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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-01-01 |
Psilocybin: clinical potential, mechanistic insights, and biotechnological advances for scalable production
2025-Dec-31, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04758-0
PMID:41474478
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综述 | 本文综述了裸盖菇素的临床潜力、机制见解以及用于可扩展生产的生物技术进展 | 整合了临床研究、机制洞察和生物技术生产方法,强调了微生物平台在工业规模生物合成中的前景,并探讨了生物技术与文化背景的融合 | 未提及具体临床研究的样本量限制或生物技术方法的经济成本详细分析 | 探讨裸盖菇素作为生物制药候选物的临床潜力和可扩展生产方法 | 裸盖菇素及其生物合成 | 生物技术 | 心理健康疾病 | 异源表达、代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 酿酒酵母, 构巢曲霉, 大肠杆菌 | 裸盖菇素生物合成途径 | 医药 |
| 42 | 2026-01-01 |
Neutral theory of cooperative dynamics
2025-Dec-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2515423122
PMID:41417606
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研究论文 | 本文提出了一种基于随机中性理论的合作物种模型,探讨了合作互动在生态系统中的作用 | 模型在经典中性理论基础上引入物种间合作复制的假设,揭示了低迁移率下物种丰度分布的双峰模式及核心合作物种的作用 | NA | 研究合作物种的随机中性理论,以理解合作互动对生物多样性和生态系统稳定性的影响 | 合作物种的动力学行为,包括物种丰度分布、多样性和停留时间 | 生态学 | NA | 随机中性理论建模 | 中性理论模型 | 理论模型数据 | NA | NA | NA | NA | 微生物组研究、合成生物学、生命起源 |
| 43 | 2025-12-31 |
Microbial Systems Enhancing CAR-Based Therapies: A Synthetic Biology Paradigm for Next-Generation Cancer Immunotherapy
2025-Dec-27, Current microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00284-025-04679-z
PMID:41454921
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综述 | 本文系统综述了利用合成生物学方法改造微生物系统以增强CAR免疫疗法在实体瘤治疗中的应用,旨在解决制造可扩展性、肿瘤靶向特异性和抗原异质性等挑战 | 提出将工程化益生菌株作为可编程工厂,用于合成抗原生产、scFv表达、共刺激结构域递送以及肿瘤微环境调节,并利用CRISPR/Cas工程化遗传电路实现治疗载荷的精确时空控制 | 临床转化的关键障碍包括生物防护挑战、对肿瘤归巢特异性的机制理解不完整以及安全性验证要求 | 评估微生物系统作为创新平台,通过合成生物学方法解决CAR免疫疗法在实体瘤应用中的局限性,并弥合临床前进展与临床实施之间的差距 | 工程化益生菌株(如大肠杆菌Nissle 1917)及其在CAR-T细胞疗法中的应用 | 合成生物学 | 癌症 | CRISPR/Cas | NA | NA | 389项同行评议研究(2015-2025年) | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 遗传电路,用于精确时空控制治疗载荷 | 医学 |
| 44 | 2025-12-31 |
Geometric deep learning assists protein engineering. Opportunities and Challenges
2025-Dec-26, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108790
PMID:41456696
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综述 | 本文全面评述了几何深度学习在蛋白质工程中的应用、机遇与挑战 | 系统整合了几何深度学习在蛋白质工程中的方法论原理、架构多样性和性能趋势,强调了其在提升可解释性和泛化能力方面的作用,并提出了将可解释人工智能与基于结构的验证相结合的统一概念框架 | NA | 探讨几何深度学习如何变革蛋白质工程的计算设计流程 | 蛋白质工程中的稳定性预测、功能注释、分子相互作用建模及从头蛋白质设计 | 机器学习 | NA | 几何深度学习 | 几何深度学习模型 | 非欧几里得域数据(空间、拓扑、物理化学特征) | NA | NA | NA | NA | 医学, 工业生物技术 |
| 45 | 2025-12-31 |
Protein-Based Nanostructures: Column-free Biosynthesis of Bundlemer Peptides with Programmable, Orthogonally Reactive Handles for Nanomaterial Construction
2025-Dec-24, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c17204
PMID:41369150
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研究论文 | 本研究开发了一种基于重组表达的、可编程的束状肽(bundlemer)作为模块化构建单元,用于构建复杂的蛋白质纳米结构 | 通过融合pH可切割的intein-inclusion body实现无痕纯化,并整合SpyTag和sortase识别基序,实现了正交反应性连接和精确组装 | NA | 开发模块化生物合成平台,用于构建具有精确结构和功能的蛋白质纳米材料 | 重组表达的束状肽及其融合构建体 | 合成生物学 | NA | 重组表达、TEM、SEC-MALS、SDS-PAGE、DLS | NA | 蛋白质序列、结构图像 | NA | SpyCatcher-SpyTag连接、sortase介导连接 | NA | 模块化束状肽作为构建单元,通过正交连接化学组装成纤维结构和多层纳米笼结构 | 生物材料工程、靶向药物递送、合成生物学 |
| 46 | 2025-12-31 |
Real-Time Monitoring of Microbial Metabolic Dynamics through a Carbon Dot-Functionalized Whole-Cell Electrochemical Biosensor
2025-Dec-24, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c18617
PMID:41395934
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研究论文 | 本研究开发了一种基于碳点功能化全细胞电化学生物传感器的平台,用于实时监测微生物代谢动态 | 通过将碳点工程化微生物与先进循环伏安法相结合,利用量子增强电荷传输机制实现电化学信号近20倍放大,并采用模块化生物架构设计,可跨多种微生物系统无缝适配 | NA | 开发实时监测微生物代谢动态的新型生物传感平台 | 微生物代谢网络及其动态变化 | NA | NA | 碳点工程化、循环伏安法、电化学生物传感 | NA | 电化学信号、代谢物数据 | NA | 碳点功能化、合成生物学 | 微生物(具体种类未指定) | 全细胞生物传感器、模块化生物架构 | 工业生物技术、临床诊断、生物过程优化 |
| 47 | 2025-12-30 |
Synthetic biology for phytohormone production
2025-Dec-27, Current opinion in chemical biology
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.cbpa.2025.102649
PMID:41456574
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综述 | 本文综述了利用合成生物学方法生产植物激素的可持续策略 | 系统评估了合成生物学在植物激素生产中的应用,为农业提供了可持续的替代方案 | NA | 评估合成生物学方法在植物激素生产中的应用 | 植物激素(生长素、赤霉素、水杨酸) | 合成生物学 | NA | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 48 | 2025-12-30 |
[Progress in engineering design and application of electrogenetic systems]
2025-Dec-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250322
PMID:41457542
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综述 | 本文综述了电遗传系统的组成、优势、发展历程、关键响应调控元件及其应用,并展望了该技术在合成生物学中的前景 | 整合电子设备与遗传方法控制基因表达,是合成生物学的新兴交叉领域,具有广泛的应用潜力 | 当前电遗传学存在不足,未来需进一步研究以推动进展 | 总结电遗传系统的发展与应用,为相关研究者提供参考,促进合成生物学中电遗传学研究的进步 | 电遗传系统及其关键响应调控元件(如代谢物转录因子、氧化应激转录因子、哺乳动物核因子) | 合成生物学 | NA | 电遗传技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 基于代谢物转录因子、氧化应激转录因子、哺乳动物核因子等的电遗传调控系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 49 | 2025-12-30 |
[Research progress in applications of iron-based materials in microbial energy conversion]
2025-Dec-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250524
PMID:41457541
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综述 | 本文系统综述了铁基材料在微生物能源转换技术中的应用研究进展,并分析了其促进转换的关键机制 | 系统总结了铁基材料在多种微生物能源转换技术中的应用,并深入分析了其促进转换的机制,为高效耦合系统的构建提供理论支持 | NA | 为高效铁基材料-微生物耦合系统的构建、优化及实际应用提供理论支持和技术参考 | 铁基材料在微生物能源转换技术中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 酶工程 | 微生物 | NA | 能源 |
| 50 | 2025-12-30 |
[Recent advances in the application of synthetic biotechnology in production of 5-aminolevulinic acid]
2025-Dec-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250395
PMID:41457543
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综述 | 本文综述了利用合成生物技术高效生产5-氨基乙酰丙酸的最新进展,包括代谢途径优化、关键酶工程和发酵工艺优化等策略 | 通过重构天然C4和C5途径、开发非天然合成路线,实现了对5-ALA前体代谢通量的精确调控,并结合关键酶的定向进化与理性设计显著提高了催化效率 | 5-ALA的亲脂性弱、稳定性低和生物利用度差等问题降低了其应用效率,如何提高其稳定性和亲脂性是未来需要解决的关键问题 | 构建高效的微生物细胞工厂,实现5-氨基乙酰丙酸的绿色高效工业化生产 | 5-氨基乙酰丙酸 | NA | NA | 代谢途径优化、关键酶工程、发酵工艺优化、定向进化、理性设计 | NA | NA | NA | 合成生物技术 | 大肠杆菌, 谷氨酸棒状杆菌 | 重构天然C4和C5代谢途径、开发非天然合成路线 | 生物医学, 农业, 食品工业 |
| 51 | 2025-12-29 |
Enzyme-driven triplex structure-based DNA logic circuits
2025-Dec-24, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03853-6
PMID:41444625
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研究论文 | 本研究提出了一种基于三链体结构的酶驱动DNA逻辑电路,通过简化链设计和减少信号泄漏,实现了高效、可扩展的生物计算 | 引入了输入-门级联形成三链体结构的设计,显著降低了链复杂度,并利用Bst 3.0聚合酶实现了低泄漏、高速率的运算 | 未明确讨论长期稳定性、体内应用可行性或与其他生物系统的兼容性 | 开发高性能、低泄漏的DNA逻辑电路以推动生物计算发展 | 基于三链体结构的酶驱动DNA逻辑电路 | 合成生物学 | NA | DNA逻辑电路设计、酶驱动反应 | NA | NA | NA | Bst 3.0聚合酶 | NA | 基于三链体结构的逻辑门、多级级联电路(二级/三级)、复杂逻辑电路、大规模平方根运算电路 | 生物传感、数据存储、合成生物学 |
| 52 | 2025-12-29 |
Ectopic expression to synthetic design: Deriving engineering principles of lncRNA-mediated epigenetic regulation
2025-Dec-17, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101478
PMID:41412114
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综述 | 本文综述了从异位表达研究到合成设计的长链非编码RNA(lncRNA)介导的表观遗传调控工程原则 | 探索了低表达lncRNA在染色质调控中的放大效应,并提出了模块化lncRNA元件可组合性策略,用于设计可编程染色质修饰系统 | NA | 推导lncRNA介导的表观遗传调控的工程原则,以实现在基因调控系统中对低水平输入的持久放大 | 长链非编码RNA(lncRNAs)及其在表观遗传调控中的作用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 可编程染色质修饰功能的理性设计系统,如基因剂量校正 | 医学 |
| 53 | 2025-12-29 |
Lipid composition effects on the number and size of liposomes formed by the inverted emulsion method
2025-Dec-11, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2025.12.013
PMID:41383017
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研究论文 | 本研究系统探究了磷脂组成对倒置乳液法制备的脂质体产量和尺寸分布的影响 | 首次系统揭示了带电磷脂替换可显著提升脂质体产量约10倍,并阐明了亲水头基大小在不同沉降方法中的差异化影响 | 研究主要基于鸡蛋卵磷脂体系,未涵盖所有磷脂类型;离心法的强外力可能掩盖部分头基尺寸效应 | 探究脂质组成对倒置乳液法制备脂质体产量与尺寸的影响机制 | 以鸡蛋卵磷脂为基质的脂质体及其在不同磷脂替换下的形成特性 | 合成生物学 | NA | 倒置乳液法、自然沉降法、离心沉降法 | NA | 实验数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 54 | 2025-12-28 |
Traceless Regulation of Genetic Circuitry
2025-Dec-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202519848
PMID:41454732
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综述 | 本文综述了无痕物理诱导基因开关在合成生物学中的应用、挑战与前景 | 探讨了利用光、热、声、磁、电和机械力等无痕物理信号调控基因电路的优势,如更高特异性、时空分辨率和生物电子接口兼容性 | NA | 评估物理诱导无痕基因开关在合成生物学中的影响、挑战及未来发展方向 | 基因开关与合成遗传电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基因开关作为生物控制端口,用于调控合成遗传电路的功能 | 医学, 农业, 可持续能源, 工业生物技术 |
| 55 | 2025-12-28 |
Self-assembling protein cages: from coiled-coil module to machine learning-driven de novo design of next-generation biomaterials
2025-Dec-23, Materials advances
IF:5.2Q2
DOI:10.1039/d5ma00792e
PMID:41446439
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综述 | 本文综述了基于卷曲螺旋或其他模块化蛋白结构域的自组装蛋白笼的工程策略、功能化及其在合成生物学、生物技术和生物医学应用中的定制机会 | 结合模块化蛋白设计、相互作用表面计算设计和基于机器学习的生成式蛋白设计等新概念,推动蛋白笼设计的革命 | NA | 探讨自组装蛋白笼的理性设计及其在合成生物学、生物技术和生物医学领域的应用潜力 | 自组装蛋白笼,包括其结构、功能化和工程策略 | 机器学习 | NA | 模块化蛋白设计,计算设计,机器学习生成式蛋白设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学,生物技术,生物医学 |
| 56 | 2025-12-28 |
Comprehensive Review on DNA Hydrogels and DNA Origami-Enabled Wearable and Implantable Biosensors
2025-Dec-18, Biosensors
DOI:10.3390/bios15120819
PMID:41440300
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综述 | 本文全面综述了DNA水凝胶和DNA折纸技术在可穿戴和植入式生物传感器中的应用,包括其制备方法、传感机制及设备级应用 | 系统比较了DNA水凝胶和DNA折纸两类DNA纳米材料在生物传感中的独特优势,并探讨了与柔性电子、微流控等新兴技术的集成前景,以及AI辅助设计和合成生物学材料的未来发展方向 | NA | 综述DNA纳米技术(特别是DNA水凝胶和DNA折纸)在下一代可穿戴和植入式生物传感器中的发展现状与应用前景 | DNA水凝胶和DNA折纸纳米材料及其构建的生物传感平台 | 生物传感器 | NA | DNA纳米技术、DNA折纸、水凝胶制备、电化学传感、光学传感、等离激元传感 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 57 | 2025-12-27 |
Synthesis of 4-hydroxybenzoic Acid in Escherichia coli by a Modular co-culture System
2025-Dec-26, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05501-z
PMID:41452415
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研究论文 | 本研究构建了一个模块化共培养系统,以葡萄糖为唯一碳源,在大肠杆菌中合成4-羟基苯甲酸 | 首次报道了利用模块化共培养技术,以葡萄糖为唯一碳源合成4-羟基苯甲酸,扩展了该技术的应用范围 | NA | 通过模块化共培养策略,解决单一菌株在代谢途径中承受的代谢负担问题,以生产4-羟基苯甲酸 | 4-羟基苯甲酸的生物合成 | 合成生物学 | NA | 模块化共培养技术 | NA | NA | NA | 代谢工程 | 大肠杆菌 | 将完整的4-羟基苯甲酸合成途径在莽草酸节点处分割为上游和下游模块,分别构建于不同的大肠杆菌菌株中 | 食品, 医药, 化妆品 |
| 58 | 2025-12-27 |
A synthetic biology toolkit for the plasmid-dependent and thermophilic methylotroph Bacillus methanolicus
2025-Dec-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116788
PMID:41447528
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研究论文 | 本研究为质粒依赖型嗜热甲基营养菌Bacillus methanolicus开发了一套全面的合成生物学工具包,并利用该工具包系统解析了其甲基营养机制,实现了菌株稳定性和L-精氨酸生产的工程化改造 | 开发了首个针对B. methanolicus的综合性合成生物学工具包,包括高效电转化方案、CRISPR-Cas9多重基因组编辑方法、多样化的基因整合位点以及云端基因组规模代谢模型iBM822,并首次将大型内源性质粒pBM19整合到染色体中以解决质粒丢失导致的菌株退化问题 | 工具包在非模式微生物中的应用可能仍存在未知限制,工程化菌株的长期稳定性和工业规模应用效果有待进一步验证 | 建立Bacillus methanolicus的合成生物学框架,促进甲基营养机制研究和一碳生物制造应用 | 质粒依赖型嗜热甲基营养菌Bacillus methanolicus及其内源性质粒pBM19 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑、电转化、基因组规模代谢建模 | 基因组规模代谢模型iBM822 | 基因组数据、代谢模型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | Bacillus methanolicus | L-精氨酸反馈调节回路、染色体整合的甲基营养基因簇 | 工业生物技术 |
| 59 | 2025-12-27 |
Microorganism-Based Strategies for the Control of Cyanobacterial Blooms: A Review of Recent Progress
2025-Dec-17, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins17120604
PMID:41441639
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综述 | 本文系统回顾了微生物干预策略在控制蓝藻水华方面的最新进展 | 整合了直接裂解、间接抑制和综合策略,并展望了合成生物学、智能递送系统和多组学技术的应用前景 | 实际应用面临环境适应性、生态安全和监管框架等挑战 | 控制蓝藻水华,以应对富营养化和气候变化加剧的威胁 | 蓝藻水华及其对生态系统和公共健康的影响 | 环境科学 | NA | 微生物干预策略,包括直接裂解、间接抑制和综合方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 60 | 2025-12-27 |
Advances in Microbial Remediation of Heavy Metal-Contaminated Soils: Mechanisms, Synergistic Technologies, Field Applications and Future Perspectives
2025-Dec-12, Toxics
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxics13121069
PMID:41441290
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综述 | 本文系统总结了重金属污染土壤微生物修复领域的进展,涵盖修复机制、协同技术、现场应用及未来展望 | 提出了构建'可预测-可控制-可持续'微生物修复平台的关键要素,并探讨了合成生物学工程菌、AI驱动微生物设计等新兴前沿 | NA | 为研究人员提供全面的知识框架,并为从业者和政策制定者提供决策指导,以推动微生物修复技术向更高效率、可靠性和可扩展性发展 | 重金属污染土壤的微生物修复技术 | 环境科学 | NA | 微生物修复、生物电化学系统(BESs)、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程微生物 | NA | 环境 |