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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 41 | 2026-01-06 |
Dietary Saponins as Antiaging Agents: A Systematic Review of Molecular Mechanisms, Nutritional Intervention, and Product Development
2025-Dec-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12207
PMID:41288460
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综述 | 本文系统综述了膳食皂苷作为抗衰老剂的分子机制、营养干预及产品开发 | 系统总结了膳食皂苷通过多种信号通路(如Nrf2/HO-1、PI3K/Akt等)实现抗衰老的分子机制、构效关系及产品开发,并提出了未来研究方向 | NA | 探讨膳食皂苷的抗衰老作用及其应用潜力 | 膳食皂苷 | NA | 衰老相关疾病 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医药, 食品 |
| 42 | 2026-01-06 |
Pseudomonas spp. and antimicrobial resistance: unlocking new horizons with 1-hydroxyphenazine
2025-Dec, Folia microbiologica
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12223-025-01355-4
PMID:41045408
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综述 | 本文综述了1-羟基吩嗪(1-HP)作为应对抗菌素耐药性(AMR)的新型抗菌策略的潜力,涵盖其历史、作用机制、生物合成及在农业、生物技术和医学中的应用前景 | 系统整合了1-HP作为毒力因子和治疗支架的双重角色,并强调通过合成生物学、代谢工程和纳米载体递送系统实现规模化生产与毒性降低的创新策略 | NA | 探索应对抗菌素耐药性的新型抗菌策略,重点关注吩嗪类化合物特别是1-HP的潜力 | 1-羟基吩嗪(1-HP)及其作为抗菌剂和抗癌先导化合物的特性 | NA | NA | 合成生物学,代谢工程,纳米载体递送系统,结构修饰(如卤化) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业,生物技术,医学 |
| 43 | 2026-01-04 |
A Review of Receptor Recognition Mechanisms in Coronaviruses
2025-Dec-16, Viruses
DOI:10.3390/v17121628
PMID:41472297
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综述 | 本文综述了冠状病毒家族中不同属的宿主受体识别机制,并总结了病毒受体的鉴定和阐明方法 | 整合结构生物学、多组学、计算预测、合成生物学和人工工程化病毒受体,为阐明冠状病毒-受体相互作用提供了一个强大的框架 | NA | 阐明冠状病毒的受体识别机制,以更好地理解病毒感染、传播和发病机制,并支持广谱抗病毒药物、智能生物传感器和针对新兴冠状病毒的干预策略的开发 | 冠状病毒家族及其宿主受体 | NA | 冠状病毒感染 | 结构生物学、多组学、计算预测、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 44 | 2026-01-04 |
CRISPR Treatments for AI-Designed Synthetic Viruses: Rapid Programmable Countermeasures for Emerging and Engineered Viruses
2025-Dec-05, Viruses
DOI:10.3390/v17121588
PMID:41472258
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综述 | 本文综述了利用可编程CRISPR技术对抗新兴及人工合成病毒的快速应对策略 | 提出将实时测序、AI辅助gRNA筛选与多重CRISPR盒设计相结合的快速响应管线,并强调多gRNA鸡尾酒疗法、持续基因组监测及自适应gRNA轮换等创新策略 | NA | 构建基于CRISPR的抗病毒对策以应对自然爆发和人工智能设计的生物威胁 | 新兴及人工合成的DNA与RNA病毒 | 合成生物学 | 病毒性疾病 | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas13, 实时测序, AI辅助设计 | NA | 基因组序列 | NA | CRISPR-Cas9, CRISPR-Cas13 | NA | 多重CRISPR盒设计 | 医学 |
| 45 | 2026-01-04 |
A Bioorthogonal and Programmable Bacterial Delivery System for Spatiotemporally Targeted Therapy of Solid Tumors
2025-Dec, Exploration (Beijing, China)
DOI:10.1002/EXP.20240396
PMID:41476656
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研究论文 | 本文设计了一种基于工程化大肠杆菌Nissle 1917的时空靶向递送系统,用于实体瘤治疗,通过叠氮修饰的透明质酸水凝胶和近红外辐射控制,实现安全有效的肿瘤靶向治疗 | 开发了一种结合温度驱动基因状态开关和生物正交水凝胶的时空靶向系统,能精准控制细菌在肿瘤微环境中的治疗输出,增强肿瘤浸润淋巴细胞活性 | NA | 开发一种安全、可编程的细菌递送系统,用于实体瘤的时空靶向治疗,以克服传统细菌疗法对健康组织的潜在危害 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917、叠氮修饰的透明质酸水凝胶、近红外辐射诱导系统 | 合成生物学 | 实体瘤 | 合成生物学工程、温度驱动基因开关、近红外辐射诱导 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌Nissle 1917 | 温度驱动的遗传状态开关,用于控制治疗性输出的产生和释放 | 医学 |
| 46 | 2026-01-03 |
Temperature-Dependent Recombinase-Based Genetic Circuits
2025-Dec-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412055
PMID:41465482
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研究论文 | 本文设计并表征了一套基于温度依赖的DNA重组酶遗传电路,通过整合RNA温度计实现基因表达的精确、不可逆控制 | 首次将RNA温度计与位点特异性DNA重组酶整合,实现了温度依赖的不可逆基因表达控制,并展示了空间图案生成、温度梯度记录和可控细胞裂解等创新应用 | 未明确说明电路的长期稳定性、在不同宿主中的普适性以及大规模应用时的能耗问题 | 开发温度调控的遗传电路以实现可编程、空间分辨且不可逆的基因表达控制 | 基于Bxb1丝氨酸重组酶和FourU RNA温度计的遗传电路系统 | 合成生物学 | NA | RNA温度计技术、位点特异性DNA重组技术 | NA | 基因表达数据、空间图案数据 | NA | CRISPR-Cas9(隐含于重组酶系统) | 大肠杆菌(根据合成生物学常规推断) | 温度敏感型重组开关电路,包含RNA温度计调控的重组酶表达模块 | 合成生物学, 生物传感, 生物生产 |
| 47 | 2026-01-03 |
Synthetic Pentatricopeptide Repeat Proteins: Building a Toolkit for Precise RNA Control
2025-Dec-14, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412033
PMID:41465458
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综述 | 本文综述了合成五肽重复(synPPR)蛋白作为可编程RNA工程工具的最新进展,包括其设计原理、应用及在生物医学领域的潜力 | 利用可预测的氨基酸-核苷酸识别密码理性设计合成PPR蛋白,并将其与催化结构域融合,创建可在多种生物系统中实现精确碱基编辑的可定制酶 | NA | 总结PPR介导的RNA编辑的结构与机制原理,并探讨合成PPR蛋白在RNA工程中的应用前景 | 合成五肽重复(PPR)蛋白及其作为RNA结合因子和编辑工具的特性 | 合成生物学 | RNA介导的疾病 | 理性蛋白质设计、结构域融合 | NA | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 细菌, 植物, 人类细胞 | 可编程RNA稳定器、翻译调节器、靶向C-to-U或U-to-C编辑器 | 基础研究, 生物技术, 生物医学 |
| 48 | 2026-01-03 |
Development of the Efficient Electroporation Protocol for Leuconostoc mesenteroides
2025-Dec-11, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262411933
PMID:41465360
|
研究论文 | 本研究开发并验证了一种适用于肠膜明串珠菌H32-02 Ksu菌株的高效、可重复的电穿孔转化方案 | 首次为该菌株建立了稳定可重复的转化方法,通过顺序优化细胞壁处理、电刺激参数和恢复条件,并结合质粒甲基化模式匹配,使转化效率提升约40倍 | 方法具有菌株特异性,可能不完全适用于其他乳酸菌,且未在更广泛的工业菌株中进行验证 | 克服肠膜明串珠菌的遗传操作障碍,为其代谢工程和合成生物学应用建立高效的基因转移技术 | 肠膜明串珠菌H32-02 Ksu菌株 | NA | NA | 电穿孔转化 | NA | NA | NA | 电穿孔 | 肠膜明串珠菌 | NA | 食品工业, 工业生物技术 |
| 49 | 2026-01-03 |
From Ancient Fermentations to Modern Biotechnology: Historical Evolution, Microbial Mechanisms, and the Role of Natural and Commercial Starter Cultures in Shaping Organic and Sustainable Food Systems
2025-Dec-10, Foods (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/foods14244240
PMID:41464947
|
综述 | 本文回顾了天然发酵剂从古代自发发酵到现代生物技术的历史演变,探讨了其微生物机制、全球应用,并与商业发酵剂进行了对比,同时分析了其在有机和可持续食品系统中的角色与未来创新方向 | 系统性地将天然发酵剂的历史演变、微生物机制、全球应用与有机食品生产及可持续发展原则相结合,并探讨了组学技术、合成生物学等新兴创新如何在不损害其真实性的前提下提升其安全性、稳定性和功能性 | 当前监管框架主要集中于酵母,对更广泛的认证构成了挑战和机遇,且天然发酵剂的高微生物多样性虽带来功能韧性,但也引入了可变性和安全性挑战 | 探讨天然发酵剂在塑造有机和可持续食品系统中的作用,并分析其历史发展、微生物机制、应用现状及未来创新路径 | 天然发酵剂(由乳酸菌、酵母和丝状真菌组成的复杂微生物群落)及其在全球各类食品(谷物、豆类、乳制品、蔬菜、饮料、海鲜和肉类)中的应用 | NA | NA | 组学驱动的菌株选择、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品, 农业, 工业生物技术 |
| 50 | 2026-01-03 |
Autophagy-Mediated Adaptation: Revealing the Role of Autophagy in Plant Responses to Abiotic Stress
2025-Dec-07, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16121461
PMID:41465134
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综述 | 本文综述了自噬在植物响应干旱、盐分、极端温度和重金属毒性等多种非生物胁迫中的作用及其调控机制 | 系统整合了自噬在非生物胁迫下超越传统营养回收功能的新角色,包括作为胁迫信号传导、激素互作和代谢重编程的核心调控因子,并提出了利用基因组编辑、多组学整合分析和合成生物学等创新策略培育高抗逆作物的新方向 | NA | 阐明自噬在植物适应非生物胁迫中的调控网络,为设计在气候胁迫下保持高产和抗逆性的新一代作物提供理论基础 | 植物自噬过程及其在非生物胁迫响应中的功能 | NA | NA | 基因组编辑、多组学整合分析、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 51 | 2026-01-02 |
Computational design of allulose-responsive biosensor toolbox for auto-inducible protein expression and CRISPRi mediated dynamic metabolic regulation
2025-Dec-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67669-6
PMID:41430049
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研究论文 | 本文通过计算设计开发了一种基于转录因子的阿洛酮糖响应生物传感器工具箱,用于自动诱导蛋白表达和CRISPRi介导的动态代谢调控 | 成功实现了结构引导的计算设计,优化了PsiR的阿洛酮糖响应性,灵敏度提高20倍,并构建了检测范围广泛的PAB盒,同时验证了其在增强LacI-IPTG生物传感器灵敏度中的普适性 | NA | 开发阿洛酮糖触发的调控电路,用于生物技术应用中的动态代谢调控和蛋白表达 | 转录因子PsiR、阿洛酮糖响应生物传感器、CRISPR干扰电路 | 合成生物学 | NA | 结构引导计算设计、CRISPRi | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 阿洛酮糖触发的CRISPR干扰电路、自动诱导蛋白表达系统 | 工业生物技术 |
| 52 | 2026-01-02 |
Advances in functional genomics of major rice pests and pathogens and their molecular interactions with the host: A comprehensive review
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148965
PMID:41232877
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综述 | 本文全面综述了主要水稻病虫害的功能基因组学研究进展及其与宿主的分子互作机制 | 系统总结了水稻免疫的新机制,如效应子触发的自噬降解和环状RNA衍生的防御肽,并提出了整合人工智能、合成生物学和纳米技术的未来研究方向 | 田间应用面临效应子变异、信号串扰理解不完整以及抗性与发育权衡等挑战,许多抗性位点在感病背景下被抑制 | 阐明水稻病虫害的功能基因组学及其与宿主的分子互作机制,以促进可持续作物生产 | 水稻病虫害(害虫和病原体)及其与水稻宿主的分子互作 | 植物功能基因组学 | 水稻病虫害 | 功能基因组学、多组学方法、CRISPR编辑 | NA | 基因组学数据、转录组学数据 | NA | CRISPR | 水稻 | NA | 农业 |
| 53 | 2026-01-01 |
Trends in Customizable Single-Cell Protein Production Enabled by Synthetic Biology: Carbon-Negative Biomanufacturing and Engineered Functionalities
2025-Dec-31, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c08537
PMID:41330641
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综述 | 本文综述了合成生物学如何推动可定制单细胞蛋白生产的趋势,包括碳负生物制造和工程化功能的发展 | 探讨了从糖类到废物衍生流和C1化合物的底物演变,以及通过合成生物学实现营养定制和感官属性编程的新兴策略 | NA | 分析合成生物学在解决单细胞蛋白生产可持续性、效率和可扩展性挑战中的应用 | 单细胞蛋白生产价值链,包括底物、菌株开发、发酵过程和营养定制 | 合成生物学 | NA | 模型驱动代谢工程、数字精准控制发酵 | NA | NA | NA | NA | 工程微生物 | 优化蛋白质生物合成的代谢途径 | 农业, 食品 |
| 54 | 2026-01-01 |
Neutral theory of cooperative dynamics
2025-Dec-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2515423122
PMID:41417606
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研究论文 | 本文提出了一种基于随机中性理论的合作物种模型,探讨了合作互动在生态系统中的作用 | 模型在经典中性理论基础上引入物种间合作复制的假设,揭示了低迁移率下物种丰度分布的双峰模式及核心合作物种的作用 | NA | 研究合作物种的随机中性理论,以理解合作互动对生物多样性和生态系统稳定性的影响 | 合作物种的动力学行为,包括物种丰度分布、多样性和停留时间 | 生态学 | NA | 随机中性理论建模 | 中性理论模型 | 理论模型数据 | NA | NA | NA | NA | 微生物组研究、合成生物学、生命起源 |
| 55 | 2025-12-31 |
Protein-Based Nanostructures: Column-free Biosynthesis of Bundlemer Peptides with Programmable, Orthogonally Reactive Handles for Nanomaterial Construction
2025-Dec-24, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c17204
PMID:41369150
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研究论文 | 本研究开发了一种基于重组表达的、可编程的束状肽(bundlemer)作为模块化构建单元,用于构建复杂的蛋白质纳米结构 | 通过融合pH可切割的intein-inclusion body实现无痕纯化,并整合SpyTag和sortase识别基序,实现了正交反应性连接和精确组装 | NA | 开发模块化生物合成平台,用于构建具有精确结构和功能的蛋白质纳米材料 | 重组表达的束状肽及其融合构建体 | 合成生物学 | NA | 重组表达、TEM、SEC-MALS、SDS-PAGE、DLS | NA | 蛋白质序列、结构图像 | NA | SpyCatcher-SpyTag连接、sortase介导连接 | NA | 模块化束状肽作为构建单元,通过正交连接化学组装成纤维结构和多层纳米笼结构 | 生物材料工程、靶向药物递送、合成生物学 |
| 56 | 2025-12-31 |
Real-Time Monitoring of Microbial Metabolic Dynamics through a Carbon Dot-Functionalized Whole-Cell Electrochemical Biosensor
2025-Dec-24, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c18617
PMID:41395934
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研究论文 | 本研究开发了一种基于碳点功能化全细胞电化学生物传感器的平台,用于实时监测微生物代谢动态 | 通过将碳点工程化微生物与先进循环伏安法相结合,利用量子增强电荷传输机制实现电化学信号近20倍放大,并采用模块化生物架构设计,可跨多种微生物系统无缝适配 | NA | 开发实时监测微生物代谢动态的新型生物传感平台 | 微生物代谢网络及其动态变化 | NA | NA | 碳点工程化、循环伏安法、电化学生物传感 | NA | 电化学信号、代谢物数据 | NA | 碳点功能化、合成生物学 | 微生物(具体种类未指定) | 全细胞生物传感器、模块化生物架构 | 工业生物技术、临床诊断、生物过程优化 |
| 57 | 2025-12-30 |
[Progress in engineering design and application of electrogenetic systems]
2025-Dec-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250322
PMID:41457542
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综述 | 本文综述了电遗传系统的组成、优势、发展历程、关键响应调控元件及其应用,并展望了该技术在合成生物学中的前景 | 整合电子设备与遗传方法控制基因表达,是合成生物学的新兴交叉领域,具有广泛的应用潜力 | 当前电遗传学存在不足,未来需进一步研究以推动进展 | 总结电遗传系统的发展与应用,为相关研究者提供参考,促进合成生物学中电遗传学研究的进步 | 电遗传系统及其关键响应调控元件(如代谢物转录因子、氧化应激转录因子、哺乳动物核因子) | 合成生物学 | NA | 电遗传技术 | NA | NA | NA | NA | NA | 基于代谢物转录因子、氧化应激转录因子、哺乳动物核因子等的电遗传调控系统 | 医学, 工业生物技术 |
| 58 | 2025-12-30 |
[Research progress in applications of iron-based materials in microbial energy conversion]
2025-Dec-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250524
PMID:41457541
|
综述 | 本文系统综述了铁基材料在微生物能源转换技术中的应用研究进展,并分析了其促进转换的关键机制 | 系统总结了铁基材料在多种微生物能源转换技术中的应用,并深入分析了其促进转换的机制,为高效耦合系统的构建提供理论支持 | NA | 为高效铁基材料-微生物耦合系统的构建、优化及实际应用提供理论支持和技术参考 | 铁基材料在微生物能源转换技术中的应用 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 酶工程 | 微生物 | NA | 能源 |
| 59 | 2025-12-30 |
[Recent advances in the application of synthetic biotechnology in production of 5-aminolevulinic acid]
2025-Dec-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.250395
PMID:41457543
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综述 | 本文综述了利用合成生物技术高效生产5-氨基乙酰丙酸的最新进展,包括代谢途径优化、关键酶工程和发酵工艺优化等策略 | 通过重构天然C4和C5途径、开发非天然合成路线,实现了对5-ALA前体代谢通量的精确调控,并结合关键酶的定向进化与理性设计显著提高了催化效率 | 5-ALA的亲脂性弱、稳定性低和生物利用度差等问题降低了其应用效率,如何提高其稳定性和亲脂性是未来需要解决的关键问题 | 构建高效的微生物细胞工厂,实现5-氨基乙酰丙酸的绿色高效工业化生产 | 5-氨基乙酰丙酸 | NA | NA | 代谢途径优化、关键酶工程、发酵工艺优化、定向进化、理性设计 | NA | NA | NA | 合成生物技术 | 大肠杆菌, 谷氨酸棒状杆菌 | 重构天然C4和C5代谢途径、开发非天然合成路线 | 生物医学, 农业, 食品工业 |
| 60 | 2025-12-29 |
Enzyme-driven triplex structure-based DNA logic circuits
2025-Dec-24, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03853-6
PMID:41444625
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研究论文 | 本研究提出了一种基于三链体结构的酶驱动DNA逻辑电路,通过简化链设计和减少信号泄漏,实现了高效、可扩展的生物计算 | 引入了输入-门级联形成三链体结构的设计,显著降低了链复杂度,并利用Bst 3.0聚合酶实现了低泄漏、高速率的运算 | 未明确讨论长期稳定性、体内应用可行性或与其他生物系统的兼容性 | 开发高性能、低泄漏的DNA逻辑电路以推动生物计算发展 | 基于三链体结构的酶驱动DNA逻辑电路 | 合成生物学 | NA | DNA逻辑电路设计、酶驱动反应 | NA | NA | NA | Bst 3.0聚合酶 | NA | 基于三链体结构的逻辑门、多级级联电路(二级/三级)、复杂逻辑电路、大规模平方根运算电路 | 生物传感、数据存储、合成生物学 |