合成生物学相关文章
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当前共找到 163 篇文献，本页显示第 121 - 140 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 121 | 2025-12-05 |
Integrative Multi-Omics and Artificial Intelligence: A New Paradigm for Systems Biology
2025-Dec, Omics : a journal of integrative biology
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/15578100251392371
PMID:41203247
|
综述 | 本文综述了整合多组学与人工智能在系统生物学中的应用，强调其在癌症生物学、微生物工程和合成生物学中的原理、方法及案例 | 提出整合多组学与人工智能作为系统生物学的新范式，克服高维度、异质性和上下文限制的挑战 | 存在数据异质性和可解释性等当前限制 | 评估多组学整合的原理、方法及应用，以推动生物系统预测模型和生物技术应用 | 基因组、转录组、蛋白质组和代谢组等多组学数据 | 系统生物学 | 癌症 | 高通量组学技术、单细胞组学 | 机器学习 | 多组学数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、工业生物技术 |
| 122 | 2025-12-05 |
Plant-derived peptides: From identification to agronomic applications
2025-Dec-01, Molecular plant
IF:17.1Q1
DOI:10.1016/j.molp.2025.11.004
PMID:41243283
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综述 | 本文综述了植物源肽作为生物农药和生物刺激剂的潜力，并提出了一个整合肽鉴定、分子设计、生物制造和生态评估的框架 | 提出结合人工智能、纳米技术和合成生物学等新兴技术，以克服植物源肽商业化中的瓶颈 | 商业化受限，包括多样性探索不足、生产成本高、生态风险评估不完整和应用场景未定义 | 探索植物源肽作为环保型生物农药和生物刺激剂在农业中的应用潜力 | 植物源肽及其在农业中的鉴定、设计和应用 | 农业生物技术 | NA | 人工智能、纳米技术、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 123 | 2025-12-05 |
PyFuRNAce: an integrated design engine for RNA origami
2025-Dec-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66290-x
PMID:41326357
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研究论文 | 介绍了一个名为pyFuRNAce的开源、基于Python的RNA纳米结构设计软件包，专注于共转录RNA折纸设计 | 开发了首个将RNA折纸完整工作流程（从基序定义到序列生成）集成到单一用户友好平台的集成设计引擎 | NA | 开发用户友好的RNA纳米结构设计工具以推动RNA纳米技术发展 | RNA纳米结构，特别是共转录RNA折纸 | 合成生物学 | NA | 原子力显微镜，共聚焦荧光成像 | NA | NA | NA | NA | NA | RNA折纸纳米结构（包括自组装RNA丝、RNA液滴和大型共转录RNA折纸） | 医学，生物技术，合成生物学 |
| 124 | 2025-12-04 |
Engineered Commensals as Next-Generation Drug Delivery Agents for Nose-to-Brain Therapeutics in Neurological Disorders
2025-Dec-03, ACS chemical neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.1021/acschemneuro.5c00874
PMID:41268975
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综述 | 本文探讨了利用合成生物学和材料工程开发的工程化共生菌作为鼻-脑给药系统，用于治疗中枢神经系统疾病 | 提出将工程化共生菌与鼻内给药途径相结合，绕过血脑屏障，实现中枢神经系统药物的靶向递送 | NA | 开发一种基于工程化共生菌的鼻-脑给药系统，以改善中枢神经系统疾病的治疗 | 中枢神经系统疾病（如阿尔茨海默病、帕金森病、中风、胶质瘤） | 合成生物学 | 神经系统疾病 | 合成生物学、材料工程 | NA | NA | NA | NA | 哺乳动物细胞、细菌、病毒 | 疾病靶向迁移、局部治疗生产、适应性递送、免疫激活、代谢调节 | 医学 |
| 125 | 2025-12-04 |
Techno-economic assessment-guided biofoundry for microbial strain development
2025-Dec-02, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.002
PMID:41330850
|
研究论文 | 本文提出了一种结合机器人辅助模块和实验价格指数来优化合成生物学工作流程及生物铸造厂经济效益的方法 | 定义了机器人辅助模块作为即插即用单元，并引入实验价格指数这一结合时间和成本的标准化指标来评估和优化合成生物学工作流程 | 未提及具体实验验证的样本规模或实际应用案例的详细数据 | 开发一种用于评估和优化生物铸造厂自动化流程经济效益的方法 | 微生物菌株开发工作流程 | 合成生物学 | NA | 机器人自动化、DBTL工作流程 | NA | 实验流程数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 126 | 2025-12-04 |
Fighting citrus Huanglongbing with evolutionary principles
2025-Dec-01, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2025.11.004
PMID:41330792
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综述 | 本文综述了利用进化原理和先进技术（如人工智能与合成生物学）开发可持续农业害虫管理策略，并以柑橘黄龙病为例进行了案例研究 | 提出将进化原理与人工智能、合成生物学相结合，设计精准的生物防治工具，突破传统防治方法加速害虫抗性进化的局限 | NA | 开发基于进化原理的可持续害虫管理策略，以应对农业病虫害 | 柑橘黄龙病（HLB）及其防治 | 农业生物技术 | 柑橘黄龙病 | 人工智能（AI）、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 127 | 2025-12-04 |
Discovery, characterization, and application of chromosomal integration sites in the hyperthermophilic archaeon Sulfolobus islandicus
2025-Dec-01, Trends in biotechnology
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.tibtech.2025.11.003
PMID:41330849
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研究论文 | 本研究系统鉴定并表征了嗜热古菌Sulfolobus islandicus中的染色体整合位点，并利用CRISPR-Cas系统实现了外源基因整合与代谢工程应用 | 首次系统鉴定S. islandicus的8个染色体整合位点，开发了基于CRISPR-COPIES和多组学计算流程的整合策略，并成功应用于脂质代谢工程 | 研究揭示了整合位点对基因表达存在显著位置效应，可能影响外源基因表达效率 | 开发适用于极端环境古菌的遗传操作工具，拓展其在合成生物学和工业生物技术中的应用潜力 | 嗜热古菌Sulfolobus islandicus | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas系统、多组学分析、β-半乳糖苷酶活性检测 | NA | 基因组数据、酶活性数据 | 13个人工CRISPR RNA靶向8个整合位点 | CRISPR-Cas系统, CRISPR-COPIES | Sulfolobus islandicus | 报告基因lacS整合系统、GDGT环合酶B（GrsB）过表达代谢通路 | 工业生物技术 |
| 128 | 2025-12-03 |
Versatile Applications of CRISPR-Based Programmable T-DNA Integration in Plants
2025-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70353
PMID:40905066
|
研究论文 | 本文探索了CRISPR辅助的靶向T-DNA整合技术在植物中的应用，旨在提高转基因表达的精确性和效率 | 开发了CRISTTIN技术，利用CRISPR诱导的双链断裂实现精确T-DNA插入，相比传统Cas9，优化了基因功能研究和转基因表达控制 | NA | 研究植物中靶向T-DNA整合策略，以克服随机整合的缺点，提升转基因表达的精确性和应用范围 | 拟南芥和水稻 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, Agrobacterium介导的T-DNA整合 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 拟南芥, 水稻 | 靶向T-DNA整合系统，用于基因敲除、原位互补、报告基因插入和转录增强 | 农业, 合成生物学 |
| 129 | 2025-12-03 |
From marsh to market: taming Vibrio natriegens for sustainable bioproduction
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103353
PMID:40945411
|
综述 | 本文探讨了利用已知最快生长的细菌——Vibrio natriegens作为生物技术底盘，开发可持续生物生产的过程 | 提出采用系统生物技术方法，结合菌株与工艺工程，指导Vibrio natriegens的理性优化，以实现可扩展的新一代生物制造 | 目前仍存在重要限制，特别是在实现高产品产量和处理难降解底物方面 | 开发Vibrio natriegens作为可持续生物生产的底盘微生物 | Vibrio natriegens细菌及其在生物生产中的应用 | 合成生物学 | NA | 基因组工程、合成生物学工具、系统水平分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | Vibrio natriegens | 生物传感器、代谢途径 | 工业生物技术、能源、环境 |
| 130 | 2025-12-03 |
Unearth hidden terpenoids in plants by genome mining and synthetic biology
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103365
PMID:41016367
|
综述 | 本文综述了如何通过基因组挖掘与合成生物学相结合的方法，系统性发现和表征植物中隐藏的萜类化合物 | 整合基因组挖掘与合成生物学，系统性挖掘所有主要萜类（包括三萜、二萜、倍半萜等）中隐藏的新颖骨架，显著扩展了药物开发的化学空间 | NA | 探索植物中隐藏萜类化合物的发现与表征方法 | 植物萜类化合物 | 合成生物学 | NA | 基因组挖掘，组合生物合成 | NA | 基因组数据 | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 131 | 2025-12-03 |
Building a lignin biofoundry: a review
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103377
PMID:41172615
|
综述 | 本文综述了合成生物学和生物铸造厂在木质素生物转化中的应用潜力，探讨了如何通过自动化设计-构建-测试-学习循环来开发木质素降解酶 | 提出了聚焦木质素的生物铸造厂概念，整合机器人技术、数据驱动生物学和人工智能，为木质素的高效生物转化提供创新框架 | NA | 探索利用合成生物学和生物铸造厂技术克服木质素生物转化工业应用限制的途径 | 木质素生物转化技术、生物铸造厂平台 | 合成生物学 | NA | 高通量筛选、定向进化、生物传感器引导选择 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、环境、能源 |
| 132 | 2025-12-03 |
Architectures of emerging biofoundry platforms for synthetic biology
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103379
PMID:41177134
|
综述 | 本文综述了新兴生物铸造平台的架构，这些平台通过自动化加速合成生物学应用 | 强调了机器人辅助模块（RAMs）的灵活配置，以及人工智能集成以实现预测建模和迭代学习，为自驱动实验室奠定基础 | NA | 概述生物铸造平台的架构基础，以促进高通量和可重复的生物工程 | 生物铸造平台，包括机器人系统、分析仪器和软件 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | E. coli, S. cerevisiae, B. subtilis, 哺乳动物细胞 | 切换开关、振荡器、逻辑门、生物传感器、代谢途径 | 医学、农业、环境、能源、材料、食品、工业生物技术 |
| 133 | 2025-12-03 |
Programmable probiotics as next-generation living therapeutics: bridging synthetic biology and precision medicine
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103375
PMID:41187701
|
综述 | 本文综述了可编程益生菌作为下一代活体治疗剂的发展，探讨了合成生物学如何将其改造为能够靶向疾病部位、感知信号并原位递送治疗的智能药物 | 提出将合成生物学与精准医学结合，通过模块化遗传电路将益生菌改造为可编程的活体治疗剂，实现疾病原位靶向治疗 | 存在生物安全性、监管复杂性及微生物组变异性等转化瓶颈 | 探讨可编程益生菌作为活体治疗剂的开发策略与临床转化前景 | 工程化益生菌（活体治疗剂） | 合成生物学 | 炎症性肠病、代谢性疾病、癌症 | 模块化遗传电路设计 | NA | NA | NA | 合成生物学工具（未具体说明） | 益生菌（原共生细菌） | 感知-响应型遗传电路（具备疾病部位归巢、信号感知与治疗递送功能） | 医药 |
| 134 | 2025-12-03 |
Artificial intelligence-powered biofoundries for protein engineering and metabolic engineering
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103380
PMID:41192167
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综述 | 本文综述了人工智能与自动化生物铸造厂融合在蛋白质工程和代谢工程中的应用，加速了设计-构建-测试-学习循环 | 整合人工智能与自动化生物铸造厂，实现蛋白质工程和代谢工程从劳动密集型手动实验向自主实验的转变 | NA | 总结人工智能模型与生物铸造厂集成在蛋白质工程和代谢工程中的最新进展，以加速合成生物学领域的科学发现与创新 | 蛋白质工程和代谢工程的工作流程、人工智能模型及其与生物铸造厂的集成 | 合成生物学 | NA | NA | 人工智能模型 | NA | NA | 生物铸造厂 | NA | NA | 工业生物技术 |
| 135 | 2025-12-03 |
Recent innovations in cannabinoid chemistry, biology, and biosynthesis
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103378
PMID:41205317
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综述 | 本文总结了关于大麻素化学、生物学和生物合成的最新进展，包括药理学、合成化学创新和工程化生产策略 | 整合了不对称合成方法和合成生物学技术，以生产低丰度的大麻素，并强调了跨学科反馈如何重塑对这些分子的获取和理解 | NA | 总结大麻素研究的最新进展，促进对次要大麻素的获取和认识 | 大麻素，包括主要和次要大麻素，如Δ⁹-四氢大麻酚和大麻二酚 | NA | NA | 不对称合成方法，合成生物学方法，包括异源途径重建和功能类似酶发现 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医药 |
| 136 | 2025-12-03 |
Recent advances in AI-enabled automation of DNA assembly in biofoundries
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103386
PMID:41205316
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综述 | 本文综述了生物铸造厂中DNA组装自动化策略的最新进展，重点关注新兴平台、标准化设计工具和机器学习集成 | 整合了AI驱动的动态协议优化、故障诊断和实时学习，建立了通过迭代持续改进实验的新范式 | NA | 探讨生物铸造厂中DNA组装工作流程的自动化进展，以加速基础研究和工业应用 | DNA组装策略、生物铸造厂工作流程 | 合成生物学 | NA | DNA组装、机器学习 | AI驱动系统 | 协议数据、实验数据 | NA | NA | NA | NA | 工业生物技术、基础研究 |
| 137 | 2025-12-03 |
Molecular methods for high-throughput, multiplexed, and automated genome editing in prokaryotes and eukaryotes
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103381
PMID:41205315
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综述 | 本文综述了在原核和真核生物中进行高通量、多重化和自动化基因组编辑的分子方法的最新进展 | 整合了高通量、多重化和自动化技术于基因组编辑中，强调了机器人辅助平台在提升编辑效率和规模方面的关键作用 | NA | 综述基因组工程领域的新方法，以推动菌株工程和合成生物学的发展 | 原核和真核生物 | 合成生物学 | NA | DNA编辑技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN | 原核生物, 真核生物 | NA | 工业生物技术 |
| 138 | 2025-12-03 |
A π-stacking gate for redox control in flavin ferredoxin-thioredoxin reductases
2025-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.148860
PMID:41205938
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研究论文 | 本研究揭示了黄素铁氧还蛋白-硫氧还蛋白还原酶（FFTRs）中C端尾部及其保守芳香残基通过π-堆积相互作用调控FAD电子环境、电子转移效率和铁氧还蛋白供体相互作用的机制 | 首次在蓝藻FFTRs中证明C端尾部及其保守色氨酸通过π-堆积相互作用调控FAD电子环境、电子转移效率和供体特异性，为工程化氧化还原活性生物催化剂提供新框架 | 研究主要基于蓝藻Gloeobacter violaceus的FFTR模型，可能未涵盖所有细菌谱系FFTRs的多样性 | 探究蓝藻FFTRs中C端尾部及其保守芳香残基在电子转移和氧化还原调控中的作用机制 | 蓝藻Gloeobacter violaceus的黄素铁氧还蛋白-硫氧还蛋白还原酶（FFTR）及其突变体 | NA | NA | 突变分析、电子转移动力学测定、氧化还原电位测量、结合特异性评估 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学、代谢应用 |
| 139 | 2025-12-03 |
Computationally Guided Design of a Soluble, Abundant and Functional AnfH Variant for the Expression of Fe-Only Nitrogenase in Plant Mitochondria
2025-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70263
PMID:40831097
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研究论文 | 本研究利用计算指导方法设计并验证了一种可溶性、高丰度且功能性的AnfH变体，用于在植物线粒体中表达铁-氮酶 | 首次通过PROSS蛋白优化算法和Rosetta能量计算，设计出在植物线粒体中溶解度显著提高的AnfH变体，其中AnfH V6变体溶解度提升约90倍，并保持氮还原功能 | 研究仅针对AnfH蛋白的溶解度优化，未全面评估整个铁-氮酶系统在植物中的完整功能整合或长期稳定性 | 开发适用于植物线粒体的可溶性铁-氮酶电子供体蛋白，以推进植物合成生物学中氮酶工程的应用 | 来自A. vinelandii的铁-氮酶必需电子供体蛋白AnfH及其计算设计的变体 | 合成生物学 | NA | PROSS蛋白优化算法、Rosetta能量计算、[FeS]簇重建 | NA | 蛋白质序列与结构数据 | 8个AnfH变体（含1至11个氨基酸替换），在N. benthamiana叶片中测试 | NA | N. benthamiana（植物） | 铁-氮酶电子传递系统（AnfH与AnfDKG复合物） | 农业、工业生物技术 |
| 140 | 2025-12-03 |
CYP82G1 Enzyme Functions as Chromone Hydroxylase in the Biosynthesis of 6-Hydroxy-2-(2-Phenylethyl)chromone in Aquilaria sinensis
2025-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70327
PMID:40824768
|
研究论文 | 本研究鉴定了Aquilaria sinensis中CYP82G1酶作为色原酮羟化酶，催化2-(2-苯乙基)色原酮生成6-羟基-2-(2-苯乙基)色原酮，揭示了沉香中2-(2-苯乙基)色原酮生物合成的关键分子机制 | 首次鉴定并功能验证了AsCYP82G1作为C-6位羟化酶在2-(2-苯乙基)色原酮生物合成中的关键作用，并通过同源建模、分子对接和量子力学计算阐明了其催化机制 | 研究主要聚焦于C-6位羟化步骤，其他修饰步骤（如C-5、C-7、C-8位取代）的酶学机制尚未完全阐明 | 解析沉香中2-(2-苯乙基)色原酮类化合物的生物合成途径，特别是C-6位羟基化的分子机制 | Aquilaria sinensis（白木香）植物及其产生的2-(2-苯乙基)色原酮类化合物 | 植物分子生物学与合成生物学 | NA | 转录组学、LC-MS/MS分析、酵母表达系统、烟草瞬时表达、同源建模、分子对接、量子力学计算 | NA | 基因表达数据、代谢物谱数据、蛋白质结构数据 | 两年生野生型白木香和奇楠型白木香 | 酵母表达系统 | 酿酒酵母、本氏烟草、Aquilaria sinensis | NA | 农业、工业生物技术 |