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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-12-12 |
Advancements in photosynthetic efficiency: Pathways, regulation, and biotechnological applications for enhancing crop productivity
2025-Dec-31, Plant signaling & behavior
IF:2.8Q2
DOI:10.1080/15592324.2025.2596483
PMID:41346023
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综述 | 本文综述了通过分子、生化和生物物理策略提高光合作用效率的最新进展,重点讨论了调控过程、基因编辑和合成生物学等生物技术应用,以增强作物生产力和气候适应性 | 系统整合了光合作用调控的关键过程与新兴生物技术(如CRISPR/Cas9和合成生物学),提出了通过优化光能利用、改造光呼吸和光保护途径以及工程化C₄和CAM性状来克服长期生化与解剖学限制的创新策略 | NA | 提高作物光合作用效率以增强农业生产力并应对未来全球粮食需求 | 光合作用过程及其调控机制,以及相关的作物改良策略 | NA | NA | 基因组编辑(特别是CRISPR/Cas9)、合成生物学、系统建模、高通量表型分析、多组学分析、计算建模 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas9 | C₃作物、C₄作物、CAM作物 | 光合作用途径的理性重设计、C₄和CAM性状工程化、光保护与光呼吸途径改造 | 农业 |
| 102 | 2025-12-12 |
A modular two-component protein cage for spatially organized enzymatic assembly and enhanced metabolic flux
2025-Dec-10, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb01129a
PMID:41250881
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研究论文 | 本文提出了一种模块化的双组分蛋白质笼支架,用于空间组织酶组装并增强代谢通量 | 开发了首个基于正交SpyTag/SpyCatcher和SnoopTag/SnoopCatcher系统的双组分蛋白质笼支架,实现了活细胞内可编程的蛋白质共定位与组装时序控制 | 未在更复杂的代谢途径或多细胞系统中验证支架性能,长期稳定性与规模化应用潜力有待进一步研究 | 构建空间组织化的多酶组装体以增强代谢工程效率 | 双组分蛋白质笼支架I5232及其酶复合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、正交生物共轭系统 | NA | 荧光成像数据、代谢产物定量数据 | NA | SpyTag/SpyCatcher, SnoopTag/SnoopCatcher | 活细胞(未指定具体物种) | 膜靶向肽引导的酶空间定位系统,用于构建类胡萝卜素代谢途径的底物通道 | 代谢工程、工业生物技术 |
| 103 | 2025-12-12 |
Fluoride-Triggered Protein Activation via a Genetically Encoded Tyrosine Analogue
2025-Dec-10, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c13604
PMID:41296558
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研究论文 | 本文提出了一种基于基因编码的氟化物响应非经典氨基酸的蛋白质激活平台,用于在活细胞中实现蛋白质活性的时空调控 | 开发了基于二甲基硫代膦酰酪氨酸(DTPY)的基因编码执行器平台,首次实现氟化物触发的蛋白质特异性激活 | NA | 开发一种通用的蛋白质活性时空调控策略 | 超折叠绿色荧光蛋白和Cre重组酶 | 合成生物学 | NA | 基因编码非经典氨基酸技术 | NA | NA | NA | 基因编码技术 | 活细胞 | 氟化物响应型蛋白质开关 | 合成生物学, 细胞工程 |
| 104 | 2025-12-12 |
Synthetic tunable promoters for flexible control of multi-gene expression in mammalian cells
2025-Dec, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.008
PMID:39938795
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研究论文 | 本研究构建了一个多样化的合成可调启动子库,用于在哺乳动物细胞中灵活控制多基因表达 | 设计了同时包含通用激活位点和特异性激活位点的合成可调启动子,结合CRISPRa系统实现多层级表达控制,并通过大规模平行报告基因检测验证了其正交性和可调性 | NA | 构建合成可调启动子库以实现哺乳动物细胞中多基因表达的灵活控制 | 合成可调启动子及其在哺乳动物细胞多基因系统中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR激活系统、大规模平行报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | 24,960个独特的非冗余启动子 | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 包含通用激活位点和特异性激活位点的合成启动子,用于构建多基因表达系统 | 基因治疗、生物技术 |
| 105 | 2025-12-12 |
Receptor dimerization enables ligand discrimination through tunable response heterogeneity
2025-Dec, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013781
PMID:41336286
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研究论文 | 本文通过数学模型探讨了配体-受体相互作用如何使细胞群体通过响应异质性编码配体身份,揭示了受体二聚化在配体识别中的新机制 | 提出了配体识别可在群体水平通过响应异质性实现的新机制,特别强调了异二聚体受体在调控群体响应异质性中的功能优势 | 研究基于数学模型,可能未完全涵盖体内复杂生物环境的影响,且主要聚焦于特定信号通路如I型干扰素通路 | 探究细胞如何通过信号通路在群体水平区分不同配体信号,以理解免疫调节和组织发育的机制 | 配体-受体相互作用、细胞群体响应异质性、二聚体受体(特别是异二聚体) | NA | NA | 数学模型 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 106 | 2025-12-11 |
Engineered living materials: emerging frontiers in therapeutic innovation and management of skin disorders
2025-Dec-11, Zeitschrift fur Naturforschung. C, Journal of biosciences
DOI:10.1515/znc-2025-0208
PMID:41369022
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综述 | 本文综述了工程化活性材料在皮肤疾病治疗创新与管理中的新兴前沿,探讨了其作为新型治疗剂的潜力 | 将合成生物学与材料工程相结合,创造出具有实时感知、自适应响应和局部治疗递送功能的动态活性材料系统 | 临床转化面临生物安全性、可扩展性和监管问题等挑战 | 探索工程化活性材料作为皮肤疾病新型治疗平台的开发与应用 | 慢性伤口、烧伤、感染和皮肤病等皮肤并发症 | 合成生物学 | 皮肤病 | 遗传电路工程、支架优化、生物相容性增强 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 细菌, 真菌 | 生物传感器、逻辑门、治疗性肽类释放系统 | 医学 |
| 107 | 2025-12-11 |
Advances in Producing Health-Promoting Punicic Acid: From Extraction Technologies to Cutting-Edge Biotechnology Innovations
2025-Dec-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12722
PMID:41284366
|
综述 | 本文综述了促进健康pun酸的生产进展,从提取技术到前沿生物技术创新 | 探讨了微波、超声波、酶辅助和超临界流体辅助提取技术,以及合成生物学在植物和微生物中优化pun酸积累的生物技术进展 | NA | 提高pun酸的产量、纯度和稳定性,以促进其在功能性食品中的广泛应用 | pun酸(一种ω-5多不饱和脂肪酸) | NA | NA | 微波提取、超声波提取、酶辅助提取、超临界流体辅助提取、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物、微生物 | 调整脂肪酸谱以促进pun酸积累 | 食品、工业生物技术 |
| 108 | 2025-12-11 |
Nanotechnology-based cytokine delivery strategies in gastrointestinal cancers
2025-Dec, Cytokine & growth factor reviews
IF:9.3Q1
DOI:10.1016/j.cytogfr.2025.11.002
PMID:41242181
|
综述 | 本文综述了基于纳米技术的细胞因子递送策略在胃肠道癌症治疗中的应用、优势与挑战 | 系统总结了利用脂质体、聚合物纳米颗粒、外泌体、水凝胶和智能纳米载体等纳米平台实现细胞因子的靶向、可控和持续释放,以增强抗肿瘤免疫并克服传统细胞因子疗法的局限性 | 仍面临生物屏障、细胞因子不稳定性、免疫原性以及制造复杂性等挑战 | 探讨纳米技术驱动的细胞因子递送平台如何改善胃肠道癌症免疫疗法的疗效与安全性 | 胃肠道癌症(包括结直肠癌、胃癌和食管癌)及其肿瘤微环境 | NA | 胃肠道癌症 | 纳米技术递送平台(脂质体、聚合物纳米颗粒、外泌体、水凝胶、智能纳米载体等) | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 109 | 2025-12-10 |
Methyltransferase Detection Based on Target-Responsive Transcription Amplification of Light-Up Aptamer
2025-Dec-09, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c05886
PMID:41296341
|
研究论文 | 开发了一种基于目标响应转录扩增的DNA甲基转移酶检测新方法 | 提出了一种名为MTA的简单、无标记、通用策略,利用Broccoli RNA光敏适配体和转录扩增实现高灵敏度检测,并支持逻辑门设计和多目标检测 | NA | 开发高灵敏度、高特异性的DNA甲基转移酶检测方法 | DNA甲基转移酶(如Dam和M.SssI MTase) | 合成生物学 | NA | 转录扩增、光敏适配体检测 | NA | 荧光信号 | NA | NA | NA | 基于甲基化响应开关的转录调控电路,支持逻辑门设计 | 生物医学 |
| 110 | 2025-12-10 |
Phenotyping and Selection of Cells Using Mass Spectrometry and a Microfluidic Droplet Printer
2025-Dec-09, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c05032
PMID:41309380
|
研究论文 | 本文介绍了一种结合液滴电喷雾电离质谱与微流控电压介导液滴打印机的系统,用于无标记细胞表型分析和选择 | 整合液滴电喷雾电离质谱与微流控电压介导液滴打印机,实现在线分析和捕获含细胞液滴,提供无标记表型分析和选择能力 | 系统操作速率限制在0.4-1.2液滴/秒范围内,可能影响高通量筛选效率 | 开发一种高通量、无标记的细胞表型分析和选择方法 | 含细胞的微流控液滴 | 合成生物学 | NA | 液滴电喷雾电离质谱、微流控电压介导液滴打印 | NA | 质谱数据、图像数据 | NA | NA | 微生物细胞 | NA | 合成生物学、酶工程 |
| 111 | 2025-12-09 |
Discovery of a Heme-Dependent Enzyme Catalyzing Nitrogen-Nitrogen Bond Formation in Kinamycin Biosynthesis
2025-Dec-08, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202513778
PMID:41137433
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研究论文 | 本文报道了在kinamycin生物合成中,发现了一种依赖血红素的新酶Alp1J,它催化氮-氮键的形成,并与伴侣铁氧还蛋白Alp1I形成稳定复合物以保护辅因子 | 首次鉴定出属于血红素依赖酶新家族的Alp1J,能催化kinamycin生物合成中的氮-氮键形成,并揭示其与伴侣铁氧还蛋白Alp1I的复合物对活性的关键作用 | NA | 探究kinamycin和lomaiviticin等天然产物中氮-氮键形成的生物合成机制 | kinamycin生物合成途径中的酶Alp1J及其伴侣铁氧还蛋白Alp1I | NA | NA | 定点诱变、生化研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 112 | 2025-12-09 |
Next-Generation Probiotics in Allergy Therapy: Scientific Evidence and Clinical Applications
2025-Dec-04, Anti-inflammatory & anti-allergy agents in medicinal chemistry
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综述 | 本文综述了下一代益生菌在过敏性疾病治疗中的科学证据和临床应用 | 探讨了下一代益生菌(如Akkermansia muciniphila、Faecalibacterium prausnitzii)相比传统益生菌更具靶向性的免疫调节和肠道屏障修复作用 | 存在菌株特异性、剂量、免疫受损个体安全性以及监管分类问题 | 评估益生菌在过敏性疾病免疫调节和肠道屏障功能恢复中的治疗潜力 | 过敏性疾病(如特应性皮炎、过敏性鼻炎、哮喘、食物过敏)及其免疫失调机制 | NA | 过敏性疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 113 | 2025-12-09 |
Engineering Protocell Networks for Prototissue Development
2025-Dec, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500376
PMID:40177794
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综述 | 本文综述了将原始细胞组装成原始组织的方法,以模拟生物组织的层次结构和复杂功能 | 系统探讨了多种原始细胞模型的构建及其组装成具有通信、集体行为等功能的原始组织的化学与物理方法,为合成生物学和再生医学提供了设计思路 | NA | 探索原始细胞组装成原始组织的构建方法、特性及其在生物医学中的应用潜力 | 原始细胞模型(如脂质囊泡、聚合物囊泡、蛋白质体、无膜凝聚层、乳液液滴)及其组装形成的原始组织 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物医学, 再生医学 |
| 114 | 2025-12-08 |
Directed evolution-driven reprogramming of PD-L1 for compact and tunable checkpoint modulation
2025-Dec-05, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00577-x
PMID:41345880
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研究论文 | 本研究通过酵母表面展示定向进化技术,开发了一种紧凑且可调控的PD-L1变体,用于增强PD-1结合亲和力并改善免疫检查点抑制剂的治疗潜力 | 利用定向进化技术改造PD-L1,获得双突变体(DM),其PD-1结合亲和力比野生型提高173倍,同时保持低免疫原性,并通过结构建模揭示了亲和力增强的分子机制 | NA | 开发一种紧凑、可调控的PD-L1变体,以克服传统IgG类检查点抑制剂的局限性,如分子尺寸大和Fc效应介导的T细胞耗竭 | PD-L1蛋白变体及其与PD-1的相互作用 | 合成生物学 | 癌症 | 酵母表面展示定向进化、计算机免疫原性分析、结构建模、功能测定 | NA | 蛋白质序列、结构模型、细胞培养数据 | NA | 定向进化 | 酵母 | NA | 医学 |
| 115 | 2025-12-08 |
A Modular T7 RNA Polymerase Toolbox Linking Selective miRNA Detection to Signal Amplification and Protein Expression
2025-Dec-03, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c16214
PMID:41258773
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研究论文 | 本文介绍了一种基于T7 RNA聚合酶的工具箱,用于选择性miRNA检测、信号放大和蛋白质表达 | 开发了无泄漏的T7 RNAP工具箱,通过模块化T7-Locks实现选择性寡核苷酸检测和门控转录,具有高正交性和超过100的开关比 | NA | 构建一个可编程的合成生物学平台,连接输入感知、放大和输出合成 | miRNA检测、转录调控和蛋白质表达系统 | 合成生物学 | NA | T7 RNA聚合酶工具箱、细胞无转录-翻译系统 | NA | 寡核苷酸序列、蛋白质表达数据 | NA | T7 RNAP工具箱、T7-Locks、C12间隔子 | 细胞无系统 | 模块化T7-Locks、正反馈信号放大电路、门控转录系统 | 医学、工业生物技术 |
| 116 | 2025-12-08 |
Advances in the microbial biosynthesis of therapeutic terpenoids
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103374
PMID:41161185
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综述 | 本文综述了利用合成生物学和代谢工程在微生物中生物合成治疗性萜类化合物的最新进展 | 总结了利用自动化、机器学习和人工智能等新兴方法加速微生物生物合成研究的新兴策略 | NA | 促进治疗性萜类化合物的微生物生物合成,以实现规模化生产和经济可行的成本目标 | 天然及新型萜类化合物(如青蒿素、紫杉醇、长春花碱、QS-21和环巴胺) | NA | NA | 合成生物学,代谢工程 | NA | NA | NA | NA | 大肠杆菌,酿酒酵母 | NA | 医药 |
| 117 | 2025-12-07 |
Expanding the quorum sensing toolbox: Promoter libraries and hybrid promoter for dynamic genetic circuits
2025-Dec-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.09.004
PMID:40945582
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研究论文 | 本文通过构建启动子库和设计新型混合启动子,扩展了群体感应工具箱,用于动态遗传电路的优化与应用 | 创建了P(LasI/LasR)和P(EsaI/EsaR)系统的启动子库,并设计了一种新型混合启动子,需要两种自诱导剂激活,实现了多阶段遗传开关的动态控制 | NA | 扩展群体感应工具箱,优化动态遗传电路的设计与调谐 | 群体感应系统、启动子库、混合启动子、遗传电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | NA | 多阶段遗传开关,包括生长阶段和两个顺序生产阶段,使用混合启动子实现动态控制 | 工业生物技术 |
| 118 | 2025-12-07 |
Characterization and orthogonality assessment of two quorum sensing systems for synthetic biology applications
2025-Dec-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.08.001
PMID:40835148
|
研究论文 | 本研究全面表征了LasI/LasR和EsaI/EsaR两种群体感应系统在大肠杆菌中的功能,并评估了它们的正交性以避免交叉干扰 | 首次在模型宿主大肠杆菌中全面表征这两种群体感应系统,并通过突变策略解决了系统间的交叉干扰问题,实现了功能正交 | 研究仅在大肠杆菌中进行,未在其他宿主中验证,且突变体可能影响系统在其他环境下的性能 | 优化和标准化群体感应系统以扩展合成生物学应用范围 | LasI/LasR和EsaI/EsaR两种群体感应系统 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, 理性设计突变 | 大肠杆菌 | 群体感应系统,包括启动子、信号分子和合酶组件 | 工业生物技术 |
| 119 | 2025-12-07 |
Reengineering of ergosterol biosynthesis in Saccharomyces cerevisiae and its sustainable application in citrus peel processing industry
2025-Dec-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.10.002
PMID:41072655
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研究论文 | 本研究通过合成生物学策略重新工程化酿酒酵母中的麦角固醇生物合成,并探索其在柑橘皮加工工业中的可持续应用 | 首次报道了在酿酒酵母中重新工程化麦角固醇生物合成以抵抗D-柠檬烯胁迫,为柑橘皮加工工业提供可持续生物能源解决方案 | NA | 重新工程化麦角固醇生物合成并应用于柑橘皮加工工业的可持续生物能源开发 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 合成生物学 | NA | 合成生物学策略,包括MVA途径模块、后角鲨烯途径模块和麦角固醇生物合成模块 | NA | NA | 摇瓶和5升生物反应器发酵实验 | 合成生物学策略 | 酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae) | 麦角固醇生物合成途径的重新工程化,涉及MVA途径、后角鲨烯途径和麦角固醇生物合成模块 | 能源, 工业生物技术 |
| 120 | 2025-12-07 |
Monoclonal antibodies production in microbial systems: Current status, challenges and perspectives
2025-Dec-25, New biotechnology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.nbt.2025.10.005
PMID:41075867
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综述 | 本文全面综述了微生物系统生产单克隆抗体的现状、挑战与前景,重点讨论了微生物表达平台的优势、基因编辑与合成生物学技术的应用,以及AI驱动的优化策略 | 系统整合了CRISPR/Cas9基因编辑、合成生物学重建哺乳动物糖基化通路、以及AI驱动的高通量优化等前沿技术,提出微生物平台作为哺乳动物细胞系统的高效替代方案 | 微生物系统在蛋白质正确折叠、翻译后修饰(如糖基化)的精确性方面仍存在局限性,可能影响某些治疗性抗体的功能与安全性 | 探索微生物系统作为单克隆抗体工业化生产的替代平台,以解决传统哺乳动物细胞系统成本高、周期长的问题 | 单克隆抗体(mAbs) | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、合成生物学、AI优化、高通量筛选 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物系统(具体未指定,可能包括大肠杆菌、酵母等) | 哺乳动物糖基化通路重建 | 医药、生物医学研究 |