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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-03-13 |
Advanced microbial engineering approaches for biodegradation of pharmaceutical pollutants
2025-12-18, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-025-10238-x
PMID:41410736
|
综述 | 本文综述了利用微生物工程策略高效降解药物污染物的最新进展 | 整合了CRISPR系统、适应性实验室进化、代谢工程、生物强化和生物反应器设计等多种先进技术,并探讨了合成生物学和宏基因组学在应对新兴污染物中的应用 | NA | 开发更有效和可持续的药物污染物生物修复策略 | 药物污染物(如抗癫痫药、抗生素、镇痛药、非甾体抗炎药、激素和防腐剂) | 环境生物技术 | NA | CRISPR系统、适应性实验室进化、代谢工程、生物强化、生物反应器设计、合成生物学、宏基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 环境 |
| 2 | 2026-03-13 |
Bioremediation of polycyclic aromatic hydrocarbons contaminated soils/water for environmental remediation
2025-12-01, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-025-10229-y
PMID:41324725
|
综述 | 本文综述了利用微生物进行多环芳烃(PAHs)污染土壤/水体的生物修复方法 | 系统总结了利用特定细菌(如假单胞菌、分枝杆菌等)及其酶系统降解PAHs的机制,并探讨了生物表面活性剂、生物膜、微生物群落以及基因工程、合成生物学和纳米技术等新兴工具在提升修复效率中的作用 | NA | 探讨可持续、环保的多环芳烃污染修复方法 | 多环芳烃(如萘、菲、蒽、芘)污染的土壤和水体 | NA | NA | 微生物降解、基因工程、合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 3 | 2026-03-08 |
Integrating synthetic biology to understand and engineer the heart, lung, blood, and sleep systems
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101446
PMID:41412113
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综述 | 本文综述了合成生物学在心脏、肺、血液和睡眠系统中的整合应用,以理解和工程化这些系统 | 将合成生物学从微生物扩展到人类系统,通过基因组工程、动态基因电路和高维生物传感器实现基因表达、细胞命运和组织组织的精确控制,并整合组学数据与AI引导的电路设计 | 存在递送、转基因稳定性和生理相关模型中稳健时空控制等关键挑战 | 工程化细胞和组织,使其在动态多器官环境中可靠功能 | 心脏、肺、血液和睡眠系统 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、动态基因电路、高维生物传感器、组学数据、AI引导电路设计 | 系统级模型 | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 人类细胞、组织 | 可调转录调节器、合成组织器、反馈电路 | 医学、药物开发、基因治疗 |
| 4 | 2026-03-06 |
Repurposing the bacterial surface display technology for drug delivery
2025-Dec, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115701
PMID:41046872
|
综述 | 本文综述了细菌表面展示技术在药物递送领域的应用进展与未来前景 | 提出利用AlphaFold等计算工具理性设计最优外膜锚定蛋白,以加速下一代表面展示平台的开发 | 面临监管障碍和微生物稳定性等挑战 | 探索细菌工程在医学应用中的演变,重点研究细菌表面展示技术实现的药物递送策略 | 革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌的表面展示系统 | 合成生物学 | 癌症 | 细菌表面展示技术 | NA | NA | NA | NA | 革兰氏阴性菌, 革兰氏阳性菌 | 外膜蛋白系统、分选酶介导的锚定系统、基于孢子的系统 | 医学 |
| 5 | 2026-02-28 |
Microbiome-driven resistance in cervical cancer therapy: from mechanistic dissection to clinical translation
2025-Dec-29, Expert reviews in molecular medicine
IF:4.5Q2
DOI:10.1017/erm.2025.10029
PMID:41457383
|
综述 | 本文综述了微生物组在宫颈癌治疗耐药性中的作用,从机制解析到临床转化的最新进展 | 系统性地将阴道微生物群失调与宫颈癌治疗耐药性联系起来,并提出了基于微生物组的干预策略,包括合成生物学驱动的精准微生物组疗法 | NA | 探讨微生物组如何驱动宫颈癌治疗耐药性,并评估基于微生物组的干预策略的临床转化潜力 | 宫颈癌患者及其相关的阴道微生物组 | NA | 宫颈癌 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程细菌 | NA | 医学 |
| 6 | 2026-02-15 |
Beer yeast breeding in the era of innovation: advances and applications for modern brewing
2025-Dec-16, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03681-6
PMID:41400895
|
综述 | 本文系统回顾了现代啤酒酵母育种策略,重点讨论了组学、适应性进化和CRISPR基因组编辑等创新技术在酵母菌株开发中的应用与进展 | 强调了多维策略、高通量筛选平台以及合成生物学与计算模型协同整合在实现精准菌株优化中的重要性,并展望了未来菌株增强技术的发展趋势 | NA | 探讨现代生物技术背景下啤酒酵母育种的最新进展与应用,以满足啤酒行业对定制化风味和品质的多样化市场需求 | 啤酒酵母(酿酒酵母) | NA | NA | 组学技术、适应性进化、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | NA | 食品工业、工业生物技术 |
| 7 | 2026-02-14 |
Bacteriophages as Therapeutic and Biotechnological Agents: Host Interactions, Immune Modulation, and Engineering Strategies
2025-Dec, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1177/26416549251384321
PMID:41685372
|
综述 | 本文综述了噬菌体作为治疗和生物技术工具的最新进展,重点探讨了其与宿主(细菌和真核细胞)的相互作用、免疫调节功能及工程化策略 | 系统整合了噬菌体穿越血脑屏障等组织渗透机制、免疫调节功能与CRISPR抗菌等前沿工程技术的交叉应用 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证,且部分新兴工程技术的临床转化潜力仍需进一步评估 | 探讨噬菌体在抗感染治疗和生物技术领域的应用潜力及作用机制 | 噬菌体及其与细菌宿主、真核宿主(包括哺乳动物组织)的相互作用 | 合成生物学 | 多重耐药菌感染 | CRISPR基因编辑、群体感应干扰技术 | NA | 文献综述数据 | NA | CRISPR-Cas系统 | 细菌(噬菌体天然宿主)、哺乳动物细胞 | 非裂解性质粒系统、群体感应干扰回路 | 医学、工业生物技术 |
| 8 | 2026-02-11 |
Microbial Systems Enhancing CAR-Based Therapies: A Synthetic Biology Paradigm for Next-Generation Cancer Immunotherapy
2025-Dec-27, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04679-z
PMID:41454921
|
综述 | 本文系统综述了利用合成生物学方法改造微生物系统,以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中面临的挑战 | 提出将工程化益生菌株作为可编程工厂,用于合成抗原、递送共刺激域和调节肿瘤微环境,并通过CRISPR/Cas工程化遗传电路实现治疗载荷的精确时空控制 | 临床转化的主要障碍包括生物防护挑战、对肿瘤归巢特异性的机制理解不完整以及安全性验证要求 | 评估微生物系统作为创新平台,以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中的局限性,并推动临床转化 | 工程化微生物系统(如大肠杆菌Nissle 1917)及其在CAR-T细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas, 合成生物学方法 | NA | 文献数据(389篇同行评审研究) | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 遗传电路,用于精确时空控制治疗载荷 | 医学 |
| 9 | 2026-02-06 |
Psilocybin: clinical potential, mechanistic insights, and biotechnological advances for scalable production
2025-Dec-31, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04758-0
PMID:41474478
|
综述 | 本文综述了裸盖菇素的临床潜力、作用机制及生物技术进展,重点讨论了其作为精神健康治疗候选药物的前景以及通过微生物平台实现规模化生产的生物技术策略 | 整合了裸盖菇素的临床研究、作用机制和生物技术生产进展,强调了利用工程化微生物(如酿酒酵母、构巢曲霉和大肠杆菌)进行异源表达以提高产量(达2000 mg/L)的创新方法 | NA | 探讨裸盖菇素作为生物制药候选物的临床潜力、作用机制及通过生物技术实现可持续规模化生产的途径 | 裸盖菇素(一种来自裸盖菇属蘑菇的色胺衍生生物碱)及其生物合成 | NA | 精神健康疾病 | 异源表达、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母, 构巢曲霉, 大肠杆菌 | 裸盖菇素生物合成途径 | 医药 |
| 10 | 2026-02-03 |
Wheat Plasma Membrane Receptors: Orchestrating Immunity and Bridging to Crop Improvement
2025-Dec-19, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48010002
PMID:41614833
|
综述 | 本文综述了小麦质膜受体的多样性、分类、信号机制及其在植物免疫中的核心作用,并探讨了其在作物改良中的应用潜力 | 系统整合了小麦质膜受体在大型六倍体基因组背景下的功能特征化挑战,并首次详细阐述了其家族规模从10个到3424个成员的巨大差异,以及将基础研究与作物改良策略(如标记辅助选择、基因叠加和受体工程)相连接 | 小麦基因组庞大、基因重复和功能冗余阻碍了质膜受体的功能表征,且遗传冗余和多效性效应是主要障碍 | 阐明小麦质膜受体的功能、信号机制及其在免疫与作物抗病改良中的作用 | 小麦质膜受体,特别是受体样激酶家族 | 植物生物学/作物遗传改良 | 植物病害(如小麦叶锈病) | 多组学、系统生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 小麦 | NA | 农业 |
| 11 | 2026-02-03 |
Cancer Reversion Therapy: Prospects, Progress and Future Directions
2025-Dec-15, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47121049
PMID:41614813
|
综述 | 本文综述了癌症逆转疗法的前景、进展和未来方向,这是一种通过重编程恶性细胞使其恢复为非恶性状态而非摧毁它们的新型治疗范式 | 系统性地整合了癌症逆转疗法的生物学基础、现有策略、新兴技术,并提出了未来发展的关键方向,强调从“摧毁”到“重编程”的范式转变 | 许多报道的“逆转”现象可能只是刺激依赖的可塑性或短暂生长停滞,而非稳定的表型正常化;真正的癌症逆转需要持久、可遗传的表型改变,这在实现上仍面临重大挑战 | 探讨将恶性细胞重编程为非恶性状态的癌症治疗新策略 | 癌症细胞及其微环境 | NA | 癌症 | 单细胞分析、CRISPR基因编辑、患者来源类器官、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |
| 12 | 2026-02-02 |
Intracellularly coupled oscillators for synthetic biology
2025-Dec-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67893-0
PMID:41423683
|
研究论文 | 本文提出并建模了细胞内耦合振荡器作为合成生物学的高级构建模块,旨在指导未来细菌合成生物学实验 | 基于耦合强度对振荡器进行分类,并预测了包括混沌和同步在内的多种动态行为,为振荡器计算提供新方向 | NA | 工程化或重新设计生命系统以实现复杂功能 | 细胞内耦合振荡器 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 基于振荡器的电路设计,包括独立、弱耦合、强耦合和深度耦合振荡器 | 工业生物技术 |
| 13 | 2026-01-30 |
DNABERT2-CAMP: A Hybrid Transformer-CNN Model for E. coli Promoter Recognition
2025-Dec-28, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010027
PMID:41595447
|
研究论文 | 提出了一种名为DNABERT2-CAMP的混合深度学习模型,用于准确识别大肠杆菌的启动子序列 | 首次将预训练的DNABERT-2 Transformer与定制的CAMP模块(CNN-注意力-平均池化)相结合,以同时建模长距离基因组依赖性和细粒度局部基序 | NA | 开发一个强大的、可推广的基因组注释和合成生物学应用工具 | 大肠杆菌的启动子序列 | 自然语言处理 | NA | 深度学习 | Transformer, CNN | DNA序列 | 8720个经过实验验证的81-bp序列(正负样本) | NA | 大肠杆菌 | NA | 合成生物学 |
| 14 | 2026-01-30 |
Systemic engineering and global regulation enabling high-level bilirubin biosynthesis
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67804-3
PMID:41436472
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研究论文 | 本研究通过系统工程和全局调控,开发了一种高效、可扩展的体外胆红素生物合成途径 | 揭示了Fe²⁺诱导中间体氧化降解的隐藏挑战,并通过竞争性铁螯合、质子化状态调控以及引入一氧化碳脱氢酶解决酶活性抑制问题,实现了胆红素合成效率的20倍提升 | 研究基于体外系统,其在体内应用的效果和稳定性仍需进一步验证 | 提高胆红素生物合成的产量和效率,解决合成生物学中血红素相关途径的稳定性问题 | 胆红素生物合成途径及其关键酶和中间体 | 合成生物学 | NA | DFT计算、酶筛选、机理分析 | NA | NA | NA | NA | NA | 体外胆红素生物合成途径,包含血红素加氧酶、一氧化碳脱氢酶和甲酸脱氢酶(用于NADPH循环) | 工业生物技术 |
| 15 | 2026-01-28 |
Antifungal Biocontrol in Sustainable Crop Protection: Microbial Lipopeptides, Polyketides, and Plant-Derived Agents
2025-Dec-27, Journal of fungi (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/jof12010022
PMID:41590434
|
综述 | 本文综述了微生物和植物来源的抗真菌生物防治剂在可持续作物保护中的应用,重点介绍了环状脂肽和聚酮类等次级代谢产物的结构、生物合成途径及作用机制 | 整合了当前关于微生物次级代谢产物(特别是环状脂肽和聚酮类)和植物来源抗真菌剂的最新知识,并强调了基因组学、代谢工程和合成生物学在加速菌株改良和新化合物发现方面的进展 | NA | 探讨抗真菌生物防治剂作为合成杀菌剂替代品在可持续作物保护中的作用 | 微生物(如芽孢杆菌属、假单胞菌属、链霉菌属)和植物产生的抗真菌次级代谢产物 | NA | NA | 基因组学、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 16 | 2026-01-28 |
Genetically Encoded Sensors for Monitoring Intracellular Redox Health of the Pathogenic Fungus Cryptococcus neoformans
2025-Dec-26, ACS sensors
IF:8.2Q1
DOI:10.1021/acssensors.5c01883
PMID:41273792
|
研究论文 | 本研究为致病真菌新型隐球菌开发了基因编码的氧化还原传感器,用于实时监测细胞内氧化还原状态 | 首次为新型隐球菌优化设计了基因编码的氧化还原传感器,并建立了多种基于荧光的实时监测技术 | 该研究主要针对新型隐球菌,在其它真菌中的应用仍需进一步验证 | 开发用于致病真菌的氧化还原生物传感器,研究真菌毒力相关的氧化还原调控机制 | 致病真菌新型隐球菌及其氧化还原蛋白 | 合成生物学 | 真菌感染 | 基因编码传感器技术、荧光监测技术 | NA | 荧光信号数据 | NA | 基因编码传感器 | Cryptococcus neoformans | 氧化还原生物传感器 | 医学 |
| 17 | 2026-01-25 |
Epigenetic landscape of Leishmania-host interactions
2025-Dec, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2025.2574836
PMID:41099169
|
综述 | 本文综述了利什曼原虫与宿主相互作用中的表观遗传调控机制及其在疾病发病中的作用 | 系统总结了不同物种利什曼原虫的表观遗传变化,并探讨了寄生虫如何通过表观遗传途径操纵宿主免疫信号,同时提出了合成基因回路调控宿主和寄生虫表观基因组的新策略 | 本文为综述性文章,未报告原始实验数据,主要基于现有文献进行整合分析 | 探讨利什曼病中寄生虫与宿主相互作用的表观遗传调控机制,并评估基于表观遗传学和合成生物学的治疗策略潜力 | 利什曼原虫及其宿主(包括人类)的表观遗传修饰与相互作用 | NA | 利什曼病 | 文献综述(Web of Science、PubMed、Scopus数据库检索) | NA | 文本(文献数据) | NA | 合成基因回路 | 人类(宿主) | 用于调控宿主和寄生虫表观基因组的合成基因回路 | 医学 |
| 18 | 2025-12-19 |
Engineered Clostridium butyricum: a promising application of synthetic biology in comprehensive health
2025-Dec-17, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02901-y
PMID:41408287
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 19 | 2026-01-24 |
Medium dependent factors govern the functionality of engineered type III secretion systems
2025-Dec-16, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00600-1
PMID:41402848
|
研究论文 | 本研究探讨了细菌宿主培养条件对基于III型分泌系统(T3SS)的工程化电路功能的影响,并开发了可诱导的iT3SS系统 | 首次系统研究了培养介质对T3SS工程化系统性能的影响,揭示了介质依赖性因素如何通过宿主资源分配策略影响分泌效率 | 研究仅基于沙门氏菌模型,未在其他细菌宿主中验证;提出的翻译和翻译后负担假设需要进一步实验验证 | 优化工程化分泌系统在合成生物学应用中的性能,理解培养条件对T3SS功能的影响机制 | 沙门氏菌中的工程化III型分泌系统(iT3SS),包括PrgH-GFP融合蛋白和效应蛋白SptP | 合成生物学 | NA | RNA-seq分析,GFP荧光监测,IPTG诱导系统 | NA | 基因表达数据,蛋白质分泌效率数据,RNA-seq转录组数据 | 在丰富LB培养基和葡萄糖最小培养基中培养的沙门氏菌细胞,使用不同IPTG浓度处理 | 基因融合,IPTG诱导系统 | 沙门氏菌(Salmonella enterica) | IPTG诱导的工程化III型分泌系统(iT3SS),将prgH基因与GFP编码序列融合以监测表达 | 工业生物技术,合成生物学 |
| 20 | 2026-01-17 |
Rewiring central metabolism in Komagataella phaffii for efficient mannose synthesis
2025-Dec-09, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02886-8
PMID:41366679
|
研究论文 | 本研究通过代谢工程改造Komagataella phaffii酵母,优化其中心代谢途径,实现了高效甘露糖合成 | 采用双碳源系统(甘油用于生物质生成,葡萄糖用于甘露糖合成),通过敲除和下调关键基因(如pfk2、pfk1、zwf1)来重定向碳通量,并过表达大肠杆菌来源的磷酸酶基因yniC以促进甘露糖生物合成,最终在发酵中达到约121.1 g/L的甘露糖产量,创下微生物发酵的最高纪录 | NA | 通过代谢工程改造Komagataella phaffii酵母,实现高效甘露糖生产 | Komagataella phaffii酵母及其甘露糖生物合成途径 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因敲除、基因下调、过表达、高细胞密度补料分批发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Komagataella phaffii | 甘露糖生物合成途径的重构,包括碳通量重定向至果糖-6-磷酸积累、抑制副产物生成 | 工业生物技术 |