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当前共找到 187 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-12-18 |
Deciphering guanidine assimilation and riboswitch-based gene regulation in cyanobacteria for synthetic biology applications
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2519335122
PMID:41343670
|
研究论文 | 本研究揭示了蓝藻中肌基的代谢途径及其核糖开关调控机制，并开发了基于肌基核糖开关的合成生物学工具 | 首次在蓝藻中系统阐明肌基通过GdmH酶的同化途径，发现并验证了肌基-I核糖开关的高亲和力结合特性，并成功将其应用于蓝藻异源基因表达的精确可调控系统 | 未完全阐明蓝藻在>1 mM肌基浓度下的其他摄取机制，且研究主要基于模式蓝藻PCC 6803，在其他蓝藻中的普适性需进一步验证 | 解析蓝藻中肌基代谢的分子机制并开发合成生物学调控工具 | 蓝藻（特别是集胞藻PCC 6803）的肌基代谢基因簇、转运系统及核糖开关 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、启动子融合、体内基因表达调控 | NA | 分子生物学实验数据、生长表型数据 | 集胞藻PCC 6803野生型及突变株 | 核糖开关工程、启动子组合设计 | 蓝藻（集胞藻PCC 6803） | 基于肌基-I核糖开关的基因表达调控回路，实现异源基因的剂量依赖性精确控制 | 工业生物技术 |
| 102 | 2025-12-17 |
Mapping human neurodevelopment-Brain organoids meet lineage tracing
2025-Dec-16, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70250
PMID:41400133
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综述 | 本文综述了脑类器官结合谱系追踪技术在研究人类神经发育中的应用现状与前景 | 整合组学技术的新型谱系追踪系统以空前分辨率解析复杂人类生物过程，为合成生物学工具在脑类器官研究中的应用创造新机遇 | 现有技术存在保真度、可扩展性和转化相关性方面的局限性，需要进一步改进 | 利用脑类器官研究人类发育过程中细胞谱系与时间进程相关的生物学过程 | 脑类器官（三维体外自组织系统） | 合成生物学 | NA | 谱系追踪系统、组学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 103 | 2025-12-17 |
Beer yeast breeding in the era of innovation: advances and applications for modern brewing
2025-Dec-16, Biotechnology letters
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s10529-025-03681-6
PMID:41400895
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综述 | 本文系统回顾了现代啤酒酵母育种策略，重点讨论了组学、适应性进化和CRISPR基因组编辑等创新技术在提升发酵性能和开发定制化菌株方面的应用 | 强调了多维度策略、高通量筛选平台以及合成生物学与计算建模协同整合在实现精准菌株优化中的重要性，并展望了未来菌株增强技术的发展趋势 | NA | 探讨在创新时代背景下啤酒酵母育种的进展与应用，以满足现代酿造业对定制化啤酒特性的多样化市场需求 | 啤酒酵母 | NA | NA | 组学技术、适应性进化、CRISPR基因组编辑 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 啤酒酵母 | NA | 食品、工业生物技术 |
| 104 | 2025-12-17 |
SUPER: Upcycling Genetic Parts for Precise Gene Expression Control, Leakage Minimization, and Genetic Circuit Stability
2025-Dec-15, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514653
PMID:41397952
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SUPER的模块化平台，用于升级改造遗传部件，以精确控制基因表达、最小化泄漏并提高遗传电路稳定性 | 提出了一种无需修改目标调控元件序列即可通过小RNA作为附加控制器来调节基因表达模式的新方法，灵感来源于拮抗调控机制 | NA | 为合成生物学中构建具有所需规格的集成合成电路提供替代方法，克服序列上下文依赖导致的动态范围窄和泄漏表达问题 | 遗传部件、合成基因电路、细胞重编程 | 合成生物学 | NA | 小RNA调控、遗传电路设计 | NA | NA | NA | SUPER平台 | NA | RNA响应、化学响应、温度响应和蛋白质响应调控器，Holin表达杀伤开关，TlpA36环境传感器作为化学和温度响应双输入杀伤开关 | 生物技术 |
| 105 | 2025-12-17 |
Abiotic stress-induced circular RNAs: Implications for plant stress tolerance
2025-Dec, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110688
PMID:41172760
|
综述 | 本文综述了非生物胁迫诱导的环状RNA在植物胁迫耐受中的作用及其潜在应用 | 系统总结了植物中环状RNA作为竞争性内源RNA调控胁迫响应的机制，并提出了工程化环状RNA作为作物改良的新方向 | 植物中环状RNA的miRNA海绵功能研究仍有限，工程化环状RNA的应用仍处于推测性阶段 | 探讨环状RNA在植物非生物胁迫响应中的功能及其在作物改良中的应用潜力 | 植物环状RNA及其在干旱、盐度、极端温度、金属毒性和营养胁迫中的作用 | 植物分子生物学 | NA | 测序技术 | NA | RNA序列数据 | 多种植物物种 | 合成生物学方法 | 植物 | 工程化环状RNA设计 | 农业 |
| 106 | 2025-12-16 |
CRISPR/Cas9-engineered Bacillus subtilis chassis for tailored chitooligosaccharide production from marine waste chitosan
2025-Dec-14, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02881-z
PMID:41392248
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研究论文 | 本研究建立了一种可持续的生物工艺，利用CRISPR/Cas9工程化的枯草芽孢杆菌底盘，将海洋废弃物壳聚糖转化为高价值的壳寡糖 | 通过CRISPR/Cas9敲除枯草芽孢杆菌内源壳聚糖酶基因，构建工程化底盘菌株，并异源表达优化后的GH46壳聚糖酶，实现了从海洋废弃物到高价值壳寡糖的高效、环保转化 | NA | 开发一种可持续的生物工艺，将海洋废弃物壳聚糖转化为高价值的壳寡糖 | 枯草芽孢杆菌WB800N菌株、来自天蓝色链霉菌的GH46壳聚糖酶（CsnA）、海洋废弃物壳聚糖 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、响应面方法学、MALDI-TOF MS分析、DO-stat控制补料分批发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | 通过敲除内源壳聚糖酶基因（BsCsn）并异源表达融合了AprE信号肽的优化壳聚糖酶（CsnA），构建用于生产壳寡糖的工程化菌株 | 环境, 工业生物技术 |
| 107 | 2025-12-15 |
Adaptive laboratory evolution optimizes an engineered phosphite utilization pathway in Synechococcus elongatus PCC 7942
2025-Dec-12, Journal of bioscience and bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.jbiosc.2025.11.006
PMID:41390308
|
研究论文 | 本研究通过适应性实验室进化优化了集胞藻PCC 7942中工程化的亚磷酸盐利用途径，提高了菌株的生长和亚磷酸盐消耗速率 | 首次在集胞藻中通过长期传代培养实现了工程化亚磷酸盐利用途径的优化，并鉴定出htxBCDE转运蛋白基因的点突变是表型改善的关键 | 研究仅针对单一菌株和特定培养条件，突变对长期遗传稳定性和实际应用环境的影响尚未评估 | 优化工程化微生物的代谢途径以减轻代谢负担并维持生物防护能力 | 集胞藻Synechococcus elongatus PCC 7942工程菌株RH714及其传代进化群体 | 合成生物学 | NA | 适应性实验室进化、长期传代培养、基因测序分析、基因工程改造 | NA | 生长曲线数据、基因序列数据、表型数据 | 原始工程菌株RH714及其传代进化群体 | 基因工程、适应性进化 | Synechococcus elongatus PCC 7942（集胞藻） | 亚磷酸盐依赖型代谢系统，包含htxBCDE转运蛋白基因和ptxD基因簇 | 环境、工业生物技术 |
| 108 | 2025-12-14 |
Advancing Africa's bioeconomy and biosolutions through microbial natural product discovery: unlocking indigenous microbe potential for sustainability
2025-Dec-12, Microbiology and molecular biology reviews : MMBR
IF:8.0Q1
DOI:10.1128/mmbr.00174-25
PMID:41384918
|
综述 | 本文综述了如何通过发掘非洲本土微生物天然产物来推动非洲生物经济发展和可持续生物解决方案 | 整合了BV-BRC数据库分析与文献证据，首次系统梳理了非洲本土传统模型及新兴非模型细菌底盘资源的基因组分布，并提出了利用本土微生物资源促进可持续创新的路线图 | 调查仅限于BV-BRC数据库的数据，未能涵盖所有非洲微生物资源 | 推动非洲生物经济发展，通过微生物天然产物发现促进医疗、农业和工业生物技术创新 | 非洲本土微生物资源，特别是细菌和病毒生物信息学资源中心（BV-BRC）数据库中的传统模型及新兴非模型细菌底盘 | 工业生物技术 | NA | 基因组测序、功能组学、合成生物学 | NA | 基因组数据、文献数据 | NA | NA | 非洲本土微生物（细菌） | NA | 医疗, 农业, 工业生物技术 |
| 109 | 2025-12-14 |
Over-Expression of a Phycocyanin-Interferon Fusion and Differential Cleaving Efficiency in Cyanobacteria (Synechocystis sp. PCC 6803)
2025-Dec-12, Biotechnology and bioengineering
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/bit.70126
PMID:41388596
|
研究论文 | 本研究在蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803中稳定过表达藻蓝蛋白-人干扰素α-2融合蛋白，并比较了TEV和HRV蛋白酶在分离干扰素时的切割效率 | 首次在蓝藻中构建藻蓝蛋白-干扰素融合表达系统，并证明HRV蛋白酶在切割效率上优于TEV蛋白酶及其他近期测试的蛋白酶 | NA | 开发蓝藻作为低成本重组蛋白生产平台，优化融合蛋白的切割和分离方法 | 蓝藻Synechocystis sp. PCC 6803作为宿主，表达藻蓝蛋白CpcB β亚基与人干扰素α-2的融合蛋白 | 合成生物学 | NA | 重组蛋白表达、融合蛋白构建、蛋白酶切割分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | Synechocystis sp. PCC 6803（蓝藻） | 藻蓝蛋白-干扰素融合蛋白，包含TEV或HRV蛋白酶切割位点的合成生物电路 | 工业生物技术 |
| 110 | 2025-12-14 |
Bacillus velezensis LoaP promotes antitermination by antagonizing NusA
2025-Dec-10, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.01429-25
PMID:41147751
|
研究论文 | 本研究揭示了芽孢杆菌NusG同源蛋白LoaP通过特异性拮抗转录因子NusA来促进转录抗终止的分子机制 | 首次在革兰氏阳性细菌中解析了LoaP类NusG同源蛋白的抗终止复合物机制，证明其仅需拮抗NusA即可发挥作用，无需其他因子，这与已知的RfaH范式显著不同 | 研究主要基于体外重建实验，体内生理环境下的调控网络可能更为复杂 | 探究NusG同源蛋白LoaP在细菌转录抗终止中的分子机制 | Bacillus velezensis LoaP蛋白及其调控的difficidin抗生素合成操纵子 | 分子生物学 | NA | RNA聚合酶纯化、转录因子重建、体外转录分析 | NA | 生化实验数据 | NA | NA | Bacillus velezensis（作为研究对象的来源菌） | NA | 合成生物学、天然产物发现 |
| 111 | 2025-12-14 |
Building an expanded bio-based economy through synthetic biology
2025-Dec-06, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108775
PMID:41360191
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综述 | 本文探讨了合成生物学在扩展生物基经济中的作用，包括资源利用、生物转化和未来底盘生物的开发 | 系统性地概述了合成生物学在生物基经济中的近期和长期资源、输出分子以及未来底盘生物的需求，并详细分析了微生物和植物合成生物学的进展与挑战 | NA | 探讨合成生物学如何推动生物基经济的发展，包括资源转化和可持续原料的创建 | 生物基经济中的资源、生物转化过程、微生物和植物合成生物学技术 | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物, 植物 | NA | 能源, 工业生物技术, 环境 |
| 112 | 2025-12-14 |
An Engineered Probiotic Consortium Based on Quorum-Sensing for Colorectal Cancer Immunotherapy
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512744
PMID:40999885
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研究论文 | 本研究设计了一种基于群体感应的工程化益生菌联合体，用于结直肠癌免疫治疗 | 开发了能够整合多种肿瘤微环境信号并通过正交群体感应系统协调多治疗载荷释放的工程化益生菌联合体 | NA | 开发用于癌症治疗的工程化活体生物治疗产品 | 工程化益生菌联合体及其在结直肠癌免疫治疗中的应用 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 合成生物学、群体感应系统 | NA | NA | 使用hPD-L1 MC38肿瘤的人源化PD-1小鼠模型和HT-29肿瘤的人源化外周血单个核细胞小鼠模型 | 合成生物学 | 益生菌 | 正交群体感应系统，能够响应pH值、缺氧和高乳酸水平三种肿瘤微环境参数，控制乳酸消耗酶和PD-L1纳米抗体的释放 | 医学 |
| 113 | 2025-12-12 |
Advancements in photosynthetic efficiency: Pathways, regulation, and biotechnological applications for enhancing crop productivity
2025-Dec-31, Plant signaling & behavior
IF:2.8Q2
DOI:10.1080/15592324.2025.2596483
PMID:41346023
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综述 | 本文综述了通过分子、生化和生物物理策略提高光合作用效率的最新进展，重点讨论了调控过程、基因编辑和合成生物学等生物技术应用，以增强作物生产力和气候适应性 | 系统整合了光合作用调控的关键过程与新兴生物技术（如CRISPR/Cas9和合成生物学），提出了通过优化光能利用、改造光呼吸和光保护途径以及工程化C₄和CAM性状来克服长期生化与解剖学限制的创新策略 | NA | 提高作物光合作用效率以增强农业生产力并应对未来全球粮食需求 | 光合作用过程及其调控机制，以及相关的作物改良策略 | NA | NA | 基因组编辑（特别是CRISPR/Cas9）、合成生物学、系统建模、高通量表型分析、多组学分析、计算建模 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas9 | C₃作物、C₄作物、CAM作物 | 光合作用途径的理性重设计、C₄和CAM性状工程化、光保护与光呼吸途径改造 | 农业 |
| 114 | 2025-12-12 |
A modular two-component protein cage for spatially organized enzymatic assembly and enhanced metabolic flux
2025-Dec-10, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb01129a
PMID:41250881
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研究论文 | 本文提出了一种模块化的双组分蛋白质笼支架，用于空间组织酶组装并增强代谢通量 | 开发了首个基于正交SpyTag/SpyCatcher和SnoopTag/SnoopCatcher系统的双组分蛋白质笼支架，实现了活细胞内可编程的蛋白质共定位与组装时序控制 | 未在更复杂的代谢途径或多细胞系统中验证支架性能，长期稳定性与规模化应用潜力有待进一步研究 | 构建空间组织化的多酶组装体以增强代谢工程效率 | 双组分蛋白质笼支架I5232及其酶复合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、正交生物共轭系统 | NA | 荧光成像数据、代谢产物定量数据 | NA | SpyTag/SpyCatcher, SnoopTag/SnoopCatcher | 活细胞（未指定具体物种） | 膜靶向肽引导的酶空间定位系统，用于构建类胡萝卜素代谢途径的底物通道 | 代谢工程、工业生物技术 |
| 115 | 2025-12-12 |
Fluoride-Triggered Protein Activation via a Genetically Encoded Tyrosine Analogue
2025-Dec-10, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c13604
PMID:41296558
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研究论文 | 本文提出了一种基于基因编码的氟化物响应非经典氨基酸的蛋白质激活平台，用于在活细胞中实现蛋白质活性的时空调控 | 开发了基于二甲基硫代膦酰酪氨酸（DTPY）的基因编码执行器平台，首次实现氟化物触发的蛋白质特异性激活 | NA | 开发一种通用的蛋白质活性时空调控策略 | 超折叠绿色荧光蛋白和Cre重组酶 | 合成生物学 | NA | 基因编码非经典氨基酸技术 | NA | NA | NA | 基因编码技术 | 活细胞 | 氟化物响应型蛋白质开关 | 合成生物学, 细胞工程 |
| 116 | 2025-12-12 |
InsiliCoil: An Integrated Software Suite for Coiled Coil Design, Prediction, and Therapeutic Engineering
2025-Dec-10, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00678
PMID:41370672
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研究论文 | 介绍了一个名为InsiliCoil的集成软件套件，用于卷曲螺旋的设计、预测和治疗性工程 | 将预测建模、选择性肽抑制剂发现和正交相互作用组设计统一到一个可访问的框架中，提供比基于结构方法快几个数量级的通量 | NA | 开发一个用于控制螺旋介导的蛋白质-蛋白质相互作用的软件平台，以加速治疗发现和可编程生物系统的理性工程 | 卷曲螺旋（CCs）作为合成生物学中的模块化、可编程构建块和治疗靶点 | 合成生物学 | NA | 预测建模、高通量筛选、计算设计 | NA | 蛋白质序列数据、实验数据集 | NA | InsiliCoil软件套件 | NA | 正交卷曲螺旋网络，用于合成生物电路和生物材料 | 医学, 工业生物技术 |
| 117 | 2025-12-12 |
Rna triplet repeats: improved algorithms for structure prediction and interactions
2025-Dec-10, Algorithms for molecular biology : AMB
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13015-025-00292-8
PMID:41372930
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研究论文 | 本文研究了由三核苷酸重复序列构成的RNA的最小自由能二级结构预测及RNA间相互作用，提出了改进的计算算法 | 针对三核苷酸重复RNA，改进了最小自由能和配分函数的计算算法，并为RNA-RNA相互作用设计了新算法，将阶乘时间复杂度降低至指数级 | 对于三核苷酸重复序列的情况，计算上存在困难，仅能获得参数化算法 | 开发更高效的算法来预测三核苷酸重复RNA的二级结构及其相互作用 | 由三核苷酸重复序列构成的RNA分子 | 计算生物学 | NA | RNA二级结构预测算法 | 最小自由能模型 | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 118 | 2025-12-12 |
Synthetic tunable promoters for flexible control of multi-gene expression in mammalian cells
2025-Dec, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.008
PMID:39938795
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研究论文 | 本研究构建了一个多样化的合成可调启动子库，用于在哺乳动物细胞中灵活控制多基因表达 | 设计了同时包含通用激活位点和特异性激活位点的合成可调启动子，结合CRISPRa系统实现多层级表达控制，并通过大规模平行报告基因检测验证了其正交性和可调性 | NA | 构建合成可调启动子库以实现哺乳动物细胞中多基因表达的灵活控制 | 合成可调启动子及其在哺乳动物细胞多基因系统中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR激活系统、大规模平行报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | 24,960个独特的非冗余启动子 | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 包含通用激活位点和特异性激活位点的合成启动子，用于构建多基因表达系统 | 基因治疗、生物技术 |
| 119 | 2025-12-12 |
Receptor dimerization enables ligand discrimination through tunable response heterogeneity
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013781
PMID:41336286
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研究论文 | 本文通过数学模型探讨了配体-受体相互作用如何使细胞群体通过响应异质性编码配体身份，揭示了受体二聚化在配体识别中的新机制 | 提出了配体识别可在群体水平通过响应异质性实现的新机制，特别强调了异二聚体受体在调控群体响应异质性中的功能优势 | 研究基于数学模型，可能未完全涵盖体内复杂生物环境的影响，且主要聚焦于特定信号通路如I型干扰素通路 | 探究细胞如何通过信号通路在群体水平区分不同配体信号，以理解免疫调节和组织发育的机制 | 配体-受体相互作用、细胞群体响应异质性、二聚体受体（特别是异二聚体） | NA | NA | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 120 | 2025-12-11 |
Engineered living materials: emerging frontiers in therapeutic innovation and management of skin disorders
2025-Dec-11, Zeitschrift fur Naturforschung. C, Journal of biosciences
DOI:10.1515/znc-2025-0208
PMID:41369022
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综述 | 本文综述了工程化活性材料在皮肤疾病治疗创新与管理中的新兴前沿，探讨了其作为新型治疗剂的潜力 | 将合成生物学与材料工程相结合，创造出具有实时感知、自适应响应和局部治疗递送功能的动态活性材料系统 | 临床转化面临生物安全性、可扩展性和监管问题等挑战 | 探索工程化活性材料作为皮肤疾病新型治疗平台的开发与应用 | 慢性伤口、烧伤、感染和皮肤病等皮肤并发症 | 合成生物学 | 皮肤病 | 遗传电路工程、支架优化、生物相容性增强 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 细菌, 真菌 | 生物传感器、逻辑门、治疗性肽类释放系统 | 医学 |