合成生物学相关文章
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当前共找到 162 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-04-28 |
Advances in the microbial biosynthesis of ʟ-tryptophan and its derivatives
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100046
PMID:42038707
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综述 | 综述L-色氨酸及其衍生物的微生物合成进展 | 系统总结了提高微生物L-色氨酸产量的优化策略及工程菌株在合成高价值衍生物方面的应用，并探讨了合成生物学快速进化为衍生物生产带来的变革性机遇 | 仍存在若干关键瓶颈，但未具体阐述 | 优化微生物合成途径以高效生产L-色氨酸及其衍生物 | L-色氨酸及其衍生物的微生物合成 | 合成生物学 | NA | 微生物合成 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | 生物合成途径 | 医药, 食品 |
| 2 | 2026-04-28 |
Four enzymes from button bush enable de novo biosynthesis of spirooxindole alkaloids in yeast
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100049
PMID:42038706
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研究论文 | 本文从风箱树中发现了四种酶，并在酵母中实现了螺环氧化吲哚生物碱的从头生物合成 | 首次发现并表征了四条酶的级联反应途径，能够在酵母中完全从头合成异育亨宾型氧化吲哚生物碱，阐明了氧化吲哚形成的酶学逻辑 | 未明确提及局限性 | 揭示异育亨宾型氧化吲哚生物碱的生物合成途径并实现其在酵母中的异源重建 | 风箱树中的四种酶（CoAJS、CoHYC3O、CoHYC3R、CoOIS）及相应生物碱产物 | 合成生物学 | NA | 转录组挖掘、生化验证、酶动力学分析、酵母工程改造 | NA | NA | NA | 酵母菌株工程 | 酿酒酵母 | 四酶级联途径，将鹰爪豆碱苷元转化为异育亨宾型氧化吲哚生物碱（米曲菲林、异米曲菲林、uncarine F） | 医药、工业生物技术 |
| 3 | 2026-04-28 |
DeepCodon: A deep learning codon-optimization model to enhance protein expression
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100042
PMID:42038710
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研究论文 | 提出一种名为DeepCodon的深度学习密码子优化模型，用于增强蛋白质表达 | 首次在密码子优化中保留功能上重要的稀有密码子簇，采用条件概率策略保护保守稀有密码子 | 未详细说明模型的泛化能力或在不同宿主物种中的表现 | 开发一种多目标密码子优化工具，平衡宿主密码子偏好、GC含量和mRNA二级结构等因素以提高异源基因表达 | Enterobacteriaceae序列、P450和G3PDH基因 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CNN | 序列数据 | 150万个天然肠杆菌科序列，7种低产量P450和13种AI设计的G3PDH | NA | E. coli | NA | 合成生物学、基因工程 |
| 4 | 2026-04-28 |
Protein design drives synthetic biology research of plant natural products
2025-Dec, Biodesign research
DOI:10.1016/j.bidere.2025.100048
PMID:42038708
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综述 | 本文综述了蛋白质设计技术在植物天然产物合成生物学研究中的前沿进展，探讨如何通过人工智能与合成生物学深度融合解决植物天然产物微生物生产中的关键瓶颈 | 系统阐述了蛋白质设计技术在解决植物天然产物生物合成中未知酶步骤和植物源酶功能表现不佳等难题方面的突破性进展，并强调了人工智能与合成生物学深度融合的潜力 | 未深入讨论蛋白质设计技术的具体实验验证细节及其在工业规模化生产中的实际应用挑战 | 总结蛋白质设计技术在植物天然产物生物合成中的应用，探索解决微生物生产瓶颈的方法 | 植物天然产物及其相关的植物源酶 | 合成生物学 | NA | 蛋白质设计技术 | NA | NA | NA | NA | 微生物系统 | 植物天然产物的生物合成途径 | 医药, 化妆品, 食品 |
| 5 | 2026-04-26 |
Repurposing the bacterial surface display technology for drug delivery
2025-Dec, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115701
PMID:41046872
|
综述 | 本文探讨了细菌表面展示技术用于药物递送的发展现状与未来方向 | 提出利用AlphaFold等计算工具理性设计外膜锚定蛋白，将合成生物学与免疫工程结合推进工程菌临床转化 | 面临监管障碍和微生物稳定性等挑战 | 评估细菌表面展示技术在药物递送中的应用潜力并规划发展路线 | 细菌表面展示系统（包括革兰氏阴性菌和阳性菌的锚定机制） | 机器学习 | 癌症 | 细菌表面展示 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 枯草芽孢杆菌 | 生物传感器, 偶联系统 | 医学, 农业 |
| 6 | 2026-04-17 |
Integrating synthetic biology to understand and engineer the heart, lung, blood, and sleep systems
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101446
PMID:41412113
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综述 | 本文综述了合成生物学在心脏、肺、血液和睡眠系统中的整合应用，以理解和工程化这些系统 | 将合成生物学从微生物扩展到人类系统，实现基因表达、细胞命运和组织组织的精确控制，并整合组学数据与AI引导的电路设计 | 包括递送、转基因稳定性和在生理相关模型中稳健的时空控制等关键挑战 | 理解并工程化心脏、肺、血液和睡眠系统 | 心脏、肺、血液和睡眠系统的细胞和组织 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、动态基因电路、高维生物传感器、组学数据 | 系统级模型、AI引导的电路设计 | 组学数据 | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 人类细胞、组织 | 可调转录调节器、合成组织器、反馈电路 | 医学 |
| 7 | 2026-04-09 |
Engineered bacteria for cancer therapy: Advancements, challenges, and future directions
2025-Dec-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003807
PMID:41243447
|
综述 | 本文综述了工程化细菌在癌症治疗中的最新进展、挑战和未来方向，重点探讨了其作为新型治疗平台的潜力 | 利用工程化细菌选择性定植肿瘤微环境，作为局部递送治疗剂和激发抗肿瘤免疫反应的创新平台 | NA | 探讨工程化细菌在癌症治疗中的应用，以克服传统疗法的局限性 | 工程化细菌及其在癌症治疗中的设计和应用 | 合成生物学 | 癌症 | 基因工程和合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | 可编程生产抗癌有效载荷的合成生物电路 | 医学 |
| 8 | 2026-04-04 |
RNA triplet repeats: improved algorithms for structure prediction and interactions
2025-Dec-10, Algorithms for molecular biology : AMB
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13015-025-00292-8
PMID:41372930
|
研究论文 | 本文研究了由三核苷酸重复序列组成的RNA的最小自由能二级结构，并改进了计算最小自由能和配分函数的算法，同时设计了用于RNA-RNA相互作用的新算法 | 改进了计算RNA三核苷酸重复序列最小自由能和配分函数的算法，并将RNA-RNA相互作用的计算复杂度从阶乘时间优化至指数时间，提出了基于碱基集的相互作用多项式时间算法 | 在TR情况下存在计算复杂性，但通过参数化算法部分解决，未提及实验验证或实际应用限制 | 提高RNA三核苷酸重复序列结构预测和相互作用的计算效率与准确性 | 由三核苷酸重复序列组成的RNA及其相互作用 | 计算生物学 | NA | 最小自由能计算、配分函数计算、RNA-RNA相互作用算法 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 9 | 2026-03-28 |
The secret life of RNA and lipids
2025-12, RNA biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1080/15476286.2025.2526903
PMID:40613519
|
综述 | 本文探讨了RNA与脂质之间的相互作用，包括其化学基础及其对合成生物学、RNA世界和现代细胞生物学的影响 | 综述了RNA与脂质相互作用的新兴领域，提出了利用这些相互作用设计合成系统中RNA传感器和调控元件的可能性 | NA | 探索RNA与脂质相互作用，以推动合成生物学、RNA治疗和细胞调控研究 | RNA和脂质 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | RNA传感器和调控元件 | 医学, 工业生物技术 |
| 10 | 2026-03-25 |
The oxidative rearrangements in bacterial aromatic polyketide biosynthesis
2025-12-10, Natural product reports
IF:10.2Q1
DOI:10.1039/d5np00049a
PMID:40927919
|
综述 | 本文综述了细菌芳香聚酮类化合物生物合成中的氧化重排反应，重点介绍了相关氧化还原酶的催化机制及其在天然产物合成中的应用 | 系统总结了细菌芳香聚酮生物合成中氧化重排反应的酶学机制，包括Baeyer-Villiger和Favorskii型重排、酮还原酶和双加氧酶催化的创新碳骨架重排，以及CYP450或NmrA样蛋白催化的分子间二聚化 | NA | 阐明细菌芳香聚酮生物合成中氧化重排反应的化学和酶学基础，为复杂天然分子的半合成或合成生物学提供生物催化剂 | 细菌芳香聚酮类化合物的生物合成途径及其相关的氧化还原酶 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 11 | 2026-03-24 |
Using Embodied Artificial Intelligence Agents to Automate Biorisk Management Tasks in High-Containment Laboratories
2025-Dec, Applied biosafety : journal of the American Biological Safety Association
IF:0.5Q4
DOI:10.1089/apb.2024.0068
PMID:41868755
|
研究论文 | 本文探讨了在高级别生物安全实验室中，利用人工智能代理自动化生物风险管理任务，以提升安全性和效率 | 提出了一种结合机器学习风险预测模型与具身AI代理的集成系统，用于自动化物理防护任务，减少人为错误和暴露风险 | NA | 通过AI技术增强高级别生物安全实验室的生物风险管理框架，实现安全与效率的优化 | 高级别生物安全实验室中的生物风险管理任务 | 机器学习 | NA | 机器学习、预测风险建模、异常检测 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 12 | 2026-03-13 |
Advanced microbial engineering approaches for biodegradation of pharmaceutical pollutants
2025-12-18, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-025-10238-x
PMID:41410736
|
综述 | 本文综述了利用微生物工程策略高效降解药物污染物的最新进展 | 整合了CRISPR系统、适应性实验室进化、代谢工程、生物强化和生物反应器设计等多种先进技术，并探讨了合成生物学和宏基因组学在应对新兴污染物中的应用 | NA | 开发更有效和可持续的药物污染物生物修复策略 | 药物污染物（如抗癫痫药、抗生素、镇痛药、非甾体抗炎药、激素和防腐剂） | 环境生物技术 | NA | CRISPR系统、适应性实验室进化、代谢工程、生物强化、生物反应器设计、合成生物学、宏基因组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 环境 |
| 13 | 2026-03-13 |
Bioremediation of polycyclic aromatic hydrocarbons contaminated soils/water for environmental remediation
2025-12-01, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-025-10229-y
PMID:41324725
|
综述 | 本文综述了利用微生物进行多环芳烃（PAHs）污染土壤/水体的生物修复方法 | 系统总结了利用特定细菌（如假单胞菌、分枝杆菌等）及其酶系统降解PAHs的机制，并探讨了生物表面活性剂、生物膜、微生物群落以及基因工程、合成生物学和纳米技术等新兴工具在提升修复效率中的作用 | NA | 探讨可持续、环保的多环芳烃污染修复方法 | 多环芳烃（如萘、菲、蒽、芘）污染的土壤和水体 | NA | NA | 微生物降解、基因工程、合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 14 | 2026-02-28 |
Microbiome-driven resistance in cervical cancer therapy: from mechanistic dissection to clinical translation
2025-Dec-29, Expert reviews in molecular medicine
IF:4.5Q2
DOI:10.1017/erm.2025.10029
PMID:41457383
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综述 | 本文综述了微生物组在宫颈癌治疗耐药性中的作用，从机制解析到临床转化的最新进展 | 系统性地将阴道微生物群失调与宫颈癌治疗耐药性联系起来，并提出了基于微生物组的干预策略，包括合成生物学驱动的精准微生物组疗法 | NA | 探讨微生物组如何驱动宫颈癌治疗耐药性，并评估基于微生物组的干预策略的临床转化潜力 | 宫颈癌患者及其相关的阴道微生物组 | NA | 宫颈癌 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程细菌 | NA | 医学 |
| 15 | 2026-02-15 |
Beer yeast breeding in the era of innovation: advances and applications for modern brewing
2025-Dec-16, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03681-6
PMID:41400895
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综述 | 本文系统回顾了现代啤酒酵母育种策略，重点讨论了组学、适应性进化和CRISPR基因组编辑等创新技术在酵母菌株开发中的应用与进展 | 强调了多维策略、高通量筛选平台以及合成生物学与计算模型协同整合在实现精准菌株优化中的重要性，并展望了未来菌株增强技术的发展趋势 | NA | 探讨现代生物技术背景下啤酒酵母育种的最新进展与应用，以满足啤酒行业对定制化风味和品质的多样化市场需求 | 啤酒酵母（酿酒酵母） | NA | NA | 组学技术、适应性进化、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | NA | 食品工业、工业生物技术 |
| 16 | 2026-02-14 |
Bacteriophages as Therapeutic and Biotechnological Agents: Host Interactions, Immune Modulation, and Engineering Strategies
2025-Dec, PHAGE (New Rochelle, N.Y.)
DOI:10.1177/26416549251384321
PMID:41685372
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综述 | 本文综述了噬菌体作为治疗和生物技术工具的最新进展，重点探讨了其与宿主（细菌和真核细胞）的相互作用、免疫调节功能及工程化策略 | 系统整合了噬菌体穿越血脑屏障等组织渗透机制、免疫调节功能与CRISPR抗菌等前沿工程技术的交叉应用 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据验证，且部分新兴工程技术的临床转化潜力仍需进一步评估 | 探讨噬菌体在抗感染治疗和生物技术领域的应用潜力及作用机制 | 噬菌体及其与细菌宿主、真核宿主（包括哺乳动物组织）的相互作用 | 合成生物学 | 多重耐药菌感染 | CRISPR基因编辑、群体感应干扰技术 | NA | 文献综述数据 | NA | CRISPR-Cas系统 | 细菌（噬菌体天然宿主）、哺乳动物细胞 | 非裂解性质粒系统、群体感应干扰回路 | 医学、工业生物技术 |
| 17 | 2026-02-11 |
Microbial Systems Enhancing CAR-Based Therapies: A Synthetic Biology Paradigm for Next-Generation Cancer Immunotherapy
2025-Dec-27, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04679-z
PMID:41454921
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综述 | 本文系统综述了利用合成生物学方法改造微生物系统，以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中面临的挑战 | 提出将工程化益生菌株作为可编程工厂，用于合成抗原、递送共刺激域和调节肿瘤微环境，并通过CRISPR/Cas工程化遗传电路实现治疗载荷的精确时空控制 | 临床转化的主要障碍包括生物防护挑战、对肿瘤归巢特异性的机制理解不完整以及安全性验证要求 | 评估微生物系统作为创新平台，以解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中的局限性，并推动临床转化 | 工程化微生物系统（如大肠杆菌Nissle 1917）及其在CAR-T细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas, 合成生物学方法 | NA | 文献数据（389篇同行评审研究） | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 遗传电路，用于精确时空控制治疗载荷 | 医学 |
| 18 | 2026-02-06 |
Psilocybin: clinical potential, mechanistic insights, and biotechnological advances for scalable production
2025-Dec-31, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04758-0
PMID:41474478
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综述 | 本文综述了裸盖菇素的临床潜力、作用机制及生物技术进展，重点讨论了其作为精神健康治疗候选药物的前景以及通过微生物平台实现规模化生产的生物技术策略 | 整合了裸盖菇素的临床研究、作用机制和生物技术生产进展，强调了利用工程化微生物（如酿酒酵母、构巢曲霉和大肠杆菌）进行异源表达以提高产量（达2000 mg/L）的创新方法 | NA | 探讨裸盖菇素作为生物制药候选物的临床潜力、作用机制及通过生物技术实现可持续规模化生产的途径 | 裸盖菇素（一种来自裸盖菇属蘑菇的色胺衍生生物碱）及其生物合成 | NA | 精神健康疾病 | 异源表达、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母, 构巢曲霉, 大肠杆菌 | 裸盖菇素生物合成途径 | 医药 |
| 19 | 2026-02-03 |
Wheat Plasma Membrane Receptors: Orchestrating Immunity and Bridging to Crop Improvement
2025-Dec-19, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb48010002
PMID:41614833
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综述 | 本文综述了小麦质膜受体的多样性、分类、信号机制及其在植物免疫中的核心作用，并探讨了其在作物改良中的应用潜力 | 系统整合了小麦质膜受体在大型六倍体基因组背景下的功能特征化挑战，并首次详细阐述了其家族规模从10个到3424个成员的巨大差异，以及将基础研究与作物改良策略（如标记辅助选择、基因叠加和受体工程）相连接 | 小麦基因组庞大、基因重复和功能冗余阻碍了质膜受体的功能表征，且遗传冗余和多效性效应是主要障碍 | 阐明小麦质膜受体的功能、信号机制及其在免疫与作物抗病改良中的作用 | 小麦质膜受体，特别是受体样激酶家族 | 植物生物学/作物遗传改良 | 植物病害（如小麦叶锈病） | 多组学、系统生物学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 小麦 | NA | 农业 |
| 20 | 2026-02-03 |
Cancer Reversion Therapy: Prospects, Progress and Future Directions
2025-Dec-15, Current issues in molecular biology
IF:2.8Q3
DOI:10.3390/cimb47121049
PMID:41614813
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综述 | 本文综述了癌症逆转疗法的前景、进展和未来方向，这是一种通过重编程恶性细胞使其恢复为非恶性状态而非摧毁它们的新型治疗范式 | 系统性地整合了癌症逆转疗法的生物学基础、现有策略、新兴技术，并提出了未来发展的关键方向，强调从“摧毁”到“重编程”的范式转变 | 许多报道的“逆转”现象可能只是刺激依赖的可塑性或短暂生长停滞，而非稳定的表型正常化；真正的癌症逆转需要持久、可遗传的表型改变，这在实现上仍面临重大挑战 | 探讨将恶性细胞重编程为非恶性状态的癌症治疗新策略 | 癌症细胞及其微环境 | NA | 癌症 | 单细胞分析、CRISPR基因编辑、患者来源类器官、人工智能 | NA | NA | NA | CRISPR | NA | NA | 医学 |