合成生物学相关文章
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当前共找到 312 篇文献，本页显示第 181 - 200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 工程工具 | 宿主生物 | 回路设计 | 应用领域 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 181 | 2026-02-20 |
Integrated omics analysis of the cellulose co-degradation network of Chaetomium thermophilum
2026-Jan-24, Biotechnology for biofuels and bioproducts
IF:3.3Q3
DOI:10.1186/s13068-026-02741-x
PMID:41580774
|
研究论文 | 本研究通过整合组学分析揭示了嗜热毛壳菌纤维素共降解网络的协同机制，包括核心转录因子调控、酶分泌级联模式及糖酸代谢网络的作用 | 首次在嗜热真菌中发现CtClr-2作为核心转录因子驱动LPMOs、CDH和CBH等关键基因共表达，并揭示氧化酶与水解酶的三阶段级联分泌模式使还原糖产量提升60.6% | 研究聚焦于单一嗜热真菌物种，其机制在其他工业相关真菌中的普适性仍需验证；合成生物学工程改造仅停留在理论建议阶段 | 解析嗜热真菌高效降解纤维素的系统机制，为生物燃料工业化生产提供菌株改造靶点 | 嗜热毛壳菌（Chaetomium thermophilum）的纤维素降解网络 | 合成生物学 | NA | 整合组学分析（包括转录组、蛋白质组） | NA | 组学数据 | NA | 合成生物学 | 嗜热毛壳菌 | 纤维素降解网络（包含转录调控模块、酶分泌级联模块、糖酸代谢模块） | 能源 |
| 182 | 2026-02-19 |
T cell immunotherapy for solid tumors: limitations, progress, and future prospects
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1755751
PMID:41694348
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综述 | 本文全面综述了针对实体瘤的T细胞免疫疗法的现状、挑战与未来前景 | 系统梳理了CAR-T、TCR-T和TIL疗法在实体瘤中的最新进展，并重点讨论了克服抗原异质性、肿瘤微环境抑制等障碍的新兴策略 | 本文为综述性文章，未报告原始实验数据或临床结果，主要基于现有文献进行分析 | 总结T细胞免疫疗法在实体瘤治疗中的进展、挑战及未来发展方向 | 针对实体瘤的T细胞免疫疗法，包括CAR-T细胞、TCR-T细胞和肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | 实体瘤 | 合成生物学工具、基因编辑技术、多组学数据分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | T细胞 | 嵌合抗原受体、T细胞受体工程 | 医学 |
| 183 | 2026-02-19 |
Elucidation of the pramanicin biosynthetic pathway reveals a DUF2306 family membrane protein involved in terminal epoxidation
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1765828
PMID:41695960
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研究论文 | 本研究阐明了真菌代谢产物pramanicin的生物合成途径，并首次揭示了DUF2306家族膜蛋白在终端环氧化反应中的功能 | 首次鉴定了pramanicin的生物合成基因簇，并发现DUF2306家族膜蛋白PraC在天然产物生物合成中的环氧化功能 | NA | 解析pramanicin的生物合成途径 | 真菌代谢产物pramanicin及其生物合成基因 | 合成生物学 | NA | 异源表达、组合表达、饲喂实验 | NA | NA | NA | 异源表达 | 真菌、Aspergillus nidulans | pramanicin生物合成途径（包含PKS-NRPS杂合酶、单加氧酶、短链脱氢酶/还原酶及膜蛋白环氧化酶） | 医药 |
| 184 | 2026-02-19 |
KmPred: prediction of Michaelis constants (Km) using an integrative machine learning framework
2026, Frontiers in artificial intelligence
IF:3.0Q2
DOI:10.3389/frai.2026.1711471
PMID:41696044
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研究论文 | 本文提出了一个名为KmPred的集成机器学习框架，用于预测酶动力学参数米氏常数（Km） | 整合了最先进语言模型的蛋白质序列嵌入与底物SMILES描述的分子描述符，构建了多模态特征融合的预测框架 | NA | 开发一个计算预测方法，以替代传统耗时费力的体外实验测定酶动力学参数 | 酶-底物相互作用的米氏常数（Km） | 机器学习 | NA | 机器学习 | LSTM, Transformer, XGBoost | 蛋白质序列, 化学描述符 | MPEK数据集和Kroll等人组装的独立数据集 | NA | NA | NA | 生物技术, 合成生物学, 药物发现 |
| 185 | 2026-02-19 |
Tripterygium glycosides: recent advances in mechanisms, therapeutic applications, and safety optimization
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1728162
PMID:41704700
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综述 | 本文综述了雷公藤多苷在药理机制、临床应用及安全性优化方面的最新进展 | 强调了通过单体分离、结构优化、前药策略和创新递送系统来克服雷公藤多苷治疗窗口窄的问题，并介绍了新兴衍生物如LLDT-8和雷公藤内酯的减毒增效特性 | NA | 总结雷公藤多苷的药理机制、治疗应用及安全性优化策略 | 雷公藤多苷及其衍生物 | NA | 系统性红斑狼疮、糖尿病肾病、类风湿关节炎、银屑病 | 系统药理学、合成生物学、AI辅助药物设计 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 医学 |
| 186 | 2026-02-17 |
Mining the Hidden Pharmacopeia: Fungal Endophytes, Natural Products, and the Rise of AI-Driven Drug Discovery
2026-Jan-29, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms27031365
PMID:41683797
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综述 | 本文综述了真菌内生菌天然产物的化学与生物合成多样性，并探讨了人工智能如何将天然产物发现从经验筛选转变为具有直接工业应用价值的预测性学科 | 将真菌内生菌这一进化优化的天然产物宝库与人工智能、机器学习及多组学整合技术相结合，实现了对隐蔽生物合成基因簇的预测、激活及从头设计，推动了药物发现向预测性、工程化方向转型 | NA | 探讨人工智能如何加速真菌内生菌天然产物的发现、设计与工业化应用，以应对生物医学和可持续性挑战 | 真菌内生菌产生的天然产物（如聚酮、生物碱、萜类、肽类）及其生物合成基因簇 | 机器学习 | NA | 多组学整合、基因组挖掘、代谢组学注释 | 深度学习、生成式AI、扩散模型 | 基因组数据、代谢组数据、生物合成基因簇数据 | NA | NA | NA | NA | 医药、合成生物学 |
| 187 | 2026-02-17 |
Phage Therapy in Plant Disease Management: 110 Years of History, Current Challenges, and Future Trends
2026-Jan-24, Plants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/plants15030368
PMID:41681534
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综述 | 本文回顾了噬菌体疗法在植物病害管理中110年的发展历史，分析了当前面临的挑战，并探讨了未来的发展趋势 | 全面梳理了噬菌体疗法在植物病害管理领域的完整历史脉络，并前瞻性地讨论了合成生物学、先进递送系统与人工智能等前沿技术的整合潜力 | NA | 回顾噬菌体疗法在植物病害管理领域的发展历程，并展望其未来趋势 | 噬菌体及其在植物病害管理中的应用 | NA | 植物病害 | 噬菌体疗法 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 农业 |
| 188 | 2026-02-16 |
Membrane and proteome allocation constraints in Escherichia coli models during overflow metabolism
2026-Jan-23, Biophysical journal
IF:3.2Q2
DOI:10.1016/j.bpj.2026.01.028
PMID:41580894
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研究论文 | 本研究开发了膜相关约束通量平衡分析模型，以探究大肠杆菌在溢流代谢中膜资源分配的关键作用 | 引入了可调节的膜蛋白质量约束，首次在基因组尺度模型中整合膜分配限制，提高了溢流代谢预测的准确性 | 模型可能未涵盖所有膜相关生物物理因素，且主要基于大肠杆菌，在其他微生物中的普适性有待验证 | 探究膜资源分配如何与整体蛋白质组限制共同调控细菌生理和溢流代谢 | 大肠杆菌的代谢策略和膜蛋白表达 | 代谢工程 | NA | 通量平衡分析 | MAFBA | 基因组尺度代谢模型数据 | NA | NA | 大肠杆菌 | NA | 工业生物技术 |
| 189 | 2026-02-14 |
Engineered probiotics that sequester arsenite in a mouse gastrointestinal system
2026-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.16.699961
PMID:41648437
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研究论文 | 本研究开发了一种基于合成生物学的工程化益生菌，用于在小鼠胃肠道中检测和隔离砷离子，以减少其系统性吸收 | 创新点包括设计了一个砷离子响应的遗传切换开关，能激活螯合剂表达并在生物静态条件下维持生产，同时自动在细胞分裂时关闭以降低代谢负担和提高生物安全性，并改造了砷离子结合蛋白以消除DNA结合活性，保留高亲和力金属结合，适合细胞内隔离 | NA | 研究目的是开发一种策略，防止饮食中的砷离子在消化过程中进入人体，以减少长期健康风险 | 研究对象是工程化的益生菌菌株，用于在小鼠胃肠道系统中隔离砷离子 | 合成生物学 | 癌症、器官功能障碍、神经系统疾病 | 合成生物学方法 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 大肠杆菌 | 砷离子响应的遗传切换开关，用于激活螯合剂表达，并设计了一个非毒性螯合剂用于细胞内隔离 | 医学 |
| 190 | 2026-02-13 |
Digital Twins are a Key Enabling Technology for Personalized Medicine
2026-Jan-14, Bulletin of mathematical biology
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s11538-025-01589-w
PMID:41530522
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观点文章 | 本文探讨了数字孪生作为个性化医疗的关键使能技术，强调其在健康管理中的潜力 | 从学术和商业视角分析数字孪生技术，并扩展到生态、生物技术等跨领域应用 | NA | 强调数字孪生技术对数学建模社区的机遇及其在个性化医疗中的作用 | 数字孪生技术及其在人类生物学和健康管理中的应用 | NA | NA | NA | 计算模型 | NA | NA | NA | NA | NA | 医疗, 生态, 生物技术, 农业, 合成生物学 |
| 191 | 2026-02-12 |
Light force-powered cellular medical micromachines
2026, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2026.1746261
PMID:41658983
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综述 | 本文系统综述了光力驱动的细胞微机器（包括趋化细菌、光合微藻、红细胞、免疫细胞和亚细胞结构）的设计策略及其在靶向药物递送、微创手术和免疫治疗中的应用 | 提出将天然生物细胞与可编程光镊技术相结合，克服传统人工合成材料微机器在生物安全性和深部组织疗效方面的限制 | 存在组织穿透深度有限、光毒性管理以及操作智能化不足等关键挑战 | 探讨光力驱动的细胞微机器在精准医疗中的应用潜力与发展方向 | 趋化细菌、光合微藻、红细胞、免疫细胞和亚细胞结构 | 生物医学工程 | NA | 光镊技术、光子技术 | NA | NA | NA | NA | 细菌、微藻、人类红细胞、免疫细胞 | NA | 医学 |
| 192 | 2026-02-10 |
A programmable ribozyme for RNA signal transduction
2026-Jan-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68175-5
PMID:41519779
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研究论文 | 本文报道了一种可编程的RNA触发激活双位点自切割核酶平台UNBAR，用于RNA信号转导 | 首次开发了一种通用方法，允许RNA触发器直接激活多种非编码RNA效应子，实现了RNA检测与功能转导的一体化 | NA | 开发一种可编程的RNA信号转导平台，用于合成生物学、诊断和基因调控 | RNA触发器、非编码RNA效应子（如sgRNA、shRNA、适配体） | 合成生物学 | NA | RNA工程、细胞自由传感、蛋白质自由扩增 | NA | RNA序列数据 | NA | CRISPR-Cas9 | 斑马鱼胚胎、人类细胞 | 可编程双位点自切割核酶，具有模块化传感域和切割产物 | 医学、合成生物学、诊断 |
| 193 | 2026-02-09 |
AP2/ERF transcription factors regulate the biosynthesis of terpenoids, phenolics, and alkaloids in plants
2026-Jan, Horticulture research
IF:7.6Q1
DOI:10.1093/hr/uhaf280
PMID:41647723
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综述 | 本文综述了AP2/ERF转录因子在调控植物萜类、酚类和生物碱等次生代谢物生物合成中的分子机制与作用 | 系统性地分类和剖析了AP2/ERF转录因子调控次生代谢的多种模式，并探讨了其在代谢工程和合成生物学中的新兴应用 | NA | 阐明AP2/ERF转录因子调控植物次生代谢物生物合成的分子机制 | AP2/ERF转录因子及其调控的萜类、酚类和生物碱等植物次生代谢物 | NA | NA | 多组学技术、CRISPR/Cas9 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 植物 | NA | 农业, 工业生物技术 |
| 194 | 2026-02-08 |
HMRPred: A Machine Learning-Based Web Resource for Identification of Heavy Metal Resistance Proteins
2026-Jan-22, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2026.169659
PMID:41580067
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研究论文 | 开发了一个基于机器学习的网络资源HMRPred，用于识别重金属抗性蛋白 | 首个针对多种重金属（砷、镉、铬等十种金属）和生物域的系统性重金属抗性蛋白分类资源，解决了传统同源性方法的局限性 | NA | 开发可靠的机器学习框架以识别重金属抗性蛋白，支持环境修复和合成生物学应用 | 重金属抗性蛋白和非抗性蛋白 | 机器学习 | NA | 机器学习算法 | 多种机器学习分类器 | 蛋白质序列 | 经过实验验证的抗性和非抗性蛋白数据集 | NA | NA | NA | 环境, 农业, 工业生物技术 |
| 195 | 2026-02-08 |
Microbial engineering for sustainable microplastic biodegradation: from enzyme redesign to synthetic consortia
2026-Jan, International microbiology : the official journal of the Spanish Society for Microbiology
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s10123-025-00760-6
PMID:41423577
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综述 | 本文综述了微生物工程在可持续微塑料生物降解中的应用，涵盖从酶重设计到合成菌群的最新进展 | 结合CRISPR技术、计算酶设计和合成菌群，推动塑料生物降解效率，并连接实验室研究与实际应用 | 聚乙烯和聚苯乙烯降解的可扩展性不足、转基因生物的生物安全标准不明确、降解副产物可能带来环境风险 | 开发可持续的微塑料生物降解方法，以应对塑料污染问题 | 微塑料、微生物、酶（如PET水解酶、角质酶）、合成菌群 | 合成生物学 | NA | CRISPR技术、基因组编辑、酶重设计、多组学分析 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 细菌、真菌 | NA | 环境、工业生物技术 |
| 196 | 2026-02-07 |
Engineered probiotics platform for oral delivery of antibody as a high-compliance alternative for immune-mediated inflammatory diseases
2026-Jan-20, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102523
PMID:41421354
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研究论文 | 本研究开发了一种名为AIDEN的工程化益生菌平台，用于口服递送治疗性抗体，以改善免疫介导炎症性疾病的治疗依从性 | 首次构建了能够口服递送单链可变片段抗体的工程化益生菌平台，实现了肠道稳定定植和原位抗体持续生产 | 研究仅在鼠类模型中进行，尚未进行人体临床试验；系统IL-17A水平仅中度降低 | 开发一种高依从性的口服抗体递送平台，用于治疗免疫介导炎症性疾病 | 工程化大肠杆菌Nissle 1917（EcN）益生菌平台及其分泌抗IL-17A单链可变片段的变体AIDEN-IL17 | 合成生物学 | 银屑病，炎症性肠病 | 合成生物学技术 | NA | NA | 鼠类模型 | 合成生物学 | 大肠杆菌Nissle 1917（EcN） | 抗体分泌系统，可模块化适配多种抗体治疗 | 医学 |
| 197 | 2026-02-06 |
A universal polyphosphate kinase powers in vitro transcription
2026-Jan-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68012-9
PMID:41507187
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研究论文 | 本文介绍了一种通用多磷酸激酶，能够高效磷酸化所有八种常见核糖核苷酸为三磷酸盐，并展示了其在体外转录中的应用潜力 | 开发了一种具有广泛底物谱的通用多磷酸激酶，突破了现有PPKs底物限制，实现了对嘌呤和嘧啶单磷酸及二磷酸的高效磷酸化 | NA | 探索多磷酸激酶在核苷酸生产及体外转录系统中的应用 | 多磷酸激酶及其催化的磷酸化反应 | 合成生物学 | NA | 体外转录、酶催化反应 | NA | NA | NA | NA | NA | 基于通用多磷酸激酶的一锅法体外转录系统 | 工业生物技术 |
| 198 | 2026-02-06 |
Role of CRISPR in bioremediation of heavy metal(loid): a breakthrough in environmental biotechnology
2026-Jan-07, World journal of microbiology & biotechnology
IF:4.0Q2
DOI:10.1007/s11274-025-04770-4
PMID:41498982
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综述 | 本文综述了CRISPR技术在重金属（类金属）生物修复中的应用，探讨了其在环境生物技术领域的突破性潜力 | 首次提出了一个整合CRISPR编辑、多组学、合成生物学和新兴CRISPR生物传感器的统一路线图，用于指导下一代生物修复技术的发展 | 讨论了当前面临的生态风险、技术难题、法规问题以及未来实地部署的挑战 | 探讨CRISPR技术如何提升生物修复的效率、特异性和可扩展性，以应对重金属污染 | 微生物和植物中的金属转运蛋白、解毒酶和应激反应通路 | 环境生物技术 | NA | CRISPR基因组工程 | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9 | 微生物, 植物 | 生物传感系统 | 环境 |
| 199 | 2026-02-06 |
Precise control of transcriptional stoichiometry in bacteria: From mechanisms to synthetic biology applications
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108748
PMID:41187847
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综述 | 本文综述了细菌在转录水平精确控制蛋白质亚基化学计量的机制，并探讨了这些机制在合成生物学中的应用 | 超越经典的转录调控，重点阐述了转录后精细调控机制（如内部转录终止子和选择性RNA加工与稳定系统）在控制化学计量中的作用，并展示了如何利用这些机制设计可编程的合成基因电路 | NA | 探索细菌精确控制转录化学计量的机制及其在合成生物学中的应用 | 细菌的RNA水平调控机制及合成基因电路 | 合成生物学 | NA | NA | NA | NA | NA | CRISPR-Cas9, TALEN, ZFN, Gibson Assembly, Golden Gate Assembly, BioBrick, iGEM | 细菌 | 启动子库、工程化终止子、基于RNase的加工模块、合成基因电路 | 生物技术、生物医学 |
| 200 | 2026-02-05 |
Biological conversion of methane to organic molecules: towards a low-carbon bioeconomy
2026-Jan, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaf547
PMID:41623557
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综述 | 本文综述了将甲烷生物转化为有机分子的研究进展，旨在推动低碳生物经济的发展 | 提出了一个整合合成生物学、代谢工程和系统生物学的系统性框架，用于设计基于甲烷的生物制造，以开发高效的甲烷同化细胞工厂 | NA | 开发下一代甲烷氧化细胞工厂，克服天然甲烷氧化菌的生理限制，实现甲烷向高价值生物产品的可持续转化 | 甲烷氧化菌及其代谢途径 | NA | NA | 合成生物学、代谢工程、系统生物学 | NA | NA | NA | NA | 甲烷氧化菌 | 甲烷同化途径、中心碳代谢整合 | 能源, 环境, 工业生物技术 |