未来研究方向 | 提出整合植物移动组学、转座报告基因、基因组编辑、合成生物学和互作组学来阐明植物特异性机制 | 精确机制在植物中仍不明确，尤其是针对富含LTR反转座子的植物 | 探讨促进植物中LTR反转座子转座的主机蛋白质 | LTR反转座子及其与植物宿主细胞的相互作用 | 植物生物学 | NA | 移动组学、转座报告基因、基因组编辑、合成生物学、互作组学 | NA | 文献分析 | NA | 基因组编辑 | 植物细胞 | NA | 农业 |
| 17 | 2026-01-14 |
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in vivo in the mouse embryo
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.695948
PMID:41497587
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研究论文 | 本研究提出了一种基于深度学习的通用策略，用于设计在小鼠胚胎中可靠发挥功能的组织特异性增强子 | 首次将深度学习模型应用于哺乳动物活体组织的增强子设计，成功实现了在复杂调控环境下对组织特异性基因表达的程序化控制 | 研究仅在小鼠胚胎中验证了三种组织（心脏、肢体、中枢神经系统）的增强子功能，尚未扩展到更多组织类型或成年动物模型 | 开发能够预测和设计在哺乳动物活体组织中有效工作的组织特异性增强子的通用框架 | 小鼠胚胎的心脏、肢体和中枢神经系统组织 | 机器学习 | NA | 深度学习，全基因组染色质可及性分析，迁移学习 | 卷积神经网络（CNN） | 基因组序列数据，染色质可及性数据 | 使用了已验证的人类和小鼠增强子数据进行迁移学习，并设计了15个合成增强子在小鼠胚胎中进行测试 | NA | 小鼠 | 组织特异性基因表达增强子 | 功能基因组学，合成生物学，基因治疗 |
| 18 | 2026-01-14 |
Active learning-guided optimization of cell-free biosensors for lead testing in drinking water
2025-Dec-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66964-6
PMID:41422091
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研究论文 | 本文开发了一种基于机器学习的细胞游离基因表达工作流程，用于优化基于变构转录因子的生物传感器，以检测饮用水中的铅污染 | 采用多目标机器学习引导的细胞游离工作流程，结合方向性标签训练模型，快速优化生物传感器的灵敏度和选择性 | NA | 优化基于变构转录因子的生物传感器，用于环境监测和人类健康中的铅污染检测 | 变构转录因子PbrR作为生物传感器，用于饮用水中的铅检测 | 合成生物学 | NA | 细胞游离基因表达、机器学习模型训练 | 机器学习模型（未指定具体类型） | 序列到功能数据 | NA | CRISPR-Cas9（隐含于定向进化中，但未明确指定），机器学习框架 | 细胞游离系统（无特定宿主生物） | 基于变构转录因子的生物传感器，用于铅检测 | 环境监测 |
| 19 | 2026-01-14 |
Cyanobacteria-Derived Extracellular Vesicles: A Novel Frontier in Drug Delivery and Therapeutics
2025-Dec-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010004
PMID:41515885
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综述 | 本文综述了蓝藻来源的细胞外囊泡作为新型药物递送载体的潜力、优势、应用领域及面临的挑战 | 首次系统性地探讨蓝藻细胞外囊泡作为专用纳米载体平台的潜力，并与现有合成载体进行比较分析 | 蓝藻细胞外囊泡的大规模分离和表征仍存在挑战，其相对于现有系统的具体优势和局限性尚未被系统总结 | 探索蓝藻细胞外囊泡在药物递送和治疗应用中的潜力 | 蓝藻来源的细胞外囊泡 | NA | 癌症、神经退行性疾病、感染性疾病 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | NA | 医药 |
| 20 | 2026-01-13 |
Overcoming the eIF2α Brake in Human Cell-Derived Translation Systems
2025-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.16.688697
PMID:41497621
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研究论文 | 本研究通过基因编辑和表达调控策略，克服了人源细胞无细胞翻译系统中由eIF2α磷酸化抑制的翻译瓶颈 | 系统探索了在可编辑和难编辑的人源细胞类型中，通过基因编辑eIF2α-S52A、敲除PKR激酶，以及利用piggyBac系统表达GADD34/K3L来绕过eIF2α磷酸化抑制的互补策略 | 基因编辑在某些细胞类型（如原代细胞）中不适用，表达策略可能引入额外的调控复杂性 | 提高人源细胞无细胞翻译系统的翻译效率和生产力 | 人源细胞无细胞翻译系统、eIF2α磷酸化调控机制 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、piggyBac转座子系统、Tet诱导表达系统 | NA | NA | Expi293F悬浮细胞、诱导多能干细胞（iPSCs）、原代人成纤维细胞、心肌细胞 | CRISPR-Cas9, piggyBac | 人源细胞（Expi293F, iPSCs, 原代成纤维细胞, 心肌细胞） | Tet诱导启动子控制的GADD34/K3L表达盒，用于调控eIF2α磷酸化状态 | 医学, 工业生物技术 |