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当前共找到 349 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-09-21 |
Genome Position Does Not Impact Transgene Expression Efficiency in the Ancient Red Alga Cyanidioschyzon merolae
2026-Jan-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.31.703004
PMID:41659391
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研究论文 | 该研究通过生物信息学分析、液体处理机器人和异源蛋白及代谢物生产实验，建立了在Cyanidioschyzon merolae中进行核基因组工程的框架，并发现基因组位置不影响转基因表达效率 | 首次在Cyanidioschyzon merolae中实验验证了中性整合位点，并建立了高通量转化方案；发现基因组位置对转基因表达影响极小，具有转录中性 | 未明确提及 | 系统研究基因组位置对转基因表达的影响，并建立可重复的核基因组工程框架 | Cyanidioschyzon merolae（一种嗜热嗜酸红藻） | 合成生物学 | NA | 生物信息学基因组分析、液体处理机器人、异源蛋白和代谢物生产测定、顶空分析 | NA | 基因组序列、实验数据 | 40个基因间 loci（分布于20条染色体中的16条），验证了38个 | 同源重组 | Cyanidioschyzon merolae | NA | 工业生物技术 |
| 2 | 2026-09-21 |
Synthetic Biology of Plants and Microbes for Agriculture, Environment, and Future Applications
2026-Jan-28, Chemical reviews
IF:51.4Q1
DOI:10.1021/acs.chemrev.4c00687
PMID:41609588
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综述 | 本文综述了植物和微生物合成生物学在农业、环境及未来应用中的进展，包括基因组构建工具、CAD和AI，以及智能植物和微生物组工程 | 将植物与相关微生物视为一个整体系统进行工程化，利用合成生物学工具扩展可工程化物种、增加工程化功能复杂性、控制环境释放并组装稳定菌群 | 传统育种和转基因方法速度慢、性状不可预测且持续表达，合成生物学在植物多基因组和微生物组工程中仍面临复杂性和稳定性挑战 | 推动下一次农业革命，并将植物工程拓展至制造、基础设施、传感和修复等新领域 | 植物（作物）和相关的微生物（真菌、细菌、古菌） | 合成生物学 | NA | 基因组构建工具、计算机辅助设计（CAD）、人工智能（AI） | NA | 文本 | NA | NA | 植物，微生物（真菌、细菌、古菌） | 响应环境变化的基因回路，可改变形态或应对威胁 | 农业，环境，制造，基础设施，传感，修复 |
| 3 | 2026-09-21 |
KSHV and cancer: understanding the oncogenic machinery for next-generation diagnostic tools and therapies
2026-Jan-21, Archives of microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s00203-025-04706-4
PMID:41563473
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综述 | 本文综述了KSHV的致癌机制，重点介绍了其操纵宿主细胞信号、逃避免疫检测和促进肿瘤发生的能力，并探讨了下一代诊断工具和治疗方法 | 整合了新兴诊断生物标志物（如病毒microRNA）与下一代治疗策略（包括基因编辑和基于合成生物学的方法），为精准医学改善疾病检测、治疗特异性和患者预后提供了机会 | 当前KS诊断仍主要依赖组织病理学和LANA免疫染色，在早期或不典型病变以及区分潜伏感染和裂解感染方面存在重要局限性；KSHV相关恶性肿瘤缺乏病毒特异性靶向治疗，临床结果仍不理想 | 探索KSHV的致癌机制，并探讨下一代诊断工具和治疗方法 | KSHV病毒及其相关疾病（卡波西肉瘤、原发性渗出性淋巴瘤、多中心Castleman病） | 医学 | 卡波西肉瘤, 原发性渗出性淋巴瘤, 多中心Castleman病 | CRISPR-Cas9, 治疗性适配体, 先进成像, 分子生物标志物 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | NA | NA | 医学 |
| 4 | 2026-09-21 |
Engineered probiotics that sequester arsenite in a mouse gastrointestinal system
2026-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.16.699961
PMID:41648437
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研究论文 | 该研究通过合成生物学方法改造益生菌，使其在胃肠道内检测并螯合亚砷酸盐，从而阻止其被吸收进入血液 | 设计了一个砷响应遗传拨动开关，在暴露时激活螯合剂表达并在生物静息条件下维持生产，而在活跃细胞分裂时自动关闭以减少代谢负担和增强生物安全性；同时改造了ArsR衍生的砷结合蛋白，消除DNA结合活性但保留高亲和力金属结合能力，产生无毒螯合剂；结合质量传递模型预测细菌剂量，并在小鼠模型中验证了工程益生菌减少亚砷酸盐进入血液的效果 | 摘要未明确提及研究的局限性 | 开发一种基于工程益生菌的合成生物学方法，在胃肠道内拦截膳食亚砷酸盐，防止其被人体吸收 | 工程益生菌（EcN）、亚砷酸盐、小鼠胃肠道模型 | 合成生物学 | 癌症、器官功能障碍、神经系统疾病 | 合成生物学、基因工程 | 遗传拨动开关、质量传递模型 | 实验数据、模型预测数据 | NA | NA | 益生菌（EcN） | 砷响应遗传拨动开关，激活螯合剂表达，在生物静息条件下维持生产，细胞分裂时关闭 | 医学、环境 |
| 5 | 2026-09-21 |
The oleaginous yeast Cutaneotrichosporon oleaginosum modifies corn stover alkali lignin
2026-Jan-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-36483-5
PMID:41549121
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研究论文 | 利用多种分析工具评估玉米秸秆提取的碱木质素与产油酵母Cutaneotrichosporon oleaginosum之间的相互作用 | 首次系统研究非模式产油酵母C. oleaginosum对玉米秸秆碱木质素的修饰作用，发现其可通过胞外醌氧化还原循环产生活性氧来修饰木质素，并首次在该酵母中观察到铁还原酶和草酸交换体在木质素条件下的特异性表达 | 研究主要基于体外分析和组学数据，尚未进行基因工程验证实验，木质素 uptake 的具体机制和聚合物木质素能否被完整摄取仍需进一步证实 | 探究产油酵母Cutaneotrichosporon oleaginosum对玉米秸秆碱木质素的修饰能力及其分子机制 | 产油酵母Cutaneotrichosporon oleaginosum和玉米秸秆提取的碱木质素 | 合成生物学 | NA | 2D-NMR、超分辨荧光显微镜、分泌组学、蛋白质组学 | NA | 光谱数据、图像、蛋白质组学数据 | NA | NA | Cutaneotrichosporon oleaginosum | NA | 能源、工业生物技术 |
| 6 | 2026-09-21 |
Resource Competition and Growth Dilution Modulate Synthetic Gene Cascade Dynamics
2026-01-16, ACS synthetic biology
IF:3.7Q1
DOI:10.1021/acssynbio.5c00606
PMID:41457566
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研究论文 | 本文构建并表征了具有不同启动子强度、RBS强度和质粒骨架的抑制性基因级联文库，研究了资源竞争和生长稀释对合成基因级联动态的影响。 | 发现增加下游模块表达会通过竞争共享细胞资源意外降低上游调控模块表达，将单向抑制级联转变为非预期反馈回路；并揭示生长介导的稀释重塑基因表达模式。 | 未明确说明具体资源类型和定量模型，可能未在单细胞水平验证或缺乏动态调控的精确预测。 | 设计具有准确可预测行为的鲁棒稳定基因回路，理解资源竞争对模块化基因回路动态的影响。 | 合成基因级联（抑制性基因级联） | 合成生物学 | NA | 基因回路构建与表征 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | 抑制性基因级联 | 医学, 工业生物技术 |
| 7 | 2026-09-21 |
Copper biosorption by Serratia plymuthica: crucial role of tightly bound extracellular polymeric substances in planktonic and biofilm systems
2026-Jan-16, Biodegradation
IF:3.1Q2
DOI:10.1007/s10532-026-10245-6
PMID:41545695
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研究论文 | 本研究探讨了普利茅斯沙雷氏菌的浮游细胞和生物膜系统中，紧密结合的胞外聚合物对铜生物吸附的作用 | 揭示了紧密结合的胞外聚合物中蛋白质组分在铜生物吸附中的关键作用，并展示了在真实电镀废水中高效吸附铜的能力 | 未来需要采用合成生物学方法提高铜螯合能力，并在真实工业废水条件下研究这些系统的可扩展性以提高技术成熟度 | 探索细菌胞外聚合物作为铜活性结合表面的作用，开发高效的生物系统去除工业废水中的重金属 | 普利茅斯沙雷氏菌菌株As3-5a(5)的浮游细胞和生物膜系统 | 环境生物技术 | NA | 生物吸附 | NA | 实验数据 | NA | NA | 普利茅斯沙雷氏菌 | NA | 环境，工业生物技术 |
| 8 | 2026-09-21 |
SynVectorDB: embedding-based retrieval system for synthetic biology parts
2026-Jan-15, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baaf088
PMID:41537189
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研究论文 | 开发了SynVectorDB，一个基于嵌入的检索系统，用于合成生物学元件的语义搜索和发现 | 整合了多来源的19850个生物元件，建立了三级层次分类系统，采用BGE-M3多语言嵌入在可扩展向量数据库中实现语义相似度匹配，显著优于关键词检索方法 | 摘要中未明确提及 | 解决合成生物学元件发现中数据组织不一致和语义搜索能力有限的问题 | 合成生物学元件（DNA元件、RNA元件、编码序列、应用构建体） | 自然语言处理 | NA | BGE-M3多语言嵌入 | BGE-M3 | 文本 | 19850个生物元件，其中7656个经文献验证达到验证状态 | NA | NA | NA | 合成生物学 |
| 9 | 2026-09-21 |
Emerging Chemical and Biological Materials Technologies in the Extraplanetary Environment
2026-Jan-12, Nano-micro letters
IF:31.6Q1
DOI:10.1007/s40820-025-01979-8
PMID:41521243
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综述 | 本文综述了空间制造的历史演变与最新进展，涵盖轨道空间站、月球表面、火星及小行星等环境，并探讨了化学与生物纳米/微米/介观尺度制造技术以及合成生物学和人工智能在克服微重力、资源有限和极端条件中的应用前景 | 整合了化学与生物制造技术在多种地外环境中的最新进展，并首次系统讨论了合成生物学和人工智能在克服空间制造限制中的潜在应用 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，对具体技术的可行性缺乏实验验证 | 梳理空间制造的研究现状，概述关键制造策略与技术，评估技术与环境挑战，并讨论新兴趋势与未来方向 | 空间制造技术，包括化学和生物纳米/微米/介观尺度制造，以及轨道空间站、月球表面、火星和小行星等环境 | space manufacturing | NA | NA | NA | text | NA | NA | NA | NA | space exploration, industrial biotechnology |
| 10 | 2026-09-21 |
High-throughput yeast engineering in biofoundries: towards autonomous and scalable synthetic biology
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag003
PMID:41591451
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综述 | 本文综述了生物铸造厂中高通量酵母工程的发展，涵盖自动化、人工智能和标准化工作流程在酵母菌株开发中的应用 | 提出了从设计-构建-测试-学习（DBTL）向设计-构建-部署（DBD）循环转变的自主自优化“自驱动实验室”概念，并强调国际标准协调、数据治理和伦理保障的重要性 | 协议变异性仍然存在，人工智能工具的整合仍面临挑战，国际标准化和数据治理尚未完全实现 | 探讨生物铸造厂如何通过自动化、人工智能和标准化流程加速酵母菌株开发，并展望自主可扩展合成生物学的未来方向 | 酵母工程、生物铸造厂、合成生物学工作流程 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、表型筛选、预测建模 | NA | 文本 | NA | NA | 酵母 | NA | 工业生物技术、医学 |
| 11 | 2026-09-21 |
Engineering yeast for sustainable bioproduction of tryptophan-derived aromatic compounds
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag012
PMID:41770028
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综述 | 本文综述了通过工程化酵母细胞工厂，利用代谢工程策略和合成生物学工具，实现色氨酸衍生芳香族化合物可持续生物合成的研究进展 | 系统整合了酵母中色氨酸衍生芳香族化合物生物合成的最新研究进展，综合阐述了代谢工程策略、合成生物学工具及面临的挑战 | 本文为综述性文章，未提供原始实验数据，对具体代谢工程策略的技术细节和定量比较分析有限 | 总结酵母工程化生产色氨酸衍生化合物的最新进展，探讨当前代谢工程策略、合成生物学工具及实现高效、可扩展、经济可行的生物合成所需克服的挑战 | 酵母细胞工厂及色氨酸衍生芳香族化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程，合成生物学 | NA | 文本 | NA | NA | 酵母 | NA | 医药，食品，饲料，化妆品，聚合物 |
| 12 | 2026-09-21 |
Bacterial secondary metabolites as resistance-modifying adjuvants: microbial origins, molecular mechanisms, and translational relevance
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1779022
PMID:42039799
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综述 | 本文综述了2020至2025年间将细菌次生代谢产物重新定位为抗微生物耐药性干预策略重要组成部分的关键进展 | 系统整合了细菌次生代谢产物作为耐药性修饰和抗毒力剂的机制与进化分析，阐明了其相比单靶点抗生素具有更高耐药性发展屏障的原因，并讨论了基因组挖掘、多组学、合成生物学和AI辅助建模等现代发现与优化流程 | 未涉及具体实验验证数据，药代动力学和药效学约束、临床前验证及监管制造商业化等方面仍面临挑战 | 探索细菌次生代谢产物作为耐药性修饰佐剂在抗微生物耐药性干预中的潜力、机制和转化应用前景 | 细菌次生代谢产物 | 机器学习 | NA | 基因组挖掘, 多组学, 合成生物学, AI辅助结构-活性建模 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 13 | 2026-09-21 |
From biological surfaces to engineered systems: how synthetic and systems biology enable biomimetic design
2026, Frontiers in systems biology
DOI:10.3389/fsysb.2026.1860815
PMID:42761473
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综述 | 本文综述了如何利用系统生物学和合成生物学从生物表面的结构与功能特性中提取设计原则，并将其转化为先进的仿生工程系统 | 通过整合系统生物学与合成生物学的框架，从生物表面的通讯、交换、防御和运动功能中提炼设计原理，并系统阐述其向工程系统的转化路径，弥补了现有综述多聚焦制造方法而忽视生物学机制的不足 | 作为综述文章，未提供原创实验数据，所提出的整合框架和设计原则的实际可行性尚需通过具体工程实践加以验证 | 建立一个整合系统生物学与合成生物学的框架，阐明生物表面的关键设计原则如何指导下一代仿生系统的设计 | 生物表面（包括通讯、分子交换、防御和运动相关的表面结构）及由其启发的仿生工程系统 | 合成生物学, 系统生物学, 仿生工程 | NA | 系统生物学建模, 合成生物学工程化, 多尺度定量模型 | 多尺度定量模型 | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 材料, 工业生物技术, 环境 |
| 14 | 2026-09-21 |
Cell-type-specific alkaloid and terpenoid biosynthesis in glandular trichomes: single-cell and spatial transcriptomic perspectives
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1911787
PMID:42761523
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综述 | 本文系统总结了单细胞和空间组学技术在腺毛研究中的最新应用，重点关注关键模式植物中生物碱和萜类化合物的生物合成途径 | 整合单细胞组学和空间组学技术，揭示了腺毛内不同细胞类型的代谢酶和转运蛋白的空间分布，构建了更精细和预测性的代谢网络模型 | 传统宏观组学方法常忽视组织内的细胞异质性，难以解析腺毛中不同细胞类型的具体动态 | 探讨单细胞和空间组学技术在腺毛次生代谢研究中的应用，并展望其与合成生物学的深度整合前景 | 腺毛及其参与的生物碱和萜类化合物生物合成途径，涉及关键模式植物如（L.）G. Don、L.、L.等 | 植物次生代谢 | NA | 单细胞组学，空间组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业，医学 |
| 15 | 2026-09-21 |
Algae and microbial proteins for alternative proteins: Untapped molecular resources
2026, Advances in protein chemistry and structural biology
DOI:10.1016/bs.apcsb.2026.08.003
PMID:42763115
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综述 | 本章批判性地综述了微藻、蓝细菌、酵母、丝状真菌和细菌等用于单细胞蛋白生产的平台的分类、生化和结构多样性，重点关注提取与下游加工、分子表征、营养品质、生物活性潜力、监管框架以及合成生物学和代谢工程等新兴进展 | 系统整合了藻类和微生物蛋白的分子见解、过程工程和循环生物经济原则，强调了未充分利用的分子资源在替代蛋白中的潜力 | 摘要未明确提及具体限制 | 综述藻类和微生物蛋白作为替代蛋白的未开发分子资源，探讨其生产、表征、应用及未来发展方向 | 微藻、蓝细菌、酵母、丝状真菌、细菌 | 合成生物学 | NA | 多组学 | NA | 文本 | NA | NA | 微藻, 蓝细菌, 酵母, 丝状真菌, 细菌 | NA | 食品 |
| 16 | 2026-09-20 |
Advances in the engineering of living probiotics for cancer immunotherapy
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.125301
PMID:41355950
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综述 | 本文综述了用于癌症免疫治疗的工程化活益生菌的研究进展，包括细菌与肿瘤的关系、工程化改造方法及其在癌症治疗中的应用 | 系统总结了物理化学方法和合成生物学方法改造细菌的策略，并探讨了联合治疗、个性化医疗和微生物组在提高治疗效果中的潜力 | 作为综述文章，未提供原始实验数据，对具体工程化策略的疗效和安全性缺乏定量比较分析 | 概述细菌与肿瘤的复杂关系，讨论细菌改造的工程方法，并探讨其在癌症治疗中的应用前景 | 活益生菌、工程化细菌、肿瘤微环境、免疫系统 | 肿瘤免疫治疗、合成生物学 | 癌症 | 合成生物学、物理化学改造方法 | NA | 文本 | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 17 | 2026-09-20 |
Engineered food-borne probiotics delivering checkpoint-inhibitor modulators
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004399
PMID:41497008
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综述 | 该文章综述了工程化食源性益生菌作为递送检查点抑制剂调节剂的平台，结合合成生物学、营养学和癌症免疫治疗，并总结了临床前和临床证据 | 将食源性益生菌工程化以递送检查点抑制剂调节剂（如可溶性CD80、PD-L1纳米抗体、IL-2），并整合临床荟萃分析和I期试验数据，提出可食用生物制剂作为低毒性免疫治疗平台 | 仍面临定植效率和生物安全性方面的挑战 | 探讨工程化食源性益生菌递送检查点抑制剂调节剂在癌症免疫治疗中的效果和潜力 | 工程化食源性益生菌、检查点抑制剂调节剂、肿瘤模型、肠道微生物组、非小细胞肺癌患者 | 机器学习 | 肺癌 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 益生菌 | 可控遗传回路 | 医学 |
| 18 | 2026-09-20 |
Engineered Lactobacillus expressing tumor-killing cytokines: a novel biotherapeutic
2026-Jan, Annals of medicine and surgery (2012)
DOI:10.1097/MS9.0000000000004400
PMID:41497134
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综述 | 本文综述了工程化乳酸杆菌表达肿瘤杀伤性细胞因子（如IL-12、IL-15和TRAIL）作为一种新型生物治疗策略的研究进展 | 将免疫治疗与微生物组工程相结合，利用工程化乳酸杆菌实现局部递送肿瘤杀伤性细胞因子，在保持疗效的同时规避全身性细胞因子治疗的剂量限制性毒性 | 目前主要证据来自小鼠模型，尚缺乏临床试验数据；工程菌在人体内的定植效率、长期安全性及生物安全控制仍需进一步验证 | 探讨工程化乳酸杆菌表达肿瘤杀伤性细胞因子作为新型抗肿瘤生物治疗剂的可行性与转化潜力 | 工程化乳酸杆菌（表达IL-12、IL-15、TRAIL等细胞因子），以及结直肠肿瘤、胰腺肿瘤等实体瘤模型 | 机器学习 | 肺癌 | 合成生物学、微生物组工程 | NA | 文本 | NA | NA | 乳酸杆菌 | 诱导型启动子、生物安全杀伤开关 | 医学 |
| 19 | 2026-09-20 |
Synthetic microbiomes in bioengineered rhizospheres: new frontiers for climate-resilient agriculture
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1780132
PMID:42039802
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综述 | 本文综述了合成微生物组与工程化根际在气候韧性农业中的应用，重点关注细菌、真菌、原生生物和古菌等多界微生物相互作用及其在工程根际系统中的胁迫特异性应用 | 强调了多界微生物相互作用（包括细菌、真菌、原生生物和古菌）在工程化根际系统中的潜力，整合了微生物生态学、基因组学和系统生物学知识，并探讨了CRISPR基因编辑和代谢途径工程等合成生物学工具在优化微生物性状中的应用 | 在多界微生物动态理解、针对特定环境条件优化合成微生物群落、以及将实验室成果转化为可靠的田间规模应用方面仍存在知识空白，同时在规模化田间应用、确保生态安全性和一致性方面仍面临挑战 | 探讨通过合成微生物组和工程化根际增强植物在环境胁迫下的韧性，推动气候韧性可持续农业系统的发展 | 合成微生物组、工程化根际、植物相关微生物群落（包括细菌、真菌、原生生物和古菌） | 合成生物学、微生物生态学、农业生物技术 | NA | CRISPR基因编辑、代谢途径工程、高通量筛选、机器学习、宏基因组分析 | NA | 文本 | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | 合成微生物群落、代谢途径 | 农业、环境 |
| 20 | 2026-09-20 |
Targeting cancer hallmarks with microbiome-derived bacteriocins and postbiotics: molecular mechanisms and translational opportunities in oncology
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1899156
PMID:42757169
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综述 | 本文综述了微生物组来源的细菌素和后生元代谢物作为抗癌剂的作用机制、计算辅助发现、纳米递送系统及临床转化挑战 | 系统整合了微生物组学、合成生物学、计算药物发现和纳米递送技术，全面阐述了细菌素和后生元在精准肿瘤学中的转化潜力 | 临床证据有限，实验方法未标准化，药代动力学性质差，生产制造受限，监管障碍显著 | 全面评估细菌素和后生元代谢物作为抗癌剂的研究现状，探讨其来源、结构功能特性、作用机制及临床转化挑战 | 细菌素、后生元代谢物（短链脂肪酸、吲哚衍生物、路透菌素、微生物外多糖）、产细菌素微生物 | 肿瘤学、微生物组学、计算药物发现 | 癌症（广谱） | 分子对接、分子动力学模拟、系统生物学、人工智能、纳米技术 | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学 |