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当前共找到 165 篇文献，本页显示第 81 - 100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 81 | 2025-12-27 |
A synthetic biology toolkit for the plasmid-dependent and thermophilic methylotroph Bacillus methanolicus
2025-Dec-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116788
PMID:41447528
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研究论文 | 本研究为质粒依赖型嗜热甲基营养菌Bacillus methanolicus开发了一套全面的合成生物学工具包，并利用该工具包系统解析了其甲基营养机制，实现了菌株稳定性和L-精氨酸生产的工程化改造 | 开发了首个针对B. methanolicus的综合性合成生物学工具包，包括高效电转化方案、CRISPR-Cas9多重基因组编辑方法、多样化的基因整合位点以及云端基因组规模代谢模型iBM822，并首次将大型内源性质粒pBM19整合到染色体中以解决质粒丢失导致的菌株退化问题 | 工具包在非模式微生物中的应用可能仍存在未知限制，工程化菌株的长期稳定性和工业规模应用效果有待进一步验证 | 建立Bacillus methanolicus的合成生物学框架，促进甲基营养机制研究和一碳生物制造应用 | 质粒依赖型嗜热甲基营养菌Bacillus methanolicus及其内源性质粒pBM19 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9基因组编辑、电转化、基因组规模代谢建模 | 基因组规模代谢模型iBM822 | 基因组数据、代谢模型数据 | NA | CRISPR-Cas9 | Bacillus methanolicus | L-精氨酸反馈调节回路、染色体整合的甲基营养基因簇 | 工业生物技术 |
| 82 | 2025-12-27 |
Microorganism-Based Strategies for the Control of Cyanobacterial Blooms: A Review of Recent Progress
2025-Dec-17, Toxins
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxins17120604
PMID:41441639
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综述 | 本文系统回顾了微生物干预策略在控制蓝藻水华方面的最新进展 | 整合了直接裂解、间接抑制和综合策略，并展望了合成生物学、智能递送系统和多组学技术的应用前景 | 实际应用面临环境适应性、生态安全和监管框架等挑战 | 控制蓝藻水华，以应对富营养化和气候变化加剧的威胁 | 蓝藻水华及其对生态系统和公共健康的影响 | 环境科学 | NA | 微生物干预策略，包括直接裂解、间接抑制和综合方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 环境 |
| 83 | 2025-12-27 |
Advances in Microbial Remediation of Heavy Metal-Contaminated Soils: Mechanisms, Synergistic Technologies, Field Applications and Future Perspectives
2025-Dec-12, Toxics
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/toxics13121069
PMID:41441290
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综述 | 本文系统总结了重金属污染土壤微生物修复领域的进展，涵盖修复机制、协同技术、现场应用及未来展望 | 提出了构建'可预测-可控制-可持续'微生物修复平台的关键要素，并探讨了合成生物学工程菌、AI驱动微生物设计等新兴前沿 | NA | 为研究人员提供全面的知识框架，并为从业者和政策制定者提供决策指导，以推动微生物修复技术向更高效率、可靠性和可扩展性发展 | 重金属污染土壤的微生物修复技术 | 环境科学 | NA | 微生物修复、生物电化学系统(BESs)、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 工程微生物 | NA | 环境 |
| 84 | 2025-12-27 |
Life cycle design of polyhydroxyalkanoates (PHA)
2025-Dec, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaf517
PMID:41438675
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综述 | 本文综述了聚羟基脂肪酸酯（PHA）的全生命周期设计，涵盖微生物底盘工程、海水基生物制造、低能耗下游加工以及废弃处理策略，旨在推动可持续聚合物系统的发展 | 整合合成生物学、材料科学和工业生态学，提出减少淡水使用、能源输入和工艺复杂性的PHA全生命周期设计原则 | 生产成本仍需降低，材料性能有待提升，且缺乏标准化的生物降解和循环经济框架 | 设计可持续的PHA基聚合物系统，实现从生产到废弃的全生命周期环境效益优化 | 聚羟基脂肪酸酯（PHA）及其生产微生物、制造工艺和应用产品 | NA | NA | 微生物底盘工程、海水基生物制造、低能耗下游加工、生命周期评估 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 工业生物技术, 环境, 材料, 医药 |
| 85 | 2025-12-26 |
Orthogonal in vivo and in vitro membrane engineering enables human-like lipid remodeling of bacterial magnetosomes for functional TrkA display
2025-Dec-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.01710-25
PMID:41190832
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研究论文 | 本研究通过正交体内外膜工程技术，重塑细菌磁小体膜脂质组成，使其模拟人类细胞膜，成功增强了人源跨膜受体TrkA的功能性展示 | 首次结合体内磷脂酰胆碱生物合成与体外胆固醇加载技术，实现对细菌磁小体膜的双重脂质工程改造，创建了能模拟人类细胞膜环境的磁性纳米平台 | 未明确说明该技术在其他类型人类膜蛋白中的普适性验证程度，以及长期稳定性数据 | 开发能够模拟人类细胞膜环境的细菌磁小体平台，用于功能性膜蛋白展示与配体筛选 | 磁螺菌（Magnetospirillum）产生的磁小体及人源神经营养因子受体TrkA | 合成生物学 | 阿尔茨海默病、癌症 | 膜脂质工程、磷脂酰胆碱生物合成、胆固醇加载、甲基-β-环糊精处理 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 代谢工程 | 磁螺菌AMB-1 | 磷脂酰胆碱合成酶共表达系统 | 医学、工业生物技术 |
| 86 | 2025-12-26 |
Development of new Thermus thermophilus-Escherichia coli shuttle vectors
2025-Dec-23, Applied and environmental microbiology
IF:3.9Q2
DOI:10.1128/aem.02102-25
PMID:41283684
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研究论文 | 本研究开发了基于Thermus thermophilus的新型穿梭载体pIOK，并验证了其与现有载体的兼容性及稳定性 | 从日本Senami温泉分离的Thermus thermophilus菌株中鉴定了新型复制蛋白和毒素-抗毒素样模块，构建了兼容且高稳定性的穿梭载体系统 | NA | 开发适用于Thermus thermophilus的合成生物学工具，特别是多质粒系统 | Thermus thermophilus菌株及其质粒 | 合成生物学 | NA | 基因组分析、质粒构建、定量PCR、转化实验 | NA | 基因组序列数据、质粒稳定性数据 | 从日本Senami温泉分离的Thermus thermophilus菌株及其质粒 | 质粒克隆、Gibson Assembly | Thermus thermophilus, Escherichia coli | 木聚糖利用途径（约13 kbp）被分割并克隆到两个兼容质粒中，实现功能重构 | 工业生物技术 |
| 87 | 2025-12-26 |
A Reporter System for Assessment of Transcription from Divergently Oriented Promoters in Pseudomonas putida
2025-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00723
PMID:41367291
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研究论文 | 本文开发了一种针对恶臭假单胞菌的质粒基双报告系统，用于同时监测含有反向启动子的启动子区域的基因表达 | 开发了优化的双报告系统，结合荧光蛋白选择、质粒骨架工程和毒素-抗毒素模块，支持无抗生素选择和动态转录评估 | 在测试条件下，基于excludon的转录抑制效率有限 | 研究恶臭假单胞菌的基因调控，开发基因表达监测工具 | 恶臭假单胞菌的启动子区域和基因表达 | 合成生物学 | NA | 质粒工程、荧光报告系统、共聚焦显微镜 | NA | 荧光图像、基因表达数据 | NA | 质粒构建、毒素-抗毒素模块 | 恶臭假单胞菌 | 双报告系统，用于监测反向启动子的转录活动 | 工业生物技术 |
| 88 | 2025-12-26 |
Site-Specific OaAEP1 Mediated Functional Proteins Immobilization on Magnetic Nanoparticles and the Recyclings
2025-Dec-17, Chemistry (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/chem.202502540
PMID:41273006
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研究论文 | 本文开发了一种基于肽连接酶OaAEP1的位点特异性蛋白质固定化策略，用于在磁性纳米颗粒上实现功能蛋白质的定向高效固定 | 利用OaAEP1酶催化N端GL和C端NGL基序的连接，实现了蛋白质在纳米颗粒表面的可控定向固定，避免了传统方法的非特异性结合和活性损失 | NA | 开发一种精确稳定的蛋白质固定化方法，以推进生物催化、生物传感和合成生物学领域的应用 | 功能蛋白质和酶（如荧光蛋白、TEV蛋白酶、Taq聚合酶）在FeO和FeO@SiO磁性纳米颗粒上的固定化 | 合成生物学 | NA | 肽连接酶催化技术 | NA | NA | NA | OaAEP1 | NA | NA | 生物催化, 生物传感, 合成生物学 |
| 89 | 2025-12-26 |
Research progress on the evaluation, screening, and mechanisms of salinity tolerance in Azolla
2025-Dec, Ying yong sheng tai xue bao = The journal of applied ecology
DOI:10.13287/j.1001-9332.202512.035
PMID:41445342
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综述 | 本文综述了红萍耐盐性评价、耐盐种质筛选及其生理与分子机制的研究进展 | 系统总结了红萍-固氮蓝藻共生体系在盐碱地可持续修复中的潜力，并提出了整合基因编辑、合成生物学及共生互作等技术的未来研究方向 | 当前研究存在缺乏统一的评价标准、对耐盐遗传基础理解不完整、对复合胁迫及其机制探索有限等问题 | 筛选和培育耐盐植物，以实现盐碱地的可持续利用 | 红萍及其与固氮蓝藻形成的专性共生体系 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 基因编辑, 合成生物学 | 红萍, 固氮蓝藻 | NA | 农业, 环境 |
| 90 | 2025-12-25 |
Antisense transcription can induce expression memory via stable promoter repression
2025-Dec-20, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03875-1
PMID:41422243
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研究论文 | 本研究探讨了反义转录如何通过稳定启动子抑制诱导基因表达记忆，结合数学模型、基因组学和合成生物学方法 | 建立了定量框架预测反义介导的顺式记忆在生理相关条件下产生，并揭示干细胞在分化过程中调整记忆能力 | 未具体说明实验模型的局限性或样本量不足等问题 | 理解反义转录生成表达记忆的条件和机制 | 反义基因对、小鼠胚胎干细胞（mESCs） | 合成生物学 | NA | 数学模型、基因组学分析、合成生物学方法 | NA | 基因组数据、实验数据 | NA | 合成生物学方法 | 小鼠胚胎干细胞（mESCs） | 反义基因对形成的切换开关，涉及启动子抑制和染色质状态 | 医学 |
| 91 | 2025-12-25 |
Exploring lipid diversity and minimalism to define membrane requirements for synthetic cells
2025-Dec, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70131
PMID:40787853
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综述 | 本文探讨了构建模拟生物细胞基本功能的合成细胞时，脂质多样性与简约性在定义膜需求方面的作用 | 对比了自下而上和自上而下两种构建合成细胞的方法，并强调了膜蛋白与其周围脂质环境之间关键相互作用的重要性 | NA | 定义自繁殖合成细胞所需的最小脂质组要求 | 合成细胞的脂质膜 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 生物技术, 环境科学 |
| 92 | 2025-12-24 |
A Novel Salicylaldehyde Dehydrogenase from Alpine Soil Metagenome Reveals a Unique Catalytic Mechanism
2025-Dec, Applied biochemistry and biotechnology
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s12010-025-05445-4
PMID:41182549
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研究论文 | 本研究从高山土壤宏基因组中发现并全面表征了一种新型水杨醛脱氢酶（SALD），揭示了其独特的催化机制和生态意义 | 首次实验表征了Alphaproteobacterial来源的SALD，发现其形成独特的进化分支，并提出了涉及ASN-137等残基的非经典催化配置模型 | 高浓度金属和溶剂会抑制酶活性，且对脂肪醛的催化效率较低 | 探索高山土壤宏基因组中新型酶的催化机制及其生态和生物技术应用 | 从高山土壤宏基因组中获得的SALD酶 | NA | NA | 宏基因组学、系统发育分析、动力学分析、差示扫描荧光法、结构比对和分子对接 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物修复、合成生物学 |
| 93 | 2025-12-22 |
Engineered Peptide Scrambling for Enhanced Drug Delivery to Resistant Breast Cancer Cells via Small Extracellular Vesicles
2025-Dec-15, ACS applied bio materials
IF:4.6Q2
DOI:10.1021/acsabm.5c00582
PMID:41321158
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研究论文 | 本研究开发了一种通过工程化肽序列扰乱来增强小细胞外囊泡靶向药物递送至耐药乳腺癌细胞的方法 | 利用双报告平台定量评估肿瘤归巢肽功能化小细胞外囊泡的结合，并通过氨基酸序列扰乱设计增强结合能力的肽变体，结合机械刺激提高药物负载效率 | 方法主要基于体外细胞实验，尚未进行体内验证；技术对小细胞外囊泡表面靶向部分的表征仍有限制 | 优化肿瘤靶向药物递送，克服耐药性 | 乳腺癌细胞（MDA-MB-231）和HEK293FT细胞 | 合成生物学 | 乳腺癌 | 生物发光测定、荧光显微镜、小细胞外囊泡工程 | NA | 体外细胞实验数据 | 24种扰乱变体肽在MDA-MB-231细胞中评估 | 细胞外囊泡表面功能化 | HEK293FT细胞 | 肿瘤归巢肽功能化的小细胞外囊泡作为靶向药物递送系统 | 医学 |
| 94 | 2025-12-22 |
DrEFO: A Fermented Oil Rich in Dihydroquercetin With High Antioxidant Activity
2025-Dec, Journal of cosmetic dermatology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/jocd.70612
PMID:41413727
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研究论文 | 本研究通过合成生物学方法改造酿酒酵母生产二氢槲皮素，并利用其发酵制备富含二氢槲皮素的十一籽发酵油（DrEFO），评估其抗氧化及促进胶原合成的护肤功效 | 首次通过合成生物学改造酵母生产二氢槲皮素并用于植物油发酵，显著提升天然油的抗氧化活性与护肤价值，开创了利用发酵技术增强天然油护肤功效的新策略 | 研究主要基于体外化学实验和细胞模型，缺乏完整的动物实验或人体临床试验数据验证实际护肤效果 | 提升天然植物油的护肤功效，解决其因功效不足难以应对复杂皮肤问题 | 二氢槲皮素（DHQ）及其发酵制备的十一籽发酵油（DrEFO） | 合成生物学 | NA | 发酵工程、DPPH/ABTS/羟基/超氧阴离子/PTIO/ROS自由基清除实验、细胞模型 | NA | 化学实验数据、细胞实验数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母（S. cerevisiae） | 用于生产二氢槲皮素（DHQ）的代谢途径 | 化妆品、护肤品 |
| 95 | 2025-12-21 |
A Modular and Customizable CRISPR/Cas Toolkit for Epigenome Editing of Cis-regulatory Modules
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503917
PMID:41024337
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研究论文 | 本文开发了一种模块化CRISPR/Cas工具包，用于表观基因组编辑，以解析和工程化顺式调控模块的功能 | 开发了基于dead Cas9的DNA去甲基化（dCd）和DNA甲基化（dCm）平台，实现了对顺式调控模块的可编程编辑和跨物种移植性研究 | NA | 研究表观遗传标记如何因果影响顺式调控模块功能，并开发工具进行工程化调控 | 顺式调控元件和模块，包括植物和酵母中的表观遗传调控 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas表观基因组编辑，包括DNA甲基化和去甲基化技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物，酿酒酵母 | 逻辑门控基因调控，输入响应型合成表观基因组编辑器 | 合成生物学，性状设计 |
| 96 | 2025-12-21 |
Engineering the Link: From Genome Interaction Maps to Functional Insight
2025-Dec, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202500525
PMID:41221676
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综述 | 本文探讨了如何利用基因组工程方法（如锌指蛋白、TALEs和CRISPR-Cas9）来靶向操控3D染色质结构，以揭示基因组结构与功能之间的因果联系 | 通过合成策略重新布线增强子-启动子通信，利用可编程DNA结合平台进行3D基因组工程，作为合成生物学的新支柱 | 当前方法在效率、可扩展性和特异性方面存在限制 | 理解并最终重编程基因组功能，特别是通过操控染色质结构来建立因果联系 | 3D染色质架构，特别是DNA环，以及增强子-启动子相互作用 | 合成生物学 | NA | 染色体构象捕获测序，基因组工程 | NA | 基因组相互作用数据 | NA | 锌指蛋白, TALEs, CRISPR-Cas9 | NA | 增强子-启动子通信的重布线，工程化染色质环 | 医学, 工业生物技术 |
| 97 | 2025-12-20 |
Patchoulol: Bioactive Properties, Synthase Catalytic Mechanisms, and Biosynthetic Progress ── a Review
2025-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00552
PMID:41311191
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综述 | 本文综述了广藿香醇的生物活性、其合酶的催化机制以及生物合成研究进展 | 系统总结了广藿香醇合酶的环化机制假说，并讨论了利用合成生物学和代谢工程提高其生物合成产量的可行策略 | NA | 探讨广藿香醇的生物活性、生物合成机制及其大规模生产的潜在应用前景 | 广藿香醇（一种三环倍半萜醇） | 合成生物学 | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 香水，化妆品，医药 |
| 98 | 2025-12-20 |
Environmental Census: Modeling Synthetic Biology Ecological Risk with Metagenomic Enzymatic Data and High-Performance Computing
2025-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00618
PMID:41335476
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研究论文 | 本研究开发了一个名为Environmental Census的Python软件包，用于预测工程微生物的环境范围，通过功能注释相似性评估其生态风险 | 利用公开可用的复合宏基因组数据，结合高性能计算，开发了一种新的风险评估工具，能预测工程微生物在农业-水循环等环境中的潜在定殖风险 | 工具依赖于公开的宏基因组数据，可能无法覆盖所有环境；风险评估基于相似性，可能忽略其他生态因素 | 评估合成生物学中工程微生物的生态风险，辅助其安全设计和管理 | 工程微生物，特别是细菌生物农药，以及农业-水循环环境中的微生物群落 | 计算生物学 | NA | 宏基因组测序，高性能计算 | NA | 宏基因组数据 | 基于公开的复合宏基因组数据库，具体样本数量未指定 | NA | 工程微生物（如细菌生物农药） | NA | 环境，农业 |
| 99 | 2025-12-20 |
Construction and Functional Characterization of a Heterologous Quorum Sensing Circuit in Clostridium sporogenes
2025-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00628
PMID:41359820
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研究论文 | 本研究在严格厌氧的革兰氏阳性菌Clostridium sporogenes中构建并功能表征了一个异源群体感应（QS）电路，利用agr-QS系统实现密度依赖性基因调控 | 首次在严格厌氧菌中成功工程化agr群体感应系统，扩展了合成生物学工具包，为细菌疗法和代谢工程提供了新机会 | NA | 工程化革兰氏阳性菌中的群体感应系统，以实现密度依赖性基因调控 | 严格厌氧的革兰氏阳性菌Clostridium sporogenes | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS | NA | NA | NA | agr-QS系统 | Clostridium sporogenes | 异源群体感应电路，基于agr-QS系统，包括自诱导肽（AIP）生产和QS调控的GFP报告基因 | 医学, 工业生物技术 |
| 100 | 2025-12-20 |
Unveiling the landscape of prokaryotic global regulators through deep protein language models
2025-Dec-17, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00950-25
PMID:41283681
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研究论文 | 本研究利用深度蛋白质语言模型，系统性地揭示了原核生物全局调节因子的多样性及其进化结构 | 开发了一个基于深度学习的大规模框架，能够识别远程同源物和新型全局调节因子，超越了传统基于相似性或结构域的方法 | NA | 系统性绘制原核生物全局调节因子的调控景观，以理解其多样性和进化动力学 | 14,800个细菌和古菌类型菌株基因组中的全局调节因子样蛋白质 | 自然语言处理 | NA | 深度蛋白质语言模型 | 深度学习模型 | 蛋白质序列 | 14,800个细菌和古菌类型菌株基因组，包含超过270,000个全局调节因子样蛋白质 | NA | NA | NA | 合成生物学 |