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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 161 | 2025-12-03 |
Computationally Guided Design of a Soluble, Abundant and Functional AnfH Variant for the Expression of Fe-Only Nitrogenase in Plant Mitochondria
2025-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70263
PMID:40831097
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研究论文 | 本研究利用计算指导方法设计并验证了一种可溶性、高丰度且功能性的AnfH变体,用于在植物线粒体中表达铁-氮酶 | 首次通过PROSS蛋白优化算法和Rosetta能量计算,设计出在植物线粒体中溶解度显著提高的AnfH变体,其中AnfH V6变体溶解度提升约90倍,并保持氮还原功能 | 研究仅针对AnfH蛋白的溶解度优化,未全面评估整个铁-氮酶系统在植物中的完整功能整合或长期稳定性 | 开发适用于植物线粒体的可溶性铁-氮酶电子供体蛋白,以推进植物合成生物学中氮酶工程的应用 | 来自A. vinelandii的铁-氮酶必需电子供体蛋白AnfH及其计算设计的变体 | 合成生物学 | NA | PROSS蛋白优化算法、Rosetta能量计算、[FeS]簇重建 | NA | 蛋白质序列与结构数据 | 8个AnfH变体(含1至11个氨基酸替换),在N. benthamiana叶片中测试 | NA | N. benthamiana(植物) | 铁-氮酶电子传递系统(AnfH与AnfDKG复合物) | 农业、工业生物技术 |
| 162 | 2025-12-03 |
CYP82G1 Enzyme Functions as Chromone Hydroxylase in the Biosynthesis of 6-Hydroxy-2-(2-Phenylethyl)chromone in Aquilaria sinensis
2025-Dec, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.70327
PMID:40824768
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研究论文 | 本研究鉴定了Aquilaria sinensis中CYP82G1酶作为色原酮羟化酶,催化2-(2-苯乙基)色原酮生成6-羟基-2-(2-苯乙基)色原酮,揭示了沉香中2-(2-苯乙基)色原酮生物合成的关键分子机制 | 首次鉴定并功能验证了AsCYP82G1作为C-6位羟化酶在2-(2-苯乙基)色原酮生物合成中的关键作用,并通过同源建模、分子对接和量子力学计算阐明了其催化机制 | 研究主要聚焦于C-6位羟化步骤,其他修饰步骤(如C-5、C-7、C-8位取代)的酶学机制尚未完全阐明 | 解析沉香中2-(2-苯乙基)色原酮类化合物的生物合成途径,特别是C-6位羟基化的分子机制 | Aquilaria sinensis(白木香)植物及其产生的2-(2-苯乙基)色原酮类化合物 | 植物分子生物学与合成生物学 | NA | 转录组学、LC-MS/MS分析、酵母表达系统、烟草瞬时表达、同源建模、分子对接、量子力学计算 | NA | 基因表达数据、代谢物谱数据、蛋白质结构数据 | 两年生野生型白木香和奇楠型白木香 | 酵母表达系统 | 酿酒酵母、本氏烟草、Aquilaria sinensis | NA | 农业、工业生物技术 |
| 163 | 2025-12-03 |
Expanding the frontiers of microbial biosynthesis with synthetic microbial communities
2025-Dec, Current opinion in biotechnology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.copbio.2025.103351
PMID:40886452
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综述 | 本文综述了合成微生物群落在微生物合成领域的最新进展,讨论了其优势、功能,并提出了一个设计框架,重点关注通过微生物相互作用进行种群控制 | 通过理性途径分区和明确的微生物相互作用,合成微生物群落缓解了单一培养的局限性,如代谢负担、途径抑制和副产物积累,从而扩展了微生物生物合成的前沿 | NA | 探讨合成微生物群落在微生物生物合成中的应用,以扩展其前沿 | 合成微生物群落 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 微生物 | NA | 工业生物技术 |
| 164 | 2025-12-03 |
Microbial biomolecular condensates: from conserved principles to synthetic biology opportunities
2025-Dec, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2025.102677
PMID:41086652
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综述 | 本文综述了微生物生物分子凝聚体的普遍存在性、保守的物理原理及其在合成生物学中的应用潜力 | 将生物分子凝聚体视为一种广泛存在于微生物界的模块化区室化策略,并探讨了其保守的物理原理如何通过进化力量适应不同的细胞需求,为合成生物学中可编程凝聚体的设计提供了新视角 | NA | 探讨微生物生物分子凝聚体的运作原理及其在合成生物学中的应用机会 | 微生物生物分子凝聚体 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 可编程凝聚体 | 合成生物学 |
| 165 | 2025-12-02 |
Bioremediation of polycyclic aromatic hydrocarbons contaminated soils/water for environmental remediation
2025-Dec-01, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-025-10229-y
PMID:41324725
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综述 | 本文综述了利用微生物生物修复技术降解土壤/水中多环芳烃(PAHs)污染的研究进展 | 探讨了生物表面活性剂、生物膜及微生物群落协同作用在增强PAHs生物降解效率中的应用,并强调了基因工程、合成生物学和纳米技术等前沿工具在提升降解能力方面的潜力 | NA | 研究利用微生物生物修复技术可持续地去除环境中的PAHs污染 | 多环芳烃(如萘、菲、蒽、芘)及其在土壤/水中的污染 | 环境科学 | NA | 微生物降解、基因工程、合成生物学、纳米技术 | NA | NA | NA | 基因工程、合成生物学 | 假单胞菌、分枝杆菌、红球菌、Novosphingobium属海洋物种 | NA | 环境 |
| 166 | 2025-11-30 |
Microorganism delivery of cancer vaccines
2025-Dec-10, Journal of controlled release : official journal of the Controlled Release Society
IF:10.5Q1
DOI:10.1016/j.jconrel.2025.114288
PMID:41045964
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综述 | 本文综述了微生物癌症疫苗通过利用细菌和病毒靶向肿瘤区域、增强免疫原性的机制及其在癌症免疫治疗中的应用 | 系统阐述微生物疫苗靶向肿瘤机制,并重点介绍合成生物学技术在精准表达肿瘤抗原和免疫检查点抑制剂方面的最新进展 | NA | 探讨微生物癌症疫苗作为变革性免疫治疗策略的潜力 | 细菌疫苗、病毒疫苗和病毒样颗粒等微生物载体 | 合成生物学 | 癌症 | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌, 病毒 | 肿瘤抗原表达系统, 免疫检查点抑制剂表达系统 | 医学 |
| 167 | 2025-11-29 |
Recombinant collagen in regenerative medicine: Expression strategies, structural design, and translational applications
2025-Dec, Materials today. Bio
DOI:10.1016/j.mtbio.2025.102452
PMID:41293490
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综述 | 本文综述了重组胶原蛋白在再生医学中的表达策略、结构设计和临床应用 | 整合了合成生物学技术开发具有明确序列和一致质量的重组胶原蛋白系统,拓展了基于重组胶原蛋白生物材料的结构多样性和功能景观 | 在实现完全羟基化、成本效益高的大规模制造和统一监管标准方面仍面临挑战 | 开发新一代具有分子精度、功能可调性和可扩展生物制造能力的生物材料 | 重组胶原蛋白及其工程化生物材料 | 合成生物学 | 骨科疾病、皮肤损伤、角膜疾病 | 合成生物学、AI辅助序列设计、程序化分子工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly | 大肠杆菌, 酿酒酵母, 植物, 哺乳动物细胞, 转基因生物 | 三螺旋重组胶原蛋白、非螺旋明胶样蛋白、多功能融合构建体 | 医学 |
| 168 | 2025-11-28 |
Overcoming antimicrobial resistance: Phage therapy as a promising solution to combat ESKAPE pathogens
2025-Dec, International journal of antimicrobial agents
IF:4.9Q1
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综述 | 本文系统评估噬菌体疗法对抗多重耐药ESKAPE病原体的治疗潜力 | 重点探讨噬菌体裂解-溶原性转换的分子调控机制,并整合纳米技术递送系统和CRISPR-Cas等前沿工程技术 | 存在监管、耐药性和可扩展性等挑战,尚未实现从实验性到主流治疗的完全转变 | 评估噬菌体疗法作为对抗抗菌素耐药性的替代治疗策略 | 多重耐药的ESKAPE病原体(医院获得性感染主要致病菌) | 微生物学与传染病学 | 细菌感染性疾病 | 噬菌体疗法、CRISPR-Cas技术、合成生物学方法 | NA | 文献资料与临床证据 | NA | CRISPR-Cas, 合成生物学方法 | 噬菌体 | NA | 医学 |
| 169 | 2025-11-23 |
Engineering sulfoxide synthases for efficient microbial production of ergothioneine: Mechanisms, strategies, and perspectives
2025-Dec-25, Food chemistry
IF:8.5Q1
DOI:10.1016/j.foodchem.2025.146618
PMID:41082819
|
综述 | 本文系统综述了硫氧化物合酶在微生物合成麦角硫因过程中的分子机制与工程策略 | 首次全面整合硫氧化物合酶的分子机制与工程策略,为含硫化合物生物合成提供通用框架 | 作为综述文章未涉及原始实验数据验证 | 提升麦角硫因微生物合成效率的酶工程策略研究 | 硫氧化物合酶及其催化机制 | 合成生物学 | NA | 酶工程、代谢工程 | NA | 文献数据 | NA | NA | 微生物 | 麦角硫因生物合成途径 | 工业生物技术 |
| 170 | 2025-11-22 |
Dissecting native plasmid functions in Lactococcus lactis: Synergistic regulation of metabolism and industrially relevant traits
2025-Dec, Journal of dairy science
IF:3.7Q2
DOI:10.3168/jds.2025-27053
PMID:41130394
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研究论文 | 本研究解析了乳酸乳球菌C20中3个天然质粒的功能及其对代谢和工业性状的协同调控作用 | 首次系统揭示了乳酸乳球菌C20中天然质粒的协同调控网络及其对工业性状的关键影响 | 研究仅针对C20菌株的3个质粒,未在其他乳酸乳球菌菌株中验证普适性 | 阐明乳酸乳球菌天然质粒的生物学功能及其在工业应用中的潜力 | 乳酸乳球菌C20菌株及其3个天然质粒(pLL1, pLL2, pLL3) | 合成生物学 | NA | 基因组分析、组合消除、功能表征 | NA | 基因组数据、代谢数据 | 乳酸乳球菌C20菌株及其质粒变异株 | 基因编辑、合成生物学 | 乳酸乳球菌 | 天然质粒调控网络 | 食品,制药,工业生物技术 |
| 171 | 2025-11-17 |
Synthetic peptide vaccines targeting SVA elicit robust protective immune responses in swine
2025-Dec, Veterinary microbiology
IF:2.4Q1
DOI:10.1016/j.vetmic.2025.110763
PMID:41106188
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研究论文 | 本研究基于合成生物学原理设计合成针对塞内卡病毒A(SVA)的合成肽疫苗,并在猪体内验证其免疫保护效果 | 首次基于SVA衣壳蛋白VP2的B细胞中和表位和荨麻疹病毒F蛋白的辅助T细胞表位设计合成肽疫苗,并筛选出最佳佐剂组合 | 研究样本量有限,未进行大规模田间试验验证疫苗的长期保护效果 | 开发安全有效的塞内卡病毒A(SVA)合成肽疫苗 | 小鼠和猪的免疫反应及保护效果 | 合成生物学 | 猪水疱病 | 固相肽合成(SPPS) | NA | 免疫学数据 | 小鼠和猪的免疫实验样本 | NA | 小鼠,猪 | 基于B细胞中和表位和T细胞表位的合成肽设计 | 兽医学 |
| 172 | 2025-11-15 |
Repurposing the bacterial surface display technology for drug delivery
2025-Dec, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115701
PMID:41046872
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综述 | 探讨细菌表面展示技术在药物递送领域的重新定位与应用发展 | 提出将计算工具(如AlphaFold)与体外筛选结合以理性设计新一代表面展示平台的技术路线 | 存在监管障碍和微生物稳定性等挑战 | 研究细菌工程在医学应用中的演进,重点分析表面展示技术实现的药物递送策略 | 革兰氏阴性菌与革兰氏阳性菌的表面展示系统 | 合成生物学 | 癌症 | 细菌表面展示技术 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 革兰氏阴性菌, 革兰氏阳性菌 | 外膜蛋白锚定、分选酶介导锚定、孢子展示系统 | 医学 |
| 173 | 2025-11-14 |
Design principle of successful genome editing applications using CRISPR-based toolkits
2025-Dec, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-025-00979-z
PMID:40591237
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综述 | 探讨基于CRISPR工具包的成功基因组编辑应用设计原则 | 提出整合Cpf1和dCas9的一锅法质粒系统构建策略,并讨论降低脱靶效应的先进方法 | 未提供具体实验验证数据,主要集中于策略性讨论 | 开发微生物宿主中稳健的CRISPR基因编辑系统 | CRISPR-Cas系统及其在微生物宿主中的应用 | 合成生物学 | NA | CRISPR-Cas9, Cpf1, dCas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酵母 | 基因编辑系统,一锅法质粒系统 | 工业生物技术 |
| 174 | 2025-11-08 |
Boosting microalgae-based carbon sequestration with the artificial CO2 concentration system
2025-Dec, Critical reviews in biotechnology
IF:8.1Q1
DOI:10.1080/07388551.2025.2498464
PMID:40374568
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综述 | 本文综述了微藻人工CO2封存技术的现状,重点探讨了CO2耐受物种筛选、培养优化、反应器设计及合成生物学应用 | 系统整合了微藻固碳技术的光反应与暗反应优化策略,并引入合成生物学手段提升CO2溶解与生物固定效率 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述的理论分析 | 推动微藻基CO2封存技术发展,应对全球变暖挑战 | 微藻光合微生物及其碳封存系统 | 环境生物技术 | NA | 合成生物学、生命周期评估、技术经济分析 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学工具 | 微藻 | CO2生物固定代谢通路 | 环境,能源 |
| 175 | 2025-10-13 |
Multigene engineering in plants: Technologies, applications, and future prospects
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108697
PMID:40882716
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综述 | 本文综述了植物多基因工程的技术、应用及未来前景,重点介绍了合成生物学驱动的设计-构建-测试-学习框架 | 系统总结了多基因工程在合成生物学DBTL框架下的完整技术流程,并提出了优化路径和未来发展方向 | 在多基因构建稳定性、协调性基因表达和调控可预测性方面仍存在挑战 | 促进多基因工程在可持续农业中的部署应用 | 植物多基因工程技术体系 | 合成生物学 | NA | 多基因工程 | 计算建模 | NA | NA | Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 植物 | 代谢通路、调控通路 | 农业, 环境, 能源, 材料, 食品, 工业生物技术 |
| 176 | 2025-10-13 |
Engineered microbial production of carotenoids and their cleavage products: Recent advances and prospects
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108708
PMID:40921259
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综述 | 总结类胡萝卜素及其裂解产物微生物合成的最新进展与前景 | 系统阐述代谢工程和合成生物学在异源生物合成中的应用,重点关注类胡萝卜素裂解酶的研究进展 | NA | 探讨类胡萝卜素及其裂解产物的可持续微生物生产策略 | 类胡萝卜素和脱辅基类胡萝卜素 | 合成生物学 | NA | 代谢工程,合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 甲羟戊酸途径和甲基赤藓糖醇磷酸途径的代谢通路设计 | 制药,医疗保健,化妆品,食品 |
| 177 | 2025-10-13 |
Intersecting precision fermentation for global cell-based food production innovation: Challenges and opportunities
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108712
PMID:40930311
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综述 | 探讨精准发酵与全球细胞基食品生产交叉领域的挑战与机遇 | 提出融合合成生物学与精准营养的愿景框架,分析计算机辅助工程和人工智能在发酵过程中的应用潜力 | 存在技术扩展瓶颈、监管碎片化、区域可及性和消费者接受度等实施障碍 | 推动发酵食品生产向高效可持续制造转型 | 微生物细胞工厂生产的食品成分 | 工业生物技术 | NA | 合成生物学、代谢工程、计算机辅助工程(CAE)、人工智能(AI)、自动化 | NA | 案例研究、建模分析 | NA | 合成生物学工具、代谢工程工具 | 微生物细胞工厂 | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 178 | 2025-10-13 |
Genetically engineered Escherichia coli: The new recyclers of PET plastic waste
2025-Dec, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108713
PMID:40934993
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综述 | 本文综述了基因工程改造的大肠杆菌作为PET塑料废物生物降解与转化平台的最新进展 | 将PET水解酶在工程化大肠杆菌中进行异源表达和蛋白质工程改造,并整合合成生物学策略构建多酶级联系统和表面展示系统 | NA | 开发能够实现PET塑料高效生物降解和转化的工程微生物平台 | 基因工程改造的大肠杆菌及其在PET生物转化中的应用 | 合成生物学 | NA | 蛋白质工程、合成生物学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, BioBrick | E. coli | 多酶级联系统、表面展示系统、代谢通路 | 环境 |
| 179 | 2025-10-05 |
Synthetic biology meets diagnostics: Engineering biosensing platforms for rapid and accurate pathogen and viral detection
2025-Dec-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117946
PMID:40939269
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综述 | 本文综述了合成生物学与生物传感技术结合在病原体和病毒快速精准检测诊断系统开发中的应用 | 整合CRISPR系统、argonaute蛋白和模块化遗传电路等合成生物学工具与人工智能、纳米技术相结合,开发自动化、低成本、高通量诊断系统 | NA | 推进病原体检测和体外诊断技术的发展 | 病原体和病毒检测诊断系统 | 合成生物学 | 传染病 | CRISPR系统、argonaute蛋白、模块化遗传电路、无细胞系统、纳米材料增强平台 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas | NA | 模块化遗传电路、生物传感器 | 医学, 公共卫生, 食品安全 |
| 180 | 2025-10-05 |
De novo biosynthesis of Asperosaponin VI in Saccharomyces cerevisiae
2025-Dec, Synthetic and systems biotechnology
IF:4.4Q1
DOI:10.1016/j.synbio.2025.08.007
PMID:40951686
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研究论文 | 本研究首次在酿酒酵母中实现了Asperosaponin VI的完整生物合成途径重构 | 首次在酿酒酵母中采用模块化合成生物学策略完整重建ASA VI生物合成途径,包括UDP-阿拉伯糖原位生物合成和多个糖基化步骤 | 产量仍处于痕量水平(395 ng/L),下游糖基化步骤和UDP-阿拉伯糖供应可能是主要限速因素 | 开发可持续生产Asperosaponin VI及相关阿拉伯糖基化皂苷的微生物平台 | Asperosaponin VI(ASA VI)三萜皂苷及其生物合成中间体 | 合成生物学 | NA | 模块化合成生物学策略、LC-MS分析、异源表达 | NA | 代谢物分析数据 | NA | 异源基因表达、多拷贝表达 | 酿酒酵母 | 完整生物合成途径包括:UDP-阿拉伯糖原位生物合成、三萜骨架生成(齐墩果酸生产)、下游修饰(C-23羟基化、C-28逐步葡萄糖基化、C-3阿拉伯糖基化) | 医药 |