合成生物学相关文章
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当前共找到 164 篇文献，本页显示第 101 - 120 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 101 | 2025-12-21 |
Engineering the Link: From Genome Interaction Maps to Functional Insight
2025-Dec, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202500525
PMID:41221676
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综述 | 本文探讨了如何利用基因组工程方法（如锌指蛋白、TALEs和CRISPR-Cas9）来靶向操控3D染色质结构，以揭示基因组结构与功能之间的因果联系 | 通过合成策略重新布线增强子-启动子通信，利用可编程DNA结合平台进行3D基因组工程，作为合成生物学的新支柱 | 当前方法在效率、可扩展性和特异性方面存在限制 | 理解并最终重编程基因组功能，特别是通过操控染色质结构来建立因果联系 | 3D染色质架构，特别是DNA环，以及增强子-启动子相互作用 | 合成生物学 | NA | 染色体构象捕获测序，基因组工程 | NA | 基因组相互作用数据 | NA | 锌指蛋白, TALEs, CRISPR-Cas9 | NA | 增强子-启动子通信的重布线，工程化染色质环 | 医学, 工业生物技术 |
| 102 | 2025-12-20 |
Patchoulol: Bioactive Properties, Synthase Catalytic Mechanisms, and Biosynthetic Progress ── a Review
2025-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00552
PMID:41311191
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综述 | 本文综述了广藿香醇的生物活性、其合酶的催化机制以及生物合成研究进展 | 系统总结了广藿香醇合酶的环化机制假说，并讨论了利用合成生物学和代谢工程提高其生物合成产量的可行策略 | NA | 探讨广藿香醇的生物活性、生物合成机制及其大规模生产的潜在应用前景 | 广藿香醇（一种三环倍半萜醇） | 合成生物学 | NA | 合成生物学，代谢工程 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 香水，化妆品，医药 |
| 103 | 2025-12-20 |
Environmental Census: Modeling Synthetic Biology Ecological Risk with Metagenomic Enzymatic Data and High-Performance Computing
2025-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00618
PMID:41335476
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研究论文 | 本研究开发了一个名为Environmental Census的Python软件包，用于预测工程微生物的环境范围，通过功能注释相似性评估其生态风险 | 利用公开可用的复合宏基因组数据，结合高性能计算，开发了一种新的风险评估工具，能预测工程微生物在农业-水循环等环境中的潜在定殖风险 | 工具依赖于公开的宏基因组数据，可能无法覆盖所有环境；风险评估基于相似性，可能忽略其他生态因素 | 评估合成生物学中工程微生物的生态风险，辅助其安全设计和管理 | 工程微生物，特别是细菌生物农药，以及农业-水循环环境中的微生物群落 | 计算生物学 | NA | 宏基因组测序，高性能计算 | NA | 宏基因组数据 | 基于公开的复合宏基因组数据库，具体样本数量未指定 | NA | 工程微生物（如细菌生物农药） | NA | 环境，农业 |
| 104 | 2025-12-20 |
Construction and Functional Characterization of a Heterologous Quorum Sensing Circuit in Clostridium sporogenes
2025-Dec-19, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00628
PMID:41359820
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研究论文 | 本研究在严格厌氧的革兰氏阳性菌Clostridium sporogenes中构建并功能表征了一个异源群体感应（QS）电路，利用agr-QS系统实现密度依赖性基因调控 | 首次在严格厌氧菌中成功工程化agr群体感应系统，扩展了合成生物学工具包，为细菌疗法和代谢工程提供了新机会 | NA | 工程化革兰氏阳性菌中的群体感应系统，以实现密度依赖性基因调控 | 严格厌氧的革兰氏阳性菌Clostridium sporogenes | 合成生物学 | NA | LC-MS/MS | NA | NA | NA | agr-QS系统 | Clostridium sporogenes | 异源群体感应电路，基于agr-QS系统，包括自诱导肽（AIP）生产和QS调控的GFP报告基因 | 医学, 工业生物技术 |
| 105 | 2025-12-20 |
Unveiling the landscape of prokaryotic global regulators through deep protein language models
2025-Dec-17, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00950-25
PMID:41283681
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研究论文 | 本研究利用深度蛋白质语言模型，系统性地揭示了原核生物全局调节因子的多样性及其进化结构 | 开发了一个基于深度学习的大规模框架，能够识别远程同源物和新型全局调节因子，超越了传统基于相似性或结构域的方法 | NA | 系统性绘制原核生物全局调节因子的调控景观，以理解其多样性和进化动力学 | 14,800个细菌和古菌类型菌株基因组中的全局调节因子样蛋白质 | 自然语言处理 | NA | 深度蛋白质语言模型 | 深度学习模型 | 蛋白质序列 | 14,800个细菌和古菌类型菌株基因组，包含超过270,000个全局调节因子样蛋白质 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 106 | 2025-12-20 |
Nanobody CAR-T cells in cancer: From molecular design to clinical translation
2025-Dec, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118819
PMID:41319516
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综述 | 本文综述了基于纳米抗体的嵌合抗原受体T细胞（CAR-T）疗法，从分子设计到临床转化的全过程 | 利用单域抗体（VHH）的结构优势，开发出更紧凑、选择性更高、可模块化设计的纳米抗体CAR-T细胞，以克服传统ScFv CAR-T在折叠、信号传导和免疫原性等方面的问题 | 面临肿瘤异质性、免疫逃逸和T细胞耗竭等挑战 | 探讨纳米抗体CAR-T细胞在癌症治疗中的分子设计、功能优势及临床转化潜力 | 纳米抗体CAR-T细胞 | NA | 血液系统恶性肿瘤，实体瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 双特异性、三价及逻辑门控形式的CAR设计 | 医学 |
| 107 | 2025-12-19 |
Bio-hybrid 6G networks with synthetic biology-enabled base stations for energy-autonomous telecommunications
2025-Dec-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27597-3
PMID:41398187
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研究论文 | 本研究开发了一个全面的数学建模框架，用于评估由合成生物学驱动的生物混合基站（重点利用微生物燃料电池和酶介导的生物能源收集）在6G网络中的可行性、韧性和可持续性 | 首次将电信工程与合成生物学通过一个统一的定量框架联系起来，评估生物混合基站在现实运行条件下的能源自主性、碳排放和系统韧性 | 研究基于模拟结果，需要未来的实验验证、现场试验和大规模部署来证实其实际可行性 | 解决6G网络超密集小基站部署带来的高能耗和碳足迹问题，探索可持续的能源自主通信方案 | 生物混合基站（由合成生物学技术供能） | NA | NA | 合成生物学、微生物燃料电池、酶介导生物能源收集 | 数学建模框架 | 模拟数据 | NA | NA | NA | NA | 电信、能源 |
| 108 | 2025-12-19 |
Recent Advances in Bio-Based Production of Free Heme Using Microbial Metabolic Engineering
2025-Dec, Advanced biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1002/adbi.202500434
PMID:41324255
|
综述 | 本文综述了利用微生物代谢工程生物基生产游离血红素的最新进展 | 系统总结了利用代谢工程和合成生物学策略实现血红素微生物生产的可持续替代方案，并讨论了当前挑战与未来机遇 | NA | 探讨血红素的生物基生产方法，以替代传统的高成本、有伦理和环境问题的生产途径 | 血红素及其卟啉中间体 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 血红素生物合成途径 | 医药、食品添加剂、生物技术 |
| 109 | 2025-12-18 |
Advances and Potential of Aspergillus niger in Industrial Biomanufacturing
2025-Dec-17, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c07467
PMID:41347444
|
综述 | 本文综述了黑曲霉在工业生物制造中的进展与潜力，重点关注其作为细胞工厂生产高价值代谢产物的工程策略 | 总结了利用基因编辑、基因组学和合成生物学技术增强黑曲霉作为高效细胞工厂的最新突破，并强调了共培养诱导和沉默基因簇激活等新兴方法 | NA | 概述黑曲霉在工业生物制造中的最新进展与未来潜力 | 黑曲霉及其作为细胞工厂生产代谢产物的工程策略 | 合成生物学 | NA | 基因编辑、基因组学、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 黑曲霉 | 改善碳源利用、调控代谢途径、增强转运系统、促进产物分泌的工程策略 | 食品、制药、可持续制造 |
| 110 | 2025-12-18 |
Deciphering guanidine assimilation and riboswitch-based gene regulation in cyanobacteria for synthetic biology applications
2025-Dec-09, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2519335122
PMID:41343670
|
研究论文 | 本研究揭示了蓝藻中肌基的代谢途径及其核糖开关调控机制，并开发了基于肌基核糖开关的合成生物学工具 | 首次在蓝藻中系统阐明肌基通过GdmH酶的同化途径，发现并验证了肌基-I核糖开关的高亲和力结合特性，并成功将其应用于蓝藻异源基因表达的精确可调控系统 | 未完全阐明蓝藻在>1 mM肌基浓度下的其他摄取机制，且研究主要基于模式蓝藻PCC 6803，在其他蓝藻中的普适性需进一步验证 | 解析蓝藻中肌基代谢的分子机制并开发合成生物学调控工具 | 蓝藻（特别是集胞藻PCC 6803）的肌基代谢基因簇、转运系统及核糖开关 | 合成生物学 | NA | 基因敲除、启动子融合、体内基因表达调控 | NA | 分子生物学实验数据、生长表型数据 | 集胞藻PCC 6803野生型及突变株 | 核糖开关工程、启动子组合设计 | 蓝藻（集胞藻PCC 6803） | 基于肌基-I核糖开关的基因表达调控回路，实现异源基因的剂量依赖性精确控制 | 工业生物技术 |
| 111 | 2025-12-17 |
Mapping human neurodevelopment-Brain organoids meet lineage tracing
2025-Dec-16, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70250
PMID:41400133
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综述 | 本文综述了脑类器官结合谱系追踪技术在研究人类神经发育中的应用现状与前景 | 整合组学技术的新型谱系追踪系统以空前分辨率解析复杂人类生物过程，为合成生物学工具在脑类器官研究中的应用创造新机遇 | 现有技术存在保真度、可扩展性和转化相关性方面的局限性，需要进一步改进 | 利用脑类器官研究人类发育过程中细胞谱系与时间进程相关的生物学过程 | 脑类器官（三维体外自组织系统） | 合成生物学 | NA | 谱系追踪系统、组学技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 112 | 2025-12-17 |
Abiotic stress-induced circular RNAs: Implications for plant stress tolerance
2025-Dec, Plant physiology and biochemistry : PPB
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.plaphy.2025.110688
PMID:41172760
|
综述 | 本文综述了非生物胁迫诱导的环状RNA在植物胁迫耐受中的作用及其潜在应用 | 系统总结了植物中环状RNA作为竞争性内源RNA调控胁迫响应的机制，并提出了工程化环状RNA作为作物改良的新方向 | 植物中环状RNA的miRNA海绵功能研究仍有限，工程化环状RNA的应用仍处于推测性阶段 | 探讨环状RNA在植物非生物胁迫响应中的功能及其在作物改良中的应用潜力 | 植物环状RNA及其在干旱、盐度、极端温度、金属毒性和营养胁迫中的作用 | 植物分子生物学 | NA | 测序技术 | NA | RNA序列数据 | 多种植物物种 | 合成生物学方法 | 植物 | 工程化环状RNA设计 | 农业 |
| 113 | 2025-12-16 |
CRISPR/Cas9-engineered Bacillus subtilis chassis for tailored chitooligosaccharide production from marine waste chitosan
2025-Dec-14, Microbial cell factories
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12934-025-02881-z
PMID:41392248
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研究论文 | 本研究建立了一种可持续的生物工艺，利用CRISPR/Cas9工程化的枯草芽孢杆菌底盘，将海洋废弃物壳聚糖转化为高价值的壳寡糖 | 通过CRISPR/Cas9敲除枯草芽孢杆菌内源壳聚糖酶基因，构建工程化底盘菌株，并异源表达优化后的GH46壳聚糖酶，实现了从海洋废弃物到高价值壳寡糖的高效、环保转化 | NA | 开发一种可持续的生物工艺，将海洋废弃物壳聚糖转化为高价值的壳寡糖 | 枯草芽孢杆菌WB800N菌株、来自天蓝色链霉菌的GH46壳聚糖酶（CsnA）、海洋废弃物壳聚糖 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑、响应面方法学、MALDI-TOF MS分析、DO-stat控制补料分批发酵 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 枯草芽孢杆菌 | 通过敲除内源壳聚糖酶基因（BsCsn）并异源表达融合了AprE信号肽的优化壳聚糖酶（CsnA），构建用于生产壳寡糖的工程化菌株 | 环境, 工业生物技术 |
| 114 | 2025-12-14 |
An Engineered Probiotic Consortium Based on Quorum-Sensing for Colorectal Cancer Immunotherapy
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512744
PMID:40999885
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研究论文 | 本研究设计了一种基于群体感应的工程化益生菌联合体，用于结直肠癌免疫治疗 | 开发了能够整合多种肿瘤微环境信号并通过正交群体感应系统协调多治疗载荷释放的工程化益生菌联合体 | NA | 开发用于癌症治疗的工程化活体生物治疗产品 | 工程化益生菌联合体及其在结直肠癌免疫治疗中的应用 | 合成生物学 | 结直肠癌 | 合成生物学、群体感应系统 | NA | NA | 使用hPD-L1 MC38肿瘤的人源化PD-1小鼠模型和HT-29肿瘤的人源化外周血单个核细胞小鼠模型 | 合成生物学 | 益生菌 | 正交群体感应系统，能够响应pH值、缺氧和高乳酸水平三种肿瘤微环境参数，控制乳酸消耗酶和PD-L1纳米抗体的释放 | 医学 |
| 115 | 2025-12-12 |
Advancements in photosynthetic efficiency: Pathways, regulation, and biotechnological applications for enhancing crop productivity
2025-Dec-31, Plant signaling & behavior
IF:2.8Q2
DOI:10.1080/15592324.2025.2596483
PMID:41346023
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综述 | 本文综述了通过分子、生化和生物物理策略提高光合作用效率的最新进展，重点讨论了调控过程、基因编辑和合成生物学等生物技术应用，以增强作物生产力和气候适应性 | 系统整合了光合作用调控的关键过程与新兴生物技术（如CRISPR/Cas9和合成生物学），提出了通过优化光能利用、改造光呼吸和光保护途径以及工程化C₄和CAM性状来克服长期生化与解剖学限制的创新策略 | NA | 提高作物光合作用效率以增强农业生产力并应对未来全球粮食需求 | 光合作用过程及其调控机制，以及相关的作物改良策略 | NA | NA | 基因组编辑（特别是CRISPR/Cas9）、合成生物学、系统建模、高通量表型分析、多组学分析、计算建模 | NA | NA | NA | CRISPR/Cas9 | C₃作物、C₄作物、CAM作物 | 光合作用途径的理性重设计、C₄和CAM性状工程化、光保护与光呼吸途径改造 | 农业 |
| 116 | 2025-12-12 |
A modular two-component protein cage for spatially organized enzymatic assembly and enhanced metabolic flux
2025-Dec-10, Journal of materials chemistry. B
DOI:10.1039/d5tb01129a
PMID:41250881
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研究论文 | 本文提出了一种模块化的双组分蛋白质笼支架，用于空间组织酶组装并增强代谢通量 | 开发了首个基于正交SpyTag/SpyCatcher和SnoopTag/SnoopCatcher系统的双组分蛋白质笼支架，实现了活细胞内可编程的蛋白质共定位与组装时序控制 | 未在更复杂的代谢途径或多细胞系统中验证支架性能，长期稳定性与规模化应用潜力有待进一步研究 | 构建空间组织化的多酶组装体以增强代谢工程效率 | 双组分蛋白质笼支架I5232及其酶复合物 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、正交生物共轭系统 | NA | 荧光成像数据、代谢产物定量数据 | NA | SpyTag/SpyCatcher, SnoopTag/SnoopCatcher | 活细胞（未指定具体物种） | 膜靶向肽引导的酶空间定位系统，用于构建类胡萝卜素代谢途径的底物通道 | 代谢工程、工业生物技术 |
| 117 | 2025-12-12 |
Synthetic tunable promoters for flexible control of multi-gene expression in mammalian cells
2025-Dec, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.008
PMID:39938795
|
研究论文 | 本研究构建了一个多样化的合成可调启动子库，用于在哺乳动物细胞中灵活控制多基因表达 | 设计了同时包含通用激活位点和特异性激活位点的合成可调启动子，结合CRISPRa系统实现多层级表达控制，并通过大规模平行报告基因检测验证了其正交性和可调性 | NA | 构建合成可调启动子库以实现哺乳动物细胞中多基因表达的灵活控制 | 合成可调启动子及其在哺乳动物细胞多基因系统中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR激活系统、大规模平行报告基因检测 | NA | 基因表达数据 | 24,960个独特的非冗余启动子 | CRISPR-Cas9 | 哺乳动物细胞 | 包含通用激活位点和特异性激活位点的合成启动子，用于构建多基因表达系统 | 基因治疗、生物技术 |
| 118 | 2025-12-11 |
Engineered living materials: emerging frontiers in therapeutic innovation and management of skin disorders
2025-Dec-11, Zeitschrift fur Naturforschung. C, Journal of biosciences
DOI:10.1515/znc-2025-0208
PMID:41369022
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综述 | 本文综述了工程化活性材料在皮肤疾病治疗创新与管理中的新兴前沿，探讨了其作为新型治疗剂的潜力 | 将合成生物学与材料工程相结合，创造出具有实时感知、自适应响应和局部治疗递送功能的动态活性材料系统 | 临床转化面临生物安全性、可扩展性和监管问题等挑战 | 探索工程化活性材料作为皮肤疾病新型治疗平台的开发与应用 | 慢性伤口、烧伤、感染和皮肤病等皮肤并发症 | 合成生物学 | 皮肤病 | 遗传电路工程、支架优化、生物相容性增强 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, BioBrick, iGEM | 细菌, 真菌 | 生物传感器、逻辑门、治疗性肽类释放系统 | 医学 |
| 119 | 2025-12-11 |
Advances in Producing Health-Promoting Punicic Acid: From Extraction Technologies to Cutting-Edge Biotechnology Innovations
2025-Dec-10, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.5c12722
PMID:41284366
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综述 | 本文综述了促进健康pun酸的生产进展，从提取技术到前沿生物技术创新 | 探讨了微波、超声波、酶辅助和超临界流体辅助提取技术，以及合成生物学在植物和微生物中优化pun酸积累的生物技术进展 | NA | 提高pun酸的产量、纯度和稳定性，以促进其在功能性食品中的广泛应用 | pun酸（一种ω-5多不饱和脂肪酸） | NA | NA | 微波提取、超声波提取、酶辅助提取、超临界流体辅助提取、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 植物、微生物 | 调整脂肪酸谱以促进pun酸积累 | 食品、工业生物技术 |
| 120 | 2025-12-10 |
Methyltransferase Detection Based on Target-Responsive Transcription Amplification of Light-Up Aptamer
2025-Dec-09, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.5c05886
PMID:41296341
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研究论文 | 开发了一种基于目标响应转录扩增的DNA甲基转移酶检测新方法 | 提出了一种名为MTA的简单、无标记、通用策略，利用Broccoli RNA光敏适配体和转录扩增实现高灵敏度检测，并支持逻辑门设计和多目标检测 | NA | 开发高灵敏度、高特异性的DNA甲基转移酶检测方法 | DNA甲基转移酶（如Dam和M.SssI MTase） | 合成生物学 | NA | 转录扩增、光敏适配体检测 | NA | 荧光信号 | NA | NA | NA | 基于甲基化响应开关的转录调控电路，支持逻辑门设计 | 生物医学 |