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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-05-07 |
Improving governance in the age of synthetic biology, artificial intelligence, and diverging threats
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1705143
PMID:42088837
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研究论文 | 探讨合成生物学和人工智能时代如何改进治理以应对生物安全威胁 | 提出了一个包含四个相互关联组件的混合治理框架,并结合专家共识制定政策建议 | 依赖于少数专家的意见,可能无法涵盖所有视角 | 在合成生物学和人工智能时代改进治理,降低生物武器开发与扩散风险 | 生物威胁优先事项及治理框架 | NA | NA | Delphi过程 | NA | 定性数据 | 13位来自不同相关领域的专家 | 合成生物学 | NA | NA | 生物安全, 治理 |
| 2 | 2026-05-06 |
A comprehensive ruminant microbial catalog (CRMC) reveals convergent selection for key vitamin-synthesizing pathways and genes across ruminants and human
2026-Jan-21, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giag016
PMID:41738843
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研究论文 | 基于8种反刍动物的2325个宏基因组样本,重建了反刍动物胃肠道微生物组参考基因组目录(CRMC),并揭示了维生素合成微生物的分布模式和途径偏好 | 构建了目前最大的反刍动物胃肠道微生物基因组目录(CRMC),包含约39,696个MAGs,图谱拼接率高达83.45%,首次系统性地揭示了反刍动物与人类在维生素合成途径和基因节点选择上的趋同演化规律 | 可能受限于样本来源的多样性及宏基因组组装的完整性,未具体分析不同宿主间维生素合成微生物的功能差异或环境因素的影响 | 系统阐明反刍动物胃肠道维生素合成微生物的功能特征、生态角色及其在宿主间的分布模式 | 8种反刍动物(牛、羊等)的胃肠道宏基因组样本及维生素合成微生物 | 微生物组学 | NA | 宏基因组学、宏基因组组装基因组(MAG)重建、维生素合成通路分析 | NA | 宏基因组测序数据 | 2325个宏基因组样本,来源于8种反刍动物宿主 | NA | 反刍动物(牛、羊等) | NA | 农业、医学 |
| 3 | 2026-05-06 |
Microbial-Derived Anti-Cancer Compounds: Advances in Drug Discovery, Bioengineering, and Therapeutic Applications
2026, Anti-cancer agents in medicinal chemistry
IF:2.6Q3
|
综述 | 综述微生物来源抗癌化合物的发现、生物工程和治疗应用进展 | 整合人工智能、机器学习、分子对接与纳米技术来加速微生物代谢产物的发现和递送 | 缺乏体内验证和全面的药代动力学数据,临床转化面临挑战 | 探讨利用人工智能与合成生物学工程化微生物菌株以产生增强生物活性化合物,并利用纳米技术优化靶向递送机制 | 微生物代谢产物及其抗癌活性 | 机器学习 | 癌症 | 分子对接 | NA | 文本 | NA | 合成生物学 | 微生物 | NA | 医学 |
| 4 | 2026-05-05 |
Applications of Metabolomics in the Development of Biomedicine and Biotechnology
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-18966-0_21
PMID:42071157
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综述 | 探讨代谢组学从早期谱分析到与先进分析平台、计算生物学和精准医学整合的发展过程,并强调其在癌症、心血管疾病、糖尿病等疾病中的生物标志物发现、机制阐明和个性化治疗中的应用 | 系统阐述了代谢组学在生物医学和生物技术领域的整合应用,包括单细胞代谢组学和机器学习等新兴工具,及其在代谢流追踪和人工途径设计中的实践驱动作用 | 未明确提及具体局限性 | 概述代谢组学在生物医学和生物技术开发中的应用进展 | 代谢物和代谢途径,用于疾病机制和生物过程研究 | 生物信息学 | 癌症, 心血管疾病, 糖尿病 | 代谢组学, 单细胞代谢组学, 机器学习 | NA | 代谢物数据 | NA | NA | NA | 人工代谢途径 | 医学, 生物技术, 合成生物学 |
| 5 | 2026-05-02 |
Mass spectrometry integrates protein design into structural biology method development
2026, QRB discovery
DOI:10.1017/qrd.2025.10018
PMID:42063620
|
综述 | 概述了质谱如何通过验证多种设计目标来补充蛋白质设计,并探讨了工程蛋白作为方法开发测试平台的价值 | 提出将机器学习与原生质谱整合形成反馈循环的新观点,即新设计挑战分析技术,改进的方法提供更丰富数据以指导未来预测 | 未提及具体实验数据或量化分析,缺乏对整合方法实际效能的评估 | 阐述质谱在蛋白质设计验证中的作用及其与机器学习的协同关系 | 人工设计蛋白质及其结构特征(寡聚化、折叠、配体结合、动态构象变化) | 机器学习 | NA | 质谱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学, 人工原细胞开发 |
| 6 | 2026-05-02 |
PSMA-directed CAR-T cell therapy for metastatic castration-resistant prostate cancer: a next-generation engineering perspective on stem cell-derived immune effectors
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1819701
PMID:42064077
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综述 | 这篇综述回顾了针对转移性去势抵抗性前列腺癌(mCRPC)的PSMA导向CAR-T细胞疗法的临床翻译现状,并提出了一种三重协同框架来克服TME免疫抑制、抗原异质性和T细胞适应性等核心挑战 | 提出了三重协同框架系统解构实体瘤障碍,并聚焦于干细胞衍生免疫效应器(如iPSC衍生CAR-T、CAR-NK、CAR-巨噬细胞)作为新一代细胞产品范式,同时纳入基于证据的等级评估提升学术严谨性 | NA | 为PSMA-CAR-T疗法提供战略蓝图,以将其推进至mCRPC的治愈性治疗,并广泛适用于新一代干细胞衍生免疫疗法 | PSMA导向CAR-T细胞疗法及其在mCRPC中的临床应用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | CAR-T细胞疗法 | NA | NA | NA | NA | 人 | 嵌合抗原受体 | 医学 |
| 7 | 2026-05-01 |
Rewiring gene circuits to dissect oscillatory signaling dynamics
2026-01-05, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.353319.125
PMID:41162152
|
研究论文 | 利用合成生物学重构DELTA-NOTCH信号通路,研究分节时钟中细胞间振荡通讯的动态机制 | 首次通过合成生物学方法重建DELTA-NOTCH通路,并结合光遗传学验证配体呈现动态对细胞通讯的关键作用 | 结果主要基于小鼠PSM类器官模型,需进一步在体内验证 | 验证DELTA-NOTCH信号在分节时钟中耦合细胞间振荡的作用 | 小鼠前体节中胚层类器官中的DELTA缺陷细胞 | 合成生物学 | NA | 合成生物学构建、光遗传学激活 | NA | NA | NA | 合成DELTA-NOTCH通路 | 小鼠 | DELTA-NOTCH信号振荡回路 | 发育生物学 |
| 8 | 2026-05-01 |
Microbial response and resistance mechanisms against diverse anthropogenic pollutants
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1775529
PMID:42057789
|
综述 | 本文综述了微生物对人类活动产生的多种污染物的响应和抗性机制 | 整合微生物天然抗性、实验室适应性进化及组学技术,揭示污染物特异性与生物特异性适应策略 | 群落水平多组学研究不足、真菌相关数据相对有限以及混合培养研究面临的挑战 | 增强对微生物响应与抵抗人为污染物机制的理解 | 细菌、微藻、真菌等微生物 | 机器学习 | NA | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | NA | NA | NA | 细菌、微藻、真菌 | NA | 环境, 生物修复, 生物监测, 合成生物学 |
| 9 | 2026-05-01 |
Biosecurity in the age of synthetic nucleic acids: modernizing the law to manage emerging threats
2026 Jan-Jun, Journal of law and the biosciences
IF:2.5Q1
DOI:10.1093/jlb/lsag005
PMID:42058498
|
综述 | 本文分析了合成核酸技术带来的生物安全挑战,并建议更新国际法以加强监管 | 提出结合具有约束力的国际义务与协调技术标准的跨国新治理方法来管理合成核酸风险 | 未提供实证研究或定量评估,主要基于法律和政策分析 | 评估当前生物安全框架对合成核酸的适用性并提出法律改革建议 | 合成核酸技术及相关的国际法律和监管框架 | NA | NA | 合成核酸技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 生物安全、法律 |
| 10 | 2026-04-30 |
AI-Driven De Novo Binder Design: From Structure Prediction to Closed-Loop Optimization
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0070
PMID:42052042
|
综述 | 总结了人工智能驱动从头设计蛋白结合物的标准化技术栈,涵盖从结构预测到闭环优化的实用工作流程 | 系统整合了结构预测、蛋白质语言模型和扩散生成建模等前沿技术,提出了从计算设计到实验反馈的完整闭环优化框架 | 面临诱导契合、负设计和数据集偏差等关键挑战,端到端复合物生成尚未实现 | 综述人工智能驱动的从头蛋白结合物设计方法,建立标准化技术栈 | 蛋白结合物(包括抗体和非抗体支架,如单抗体和设计的锚蛋白重复蛋白) | 机器学习 | NA | 结构预测、蛋白质语言模型、扩散生成建模 | 扩散模型、蛋白质语言模型 | 蛋白质序列、蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 医学、合成生物学 |
| 11 | 2026-04-30 |
Artificial intelligence and synthetic biology in traditional Chinese medicine: revolutionizing public health applications
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1789960
PMID:42052276
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综述 | 探讨人工智能与合成生物学在中医药现代化中的应用,以推动公共卫生领域的革新 | 首次系统综述人工智能与合成生物学的协同作用,提出将中医药从经验实践转化为标准化、循证公共卫生干预的路径 | 综述性质缺乏实验验证,未来需增强AI可解释性、扩展生物数据库及优化跨学科协作 | 分析人工智能与合成生物学如何解决中医药面临的资源不可持续、多靶点机制模糊及标准化不足等挑战 | 中医药的活性化合物、临床诊疗体系及公共卫生应用 | 机器学习 | COVID-19 | NA | NA | 文本 | NA | NA | NA | NA | 医学, 制药 |
| 12 | 2026-04-28 |
Bacterial secondary metabolites as resistance-modifying adjuvants: microbial origins, molecular mechanisms, and translational relevance
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1779022
PMID:42039799
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综述 | 综述2020至2025年间细菌次级代谢产物作为抗性修饰佐剂的研究进展 | 将细菌次级代谢产物重新定位为下一代抗菌药物耐药性干预策略的核心组成部分,并整合其化学多样性、生态功能及多项分子机制 | 未明确提及具体局限性,但综述性质决定了缺乏原始实验数据验证 | 阐述细菌次级代谢产物作为抗性修饰佐剂在对抗抗菌药物耐药性中的作用 | 细菌次级代谢产物及其抗性修饰机制 | 微生物学 | 抗菌药物耐药性相关疾病 | 基因组挖掘、多组学方法、合成生物学、人工智能辅助结构活性建模 | NA | 综述性数据 | NA | 合成生物学 | 细菌 | 抗性修饰回路(如外排泵抑制、β-内酰胺酶抑制、核糖体保护干扰、生物膜与群体感应网络破坏) | 医学、生物技术 |
| 13 | 2026-04-28 |
Synthetic microbiomes in bioengineered rhizospheres: new frontiers for climate-resilient agriculture
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1780132
PMID:42039802
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综述 | 探讨通过设计合成微生物组和工程化根际来增强植物在环境胁迫下的恢复力,以应对气候变化对农业的威胁 | 整合多界微生物(细菌、真菌、原生生物和古菌)互作,并结合合成生物学工具(如CRISPR)和系统生物学方法,提出针对特定胁迫的定制化根际工程策略 | 对多界微生物动态的理解不足、合成群落在特定环境下的优化困难、实验室成果向田间应用转化时面临规模化和生态安全性挑战 | 开发气候韧性可持续农业系统 | 多界微生物群落(细菌、真菌、原生生物、古菌)及植物根际系统 | 微生物生态学 | NA | CRISPR基因编辑、代谢通路工程、高通量筛选、机器学习、宏基因组分析 | NA | 宏基因组数据 | NA | CRISPR-Cas9, 代谢通路工程 | 植物(根际宿主) | 合成微生物组(SynComs)、根际工程(调控根系分泌物和土壤理化性质) | 农业 |
| 14 | 2026-04-22 |
Synthetic Control of Implanted Engineered Liver Tissue Growth
2026-Jan-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.10.693527
PMID:41427324
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研究论文 | 本文提出了一种通过合成生物学工具控制植入后工程肝组织生长的策略,以解决组织工程植入物规模扩大的临床转化难题 | 结合合成生物学和组织工程技术,首次实现植入后通过合成触发因子按需诱导工程肝组织生长 | NA | 开发一种通过植入后诱导生长来扩大工程组织规模的方法,以治疗器官衰竭 | 工程肝组织和人肝细胞 | 组织工程 | 器官衰竭 | 合成生物学工具、YAP和生长因子信号通路调控 | NA | NA | NA | 合成生物学工具 | 人肝细胞 | 通过合成生物学工具控制YAP和生长因子信号轴,以驱动组织扩张 | 医学 |
| 15 | 2026-04-16 |
Biomaterials Based on Bacteria for Cancer Clinical Therapy
2026, Biomaterials research
IF:8.1Q1
DOI:10.34133/bmr.0350
PMID:41982812
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综述 | 本文系统探讨了基于细菌的生物材料在癌症临床治疗中的应用,包括工程化细菌的抗肿瘤机制及其与标准疗法的协同潜力 | 利用合成生物学将细菌工程化为精确的活体治疗剂,实现局部药物递送、靶向免疫调节和肿瘤微环境重塑,并探讨其与化疗、放疗和免疫疗法的协同作用 | NA | 开发基于细菌的创新癌症治疗策略,克服传统治疗的耐药性 | 工程化细菌及其在肿瘤微环境中的作用 | NA | 癌症 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 细菌 | NA | 医学 |
| 16 | 2026-04-15 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343925
PMID:41941447
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研究论文 | 本研究利用合成生物学方法改造BCG疫苗,使其过量产生HMBPP以增强Vγ9Vδ2 T细胞的扩增,从而提升抗结核免疫效果 | 首次通过改造BCG的MEP途径过量产生HMBPP,利用宿主对细菌异戊二烯途径中间产物的自我-非我识别机制激活Vγ9Vδ2 T细胞 | 研究目前仅进行体外实验,尚未在动物模型或人体中验证效果 | 开发更有效的抗结核疫苗 | BCG疫苗菌株和人类Vγ9Vδ2 T细胞 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学工程、同线性分析、体外刺激实验 | NA | 基因组数据、体外细胞实验数据 | 超过63种分枝杆菌物种的356个基因组 | 合成生物学方法 | BCG(牛分枝杆菌减毒株) | 合成MEP途径基因座,过表达HMBPP合成酶GcpE以积累HMBPP | 医学 |
| 17 | 2026-04-15 |
Systems biology can provide guidance to synthetic biology in the pursuit of new drug targets
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1770107
PMID:41971098
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观点文章 | 本文通过案例研究展示了系统生物学分析在指导药物靶点发现中的力量,强调动态建模作为合成生物学中药物干预设计的探索工具 | 利用系统生物学分析简化生理电路,揭示直觉可能误导药物靶点选择,并展示动态建模如何克服这一挑战,为合成生物学提供指导 | 案例研究基于简化的线性代谢通路模型,可能未完全反映真实生物系统的复杂性 | 探索系统生物学如何指导合成生物学在寻找新药物靶点方面的应用 | 涉及NQO1酶和β-拉帕醌的癌症相关氧化还原电路,作为生理反馈机制的案例 | 系统生物学与合成生物学 | 癌症 | 动态建模 | NA | NA | NA | NA | NA | 涉及NQO1酶的正反馈回路,模拟生理和病理中观察到的电路类型 | 医学 |
| 18 | 2026-04-15 |
Programmable saponin biosynthesis from gene networks to predictive biomanufacturing
2026, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2026.1800149
PMID:41971552
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综述 | 本文综述了皂苷生物合成从基因网络到预测性生物制造的最新进展,包括合成生物学工具和AI辅助设计在优化生产平台中的应用 | 将皂苷研究从描述性途径阐明转向预测性和可编程的生物制造,通过合成生物学和AI技术实现精确控制与优化 | NA | 探讨皂苷生物合成的可编程和预测性生物制造策略 | 皂苷生物合成途径、基因网络和工业生物制造平台 | 合成生物学 | NA | CRISPR-based transcriptional modulation, synthetic promoters, transcription factor rewiring, structure-guided enzyme engineering, AI-assisted protein design | NA | 基因组、多组学数据、代谢基因簇分析 | NA | CRISPR-Cas9 | engineered microbes, plant suspension cells, hairy roots, adventitious root systems | biosynthetic networks, metabolic pathways | medicine, industrial biotechnology |
| 19 | 2026-04-11 |
Antimicrobial peptides: emerging next-generation strategy for sustainable plant disease management
2026, Frontiers in antibiotics
DOI:10.3389/frabi.2026.1766594
PMID:41958967
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综述 | 本文综述了抗菌肽作为可持续植物病害管理的新一代策略,包括其作用机制、结构功能多样性以及在农业中的应用潜力 | 将抗菌肽定位为应对气候变化、单一栽培和化学农药过度使用等挑战的可持续解决方案,并整合了分子生物学、计算建模和合成生物学的最新进展来优化抗菌肽的应用 | NA | 评估抗菌肽作为化学农药和抗菌剂的替代品,为植物病害管理提供环境友好、持久且高效的策略 | 抗菌肽及其在植物病害防治中的应用 | NA | 植物病害 | 分子生物学、计算建模、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 20 | 2026-04-10 |
Chemistry and biology of imidazole, oxazole and thiazole alkaloids
2026, The Alkaloids. Chemistry and biology
DOI:10.1016/bs.alkal.2025.12.002
PMID:41951284
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综述 | 总结了含咪唑、噁唑和噻唑环的五元氮杂环天然产物的最新研究进展,包括其来源、分离、结构表征、生物活性、化学合成及合成生物学应用 | 系统性地将相关生物碱按共同结构特征或生物来源进行分类,并涵盖了最新的合成生物学研究进展 | NA | 综述含咪唑、噁唑和噻唑环的天然生物碱的化学与生物学研究 | 含咪唑、噁唑和噻唑环的天然生物碱 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 药物发现 |