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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21 | 2026-01-16 |
Decoding necrosome assembly: harmonizing signal amplification and attenuation through optimal RIP3 stoichiometry
2025-Dec-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67098-5
PMID:41436733
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研究论文 | 本研究通过定量STORM和数学建模揭示了坏死小体组装中RIP3与RIP1的最优化学计量比约为3:1,以调控坏死性凋亡的信号放大与衰减 | 首次定义了坏死小体中RIP3与RIP1的最优化学计量比,并发现过度RIP3寡聚化可作为内在尺寸控制机制来衰减信号 | NA | 探究坏死小体组装的时空规则及其在坏死性凋亡中的作用机制 | 坏死小体、RIP3、RIP1、MLKL、Caspase-8、c-FLIP | 分子生物学 | 神经退行性疾病、缺血性损伤、炎症性疾病 | 定量STORM、数学建模 | NA | 成像数据、数学模型 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 22 | 2026-01-16 |
Reconstituting transcription-translation-coupled DNA replication within complex in vitro biological systems
2025-Dec-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67411-2
PMID:41398169
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研究论文 | 本研究开发了一种名为LoopReX的无细胞系统,利用大肠杆菌粗提物重建了转录-翻译耦合的DNA复制过程,为合成生命构建提供了新平台 | 首次使用粗提物而非纯化组分重建TTcDR,引入机器学习优化系统效率,并利用CipB介导的区室化形成人工核样结构 | 系统仍依赖外源添加的phi29和T7聚合酶,且长期稳定性和遗传保真度有待进一步验证 | 在人工系统中重建转录-翻译耦合的DNA复制过程以推进合成生命构建 | 无细胞转录翻译系统与DNA复制机制 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统构建、机器学习优化 | NA | 实验性能数据 | NA | Gibson Assembly, iGEM | 大肠杆菌 | 转录-翻译耦合的DNA复制系统、人工核样区室化结构 | 合成生物学、生物技术、生物混合系统 |
| 23 | 2026-01-15 |
Molecular life sciences in the era of the Fourth Industrial Revolution: sequencing, multi-omics and artificial intelligence
2025-Dec-11, Emerging topics in life sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1042/ETLS20253019
PMID:41385245
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综述 | 本文探讨了第四次工业革命背景下,人工智能与多组学技术在分子生命科学中的整合应用及其未来发展趋势 | 综述了人工智能与低成本高通量测序在多组学领域的结合,实现了前所未有的数据解析速度 | NA | 概述人工智能如何整合到多组学研究中,并预测该领域未来的研究方向 | 分子生命科学中的多组学数据 | 机器学习 | NA | 高通量测序 | NA | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 24 | 2026-01-14 |
Host Factors Promoting the LTR Retrotransposon Life Cycle in Plant Cells: Current Knowledge and Future Directions
2025-Dec-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010374
PMID:41516247
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综述 | 本文综述了植物细胞中促进LTR反转座子生命周期的主机因素,探讨了其与宿主过程的整合及未来研究方向 | 提出整合植物移动组学、转座报告基因、基因组编辑、合成生物学和互作组学来阐明植物特异性机制 | 精确机制在植物中仍不明确,尤其是针对富含LTR反转座子的植物 | 探讨促进植物中LTR反转座子转座的主机蛋白质 | LTR反转座子及其与植物宿主细胞的相互作用 | 植物生物学 | NA | 移动组学、转座报告基因、基因组编辑、合成生物学、互作组学 | NA | 文献分析 | NA | 基因组编辑 | 植物细胞 | NA | 农业 |
| 25 | 2026-01-14 |
Predictive design of tissue-specific mammalian enhancers that function in vivo in the mouse embryo
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.695948
PMID:41497587
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研究论文 | 本研究提出了一种基于深度学习的通用策略,用于设计在小鼠胚胎中可靠发挥功能的组织特异性增强子 | 首次将深度学习模型应用于哺乳动物活体组织的增强子设计,成功实现了在复杂调控环境下对组织特异性基因表达的程序化控制 | 研究仅在小鼠胚胎中验证了三种组织(心脏、肢体、中枢神经系统)的增强子功能,尚未扩展到更多组织类型或成年动物模型 | 开发能够预测和设计在哺乳动物活体组织中有效工作的组织特异性增强子的通用框架 | 小鼠胚胎的心脏、肢体和中枢神经系统组织 | 机器学习 | NA | 深度学习,全基因组染色质可及性分析,迁移学习 | 卷积神经网络(CNN) | 基因组序列数据,染色质可及性数据 | 使用了已验证的人类和小鼠增强子数据进行迁移学习,并设计了15个合成增强子在小鼠胚胎中进行测试 | NA | 小鼠 | 组织特异性基因表达增强子 | 功能基因组学,合成生物学,基因治疗 |
| 26 | 2026-01-14 |
Active learning-guided optimization of cell-free biosensors for lead testing in drinking water
2025-Dec-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66964-6
PMID:41422091
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研究论文 | 本文开发了一种基于机器学习的细胞游离基因表达工作流程,用于优化基于变构转录因子的生物传感器,以检测饮用水中的铅污染 | 采用多目标机器学习引导的细胞游离工作流程,结合方向性标签训练模型,快速优化生物传感器的灵敏度和选择性 | NA | 优化基于变构转录因子的生物传感器,用于环境监测和人类健康中的铅污染检测 | 变构转录因子PbrR作为生物传感器,用于饮用水中的铅检测 | 合成生物学 | NA | 细胞游离基因表达、机器学习模型训练 | 机器学习模型(未指定具体类型) | 序列到功能数据 | NA | CRISPR-Cas9(隐含于定向进化中,但未明确指定),机器学习框架 | 细胞游离系统(无特定宿主生物) | 基于变构转录因子的生物传感器,用于铅检测 | 环境监测 |
| 27 | 2026-01-14 |
Cyanobacteria-Derived Extracellular Vesicles: A Novel Frontier in Drug Delivery and Therapeutics
2025-Dec-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27010004
PMID:41515885
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综述 | 本文综述了蓝藻来源的细胞外囊泡作为新型药物递送载体的潜力、优势、应用领域及面临的挑战 | 首次系统性地探讨蓝藻细胞外囊泡作为专用纳米载体平台的潜力,并与现有合成载体进行比较分析 | 蓝藻细胞外囊泡的大规模分离和表征仍存在挑战,其相对于现有系统的具体优势和局限性尚未被系统总结 | 探索蓝藻细胞外囊泡在药物递送和治疗应用中的潜力 | 蓝藻来源的细胞外囊泡 | NA | 癌症、神经退行性疾病、感染性疾病 | 合成生物学、基因工程 | NA | NA | NA | NA | 蓝藻 | NA | 医药 |
| 28 | 2026-01-13 |
Overcoming the eIF2α Brake in Human Cell-Derived Translation Systems
2025-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.16.688697
PMID:41497621
|
研究论文 | 本研究通过基因编辑和表达调控策略,克服了人源细胞无细胞翻译系统中由eIF2α磷酸化抑制的翻译瓶颈 | 系统探索了在可编辑和难编辑的人源细胞类型中,通过基因编辑eIF2α-S52A、敲除PKR激酶,以及利用piggyBac系统表达GADD34/K3L来绕过eIF2α磷酸化抑制的互补策略 | 基因编辑在某些细胞类型(如原代细胞)中不适用,表达策略可能引入额外的调控复杂性 | 提高人源细胞无细胞翻译系统的翻译效率和生产力 | 人源细胞无细胞翻译系统、eIF2α磷酸化调控机制 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、piggyBac转座子系统、Tet诱导表达系统 | NA | NA | Expi293F悬浮细胞、诱导多能干细胞(iPSCs)、原代人成纤维细胞、心肌细胞 | CRISPR-Cas9, piggyBac | 人源细胞(Expi293F, iPSCs, 原代成纤维细胞, 心肌细胞) | Tet诱导启动子控制的GADD34/K3L表达盒,用于调控eIF2α磷酸化状态 | 医学, 工业生物技术 |
| 29 | 2026-01-10 |
Development and application of synthetic biology tools for improved production of human breast milk components
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.002
PMID:41497495
|
综述 | 本文综述了合成生物学工具在提高人乳成分微生物发酵生产效率和构建细胞工厂方面的应用 | 系统总结了合成生物学工具在优化人乳成分生产中的潜在应用,并探讨了相关细胞工厂构建的挑战与机遇 | NA | 提高人乳成分的微生物发酵生产效率,以降低生产成本、简化制造过程并减少环境污染 | 人乳成分及其在微生物细胞工厂中的合成 | 合成生物学 | NA | 微生物发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 枯草芽孢杆菌, 哺乳动物细胞 | 生物传感器, 代谢途径 | 医药, 食品, 工业生物技术 |
| 30 | 2026-01-10 |
Construction of microbial systems for polyethylene terephthalate degradation
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.07.013
PMID:41497499
|
综述 | 本文综述了用于聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)降解的微生物系统的构建研究现状 | NA | NA | 探讨PET塑料微生物降解的研究现状与未来发展潜力 | 聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)塑料 | 合成生物学 | NA | 微生物降解、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 31 | 2026-01-07 |
Harnessing microalgae for bioproducts: innovations in synthetic biology
2025-Dec-08, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04727-7
PMID:41359128
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综述 | 本文综述了合成生物学在微藻工程中的应用,以促进可持续生物燃料和高价值生物产品的生产 | 整合CRISPR/Cas基因组编辑、模块化克隆系统、合成启动子库和动态环境响应调控电路等最新合成生物学工具,提升微藻代谢途径的精确重编程能力 | 菌株鲁棒性和生物过程转化方面仍存在挑战 | 推动微藻作为可持续生物制造平台的发展,以支持低碳生物经济 | 微藻 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑、模块化克隆系统、合成启动子库、动态调控电路 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 模块化克隆系统 | 微藻 | 动态环境响应调控电路,用于控制脂质和色素生物合成 | 能源, 工业生物技术 |
| 32 | 2026-01-06 |
Dietary Saponins as Antiaging Agents: A Systematic Review of Molecular Mechanisms, Nutritional Intervention, and Product Development
2025-Dec-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12207
PMID:41288460
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综述 | 本文系统综述了膳食皂苷作为抗衰老剂的分子机制、营养干预及产品开发 | 系统总结了膳食皂苷通过多种信号通路(如Nrf2/HO-1、PI3K/Akt等)实现抗衰老的分子机制、构效关系及产品开发,并提出了未来研究方向 | NA | 探讨膳食皂苷的抗衰老作用及其应用潜力 | 膳食皂苷 | NA | 衰老相关疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医药, 食品 |
| 33 | 2026-01-06 |
Pseudomonas spp. and antimicrobial resistance: unlocking new horizons with 1-hydroxyphenazine
2025-Dec, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-025-01355-4
PMID:41045408
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综述 | 本文综述了1-羟基吩嗪(1-HP)作为应对抗菌素耐药性(AMR)的新型抗菌策略的潜力,涵盖其历史、作用机制、生物合成及在农业、生物技术和医学中的应用前景 | 系统整合了1-HP作为毒力因子和治疗支架的双重角色,并强调通过合成生物学、代谢工程和纳米载体递送系统实现规模化生产与毒性降低的创新策略 | NA | 探索应对抗菌素耐药性的新型抗菌策略,重点关注吩嗪类化合物特别是1-HP的潜力 | 1-羟基吩嗪(1-HP)及其作为抗菌剂和抗癌先导化合物的特性 | NA | NA | 合成生物学,代谢工程,纳米载体递送系统,结构修饰(如卤化) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业,生物技术,医学 |
| 34 | 2026-01-04 |
A Review of Receptor Recognition Mechanisms in Coronaviruses
2025-Dec-16, Viruses
DOI:10.3390/v17121628
PMID:41472297
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综述 | 本文综述了冠状病毒家族中不同属的宿主受体识别机制,并总结了病毒受体的鉴定和阐明方法 | 整合结构生物学、多组学、计算预测、合成生物学和人工工程化病毒受体,为阐明冠状病毒-受体相互作用提供了一个强大的框架 | NA | 阐明冠状病毒的受体识别机制,以更好地理解病毒感染、传播和发病机制,并支持广谱抗病毒药物、智能生物传感器和针对新兴冠状病毒的干预策略的开发 | 冠状病毒家族及其宿主受体 | NA | 冠状病毒感染 | 结构生物学、多组学、计算预测、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 35 | 2026-01-04 |
CRISPR Treatments for AI-Designed Synthetic Viruses: Rapid Programmable Countermeasures for Emerging and Engineered Viruses
2025-Dec-05, Viruses
DOI:10.3390/v17121588
PMID:41472258
|
综述 | 本文综述了利用可编程CRISPR技术对抗新兴及人工合成病毒的快速应对策略 | 提出将实时测序、AI辅助gRNA筛选与多重CRISPR盒设计相结合的快速响应管线,并强调多gRNA鸡尾酒疗法、持续基因组监测及自适应gRNA轮换等创新策略 | NA | 构建基于CRISPR的抗病毒对策以应对自然爆发和人工智能设计的生物威胁 | 新兴及人工合成的DNA与RNA病毒 | 合成生物学 | 病毒性疾病 | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas13, 实时测序, AI辅助设计 | NA | 基因组序列 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas13 | NA | 多重CRISPR盒设计 | 医学 |
| 36 | 2026-01-04 |
A Bioorthogonal and Programmable Bacterial Delivery System for Spatiotemporally Targeted Therapy of Solid Tumors
2025-Dec, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240396
PMID:41476656
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研究论文 | 本文设计了一种基于工程化大肠杆菌Nissle 1917的时空靶向递送系统,用于实体瘤治疗,通过叠氮修饰的透明质酸水凝胶和近红外辐射控制,实现安全有效的肿瘤靶向治疗 | 开发了一种结合温度驱动基因状态开关和生物正交水凝胶的时空靶向系统,能精准控制细菌在肿瘤微环境中的治疗输出,增强肿瘤浸润淋巴细胞活性 | NA | 开发一种安全、可编程的细菌递送系统,用于实体瘤的时空靶向治疗,以克服传统细菌疗法对健康组织的潜在危害 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917、叠氮修饰的透明质酸水凝胶、近红外辐射诱导系统 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学工程、温度驱动基因开关、近红外辐射诱导 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 温度驱动的遗传状态开关,用于控制治疗性输出的产生和释放 | 医学 |
| 37 | 2026-01-03 |
Temperature-Dependent Recombinase-Based Genetic Circuits
2025-Dec-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412055
PMID:41465482
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研究论文 | 本文设计并表征了一套基于温度依赖的DNA重组酶遗传电路,通过整合RNA温度计实现基因表达的精确、不可逆控制 | 首次将RNA温度计与位点特异性DNA重组酶整合,实现了温度依赖的不可逆基因表达控制,并展示了空间图案生成、温度梯度记录和可控细胞裂解等创新应用 | 未明确说明电路的长期稳定性、在不同宿主中的普适性以及大规模应用时的能耗问题 | 开发温度调控的遗传电路以实现可编程、空间分辨且不可逆的基因表达控制 | 基于Bxb1丝氨酸重组酶和FourU RNA温度计的遗传电路系统 | 合成生物学 | NA | RNA温度计技术、位点特异性DNA重组技术 | NA | 基因表达数据、空间图案数据 | NA | CRISPR-Cas9(隐含于重组酶系统) | 大肠杆菌(根据合成生物学常规推断) | 温度敏感型重组开关电路,包含RNA温度计调控的重组酶表达模块 | 合成生物学, 生物传感, 生物生产 |
| 38 | 2026-01-03 |
Synthetic Pentatricopeptide Repeat Proteins: Building a Toolkit for Precise RNA Control
2025-Dec-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412033
PMID:41465458
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综述 | 本文综述了合成五肽重复(synPPR)蛋白作为可编程RNA工程工具的最新进展,包括其设计原理、应用及在生物医学领域的潜力 | 利用可预测的氨基酸-核苷酸识别密码理性设计合成PPR蛋白,并将其与催化结构域融合,创建可在多种生物系统中实现精确碱基编辑的可定制酶 | NA | 总结PPR介导的RNA编辑的结构与机制原理,并探讨合成PPR蛋白在RNA工程中的应用前景 | 合成五肽重复(PPR)蛋白及其作为RNA结合因子和编辑工具的特性 | 合成生物学 | RNA介导的疾病 | 理性蛋白质设计、结构域融合 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌, 植物, 人类细胞 | 可编程RNA稳定器、翻译调节器、靶向C-to-U或U-to-C编辑器 | 基础研究, 生物技术, 生物医学 |
| 39 | 2026-01-03 |
Development of the Efficient Electroporation Protocol for Leuconostoc mesenteroides
2025-Dec-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262411933
PMID:41465360
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种适用于肠膜明串珠菌H32-02 Ksu菌株的高效、可重复的电穿孔转化方案 | 首次为该菌株建立了稳定可重复的转化方法,通过顺序优化细胞壁处理、电刺激参数和恢复条件,并结合质粒甲基化模式匹配,使转化效率提升约40倍 | 方法具有菌株特异性,可能不完全适用于其他乳酸菌,且未在更广泛的工业菌株中进行验证 | 克服肠膜明串珠菌的遗传操作障碍,为其代谢工程和合成生物学应用建立高效的基因转移技术 | 肠膜明串珠菌H32-02 Ksu菌株 | NA | NA | 电穿孔转化 | NA | NA | NA | 电穿孔 | 肠膜明串珠菌 | NA | 食品工业, 工业生物技术 |
| 40 | 2026-01-03 |
From Ancient Fermentations to Modern Biotechnology: Historical Evolution, Microbial Mechanisms, and the Role of Natural and Commercial Starter Cultures in Shaping Organic and Sustainable Food Systems
2025-Dec-10, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods14244240
PMID:41464947
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综述 | 本文回顾了天然发酵剂从古代自发发酵到现代生物技术的历史演变,探讨了其微生物机制、全球应用,并与商业发酵剂进行了对比,同时分析了其在有机和可持续食品系统中的角色与未来创新方向 | 系统性地将天然发酵剂的历史演变、微生物机制、全球应用与有机食品生产及可持续发展原则相结合,并探讨了组学技术、合成生物学等新兴创新如何在不损害其真实性的前提下提升其安全性、稳定性和功能性 | 当前监管框架主要集中于酵母,对更广泛的认证构成了挑战和机遇,且天然发酵剂的高微生物多样性虽带来功能韧性,但也引入了可变性和安全性挑战 | 探讨天然发酵剂在塑造有机和可持续食品系统中的作用,并分析其历史发展、微生物机制、应用现状及未来创新路径 | 天然发酵剂(由乳酸菌、酵母和丝状真菌组成的复杂微生物群落)及其在全球各类食品(谷物、豆类、乳制品、蔬菜、饮料、海鲜和肉类)中的应用 | NA | NA | 组学驱动的菌株选择、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 农业, 工业生物技术 |