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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 2026-06-17 |
Transmembrane Transport of cAMP and AMP Using a Two Component Small Molecule Transport System
2026-01-22, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202524663
PMID:41367116
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研究论文 | 报道首个在生理pH下利用中性双组分系统辅助环磷酸腺苷和磷酸腺苷穿过脂质体膜转运的研究 | 首次实现中性小分子系统对环磷酸腺苷和磷酸腺苷的跨膜转运,采用磷酸基团靶向合成阴离子载体与胸腺嘧啶衍生物协同作用提高转运效率 | 仅基于脂质体模型验证,未在活细胞体系中测试,且转运机制细节尚需进一步阐明 | 开发小分子系统实现核苷酸跨膜转运,探索在药物递送和合成生物学中的应用 | 环磷酸腺苷和磷酸腺苷的跨膜转运过程 | 合成生物学 | NA | 荧光检测、磷核磁共振 | NA | 实验数据 | 未明确样本数量,涉及脂质体模型和多种小分子化合物 | NA | 脂质体(模拟膜系统) | 双组分小分子转运系统:合成阴离子载体(氟化方酰胺)与胸腺嘧啶衍生物协同作用 | 药物递送, 合成生物学 |
| 2 | 2026-06-16 |
A CURE for synthetic regulation of gene expression: rapid screening of guide RNA efficacy as a framework for enabling undergraduate research in plant synthetic biology
2026, Synthetic biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/synbio/ysag007
PMID:42293129
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研究论文 | 开发并验证了一种基于课程的本科研经历(CURE),通过病毒载体快速筛选导向RNA(gRNA)效率,用于植物合成生物学中的基因表达调控 | 创新性地将CURE模式应用于植物合成生物学,利用病毒递送gRNA实现高通量快速筛选,解决植物转化周期长的难题 | 未明确说明局限性 | 开发适用于植物合成生物学的CURE框架,快速筛选靶向Cas9转录抑制因子的gRNA | 本科学员及三个基因的启动子区域 | 数字病理学 | NA | 病毒载体递送gRNA, 基因表达分析 | NA | 基因表达数据 | 12个新gRNA,稳定转基因系 | CRISPR-Cas9 | 植物 | Cas9转录抑制因子回路 | 农业, 工业生物技术 |
| 3 | 2026-06-15 |
Advances in Machine Learning Models for Predicting Enzyme Kinetic Parameters
2026-01-12, Journal of chemical information and modeling
IF:5.6Q1
DOI:10.1021/acs.jcim.5c02428
PMID:41406463
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综述 | 综述机器学习模型在预测酶动力学参数方面的最新进展 | 系统总结了基于机器学习的全局和局部模型在酶动力学参数预测中的应用,并提出了利用高通量数据生成和半监督学习来克服数据稀缺问题的新机遇 | 数据稀缺仍然是这些模型的主要限制 | 为利用机器学习提升酶动力学参数预测的性能、鲁棒性和范围提供路线图 | 酶动力学参数(kcat、Km、kcat/Km等) | 机器学习 | NA | NA | 机器学习模型(全局模型和局部模型) | 酶序列和动力学参数数据 | NA | NA | NA | NA | 酶工程、代谢建模、合成生物学 |
| 4 | 2026-06-15 |
Cell-free systems for expression of transmembrane protein
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.001
PMID:41688133
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综述 | 讨论无细胞蛋白合成系统在表达跨膜蛋白中的基本原理、进展和应用 | 全面比较原核和真核无细胞平台在跨膜蛋白生产中的优势,并深入探讨膜模拟物、折叠伴侣、非标准氨基酸等生化方法以及混合系统、微流控反应器和自动化等技术创新 | 未明确提及具体限制,但可推断无细胞系统在维持跨膜蛋白正确拓扑结构和功能性重构方面仍面临挑战 | 系统阐述无细胞蛋白合成在跨膜蛋白表达中的潜力和应用前景 | 跨膜蛋白及无细胞蛋白合成系统 | 合成生物学 | NA | 无细胞蛋白合成 | NA | NA | NA | 无细胞蛋白合成系统 | 原核生物、真核生物 | 无细胞表达系统用于跨膜蛋白生产 | 药物发现, 结构生物学, 生物传感器开发, 下一代生物制品 |
| 5 | 2026-06-15 |
Challenges and opportunities in cell-free systems
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.006
PMID:41688140
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综述 | 全面评估无细胞系统面临的挑战与机遇 | 系统总结了无细胞系统在医学应用中的最新进展,并深入探讨了技术、伦理、环境和社会平衡问题 | 未提供具体实验数据或案例验证,更多为观点性总结 | 评估无细胞系统的技术挑战与未来机遇 | 无细胞系统技术及其在医学领域的应用 | 合成生物学 | NA | 无细胞系统 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学, 疫苗生产, 基因表达研究, 即时诊断 |
| 6 | 2026-06-13 |
Leveraging a synthetic biology approach to enhance BCG-mediated expansion of Vγ9Vδ2 T cells
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0343925
PMID:41941447
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研究论文 | 利用合成生物学方法工程化BCG菌株以增强HMBPP的产生,进而促进Vγ9Vδ2 T细胞扩增 | 通过宿主自身-非自身识别机制利用HMBPP感知来增强免疫应答,而非传统的配体或抗原策略 | 尚未进行体内验证,且未评估工程菌株的安全性和长期免疫保护效果 | 开发更有效的抗结核疫苗,增强BCG诱导的免疫应答 | BCG菌株、Vγ9Vδ2 T细胞 | 合成生物学 | 结核病 | 合成生物学工程、体外刺激实验、同线性分析 | NA | 基因组序列、实验数据 | 超过63种分枝杆菌物种和356个基因组 | 合成生物学方法 | BCG(牛分枝杆菌卡介苗) | MEP途径合成基因座,包括HMBPP合酶GcpE过表达 | 医学 |
| 7 | 2026-06-11 |
Engineering yeast for sustainable bioproduction of tryptophan-derived aromatic compounds
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag012
PMID:41770028
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综述 | 该文章综述了通过工程化酵母可持续生产色氨酸衍生芳香族化合物的最新进展 | 系统总结了利用酵母细胞工厂生产色氨酸衍生物的最新策略与合成生物学工具 | 讨论了实现高效、可扩展和经济可行的酵母生物合成所面临的挑战 | 推动酵母在可持续生物生产中替代传统化学合成以应对气候变化和资源枯竭 | 酵母细胞工厂和色氨酸衍生芳香族化合物 | 合成生物学 | NA | 代谢工程、合成生物学工具 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick | 酵母 | 色氨酸代谢通路 | 聚合物、食品、饲料、化妆品、制药工业 |
| 8 | 2026-06-11 |
Characterization of phage AbpL with a terminally redundant genome and its therapeutic potential against drug-resistant Acinetobacter baumannii infections
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2026.1760018
PMID:41798749
|
研究论文 | 表征具有末端冗余基因组的噬菌体AbpL及其对耐药鲍曼不动杆菌感染的治疗潜力 | 首次分离并全面表征了具有400 bp末端冗余的噬菌体AbpL,评估其对多重耐药鲍曼不动杆菌的体内外疗效,并作为合成生物学工程候选平台 | 主要依赖小鼠模型,未涉及人体临床试验或长期安全性评估 | 评估噬菌体AbpL作为替代抗生素治疗多重耐药鲍曼不动杆菌感染的潜力 | 多重耐药鲍曼不动杆菌(MDR-AB)和噬菌体AbpL | NA | 鲍曼不动杆菌感染 | NA | NA | 实验数据(形态、生长特性、基因组、治疗结果) | 52%的临床MDR-AB分离株和40只小鼠(脓毒症模型) | NA | NA | NA | 医学 |
| 9 | 2026-06-10 |
Live biotherapeutics: Emerging trends and future directions in microbial therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.12.001
PMID:41714074
|
综述 | 综述了活体生物治疗产品在微生物疗法中的新兴趋势和未来方向 | 系统阐述了活体生物治疗产品从单一菌株到工程化微生物群落和天然配方的多样性发展,以及其在精准医学中的整合潜力 | 临床开发面临菌株筛选、复杂生产、活性问题及合并症患者安全性等关键挑战 | 概述当前活体生物治疗产品的种类、作用机制、临床应用及监管框架,并展望其未来方向 | 活体生物治疗产品 | NA | 代谢性疾病、神经系统疾病、免疫介导疾病 | 合成生物学、CRISPR基因组编辑、多组学 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | NA | 工程化微生物群落 | 医学 |
| 10 | 2026-06-10 |
Advancements in technology for developing recombinant live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.006
PMID:41714076
|
综述 | 综述重组活体生物治疗药物的最新技术进展及其在人类健康中的应用 | 综合了合成生物学、基因工程、多组学和人工智能/机器学习方法在重组活体生物治疗药物设计中的应用,强调了从基础研究到临床转化的创新策略 | 在可扩展性、安全性和临床应用方面仍存在重大挑战 | 总结重组活体生物治疗药物的开发进展,并指出其作为下一代治疗剂的机遇与障碍 | 基因和代谢工程改造的微生物物种 | 机器学习 | NA | 合成生物学, 基因工程, 多组学, 人工智能/机器学习 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 11 | 2026-06-10 |
The human reproductive tract microbiome: A novel source of live biotherapeutics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.027
PMID:41714081
|
综述 | 探讨人类生殖道微生物组作为活体生物治疗药物新来源的潜力 | 提出了将生殖道微生物组特别是阴道微生物作为下一代活体生物治疗药物候选来源的新视角 | 未提供具体实验数据或临床验证结果,仅为文献综述 | 探索人类生殖道微生物组作为活体生物治疗药物候选来源的应用潜力 | 人类生殖道微生物组,特别是女性阴道微生物群落 | 微生物组学 | 细菌性阴道病、性传播感染、不孕症、早产 | NA | NA | 文本 | NA | 合成生物学、基因工程 | 人类阴道 | NA | 医学 |
| 12 | 2026-06-10 |
Recent advances of microbial medicine to prevent and treat cardiovascular disease
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.028
PMID:41714082
|
综述 | 综述微生物医学在预防和治疗心血管疾病方面的最新进展,重点关注肠道微生物组的作用 | 提出微生物医学整合到心血管护理中,推动精准、整体和个性化治疗范式转变 | 面临菌株特异性、递送系统和监管框架等挑战 | 探索微生物医学在心血管疾病管理中的创新治疗干预措施及其影响 | 肠道微生物组及其代谢产物如短链脂肪酸、三甲胺N-氧化物和吲哚衍生物 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | NA | NA | NA | 人类肠道微生物组 | 肠道微生物代谢通路 | 医学 |
| 13 | 2026-06-10 |
Recombinant live biotherapeutics and synthetic biology: Recent advancement and perspective
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.004
PMID:41714087
|
综述 | 本文综述了重组活体生物治疗药物及其合成生物学的最新进展和前景 | 系统性地总结了合成生物学在精准改造微生物以调控宿主-微生物组相互作用、疾病通路和免疫反应方面的关键作用 | 未提供具体的实验数据或对比分析,可能缺乏对临床转化风险的深入探讨 | 阐述重组活体生物治疗药物的原理、宿主相互作用、递送机制及应用前景 | 重组活体生物治疗药物及其在人类疾病治疗中的应用 | 合成生物学 | 代谢性疾病、炎症性肠病、癌症 | 基因工程 | NA | NA | NA | NA | 微生物 | 生物遏制策略 | 医学 |
| 14 | 2026-06-10 |
Live biotherapeutics in cancer therapy
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2026.01.002
PMID:41714084
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综述 | 本文综述了活体生物治疗剂在癌症治疗中的潜力与应用 | 整合微生物学、免疫学、合成生物学和肿瘤学,提出活体生物治疗剂作为下一代癌症治疗策略的创新方向 | 安全性、生产制造、监管和个性化方面仍存在挑战 | 探讨活体生物治疗剂在癌症治疗中的潜在应用及未来发展方向 | 天然和工程化活体生物治疗剂(细菌和病毒) | 合成生物学 | 癌症(结肠癌、胃癌、胰腺癌、肝癌等) | NA | NA | NA | NA | 合成生物学 | NA | NA | 医学 |
| 15 | 2026-06-08 |
From Atoms to Cells: AI-Based Structure Prediction Fueling Molecular Dynamics Simulations in Computational Structural Biology
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-07511-6_2
PMID:41652159
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综述 | 探讨人工智能结构预测与分子动力学模拟的融合如何推动计算结构生物学从单分子到全细胞模拟的变革 | 首次系统阐述人工智能驱动的结构预测(如AlphaFold)与分子动力学模拟相结合,突破静态结构局限,实现动态细胞过程模拟,为全细胞建模奠定基础 | 未讨论当前全细胞模拟在计算资源需求、多尺度整合及实验验证方面的具体挑战 | 综述人工智能与分子动力学模拟在计算结构生物学中的协同作用及其对全细胞模拟的推动作用 | 生物系统从单蛋白质到细胞环境的模拟 | 计算结构生物学 | NA | 分子动力学模拟,人工智能结构预测(如AlphaFold) | AlphaFold等人工智能预测模型 | 蛋白质结构数据 | NA | NA | NA | NA | 生物学研究、药物发现、合成生物学 |
| 16 | 2026-06-07 |
High-throughput yeast engineering in biofoundries: towards autonomous and scalable synthetic biology
2026-Jan-05, FEMS yeast research
IF:2.4Q3
DOI:10.1093/femsyr/foag003
PMID:41591451
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综述 | 探讨生物工厂如何通过集成自动化、人工智能和标准化工作流程来推动酵母工程的高通量发展 | 强调了从设计-构建-测试-学习循环向设计-构建-部署循环的转变,并展望了自主优化型“自驱动实验室”的未来 | 协议可变性和人工智能工具的集成仍是关键障碍 | 实现可扩展的合成生物学和自主酵母工程 | 酵母工程中的菌株开发流程 | 合成生物学 | NA | 基因组编辑、表型筛选、预测建模 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 酿酒酵母 | NA | 工业生物技术, 环境, 医药 |
| 17 | 2026-06-07 |
Cell-free systems for development of biosensors
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.09.003
PMID:41581985
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综述 | 本文综述了基于无细胞系统的生物传感器的设计、功能和临床应用 | 强调了无细胞系统在生物传感器开发中的模块化、可定制化和快速响应优势,并探讨了与智能技术(如物联网)的结合 | 当前无细胞生物传感器面临保质期、灵敏度和可扩展性等限制 | 全面介绍无细胞生物传感器的设计原理和应用潜力 | 无细胞生物传感器及其在病原体检测、环境监测等领域的应用 | 合成生物学 | NA | 体外转录和翻译 | NA | NA | NA | NA | 无细胞系统 | 基因电路、信号输出策略 | 医疗保健, 环境科学, 农业, 食品安全 |
| 18 | 2026-06-07 |
Cell-free systems for automation and robotics
2026, Progress in molecular biology and translational science
DOI:10.1016/bs.pmbts.2025.08.008
PMID:41581984
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综述 | 本文探讨了无细胞系统与自动化和机器人技术结合在生物技术和生物工程领域的变革作用 | 系统性地分析了无细胞系统与自动化平台集成的设计、功能和局限性,并强调了人工智能和机器学习在实验设计和过程优化中的潜力 | 面临标准化、更稳健经济的无细胞提取物制备以及AI/ML集成等挑战 | 推动无细胞系统与自动化和机器人技术的融合,以加速发现、开发创新生物材料并拓宽生物技术应用 | 无细胞蛋白合成(CFPS)系统、自动化机器人平台(微流控装置、液体处理机器人、集成分析平台) | 生物工程 | NA | 无细胞蛋白合成(CFPS) | NA | NA | NA | NA | NA | 合成生物学电路 | 生物技术,生物工程 |
| 19 | 2026-06-06 |
Rational engineering of combinatorial bacterial therapies for cancer
2026-Jan-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03951-0
PMID:41606628
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综述 | 本文综述了合成生物学在工程化细菌用于癌症治疗中的最新进展,重点讨论了基因回路设计如何增强肿瘤特异性、调控治疗递送和调动宿主免疫系统 | 强调了通过理性工程实现时空控制和菌群行为编程的策略,为下一代微生物疗法提供指导 | 当前临床转化存在障碍,但本文未具体展开,仅作简要讨论 | 促进工程化细菌作为癌症治疗方法的开发和应用 | 工程化细菌及其基因回路设计 | 合成生物学 | 癌症 | NA | NA | NA | NA | 合成生物学基因回路工具箱 | 细菌 | 基因回路,包括减毒控制、有效载荷释放和免疫调节回路 | 医学 |
| 20 | 2026-06-06 |
Microbial melanin: biosynthesis, functional Insights, and emerging research challenges
2026-Jan-27, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04757-1
PMID:41591674
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综述 | 综述微生物黑色素的生物合成、功能见解及新兴研究挑战 | 系统总结了组学技术和基因工程在阐明微生物黑色素合成机制和提高产量中的关键作用,并提出了整合合成生物学、先进分析技术和安全性评估的未来研究方向 | 强调该领域仍存在挑战和争议,从基础研究到工业化之间存在差距 | 为微生物黑色素领域的研究者提供全面且关键的参考,推动基础研究与工业化的衔接 | 微生物黑色素及其产生菌(细菌和真菌) | NA | NA | 组学技术,基因工程,分析技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌,真菌 | NA | 工业生物技术 |