合成生物学相关文章
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当前共找到 21 篇文献，本页显示第 1 - 20 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2025-12-14 |
Structure prediction and engineering of de novo proteins
2026-Jan-01, Biochimica et biophysica acta. Proteins and proteomics
DOI:10.1016/j.bbapap.2025.141100
PMID:40962101
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综述 | 本文综述了从头蛋白质的定义、历史、功能意义和研究方法，涵盖自然进化与人工设计两类，并探讨了该领域当前面临的挑战与未来方向 | 系统比较了自然进化与人工设计两类从头蛋白质的研究范式，强调了两者在生物学发现与工程应用中的融合趋势 | 作为综述文章，未提出新的实验数据或计算模型，主要基于现有文献进行归纳分析 | 梳理从头蛋白质研究领域的发展脉络、方法学及挑战，促进进化生物学与合成生物学的交叉融合 | 自然进化的从头蛋白质（源于非编码DNA）与人工设计的从头蛋白质（通过计算与实验方法从头创建） | 合成生物学 | NA | 计算设计、实验方法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物技术 |
| 2 | 2025-12-14 |
Metabolic Engineering of Acinetobacter baylyi ADP1 for L-Leucine Production
2026-Jan, Journal of basic microbiology
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/jobm.70075
PMID:40745981
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研究论文 | 本文通过代谢工程改造Acinetobacter baylyi ADP1，以提高L-亮氨酸的产量 | 在ADP1中，仅过表达天然野生型leuA和ilvBN基因即可有效驱动L-亮氨酸合成，无需反馈抑制抗性变体，且开发了基于sRNA的系统动态抑制TCA循环基因以平衡细胞生长与产物合成 | ADP1独特的葡萄糖分解代谢网络限制了丙酮酸供应，需补充丙酮酸并减少碳损失以优化生产 | 评估ADP1作为合成生物学底盘在天然产物生物合成中的潜力，并优化L-亮氨酸生产 | Acinetobacter baylyi ADP1菌株 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、基因过表达、基因敲除、基于sRNA的诱导型调控系统 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | Acinetobacter baylyi ADP1 | L-亮氨酸生物合成途径改造、Entner-Doudoroff途径增强、TCA循环动态抑制 | 工业生物技术 |
| 3 | 2025-12-12 |
Living materials for gas therapy
2026-Jan, Advanced drug delivery reviews
IF:15.2Q1
DOI:10.1016/j.addr.2025.115738
PMID:41248756
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综述 | 本文系统总结了基于活体材料的气体疗法最新进展，重点按生物来源和工程设计原则分类，并讨论了其在癌症、炎症性疾病和组织再生中的治疗机制与疗效 | 提出活体材料作为气体疗法的新范式，利用工程化生物实体（如细菌、细胞、藻类）实现智能气体生成和可控释放，克服传统纳米载体的生物相容性、靶向性和响应性不足 | 生物安全性和可扩展性仍是主要挑战 | 推动精准气体医学领域发展，通过整合合成生物学和多模式治疗策略优化气体疗法 | 一氧化氮、一氧化碳、硫化氢、氢气和二氧化硫等医用气体 | NA | 癌症、炎症性疾病 | 合成生物学、基因编程、仿生工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌、细胞、藻类 | 生物传感器、代谢途径、逻辑门、振荡器 | 医学 |
| 4 | 2025-12-12 |
Rooted intelligence: Integrating AI, Omics, and Synthetic biology to engineer the plant microbiome
2026-Jan, 3 Biotech
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s13205-025-04614-w
PMID:41376894
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综述 | 本文综述了整合组学、合成生物学和人工智能以深化对植物-微生物互作的理解并支持可持续农业的最新进展 | 提出了“根植智能”的概念，将AI、组学和合成生物学整合用于工程化设计植物微生物组，旨在理性设计下一代植物根际促生菌和合成微生物群落 | 将实验室发现转化到田间条件存在挑战，需确保工程微生物的生物安全性，并解决伦理和监管问题 | 通过跨学科技术整合，支持可持续农业并设计适应不同农业生态系统的优化微生物群落 | 植物微生物组、植物-微生物相互作用、根际微生物群落 | 合成生物学、人工智能、农业生物技术 | NA | 组学技术（包括多组学数据整合）、合成生物学、AI驱动的预测建模和实时表型分析 | 预测建模、AI驱动工具 | 多组学数据、表型数据 | NA | 合成生物学工具（用于设计微生物菌株和合成群落） | 植物根际微生物 | 设计具有增强性状（如营养溶解、胁迫耐受、病原抑制）的微生物菌株和合成群落 | 农业、环境 |
| 5 | 2025-12-11 |
The Road to Sustainable Soy Sauce Production and Consumption
2026-Jan, Comprehensive reviews in food science and food safety
IF:12.0Q1
DOI:10.1111/1541-4337.70352
PMID:41355608
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综述 | 本文通过系统综述分析了酱油生产与消费的趋势，重点关注工艺优化、微生物发酵、安全性、废物管理和新兴分析技术五个关键领域，并提出了一个连接可持续性核心支柱的整合框架 | 提出了一个连接环境、经济、社会、技术和营养五大可持续性支柱的整合框架，并系统性地将传统工艺与宏基因组学、合成生物学、酶工程及多组学等新兴技术相结合进行趋势分析 | 整合传统方法与精准发酵等新兴技术仍面临微生物菌株不相容、可扩展性问题以及保持文化真实性和感官属性的挑战 | 审查酱油生产与消费的趋势，并为未来的研究、政策制定和工业实践提供方向，以促进可持续的酱油生产与消费 | 酱油的生产工艺、微生物发酵过程、消费模式及相关可持续性创新 | NA | NA | 宏基因组学、合成生物学、酶工程、多组学方法（代谢组学、基因组学、转录组学）、光谱学、传感器系统 | NA | 同行评审文献数据 | 181篇同行评审文章 | 合成生物学 | NA | NA | 食品, 工业生物技术 |
| 6 | 2025-12-11 |
Advances in the engineering of living probiotics for cancer immunotherapy
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.125301
PMID:41355950
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综述 | 本文综述了工程化活益生菌在癌症免疫治疗中的应用进展，包括细菌与肿瘤的复杂关系、细菌修饰的工程方法及其在增强癌症疗法中的应用 | 系统总结了利用合成生物学等工程方法改造活益生菌以增强其靶向肿瘤、激活免疫反应的能力，并探讨了联合疗法、个性化医疗及微生物组在提升疗效中的潜力 | NA | 探讨工程化活益生菌作为癌症免疫治疗新策略的潜力与应用 | 活益生菌及其工程化改造系统 | 合成生物学 | 癌症 | 测序技术、理化方法、合成生物学 | NA | NA | NA | 合成生物学 | 益生菌 | 基于细菌的药物递送系统 | 医学 |
| 7 | 2025-12-10 |
Biogenic amines in fermented foods: A comprehensive review from formation pathways, risk analysis, detection technologies to control measures
2026-Jan-15, Food research international (Ottawa, Ont.)
DOI:10.1016/j.foodres.2025.117832
PMID:41360534
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综述 | 本文系统综述了发酵食品中生物胺的形成途径、风险分析、检测技术及控制措施，特别聚焦于微生物策略及其机制与未来展望 | 特别强调微生物控制策略作为内在兼容的解决方案，并展望了将微生物策略与AI驱动的生物传感器等智能技术结合，以及利用合成生物学提高酶产量的未来研究方向 | 在优化菌株效能、稳定性及大规模生产应用方面仍存在挑战 | 为发酵食品中生物胺的相关研究和实际应用提供结构化参考 | 发酵食品中的生物胺 | NA | NA | AI驱动的生物传感器、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 食品 |
| 8 | 2025-12-10 |
Chromatin Landscape of Saccharomyces cerevisiae Acquiring H3K9 Methylation and Its Reader Molecule HP1
2026-Jan, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.70072
PMID:41362113
|
研究论文 | 本研究通过合成生物学方法，将小鼠的H3K9甲基化酶和HP1引入酿酒酵母，探究H3K9甲基化及其阅读分子HP1对转录和染色质结构的影响 | 首次在缺乏H3K9甲基化系统的酿酒酵母中引入哺乳动物H3K9甲基化酶和HP1，以克服系统冗余问题，直接评估其在异染色质形成中的作用 | 研究仅在酿酒酵母的基因体区域进行，可能无法完全反映H3K9甲基化和HP1在高等生物中的全部功能，且未观察到对转录或染色质三维结构的显著影响 | 探究H3K9甲基化和HP1在异染色质形成中的具体作用机制 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 合成生物学 | NA | Hi-C-seq分析 | NA | 基因组测序数据 | NA | 合成生物学方法 | 酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae） | 引入小鼠H3K9甲基化酶催化H3K9甲基化及HP1蛋白 | 基础研究 |
| 9 | 2025-12-09 |
Extraction, preparation, pharmacological activities, and potential applications of ginsenosides Rk1 and Rg5
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120678
PMID:41052692
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综述 | 本文系统总结了稀有皂苷Rk1和Rg5在天然来源、提取加工、结构特性、药理机制及在功能性食品和营养品中潜在应用的最新进展 | 整合了网络药理学和分子对接技术来预测Rk1和Rg5的潜在抗癌及生殖保护作用，并探讨了人工智能辅助生物转化和合成生物学等新兴技术为其规模化生产提供的新途径 | 稀有皂苷Rk1和Rg5的天然丰度低、结构复杂且可持续生产面临挑战，其药代动力学特征尚不明确，缺乏严格的临床试验验证其疗效 | 系统总结稀有皂苷Rk1和Rg5的研究进展，弥合临床前研究与临床转化之间的差距，促进其在医疗保健和营养领域的更广泛应用 | 人参属植物（人参、西洋参、三七）中的稀有皂苷成分，特别是Rk1和Rg5 | NA | 肿瘤、代谢性疾病、神经退行性疾病、心血管疾病 | 网络药理学、分子对接、化学与物理转化方法、人工智能辅助生物转化、合成生物学策略 | NA | 文献数据、药理模型数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、功能性食品、营养品 |
| 10 | 2025-12-05 |
Marine-derived natural products as anti-osteoporosis agents
2026-Jan-15, European journal of medicinal chemistry
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ejmech.2025.118284
PMID:41138334
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综述 | 本文系统总结了152种具有抗骨质疏松活性的海洋天然产物，并探讨了其生物合成途径、全合成策略及临床转化挑战 | 首次系统梳理海洋来源（主要为海洋真菌）的抗骨质疏松天然产物，并整合基因组挖掘与合成生物学等新兴技术推动临床转化 | 未涉及具体临床实验数据，转化路径中的药效学与毒理学评估仍需深入 | 加速海洋天然产物在骨质疏松治疗领域的药物开发 | 海洋来源的天然产物（以聚酮类和萜类为主） | NA | 骨质疏松症 | 基因组挖掘、合成生物学 | NA | 文献数据、化合物结构信息 | 152种海洋天然产物 | NA | 海洋真菌 | NA | 医药 |
| 11 | 2025-12-04 |
Darkfield illumination enhancing artificial-intelligence-assisted digital microfluidics for on-site pathogen detection
2026-Jan-08, Analytica chimica acta
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.aca.2025.344831
PMID:41330666
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研究论文 | 本研究提出了一种集成暗场照明的数字微流控平台，通过人工智能辅助增强液滴检测性能，用于现场病原体检测 | 开发了具有可切换双模式光学系统的ITO-DMF平台，利用暗场成像显著提升液滴对比度，优化AI驱动的液滴识别和特征提取 | NA | 提高数字微流控系统中基于人工智能的液滴识别精度，实现自动化病原体检测 | 数字微流控平台中的液滴，以及临床样本中的肺炎支原体 | 计算机视觉 | 肺炎 | 暗场成像，荧光成像，qPCR | 深度学习模型 | 图像 | 临床样本 | NA | NA | NA | 医学 |
| 12 | 2025-12-03 |
Microplastics and microbial interactions in marine environments: A critical review on biogeochemical cycling and ecological impacts
2026-Jan, Marine pollution bulletin
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.marpolbul.2025.118891
PMID:41166776
|
综述 | 本文通过文献计量分析和机制综述，系统探讨了海洋环境中微塑料与微生物之间的双向相互作用及其对生物地球化学循环和生态的影响 | 整合了文献计量分析（2015-2025）与机制综述，系统性地阐述了微塑料与微生物的双向相互作用及其对海洋生物地球化学循环的级联效应 | 在将分子水平机制与生态系统尺度结果（尤其是在深海和沉积物生境中）联系起来方面仍存在关键空白 | 研究海洋微塑料污染及其与微生物的相互作用对生物地球化学循环和生态系统的影响 | 海洋环境中的微塑料和微生物 | NA | NA | 文献计量分析，多组学技术，沉积物微生物学 | NA | 文献数据 | NA | 合成生物学 | NA | NA | 环境 |
| 13 | 2025-11-21 |
Gene expression and protein abundance: Just how associated are these molecular traits?
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108720
PMID:41038299
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综述 | 本文综述了基因表达与蛋白质丰度之间关系的研究进展，重点关注不同实验环境和细胞背景下两者的关联性 | 系统分类和比较了基于不同相关性度量方法的研究，并整合了单细胞分析等最新技术进展 | 主要依赖相关性分析，对因果关系的解释有限 | 探讨基因表达与蛋白质丰度之间的关联程度及其在生物技术中的应用潜力 | 基因表达与蛋白质丰度的关系研究 | 合成生物学 | NA | 转录组学、蛋白质组学、单细胞分析 | 统计模型、机制模型、机器学习、深度学习 | 组学数据 | NA | NA | NA | NA | 生物技术、代谢工程、合成生物学 |
| 14 | 2025-11-21 |
Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108748
PMID:41187847
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综述 | 探讨细菌通过RNA水平机制精确控制蛋白质亚基化学计量比及其在合成生物学中的应用 | 超越经典转录调控，聚焦转录后精细调控机制，并展示如何将这些天然策略转化为可编程的合成基因电路设计 | NA | 解析细菌控制转录化学计量比的机制并开发合成生物学应用工具 | 细菌转录调控机制和合成基因电路 | 合成生物学 | NA | RNA水平调控分析、合成基因电路设计 | NA | NA | NA | 启动子文库、工程化终止子、RNase处理模块 | 细菌 | 合成基因电路、代谢途径工程、蛋白质组装系统 | 生物技术、生物医学 |
| 15 | 2025-11-21 |
Synthetic biology for scalable production of medical polyhydroxyalkanoates: Advances and applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108722
PMID:41046988
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综述 | 本文综述了合成生物学在医用聚羟基脂肪酸酯规模化生产中的进展与应用 | 系统整合了CRISPR/Cas基因组编辑、启动子工程、核糖体结合位点优化等合成生物学技术，并引入嗜盐菌下一代工业生物技术提升生产经济性 | 未提供具体实验数据验证技术改进效果，主要基于现有研究进展的总结分析 | 探讨合成生物学技术促进医用聚羟基脂肪酸酯规模化生产的进展与前景 | 聚羟基脂肪酸酯及其生产工艺 | 合成生物学 | NA | CRISPR/Cas基因组编辑, 启动子工程, 核糖体结合位点优化, 代谢通路优化, 形态工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 嗜盐菌 | 代谢通路优化 | 医药, 工业生物技术 |
| 16 | 2025-11-18 |
Development of a thermophilic l-arabinose-inducible system in Acetivibrio thermocellus (Clostridium thermocellum)
2026-Jan, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.008
PMID:40976505
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研究论文 | 本研究在热纤维梭菌中开发了一种热稳定的L-阿拉伯糖诱导表达系统 | 首次在热纤维梭菌中构建了具有175倍诱导动态范围和可忽略背景表达的热稳定L-阿拉伯糖诱导系统 | 未在其他梭菌属微生物中进行广泛验证 | 开发适用于热纤维梭菌的热稳定诱导表达系统 | 热纤维梭菌（Acetivibrio thermocellus） | 合成生物学 | NA | 启动子工程、条件优化 | NA | NA | NA | 启动子工程 | 热纤维梭菌（Acetivibrio thermocellus） | L-阿拉伯糖诱导系统，包含来自嗜热脂肪地芽孢杆菌T-6的诱导型启动子P和阻遏蛋白AraR | 工业生物技术, 能源 |
| 17 | 2025-11-18 |
Edible fungus Fusarium venenatum: advances, challenges, and engineering strategies for future food production
2026-Jan, Metabolic engineering
IF:6.8Q1
DOI:10.1016/j.ymben.2025.09.009
PMID:41015229
|
综述 | 系统总结食用真菌Fusarium venenatum在合成生物学工具开发、底盘工程及应用方面的最新进展，探讨未来食品生物制造的挑战与发展策略 | 首次针对Fusarium venenatum菌株的系统性综述，填补了该领域在合成生物学工具开发和底盘工程应用方面的综述空白 | NA | 为基于Fusarium venenatum的未来食品生产系统开发提供思路和指导 | 食用丝状真菌Fusarium venenatum | 合成生物学 | NA | 合成生物学技术 | NA | NA | NA | NA | Fusarium venenatum | NA | 食品, 农业 |
| 18 | 2025-11-16 |
Integrated base editing and microfluidics boost microbial lipid production from lignin
2026-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133441
PMID:41045995
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研究论文 | 本研究通过整合碱基编辑和微流控技术，开发了一种提升真菌利用木质素生产微生物油脂的方法 | 建立了铜诱导的MCM5-AID碱基编辑器实现全基因组C-to-T/G-to-A诱变，并结合微流控技术进行超高通量筛选 | NA | 提升微生物利用木质素生产油脂的能力 | 弯曲孢子菌Curvularia clavata J1 | 合成生物学 | NA | 碱基编辑, 微流控技术, 转录组学, 基因组测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | 碱基编辑 | 弯曲孢子菌 | 铜诱导的MCM5-AID碱基编辑系统 | 能源, 工业生物技术 |
| 19 | 2025-11-16 |
Efficient biosynthesis of retinal from Escherichia coli by metabolic engineering
2026-Jan, Bioresource technology
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.biortech.2025.133501
PMID:41093029
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研究论文 | 本研究通过代谢工程改造大肠杆菌，实现了从生物资源高效合成视网膜的目标 | 采用系统与合成生物学方法构建高效视网膜生物合成细胞工厂，整合酶工程、翻译工程、膜工程和中心碳代谢重构等多层次工程策略 | 膜工程和NADPH再生的尝试未能提高视网膜产量 | 开发高效的视网膜生物合成方法 | 大肠杆菌BL21(DE3)工程菌株 | 代谢工程 | NA | 代谢工程、酶工程、定向进化、RBS优化、膜工程 | NA | NA | 4-L生物反应器规模 | CRISPR-Cas9, Gibson Assembly | 大肠杆菌 | 甲羟戊酸途径代谢工程、中心碳代谢重构、β-胡萝卜素合成途径、视网膜生物合成途径 | 医药, 工业生物技术 |
| 20 | 2025-11-02 |
A highly biosimilar synthetic Calculus Bovis enhances cerebral blood flow and provides neuroprotection against ischemic stroke
2026-Jan-30, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120602
PMID:40945882
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研究论文 | 本研究评估了高度生物相似性合成牛黄在缺血性脑卒中中的神经保护作用及改善脑血流的效果 | 首次通过合成生物学方法制备高度生物相似性合成牛黄，并证实其在缺血性脑卒中治疗中的有效性和作用机制 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠模型，未涉及其他物种或性别差异研究 | 评估合成牛黄对缺血性脑损伤的治疗效果及改善脑血流的作用 | 雄性C57BL/6J小鼠的缺血性脑卒中模型 | 生物医学工程 | 缺血性脑卒中 | 色谱指纹图谱分析、Fluoro-Jade B染色、尼氏染色、激光散斑对比成像 | NA | 生物化学数据、组织学图像、血流动力学数据 | 使用不同剂量合成牛黄处理的tMCAO模型小鼠 | 合成生物学 | NA | NA | 医药 |